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##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts (not necessarily the same as the AC), for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency (not necessarily the same as the AF), for each ALT allele, in the same order as listed">
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##INFO=<ID=MQ0,Number=1,Type=Integer,Description="Total Mapping Quality Zero Reads">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant Confidence/Quality by Depth">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read position bias">
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Chr01	1645872	.	A	G	136.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
Chr01	1813241	.	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:70,0,30
Chr01	1841520	.	G	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.792;DP=14;Dels=0.00;FS=14.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=14.05;ReadPosRankSum=-3.204	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,7:14:99:225,0,232
Chr01	1956708	.	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,70
Chr01	1973408	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:68,0,32
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Chr01	2997256	.	T	C	116.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:145,0,24
Chr01	2997277	.	A	T	133.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
Chr01	3012687	.	A	T	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
Chr01	3022071	.	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:66,0,33
Chr01	3022072	.	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:73,0,33
Chr01	3031794	.	T	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:68:68,0,106
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Chr01	3430382	.	T	C	75.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:104,0,27
Chr01	3430427	.	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:59:111,0,59
Chr01	3457797	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.826;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=0.77;ReadPosRankSum=-0.181	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,4:35:55:55,0,1186
Chr01	3470080	.	A	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,147
Chr01	3470164	.	T	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,107
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Chr01	4041693	.	A	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:60,0,32
Chr01	4126611	.	G	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.59;MQ0=37;QD=1.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:37,2:39:6:80,6,0
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Chr01	4626092	.	T	C	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=16.67	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:12:128,12,0
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Chr01	4846827	.	A	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,232
Chr01	4887640	.	T	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.716;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=3.57;ReadPosRankSum=-1.692	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,5:26:99:121,0,778
Chr01	4948842	.	C	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:64,0,70
Chr01	5063709	.	C	A	85.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
Chr01	5071683	.	G	T	168.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:197,15,0
Chr01	5071686	.	C	G	173.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:202,15,0
Chr01	5119452	.	G	C	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
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Chr01	6442203	.	C	T	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr01	6463868	.	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.47;ReadPosRankSum=-2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:136,0,135
Chr01	6499596	.	G	A	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
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Chr01	16521228	.	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;DP=73;Dels=0.00;FS=21.821;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=3.38;ReadPosRankSum=-5.631	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,13:73:99:275,0,2165
Chr01	16598816	.	T	C	231.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=23.13;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:9:259,0,9
Chr01	16602365	.	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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Chr01	19188238	.	C	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
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Chr01	19314524	.	C	A	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.31;MQ0=1;QD=14.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,2:3:6:71,6,0
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Chr01	21625752	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:58:58,0,103
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Chr01	22061970	.	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=7.98;ReadPosRankSum=0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,7:11:99:116,0,138
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Chr01	22502901	.	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,69
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Chr01	22698170	.	C	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;DP=87;Dels=0.00;FS=4.652;HaplotypeScore=2.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.32;MQ0=8;MQRankSum=-6.231;QD=1.69;ReadPosRankSum=2.516	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:61,25:87:99:175,0,1636
Chr01	22698182	.	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.572;DP=91;Dels=0.00;FS=6.227;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.63;MQ0=8;MQRankSum=-6.527;QD=1.48;ReadPosRankSum=2.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:57,34:91:99:163,0,1794
Chr01	22698450	.	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;DP=64;Dels=0.00;FS=32.417;HaplotypeScore=4.6165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.789;QD=1.23;ReadPosRankSum=-4.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,9:64:99:107,0,2037
Chr01	22699144	.	C	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=18.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:82,6,0
Chr01	22699153	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=18.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:3:6:82,6,0
Chr01	22699154	.	A	C	85.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
Chr01	22699158	.	G	A	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=25.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:104,9,0
Chr01	22699165	.	T	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=14.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:70,6,0
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Chr01	24806064	.	G	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8003;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.36;MQ0=15;MQRankSum=1.754;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,16:22:9:106,9,0
Chr01	24806066	.	C	G	43.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.62;MQ0=17;MQRankSum=1.495;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,2:24:25:72,0,25
Chr01	24909625	.	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.94;MQ0=1;MQRankSum=1.395;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.031	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:86:86,0,142
Chr01	24909645	.	A	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.71;MQ0=0;MQRankSum=1.508;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.350	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,2:16:52:52,0,169
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Chr01	33494675	.	T	C	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
Chr01	33494680	.	T	C	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
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Chr01	33621202	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:55:55,0,143
Chr01	33712318	.	A	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr01	33751456	.	G	T	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
Chr01	33784175	.	T	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.17;MQ0=0;QD=1.99	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:6:69,6,0
Chr01	33784201	.	C	G	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=0;QD=1.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:6:63,6,0
Chr01	33784203	.	T	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=0;QD=1.89	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:6:67,6,0
Chr01	33784216	.	T	C	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6566;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=0;MQRankSum=2.216;QD=1.42;ReadPosRankSum=2.216	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:19,2:21:6:57,6,0
Chr01	33784227	.	C	T	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=0;QD=1.70	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,21:21:6:63,6,0
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Chr01	37172584	.	C	A	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=21;Dels=0.00;FS=5.898;HaplotypeScore=17.9940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:54:54,0,649
Chr01	37291113	.	G	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:61,0,70
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Chr01	37342619	.	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=15.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:59,6,0
Chr01	37342626	.	G	A	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=15.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:59,6,0
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Chr01	40524479	.	A	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
Chr01	40544852	.	G	T	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr01	40836621	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:68,0,30
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Chr01	43709166	.	C	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=17;Dels=0.00;FS=2.846;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=4.05;ReadPosRankSum=-3.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:97:97,0,445
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Chr01	46560571	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:55:55,0,65
Chr01	46560576	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:57:57,0,62
Chr01	46560579	.	G	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:56:56,0,65
Chr01	46560585	.	T	C	62.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:91,0,27
Chr01	46562104	.	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:73,0,29
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Chr01	48052918	.	T	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;DP=22;Dels=0.00;FS=10.447;HaplotypeScore=5.9960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=2.35;ReadPosRankSum=-3.107	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:80:80,0,631
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Chr01	48175662	.	G	T	73.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:102,0,25
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Chr01	48888232	.	C	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr01	48888682	.	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:66:72,0,66
Chr01	48888688	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:72,0,65
Chr01	48888698	.	A	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:69,0,65
Chr01	48888982	.	C	A	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr01	48892604	.	A	G	138.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
Chr01	48893002	.	C	T	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
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Chr01	49721241	.	G	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.590	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,4:38:58:58,0,1281
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Chr01	49774777	.	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr01	49799812	.	G	A	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
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Chr01	50281643	.	C	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=11.34;ReadPosRankSum=-0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:11:99:153,0,157
Chr01	50287960	.	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=7.12;ReadPosRankSum=1.090	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:35,13:48:99:370,0,1201
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Chr01	50474164	.	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;DP=21;Dels=0.00;FS=4.506;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.428;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.662	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,6:21:99:184,0,556
Chr01	50474203	.	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:93:93,0,146
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Chr01	50560014	.	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:117,0,221
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Chr01	50576648	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
Chr01	50586697	.	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:28:105,0,28
Chr01	50592857	.	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;DP=32;Dels=0.00;FS=45.499;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=5.93;ReadPosRankSum=-3.808	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,8:32:99:218,0,760
Chr01	50599117	.	T	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:52:52,0,97
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Chr01	50888481	.	A	G	38.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:23:67,0,23
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Chr01	51150391	.	T	C	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr01	51933786	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr02	72831	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=26;Dels=0.00;FS=17.337;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.107;QD=1.57;ReadPosRankSum=-3.162	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,4:26:69:69,0,836
Chr02	208501	.	C	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.063	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:76:76,0,520
Chr02	208524	.	C	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;DP=48;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.215;QD=0.68;ReadPosRankSum=0.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,5:48:61:61,0,1507
Chr02	208555	.	A	G	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;DP=48;Dels=0.00;FS=4.807;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=0.52;ReadPosRankSum=-0.945	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:43,5:48:53:53,0,1575
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Chr02	876981	.	G	A	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
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Chr02	2329335	.	A	T	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:178,15,0
Chr02	2330056	.	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=15.82;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:65:139,0,65
Chr02	2345850	.	G	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:62:62,0,67
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Chr02	3006663	.	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
Chr02	3021771	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr02	3040510	.	A	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.97;ReadPosRankSum=-0.729	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:136,0,169
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Chr02	3042978	.	T	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,210
Chr02	3051765	.	C	A	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
Chr02	3059122	.	T	C	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr02	3245153	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr02	3250841	.	C	T	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
Chr02	3253428	.	A	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr02	3258309	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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Chr02	3544229	.	G	T	129.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
Chr02	3544238	.	T	C	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
Chr02	3576010	.	C	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr02	4800879	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr02	4804070	.	C	T	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
Chr02	4804080	.	A	G	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
Chr02	4806050	.	A	C	38.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:14:67,0,14
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Chr02	4964288	.	A	G	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
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Chr02	6118929	.	A	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr02	6125688	.	T	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:60:60,0,140
Chr02	6134614	.	T	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.75;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,7:9:55:260,0,55
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Chr02	7622054	.	T	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.61;MQ0=1;MQRankSum=1.953;QD=1.75;ReadPosRankSum=-2.331	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,2:21:56:65,0,56
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Chr02	10703988	.	A	G	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
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Chr02	10740768	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=22;Dels=0.00;FS=20.569;HaplotypeScore=16.7874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=0.765;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.487	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:55:55,0,638
Chr02	10741197	.	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr02	11255823	.	C	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr02	11255832	.	A	G	83.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=27.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:111,9,0
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Chr02	11871190	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr02	11871232	.	G	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
Chr02	11871393	.	G	A	27.91	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:15:56,0,15
Chr02	11878057	.	G	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:49:49,0,245
Chr02	11886040	.	T	A	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
Chr02	11888468	.	A	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr02	11953399	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:55:55,0,66
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Chr02	12738861	.	T	C	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
Chr02	12755932	.	T	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr02	12802493	.	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:190,0,63
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Chr02	13494164	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr02	13561984	.	G	T	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
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Chr02	14974907	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr02	14974919	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr02	14974963	.	T	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr02	15179009	.	A	T	97.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8309;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.51;MQ0=0;QD=19.41	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:12:125,12,0
Chr02	15230062	.	T	A	91.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.47;MQ0=2;QD=18.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:9:119,9,0
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Chr02	22231287	.	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:47:61,0,47
Chr02	22242390	.	A	G	161.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.02;MQ0=0;QD=32.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:190,15,0
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Chr02	22260899	.	G	A	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
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Chr02	23962415	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr02	25250732	.	C	T	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.82;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
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Chr02	25250842	.	C	T	41.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.55;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,3:5:9:69,9,0
Chr02	25250876	.	C	T	41.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.55;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.26;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,3:5:9:69,9,0
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Chr02	25976546	.	A	G	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.22;MQ0=1;QD=16.06	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:9:108,9,0
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Chr02	26002732	.	T	C	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
Chr02	26002738	.	G	C	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr02	26002770	.	C	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr02	29751454	.	T	C	133.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=33.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:161,12,0
Chr02	29758096	.	C	T	120.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:149,0,25
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Chr02	30491537	.	T	C	136.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
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Chr02	33885931	.	A	G	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr02	33885937	.	C	T	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
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Chr02	35073505	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr02	35076111	.	G	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;DP=21;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.764	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:54:54,0,588
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Chr02	35270562	.	C	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.999;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.479	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:104,0,849
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Chr02	35340889	.	C	A	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.34;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
Chr02	35341802	.	G	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,104
Chr02	35352331	.	G	A	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
Chr02	35352403	.	G	C	121.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:149,12,0
Chr02	35368851	.	T	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr02	35369858	.	C	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:70,0,31
Chr02	35461355	.	A	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr02	35471401	.	C	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:98:98,0,103
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Chr02	36571355	.	C	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.09;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:58:58,0,145
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Chr02	37388693	.	A	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr02	37453771	.	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
Chr02	37477865	.	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:98,0,64
Chr02	37477881	.	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:70:71,0,70
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Chr02	37787283	.	C	A	140.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.48	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
Chr02	37787301	.	C	A	140.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.78	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
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Chr02	37792332	.	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.538	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:78:78,0,494
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Chr02	37914525	.	G	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:96:220,0,96
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Chr02	38296574	.	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,108
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Chr02	38995874	.	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;DP=29;Dels=0.00;FS=2.124;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=1;MQRankSum=-3.184;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,4:29:76:76,0,875
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Chr02	39038788	.	T	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	39038789	.	A	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	39038813	.	T	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr02	39046357	.	T	C	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr02	39084182	.	T	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.609;DP=32;Dels=0.00;FS=12.799;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.363;QD=2.12;ReadPosRankSum=-3.529	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:96:96,0,992
Chr02	39085313	.	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,71
Chr02	39090517	.	A	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:106,0,30
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Chr02	39333299	.	A	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=17;Dels=0.00;FS=4.803;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:72:72,0,532
Chr02	39362288	.	G	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr02	39780358	.	A	T	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.179;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:54:54,0,1046
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Chr02	39787949	.	T	G	123.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:152,0,27
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Chr02	40084915	.	A	G	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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Chr02	40473397	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	40494778	.	G	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
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Chr02	40774840	.	T	C	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr02	41389605	.	C	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:56:125,0,56
Chr02	41391913	.	A	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:65,0,29
Chr02	41405000	.	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:112,0,69
Chr02	41405012	.	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:103,0,69
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Chr02	41824162	.	T	A	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=13.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:54,6,0
Chr02	41847503	.	C	T	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr02	41847523	.	T	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr02	41863727	.	A	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,133
Chr02	41865255	.	A	C	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:97:97,0,245
Chr02	41870612	.	C	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.823;DP=43;Dels=0.00;FS=52.053;HaplotypeScore=17.9962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.246;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.618	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:38,5:43:62:62,0,1446
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Chr02	42061463	.	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:59,6,0
Chr02	42061600	.	T	G	74.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.80;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:14:103,0,14
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Chr02	42290963	.	A	T	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr02	42296642	.	G	T	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
Chr02	42305078	.	A	G	119.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.91;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:7:147,0,7
Chr02	42315905	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:72,0,30
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Chr02	42513142	.	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
Chr02	42513185	.	A	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:113,0,30
Chr02	42513196	.	A	C	77.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:106,0,27
Chr02	42516647	.	G	T	138.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
Chr02	42516695	.	G	T	127.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:155,12,0
Chr02	42532467	.	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,86
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Chr02	42896427	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr02	42897520	.	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.545	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:171,0,292
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Chr02	44296168	.	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,8:19:99:251,0,358
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Chr02	44463258	.	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:221,0,223
Chr02	44487266	.	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.695	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,10:28:99:327,0,651
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Chr02	44699941	.	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,132
Chr02	44700104	.	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:8:62:62,0,164
Chr02	44703449	.	A	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	44706213	.	C	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	44706216	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr02	44921637	.	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,150
Chr02	44921683	.	T	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,144
Chr02	44945828	.	C	T	136.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
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Chr02	45243147	.	T	C	29.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:58,0,27
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Chr02	45466641	.	C	A	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
Chr02	45466697	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr02	45483429	.	T	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=23.9302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=5;MQRankSum=-0.741;QD=4.72;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,4:15:99:99,0,156
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Chr02	47081266	.	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:70,0,33
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Chr02	48107560	.	A	G	129.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:157,12,0
Chr02	48107571	.	T	C	90.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
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Chr02	48201514	.	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.815;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,37:39:59:70,0,59
Chr02	48201518	.	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.388;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.324	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,37:39:66:70,0,66
Chr02	48201526	.	G	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.386;QD=1.10;ReadPosRankSum=2.321	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,36:38:63:70,0,63
Chr02	48201540	.	A	C	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
Chr02	48201549	.	A	G	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9497;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
Chr02	48201560	.	A	T	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=19.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:85,9,0
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Chr02	48441353	.	G	A	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
Chr02	48447837	.	C	G	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.55	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
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Chr02	48460351	.	T	A	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.48;MQ0=0;QD=17.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:80,6,0
Chr02	48462543	.	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.606;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=0.85;ReadPosRankSum=-3.606	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,5:41:63:63,0,1353
Chr02	48463117	.	A	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
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Chr02	48704176	.	G	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:64,0,61
Chr02	48704213	.	A	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:106,0,68
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Chr02	48707175	.	A	G	28.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.20;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:24:57,0,24
Chr02	48724576	.	C	A	211.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
Chr02	48724757	.	T	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=14;Dels=0.00;FS=10.710;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=6.13;ReadPosRankSum=-2.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:114,0,324
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Chr02	48927331	.	C	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr02	48933342	.	A	G	86.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
Chr02	48955170	.	C	A	39.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:68,0,24
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Chr03	123742	.	G	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	457298	.	A	G	170.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:199,15,0
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Chr03	750805	.	A	G	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr03	750820	.	T	C	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
Chr03	752159	.	T	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	2433881	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr03	2433889	.	A	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr03	2435006	.	C	A	86.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
Chr03	2449628	.	C	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;DP=15;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.123	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,5:15:99:148,0,336
Chr03	2463208	.	G	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,69
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Chr03	2761385	.	A	T	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
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Chr03	2768138	.	A	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr03	2906620	.	C	G	134.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:162,12,0
Chr03	2916340	.	T	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:90:91,0,90
Chr03	2943363	.	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;DP=37;Dels=0.00;FS=3.928;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.845;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.062	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,6:37:99:141,0,1178
Chr03	2944718	.	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:73,0,30
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Chr03	3314764	.	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,109
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Chr03	3999498	.	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.909	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:120,0,359
Chr03	4002846	.	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.372	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,5:21:92:92,0,594
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Chr03	4474432	.	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.703;QD=3.44;ReadPosRankSum=-1.604	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,6:27:99:121,0,796
Chr03	4474437	.	T	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;DP=36;Dels=0.00;FS=5.191;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.842;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.743	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,6:36:94:94,0,1116
Chr03	4474438	.	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.064;DP=36;Dels=0.00;FS=5.191;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQ0=0;MQRankSum=-3.842;QD=1.83;ReadPosRankSum=-1.125	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,6:36:94:94,0,1119
Chr03	4540730	.	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:104,0,107
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Chr03	4770505	.	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;DP=32;Dels=0.00;FS=10.268;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQ0=0;MQRankSum=-1.595;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.370	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,7:32:99:174,0,842
Chr03	4793928	.	G	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:52:52,0,164
Chr03	4793974	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr03	4794174	.	T	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.733	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,294
Chr03	4803666	.	C	A	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr03	5150904	.	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.675;DP=32;Dels=0.00;FS=2.188;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.868	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:27,5:32:99:109,0,1009
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Chr03	5159631	.	A	G	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:53,6,0
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Chr03	5379927	.	G	T	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.611;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.960	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:56:56,0,742
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Chr03	5874305	.	G	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:49:49,0,273
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Chr03	5895792	.	A	C	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
Chr03	5895797	.	T	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr03	5895798	.	A	T	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr03	5900255	.	G	C	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr03	5900389	.	T	A	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:217,18,0
Chr03	5900552	.	C	T	118.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:146,12,0
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Chr03	6319902	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,340
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Chr03	6319964	.	A	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.441	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:65:65,0,484
Chr03	6320347	.	C	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr03	6321878	.	G	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:52:52,0,303
Chr03	6331447	.	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=10.52;ReadPosRankSum=0.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,5:13:99:165,0,281
Chr03	6385707	.	G	T	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
Chr03	6424852	.	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=8.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=11.08;ReadPosRankSum=-1.133	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:139,0,222
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Chr03	6713776	.	C	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
Chr03	6715036	.	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,188
Chr03	6715620	.	C	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=12;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=14.56;ReadPosRankSum=-0.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,6:12:99:203,0,199
Chr03	6737678	.	T	C	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
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Chr03	7593778	.	A	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=3.56;ReadPosRankSum=-2.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:71:71,0,300
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Chr03	7633520	.	T	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:92:92,0,164
Chr03	7633540	.	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.956	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,161
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Chr03	8080170	.	G	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:144,0,133
Chr03	8080214	.	A	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:53:135,0,53
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Chr03	8094937	.	C	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:49:49,0,657
Chr03	8101627	.	T	C	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
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Chr03	8980613	.	A	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=25;Dels=0.00;FS=12.418;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=6.59;ReadPosRankSum=-3.843	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,7:25:99:193,0,616
Chr03	8983577	.	A	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.335;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.408;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.259	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:90:90,0,766
Chr03	8986062	.	C	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr03	8986073	.	G	A	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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Chr03	11518232	.	G	A	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr03	11527469	.	G	A	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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Chr03	12865430	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr03	12931953	.	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.600	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:129,0,297
Chr03	12952399	.	C	T	70.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:99,0,27
Chr03	12970447	.	C	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr03	12970464	.	C	T	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.41;MQ0=0;QD=16.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:60,6,0
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Chr03	14197503	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.05;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	14260596	.	C	T	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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Chr03	15099756	.	G	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
Chr03	15336157	.	A	G	28.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:56,6,0
Chr03	15336712	.	A	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=18.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:64,6,0
Chr03	15342062	.	A	C	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=17.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:63,6,0
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Chr03	18253779	.	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:67:67,0,453
Chr03	18257112	.	G	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.179	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,240
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Chr03	21655261	.	A	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	23112726	.	T	C	83.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.26;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.76;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:27:112,0,27
Chr03	23176967	.	G	A	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.91;MQ0=54;MQRankSum=1.733;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:60,4:64:6:59,6,0
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Chr03	23798098	.	T	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr03	23798099	.	C	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr03	23804189	.	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.94;MQ0=2;MQRankSum=1.106;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.382	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:63:63,0,181
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Chr03	23815157	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr03	23815974	.	A	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.85;MQ0=0;QD=21.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:114,12,0
Chr03	23881385	.	T	C	37.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.13;MQ0=4;QD=5.33	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:9:65,9,0
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Chr03	26032740	.	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.275;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=3.38;ReadPosRankSum=-3.817	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,6:34:99:143,0,1070
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Chr03	26667663	.	A	G	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr03	26756521	.	G	C	176.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:205,15,0
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Chr03	28359601	.	T	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
Chr03	28368394	.	T	C	78.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.24;MQ0=1;MQRankSum=1.537;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:20:107,0,20
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Chr03	28931561	.	G	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=5.67;ReadPosRankSum=-3.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:136,0,511
Chr03	28931643	.	C	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:111,0,347
Chr03	28955674	.	C	A	91.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
Chr03	28958523	.	T	C	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr03	28983264	.	A	T	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.35	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:6:59,6,0
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Chr03	28994950	.	A	G	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
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Chr03	29568944	.	T	G	99.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:127,9,0
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Chr03	29573893	.	A	C	160.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:189,15,0
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Chr03	30332050	.	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=27.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:136,12,0
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Chr03	30386151	.	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=16;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.667	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:16:99:112,0,425
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Chr03	30790798	.	G	A	246.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:275,21,0
Chr03	30790810	.	A	T	195.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=27.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:18:224,18,0
Chr03	30790821	.	C	A	166.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
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Chr03	31520133	.	T	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;DP=27;Dels=0.00;FS=5.787;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=1.18;ReadPosRankSum=-1.194	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,4:27:60:60,0,811
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Chr03	32237623	.	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.235;QD=2.62;ReadPosRankSum=-1.463	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,6:37:99:125,0,1025
Chr03	32257586	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	32948289	.	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:74,0,32
Chr03	32948303	.	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:75,0,29
Chr03	32948312	.	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:73,0,29
Chr03	32966237	.	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.351	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:136,0,714
Chr03	32966384	.	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;DP=69;Dels=0.00;FS=1.341;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.169;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.844	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:60,9:69:99:166,0,2228
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Chr03	34197237	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr03	34202601	.	G	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr03	35835479	.	T	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr03	35898072	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr03	35898092	.	G	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	37776919	.	A	T	21.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
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Chr03	42695564	.	T	A	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
Chr03	42695937	.	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.020;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.458;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.641	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:26,4:30:78:78,0,978
Chr03	42702381	.	T	C	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:49:49,0,341
Chr03	42703424	.	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.546	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:87:87,0,226
Chr03	42713129	.	A	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr03	48138513	.	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
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Chr03	48707675	.	C	G	125.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
Chr03	48708604	.	T	C	248.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.57;ReadPosRankSum=0.751	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,8:9:11:276,0,11
Chr03	48717552	.	A	T	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr03	51453185	.	C	T	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr03	51454319	.	G	T	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
Chr03	51471105	.	C	T	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
Chr03	51471145	.	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
Chr03	51475323	.	A	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr03	51475914	.	G	T	107.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:136,0,24
Chr03	51486443	.	A	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=62;Dels=0.00;FS=24.984;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.867;QD=0.88;ReadPosRankSum=-3.403	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:55,7:62:83:83,0,1982
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Chr03	51788490	.	A	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr04	214322	.	A	T	139.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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Chr04	1629582	.	G	A	24.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,10:11:29:53,0,29
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Chr04	1726210	.	G	T	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
Chr04	1785515	.	A	G	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.03;MQ0=1;QD=2.75	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,13:13:6:63,6,0
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Chr04	5036463	.	C	T	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr04	7644534	.	T	C	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
Chr04	7658892	.	G	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr04	7661445	.	G	A	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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Chr04	8631470	.	G	T	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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Chr04	13240708	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.698;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.436	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,3:24:53:53,0,771
Chr04	13334798	.	G	A	179.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.89;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,5:7:15:208,15,0
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Chr04	15147276	.	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:71,0,72
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Chr04	15391541	.	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.53;MQ0=2;MQRankSum=2.583;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.693	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:16,3:19:96:96,0,129
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Chr04	18570862	.	G	A	49.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.31;MQ0=0;QD=12.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:9:77,9,0
Chr04	18570867	.	A	G	49.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.31;MQ0=0;QD=12.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:9:77,9,0
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Chr04	18587048	.	G	T	63.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.79;MQ0=0;QD=7.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,8:8:12:91,12,0
Chr04	18593267	.	T	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr04	18593318	.	A	G	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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Chr04	19563624	.	C	T	37.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.23;MQ0=1;MQRankSum=2.166;QD=3.39;ReadPosRankSum=0.296	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:7,4:11:9:65,9,0
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Chr04	19564365	.	T	C	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:59,6,0
Chr04	19592707	.	A	T	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
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Chr04	21527855	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr04	38369525	.	C	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:60:60,0,106
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Chr04	38386043	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr04	38386044	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr04	38386055	.	C	T	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr04	38682792	.	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=6.854;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=16.20;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:174,0,137
Chr04	38687552	.	T	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.758;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.899	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:112,0,359
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Chr04	38765014	.	A	T	75.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:104,0,25
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Chr04	39472473	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,297
Chr04	39472485	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:51:51,0,260
Chr04	39473634	.	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=12.05;ReadPosRankSum=-2.130	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:197,0,291
Chr04	39473637	.	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.872	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:201,0,288
Chr04	39502822	.	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.341;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.628	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,20:22:57:119,0,57
Chr04	39528480	.	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=23.11;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:63:190,0,63
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Chr04	40817842	.	C	A	29.91	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=0;QD=9.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:3:6:69,6,0
Chr04	40818055	.	A	G	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.46;MQ0=0;QD=24.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:127,12,0
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Chr04	41396125	.	G	A	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
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Chr04	44715529	.	G	T	120.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:149,0,27
Chr04	44715554	.	G	C	121.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:150,0,26
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Chr04	45357023	.	G	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.580	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:89:89,0,230
Chr04	45357329	.	G	T	89.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
Chr04	45357350	.	C	G	90.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
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Chr04	45525972	.	T	A	89.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
Chr04	45530450	.	T	C	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
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Chr05	255221	.	C	T	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
Chr05	255226	.	T	C	85.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
Chr05	257122	.	T	C	85.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
Chr05	257139	.	G	A	166.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:195,15,0
Chr05	264090	.	A	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr05	1774067	.	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,144
Chr05	1774083	.	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:65:65,0,137
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Chr05	2019509	.	C	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,211
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Chr05	2040434	.	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,182
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Chr05	2230959	.	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:68,0,33
Chr05	2230997	.	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=-0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:94:94,0,142
Chr05	2234300	.	C	T	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr05	2234852	.	A	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,149
Chr05	2234853	.	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,149
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Chr05	2735705	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr05	2735726	.	A	T	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr05	2736643	.	G	A	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
Chr05	2741897	.	T	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.07;ReadPosRankSum=-2.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,344
Chr05	2743097	.	C	T	292.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=29.22;ReadPosRankSum=-1.741	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:10:10:320,0,10
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Chr05	3229608	.	C	A	177.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.30	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:206,15,0
Chr05	3254198	.	A	C	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
Chr05	3263758	.	C	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:94:94,0,144
Chr05	3268378	.	C	G	142.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:171,0,21
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Chr05	3437016	.	A	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.75;MQ0=5;MQRankSum=-1.495;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,10:12:61:173,0,61
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Chr05	7089987	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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Chr05	9748049	.	A	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.126	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:24,5:29:99:117,0,912
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Chr05	11286861	.	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;DP=19;Dels=0.00;FS=5.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.09;MQ0=3;MQRankSum=-0.423;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.059	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,9:19:99:217,0,264
Chr05	11374701	.	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
Chr05	11374702	.	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:114,0,30
Chr05	11375535	.	G	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:74,0,30
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Chr05	14642274	.	T	A	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,2:3:6:57,6,0
Chr05	14642279	.	A	G	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,2:3:6:57,6,0
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Chr05	17252595	.	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;DP=45;Dels=0.00;FS=24.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.54;MQ0=0;MQRankSum=-5.014;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.199	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,14:45:99:205,0,840
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Chr05	19167543	.	C	A	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
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Chr05	19573306	.	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:90:135,0,90
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Chr05	34639987	.	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:46:63,0,46
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Chr05	35273733	.	T	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr05	35278100	.	G	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,87
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Chr05	35281527	.	A	G	138.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:166,12,0
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Chr05	36029042	.	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=6.14;ReadPosRankSum=1.135	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,5:20:99:151,0,548
Chr05	36029149	.	C	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=4.44;ReadPosRankSum=2.451	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:86:86,0,377
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Chr05	36345794	.	A	T	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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Chr05	37079735	.	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:97:97,0,219
Chr05	37079750	.	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:99:100,0,222
Chr05	37080578	.	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:100,0,29
Chr05	37099801	.	C	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:9:49:49,0,212
Chr05	37102383	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr05	37104112	.	A	C	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr05	37783851	.	T	C	249.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.83	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:278,21,0
Chr05	37785346	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:50:50,0,258
Chr05	37803147	.	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:114,0,29
Chr05	37819319	.	G	A	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
Chr05	37822774	.	C	G	62.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:19:91,0,19
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Chr05	38121159	.	T	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.363;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=2.16;ReadPosRankSum=-3.137	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,4:24:80:80,0,723
Chr05	38123570	.	G	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.962;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.647;QD=1.54;ReadPosRankSum=-3.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,6:46:99:99,0,1439
Chr05	38156355	.	T	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.29;ReadPosRankSum=-2.855	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,4:13:99:110,0,325
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Chr05	38434970	.	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
Chr05	38434979	.	T	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:70,0,69
Chr05	38454477	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.584;QD=1.05;ReadPosRankSum=-3.584	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,5:38:68:68,0,1245
Chr05	38477888	.	C	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=1.24;ReadPosRankSum=-1.799	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:53:53,0,586
Chr05	38479328	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;DP=75;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.865;QD=0.38;ReadPosRankSum=-0.829	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:68,7:75:57:57,0,2443
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Chr05	39232654	.	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
Chr05	39233033	.	A	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.109	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:77:77,0,306
Chr05	39233214	.	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.843;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.905;QD=3.36;ReadPosRankSum=-1.966	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:22,5:27:99:119,0,786
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Chr05	39418189	.	T	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=18.22;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:94:174,0,94
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Chr05	39435626	.	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.150	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,4:19:99:112,0,570
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Chr05	40676998	.	A	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=19.10;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:181,0,100
Chr05	40677002	.	T	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=17.85;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:171,0,99
Chr05	40677526	.	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.001	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:78:78,0,186
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Chr06	381159	.	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr06	381176	.	T	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr06	4131957	.	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:67,0,33
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Chr06	11070026	.	C	T	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.96;MQ0=0;QD=25.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:105,9,0
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Chr06	11070085	.	A	G	38.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.96;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:67,0,24
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Chr06	11788630	.	G	T	53.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:24:82,0,24
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Chr06	12652861	.	A	G	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
Chr06	12652902	.	G	T	24.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:52,6,0
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Chr06	14965033	.	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,72
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Chr06	16071585	.	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:72,0,68
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Chr06	16605516	.	A	C	135.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
Chr06	16616338	.	A	G	219.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.90	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:248,18,0
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Chr06	17971018	.	T	C	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr06	17971023	.	T	C	91.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
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Chr06	17971037	.	T	A	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.18;MQ0=0;QD=26.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:107,9,0
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Chr06	18301459	.	G	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,3:12:76:76,0,330
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Chr06	18353814	.	T	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.465;DP=60;Dels=0.00;FS=49.058;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=4.23;ReadPosRankSum=-4.944	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:48,12:60:99:282,0,1765
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Chr06	20238213	.	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.036	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,6:10:99:222,0,136
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Chr06	20500917	.	G	C	126.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:154,12,0
Chr06	20501337	.	G	A	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
Chr06	20525762	.	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:88:102,0,88
Chr06	20525915	.	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=22.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.62;ReadPosRankSum=2.262	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:79:79,0,293
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Chr06	24148591	.	T	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr06	24148592	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr06	24175379	.	A	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:54:71,0,54
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Chr06	25324046	.	T	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr06	25812207	.	T	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:51:51,0,291
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Chr06	27045850	.	C	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.227	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:55:55,0,1071
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Chr06	27068517	.	C	A	139.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,5:6:21:168,0,21
Chr06	27216344	.	T	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:50:50,0,241
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Chr06	30097760	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,268
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Chr06	30100474	.	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,107
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Chr06	31036027	.	G	T	162.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:191,15,0
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Chr07	181060	.	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:61:61,0,189
Chr07	181089	.	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:63:63,0,189
Chr07	181567	.	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:70,0,30
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Chr07	385500	.	T	C	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr07	472770	.	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.85;ReadPosRankSum=0.684	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:99:187,0,102
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Chr07	831729	.	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=24.44;ReadPosRankSum=-2.620	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,10:13:82:346,0,82
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Chr07	853368	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr07	889942	.	G	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:140,12,0
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Chr07	1499817	.	C	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.93;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,2:3:6:67,6,0
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Chr07	1658863	.	A	G	140.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:168,12,0
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Chr07	1854090	.	A	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr07	2181673	.	G	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr07	2181694	.	C	A	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr07	2184369	.	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:39:527,39,0
Chr07	2191247	.	T	A	125.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
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Chr07	3610769	.	T	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,224
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Chr07	3617706	.	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;DP=48;Dels=0.00;FS=14.966;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.321;QD=2.45;ReadPosRankSum=-3.739	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:41,7:48:99:146,0,1508
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Chr07	3901946	.	G	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr07	3904486	.	C	T	214.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.39;MQ0=0;QD=19.53	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,10:11:18:243,18,0
Chr07	3904497	.	G	T	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.39;MQ0=0;QD=26.62	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:24:321,24,0
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Chr07	4076547	.	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:61:139,0,61
Chr07	4083221	.	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.239	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:119,0,279
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Chr07	4676917	.	T	C	34.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.70;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:21:63,0,21
Chr07	4676941	.	T	A	34.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:21:63,0,21
Chr07	4676963	.	C	T	34.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:21:63,0,21
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Chr07	6546650	.	G	T	86.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
Chr07	6546822	.	G	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.54;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:95:130,0,95
Chr07	6577616	.	G	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.199;QD=0.87;ReadPosRankSum=-3.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,4:32:56:56,0,1056
Chr07	6579779	.	T	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr07	7711720	.	T	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:10:49:49,0,165
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Chr07	8708781	.	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.331;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=4.87;ReadPosRankSum=-4.551	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,9:41:99:228,0,1192
Chr07	8724504	.	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.35;ReadPosRankSum=1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:92:183,0,92
Chr07	8725314	.	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,5:7:59:172,0,59
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Chr07	11049127	.	G	A	64.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.43;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:9:92,0,9
Chr07	11049175	.	A	T	64.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.43;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=12.86;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:9:92,0,9
Chr07	11049178	.	G	C	101.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=0;QD=20.38	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:130,15,0
Chr07	11057911	.	T	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:58,6,0
Chr07	11057964	.	G	A	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.49;MQ0=2;MQRankSum=1.666;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:9,2:11:6:58,6,0
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Chr07	11757325	.	G	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:58:58,0,185
Chr07	11793700	.	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
Chr07	11793784	.	G	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
Chr07	11795090	.	T	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr07	11817858	.	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=15.82;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:99:139,0,101
Chr07	11817869	.	A	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=13.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:140,0,139
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Chr07	13316934	.	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:110,0,69
Chr07	13317466	.	G	A	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:55:55,0,72
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Chr07	13404532	.	T	C	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
Chr07	13419543	.	A	G	26.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=3;QD=3.82	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:6:54,6,0
Chr07	13419546	.	G	A	32.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.41;MQ0=7;QD=2.98	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,11:11:6:60,6,0
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Chr07	14385931	.	G	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr07	14522836	.	A	G	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr07	14535271	.	A	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:69:112,0,69
Chr07	14535332	.	C	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:61:62,0,61
Chr07	14536043	.	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
Chr07	14578545	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.271	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:50:50,0,306
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Chr07	15772055	.	A	G	46.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.76;MQ0=27;MQRankSum=1.537;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:21,12:33:9:74,9,0
Chr07	15772058	.	G	A	46.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.76;MQ0=27;MQRankSum=1.537;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:21,12:33:9:74,9,0
Chr07	15772083	.	G	A	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.603;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.27;MQ0=30;MQRankSum=-0.484;QD=0.45;ReadPosRankSum=2.273	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,32:53:52:52,0,336
Chr07	15772090	.	G	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.27;MQ0=30;MQRankSum=-0.484;QD=0.47;ReadPosRankSum=1.752	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,32:53:53:53,0,336
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Chr07	18907472	.	T	C	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
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Chr07	20225410	.	T	A	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=0;QD=10.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:3:6:58,6,0
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Chr07	22215693	.	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.96;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:47:68,0,47
Chr07	22250677	.	C	T	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.95;MQ0=1;QD=11.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,2:3:6:62,6,0
Chr07	22530693	.	G	A	106.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.01;MQ0=1;MQRankSum=-0.731;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:23:135,0,23
Chr07	22661048	.	C	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr07	22661059	.	G	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
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Chr07	24673619	.	C	A	120.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.75;MQ0=0;QD=30.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:148,12,0
Chr07	24730464	.	G	C	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.73;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:52,0,28
Chr07	24733812	.	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.74;MQ0=12;MQRankSum=-1.376;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.440	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:45,17:62:44:94,0,44
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Chr07	30962284	.	G	A	21.82	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:50,0,22
Chr07	30964922	.	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.37;MQ0=29;QD=1.28	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:29,2:31:6:67,6,0
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Chr07	39084667	.	A	G	82.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=27.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:110,9,0
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Chr07	39576162	.	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
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Chr07	39620043	.	G	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr07	39687605	.	G	A	89.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
Chr07	39762316	.	A	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr07	40923372	.	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:73,0,33
Chr07	40937877	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.934	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:69:69,0,392
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Chr07	45552096	.	C	T	52.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:80,9,0
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Chr07	45603953	.	T	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr07	48965901	.	T	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,142
Chr07	48965940	.	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,102
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Chr07	51073782	.	A	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr07	51076294	.	A	C	123.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
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Chr08	1077794	.	G	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.05;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,110
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Chr08	2758464	.	T	A	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
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Chr08	3964718	.	A	C	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
Chr08	3985446	.	C	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.418;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=14.11;ReadPosRankSum=-2.678	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,8:16:99:254,0,235
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Chr08	4553271	.	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:68,0,32
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Chr08	6496601	.	A	G	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.01;MQ0=1;QD=16.84	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,5:6:12:129,12,0
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Chr08	6856966	.	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:71,0,31
Chr08	6897657	.	C	G	197.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=32.97	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:226,18,0
Chr08	6897676	.	T	A	189.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=31.64	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:218,18,0
Chr08	6900043	.	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:67,0,29
Chr08	6900225	.	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.749;DP=26;Dels=0.00;FS=41.524;HaplotypeScore=6.9981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.647;QD=9.30;ReadPosRankSum=-3.665	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,9:26:99:270,0,608
Chr08	6902818	.	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
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Chr08	7320574	.	T	A	46.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:22:75,0,22
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Chr08	7321554	.	A	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr08	7326643	.	A	G	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.20;MQ0=0;QD=16.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:76,6,0
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Chr08	11430043	.	G	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:51,0,30
Chr08	11430046	.	C	T	48.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:77,0,27
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Chr08	12002569	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:81,6,0
Chr08	12004900	.	A	C	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
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Chr08	13079702	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:68,0,33
Chr08	13094097	.	G	A	21.81	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:24:50,0,24
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Chr08	33534634	.	A	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.24;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:72,0,64
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Chr08	49430013	.	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:68,0,30
Chr08	49431521	.	T	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:74,0,29
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Chr08	49940684	.	A	T	194.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.83;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:223,0,21
Chr08	49940689	.	C	G	186.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.69;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:21:215,0,21
Chr08	49948752	.	A	T	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
Chr08	49956849	.	C	T	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
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Chr08	50746795	.	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr08	50746809	.	C	T	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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Chr08	52042622	.	A	G	23.76	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:51,6,0
Chr08	52154049	.	G	A	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:86,9,0
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Chr08	54566497	.	C	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:113,0,29
Chr08	54566512	.	A	T	123.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:152,0,26
Chr08	54566521	.	A	T	118.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:147,0,24
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Chr08	55415614	.	T	C	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
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Chr08	55671895	.	A	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr08	56184385	.	T	C	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr08	56187949	.	T	C	90.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
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Chr08	56640229	.	G	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr08	56649904	.	C	T	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.419;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.510	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:55:55,0,770
Chr08	56652749	.	G	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr08	57402096	.	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
Chr08	57402099	.	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
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Chr08	58491035	.	A	T	89.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.36;MQ0=7;MQRankSum=2.017;QD=5.94;ReadPosRankSum=2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:11,4:15:12:117,12,0
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Chr09	9200932	.	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=3.84;ReadPosRankSum=2.335	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:11,3:14:82:82,0,402
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Chr09	11306053	.	G	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=11.09;ReadPosRankSum=-2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:128,0,169
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Chr09	11405035	.	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:63:63,0,520
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Chr09	11414821	.	G	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;DP=21;Dels=0.00;FS=29.510;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=12.04;ReadPosRankSum=-3.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,9:21:99:281,0,388
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Chr09	11852271	.	C	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.666;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.182	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,5:44:74:74,0,1424
Chr09	11852272	.	A	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,5:44:72:72,0,1440
Chr09	11852288	.	G	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=44;Dels=0.00;FS=18.061;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=3.34;ReadPosRankSum=-3.180	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:36,8:44:99:175,0,1267
Chr09	11890904	.	G	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr09	11896112	.	A	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr09	11896141	.	A	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr09	16354229	.	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;DP=68;Dels=0.00;FS=14.528;HaplotypeScore=3.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.511;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.861	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:58,10:68:99:208,0,2106
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Chr09	16704540	.	C	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.418;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=0.88;ReadPosRankSum=-3.612	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,5:42:65:65,0,1391
Chr09	16715604	.	C	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.449;DP=77;Dels=0.00;FS=22.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=0.58;ReadPosRankSum=-4.616	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:69,8:77:73:73,0,2628
Chr09	16752575	.	C	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.524;DP=82;Dels=0.00;FS=22.370;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.602;QD=0.41;ReadPosRankSum=-4.634	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:74,8:82:62:62,0,2727
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Chr09	18545753	.	T	A	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr09	18829509	.	A	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.860;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=1.369;QD=26.39;ReadPosRankSum=0.414	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,37:39:39:1411,39,0
Chr09	18881677	.	C	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;DP=19;Dels=0.00;FS=13.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=5.62;ReadPosRankSum=-3.287	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:135,0,490
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Chr09	23634723	.	C	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr09	23658446	.	G	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.521;QD=5.12;ReadPosRankSum=-5.004	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,11:48:99:274,0,1377
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Chr09	23765040	.	A	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:55:55,0,149
Chr09	23765061	.	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:62:62,0,172
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Chr09	32838016	.	G	T	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr09	35624993	.	C	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr09	35625027	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr09	35660487	.	C	A	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,261
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Chr09	35676581	.	G	A	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
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Chr09	36186386	.	G	C	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=16;Dels=0.00;FS=21.461;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.691;QD=1.86;ReadPosRankSum=-2.691	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,3:16:58:58,0,480
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Chr09	36263451	.	T	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr09	36291010	.	T	G	135.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:163,12,0
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Chr09	36990230	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:55:55,0,207
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Chr09	36998012	.	A	G	90.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
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Chr10	826071	.	G	A	83.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.89;MQ0=10;MQRankSum=0.731;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:11,4:15:12:111,12,0
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Chr10	1572962	.	A	C	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.34;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
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Chr10	3125016	.	A	G	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr10	3133065	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	3133066	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	3133099	.	C	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr10	3492905	.	G	T	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:51:51,0,260
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Chr10	3845529	.	T	C	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
Chr10	3850532	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:54:54,0,291
Chr10	3855615	.	G	A	90.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.34;MQ0=0;QD=30.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:118,9,0
Chr10	3858334	.	A	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.91;MQ0=0;MQRankSum=3.059;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.926	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:11,5:16:15:152,15,0
Chr10	3861902	.	A	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:73,0,32
Chr10	3861920	.	A	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
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Chr10	4285068	.	C	G	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.06;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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Chr10	6410781	.	A	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	6445190	.	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:63:63,0,143
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Chr10	6465944	.	A	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:110,0,29
Chr10	6466014	.	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:29:103,0,29
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Chr10	6675287	.	T	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.322	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:96:96,0,175
Chr10	6718160	.	A	G	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
Chr10	6754119	.	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.46;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:97:97,0,98
Chr10	6754791	.	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:71:72,0,71
Chr10	6756444	.	A	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	6759897	.	C	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:57:57,0,137
Chr10	6764700	.	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:99:138,0,180
Chr10	6764764	.	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.307;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.876	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:164,0,125
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Chr10	8337113	.	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.638;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:113,0,132
Chr10	8354971	.	C	A	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,259
Chr10	8430064	.	G	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:52:65,0,52
Chr10	8596948	.	C	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=18;Dels=0.00;FS=11.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.99;ReadPosRankSum=-2.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:64:64,0,562
Chr10	8625592	.	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;DP=33;Dels=0.00;FS=19.445;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-3.172;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.903	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:29,4:33:64:64,0,1119
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Chr10	9597222	.	A	G	124.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:152,12,0
Chr10	9597223	.	G	C	75.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.94	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:4:9:117,9,0
Chr10	9603413	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	9676747	.	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.53;ReadPosRankSum=-0.573	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,6:9:93:222,0,93
Chr10	9676778	.	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=16.53;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:99:177,0,137
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Chr10	11235378	.	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.20;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.248	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,3:9:66:66,0,154
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Chr10	12778878	.	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.56;MQ0=0;QD=16.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:77,6,0
Chr10	12785188	.	A	T	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.23;MQ0=17;MQRankSum=0.736;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:18,2:20:6:61,6,0
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Chr10	14829226	.	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.81;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
Chr10	14842676	.	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7552;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:69:69,0,102
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Chr10	15876852	.	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;DP=31;Dels=0.00;FS=17.129;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.27;MQ0=8;MQRankSum=-3.389;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.550	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,12:31:99:155,0,451
Chr10	15876869	.	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.356;DP=31;Dels=0.00;FS=17.129;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.27;MQ0=8;MQRankSum=-3.389;QD=4.09;ReadPosRankSum=2.033	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,13:31:99:155,0,453
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Chr10	15964417	.	G	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=2;MQRankSum=-0.474;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.264	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,5:19:99:113,0,178
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Chr10	16177680	.	C	A	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.80;MQ0=2;QD=9.44	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,2:4:6:65,6,0
Chr10	16204385	.	G	A	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr10	16204415	.	G	A	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr10	16204461	.	T	G	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
Chr10	16204464	.	A	G	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr10	16205377	.	G	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=1.37;ReadPosRankSum=0.251	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,3:21:57:57,0,639
Chr10	16374792	.	C	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.87;MQ0=9;QD=6.93	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:9,4:13:12:118,12,0
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Chr10	17897400	.	A	G	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=4;QD=4.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:6:53,6,0
Chr10	17897414	.	G	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=4;QD=4.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:6:53,6,0
Chr10	17897445	.	G	A	25.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=4;QD=4.29	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:6:53,6,0
Chr10	17915721	.	G	T	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=10.70;ReadPosRankSum=2.054	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,3:9:9:124,9,0
Chr10	17915722	.	C	G	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.203	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:6,3:9:9:126,9,0
Chr10	17923893	.	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.68;MQ0=0;QD=18.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:65,6,0
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Chr10	21044247	.	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:67,0,32
Chr10	21044302	.	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=4.81;ReadPosRankSum=-0.057	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:99:110,0,441
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Chr10	23173260	.	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,3:8:89:89,0,122
Chr10	23217459	.	C	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:62:62,0,98
Chr10	23235586	.	G	T	21.84	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.37;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:20:50,0,20
Chr10	23254432	.	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.31;MQ0=0;MQRankSum=3.034;QD=13.05;ReadPosRankSum=-1.485	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:99:211,0,99
Chr10	23254481	.	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.31;MQ0=0;MQRankSum=3.034;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.065	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,6:14:91:205,0,91
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Chr10	24416429	.	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:90:90,0,135
Chr10	24416441	.	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.219	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,5:9:90:90,0,132
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Chr10	26054277	.	A	G	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=18.32	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:9:101,9,0
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Chr10	26865208	.	T	C	32.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.21;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:19:61,0,19
Chr10	26898746	.	C	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:50:50,0,230
Chr10	26898753	.	T	C	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,240
Chr10	26898773	.	C	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,248
Chr10	27014936	.	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:67,6,0
Chr10	27185810	.	C	A	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr10	27185831	.	C	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
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Chr10	29024789	.	C	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:70:70,0,71
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Chr10	30994305	.	C	T	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,253
Chr10	31138842	.	C	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:69,0,32
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Chr10	31348181	.	C	A	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=23.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:74,6,0
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Chr10	33960402	.	A	T	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
Chr10	34294442	.	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;DP=16;Dels=0.00;FS=23.181;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.423	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,7:16:99:225,0,309
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Chr10	37554740	.	C	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:4:32:71,0,32
Chr10	37567119	.	A	C	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
Chr10	37629886	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.898	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,2:10:51:51,0,303
Chr10	37633804	.	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.466	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,6:12:99:214,0,172
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Chr10	38895219	.	A	G	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
Chr10	38898685	.	A	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
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Chr10	39540144	.	T	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr10	40165798	.	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:148,0,66
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Chr10	40320447	.	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,102
Chr10	40321850	.	A	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:57:57,0,170
Chr10	40322579	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr10	40322582	.	A	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr10	40324949	.	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.638;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.313	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:42,10:53:99:260,0,1577
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Chr10	40599432	.	T	G	119.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:147,12,0
Chr10	40599502	.	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:143,0,143
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Chr10	40601429	.	T	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.38;ReadPosRankSum=-0.361	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,3:15:79:79,0,425
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Chr10	40652142	.	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.758;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.152;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:12,4:17:99:120,0,433
Chr10	40653024	.	T	C	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:49:49,0,247
Chr10	40653088	.	G	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:51:51,0,262
Chr10	40653138	.	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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Chr10	40779622	.	T	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-3.150;QD=2.43;ReadPosRankSum=-2.261	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:21,4:25:89:89,0,755
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Chr10	40936049	.	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=3.18;ReadPosRankSum=-2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:60:60,0,254
Chr10	40936955	.	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,110
Chr10	40937101	.	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,145
Chr10	40937120	.	G	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,148
Chr10	40941802	.	A	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.919;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.212	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,4:14:99:125,0,377
Chr10	40941820	.	A	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.796;DP=18;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.265	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,4:18:99:110,0,505
Chr10	40943053	.	G	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.189	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,3:17:64:64,0,505
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Chr10	41255776	.	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=15;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.993;QD=16.98;ReadPosRankSum=0.340	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,8:15:99:283,0,243
Chr10	41262784	.	G	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr10	41263704	.	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:102,0,30
Chr10	41267284	.	C	A	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
Chr10	41267316	.	C	G	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr10	41267322	.	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:67,0,30
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Chr10	41461027	.	C	T	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
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Chr10	41909935	.	T	A	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr10	41915786	.	G	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	41917031	.	A	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	41917057	.	C	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	41917061	.	A	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr10	42080728	.	G	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;DP=24;Dels=0.00;FS=22.270;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.87;ReadPosRankSum=-3.270	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,5:24:99:121,0,677
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Chr10	42237801	.	C	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr10	42242689	.	G	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=11.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:123,0,207
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Chr10	42614303	.	G	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:106,9,0
Chr10	42614668	.	G	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,146
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Chr10	42889755	.	T	A	42.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.27;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:19:71,0,19
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Chr10	43016933	.	A	T	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
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Chr10	43032914	.	G	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=13.08;ReadPosRankSum=-2.450	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:159,0,158
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Chr10	43217993	.	G	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr10	43227707	.	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:93:93,0,134
Chr10	43248325	.	C	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,147
Chr11	10402	.	A	C	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:51,0,30
Chr11	40915	.	T	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr11	299057	.	C	T	69.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:98,0,27
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Chr11	358898	.	G	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr11	363499	.	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=2.20;ReadPosRankSum=-3.873	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,6:39:99:114,0,1240
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Chr11	605841	.	C	T	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
Chr11	606417	.	A	T	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
Chr11	606425	.	G	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
Chr11	606432	.	G	A	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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Chr11	625549	.	C	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	637585	.	G	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	639576	.	G	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr11	643011	.	T	C	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr11	644250	.	T	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.84;MQ0=0;MQRankSum=2.774;QD=3.81;ReadPosRankSum=2.887	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:13,4:17:93:93,0,315
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Chr11	870729	.	G	A	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.20;MQ0=0;QD=24.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:149,15,0
Chr11	871024	.	A	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.242;DP=46;Dels=0.00;FS=14.891;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=2.17;ReadPosRankSum=-4.190	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:39,7:46:99:128,0,1454
Chr11	892239	.	T	A	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr11	892241	.	G	A	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr11	892292	.	A	T	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr11	892308	.	A	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr11	982935	.	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:110,0,30
Chr11	984592	.	T	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=3.22;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:18,4:22:99:99,0,675
Chr11	989441	.	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.960;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.209	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:28,8:36:99:210,0,989
Chr11	989743	.	A	G	20.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.061	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:49:49,0,342
Chr11	991089	.	T	C	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:9,2:11:50:50,0,337
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Chr11	991779	.	T	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	991933	.	T	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:57:57,0,189
Chr11	999002	.	G	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,136
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Chr11	1156749	.	C	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.05;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	1160191	.	C	T	81.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:27:110,0,27
Chr11	1160528	.	T	C	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
Chr11	1165222	.	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:148,0,66
Chr11	1165268	.	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:65:143,0,65
Chr11	1166799	.	A	C	179.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:208,15,0
Chr11	1173511	.	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.978	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,3:11:83:83,0,241
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Chr11	1278385	.	C	G	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:122,9,0
Chr11	1280181	.	G	C	129.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:12:157,12,0
Chr11	1280198	.	A	G	155.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:184,15,0
Chr11	1280798	.	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.927;DP=122;Dels=0.00;FS=62.905;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=1.69;ReadPosRankSum=-6.435	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:106,16:122:99:234,0,3838
Chr11	1290432	.	A	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.099	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:82:82,0,377
Chr11	1291490	.	T	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:250,21,0
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Chr11	1518452	.	C	T	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr11	1533858	.	A	T	107.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:136,0,24
Chr11	1545535	.	T	G	39.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:3:6:79,6,0
Chr11	1550996	.	A	G	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:51:51,0,244
Chr11	1553215	.	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=1.118;QD=0.81;ReadPosRankSum=1.356	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,4:38:59:59,0,1120
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Chr11	1670270	.	G	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=34;Dels=0.00;FS=28.212;HaplotypeScore=3.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.020	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:30,4:34:52:52,0,1092
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Chr11	1693502	.	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.279;DP=28;Dels=0.00;FS=7.324;HaplotypeScore=9.6654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.960;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.060	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:23,5:28:99:122,0,703
Chr11	1700521	.	G	C	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:9:124,9,0
Chr11	1700526	.	T	A	94.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:9:122,9,0
Chr11	1701202	.	G	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.421	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:140,0,145
Chr11	1701466	.	A	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	1702496	.	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:68:101,0,68
Chr11	1703153	.	A	G	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	1713900	.	G	T	75.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.76;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:12:103,0,12
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Chr11	1859041	.	G	C	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:57:57,0,204
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Chr11	1949308	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	1959819	.	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:67:67,0,68
Chr11	1963749	.	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:59:59,0,110
Chr11	1963764	.	C	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:65:65,0,112
Chr11	1968062	.	C	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
Chr11	1980285	.	T	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	1986264	.	T	G	107.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:136,0,27
Chr11	1988130	.	C	G	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr11	2113893	.	G	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	2114895	.	C	G	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	2114899	.	T	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr11	2122630	.	C	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.198	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:52:52,0,163
Chr11	2122959	.	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.93;MQ0=0;QD=23.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:97,9,0
Chr11	2122960	.	T	C	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.93;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
Chr11	2122966	.	C	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.93;MQ0=0;QD=23.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:99,9,0
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Chr11	2262314	.	T	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,109
Chr11	2262323	.	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,109
Chr11	2262350	.	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.406	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:108,0,108
Chr11	2262364	.	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:107,0,109
Chr11	2262372	.	C	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:95:95,0,104
Chr11	2262373	.	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:100,0,103
Chr11	2279575	.	T	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.26;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:143,12,0
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Chr11	2663057	.	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=24.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:100,9,0
Chr11	2663065	.	G	T	84.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.08;MQ0=0;QD=28.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:112,9,0
Chr11	2667134	.	T	G	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.92;MQ0=0;QD=27.69	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:222,21,0
Chr11	2673731	.	G	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr11	2699423	.	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:109,0,30
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Chr11	2716954	.	A	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr11	3100544	.	T	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	3100553	.	C	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr11	3107348	.	G	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	3128333	.	G	T	179.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:208,0,18
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Chr11	3185051	.	T	C	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr11	3190094	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:81,6,0
Chr11	3190143	.	T	G	89.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
Chr11	3191076	.	A	G	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.35;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
Chr11	3191091	.	G	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.18;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	3191092	.	T	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.18;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	3192092	.	G	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	3206771	.	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
Chr11	3206804	.	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
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Chr11	3338313	.	A	C	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	3338429	.	C	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	3338481	.	G	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	3342962	.	G	A	120.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:149,0,26
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Chr11	3625517	.	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:68,0,68
Chr11	3631517	.	G	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:15,3:18:62:62,0,541
Chr11	3635837	.	A	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,103
Chr11	3636877	.	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.29;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,4:6:66:144,0,66
Chr11	3637453	.	C	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.72;ReadPosRankSum=-2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:130,0,136
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Chr11	3799171	.	G	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=1.12;ReadPosRankSum=-0.320	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:54:54,0,739
Chr11	3814531	.	C	A	86.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:114,9,0
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Chr11	3814759	.	T	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:30:109,0,30
Chr11	3814816	.	G	C	59.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:88,0,25
Chr11	3814837	.	C	T	64.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.20;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:93,0,25
Chr11	3822024	.	G	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	3822069	.	A	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr11	4173491	.	G	C	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	4181522	.	A	G	121.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:27:150,0,27
Chr11	4181775	.	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:68,6,0
Chr11	4184058	.	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:63:63,0,69
Chr11	4190088	.	G	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:67,0,32
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Chr11	4553406	.	T	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr11	4566294	.	T	C	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:73,6,0
Chr11	4566358	.	C	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:70,6,0
Chr11	4579929	.	G	T	23.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:52:52,0,260
Chr11	4584108	.	G	C	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr11	4584172	.	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.239;QD=6.73;ReadPosRankSum=-0.825	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:109,0,264
Chr11	4584189	.	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.06;ReadPosRankSum=-0.536	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:8,4:12:99:113,0,209
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Chr11	5445378	.	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:71,0,33
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Chr11	5478508	.	A	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:72:72,0,72
Chr11	5484339	.	T	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,5:8:96:175,0,96
Chr11	5507750	.	A	G	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr11	5507795	.	G	A	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr11	5523423	.	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:66:66,0,149
Chr11	5534891	.	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:67:67,0,110
Chr11	5535358	.	G	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	5536135	.	T	A	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr11	5732070	.	T	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;DP=35;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=16.7644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=19.51;ReadPosRankSum=3.517	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:14,20:34:99:711,0,487
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Chr11	5737521	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,2:9:53:53,0,244
Chr11	5747153	.	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:64:104,0,64
Chr11	5762877	.	C	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	5762941	.	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.447	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:99:123,0,192
Chr11	5787305	.	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.537	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,3:6:99:106,0,104
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Chr11	6080538	.	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:73,0,31
Chr11	6129757	.	A	G	181.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.98;ReadPosRankSum=0.742	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,6:7:18:210,0,18
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Chr11	6150254	.	T	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:75,0,30
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Chr11	7034396	.	C	T	85.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.04;MQ0=0;QD=28.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:113,9,0
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Chr11	7780794	.	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.937	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:99,0,142
Chr11	7780809	.	G	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.754	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,3:7:99:99,0,146
Chr11	7788021	.	A	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	7788032	.	A	T	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
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Chr11	8380051	.	G	A	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr11	8380117	.	A	T	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=26.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:108,9,0
Chr11	8380119	.	T	C	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr11	8415935	.	A	C	211.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:240,18,0
Chr11	8449920	.	G	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	8463290	.	T	C	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
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Chr11	9531385	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	9531390	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	9531391	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	9531400	.	A	G	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
Chr11	9544386	.	C	A	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=2.88;ReadPosRankSum=2.166	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,3:10:57:57,0,244
Chr11	9544438	.	C	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:61:100,0,61
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Chr11	10728839	.	A	G	139.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:167,12,0
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Chr11	11941304	.	C	T	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:160,12,0
Chr11	11941319	.	T	C	136.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:164,12,0
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Chr11	14098134	.	A	G	81.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:109,9,0
Chr11	14098149	.	C	T	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr11	14098154	.	C	T	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:76,6,0
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Chr11	14748043	.	C	G	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:125,9,0
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Chr11	14790357	.	G	A	131.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:159,12,0
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Chr11	15977743	.	A	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr11	21491396	.	G	A	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;MQ0=0;QD=17.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:62,6,0
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Chr11	21531300	.	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.38;MQ0=1;MQRankSum=0.720;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.720	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,4:7:32:73,0,32
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Chr11	22644437	.	T	A	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:118,12,0
Chr11	22649819	.	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.682;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.421;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.518	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,10:30:99:157,0,423
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Chr11	25252788	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	25252873	.	C	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;DP=30;Dels=0.00;FS=8.900;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=2.43;ReadPosRankSum=-3.506	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:25,5:30:99:101,0,897
Chr11	25253082	.	G	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	25261672	.	T	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
Chr11	25267632	.	C	T	34.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.13;MQ0=2;MQRankSum=-1.611;QD=2.48;ReadPosRankSum=-2.256	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,12:14:28:63,0,28
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Chr11	25531665	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:54:54,0,209
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Chr11	25904901	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr11	25934627	.	G	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr11	25934640	.	A	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr11	25934641	.	T	A	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr11	25934649	.	T	G	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr11	25934654	.	G	T	27.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:55,6,0
Chr11	26026548	.	G	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:76,6,0
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Chr11	28910685	.	A	C	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:77,6,0
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Chr11	29006533	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:29:55,0,29
Chr11	29006563	.	G	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
Chr11	29006575	.	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
Chr11	29006600	.	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:69,6,0
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Chr11	32376000	.	A	G	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=20.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:90,9,0
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Chr11	33375393	.	T	G	92.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:120,9,0
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Chr11	33382018	.	G	T	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:58:58,0,135
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Chr11	34100002	.	T	C	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	34128918	.	C	G	42.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:71,0,27
Chr11	34130948	.	A	G	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	34144524	.	A	C	50.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:78,6,0
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Chr11	35188967	.	C	A	105.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:26:134,0,26
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Chr11	35204170	.	G	A	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
Chr11	35204179	.	G	T	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
Chr11	35204182	.	G	A	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
Chr11	35204192	.	C	T	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
Chr11	35204194	.	G	A	127.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;QD=25.58	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:156,15,0
Chr11	35204507	.	G	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:59:59,0,139
Chr11	35223380	.	G	T	110.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.72;MQ0=4;MQRankSum=0.731;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,4:9:24:139,0,24
Chr11	35225085	.	T	C	98.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:126,9,0
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Chr11	35850770	.	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.91;MQ0=4;MQRankSum=0.727;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,3:8:9:82,9,0
Chr11	35850781	.	C	T	54.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.91;MQ0=4;MQRankSum=0.727;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,3:8:9:82,9,0
Chr11	35875681	.	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,3:5:62:74,0,62
Chr11	35879326	.	G	A	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.89;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,2:4:6:57,6,0
Chr11	35879351	.	C	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.89;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:2,2:4:6:57,6,0
Chr11	35913626	.	G	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
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Chr11	37929670	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:28:72,0,28
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Chr11	39004116	.	A	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
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Chr11	39759968	.	C	A	22.79	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=22;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.244;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.583	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:19,3:22:51:51,0,604
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Chr11	40449827	.	T	C	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=22.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:72,6,0
Chr11	40472036	.	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:65,0,66
Chr11	40491354	.	T	A	436.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.470;QD=33.58;ReadPosRankSum=0.401	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,12:13:3:463,0,3
Chr11	40564521	.	C	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr11	40564531	.	G	T	29.75	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:57,6,0
Chr11	40575482	.	A	G	53.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.32;ReadPosRankSum=0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:1,3:4:9:81,9,0
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Chr11	40812349	.	T	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	40871589	.	T	A	112.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:24:141,0,24
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Chr11	41074560	.	T	G	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:124,9,0
Chr11	41092908	.	A	G	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
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Chr11	41182315	.	T	A	88.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:116,9,0
Chr11	41187772	.	G	A	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:6:79,6,0
Chr11	41200162	.	C	T	75.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,3:4:25:104,0,25
Chr11	41224382	.	C	A	128.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
Chr11	41226295	.	G	C	91.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:119,9,0
Chr11	41226360	.	A	G	123.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:151,12,0
Chr11	41226372	.	T	C	128.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:156,12,0
Chr11	41226377	.	A	G	125.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:153,12,0
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Chr11	43113710	.	A	T	52.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=26.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:80,6,0
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Chr11	43419182	.	T	C	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:81,6,0
Chr11	43450569	.	C	A	27.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,2:7:56:56,0,178
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Chr11	44733891	.	G	C	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	44735980	.	T	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:61:61,0,98
Chr11	44743407	.	A	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=25;MQRankSum=-1.395;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.303	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:37,4:41:97:97,0,348
Chr11	44743408	.	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=25;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.067	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:34,5:40:99:150,0,266
Chr11	44747657	.	A	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.46;MQ0=1;QD=2.91	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,14:14:6:68,6,0
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Chr11	45057858	.	A	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.39;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,4:10:62:86,0,62
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Chr11	45769553	.	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:67,0,33
Chr11	45769568	.	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:71,0,33
Chr11	45769584	.	G	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:67,0,33
Chr11	45772132	.	T	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	45772146	.	G	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	45772163	.	T	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr11	46167935	.	T	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
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Chr11	46169816	.	C	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	46169839	.	C	T	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	46169849	.	G	T	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
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Chr11	46805713	.	A	T	95.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=31.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:123,9,0
Chr11	46805865	.	C	A	48.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.98;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=6.96;ReadPosRankSum=-1.231	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:5,2:7:6:76,6,0
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Chr11	46886434	.	G	A	309.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.26;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,9:9:27:338,27,0
Chr11	46886817	.	A	G	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.76;MQ0=0;QD=31.54	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,7:7:21:249,21,0
Chr11	46890130	.	C	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.930	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:87:87,0,380
Chr11	46890142	.	T	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.761	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:10,3:13:88:88,0,372
Chr11	46890156	.	C	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:75,0,33
Chr11	46890173	.	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:72,0,31
Chr11	46890176	.	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:70,0,31
Chr11	46892450	.	T	C	217.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.71;MQ0=0;QD=34.42	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,6:6:18:246,18,0
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Chr11	46968515	.	A	T	27.81	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.22;MQ0=6;MQRankSum=1.666;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.762	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:13,2:16:6:66,6,0
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Chr11	46982950	.	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:63:63,0,100
Chr11	46982959	.	T	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:64:64,0,103
Chr11	46982967	.	A	T	113.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.731	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,4:5:25:142,0,25
Chr11	46982999	.	A	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:3,2:5:66:66,0,102
Chr11	46987010	.	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.88;MQ0=18;MQRankSum=-1.589;QD=1.18;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:59:59,0,226
Chr11	46987045	.	T	A	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.88;MQ0=18;MQRankSum=-1.589;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:58:58,0,218
Chr11	46987053	.	T	C	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.88;MQ0=18;MQRankSum=-1.589;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,20:26:55:55,0,214
Chr11	46987057	.	C	G	29.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=18;MQRankSum=-1.495;QD=1.19;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,20:25:58:58,0,178
Chr11	46987059	.	C	G	28.77	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.12;MQ0=18;MQRankSum=-1.495;QD=1.15;ReadPosRankSum=1.495	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,20:25:57:57,0,180
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Chr11	47149442	.	T	C	24.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,2:8:53:53,0,214
Chr11	47152170	.	G	A	28.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.393;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.348	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,9:12:29:57,0,29
Chr11	47153265	.	T	C	87.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.45;MQ0=0;QD=29.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:115,9,0
Chr11	47155423	.	G	A	28.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:27:57,0,27
Chr11	47155432	.	C	G	27.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:32:56,0,32
Chr11	47155472	.	T	A	28.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:57,0,30
Chr11	47155480	.	C	G	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=19.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:66,6,0
Chr11	47158966	.	T	C	25.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=0.126;QD=0.72;ReadPosRankSum=3.196	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:32,4:36:54:54,0,1212
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Chr11	48110057	.	A	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=10;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=2;MQRankSum=-2.017;QD=8.48;ReadPosRankSum=-0.922	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:5,5:10:99:113,0,140
Chr11	48110069	.	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=10.22;ReadPosRankSum=-2.017	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,4:8:99:110,0,143
Chr11	48112761	.	A	G	21.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
Chr11	48112762	.	G	A	21.77	LowQual	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:49,6,0
Chr11	48112845	.	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.95;MQ0=8;MQRankSum=1.991;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.787	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:33,2:35:65:65,0,112
Chr11	48112848	.	A	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.01;MQ0=8;MQRankSum=1.853;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.851	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:31,2:33:69:71,0,69
Chr11	48112849	.	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.01;MQ0=8;MQRankSum=-1.026;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:33:68:68,0,69
Chr11	48113037	.	G	A	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
Chr11	48113067	.	G	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:71,6,0
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Chr11	49154909	.	G	A	93.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:121,9,0
Chr11	49172637	.	T	C	181.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,5:5:15:210,15,0
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Chr11	49173228	.	A	G	21.80	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;DP=20;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.223	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:17,3:20:50:50,0,613
Chr11	49178774	.	A	T	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	49178838	.	G	A	55.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:83,6,0
Chr11	49179111	.	C	G	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,4:4:12:165,12,0
Chr11	49188290	.	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:69:70,0,69
Chr11	49188311	.	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:30:71,0,30
Chr11	49188319	.	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:68,0,31
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Chr11	49545710	.	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.143;QD=8.16;ReadPosRankSum=0.387	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:6,5:11:99:118,0,195
Chr11	49546161	.	C	A	89.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,3:3:9:117,9,0
Chr11	49548092	.	C	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:31:71,0,31
Chr11	49548112	.	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:1,2:3:33:74,0,33
Chr11	49548264	.	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:64:65,0,64
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Chr11	49945196	.	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.597	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:7,4:11:99:132,0,217
Chr11	49945340	.	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:65:69,0,65
Chr11	49945350	.	G	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:69,0,68
Chr11	49945352	.	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:2,2:4:68:69,0,68
Chr11	49946901	.	C	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
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Chr11	50123809	.	G	C	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	50124044	.	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=45;Dels=0.00;FS=12.504;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=0.68;ReadPosRankSum=-2.474	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:40,5:45:59:59,0,1511
Chr11	50124095	.	A	G	26.78	LowQual	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;DP=23;Dels=0.00;FS=4.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.228;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.137	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:20,3:23:55:55,0,766
Chr11	50124699	.	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.380	GT:AD:DP:GQ:PL	0/1:4,2:6:64:64,0,139
Chr11	50125209	.	T	A	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	50125213	.	C	G	56.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:84,6,0
Chr11	50125272	.	T	A	54.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:82,6,0
Chr11	50125445	.	C	T	51.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:79,6,0
Chr11	50125459	.	T	C	47.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87	GT:AD:DP:GQ:PL	1/1:0,2:2:6:75,6,0
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