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T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,255 Chr01 1029632 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr01 1077891 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 1100251 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 1121154 . G T 39.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:68,0,21 Chr01 1140341 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,178 Chr01 1183330 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,142 Chr01 1217950 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 1231312 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;DP=48;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.641;QD=0.43;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,5:48:49:49,0,1618 Chr01 1307623 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr01 1354006 . C G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:99,0,29 Chr01 1401303 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 1401339 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 1403048 . C A 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:180,15,0 Chr01 1433540 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 1476161 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 1479098 . A T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr01 1479103 . G T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr01 1616619 . G C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr01 1703785 . C G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,109 Chr01 1749245 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,444 Chr01 1753237 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,526 Chr01 1793129 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr01 1831480 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.543;DP=32;Dels=0.00;FS=21.944;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.024;QD=2.09;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:95:95,0,974 Chr01 1940415 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,147 Chr01 1960539 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 1979998 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 2061905 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr01 2066878 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,171 Chr01 2118627 . G T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr01 2118723 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:85:85,0,206 Chr01 2160383 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,445 Chr01 2165610 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=2.42;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:84:84,0,697 Chr01 2204429 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:136,0,62 Chr01 2345946 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2345958 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2345998 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2345999 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2346012 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2346014 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2346016 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 2402742 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr01 2626455 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,200 Chr01 2633478 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,296 Chr01 2663853 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 2672510 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 2749811 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:111,0,366 Chr01 2774063 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 2774064 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 2775507 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 2775966 . G T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr01 2834649 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 2845241 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:50,0,33 Chr01 2910870 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,172 Chr01 2938743 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:84:84,0,419 Chr01 2938874 . A G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr01 2948884 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:60:60,0,135 Chr01 2949838 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr01 2949866 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr01 2950460 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:68,0,67 Chr01 2952356 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:72,0,31 Chr01 2958432 . C T 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr01 2997329 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr01 3025259 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 3032577 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=22.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,259 Chr01 3078718 . C G 231.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:260,0,17 Chr01 3083981 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr01 3083986 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:75,0,31 Chr01 3084217 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=5.935;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.045;QD=2.89;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:89:89,0,614 Chr01 3122149 . A G 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:261,0,57 Chr01 3124292 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.267;DP=57;Dels=0.00;FS=10.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=1.21;ReadPosRankSum=-4.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,7:57:97:97,0,1890 Chr01 3127067 . T G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:102,0,90 Chr01 3147177 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3147201 . T C 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3147207 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3147209 . G A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3147213 . A T 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3147222 . C A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr01 3158579 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,106 Chr01 3162937 . T C 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:60,0,27 Chr01 3162938 . T C 34.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:63,0,21 Chr01 3166266 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 3172087 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 3172100 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 3184853 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.534;DP=42;Dels=0.00;FS=10.623;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:96:96,0,1336 Chr01 3194950 . G T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:175,0,23 Chr01 3200012 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr01 3211571 . A C 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:148,0,64 Chr01 3214839 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:69,0,29 Chr01 3215364 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3223629 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:71,6,0 Chr01 3231913 . A T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr01 3253804 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.971;QD=2.61;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:70:70,0,420 Chr01 3256471 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.042;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.547 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,3:25:50:50,0,821 Chr01 3261625 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3265468 . T C 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.6096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.04;MQ0=12;MQRankSum=2.028;QD=1.28;ReadPosRankSum=-2.527 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,6:78:99:128,0,1108 Chr01 3268126 . C G 76.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:13:105,0,13 Chr01 3268141 . G C 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:114,0,24 Chr01 3268144 . A G 84.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:113,0,23 Chr01 3268155 . A G 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:114,0,25 Chr01 3268158 . A C 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:114,0,27 Chr01 3268195 . C G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr01 3284664 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 3284675 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 3284676 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 3284700 . A C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 3284702 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 3291114 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,218 Chr01 3291120 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,143 Chr01 3291141 . C G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,149 Chr01 3307101 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 3311454 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 3314699 . T A 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.722;DP=47;Dels=0.00;FS=18.503;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=2.91;ReadPosRankSum=-4.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:165,0,1437 Chr01 3329305 . G A 101.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:129,12,0 Chr01 3335237 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 3365568 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 3369478 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,556 Chr01 3378660 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,277 Chr01 3379219 . C T 287.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=26.16;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:316,0,50 Chr01 3379278 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:101,0,61 Chr01 3379678 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 3381952 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr01 3383164 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3391846 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3394753 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr01 3397771 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 3404303 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr01 3404308 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,112 Chr01 3404350 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,112 Chr01 3407218 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,273 Chr01 3417316 . G C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,260 Chr01 3430291 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr01 3430293 . A G 46.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:75,0,21 Chr01 3430319 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr01 3430321 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr01 3430325 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr01 3442172 . A C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:9:68,9,0 Chr01 3447976 . A G 146.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:175,0,21 Chr01 3470002 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr01 3486768 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr01 3493096 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 3493185 . C A 327.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:87:356,0,87 Chr01 3493275 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,64 Chr01 3494691 . G C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;DP=31;Dels=0.00;FS=5.697;HaplotypeScore=14.9900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.324;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:60:60,0,943 Chr01 3496902 . G T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr01 3499100 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 3510189 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 3510648 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:126,9,0 Chr01 3524385 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr01 3537117 . G T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,216 Chr01 3586050 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 3595757 . C G 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr01 3604082 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,333 Chr01 3606862 . A T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr01 3609374 . G C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:112,0,28 Chr01 3624489 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 3624514 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3647006 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 3647015 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr01 3647021 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 3656365 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,329 Chr01 3656366 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,321 Chr01 3706656 . C T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.37;MQ0=11;MQRankSum=-1.589;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:56:135,0,56 Chr01 3706657 . A C 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.37;MQ0=11;MQRankSum=-1.589;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:59:111,0,59 Chr01 3706666 . C T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.37;MQ0=11;MQRankSum=-1.589;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:59:127,0,59 Chr01 3706674 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.37;MQ0=11;MQRankSum=-1.589;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,17:19:59:137,0,59 Chr01 3706681 . T C 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.78;MQ0=10;MQRankSum=-0.742;QD=6.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:24:137,0,24 Chr01 3706690 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.47;MQ0=10;QD=8.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:149,12,0 Chr01 3706693 . A C 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.47;MQ0=10;QD=8.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:145,12,0 Chr01 3706719 . G A 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.47;MQ0=10;QD=8.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:142,12,0 Chr01 3706729 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.98;MQ0=10;QD=3.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:68,6,0 Chr01 3779820 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,70 Chr01 3781481 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr01 3788010 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.223 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,586 Chr01 3806689 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 3809952 . C A 143.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:172,0,21 Chr01 3831596 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:64,0,59 Chr01 3843010 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:82:82,0,249 Chr01 3975101 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,148 Chr01 3979467 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 4041706 . A T 181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.493;DP=19;Dels=0.00;FS=25.092;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.310;QD=9.57;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:210,0,432 Chr01 4163084 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 4173084 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 4184178 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:52:52,0,668 Chr01 4217481 . C A 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.811;QD=15.60;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:231,0,199 Chr01 4218715 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 4245543 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr01 4245629 . T A 144.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.13;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:173,0,21 Chr01 4250680 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr01 4531626 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,203 Chr01 4534901 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 4672114 . A C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr01 4721844 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84:84,0,205 Chr01 4749800 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 4752541 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 4789600 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,327 Chr01 4846910 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,141 Chr01 4948755 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 5019841 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,300 Chr01 5070777 . A G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr01 5070830 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 5087424 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 5090850 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr01 5119668 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,479 Chr01 5143753 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.885;DP=49;Dels=0.00;FS=20.062;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.204;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,7:49:99:123,0,1512 Chr01 5161574 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.56;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 5161628 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.56;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr01 5171454 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 5181086 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 5264791 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.93;MQ0=9;QD=2.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:62,6,0 Chr01 5264801 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.93;MQ0=9;QD=3.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:76,6,0 Chr01 5264802 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.93;MQ0=9;QD=3.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:75,6,0 Chr01 5432780 . C A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr01 5506094 . A T 75.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:12:103,0,12 Chr01 5547380 . A T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;DP=55;Dels=0.00;FS=29.179;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.492;QD=1.36;ReadPosRankSum=-4.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,7:55:99:103,0,1765 Chr01 5561322 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 5561369 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 5564046 . C T 474.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:503,39,0 Chr01 5564142 . G C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr01 5620929 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr01 5620930 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr01 5657896 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr01 5658631 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 5660434 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 5664986 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 5671707 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 5671939 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 5673149 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 5676105 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 5676312 . T C 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:120,0,127 Chr01 5736307 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.917;QD=1.80;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:104,0,1337 Chr01 5873680 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 5930395 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 5959172 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,143 Chr01 5959197 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,148 Chr01 5993360 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 6011695 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=18.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:82,6,0 Chr01 6107579 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,138 Chr01 6138031 . C A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.250;QD=5.57;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:134,0,511 Chr01 6229219 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 6423289 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.479;QD=6.08;ReadPosRankSum=-3.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:23:99:168,0,537 Chr01 6432784 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 6449260 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 6458336 . A T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=64;Dels=0.00;FS=9.542;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,7:64:81:81,0,1979 Chr01 6534028 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 6536716 . G T 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:146,0,26 Chr01 6695992 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 6723052 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,139 Chr01 6753348 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,228 Chr01 6753441 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.228;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.390;QD=2.33;ReadPosRankSum=-3.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:98:98,0,928 Chr01 6773512 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr01 6819523 . T A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.388;QD=2.80;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:87:87,0,598 Chr01 6835714 . G C 39.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:79,6,0 Chr01 6883664 . C T 35.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:64,0,24 Chr01 6942711 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 6955087 . G T 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.991;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=3.36;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:156,0,1156 Chr01 7178800 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.72;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:52,0,27 Chr01 7178810 . C A 23.85 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.72;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:52,0,18 Chr01 7178853 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.72;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 7178866 . T G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.72;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr01 7192464 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 7201220 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr01 7231553 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,110 Chr01 7293941 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 7303256 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=9.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:87,0,104 Chr01 7342915 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:98,0,58 Chr01 7364195 . C A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr01 7407833 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 7472720 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.23;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr01 7472728 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.23;MQ0=1;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:74,6,0 Chr01 7480407 . G T 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr01 7558268 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 7573377 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr01 7573379 . G T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 7573391 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.99;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 7672847 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 7672854 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 7672856 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 7672863 . C T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr01 7672886 . T G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr01 7672914 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 7672925 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 7691795 . G A 144.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.17;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:173,15,0 Chr01 7697040 . G T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr01 7700374 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr01 7735528 . T C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr01 7753830 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 7753889 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 7765609 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 7800768 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,184 Chr01 8011226 . G T 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 Chr01 8019743 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.927;DP=53;Dels=0.00;FS=27.985;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=1.49;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:53:99:107,0,1742 Chr01 8074321 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr01 8116361 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,104 Chr01 8231898 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:63,0,59 Chr01 8298799 . G T 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=9.99;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:188,0,340 Chr01 8374427 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr01 8515258 . T C 120.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.45;MQ0=0;QD=10.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:149,15,0 Chr01 8515268 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.96;MQ0=0;QD=10.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:89,9,0 Chr01 8604776 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr01 8608330 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.625;QD=0.66;ReadPosRankSum=-4.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,7:66:72:72,0,2128 Chr01 8747600 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,180 Chr01 8796555 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 8796557 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 8796568 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 8821800 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54:54,0,104 Chr01 8912821 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr01 8913940 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 8913941 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr01 8913966 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 8913969 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr01 9331077 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr01 9366496 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,324 Chr01 9366592 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.97;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:124,0,141 Chr01 9383616 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=19.98;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:268,0,128 Chr01 9493642 . G T 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.822;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.712;QD=6.29;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:217,0,808 Chr01 9673062 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;DP=27;Dels=0.00;FS=28.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.780;QD=3.10;ReadPosRankSum=-2.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:112,0,827 Chr01 9675658 . G T 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;DP=43;Dels=0.00;FS=10.867;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=3.55;ReadPosRankSum=-4.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:181,0,1175 Chr01 9677860 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.557;QD=1.68;ReadPosRankSum=-3.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:99,0,1345 Chr01 9677946 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,645 Chr01 9703478 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,108 Chr01 9790965 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.20;MQ0=1;MQRankSum=-0.570;QD=2.37;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:21:78:78,0,198 Chr01 9830208 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr01 9848516 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 9848523 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 9864936 . C A 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr01 9886552 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,322 Chr01 9925674 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 9925687 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr01 9925699 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 10021229 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr01 10031371 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 10110683 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr01 10220299 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.842;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=2.58;ReadPosRankSum=-3.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,6:36:99:121,0,1126 Chr01 10393284 . G T 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 Chr01 10427437 . A T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr01 10477681 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 10510455 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 10606090 . A C 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.84;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:49:117,0,49 Chr01 10841296 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 10941109 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.615;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=1.174;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:69:69,0,598 Chr01 10945353 . A C 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.360;DP=61;Dels=0.00;FS=14.578;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.487;QD=1.03;ReadPosRankSum=-4.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,7:61:91:91,0,2038 Chr01 10945384 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;DP=71;Dels=0.00;FS=13.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.155;QD=1.19;ReadPosRankSum=-2.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,8:71:99:113,0,2366 Chr01 10945387 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;DP=71;Dels=0.00;FS=13.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=1.19;ReadPosRankSum=1.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,8:71:99:113,0,2355 Chr01 10945390 . T C 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;DP=71;Dels=0.00;FS=13.572;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.427;QD=1.10;ReadPosRankSum=3.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,8:71:99:106,0,2306 Chr01 10945422 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=25;Dels=0.00;FS=10.193;HaplotypeScore=3.9974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:77:77,0,760 Chr01 10945423 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=18;Dels=0.00;FS=19.117;HaplotypeScore=3.9974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:58:58,0,541 Chr01 11245906 . G T 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=11;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:152,0,186 Chr01 11305338 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,104 Chr01 11339201 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 11499103 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,306 Chr01 11518529 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr01 11518615 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 11667564 . C A 238.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 Chr01 11857756 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 11892057 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.009;DP=18;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.372;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:100,0,496 Chr01 11892139 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 11946182 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 11955984 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 12027890 . C A 87.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.28;MQ0=12;QD=5.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,5:17:12:133,12,0 Chr01 12138559 . C T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.05;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr01 12259655 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.53;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 12352437 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.42;MQ0=15;QD=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,15:19:6:51,6,0 Chr01 12414173 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr01 12548138 . T C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.22;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:86,9,0 Chr01 12763602 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;DP=16;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=4.0624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.83;MQ0=1;MQRankSum=1.371;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:76:76,0,261 Chr01 12763607 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=16;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=4.0624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.83;MQ0=1;MQRankSum=1.371;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:72:72,0,262 Chr01 12786441 . C A 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.00;MQ0=3;MQRankSum=1.231;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,5:8:9:92,9,0 Chr01 12795492 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.87;MQ0=1;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:74,6,0 Chr01 12800939 . C A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=5.09;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:130,0,547 Chr01 12834737 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:67,0,66 Chr01 12835554 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr01 12855543 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 12861134 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.59;MQ0=4;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:63,6,0 Chr01 12861138 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.08;MQ0=3;QD=7.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:63,6,0 Chr01 12887241 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:66:66,0,138 Chr01 12898006 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr01 12924953 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.86;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:69,6,0 Chr01 12924956 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.86;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:67,6,0 Chr01 13067799 . C T 229.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.620;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.96;MQ0=0;MQRankSum=2.737;QD=12.77;ReadPosRankSum=0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,9:18:21:258,21,0 Chr01 13115706 . G A 69.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:98,0,26 Chr01 13169320 . C A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=14;Dels=0.00;FS=10.925;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.75;MQ0=2;MQRankSum=2.141;QD=9.91;ReadPosRankSum=-2.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:167,0,101 Chr01 13192247 . C A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.898;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:148,0,333 Chr01 13323339 . C A 229.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:258,24,0 Chr01 13426534 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,234 Chr01 13463123 . T C 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr01 13463143 . C A 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr01 13463146 . C T 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr01 13463157 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.50;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:46:53,0,46 Chr01 13463158 . C T 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7206;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:123,12,0 Chr01 13463170 . G C 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:123,12,0 Chr01 13463175 . T A 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:114,12,0 Chr01 13517996 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=23;Dels=0.00;FS=20.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.99;MQ0=3;MQRankSum=-2.752;QD=1.12;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:54:54,0,622 Chr01 13518082 . C A 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;DP=21;Dels=0.00;FS=13.415;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.60;MQ0=0;MQRankSum=1.440;QD=6.51;ReadPosRankSum=-3.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:165,0,455 Chr01 13553759 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 13571030 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=6.28;ReadPosRankSum=1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:91:91,0,261 Chr01 13649875 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr01 13651462 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 13681892 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr01 13683035 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:104,0,25 Chr01 13683131 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 13701095 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.185;DP=18;Dels=0.00;FS=15.315;HaplotypeScore=2.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,433 Chr01 13701181 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.085;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:49:49,0,1164 Chr01 13755566 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 13756776 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13756779 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13756784 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13756808 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13756817 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13756825 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 13801736 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr01 13828945 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 13849477 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=1.35;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:78:78,0,1204 Chr01 13849573 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=21;Dels=0.00;FS=5.898;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,659 Chr01 13861205 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 13951083 . G T 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:419,30,0 Chr01 14132475 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQ0=1;MQRankSum=1.754;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:33:66,0,33 Chr01 14132486 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQ0=1;MQRankSum=0.937;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:30:92,0,30 Chr01 14132492 . G A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:30:100,0,30 Chr01 14145513 . A G 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=18.25;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:229,0,127 Chr01 14212009 . T G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr01 14216765 . C T 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr01 14216770 . A G 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr01 14216771 . G A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr01 14216774 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr01 14216796 . C G 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr01 14216801 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=24.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:149,12,0 Chr01 14216822 . G T 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8934;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.48;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:180,15,0 Chr01 14408142 . G C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.78;MQ0=9;MQRankSum=-1.923;QD=0.55;ReadPosRankSum=-1.442 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,11:45:6:52,6,0 Chr01 14505995 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.40;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr01 14548482 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,175 Chr01 14569842 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.50;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:64:86,0,64 Chr01 14569849 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.720;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:61:132,0,61 Chr01 14569871 . A T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.50;MQ0=1;MQRankSum=-0.720;QD=14.11;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:60:127,0,60 Chr01 14755195 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 14826394 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr01 14963256 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,211 Chr01 15076894 . G T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr01 15234833 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 15240492 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:14:77:77,0,354 Chr01 15263121 . C A 39.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:68,0,22 Chr01 15616245 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr01 15653459 . A T 58.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:87,0,27 Chr01 15797972 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr01 15798068 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=16.154;HaplotypeScore=2.3985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:78:78,0,273 Chr01 15907487 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr01 15911630 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr01 15963865 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 16003072 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,259 Chr01 16022428 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,211 Chr01 16022519 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;DP=101;Dels=0.00;FS=17.784;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=0.91;ReadPosRankSum=-4.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,11:101:99:120,0,3240 Chr01 16141677 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=1.90;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:93:93,0,1087 Chr01 16157508 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr01 16185755 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.92;MQ0=4;MQRankSum=1.666;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,2:13:6:53,6,0 Chr01 16202196 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.58;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 16267331 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;DP=98;Dels=0.00;FS=3.011;HaplotypeScore=15.0814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQ0=0;MQRankSum=-5.278;QD=0.23;ReadPosRankSum=3.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:87,11:98:51:51,0,2958 Chr01 16354641 . A C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr01 16514246 . G T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=5.49;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:182,0,772 Chr01 16613909 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,180 Chr01 16618774 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr01 16952081 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.905;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.8718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.84;MQ0=1;MQRankSum=0.318;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:24:50:50,0,300 Chr01 17077223 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=2;QD=12.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:76,6,0 Chr01 17171664 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 17350325 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 17432018 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 17693311 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,108 Chr01 17693329 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,108 Chr01 17693359 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,105 Chr01 17930255 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr01 17930281 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 17943283 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.34;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:32:65,0,32 Chr01 17967465 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.32;MQ0=3;QD=4.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:56,6,0 Chr01 17967511 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.32;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:56,6,0 Chr01 17972183 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr01 18020444 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18020451 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18020458 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18020459 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18020463 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18020478 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr01 18190253 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.99;MQ0=2;QD=11.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:74,6,0 Chr01 18300738 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.47;MQ0=2;MQRankSum=-2.415;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:50:50,0,378 Chr01 18320978 . G A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.55;MQ0=7;MQRankSum=1.678;QD=1.35;ReadPosRankSum=-2.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:78:78,0,153 Chr01 18320995 . C T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.38;MQ0=7;MQRankSum=1.738;QD=1.31;ReadPosRankSum=2.092 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:78:78,0,161 Chr01 18321008 . C T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:78:78,0,161 Chr01 18321011 . A T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:78:78,0,153 Chr01 18546587 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.61;MQ0=1;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr01 18656712 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.04;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:58,6,0 Chr01 18665009 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.62;MQ0=6;MQRankSum=1.619;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,2:30:61:61,0,95 Chr01 18665104 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=70;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.03;MQ0=59;MQRankSum=-2.262;QD=0.64;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,3:70:73:73,0,291 Chr01 18887511 . A G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr01 18887514 . C G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr01 18887554 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 18887559 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 19154920 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:99,0,184 Chr01 19155153 . G T 82.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:111,0,24 Chr01 19187882 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.73;MQ0=3;MQRankSum=1.495;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:56:56,0,131 Chr01 19314780 . G A 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr01 19314791 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr01 19314804 . T C 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr01 19314810 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr01 19350147 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 19461798 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.019;DP=66;Dels=0.00;FS=14.364;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=0.48;ReadPosRankSum=-4.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,7:66:60:60,0,2204 Chr01 19707557 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 20071831 . C A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.41;MQ0=0;MQRankSum=2.451;QD=6.25;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:9:109,9,0 Chr01 20072905 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:72,0,66 Chr01 20168334 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 20565727 . T A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,327 Chr01 20573719 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:70,6,0 Chr01 20815231 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 21027760 . A G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:56,0,27 Chr01 21027800 . C T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr01 21027812 . G A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr01 21083428 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 21248087 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 21248125 . C G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 21290177 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr01 21344908 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=1.78;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:19:62:62,0,548 Chr01 21544193 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.734;DP=54;Dels=0.00;FS=37.455;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.798;QD=1.46;ReadPosRankSum=-4.249 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,7:54:99:107,0,1752 Chr01 21559575 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=6.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.73;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:121,0,274 Chr01 21561530 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr01 21611317 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 21871931 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 21921539 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 22010061 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.67;MQ0=0;MQRankSum=2.287;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,472 Chr01 22075607 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 22080682 . G T 44.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.727;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:21:73,0,21 Chr01 22088426 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.15;MQ0=3;MQRankSum=-0.406;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:53:56,0,53 Chr01 22088440 . T C 54.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.15;MQ0=3;MQRankSum=-0.736;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:27:83,0,27 Chr01 22102719 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 22173444 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=1.12;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:72:72,0,1276 Chr01 22389373 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 22613655 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 22698218 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.385;DP=99;Dels=0.00;FS=15.998;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.07;MQ0=6;MQRankSum=3.827;QD=1.08;ReadPosRankSum=-4.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:90,9:99:99:135,0,1890 Chr01 22807956 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 Chr01 22808006 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 Chr01 22808017 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 Chr01 23093357 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 23256923 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr01 23256924 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr01 23379874 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,214 Chr01 23608487 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:75,6,0 Chr01 23709649 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 23736130 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,239 Chr01 23828360 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.95;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:74,6,0 Chr01 23912735 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 23999638 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.577;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.670;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.871 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,8:74:86:86,0,2430 Chr01 24005436 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 24059419 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=19;Dels=0.00;FS=20.443;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.850;QD=2.57;ReadPosRankSum=-2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:77:77,0,500 Chr01 24059433 . A C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;DP=20;Dels=0.00;FS=24.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.135;QD=3.79;ReadPosRankSum=-3.055 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:104,0,495 Chr01 24083232 . T G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr01 24083244 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr01 24083250 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr01 24083270 . C T 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr01 24208968 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.23;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:40:61,0,40 Chr01 24313578 . G A 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:141,0,27 Chr01 24389795 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=3;MQRankSum=1.495;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,5:10:6:52,6,0 Chr01 24389799 . A T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=3;MQRankSum=1.495;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,5:10:6:52,6,0 Chr01 24389810 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.24;MQ0=7;MQRankSum=1.495;QD=1.77;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,9:14:6:52,6,0 Chr01 24519128 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=6;QD=6.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:76,6,0 Chr01 24564766 . C A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.36;MQ0=3;QD=18.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:12:160,12,0 Chr01 24610477 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.02;MQ0=1;MQRankSum=-2.445;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:61:61,0,318 Chr01 24663059 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr01 24693139 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 24872494 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:50,0,33 Chr01 24872497 . G T 104.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.98;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=14.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:133,0,23 Chr01 24893029 . T A 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=1;QD=18.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:121,12,0 Chr01 24893065 . A G 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=1;QD=18.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:121,12,0 Chr01 24909630 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.24;MQ0=4;MQRankSum=0.566;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:66:66,0,81 Chr01 24909695 . A T 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:50,0,23 Chr01 25132154 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 25193711 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,135 Chr01 25222206 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 25222260 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 25466667 . G A 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.17;MQ0=1;MQRankSum=1.635;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:41:127,0,41 Chr01 25770094 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.71;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:59,6,0 Chr01 25790301 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:52,0,30 Chr01 25790323 . T G 23.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:52,0,23 Chr01 25790343 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49:49,0,60 Chr01 25790356 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49:49,0,58 Chr01 26002133 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr01 26004860 . A T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:106,0,28 Chr01 26004905 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.47;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:71,0,68 Chr01 26034750 . C A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.833;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=5.53;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:161,0,677 Chr01 26034814 . A T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:143,0,589 Chr01 26034815 . T C 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:146,0,612 Chr01 26111879 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.47;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=10.55;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:80,6,0 Chr01 26266050 . G T 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.93;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=15.67;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:12:122,12,0 Chr01 26773165 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.88;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,3:10:6:77,6,0 Chr01 26807889 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 26815621 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 26859012 . G T 145.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:7:23:174,0,23 Chr01 27072595 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 27112734 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.09;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr01 27153496 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.27;MQ0=1;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:66,6,0 Chr01 27233086 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.09;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 27250404 . A T 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:68,0,24 Chr01 27253953 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 27489507 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 27591033 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 27690496 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,284 Chr01 27798048 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 27845193 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,176 Chr01 27846561 . T G 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr01 27850043 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 27861515 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr01 27869088 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr01 27869100 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr01 27869112 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr01 27869118 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr01 27925057 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.0641;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.29;MQ0=3;MQRankSum=2.404;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:89,9,0 Chr01 28123219 . G A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:130,0,103 Chr01 28194633 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.55;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,101 Chr01 28194635 . C T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.55;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:102,0,101 Chr01 28194680 . C T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.44;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:100,0,101 Chr01 28194705 . T C 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.44;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:83:83,0,101 Chr01 28427793 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 28498880 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr01 28498918 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr01 28561020 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 28571807 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=0;QD=2.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:51,6,0 Chr01 28571819 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=0;QD=2.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:51,6,0 Chr01 28571822 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=0;QD=2.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:9:6:51,6,0 Chr01 28572265 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 28744003 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 28850672 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 28991602 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 29114427 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 29124259 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.76;MQ0=0;QD=0.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:6:59,6,0 Chr01 29144739 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.044;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.10;MQ0=4;MQRankSum=0.348;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:82,6,0 Chr01 29161348 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 29161438 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 29282621 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 29282643 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 29282657 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 29282667 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 29282675 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr01 29454619 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 29566344 . C T 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.7723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.93;MQ0=1;MQRankSum=1.235;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:99:119,0,664 Chr01 29566402 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr01 29637113 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 29637199 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 29709639 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 29734229 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr01 29822592 . A T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.550;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=1.85;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:91:91,0,1088 Chr01 29822688 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:101,0,29 Chr01 29971068 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=3.37;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:72:72,0,343 Chr01 29994389 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 30010605 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=15;Dels=0.00;FS=14.564;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=3.25;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:15:77:77,0,350 Chr01 30091954 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 30268960 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.63;MQ0=3;QD=4.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:52,6,0 Chr01 30280768 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 30311379 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 30339686 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 30376113 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 30389433 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr01 30389470 . T C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr01 30539346 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.18;MQ0=2;MQRankSum=3.903;QD=1.04;ReadPosRankSum=-4.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,7:63:74:94,0,74 Chr01 30600662 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 30603936 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:7:98:98,0,106 Chr01 30614945 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 30614957 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 30783121 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr01 30785596 . G T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:100,0,26 Chr01 30817847 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,659 Chr01 30959088 . A C 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr01 30993661 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.64;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:52,6,0 Chr01 31059272 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,85 Chr01 31078968 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.506;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:63:63,0,864 Chr01 31078979 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQ0=0;MQRankSum=-3.506;QD=1.16;ReadPosRankSum=1.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:63:63,0,908 Chr01 31078996 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.837;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:64:64,0,822 Chr01 31091278 . A C 88.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.00;MQ0=12;MQRankSum=2.450;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,5:22:12:116,12,0 Chr01 31195050 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 31328424 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 31363227 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr01 31394698 . G T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:135,0,26 Chr01 31395439 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 31469059 . T A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.92;MQ0=1;MQRankSum=2.143;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:60,6,0 Chr01 31582637 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.53;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr01 31583187 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 31583654 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr01 31651607 . G A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr01 31655811 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.02;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 31659051 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr01 31662639 . C A 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;DP=30;Dels=0.00;FS=2.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.667;QD=5.26;ReadPosRankSum=-3.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,7:30:99:186,0,799 Chr01 31802703 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 31802799 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,144 Chr01 31848818 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,221 Chr01 31939505 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 32034699 . G T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.94;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.06;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:103,9,0 Chr01 32144363 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr01 32253830 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,164 Chr01 32307289 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr01 32340141 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 32340156 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 32351215 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,209 Chr01 32499756 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 32503464 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=1;MQRankSum=-1.026;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:33:67,0,33 Chr01 32537192 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.17;MQ0=0;QD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:78,6,0 Chr01 32866157 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,240 Chr01 32866254 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 32931326 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 33084693 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 33220008 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.27;MQ0=10;MQRankSum=-1.944;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,266 Chr01 33225721 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.739;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2953;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.97;MQ0=10;MQRankSum=2.180;QD=0.55;ReadPosRankSum=1.695 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,7:43:6:51,6,0 Chr01 33436851 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,284 Chr01 33494491 . C T 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.82;MQ0=2;QD=6.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:95,9,0 Chr01 33494494 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.82;MQ0=2;QD=6.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:97,9,0 Chr01 33494514 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.36;MQ0=2;QD=2.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:55,6,0 Chr01 33517615 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr01 33590495 . A T 39.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:68,0,22 Chr01 33674993 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.839;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:59:59,0,541 Chr01 33682936 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.86;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,219 Chr01 33734587 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.9087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.51;MQ0=4;MQRankSum=-0.134;QD=0.77;ReadPosRankSum=1.692 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:55:55,0,675 Chr01 33734594 . C T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.275;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.9172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.58;MQ0=1;MQRankSum=-2.425;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:82:82,0,615 Chr01 33907951 . G A 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.026;DP=84;Dels=0.00;FS=8.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.48;MQ0=4;MQRankSum=-2.141;QD=2.38;ReadPosRankSum=-1.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,42:84:99:228,0,397 Chr01 33949651 . G T 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=33;Dels=0.00;FS=8.116;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=4.30;ReadPosRankSum=-4.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:170,0,939 Chr01 34017836 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.37;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:72:72,0,365 Chr01 34079160 . A T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,248 Chr01 34079253 . C A 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:110,0,25 Chr01 34079269 . A G 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:110,0,26 Chr01 34079280 . G A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr01 34079285 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:108,0,29 Chr01 34079288 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:108,0,29 Chr01 34079296 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr01 34079302 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,101 Chr01 34079329 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.80;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:59:59,0,183 Chr01 34079465 . A G 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=19.6591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.35;MQ0=2;MQRankSum=-2.873;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.885 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:42:99:146,0,1041 Chr01 34079534 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,148 Chr01 34079536 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,148 Chr01 34079556 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,104 Chr01 34079560 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,135 Chr01 34240747 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:104,0,67 Chr01 34240827 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 34253187 . G T 23.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:52,0,22 Chr01 34345779 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 34491211 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,146 Chr01 34571482 . A T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,183 Chr01 34648367 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=1.87;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:75:75,0,779 Chr01 34778882 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 34791363 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,101 Chr01 34794031 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,259 Chr01 34938979 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 34946806 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=12;Dels=0.00;FS=23.424;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=3.81;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:74:74,0,334 Chr01 35022162 . C A 74.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=18.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:102,12,0 Chr01 35022205 . T C 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.58;MQ0=0;QD=17.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:115,12,0 Chr01 35029250 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.08;MQ0=1;MQRankSum=-1.447;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.866 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:84:84,0,145 Chr01 35092361 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 35328083 . C A 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.226;DP=107;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.00;MQ0=27;MQRankSum=4.611;QD=1.25;ReadPosRankSum=-4.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:99,8:107:99:162,0,719 Chr01 35328181 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.91;MQ0=24;QD=0.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,44:44:6:49,6,0 Chr01 35519081 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 35539051 . C A 39.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:68,0,22 Chr01 36008390 . G T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.674;QD=7.78;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:145,0,352 Chr01 36062454 . G T 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.716;DP=45;Dels=0.00;FS=24.250;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.045;QD=3.17;ReadPosRankSum=-4.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:45:99:171,0,1344 Chr01 36445626 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,108 Chr01 36447785 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,104 Chr01 36491183 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.25;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 36601918 . T A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.76;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:51,6,0 Chr01 36601919 . T A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.76;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:51,6,0 Chr01 36601944 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5810;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.39;MQ0=1;MQRankSum=0.731;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:51,6,0 Chr01 36632708 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.273;DP=68;Dels=0.00;FS=22.957;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.447;QD=1.11;ReadPosRankSum=-4.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,8:68:99:104,0,2274 Chr01 36634789 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:17:66:66,0,413 Chr01 36780911 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 36780920 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 36780928 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 36796588 . G T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:134,0,26 Chr01 36796684 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 36951747 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.819;DP=29;Dels=0.00;FS=21.759;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=2.65;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:105,0,850 Chr01 36951827 . C A 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.135;DP=43;Dels=0.00;FS=2.481;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=3.48;ReadPosRankSum=-4.385 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:178,0,1305 Chr01 37010602 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.82;MQ0=2;MQRankSum=-2.834;QD=0.90;ReadPosRankSum=1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,29:32:57:57,0,109 Chr01 37150717 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.60;MQ0=41;MQRankSum=0.736;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,3:44:30:62,0,30 Chr01 37166001 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 37171513 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=3.13;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:72:72,0,403 Chr01 37179942 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 37219571 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 37226142 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.973;DP=29;Dels=0.00;FS=42.965;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.260;QD=2.58;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:103,0,905 Chr01 37308458 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,105 Chr01 37479891 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.55;MQ0=5;MQRankSum=0.358;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:61:61,0,87 Chr01 37497335 . T A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:109,0,64 Chr01 37497366 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 37620662 . C G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,241 Chr01 37647391 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 37702125 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 37779748 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.04;MQ0=0;MQRankSum=1.610;QD=4.85;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:130,0,548 Chr01 37779849 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;DP=48;Dels=0.00;FS=5.188;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.607;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,5:48:51:51,0,1507 Chr01 37827367 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 37881313 . A T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr01 37890837 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.18;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=1.91;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:53:53,0,159 Chr01 37985011 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr01 38081919 . G A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=4.15;ReadPosRankSum=2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:78:78,0,210 Chr01 38096114 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.88;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,217 Chr01 38133407 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,512 Chr01 38200492 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,221 Chr01 38226720 . G T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr01 38275800 . T A 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:134,0,24 Chr01 38318695 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=14;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:14:99:115,0,288 Chr01 38488964 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=1;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr01 38528993 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.839;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.845 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:50:50,0,563 Chr01 38766237 . C T 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr01 38766302 . C T 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.57;MQ0=1;QD=13.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:140,15,0 Chr01 38766303 . A G 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.57;MQ0=1;QD=13.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:140,15,0 Chr01 38777826 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr01 38867473 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr01 38874888 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,145 Chr01 38885452 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:107,0,369 Chr01 38889636 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:40:75:75,0,1265 Chr01 38925530 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,345 Chr01 38964253 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.43;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:54:54,0,559 Chr01 39045046 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 39156607 . T A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr01 39156610 . A T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr01 39156617 . G T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr01 39194989 . G T 181.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:210,0,20 Chr01 39198179 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 39225591 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,147 Chr01 39333740 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,344 Chr01 39341619 . C A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=2.79;ReadPosRankSum=-4.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:140,0,1234 Chr01 39455203 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,142 Chr01 39457686 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.821;DP=70;Dels=0.00;FS=17.068;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,8:70:99:107,0,2259 Chr01 39585896 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 39683240 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 39692354 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.774;DP=68;Dels=0.00;FS=18.205;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=0.54;ReadPosRankSum=-4.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,7:68:65:65,0,2284 Chr01 39692785 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.950;QD=6.04;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:137,0,396 Chr01 39692814 . C G 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.685;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.66;MQ0=1;MQRankSum=-1.950;QD=6.88;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:152,0,432 Chr01 39756134 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr01 39852765 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 39885247 . C T 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr01 39946798 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.1426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.00;MQ0=3;MQRankSum=2.057;QD=0.74;ReadPosRankSum=-2.057 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,2:47:63:63,0,157 Chr01 40047373 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 40150006 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr01 40150102 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr01 40165326 . G T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=2.77;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:142,0,1275 Chr01 40176545 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr01 40176642 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,296 Chr01 40212080 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 40212161 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;DP=19;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,532 Chr01 40235476 . T A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54:54,0,97 Chr01 40237133 . G T 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.222;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=5.36;ReadPosRankSum=-4.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:205,0,928 Chr01 40237213 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,253 Chr01 40315708 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr01 40320964 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:8:92:132,0,92 Chr01 40321061 . A G 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=16.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,277 Chr01 40329258 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:76:76,0,321 Chr01 40380375 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 40380380 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 40380385 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 40380386 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 40414601 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 40447334 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.328;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.046;QD=0.95;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:50:50,0,711 Chr01 40447431 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=21;Dels=0.00;FS=13.835;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,687 Chr01 40473578 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:57:57,0,990 Chr01 40473664 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:62,0,32 Chr01 40544932 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=12.884;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.10;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,501 Chr01 40545028 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 40579385 . C A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=16.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:164,0,99 Chr01 40775167 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr01 40775168 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr01 40775170 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 40789689 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 40833014 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:97,0,61 Chr01 40885821 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 40893756 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr01 40965379 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,169 Chr01 40980421 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,146 Chr01 40980518 . A G 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,296 Chr01 41018990 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.948 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:19:50:50,0,484 Chr01 41029025 . A T 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 Chr01 41070598 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;DP=15;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:67:67,0,420 Chr01 41070694 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 41118635 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 41118637 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 41118641 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 41118662 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 41118671 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 41167231 . C A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.731;DP=55;Dels=0.00;FS=13.193;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=2.07;ReadPosRankSum=-3.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,8:55:99:142,0,1708 Chr01 41183386 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 41240023 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 41356498 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.37;MQ0=2;MQRankSum=0.727;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:6:6:53,6,0 Chr01 41380486 . A T 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:70,0,27 Chr01 41417768 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:80:80,0,200 Chr01 41545711 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 41748751 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.84;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:76,6,0 Chr01 41815577 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;DP=51;Dels=0.00;FS=23.419;HaplotypeScore=1.9784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.52;ReadPosRankSum=-3.763 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,9:51:99:157,0,1463 Chr01 41815994 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.906;QD=5.05;ReadPosRankSum=-3.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:109,0,406 Chr01 41816858 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 41919064 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 41950587 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:51:51,0,137 Chr01 41971131 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,167 Chr01 42087395 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 42188305 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 42192759 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.117;DP=33;Dels=0.00;FS=27.668;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.634;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:55:55,0,1106 Chr01 42213525 . A T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.78;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,257 Chr01 42289990 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:111,0,347 Chr01 42303564 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 42345183 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 42353549 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 42440214 . C A 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:99,0,27 Chr01 42525236 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,141 Chr01 42561691 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,632 Chr01 42566294 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,176 Chr01 42624173 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,218 Chr01 42628566 . C G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr01 42638882 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 42712737 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 42790346 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr01 42812267 . T C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,177 Chr01 42812364 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,105 Chr01 42816972 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,407 Chr01 42821927 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr01 42858456 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 42925910 . C A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr01 42989637 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 43028830 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,251 Chr01 43060267 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:72:72,0,1289 Chr01 43078411 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,109 Chr01 43094338 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,337 Chr01 43620353 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:10:84:84,0,219 Chr01 43627084 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 43657022 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 43692412 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 43755064 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,351 Chr01 43794704 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.330;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.459;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:62:62,0,1384 Chr01 43795214 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:56:168,0,56 Chr01 43829066 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.735;DP=65;Dels=0.00;FS=14.359;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.598;QD=0.67;ReadPosRankSum=-4.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:72:72,0,2121 Chr01 43831881 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.841;DP=33;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.965;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:51:51,0,1063 Chr01 43872814 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 43974459 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr01 43976783 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 44011656 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 44025017 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,115 Chr01 44076687 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,165 Chr01 44086547 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 44169517 . A T 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;DP=12;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.90;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:195,0,187 Chr01 44199986 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.44;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:57:57,0,625 Chr01 44200070 . T A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:106,0,29 Chr01 44230597 . T A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr01 44289551 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 44430589 . G T 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 Chr01 44489986 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 44549300 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 44569378 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 44603495 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 44633304 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 44744732 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;DP=79;Dels=0.00;FS=21.434;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=0.55;ReadPosRankSum=-4.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:79:72:72,0,2539 Chr01 44784443 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,255 Chr01 44799437 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 44816383 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 44850785 . G T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:198,0,172 Chr01 44850871 . T A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:105,0,418 Chr01 44927674 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 44952973 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:115,0,308 Chr01 45027768 . A T 110.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:139,0,23 Chr01 45138156 . C A 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr01 45156785 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;DP=22;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:87:87,0,648 Chr01 45177062 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:64,0,51 Chr01 45184692 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr01 45194512 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,258 Chr01 45251951 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 45376438 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,182 Chr01 45377411 . T G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr01 45385093 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 45406057 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 45426515 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr01 45454842 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.464;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.394;QD=5.93;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:135,0,470 Chr01 45477700 . T G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr01 45481309 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 45601133 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr01 45633396 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,203 Chr01 45697731 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr01 45704763 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;DP=34;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=0.96;ReadPosRankSum=-2.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:61:61,0,980 Chr01 45705548 . G A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr01 45708795 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.453;QD=4.12;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:123,0,641 Chr01 45711806 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;DP=64;Dels=0.00;FS=14.456;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.409;QD=0.81;ReadPosRankSum=-4.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:64:80:80,0,2046 Chr01 45711810 . C A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;DP=74;Dels=0.00;FS=29.429;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.767;QD=1.73;ReadPosRankSum=-5.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,10:74:99:156,0,2263 Chr01 45832072 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 45832095 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 45832115 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 45840946 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 45862505 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,147 Chr01 45880242 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,202 Chr01 45941522 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 45962308 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 45963644 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 45963667 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr01 45999070 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 46006023 . G C 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=11;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:86:86,0,219 Chr01 46030404 . G T 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.28;MQ0=25;QD=2.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,3:29:9:116,9,0 Chr01 46051269 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr01 46118522 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr01 46126389 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 46140988 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,180 Chr01 46146055 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 Chr01 46223518 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 46223552 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 46223561 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 46233838 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 46233856 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 46233913 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 46235628 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 46237519 . C A 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr01 46245461 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.95;MQ0=58;QD=0.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,2:60:6:76,6,0 Chr01 46249561 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 46251996 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 46255032 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 46259225 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 46461329 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 46473501 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 46480835 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 46493461 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 46498602 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 46547679 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 46547911 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=28;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=2.81;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:107,0,843 Chr01 46561320 . C G 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.322;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.721;QD=6.43;ReadPosRankSum=2.565 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:292,0,1122 Chr01 46561327 . C T 260.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.721;QD=6.36;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:289,0,1141 Chr01 46561329 . T C 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.721;QD=6.38;ReadPosRankSum=2.080 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:290,0,1152 Chr01 46561344 . G A 258.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=-4.721;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:41:99:287,0,1166 Chr01 46561353 . A G 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.577;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.701;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:295,0,1131 Chr01 46561359 . G T 266.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.701;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.796 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:295,0,1137 Chr01 46561362 . A C 263.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.234;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.701;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:292,0,1138 Chr01 46561911 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 46561914 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 46563315 . C T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,97 Chr01 46563591 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.888;DP=41;Dels=0.00;FS=36.170;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.606;QD=0.95;ReadPosRankSum=-2.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:67:67,0,1371 Chr01 46594011 . T A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.266;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.674;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:148,0,350 Chr01 46627913 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.188;QD=2.25;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:98:98,0,958 Chr01 46638192 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 46658258 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.256;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=1.32;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:40:81:81,0,1280 Chr01 46658344 . T A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;DP=14;Dels=0.00;FS=6.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=6.05;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:113,0,337 Chr01 46682474 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 46796948 . T C 48.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:77,0,19 Chr01 46822892 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.07;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,257 Chr01 46847153 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:94,0,105 Chr01 46960618 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 46961530 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:97,0,66 Chr01 47008253 . G T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr01 47015406 . G T 143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:62:172,0,62 Chr01 47044991 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,271 Chr01 47121869 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,206 Chr01 47159416 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 47177952 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 47252136 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 47272572 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 47290223 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.966;DP=33;Dels=0.00;FS=18.612;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.852;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.048 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:33:58:58,0,1030 Chr01 47290723 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,616 Chr01 47375899 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:65,0,31 Chr01 47410829 . G T 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.991;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:154,0,273 Chr01 47411915 . C A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.225;QD=2.58;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:134,0,1274 Chr01 47427683 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 47427698 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 47432435 . T C 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=11.90;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:171,0,245 Chr01 47434504 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 47435789 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 47448338 . G A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr01 47458001 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 47459815 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr01 47481000 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,159 Chr01 47539043 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,256 Chr01 47540594 . T G 155.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:184,0,21 Chr01 47549686 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:72,0,31 Chr01 47551918 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 47599871 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 47677512 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr01 47767498 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 47768318 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 47802380 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:68,0,32 Chr01 47805414 . A T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr01 47906955 . T G 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr01 47952019 . C A 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.303;DP=79;Dels=0.00;FS=27.428;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=2.00;ReadPosRankSum=-5.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:68,11:79:99:186,0,2592 Chr01 47969786 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 47992759 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 48048625 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.003;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:115,0,288 Chr01 48048709 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=2.05;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:63:63,0,524 Chr01 48074973 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,99 Chr01 48141584 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,177 Chr01 48164972 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56:64,0,56 Chr01 48165068 . T A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:139,0,26 Chr01 48254717 . C A 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.27;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:228,0,244 Chr01 48264325 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:12:99:123,0,228 Chr01 48309765 . A T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=20.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:7:23:175,0,23 Chr01 48309861 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.165;DP=29;Dels=0.00;FS=24.100;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.722;QD=2.68;ReadPosRankSum=-3.147 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:106,0,852 Chr01 48330998 . T A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr01 48340981 . G T 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=19.86;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:90:207,0,90 Chr01 48347966 . T A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.174;DP=99;Dels=0.00;FS=18.837;HaplotypeScore=4.9725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.575;QD=0.51;ReadPosRankSum=-5.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,10:99:79:79,0,3259 Chr01 48350801 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.401;QD=1.69;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:99:101,0,1384 Chr01 48350887 . C A 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.076;QD=5.34;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:183,0,794 Chr01 48354974 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr01 48368913 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 48387902 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.560;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.195;QD=1.37;ReadPosRankSum=-2.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:53:99:101,0,1670 Chr01 48409426 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 48409430 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 48409431 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 48409438 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 48413674 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48413705 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48413724 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 48413916 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 48413926 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48413944 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 48447716 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 48464777 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 48467848 . G T 180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.718;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=5.32;ReadPosRankSum=-4.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:34:99:209,0,916 Chr01 48467928 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:81:81,0,1204 Chr01 48496951 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48534228 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.25;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:86:86,0,225 Chr01 48537226 . G A 287.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:316,24,0 Chr01 48541185 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 48541192 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr01 48541199 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 48548989 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 48549012 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 48549020 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 48550034 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 48554819 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,360 Chr01 48564449 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 48564476 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 48564515 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 48564525 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 48598802 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.534;DP=42;Dels=0.00;FS=46.075;HaplotypeScore=1.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=0.88;ReadPosRankSum=-3.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:65:65,0,1422 Chr01 48609598 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 48614137 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.413;DP=75;Dels=0.00;FS=20.691;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.339;QD=0.68;ReadPosRankSum=-4.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,8:75:79:79,0,2475 Chr01 48614233 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.046;QD=1.41;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:79:79,0,1156 Chr01 48670214 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:69,0,68 Chr01 48670255 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,68 Chr01 48670258 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:69,0,68 Chr01 48735700 . G A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:104,0,25 Chr01 48773160 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr01 48773265 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48779171 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:63,0,30 Chr01 48796106 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,139 Chr01 48823879 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 48855667 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,287 Chr01 48876165 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 48876581 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 48881825 . A T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr01 48884305 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 48887400 . A G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:138,0,59 Chr01 48887416 . A G 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:150,0,62 Chr01 48887453 . C G 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:151,0,66 Chr01 48888709 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 48897867 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 48906431 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr01 48906694 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 48913226 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48955789 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.887;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.546;QD=0.88;ReadPosRankSum=-1.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:52:52,0,647 Chr01 48955793 . G C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.890;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:74:74,0,653 Chr01 48956007 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.981;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=1.27;ReadPosRankSum=3.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:88:88,0,1512 Chr01 48966798 . A G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr01 48966954 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 48975336 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,267 Chr01 48975793 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 48992852 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 48992896 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 48995806 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 48995815 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 48997214 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 49002187 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,135 Chr01 49017839 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,139 Chr01 49018015 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr01 49022321 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr01 49025222 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 49025300 . G C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr01 49028701 . G A 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.15;MQ0=3;QD=9.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:102,9,0 Chr01 49028722 . T G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=0;QD=15.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:104,9,0 Chr01 49030015 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 49030018 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 49030041 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 49037732 . C T 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95:165,0,95 Chr01 49044050 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=44;Dels=0.00;FS=10.864;HaplotypeScore=19.9964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=1.34;ReadPosRankSum=2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,8:44:87:87,0,668 Chr01 49064821 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 49071635 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,332 Chr01 49074139 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr01 49093776 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 49100578 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 49131591 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 49141243 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 49209007 . C A 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=19.42;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:203,0,97 Chr01 49255712 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 49319190 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.141;QD=2.31;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:116,0,1201 Chr01 49381745 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,177 Chr01 49420402 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,176 Chr01 49479946 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 49488117 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,182 Chr01 49507318 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr01 49520861 . G T 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.492;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=6.99;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:140,0,394 Chr01 49593264 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 49601873 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,332 Chr01 49627147 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr01 49646211 . G T 143.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:172,0,23 Chr01 49646307 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.150;DP=29;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=3.75;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,6:29:99:137,0,835 Chr01 49673563 . G T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=16;Dels=0.00;FS=2.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=7.30;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:145,0,392 Chr01 49680598 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;DP=47;Dels=0.00;FS=2.384;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.017;QD=0.53;ReadPosRankSum=-0.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:53:53,0,1467 Chr01 49683500 . A G 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr01 49688230 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,148 Chr01 49688496 . G A 38.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:67,0,23 Chr01 49688578 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr01 49688718 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr01 49700879 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:121,0,208 Chr01 49716530 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 49722640 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;DP=22;Dels=0.00;FS=5.855;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.148 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,700 Chr01 49743524 . T C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.761;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:87:87,0,334 Chr01 49776516 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr01 49841021 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.340;DP=42;Dels=0.00;FS=41.816;HaplotypeScore=21.3088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:53:53,0,1344 Chr01 49857775 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 49900622 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 49901495 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 49918057 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:38:77:77,0,1167 Chr01 49918137 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;DP=64;Dels=0.00;FS=19.651;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.344;QD=0.73;ReadPosRankSum=-3.614 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:64:75:75,0,2019 Chr01 49941291 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 49941296 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 49966251 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:77:77,0,787 Chr01 49966939 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:51:51,0,799 Chr01 49989111 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;DP=20;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:66:66,0,648 Chr01 50008075 . A T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:93,0,29 Chr01 50008082 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr01 50008089 . T A 24.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:53,0,30 Chr01 50008162 . T G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:92:99,0,92 Chr01 50008164 . T C 83.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:19:112,0,19 Chr01 50008204 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:106,0,131 Chr01 50008209 . G A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,137 Chr01 50014050 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,100 Chr01 50042771 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 50064859 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr01 50066882 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80:80,0,327 Chr01 50066979 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50084793 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr01 50096999 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,109 Chr01 50106201 . G C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:109,0,397 Chr01 50106204 . G A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.632;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:100,0,409 Chr01 50114816 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.145;DP=23;Dels=0.00;FS=17.042;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.137;QD=1.16;ReadPosRankSum=2.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:55:55,0,703 Chr01 50115282 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.094;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:59:59,0,996 Chr01 50117770 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr01 50129713 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,109 Chr01 50129716 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,110 Chr01 50129740 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,110 Chr01 50142342 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr01 50157056 . G A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:134,0,142 Chr01 50160801 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr01 50166984 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:99,0,185 Chr01 50190435 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,187 Chr01 50271674 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,331 Chr01 50279822 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr01 50287877 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr01 50287973 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=9.44;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:151,0,289 Chr01 50290545 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 50331386 . G C 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:118,0,117 Chr01 50331389 . T C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:109,0,122 Chr01 50331407 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=10.47;ReadPosRankSum=-1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:112,0,127 Chr01 50333664 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr01 50336389 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;DP=14;Dels=0.00;FS=5.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,390 Chr01 50337707 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 50337763 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr01 50355729 . T C 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.041;DP=15;Dels=0.00;FS=4.832;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.184;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:148,0,359 Chr01 50371459 . A G 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=16.60;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:161,0,103 Chr01 50376848 . A G 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:147,0,65 Chr01 50407275 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 50407279 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 50429351 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr01 50429372 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 50431960 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 50431972 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 50432266 . T G 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr01 50432267 . T A 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr01 50432710 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr01 50434725 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 50441319 . T C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr01 50479700 . A T 162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.454;QD=8.14;ReadPosRankSum=0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:191,0,522 Chr01 50479716 . C T 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.278;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:174,0,481 Chr01 50479732 . G C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:103,0,448 Chr01 50479852 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:57,0,106 Chr01 50490571 . C G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr01 50490612 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr01 50490620 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr01 50490639 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:65,0,58 Chr01 50490967 . G A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=13.54;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:123,0,100 Chr01 50495634 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr01 50506996 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 50514460 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:97,0,67 Chr01 50522518 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,167 Chr01 50522525 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:66:66,0,145 Chr01 50527160 . C G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.967;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:50:50,0,333 Chr01 50537594 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 50541644 . C T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:102,0,102 Chr01 50541646 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:101,0,104 Chr01 50572308 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,135 Chr01 50572321 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,135 Chr01 50572344 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr01 50572366 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,149 Chr01 50572367 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,151 Chr01 50572667 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,62 Chr01 50574209 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr01 50576670 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 50583209 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 50616048 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr01 50652826 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr01 50654501 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50655384 . A T 75.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:104,0,23 Chr01 50655432 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr01 50655433 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:114,0,28 Chr01 50668041 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr01 50669959 . T C 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr01 50680281 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=17;Dels=0.00;FS=10.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.34;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,476 Chr01 50688910 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,293 Chr01 50701238 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,70 Chr01 50701555 . G C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 50704613 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50708020 . G C 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 Chr01 50734508 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 50734515 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 50738361 . T C 102.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=20.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:131,0,24 Chr01 50738635 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr01 50739545 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 50739609 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50739615 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50742204 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 50742544 . A G 316.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,11:29:99:345,0,603 Chr01 50742552 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=21;Dels=0.00;FS=2.750;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.452 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:49:49,0,641 Chr01 50742633 . G A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.266;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.204;QD=15.30;ReadPosRankSum=3.225 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:99:319,0,353 Chr01 50758101 . A T 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr01 50761600 . T A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr01 50763118 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr01 50779729 . G A 46.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:75,0,20 Chr01 50785106 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 50790358 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 50790495 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 50796881 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 50796904 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 50799231 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.460;DP=65;Dels=0.00;FS=10.691;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.138;QD=0.77;ReadPosRankSum=-4.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:78:78,0,2165 Chr01 50802665 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50804772 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 50805419 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,175 Chr01 50811946 . A T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:131,0,64 Chr01 50818134 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 50818824 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr01 50819170 . T G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr01 50828180 . G A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:54:138,0,54 Chr01 50855479 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:111,0,68 Chr01 50855684 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr01 50857003 . G A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.280;DP=28;Dels=0.00;FS=2.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:81:81,0,873 Chr01 50860950 . G A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=1.620;QD=7.37;ReadPosRankSum=0.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:124,0,331 Chr01 50860954 . A T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.53;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:125,0,334 Chr01 50864297 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 50880811 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 50888357 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr01 50905164 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr01 50905621 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 50926237 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50926241 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 50927232 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 50927340 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr01 50943208 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr01 50966489 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;DP=47;Dels=0.00;FS=21.581;HaplotypeScore=32.9888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.558;QD=1.31;ReadPosRankSum=-3.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:90:90,0,1495 Chr01 50996571 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:125,9,0 Chr01 50996607 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.67;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 51002536 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 51019938 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr01 51019945 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 51019984 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 51019987 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.82;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51020020 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.63;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr01 51052666 . A G 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:144,0,66 Chr01 51071946 . T G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8610;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.19;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,135 Chr01 51074302 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51077396 . T C 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr01 51081327 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 51085044 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.794;QD=3.45;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:80:80,0,447 Chr01 51104602 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51122342 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr01 51122385 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 51122402 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 51125298 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,326 Chr01 51125757 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51126849 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 51127191 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51140482 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51140944 . T A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr01 51147819 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr01 51147821 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr01 51151421 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51151477 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr01 51151793 . A G 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 Chr01 51154417 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,269 Chr01 51155165 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51181289 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51181290 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51206928 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51206930 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51206936 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51206937 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51206959 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51206978 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51206982 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51214986 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51215022 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51215024 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51217934 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 51217942 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 51217943 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr01 51217993 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr01 51224328 . G C 197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:226,18,0 Chr01 51224334 . G A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr01 51224652 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51224662 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 51232802 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51232812 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51233592 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51235528 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51237021 . G T 163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.796;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=3.90;ReadPosRankSum=-4.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,8:42:99:192,0,1262 Chr01 51237101 . C A 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.921;DP=47;Dels=0.00;FS=4.893;HaplotypeScore=1.9732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.665;QD=3.14;ReadPosRankSum=-4.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:176,0,1418 Chr01 51237210 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr01 51244353 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr01 51244405 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr01 51244410 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 51244428 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr01 51249893 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51262044 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr01 51266522 . A T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr01 51276201 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51276527 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr01 51283965 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,107 Chr01 51284878 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 51298398 . T C 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr01 51304830 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51304854 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51304862 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51304865 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51304879 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51306108 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51319711 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51327471 . A T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr01 51338430 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr01 51338457 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 51340274 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,295 Chr01 51340371 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:8:95:95,0,137 Chr01 51340861 . C A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr01 51352357 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51352382 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51355581 . A G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:99:100,0,224 Chr01 51355891 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.216;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.60;MQ0=10;MQRankSum=-2.336;QD=1.77;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,29:31:58:83,0,58 Chr01 51356375 . C A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr01 51356669 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51365672 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 51382752 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51382787 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51384270 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51384271 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51384632 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51384633 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51384685 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51384687 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr01 51384689 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51394336 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:74:74,0,525 Chr01 51399116 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,104 Chr01 51410884 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51415033 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr01 51415057 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51415062 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51415107 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51415119 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51431726 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr01 51431772 . C G 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr01 51434162 . C A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr01 51437076 . G T 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.87;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr01 51437124 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr01 51437125 . G C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr01 51437139 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr01 51437148 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.93;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 51441178 . T A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr01 51442998 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,176 Chr01 51443000 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,177 Chr01 51448251 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 51450969 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr01 51460445 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51463081 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51470355 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51470613 . G T 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:110,0,27 Chr01 51472559 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:68,0,63 Chr01 51473618 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr01 51473886 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 51475442 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51475450 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51475474 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51475501 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr01 51475510 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51479054 . A T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr01 51479061 . T A 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr01 51479062 . A G 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr01 51479076 . T C 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr01 51479096 . G A 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr01 51480115 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51480146 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51480194 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51480205 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51480407 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51484000 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51488951 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 51494619 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51494683 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51506753 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51508546 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51511823 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51511831 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr01 51523507 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr01 51527690 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,221 Chr01 51528017 . T C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51552305 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51558677 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51559145 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr01 51566239 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51566283 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51566527 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr01 51567655 . A T 186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.898;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.272;QD=10.38;ReadPosRankSum=-3.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:215,0,395 Chr01 51581225 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr01 51589201 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 51589246 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51589249 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51589550 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51594202 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51594384 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51594392 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51595504 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.41;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr01 51595513 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.41;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51595514 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.41;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51610946 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51611006 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 51611183 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:10:88:88,0,203 Chr01 51629091 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:57:57,0,580 Chr01 51631622 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr01 51633986 . G C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr01 51656781 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 51670443 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=4.027;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,379 Chr01 51679749 . A G 180.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:209,0,19 Chr01 51679770 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 Chr01 51679866 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51679870 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51679885 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51679901 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51679952 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:29:104,0,29 Chr01 51683500 . A G 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr01 51687665 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51691840 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51691884 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51691892 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51691907 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51727956 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,261 Chr01 51740330 . T G 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:187,15,0 Chr01 51759956 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51765645 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51777943 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51778009 . T G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 51779003 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51779042 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51789012 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 51791214 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51791227 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 51793364 . G A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=35;Dels=0.00;FS=3.218;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:90:90,0,1050 Chr01 51794502 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr01 51795686 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51796909 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51800596 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=1.03;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:53:53,0,798 Chr01 51811468 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr01 51813776 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.87;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,131 Chr01 51817627 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr01 51817656 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51817810 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.56;MQ0=0;MQRankSum=3.532;QD=1.45;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:82:82,0,1198 Chr01 51821501 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr01 51826292 . A C 133.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.71;MQ0=1;QD=19.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:162,15,0 Chr01 51835067 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,219 Chr01 51837469 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51846766 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51850074 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr01 51850081 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr01 51852847 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,98 Chr01 51863041 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51863044 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 51863045 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr01 51871521 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr01 51871530 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51871619 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr01 51872065 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51886756 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51886772 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr01 51891744 . A C 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr01 51892652 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr01 51895733 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr01 51896671 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr01 51899917 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.088;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.504;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:70:70,0,1029 Chr01 51900283 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 51901097 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,148 Chr01 51908577 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr01 51918033 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 51926058 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,202 Chr01 51926095 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,223 Chr01 51937517 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr01 51944038 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51944799 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr01 51944806 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr01 51944811 . G T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr01 51945163 . C A 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr01 51949326 . G T 62.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:105,9,0 Chr01 51952141 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 51952147 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 51960937 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 51961440 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:67:67,0,434 Chr01 51967085 . A T 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:67,0,27 Chr01 51968438 . G T 141.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:170,0,24 Chr01 51968534 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.099;QD=6.04;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:137,0,479 Chr01 51996202 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 52001341 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr01 52001391 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr01 52003135 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr01 52003136 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr01 52013064 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr01 52013810 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr01 52013815 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 52013897 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 52013905 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr01 52014047 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr01 52018027 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 52023918 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 52023925 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr01 52035599 . A T 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 Chr01 52046887 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,128 Chr01 52166661 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr01 52170117 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.403;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.341;QD=3.10;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:112,0,800 Chr02 18904 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,97 Chr02 57203 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 63455 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr02 103645 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 219005 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;DP=21;Dels=0.00;FS=13.757;HaplotypeScore=1.9658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:58:58,0,623 Chr02 237880 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.441;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,474 Chr02 280417 . A G 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr02 305816 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,294 Chr02 314184 . A G 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr02 315282 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 317497 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,112 Chr02 351209 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,129 Chr02 353983 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 355974 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 361059 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr02 467217 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 467229 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 468448 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 498898 . A T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;DP=22;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.141;QD=7.72;ReadPosRankSum=-3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:198,0,532 Chr02 504416 . G C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:105,0,29 Chr02 518010 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:57,0,107 Chr02 535145 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 540160 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 555003 . C T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=10;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:160,0,162 Chr02 560702 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.557;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,401 Chr02 568828 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.43;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:77:77,0,297 Chr02 592482 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.875;DP=36;Dels=0.00;FS=5.204;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.189;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:84:84,0,1114 Chr02 607236 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.579;DP=35;Dels=0.00;FS=2.530;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.024;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:85:85,0,1068 Chr02 705365 . G T 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:116,0,141 Chr02 800477 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 800506 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 800530 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 805645 . C A 584.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:613,48,0 Chr02 807913 . G A 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr02 807918 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 807927 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 818967 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 824592 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 849479 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 861791 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 861792 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 902347 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 905705 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 912655 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 913148 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,596 Chr02 913893 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 913962 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 915895 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 943459 . G C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 945014 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 947390 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 947402 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 954084 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:65,0,29 Chr02 957269 . A T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.459;DP=62;Dels=0.00;FS=44.288;HaplotypeScore=53.8067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=1.63;ReadPosRankSum=-4.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,8:62:99:129,0,1980 Chr02 961115 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 986874 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 987110 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr02 1009744 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 1029112 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 1030480 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1030551 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 1039397 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1054265 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 1059450 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1059453 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 1065567 . G C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=22;Dels=0.00;FS=10.160;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.894;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:52:52,0,644 Chr02 1066141 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 1070661 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1071497 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 1084813 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 1122889 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1125594 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1128696 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1128737 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1128754 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1131551 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 1140817 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 1140820 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 1141030 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1186031 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 1196644 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 1196683 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1196702 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1249374 . A G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=15;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.653;QD=7.32;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:138,0,369 Chr02 1251261 . A C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr02 1260321 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 1260349 . T G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:106,0,96 Chr02 1260394 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:116,0,244 Chr02 1263860 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 1263884 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1265072 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr02 1265081 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr02 1265085 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr02 1265118 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 1265141 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:69,0,33 Chr02 1265144 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr02 1272694 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr02 1272714 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr02 1275824 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 1276099 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:91:107,0,91 Chr02 1288315 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:99,0,102 Chr02 1301012 . C G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.78;ReadPosRankSum=1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:96:96,0,261 Chr02 1301022 . C T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:91:91,0,258 Chr02 1303442 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 1303529 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 1303555 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 1303568 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 1303572 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 1303592 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 1303602 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 1336018 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 1336043 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 1336053 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 1337220 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1338402 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 1338470 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 1362688 . A T 188.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:217,0,15 Chr02 1370227 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 1379208 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 1404614 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr02 1414503 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1414552 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1417983 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.72;MQ0=0;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:61,6,0 Chr02 1418054 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 1418072 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1418073 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1422199 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 1422738 . G T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.392;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:148,0,1236 Chr02 1442727 . T C 154.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:183,0,24 Chr02 1448858 . G A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr02 1448859 . G A 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr02 1448882 . G A 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr02 1458425 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,101 Chr02 1477235 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1479446 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 1479463 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 1492944 . A C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr02 1492949 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:101,0,60 Chr02 1497259 . T C 198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:227,0,59 Chr02 1506142 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 1510478 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1515273 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:98,0,58 Chr02 1531955 . A C 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr02 1536402 . G T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 1536639 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1540285 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 1577612 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,327 Chr02 1578235 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,143 Chr02 1595796 . T G 185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.466;QD=16.89;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:43:214,0,43 Chr02 1602247 . T G 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 Chr02 1602299 . T A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:205,15,0 Chr02 1602300 . T C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr02 1602330 . G A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 Chr02 1602574 . A G 148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.72;MQ0=1;MQRankSum=-2.520;QD=12.40;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:177,0,124 Chr02 1602599 . A G 148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.769;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.72;MQ0=1;MQRankSum=-2.520;QD=12.40;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:177,0,117 Chr02 1612838 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr02 1612896 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:58,0,32 Chr02 1619906 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1619922 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1646638 . G A 184.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:213,0,17 Chr02 1646641 . A T 180.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.84;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:209,0,17 Chr02 1646650 . A G 195.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.98;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:224,0,18 Chr02 1646657 . G A 195.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:224,0,19 Chr02 1646675 . A T 200.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:229,0,21 Chr02 1646679 . T C 201.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:230,0,19 Chr02 1655210 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:98,0,67 Chr02 1678614 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:106,0,28 Chr02 1678615 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:108,0,28 Chr02 1712009 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 1720131 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 1725200 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 1725344 . A T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,246 Chr02 1729697 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 1730572 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:67:67,0,70 Chr02 1731524 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,167 Chr02 1749799 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1753679 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1763207 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 Chr02 1819040 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1819132 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1838020 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1838511 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 1839589 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1840596 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1840664 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1840674 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1840994 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1841156 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1841216 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1853539 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 1853603 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1853616 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1884524 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 1899964 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 1899981 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1899990 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1900001 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 1900392 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.82;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:119,9,0 Chr02 1906236 . G T 397.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.470;QD=30.61;ReadPosRankSum=-1.737 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:2:424,0,2 Chr02 1907696 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 1910864 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 1938796 . T A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 1949344 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 1950595 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 1957646 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 1960262 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 2048842 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr02 2058227 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr02 2059214 . C A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;DP=51;Dels=0.00;FS=7.708;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,7:51:99:113,0,1616 Chr02 2090201 . T A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.334;QD=2.26;ReadPosRankSum=-3.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:96:96,0,930 Chr02 2101300 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,387 Chr02 2101396 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2102769 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 2137995 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:9:119,9,0 Chr02 2138006 . A G 106.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:15:135,0,15 Chr02 2197714 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2197811 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr02 2211266 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:71,0,61 Chr02 2211292 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:69:69,0,106 Chr02 2223879 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2223918 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 2225020 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 2225037 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 2225176 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 2236540 . G T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.524;DP=33;Dels=0.00;FS=4.747;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=3.02;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:128,0,990 Chr02 2236635 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.982;DP=68;Dels=0.00;FS=24.122;HaplotypeScore=2.9659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.051;QD=0.57;ReadPosRankSum=-3.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,7:68:67:67,0,2178 Chr02 2245441 . A G 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:147,0,24 Chr02 2247737 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 2247741 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2252889 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,298 Chr02 2252902 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,304 Chr02 2252949 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,296 Chr02 2255880 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2261550 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 2272983 . C A 373.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.899;DP=21;Dels=0.05;FS=15.849;HaplotypeScore=11.6314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.304;QD=17.80;ReadPosRankSum=1.975 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:99:402,0,303 Chr02 2273319 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:103,0,95 Chr02 2280108 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr02 2281430 . T A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:132,0,986 Chr02 2290855 . G T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.881;QD=14.64;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:160,0,137 Chr02 2305493 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr02 2313303 . T A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=40;Dels=0.00;FS=65.841;HaplotypeScore=33.9954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=1.87;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:103,0,1299 Chr02 2323153 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:64,0,33 Chr02 2323362 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 2350952 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr02 2360266 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 2373608 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2374839 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 2379578 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 2381334 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 2435772 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 2440950 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 2452256 . G A 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:75,0,26 Chr02 2452854 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 2455868 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 2455873 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 2456992 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 2459815 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2473473 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 2473475 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 2473476 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 2473529 . A C 133.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.01;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:162,15,0 Chr02 2490874 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 2505688 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2505690 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2505698 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 2505802 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 2511100 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 2511113 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2524040 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 2524128 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 2564667 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 2564675 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 2564686 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 2569409 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,165 Chr02 2614509 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 2620324 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2620610 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 2620638 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 2621958 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2632954 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 2662451 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 2667525 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2681376 . G A 53.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 2691485 . A T 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2691500 . A G 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2691514 . A T 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2691524 . T A 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2691525 . A T 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2691529 . G T 137.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:166,21,0 Chr02 2724903 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 2724913 . T G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 2724915 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 2724916 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 2724932 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 2724937 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 2724938 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2724947 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2728809 . C G 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 Chr02 2745686 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.05;MQ0=0;QD=3.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:80,6,0 Chr02 2754285 . G T 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:66,0,25 Chr02 2754655 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.344;QD=4.85;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:130,0,581 Chr02 2762024 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr02 2768344 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr02 2778949 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 2779045 . C A 145.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:174,0,23 Chr02 2801446 . T A 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=11.13;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:184,0,283 Chr02 2827106 . A G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 2860169 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 2860217 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 2865304 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.689;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.923 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,6:45:94:94,0,1461 Chr02 2865583 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 2883560 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 2889329 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2900000 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 2902811 . G C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.88;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 2903536 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 2903545 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 2904334 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 2928694 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 2936135 . A G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 2936165 . T C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr02 2936168 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr02 2936189 . G A 114.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.93;MQ0=0;QD=3.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:70,9,0 Chr02 2941278 . G A 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.93;MQ0=0;QD=3.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:70,9,0 Chr02 2941284 . A G 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.93;MQ0=0;QD=3.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:70,9,0 Chr02 2943500 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59:97,0,59 Chr02 2943671 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:63,0,32 Chr02 2944254 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 2944324 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 2953574 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 2966352 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 2972887 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr02 2996445 . A T 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:67,0,26 Chr02 3003065 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 3006012 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,218 Chr02 3006838 . T G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr02 3011936 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr02 3018803 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,170 Chr02 3040192 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3048042 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3056564 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr02 3056773 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 3057904 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr02 3057911 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 3063612 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 3073939 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,89 Chr02 3074522 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3074549 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3074941 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr02 3075102 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 3082009 . A C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:65,0,31 Chr02 3102599 . T A 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr02 3108848 . G A 141.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:170,0,21 Chr02 3108887 . T G 283.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:81:312,0,81 Chr02 3108974 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:63:135,0,63 Chr02 3109754 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:63:135,0,63 Chr02 3109777 . A T 340.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:99:369,0,123 Chr02 3111066 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 3111187 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 3130638 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,175 Chr02 3130960 . A T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;DP=32;Dels=0.00;FS=5.281;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.128;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.218 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:97:97,0,960 Chr02 3131046 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.729;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.144;QD=2.48;ReadPosRankSum=-3.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:99:120,0,1160 Chr02 3137564 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr02 3138911 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,185 Chr02 3141224 . C T 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:228,0,58 Chr02 3146821 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:70:70,0,513 Chr02 3149586 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 3149664 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3154220 . C A 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 Chr02 3162157 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 3172425 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr02 3214749 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,214 Chr02 3217242 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 3238767 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3252865 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3252891 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 3252952 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 3256261 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3260040 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:63,0,33 Chr02 3263606 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 3266305 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3266370 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 3269155 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3269159 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 3289957 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 3290894 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 3307160 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 3316473 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3317033 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=2;MQRankSum=0.959;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:51:51,0,135 Chr02 3317041 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.58;MQ0=2;MQRankSum=0.959;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.826 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:51:51,0,133 Chr02 3323234 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3323236 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3325540 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;DP=15;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:66:66,0,407 Chr02 3325579 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=17;Dels=0.00;FS=7.186;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.215;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:63:63,0,426 Chr02 3325932 . T G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.17;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,15:20:28:105,0,28 Chr02 3348157 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3348161 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3348163 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3361208 . C T 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr02 3361516 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3361524 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 3361880 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr02 3378564 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3381372 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 3389042 . A C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 3394431 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 3407671 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3407674 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3407682 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.17;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 3410589 . T A 96.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3452728 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,147 Chr02 3465987 . G T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr02 3470503 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3471913 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 3479593 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3509797 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 3510978 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 3532699 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3538896 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3538940 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3538949 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 3564193 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,140 Chr02 3579440 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 3579442 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 3582173 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 3584993 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr02 3593760 . G C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 3593794 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3593821 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 3593875 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 3594984 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3594989 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 3595003 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 3599433 . G C 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr02 3649713 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,245 Chr02 3653467 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 3653488 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr02 3653530 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3653533 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 3670755 . C A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.031;QD=11.62;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:156,0,212 Chr02 3673615 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr02 3673618 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 3673638 . T A 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 3673649 . C G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 3677163 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 3678872 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.630;DP=34;Dels=0.00;FS=9.779;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.401;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:52:52,0,1064 Chr02 3678958 . C A 179.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:208,0,20 Chr02 3681203 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 3687874 . C T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr02 3687935 . A G 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr02 3688953 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 3711296 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 3711604 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3728707 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 3728731 . T G 93.28 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:87:87,0,166 Chr02 3794989 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3818818 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 3832651 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr02 3832817 . C A 87.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 3860878 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3907899 . G T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr02 3920581 . G A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr02 3920719 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 3934278 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr02 3934283 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr02 3934308 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr02 3937931 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3937932 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 3937968 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 3937977 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 3951283 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 3951340 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 3962657 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr02 3967642 . G T 34.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4028053 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 4041008 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4041009 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4043810 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr02 4045595 . C T 98.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4080799 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 4086672 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,103 Chr02 4086789 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 4092023 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 4093313 . T A 46.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 4217844 . G T 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;DP=55;Dels=0.00;FS=10.172;HaplotypeScore=1.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.012;QD=2.87;ReadPosRankSum=-4.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,9:55:99:186,0,1606 Chr02 4217924 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:89:135,0,89 Chr02 4227790 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84:84,0,212 Chr02 4240305 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4250176 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4250177 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 4250182 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 4256036 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,331 Chr02 4277679 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr02 4277732 . C T 157.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:186,15,0 Chr02 4278757 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4278789 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 4280332 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 4280333 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4301920 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.1360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.59;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:52:52,0,288 Chr02 4338850 . T C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 4339054 . C T 248.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:277,21,0 Chr02 4341886 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.330;DP=48;Dels=0.00;FS=18.773;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:48:51:51,0,1591 Chr02 4356257 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4361600 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 4367118 . A C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 4380054 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 4384279 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 4390212 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4393419 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 4421009 . T A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 4421063 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 4421101 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 4421123 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 4424520 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 4424584 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 4450709 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 4482423 . A T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.858;QD=4.80;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:129,0,576 Chr02 4499620 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4499625 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 4499627 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4499996 . A T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,137 Chr02 4500092 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,144 Chr02 4500492 . C A 121.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.31;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:7:149,0,7 Chr02 4506714 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4510351 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4511486 . T G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:112,0,65 Chr02 4514926 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 4514950 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4529783 . A C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 4529786 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:68,0,63 Chr02 4566425 . A C 42.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:71,0,24 Chr02 4596136 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 4598320 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 4602702 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4609222 . G C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 4609226 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 4609229 . G C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 4609285 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr02 4611991 . G A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.899;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:126,0,360 Chr02 4611992 . C G 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.909;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.899;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:126,0,357 Chr02 4614540 . A T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.41;MQ0=1;QD=6.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:151,12,0 Chr02 4618060 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 4621455 . G A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:98:98,0,201 Chr02 4626602 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr02 4626999 . T A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr02 4627010 . T A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 4638957 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 4658195 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4717466 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4730225 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 4731991 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 4736216 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4736217 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4742337 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 4744057 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 4744542 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr02 4747781 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 4760360 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 4760385 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr02 4765299 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 4765381 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 4775163 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 4775166 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 4775168 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 4775178 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 4775192 . G C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 4836819 . G T 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:139,0,24 Chr02 4843869 . A G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:103,0,95 Chr02 4847703 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 4848369 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4849633 . A C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 4860906 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4860942 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 4862000 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 4863142 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 4863889 . T G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:90,0,101 Chr02 4865839 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr02 4869202 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:56:56,0,109 Chr02 4872139 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,173 Chr02 4875088 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4892138 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:108,0,68 Chr02 4892163 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr02 4892397 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 4899057 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 4899829 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=53;Dels=0.00;FS=14.792;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=3.166;QD=1.52;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:53:99:109,0,1570 Chr02 4899990 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr02 4905837 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr02 4907454 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:68,0,52 Chr02 4936046 . T A 188.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:217,18,0 Chr02 4938088 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4967368 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 4968487 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 4970182 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr02 4970551 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 4981705 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 4982139 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:63,0,30 Chr02 4986916 . G A 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.280;DP=90;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=65.7777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.64;MQ0=4;MQRankSum=-2.935;QD=1.28;ReadPosRankSum=4.607 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,24:90:99:143,0,432 Chr02 4986918 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=72.7110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=5;MQRankSum=1.803;QD=0.24;ReadPosRankSum=1.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,6:99:52:52,0,478 Chr02 4986930 . A C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.328;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=79.4410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.66;MQ0=5;MQRankSum=-5.254;QD=0.52;ReadPosRankSum=-3.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,82:99:80:80,0,410 Chr02 4991176 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:57:57,0,542 Chr02 4995788 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 5012244 . A T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:249,18,0 Chr02 5018157 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr02 5033596 . C A 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=19.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:40:207,0,40 Chr02 5033610 . T C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:49:102,0,49 Chr02 5033629 . G A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.40;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:46:136,0,46 Chr02 5033721 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5043545 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 5179771 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.18;MQ0=3;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:57,6,0 Chr02 5179789 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.18;MQ0=3;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:57,6,0 Chr02 5585611 . C T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:150,0,164 Chr02 5591487 . T G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,139 Chr02 5606126 . G A 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQ0=0;MQRankSum=2.388;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:198,0,211 Chr02 5606136 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=3.9974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQ0=0;MQRankSum=1.896;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:63:63,0,446 Chr02 5648466 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.37;MQ0=4;QD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:57,6,0 Chr02 5654109 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 5654117 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 5654141 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 5712300 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 5712327 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 5712339 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 5712342 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 5712350 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 5712368 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 5712376 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 5712379 . G C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 5715833 . A G 34.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:63,0,28 Chr02 5719298 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5764724 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 5778966 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 5779063 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr02 5792812 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 5792823 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 5792830 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 5792837 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 5792839 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5792842 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 5792851 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5792858 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5792902 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 5855291 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 5897222 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 5897253 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 5916263 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr02 5918305 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:65,0,63 Chr02 6025321 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,104 Chr02 6116957 . C T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=28.48;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:199,15,0 Chr02 6117536 . C T 217.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:246,0,18 Chr02 6120322 . C A 164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.148;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=3.92;ReadPosRankSum=-4.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,8:42:99:193,0,1271 Chr02 6378975 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr02 6417053 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 6417162 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr02 6431516 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 6477997 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,72 Chr02 6482986 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 6500212 . G C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:112,0,67 Chr02 6636605 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 6657578 . A C 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:61,0,29 Chr02 6668368 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,91 Chr02 6668577 . G A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:110,0,69 Chr02 6674306 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 6755737 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 6758111 . C A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr02 6762843 . T C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.52;MQ0=0;QD=7.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:70,9,0 Chr02 6762895 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=113;Dels=0.00;FS=6.856;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.03;MQ0=0;MQRankSum=-3.015;QD=0.24;ReadPosRankSum=8.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:82,31:113:55:55,0,1663 Chr02 6762955 . T C 1983.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=102;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.13;MQ0=0;QD=19.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,100:100:99:2012,240,0 Chr02 6762957 . T C 1947.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=101;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7458;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.08;MQ0=0;QD=19.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,99:99:99:1976,237,0 Chr02 6762976 . A G 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.690;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.65;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:119,0,221 Chr02 6762977 . G A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.361;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.65;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:119,0,221 Chr02 6776138 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 6836164 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 6861689 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 6876316 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,107 Chr02 6884432 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,108 Chr02 6896222 . A T 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 7153859 . A C 79.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:20:108,0,20 Chr02 7193538 . G T 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.75;MQ0=0;QD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:121,12,0 Chr02 7318860 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 7326950 . G T 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;DP=13;Dels=0.00;FS=23.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=9.60;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:153,0,292 Chr02 7327142 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr02 7328589 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 7329655 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,333 Chr02 7331971 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 7380131 . G A 69.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.92;MQ0=3;MQRankSum=0.189;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,19:23:12:97,12,0 Chr02 7380148 . C T 69.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7219;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.65;MQ0=4;MQRankSum=0.189;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.063 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,19:24:12:97,12,0 Chr02 7406067 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.13;MQ0=0;QD=3.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:65,6,0 Chr02 7407310 . C A 168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=26.646;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=15.34;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:197,0,171 Chr02 7435402 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 7436502 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 7558504 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.55;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr02 7558548 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.55;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr02 7598535 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.48;MQ0=2;MQRankSum=-0.736;QD=2.73;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:30:50,0,30 Chr02 7623484 . G A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.23;MQ0=1;QD=15.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:91,9,0 Chr02 7626478 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 7630630 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 7630641 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 7630674 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.04;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 7633000 . T G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 7633066 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 7633076 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 7633084 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 7633587 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 7633640 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 7633665 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 7633775 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 7633791 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 7633792 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 7639764 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 7645404 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 7694842 . T C 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.87;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr02 7756835 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 7756860 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 7845087 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 7845089 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 7845091 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 7901280 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 7908587 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 7940603 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 7948185 . T A 29.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:58,0,31 Chr02 7948258 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:54,0,32 Chr02 8070576 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 8091882 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 8126159 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.72;MQ0=7;MQRankSum=3.899;QD=0.60;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,25:36:6:49,6,0 Chr02 8126162 . A T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.79;MQ0=7;MQRankSum=2.566;QD=0.59;ReadPosRankSum=-1.167 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,6:37:6:49,6,0 Chr02 8200460 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.72;MQ0=0;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:61,6,0 Chr02 8200468 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.72;MQ0=0;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:61,6,0 Chr02 8200471 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.72;MQ0=0;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:61,6,0 Chr02 8200494 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.16;MQ0=0;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:61,6,0 Chr02 8200502 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 8200522 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 8237555 . A C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr02 8247675 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 8280814 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 8287996 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,215 Chr02 8334736 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr02 8334798 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr02 8334803 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 8334813 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr02 8353542 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 8353603 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 8372826 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 8372886 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 8430945 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 8466074 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 8468492 . T G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 8468528 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 8468540 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 8472999 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 8480545 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 8480629 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 8500455 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 8503221 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 8507350 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 8531573 . T C 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.03;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:74,9,0 Chr02 8531588 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4968;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.03;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:74,9,0 Chr02 8547685 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 8553441 . G T 52.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.52;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:11:80,0,11 Chr02 8553564 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:78,6,0 Chr02 8553582 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 8553583 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 8664744 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.27;MQ0=5;MQRankSum=0.727;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:6:51,6,0 Chr02 8674773 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 8680449 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 8680474 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 8680490 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 8687790 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 8687812 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 8729468 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 8867371 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,102 Chr02 8867710 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 8894234 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:65,0,33 Chr02 8971916 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 9003623 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.74;MQ0=8;QD=2.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:57,6,0 Chr02 9042316 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 9094091 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 9169711 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 9174932 . T C 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr02 9291259 . C A 29.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.69;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:24:58,0,24 Chr02 9322761 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 9483090 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 9531641 . A G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 9557619 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 9597420 . G T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.048;DP=74;Dels=0.00;FS=19.639;HaplotypeScore=3.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.182;QD=1.82;ReadPosRankSum=-5.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,10:74:99:163,0,2294 Chr02 9602600 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 9602868 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,509 Chr02 9602964 . C A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:167,0,100 Chr02 9633992 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 9634023 . T G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 9644229 . G T 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.186;QD=11.52;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:155,0,198 Chr02 9649255 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 9680710 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 9702085 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 9702091 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 9702113 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 9705900 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 9795595 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 9822096 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 9825709 . G T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 9825742 . A C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 9825752 . A C 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:106,0,26 Chr02 9843791 . C T 31.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.534;DP=60;Dels=0.00;FS=32.142;HaplotypeScore=1.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.577;QD=0.81;ReadPosRankSum=-4.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,8:60:77:77,0,1929 Chr02 10198451 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.915;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=2.92;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:151,0,1313 Chr02 10217070 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.71;MQ0=0;QD=5.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:79,6,0 Chr02 10217607 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 10265375 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,218 Chr02 10346936 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 10440264 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 10440307 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 10471869 . C A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.55;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr02 10486531 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 10486572 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 10486574 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 10486724 . T G 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 Chr02 10517165 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 10518962 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 10569019 . T G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.01;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:55:100,0,55 Chr02 10575525 . T G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=1.87;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:60:60,0,495 Chr02 10620239 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 10620263 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 10636157 . A G 195.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:224,18,0 Chr02 10636165 . A G 196.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:225,18,0 Chr02 10636170 . G T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr02 10636176 . G A 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr02 10636211 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr02 10636217 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr02 10649940 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,173 Chr02 10650032 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.080;DP=28;Dels=0.00;FS=8.418;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=2.88;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:109,0,816 Chr02 10702780 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,202 Chr02 10709978 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 10721481 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 10738876 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 10738926 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 10751190 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 10837317 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 10838787 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 10857541 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 10857558 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 10860898 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 10860920 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 10860921 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 10860935 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 10867619 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 10867625 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 10931960 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 10955291 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 10955319 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.67;MQ0=16;QD=2.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,2:18:6:77,6,0 Chr02 10967965 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 10982580 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 10982920 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr02 11021537 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11024444 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr02 11063296 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.870;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.975;QD=4.16;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:124,0,664 Chr02 11098126 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 11098132 . G A 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 11160467 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 11160471 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 11163948 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr02 11164017 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr02 11165260 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:64,0,63 Chr02 11167097 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,243 Chr02 11167680 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 11168550 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 11168559 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 11202207 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 11202252 . G A 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr02 11202269 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 11202302 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 11213532 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 11213537 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 11227853 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11227875 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11227916 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 11240142 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11278656 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.38;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 11329770 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 11330685 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 11370235 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 11395411 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 11407949 . A G 32.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.448;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:13:61,0,13 Chr02 11418725 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 11449338 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 11450684 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 11450819 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 11455414 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,142 Chr02 11457391 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 11489903 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11510524 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 11532258 . T A 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.103;DP=20;Dels=0.00;FS=18.512;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=7.24;ReadPosRankSum=-3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:173,0,501 Chr02 11537541 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 11576467 . G A 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr02 11578807 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 11616983 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11616988 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11616993 . A G 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 11660522 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11660528 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11660554 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 11660557 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 11660561 . T G 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11753872 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 11753896 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 11846514 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11848706 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11854578 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 11859455 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=1.08;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:23:53:53,0,645 Chr02 11885742 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 11890847 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 11906945 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 11911451 . A G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:91,0,67 Chr02 11929349 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 11930229 . A T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:151,0,26 Chr02 11949936 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 11949985 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 11949993 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 11954741 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:99,0,101 Chr02 11954798 . G A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:106,0,107 Chr02 11968271 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,251 Chr02 11968366 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 11994001 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;DP=26;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.162;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:81:81,0,813 Chr02 11994012 . G C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;DP=27;Dels=0.00;FS=5.541;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-3.174;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:80:80,0,866 Chr02 12004971 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr02 12004987 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr02 12040400 . A G 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:61,0,27 Chr02 12040427 . A G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:91,0,30 Chr02 12040436 . C T 62.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:91,0,27 Chr02 12045335 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 12058069 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 12061289 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;DP=55;Dels=0.00;FS=14.416;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.290;QD=1.20;ReadPosRankSum=-4.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,7:55:94:94,0,1710 Chr02 12172530 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 12250679 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 12250681 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 12306388 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 12432238 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 12433091 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 12501824 . A T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr02 12509314 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 12509508 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 12530847 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 12575791 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 12575801 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 12588953 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.10;MQ0=1;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:54,6,0 Chr02 12619854 . G T 73.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.47;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:20:102,0,20 Chr02 12645395 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.72;MQ0=4;MQRankSum=-1.418;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:55:55,0,82 Chr02 12645402 . T G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.72;MQ0=4;MQRankSum=1.208;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:55:82,0,55 Chr02 12648851 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 12648852 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 12660873 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 12663723 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 12693469 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.64;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr02 12693480 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.64;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr02 12693553 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.64;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr02 12745093 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 12804305 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 12809736 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 12823378 . G A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:52:238,0,52 Chr02 12825407 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 12835978 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 12902435 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 12917690 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 13024677 . G A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.32;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr02 13086694 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13123116 . G T 171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.223;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.452;QD=4.91;ReadPosRankSum=-4.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:200,0,1003 Chr02 13135616 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr02 13165931 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 13182125 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,325 Chr02 13240080 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 13240127 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 13240135 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 13240143 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 13240145 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 13240161 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 13240170 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 13249213 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 13249232 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 13251956 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13253893 . T C 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr02 13263375 . A C 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:65,0,28 Chr02 13263377 . A G 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:65,0,28 Chr02 13277147 . A G 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr02 13285033 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 13313770 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 13317636 . T C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 13363560 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 13363561 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 13365582 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13369195 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13369215 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13387992 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 13451151 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 13493814 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 13505811 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 13505816 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 13518245 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 13530178 . C T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr02 13626819 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 13626861 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 13626866 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 13634738 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 13655361 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 13732555 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 13732607 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 13735167 . C A 190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.604;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.521;QD=12.72;ReadPosRankSum=-3.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:219,0,278 Chr02 13789202 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;DP=23;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.041;QD=2.56;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:87:87,0,662 Chr02 13828955 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:101,0,56 Chr02 13848500 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,112 Chr02 13850461 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 13886186 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr02 13999266 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 14015687 . A G 127.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.35;MQ0=0;QD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:156,18,0 Chr02 14015692 . A C 121.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.35;MQ0=0;QD=20.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:150,18,0 Chr02 14015719 . G A 127.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.35;MQ0=0;QD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:156,18,0 Chr02 14024082 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 14041349 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 14221479 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 14226698 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 14230698 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.107;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:57,0,132 Chr02 14230710 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.107;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:57,0,147 Chr02 14230711 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.107;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.064 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:57,0,147 Chr02 14230750 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.107;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:57:57,0,133 Chr02 14249230 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14249259 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 14249286 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 14267865 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 14280778 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 14312904 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 14334982 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 14358838 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 14447864 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 14447955 . T C 88.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14580110 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14580111 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14580112 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14580113 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14580124 . A G 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 14681635 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 14681647 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 14746652 . T C 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr02 14816336 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 14842752 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:48,6,0 Chr02 14842755 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:48,6,0 Chr02 14842759 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:48,6,0 Chr02 14842768 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.48;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:48,6,0 Chr02 14885783 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 14907501 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 14944002 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 14944018 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 14944224 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 14951358 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 14951396 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 14957155 . G T 146.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:175,0,21 Chr02 14957225 . C T 164.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.46;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:193,0,24 Chr02 15091341 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 15091352 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 15091383 . T A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.01;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr02 15168436 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 15208533 . C T 50.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.41;MQ0=1;MQRankSum=-0.731;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:21:79,0,21 Chr02 15230557 . G C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.09;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:53,6,0 Chr02 15239596 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 15259684 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 15261798 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 15345799 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 15362543 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.512;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.35;MQ0=4;MQRankSum=1.271;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.023 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,10:27:6:57,6,0 Chr02 15362565 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.23;MQ0=3;QD=3.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,5:8:6:57,6,0 Chr02 15365797 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.669 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:60:108,0,60 Chr02 15365814 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:60:108,0,60 Chr02 15365819 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:61:108,0,61 Chr02 15365824 . G C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:60:108,0,60 Chr02 15365825 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:61:108,0,61 Chr02 15365828 . T A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:54:108,0,54 Chr02 15365843 . T A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:55:108,0,55 Chr02 15365858 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.758;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.007 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:53:108,0,53 Chr02 15365859 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.43;MQ0=0;MQRankSum=-2.364;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,26:28:53:108,0,53 Chr02 15391578 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.85;MQ0=0;QD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:67,6,0 Chr02 15618156 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.62;MQ0=1;MQRankSum=0.740;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:66:66,0,100 Chr02 15618184 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.62;MQ0=1;MQRankSum=0.740;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:66:66,0,100 Chr02 15658076 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 15674166 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 15674169 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 15674544 . T C 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.83;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 Chr02 15674608 . T A 127.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.86;MQ0=0;QD=25.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:156,15,0 Chr02 15692390 . T C 38.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.43;MQ0=4;MQRankSum=1.495;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:16:67,0,16 Chr02 15716311 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 15717219 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 15732555 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.70;MQ0=5;QD=6.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:103,9,0 Chr02 15750293 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 15789146 . T C 161.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:190,0,24 Chr02 15789155 . G A 150.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:179,0,23 Chr02 15789160 . A G 146.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.47;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:175,0,21 Chr02 15813728 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr02 15832451 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 15893645 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 15893646 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 16047070 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 16128014 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 16128031 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 16128044 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 16128051 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 16128491 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 16128493 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 16130378 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 16130405 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 16165436 . G C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 16166914 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;DP=42;Dels=0.00;FS=11.735;HaplotypeScore=2.7331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.361;QD=1.83;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:105,0,1270 Chr02 16166996 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 16219933 . A T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.77;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:65,9,0 Chr02 16305067 . G A 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.77;MQ0=2;QD=11.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:117,12,0 Chr02 16332995 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 16343463 . C A 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr02 16451991 . C T 49.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:78,0,21 Chr02 16495210 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 16558121 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,137 Chr02 16653995 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 16654033 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 16673216 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 16676316 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 16721480 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 16756171 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 16756219 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 16832825 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 16834529 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 16834538 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 16884200 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 16941365 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 16941444 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 16967332 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 17005898 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 17023833 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 17058540 . G A 41.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:70,0,21 Chr02 17059470 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 17085752 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr02 17085753 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr02 17192011 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 17192266 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 17199067 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 17199116 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 17251045 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:60:60,0,562 Chr02 17254163 . A T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr02 17254199 . T A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr02 17344520 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 17344529 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 17344553 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 17350722 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 17373476 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 17430607 . A T 521.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=27.43;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:10:549,10,0 Chr02 17431558 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 17549833 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr02 17574408 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 17578768 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,147 Chr02 17625019 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr02 17646322 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 17650670 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.46;MQ0=2;MQRankSum=-0.358;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:43:71,0,43 Chr02 17664570 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 17675348 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.23;MQ0=1;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:61,6,0 Chr02 17764512 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 17772140 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 17803791 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.86;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 17809474 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.47;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.26;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:119,9,0 Chr02 17809625 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 17812963 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 17857310 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 17863300 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 17958804 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 18002508 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 18002536 . T G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 18002544 . T G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 18009939 . C G 32.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.93;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:61,0,22 Chr02 18024445 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 18031277 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.933;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.400;QD=8.05;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:141,0,323 Chr02 18031785 . G A 35.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:64,0,22 Chr02 18031786 . C A 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:61,0,29 Chr02 18031835 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 18031849 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 18178025 . A T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr02 18178053 . A T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr02 18236837 . G A 148.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:177,15,0 Chr02 18268033 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 18288879 . A G 30.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.727;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:14:59,0,14 Chr02 18288880 . T C 30.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.727;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:14:59,0,14 Chr02 18327639 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.67;MQ0=16;QD=1.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,3:18:6:49,6,0 Chr02 18398452 . G C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.87;MQ0=0;QD=3.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:9:83,9,0 Chr02 18411295 . C T 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr02 18428123 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 18599928 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 18624219 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:74,6,0 Chr02 18628683 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,164 Chr02 18665224 . A C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr02 18665225 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr02 18665250 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 18783828 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr02 18785325 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 18785400 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 18826990 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 18844583 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 18856782 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 18875111 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;DP=44;Dels=0.00;FS=2.401;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.118;QD=2.47;ReadPosRankSum=-3.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:137,0,1331 Chr02 18898654 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 18951666 . C T 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr02 18951976 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 18951983 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 18951993 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 18951997 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 18968742 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 18979351 . A T 1075.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:84:1104,84,0 Chr02 18980835 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 19034535 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 19034554 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19050144 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 19078186 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19078234 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 19084422 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19084440 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 19128005 . C T 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.37;MQ0=8;MQRankSum=-0.537;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.611 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,18:20:12:115,12,0 Chr02 19163636 . C T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 19163849 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 19163863 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19173649 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19173674 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 19255849 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19256656 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.69;MQ0=7;QD=2.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:50,6,0 Chr02 19256666 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.69;MQ0=7;QD=2.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:50,6,0 Chr02 19261327 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 19281681 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 19287220 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19304164 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 19308057 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,220 Chr02 19490237 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 19490273 . C T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 19557149 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=1.03;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:59:59,0,937 Chr02 19569908 . A C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr02 19569943 . T A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr02 19582172 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 19635748 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 19641611 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19641616 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19645371 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 19668961 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 19669290 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 19669313 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,101 Chr02 19723519 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19832454 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 19880213 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 19882069 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 19882135 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 19901603 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 19979886 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 19979900 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr02 19979927 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 19979932 . T C 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 20010077 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=56;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.649;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:61:61,0,1860 Chr02 20021600 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 20021621 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 20021748 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,411 Chr02 20023470 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 20023525 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 20023531 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 20023986 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 20026001 . T C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr02 20031948 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 20032011 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 20072428 . C G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.22;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 20087646 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.67;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 20099457 . T G 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr02 20099477 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 20099520 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:121,9,0 Chr02 20100071 . C G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 20177042 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 20204956 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,143 Chr02 20215634 . C A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr02 20215647 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr02 20251985 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 20252009 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr02 20252018 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 20283041 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.17;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr02 20328922 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=3.29;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:94:94,0,581 Chr02 20330837 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.098;DP=23;Dels=0.00;FS=14.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.12;MQ0=0;MQRankSum=-3.905;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:54:54,0,519 Chr02 20336169 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr02 20344548 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 20347513 . C A 74.18 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:115,9,0 Chr02 20391658 . C G 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr02 20393487 . G T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 20394565 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,138 Chr02 20410525 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 20410580 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 20434854 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 20434877 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 20438048 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.49;MQ0=0;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:59,6,0 Chr02 20438051 . A C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.49;MQ0=0;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:59,6,0 Chr02 20438070 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.49;MQ0=0;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:59,6,0 Chr02 20438390 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 20474154 . G A 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:249,21,0 Chr02 20474172 . A G 227.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.86;MQ0=0;QD=32.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:256,21,0 Chr02 20483407 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 20483427 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 20510720 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr02 20521482 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.84;MQ0=5;MQRankSum=1.368;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,4:13:9:103,9,0 Chr02 20521483 . G A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.84;MQ0=5;MQRankSum=0.922;QD=6.10;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,4:13:9:107,9,0 Chr02 20667105 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 20699137 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 20704909 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 20707004 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 20735761 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.76;MQ0=1;QD=4.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:52,6,0 Chr02 20745135 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 20766443 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 20766448 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 20774068 . A C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=3;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:59,6,0 Chr02 20857190 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 20857219 . C T 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=22.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:48:205,0,48 Chr02 20910549 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 20910554 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 20915808 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 20915818 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 20964782 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.36;MQ0=0;QD=1.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:6:84,6,0 Chr02 20974055 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:63:63,0,678 Chr02 20988781 . C G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 20995354 . A C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr02 20996799 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr02 21030262 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,252 Chr02 21035442 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 21035444 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 21035463 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 21035469 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 21035711 . A T 306.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:335,24,0 Chr02 21043623 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr02 21048355 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21064503 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=2.96;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:28:99:111,0,816 Chr02 21073890 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 21076337 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 21086285 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:87:87,0,106 Chr02 21086321 . A C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:87:87,0,101 Chr02 21086325 . G A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:87:87,0,98 Chr02 21086327 . A T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:81:81,0,170 Chr02 21124713 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,729 Chr02 21239878 . C G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 21239879 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 21239891 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 21252711 . T C 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 Chr02 21267714 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 21357283 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21357285 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21357295 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21357306 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21357314 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 21405140 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.92;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 21416116 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21416164 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21431474 . A G 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr02 21440721 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21440741 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 21489899 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 21489938 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 21489977 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,107 Chr02 21505866 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21506000 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21507837 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21511899 . A G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 21517725 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21585486 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21666016 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr02 21666555 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21667544 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr02 21667788 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 21667797 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 21676502 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 21676515 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 21676530 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 21676548 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 21680094 . G A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.63;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:33:102,0,33 Chr02 21680107 . G A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.63;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:33:104,0,33 Chr02 21680402 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 21683205 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 21683830 . C T 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr02 21683886 . A G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr02 21683896 . G T 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr02 21683906 . T G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr02 21683916 . T C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr02 21710824 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 21710848 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.40;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 21733609 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21733658 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 21744369 . C A 362.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.331;DP=41;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=8.85;ReadPosRankSum=-5.082 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,13:40:99:391,0,979 Chr02 21758008 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 21773296 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 21804458 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 21804807 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr02 21829212 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21829238 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 21833550 . T G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 21836040 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21838347 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 21838398 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21838409 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 21838633 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,103 Chr02 21840368 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 21878563 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21878594 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21880115 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:90,0,98 Chr02 21880230 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,69 Chr02 21880245 . G C 71.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:67,0,52 Chr02 21880555 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:64,0,62 Chr02 21893267 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 21893273 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21893286 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21968292 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 21968315 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 21968328 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 21983942 . A C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 22003644 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 22042095 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 22056009 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22079117 . T C 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr02 22183245 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.61;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 22209957 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 22210000 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 22210016 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 22210026 . G C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 22215285 . T G 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.51;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr02 22215349 . T G 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.51;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr02 22215522 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 22224386 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 22224410 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 22224416 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 22224424 . A G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.47;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr02 22234595 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 22339430 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr02 22339441 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr02 22339468 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 22339502 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22339517 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 22369280 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 22369284 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 22369312 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 22374014 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 22417050 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22419318 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 22437299 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437306 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437323 . A T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437346 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437348 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437359 . G T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437363 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437365 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22437369 . G A 81.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22464872 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 22464875 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 22464931 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22466062 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22467559 . C T 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 Chr02 22519420 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.36;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 22528066 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 22528102 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22533890 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 22533895 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 22539861 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22542272 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 22557882 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 22587173 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 22624919 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22625383 . A T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 22626009 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 22626019 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 22626472 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22629592 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 22654761 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 22654764 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 22654767 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 22655631 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 22662013 . G T 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.093;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.627;QD=12.83;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:195,0,236 Chr02 22676841 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22702337 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.95;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr02 22712640 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 22716095 . A T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 22718047 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=2.09;ReadPosRankSum=-2.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:95:95,0,862 Chr02 22747589 . T C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr02 22747668 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22749741 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 22751086 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 22769397 . C A 148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.926;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.637;QD=5.31;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:177,0,777 Chr02 22769644 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 22771114 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 22771533 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22771541 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22771566 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 22818587 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 22860912 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 22860928 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 22908587 . C G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 22916482 . C T 53.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 23054081 . A G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:83:83,0,382 Chr02 23054119 . T G 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,306 Chr02 23058649 . G T 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr02 23058746 . C A 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr02 23076647 . A G 39.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 23078815 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 23078833 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 23078835 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23078893 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 23080019 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 23101802 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23108316 . C T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr02 23112597 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 23154867 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 23155973 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 23160305 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23181837 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr02 23182612 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr02 23182662 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr02 23182663 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr02 23182666 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr02 23185193 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 23205070 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,110 Chr02 23244795 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 23244806 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr02 23246399 . A T 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.46;MQ0=0;QD=17.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:134,12,0 Chr02 23322782 . A C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 23329776 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 23329802 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 23331709 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 23331749 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 23332524 . G T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 23332526 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 23332529 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 23339844 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 23344746 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23344779 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 23365357 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 23365372 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 23379309 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.51;MQ0=0;QD=17.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:116,9,0 Chr02 23379330 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 23379917 . C T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.35;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr02 23379975 . C T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.35;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr02 23385630 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 23402974 . C G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.21;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:60,6,0 Chr02 23413668 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23416656 . T C 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.57;MQ0=0;QD=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:56,6,0 Chr02 23416691 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.57;MQ0=0;QD=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:56,6,0 Chr02 23426366 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 23450969 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.781;DP=57;Dels=0.00;FS=14.656;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=0.56;ReadPosRankSum=-3.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,6:57:60:60,0,1804 Chr02 23517438 . A C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.68;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr02 23517455 . T A 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.68;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr02 23517499 . C T 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.68;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr02 23545043 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 23578656 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 23578676 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 23578677 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 23578814 . C T 150.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.37;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:179,15,0 Chr02 23578852 . C T 77.01 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.37;MQ0=0;QD=15.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:5:9:121,9,0 Chr02 23617769 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 23618566 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,210 Chr02 23622841 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 23626726 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 23647318 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 23648669 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 23648735 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 23674529 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 23716177 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 23731416 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 23760692 . G A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr02 23808892 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 23827869 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 23835212 . C A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr02 23870987 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:59,0,31 Chr02 23926636 . G C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr02 23927889 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr02 23928104 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 23928135 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24044839 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:64,0,57 Chr02 24127689 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 24128302 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 24160023 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 24160119 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.16;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 24169917 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 24169933 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 24169969 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 24188309 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 24194082 . A T 100.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:129,0,23 Chr02 24194097 . T C 180.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:209,0,19 Chr02 24206993 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,181 Chr02 24272333 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 24290602 . A T 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:115,12,0 Chr02 24290610 . C T 71.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.76;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=6.53;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:19:100,0,19 Chr02 24290657 . G A 71.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.76;MQ0=0;MQRankSum=1.769;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:19:100,0,19 Chr02 24305811 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.50;MQ0=0;QD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:124,9,0 Chr02 24305826 . G C 85.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.99;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:16:114,0,16 Chr02 24317810 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 24324859 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 24324860 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 24324966 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:83,6,0 Chr02 24332318 . T C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.05;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr02 24347526 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24351294 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 24351690 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 24352007 . T A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.18;MQ0=0;QD=29.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr02 24355247 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:59:59,0,1051 Chr02 24375869 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 24376754 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24377650 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 24377651 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 24416890 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 24416948 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 24416969 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 24420952 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24467918 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.484;QD=1.06;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:62:62,0,1029 Chr02 24474007 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 24474027 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 24474077 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 24483166 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 24497464 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 24497514 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 24497768 . A T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6456;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.95;MQ0=0;QD=11.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:84,9,0 Chr02 24511635 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 24546989 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 24569768 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 24573953 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24590335 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:49:49,0,559 Chr02 24645765 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:69,0,31 Chr02 24651662 . C A 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=3.28;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:153,0,1158 Chr02 24654437 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 24654441 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24742376 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;DP=20;Dels=0.00;FS=20.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.117;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:51:51,0,622 Chr02 24787302 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 24796295 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24807158 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 24869704 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 24869706 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 24869754 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 24877286 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 24893052 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24893056 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 24893072 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24893123 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.59;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr02 24908775 . C A 60.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 24944198 . G T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.67;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr02 24944250 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 24944276 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 24975335 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24975365 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 24979014 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24979029 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 24979033 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 24980405 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 24991799 . C A 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.20;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:39:99:153,0,1196 Chr02 25001029 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 25001182 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25001633 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 25001649 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25015282 . A G 22.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:51,0,22 Chr02 25027595 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 25034706 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 25034739 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25034749 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25092543 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr02 25097030 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25097048 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 25123422 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25159299 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 25159326 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 25159328 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 25276971 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 25340420 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 25340539 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=0;QD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:84,6,0 Chr02 25489824 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.05;MQ0=0;QD=27.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 25490071 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 25496878 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25506395 . C T 595.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:624,45,0 Chr02 25506505 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25507075 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 25508447 . T G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr02 25508684 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 25513087 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 25528039 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 25528149 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25528251 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 25577092 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 25578713 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr02 25579629 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 25579630 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 25584729 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,72 Chr02 25595276 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 25617639 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25617729 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 25625193 . A G 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr02 25626013 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25626018 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 25627171 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25630569 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 25630628 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 25636643 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr02 25636969 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr02 25644713 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 25644731 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 25649657 . C A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.129;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=3.04;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:150,0,1234 Chr02 25654631 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.44;MQ0=2;QD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:49,6,0 Chr02 25676697 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr02 25693284 . C A 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.270;QD=11.34;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:17:99:221,0,311 Chr02 25729495 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 25767787 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 25782149 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 25782672 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25783285 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 25783336 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25798588 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 25798639 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25804947 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 25804967 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 25804991 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 25806640 . C A 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.062;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.451;QD=7.21;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,8:27:99:223,0,695 Chr02 25811560 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 25826351 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 25829444 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 25829475 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 25829904 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 25833287 . G T 82.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:111,0,27 Chr02 25833309 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:107,0,30 Chr02 25833667 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 25873340 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 25875368 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.80;MQ0=19;QD=2.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:6:80,6,0 Chr02 25875383 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 25875386 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 25875394 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 25875397 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25875430 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.73;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 25943046 . G A 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:59,0,30 Chr02 25943054 . T A 30.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.71;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17:59,0,17 Chr02 25943058 . C T 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:59,0,27 Chr02 25943081 . G C 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:59,0,28 Chr02 25943086 . A G 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr02 25943096 . T G 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr02 25945200 . T G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.62;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 25964698 . T G 44.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.92;MQ0=2;QD=1.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:9:72,9,0 Chr02 25964701 . T A 44.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.92;MQ0=2;QD=1.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:9:72,9,0 Chr02 25968116 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.22;MQ0=24;QD=4.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:12:160,12,0 Chr02 25978119 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 25978125 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 26016675 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 26016679 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 26017637 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;DP=31;Dels=0.00;FS=26.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.242;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:108,0,988 Chr02 26017668 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;DP=31;Dels=0.00;FS=26.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.188;QD=2.57;ReadPosRankSum=2.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:108,0,891 Chr02 26024461 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.91;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:79:79,0,341 Chr02 26025902 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,67 Chr02 26025938 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 26025939 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 26025945 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:58,0,32 Chr02 26029889 . A G 429.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:458,33,0 Chr02 26038264 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 26038275 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26038277 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26038296 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26038321 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26038335 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 26047549 . T G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.78;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr02 26069990 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.08;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:34:84,0,34 Chr02 26150116 . C T 117.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.093;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.41;MQ0=0;MQRankSum=3.016;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,6:13:18:146,18,0 Chr02 26231423 . A G 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:60,0,29 Chr02 26236822 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.044;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:6:66,6,0 Chr02 26244131 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26246134 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26246141 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26250753 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26292774 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 26292860 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,212 Chr02 26296052 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 26297676 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26303345 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 26306120 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26370128 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,147 Chr02 26373550 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.13;MQ0=25;QD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:9:119,9,0 Chr02 26382845 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 26382926 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 26384097 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 26440372 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 26442462 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 26445221 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 26451176 . G A 89.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 26504792 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 26505850 . C T 148.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:177,15,0 Chr02 26505874 . T C 144.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:173,15,0 Chr02 26505913 . T C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 26522318 . T A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.26;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:46:117,0,46 Chr02 26522324 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.22;MQ0=0;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:67,6,0 Chr02 26615990 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.37;MQ0=13;MQRankSum=0.956;QD=1.13;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:52:52,0,74 Chr02 26642591 . C A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 26642594 . C A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 26642643 . A G 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 26655382 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 26656311 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=6.68;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:75:75,0,146 Chr02 26657688 . C T 61.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.71;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=12.38;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:15:90,0,15 Chr02 26658863 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:91:91,0,382 Chr02 26658866 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.113;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:91:91,0,382 Chr02 26658883 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.273;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.5662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.281;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:91:91,0,382 Chr02 26669726 . T G 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.499;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:76:76,0,531 Chr02 26669728 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.333;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.681;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:75:75,0,532 Chr02 26669737 . G A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.681;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:76:76,0,531 Chr02 26669738 . G A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.002;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.499;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:76:76,0,530 Chr02 26669748 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.826;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.681;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,19:33:74:74,0,482 Chr02 26675814 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.36;MQ0=0;QD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:6:84,6,0 Chr02 26675829 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.36;MQ0=0;QD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:6:84,6,0 Chr02 26675835 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.36;MQ0=0;QD=3.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:6:84,6,0 Chr02 26675895 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.79;MQ0=0;QD=6.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:77,6,0 Chr02 26677946 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,143 Chr02 26677988 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,189 Chr02 26681295 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26681310 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26681344 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 26684886 . T G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.76;MQ0=0;QD=18.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:100,9,0 Chr02 26699144 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.35;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr02 26709864 . G C 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=10.92;ReadPosRankSum=1.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:203,0,348 Chr02 26710920 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.425;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:99,0,593 Chr02 26719132 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26719153 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26719170 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26784970 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr02 26787737 . A G 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr02 26787745 . A G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 26789106 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.20;MQ0=27;MQRankSum=0.988;QD=0.87;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,21:33:50:57,0,50 Chr02 26789917 . A G 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 26798863 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 26798892 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 26798911 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 26803376 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 26803386 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 26803617 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26803621 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26803638 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 26806566 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26806661 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 26807636 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26815028 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 26816702 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 26816759 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 26818432 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 26818495 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 26834698 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 26834717 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26834739 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 26834740 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26834743 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 26834749 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26834987 . T G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 26862379 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26862923 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 26862931 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 26862974 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 26862979 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 26862980 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 26893942 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 26927009 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=36;Dels=0.00;FS=20.988;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.235;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:88:88,0,1141 Chr02 26947041 . A G 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr02 26947047 . G A 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 26950804 . G C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr02 26950830 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr02 26950831 . T A 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr02 26975553 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27007534 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,140 Chr02 27012986 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.39;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 27020527 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 27027510 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 27027512 . T G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 27029755 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 27030697 . C A 143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.349;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.579;QD=3.13;ReadPosRankSum=-4.409 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,8:46:99:172,0,1383 Chr02 27045520 . C T 428.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9547;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:457,36,0 Chr02 27048765 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:115,9,0 Chr02 27054810 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 27059922 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,141 Chr02 27074388 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 27106342 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 27106354 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 27133552 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,105 Chr02 27163301 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 27194707 . A G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr02 27194731 . A T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr02 27204483 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.142;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:59:59,0,561 Chr02 27224888 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr02 27224915 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 27224934 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 27224970 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 27227487 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 27245591 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27245628 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 27280212 . C A 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;DP=25;Dels=0.00;FS=5.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.030;QD=6.67;ReadPosRankSum=-3.662 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:195,0,632 Chr02 27309083 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 27324850 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,142 Chr02 27353210 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 27353254 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 27412148 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 27430808 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27430811 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 27444359 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 27451364 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 27451764 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27451776 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 27451804 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27461937 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 27461970 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 27466407 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 27466480 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 27466495 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27467665 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 27467712 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 27467742 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 27475579 . A C 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr02 27518410 . C T 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=28.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr02 27518412 . A G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr02 27521231 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.56;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 27521249 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.56;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 27521272 . A G 84.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 27521500 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 27552455 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 27552464 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 27552495 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 27552499 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27576656 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 27576674 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27630832 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 27630836 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 27635401 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 27681201 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.04;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr02 27681212 . T C 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.04;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr02 27815082 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 27815085 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 27882383 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 27893023 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.63;MQ0=2;QD=3.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:70,6,0 Chr02 27893227 . T G 59.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.569;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.21;MQ0=122;MQRankSum=-1.734;QD=0.42;ReadPosRankSum=-1.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,142:143:27:88,0,27 Chr02 27893229 . T C 59.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;DP=143;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.21;MQ0=122;MQRankSum=-1.734;QD=0.42;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,142:143:27:88,0,27 Chr02 27893233 . A C 109.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;DP=145;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=6.83;MQ0=122;MQRankSum=-1.734;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,144:145:21:138,0,21 Chr02 27893269 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;DP=82;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.11;MQ0=59;MQRankSum=2.019;QD=0.40;ReadPosRankSum=-2.346 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,11:82:61:61,0,119 Chr02 27893271 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.31;MQ0=59;MQRankSum=-2.546;QD=0.31;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,73:79:53:53,0,123 Chr02 27893278 . T G 128.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.32;MQ0=34;MQRankSum=-1.736;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,48:49:20:157,0,20 Chr02 27927955 . C A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.620;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=14.76;ReadPosRankSum=-3.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:294,0,313 Chr02 27966293 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 27966561 . A G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr02 27966649 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 27967954 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 27980286 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 27981240 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 27981243 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 27981323 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 27984050 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 27991739 . A G 324.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28080750 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 28093815 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=17;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:61:61,0,510 Chr02 28126303 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28151631 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 28152683 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:50:50,0,174 Chr02 28161077 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr02 28164908 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 28165355 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 28166194 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 28204234 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 28204330 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 28206190 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 28208834 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.770;DP=53;Dels=0.00;FS=10.328;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.658;QD=2.22;ReadPosRankSum=-3.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,8:53:99:146,0,1638 Chr02 28210296 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.550;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:35:90:90,0,1088 Chr02 28211908 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 28211923 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28211941 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28211952 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28213076 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 28220118 . G T 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr02 28245916 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 28253346 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 28253355 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28253385 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28253441 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 28266802 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 28299340 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 28332340 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 28332437 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 28354805 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 28355873 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,360 Chr02 28361193 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 28361501 . G C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr02 28394504 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 28408564 . G C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 28410346 . T C 356.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:385,30,0 Chr02 28410399 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28415127 . A T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 28469803 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 28469834 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28469838 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28471481 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 28471684 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 28471744 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 28472224 . A C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 28472805 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 28473909 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 28478328 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 28538965 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.08;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr02 28570211 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.04;MQ0=1;QD=10.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:89,9,0 Chr02 28598726 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28598870 . G T 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:57:138,0,57 Chr02 28636742 . G T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 28639913 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 28639928 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 28667505 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 28718358 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 28718397 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 28718413 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 28718555 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 28718566 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr02 28732209 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 28757533 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28757556 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28766053 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 28766068 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.11;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 28786519 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,223 Chr02 28791256 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 28797005 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 28847096 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 28847129 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.61;MQ0=9;QD=6.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:122,9,0 Chr02 28847145 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.61;MQ0=9;QD=6.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:122,9,0 Chr02 28847166 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.97;MQ0=1;QD=13.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:122,9,0 Chr02 28872308 . C A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:147,12,0 Chr02 28904043 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 28904059 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 28904070 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 29008725 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 29008737 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 29008750 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 29008810 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 29055469 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 29060421 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29060979 . G C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 29087937 . T C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.19;MQ0=0;QD=5.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:12:147,12,0 Chr02 29087941 . A G 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.19;MQ0=0;QD=5.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:12:147,12,0 Chr02 29087951 . T A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.19;MQ0=0;QD=5.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:12:147,12,0 Chr02 29087968 . A G 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.19;MQ0=0;QD=5.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:12:147,12,0 Chr02 29095813 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 29098462 . C T 46.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 29114583 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 29138084 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 29148429 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:56:56,0,207 Chr02 29148435 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.24;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:56:56,0,207 Chr02 29148465 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:59:59,0,165 Chr02 29150800 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29150830 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29152634 . C A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr02 29170227 . G C 188.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:217,18,0 Chr02 29171117 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 29171184 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29196989 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 29204832 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 29209399 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 29250642 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 29252695 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29260351 . C A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 29260352 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr02 29260353 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 29268122 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 29288169 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 29288170 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 29288194 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 29309026 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29309190 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 29316525 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29318319 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29319162 . C G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 29329376 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 29345413 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr02 29349869 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29349890 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29349919 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 29350276 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr02 29350302 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 29350314 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 29354302 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 29354304 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 29367330 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 29401520 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=16;QD=2.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,2:18:6:76,6,0 Chr02 29415970 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 29419642 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29433308 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 29456301 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 29457705 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,109 Chr02 29470301 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 29483199 . G T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 29487903 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr02 29493825 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:91:91,0,584 Chr02 29544552 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 29544569 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 29544582 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 29544622 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 29577278 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 29577289 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 29599776 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,200 Chr02 29612099 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 29644784 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:92,0,61 Chr02 29650213 . C A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.053;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=2.35;ReadPosRankSum=-2.834 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,7:45:99:134,0,1398 Chr02 29651274 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:156,12,0 Chr02 29651277 . A T 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr02 29651509 . T G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 29664225 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29664241 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 29664252 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29677160 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 29687694 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 29693348 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29694104 . T A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr02 29718988 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 29721360 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 29721693 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 29728507 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 29756718 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr02 29766507 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 29766534 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 29788186 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 29824315 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29824324 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29824333 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 29852056 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,447 Chr02 29854918 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=2.92;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:107,0,703 Chr02 29856793 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 29878833 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 29892035 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,176 Chr02 29895749 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr02 29905138 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 29913802 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 29944646 . C G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:68,0,57 Chr02 29980719 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 30008117 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 30010706 . A G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 30011572 . G T 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:99,0,27 Chr02 30030585 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30030596 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30030597 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30061305 . A C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 30089481 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 30095085 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 30095908 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,470 Chr02 30096005 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;DP=18;Dels=0.00;FS=6.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,538 Chr02 30096212 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 30105780 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 30111699 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 30119905 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30119912 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30119929 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30125219 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 30137723 . A C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr02 30144204 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 30144633 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 30195679 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr02 30216120 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30218976 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 30226019 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;DP=17;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:62:62,0,486 Chr02 30258497 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 30265686 . T A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr02 30299870 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30323647 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 30324207 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 30337100 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 30364343 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 30364380 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 30397329 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 30398315 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 30398396 . C T 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr02 30398401 . G C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 30407345 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 30421171 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 30422564 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;DP=17;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=4.57;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:106,0,409 Chr02 30444574 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 30451027 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 30451066 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 30457273 . C T 51.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30515542 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,106 Chr02 30516433 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 30526341 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 30565838 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 30577825 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 30627642 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 30629384 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30634530 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,150 Chr02 30645641 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 30646135 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84:84,0,219 Chr02 30655523 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 30664188 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,243 Chr02 30664270 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 30758772 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30830131 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,126 Chr02 30835486 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 30903438 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 30933048 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30941085 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 30943121 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 30952963 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=6.37;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:111,0,330 Chr02 30953699 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30953727 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 30973480 . G A 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973488 . A G 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973490 . C T 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973516 . A G 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973522 . G A 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973526 . G T 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973533 . C T 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973536 . A G 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973538 . A G 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973543 . T G 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.22;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:168,15,0 Chr02 30973560 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 30982664 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr02 30984268 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 30984302 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 30984322 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 30989882 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 30989916 . G A 56.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr02 31045269 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr02 31047264 . A C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 31047265 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 31048361 . A T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.369;QD=6.16;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:133,0,419 Chr02 31100413 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 31100424 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 31100457 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31100472 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 31101124 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:65,0,57 Chr02 31101867 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 31101898 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 31102084 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 31123220 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31123224 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 31138211 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,187 Chr02 31164858 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,338 Chr02 31210597 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 31211106 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.57;MQ0=32;MQRankSum=0.736;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,34:35:29:75,0,29 Chr02 31226264 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 31245327 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 31319270 . C A 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr02 31319313 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr02 31319339 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 31329505 . C G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 31329906 . T G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr02 31357905 . T C 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr02 31389972 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31432416 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 31432446 . G T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr02 31432572 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 31432640 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 31444840 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 31444848 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 31444853 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 31444888 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 31456217 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 31456223 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 31456230 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr02 31456232 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 31456262 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 31456284 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31456297 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 31518622 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=3;MQRankSum=1.026;QD=7.68;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:6:81,6,0 Chr02 31524457 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 31525477 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31525492 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 31525512 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 31525539 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 31525561 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 31525580 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 31544781 . A C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 31567843 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,224 Chr02 31642573 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 31653946 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 31702864 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:126,9,0 Chr02 31754015 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 31789425 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr02 31789505 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:101,0,97 Chr02 31845163 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 Chr02 31845170 . C T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr02 31845216 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr02 31845610 . A T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:138,0,24 Chr02 31846667 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 31846685 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 31868336 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 31869284 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 31870341 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 31912623 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 31912638 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 31912645 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 31912669 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 31921126 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 31930160 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr02 31930168 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr02 31955346 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32036954 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr02 32037806 . C A 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 Chr02 32038095 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,220 Chr02 32054075 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 32062074 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 32062091 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 32062094 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 32062109 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 32062113 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 32062117 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 32062136 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 32083319 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 32098099 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 32100074 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,330 Chr02 32101174 . T A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:110,9,0 Chr02 32102680 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 32102683 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32102687 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 32133301 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 32133631 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 32133943 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 32133949 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 32133973 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 32135119 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 32135152 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 32136966 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 32166027 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 32166074 . G A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 32166149 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 32177815 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 32183911 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.52;MQ0=1;MQRankSum=3.979;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,6:61:18:252,18,0 Chr02 32217815 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 32217833 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 32232763 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32303768 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.48;MQ0=1;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr02 32315271 . C A 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.898;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=3.04;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:41:99:153,0,1195 Chr02 32322343 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=26.580;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,440 Chr02 32400760 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 32449369 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 32449387 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 32449388 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 32449457 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32449467 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32449472 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32449512 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32449516 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32449538 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 32475059 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 32475156 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,209 Chr02 32480103 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 32481732 . C G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr02 32481733 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 32481759 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32481773 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32490439 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,136 Chr02 32495424 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:25:99:117,0,703 Chr02 32495520 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=16;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.883;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,484 Chr02 32517575 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 32517586 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 32530266 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 32535772 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 32535809 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 32562063 . C G 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 Chr02 32565250 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr02 32573938 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32573974 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 32605543 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 32607355 . A G 92.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 32625991 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:51:99,0,51 Chr02 32626570 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 32626930 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 32685639 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.756;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:93:93,0,1347 Chr02 32685945 . T C 90.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:226,18,0 Chr02 32774843 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 32774859 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32787589 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 32807811 . C A 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:141,0,26 Chr02 32808201 . A G 294.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:323,24,0 Chr02 32808289 . A G 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 Chr02 32830888 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 32833805 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32833807 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32848921 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 32858407 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 32861154 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 32881900 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 32889801 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 32889826 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 32889836 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32891659 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 32941867 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 32946333 . A G 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:135,0,64 Chr02 32948480 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 33029610 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 33037665 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 33039559 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33039574 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33043479 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 33043721 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 33048998 . T C 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr02 33145226 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 33145234 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 33145263 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33145264 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33154930 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 33158296 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33158553 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 33168419 . T C 56.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:86:86,0,178 Chr02 33353998 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 33362653 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 33380678 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33380687 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 33409341 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 33423114 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33438004 . C T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr02 33438022 . C T 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 Chr02 33438808 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.559;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=1.77;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:101,0,1302 Chr02 33447476 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=13.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:80,9,0 Chr02 33495600 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 33536248 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr02 33550015 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33555696 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 33580749 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 33580816 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 33582172 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 33582196 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr02 33594063 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 33595547 . A C 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr02 33595608 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 33614512 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 33682393 . C G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 33692463 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 33692464 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 33723969 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.381;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:70:70,0,790 Chr02 33724641 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33725036 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 33731212 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 33731623 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,105 Chr02 33733738 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 33744371 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.24;MQ0=32;MQRankSum=2.556;QD=1.92;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,10:48:9:120,9,0 Chr02 33807530 . G A 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:75,0,26 Chr02 33835655 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33835714 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33836125 . C A 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.765;DP=66;Dels=0.00;FS=16.205;HaplotypeScore=2.9984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.545;QD=2.39;ReadPosRankSum=-4.999 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,10:66:99:186,0,2045 Chr02 33848068 . G C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 33848093 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 33848095 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 33848116 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 33877456 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 33884950 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=16;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:71:71,0,432 Chr02 33885047 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,105 Chr02 33885707 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:109,0,69 Chr02 33885718 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:107,0,69 Chr02 33885731 . T G 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:151,0,26 Chr02 33888871 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 33890438 . G T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 33899100 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 33902165 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33915525 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,251 Chr02 33943145 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 33944268 . A G 186.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:215,0,18 Chr02 33945003 . C G 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61:136,0,61 Chr02 34022564 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 34033915 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 34067030 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 34089331 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 34089334 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 34090670 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=1.10;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:60:60,0,895 Chr02 34092474 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 34092553 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 34108519 . C G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,135 Chr02 34108558 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,150 Chr02 34115541 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 34116105 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 34134220 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 34137592 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34147111 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr02 34160297 . C A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 Chr02 34209462 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 34240313 . G A 189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=21.09;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:218,0,97 Chr02 34241153 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 34241594 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 34275066 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34301029 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 34303462 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 34303525 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 34303762 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 34312193 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34312195 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 34312208 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 34312223 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 34312225 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 34325429 . T A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.40;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr02 34325442 . G A 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.40;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:93,9,0 Chr02 34325480 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 34331211 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,139 Chr02 34364362 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 34364371 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 34366740 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr02 34388518 . T G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,103 Chr02 34404393 . C G 163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=14.89;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:192,0,126 Chr02 34408131 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 34408146 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34408150 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34408588 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,71 Chr02 34417369 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34420440 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.08;MQ0=3;QD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:6:49,6,0 Chr02 34484052 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.65;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:98:98,0,403 Chr02 34527699 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 34544173 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 34544360 . A T 96.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=19.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:125,0,23 Chr02 34544419 . A T 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr02 34544755 . C A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;DP=19;Dels=0.00;FS=6.117;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=5.99;ReadPosRankSum=-2.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:142,0,424 Chr02 34547207 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 34582592 . G C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr02 34600862 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:69,0,30 Chr02 34600872 . G C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:108,0,28 Chr02 34600925 . T G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr02 34602058 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 34602060 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 34602917 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 34602927 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34603767 . T A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr02 34620636 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 34622963 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34622967 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34632722 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,251 Chr02 34657770 . G T 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.400;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,316 Chr02 34657856 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=38;Dels=0.00;FS=12.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.641;QD=1.31;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:78:78,0,1204 Chr02 34661843 . C T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:135,0,27 Chr02 34675201 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 34692207 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 34702615 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 34746191 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.298;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:94:94,0,1391 Chr02 34746769 . A G 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr02 34755307 . A C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr02 34796767 . G A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.584;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:115,0,526 Chr02 34796859 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr02 34807343 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:108,0,65 Chr02 34810299 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 34814382 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 34847789 . C T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:124,0,58 Chr02 34877683 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 34956470 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.44;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr02 34987925 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 34990485 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 34990543 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.62;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 35009962 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 35009972 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 35009976 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 35014263 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:127,0,170 Chr02 35014359 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=41;Dels=0.00;FS=8.346;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.494;QD=1.92;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:107,0,1304 Chr02 35020935 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 35061612 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;DP=59;Dels=0.00;FS=11.425;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.640;QD=0.44;ReadPosRankSum=-4.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,6:59:54:54,0,1927 Chr02 35064183 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:72:72,0,72 Chr02 35064261 . T C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:100,0,58 Chr02 35073391 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 35074317 . T A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.40;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:55:171,0,55 Chr02 35091739 . G T 152.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:181,0,23 Chr02 35129993 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 35136024 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,139 Chr02 35136085 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:69,0,67 Chr02 35136819 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,220 Chr02 35157479 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=1;QD=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:83,6,0 Chr02 35158015 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 35158048 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 35198310 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 35198332 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 35211717 . G A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr02 35211722 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 35211737 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.15;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr02 35270783 . G A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=8.751;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.08;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:129,0,185 Chr02 35270789 . C G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr02 35270807 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 35270810 . C G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 35270914 . G T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:108,9,0 Chr02 35270919 . C T 183.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:212,18,0 Chr02 35340090 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 35341247 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341248 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341251 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341255 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341256 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341257 . A T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341261 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35341283 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr02 35342244 . T A 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr02 35352475 . G C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr02 35369700 . T C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;DP=21;Dels=0.00;FS=2.086;HaplotypeScore=2.7535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:100,0,522 Chr02 35414609 . T G 186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.387;DP=16;Dels=0.00;FS=40.584;HaplotypeScore=8.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.953;QD=11.67;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:215,0,327 Chr02 35415034 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 35452967 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.31;MQ0=4;QD=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:49,6,0 Chr02 35452992 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.31;MQ0=4;QD=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:49,6,0 Chr02 35453038 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.31;MQ0=4;QD=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:49,6,0 Chr02 35515277 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:63,0,32 Chr02 35567158 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 35567502 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 35610942 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 35613020 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 35636572 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,70 Chr02 35651732 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 35651965 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:65:101,0,65 Chr02 35672440 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 35678072 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 35678126 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 35722948 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 35722949 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 35730877 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 35773154 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 35776767 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 35776891 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 35776904 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 35776928 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 35776954 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 35779149 . C A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 35838679 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 35925806 . T C 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;DP=12;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.835;QD=7.23;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:115,0,299 Chr02 35944906 . C T 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.26;MQ0=37;QD=0.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,84:84:9:77,9,0 Chr02 36000012 . C G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr02 36012184 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 36012878 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 36039223 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 36039288 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 36041909 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,103 Chr02 36041989 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,143 Chr02 36052509 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 36062286 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 36141506 . G C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.01;MQ0=0;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr02 36150670 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 36193298 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;DP=34;Dels=0.00;FS=8.243;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.091;QD=1.90;ReadPosRankSum=3.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:93:93,0,982 Chr02 36217191 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,70 Chr02 36237598 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 36264451 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:77,6,0 Chr02 36265270 . A T 46.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.65;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:14:75,0,14 Chr02 36275282 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 36320241 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,91 Chr02 36321804 . A C 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:147,0,65 Chr02 36321951 . T C 198.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:227,0,21 Chr02 36322049 . T A 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr02 36335741 . A G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 36335744 . T A 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr02 36335816 . A G 152.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:181,0,23 Chr02 36345054 . T G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:69:69,0,100 Chr02 36352112 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:56:68,0,56 Chr02 36352160 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr02 36391063 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr02 36391087 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:66,0,64 Chr02 36397520 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,257 Chr02 36417889 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 36418112 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 36427230 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 36429573 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr02 36430535 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 36439264 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:72,0,60 Chr02 36452406 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 36491035 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 36491305 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:71,0,63 Chr02 36521570 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 36549017 . T G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 36556337 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;DP=16;Dels=0.00;FS=2.858;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.538 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:70:70,0,471 Chr02 36564154 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.45;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 36564171 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 36564306 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,252 Chr02 36582615 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 36594874 . A G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:90:90,0,289 Chr02 36597778 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 36601739 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr02 36601761 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,91 Chr02 36601794 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:89:92,0,89 Chr02 36614071 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=20;Dels=0.00;FS=5.254;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:65:65,0,600 Chr02 36628321 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 36634465 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 36643413 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 36679668 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 36679676 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 36771050 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;DP=19;Dels=0.00;FS=9.234;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=3.46;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:94:94,0,485 Chr02 36771146 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.599;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.654;QD=0.97;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:41:68:68,0,1318 Chr02 36779072 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 36788468 . G A 105.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:134,0,23 Chr02 36798813 . T C 138.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:64,0,59 Chr02 36844146 . T C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr02 36845307 . C G 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.384;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:39:99:176,0,1171 Chr02 36845450 . T C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 36862482 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 36877393 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 36882432 . A T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:107,0,63 Chr02 36884711 . A T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.153;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:77:77,0,350 Chr02 36885573 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 36888081 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=2.61;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:70:70,0,480 Chr02 36888149 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=2.52;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:61:61,0,303 Chr02 36894165 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 36894262 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,397 Chr02 36912580 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:70,0,28 Chr02 36930563 . T C 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 Chr02 36930674 . C T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,108 Chr02 36932514 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr02 36946788 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 36955843 . G C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,108 Chr02 36955854 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:105,0,107 Chr02 36955908 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:99,0,98 Chr02 36955912 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,98 Chr02 36956409 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 36957999 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 36977140 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.40;MQ0=0;QD=6.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:76,6,0 Chr02 36977175 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.74;MQ0=0;QD=20.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:18:250,18,0 Chr02 36977192 . G T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.74;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=20.35;ReadPosRankSum=1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,6:11:18:252,18,0 Chr02 36977203 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.74;MQ0=0;QD=20.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:18:253,18,0 Chr02 36977218 . C T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr02 36977219 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.21;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr02 36992624 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 36992675 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 36996663 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 37010932 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 37017546 . G T 38.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:67,0,23 Chr02 37017574 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 37034470 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 37041434 . C T 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:74,0,26 Chr02 37050974 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 37052495 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 37055607 . C T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.581 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:94:94,0,769 Chr02 37071271 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 37087010 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:109,0,30 Chr02 37087638 . G A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,132 Chr02 37087641 . A C 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:118,0,121 Chr02 37093157 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,146 Chr02 37108897 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 37164434 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 37195536 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 37236533 . G A 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:68,0,26 Chr02 37239919 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:69,0,33 Chr02 37240235 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 37240236 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 37251150 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,140 Chr02 37284244 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr02 37299589 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 37300523 . T A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.031;DP=24;Dels=0.00;FS=36.491;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=4.03;ReadPosRankSum=3.889 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:125,0,565 Chr02 37334600 . A G 148.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:177,18,0 Chr02 37334678 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 37346503 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.07;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 37357936 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=1;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:49,6,0 Chr02 37360417 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,69 Chr02 37489175 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 37535980 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.048;DP=47;Dels=0.00;FS=1.738;HaplotypeScore=2.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:84:84,0,1469 Chr02 37564056 . C T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=3;MQRankSum=-2.520;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:78:78,0,263 Chr02 37564061 . G A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQ0=3;MQRankSum=-2.166;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:14:78:78,0,262 Chr02 37577138 . C T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:89:89,0,340 Chr02 37577247 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,100 Chr02 37582045 . T G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:109,0,69 Chr02 37582062 . C T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:107,0,68 Chr02 37583111 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,109 Chr02 37687823 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=1.9623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,346 Chr02 37711988 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.192;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.899;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:73:73,0,341 Chr02 37712001 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.636;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.899;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:73:73,0,332 Chr02 37719421 . A G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.746;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:89:89,0,836 Chr02 37731071 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.083;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:112,0,303 Chr02 37816948 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr02 37819613 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,299 Chr02 37829537 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,103 Chr02 37846707 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,105 Chr02 37846744 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,101 Chr02 37865410 . T G 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.057;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:116,0,495 Chr02 37865905 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=5.07;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,290 Chr02 37869487 . C T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;DP=39;Dels=0.00;FS=1.965;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:126,0,1201 Chr02 37874062 . T C 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:66,0,26 Chr02 37876355 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 37876374 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 37876383 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 37876395 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 37877863 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,213 Chr02 37877870 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,216 Chr02 37877879 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,207 Chr02 37878187 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,224 Chr02 37878255 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,190 Chr02 37901156 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,141 Chr02 37906387 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr02 37909339 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 37909379 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 37912582 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 37912611 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 37912614 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 37934058 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 37934063 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 37934088 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 37955969 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 37956002 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 37958107 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.303;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:63:63,0,498 Chr02 37973003 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59:94,0,59 Chr02 37981825 . T C 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:78:78,0,320 Chr02 38002507 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,103 Chr02 38002725 . T C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,127 Chr02 38025432 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr02 38025944 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,302 Chr02 38025990 . T C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=6.53;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,206 Chr02 38050431 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=11;Dels=0.00;FS=16.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,290 Chr02 38055979 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,258 Chr02 38082618 . C T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:138,0,27 Chr02 38082873 . T G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr02 38084189 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:69,0,66 Chr02 38089084 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:103,0,66 Chr02 38089170 . T A 111.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21:140,0,21 Chr02 38111347 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 38131874 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;DP=21;Dels=0.00;FS=10.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:90:90,0,621 Chr02 38136754 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 38171816 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr02 38173711 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.908;DP=50;Dels=0.00;FS=4.880;HaplotypeScore=2.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=1.92;ReadPosRankSum=-1.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,7:50:99:124,0,1533 Chr02 38249306 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr02 38250669 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 38250722 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 38250732 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 38258436 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 38276802 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 38324487 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 38385667 . A G 40.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:69,0,23 Chr02 38397092 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 38402221 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 38433444 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.967;QD=1.47;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:81:81,0,1157 Chr02 38447236 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:88:88,0,97 Chr02 38447237 . T C 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.29;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:84:84,0,99 Chr02 38448077 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,184 Chr02 38478168 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:106,0,90 Chr02 38503247 . A T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:86:86,0,1065 Chr02 38551102 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 38551115 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 38557802 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:74,0,29 Chr02 38557817 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 38585532 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,100 Chr02 38589979 . T C 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:136,0,261 Chr02 38589980 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=9.80;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:136,0,261 Chr02 38613801 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 38613832 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 38680545 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,125 Chr02 38727450 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 38727547 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,399 Chr02 38732370 . G T 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.766;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.075;QD=3.28;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:39:99:156,0,1150 Chr02 38760666 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 38783189 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 38786590 . C A 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.707;QD=5.23;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:180,0,803 Chr02 38788428 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:51:51,0,339 Chr02 38788607 . C G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:97:97,0,256 Chr02 38807852 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;DP=42;Dels=0.00;FS=13.082;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.388;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:66:66,0,1372 Chr02 38807883 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;DP=37;Dels=0.00;FS=5.355;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=0.59;ReadPosRankSum=1.443 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:50:50,0,1215 Chr02 38813377 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=15.53;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:168,0,136 Chr02 38821325 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr02 38843591 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,147 Chr02 38853762 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr02 38867101 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr02 38872617 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,220 Chr02 38873387 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 38873412 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 38873417 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 38874344 . T G 84.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:113,0,23 Chr02 38874353 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr02 38924706 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr02 38924723 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 38924726 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 38924728 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 38924737 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 38924738 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.42;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 38946106 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,106 Chr02 38947138 . C A 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.123;DP=30;Dels=0.03;FS=24.817;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.073;QD=6.29;ReadPosRankSum=-4.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:217,0,773 Chr02 38947454 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,180 Chr02 38950884 . T C 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:146,0,26 Chr02 38971335 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,101 Chr02 38993372 . C G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 39018557 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 39087389 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=1.5777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:73:73,0,355 Chr02 39100779 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr02 39123146 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:146,0,327 Chr02 39124171 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:88:88,0,104 Chr02 39152277 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.223;QD=2.59;ReadPosRankSum=-3.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:99:106,0,939 Chr02 39153859 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 39158178 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 39158969 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:60:60,0,204 Chr02 39160976 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr02 39177211 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr02 39205709 . T C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr02 39252676 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:99,0,146 Chr02 39253539 . C T 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;DP=45;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.402;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,14:43:99:449,0,1072 Chr02 39254009 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,102 Chr02 39254080 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,111 Chr02 39259460 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 39260167 . T G 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,278 Chr02 39261136 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr02 39279557 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr02 39290674 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 39290677 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 39310940 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;DP=47;Dels=0.00;FS=5.044;HaplotypeScore=3.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=0.61;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:47:57:57,0,1465 Chr02 39323366 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 39354444 . C T 48.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:77,0,19 Chr02 39418738 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr02 39434843 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 39443237 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 39449095 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:63,0,63 Chr02 39528393 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.230;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:120,0,658 Chr02 39541009 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 39548925 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:112,0,342 Chr02 39609439 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 39654724 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 39701863 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,242 Chr02 39721200 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 39725440 . G C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,133 Chr02 39735384 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 39750648 . C A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.04;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 39762802 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,140 Chr02 39763237 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=34;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.507;QD=1.67;ReadPosRankSum=-3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:85:85,0,1070 Chr02 39780075 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 39781688 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 39783870 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 39784311 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:71,0,66 Chr02 39784856 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 39803450 . A C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:101,0,185 Chr02 39811272 . C G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:97,0,66 Chr02 39852232 . C A 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:142,0,24 Chr02 39893487 . C A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=2.54;ReadPosRankSum=-4.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:44:99:140,0,1324 Chr02 39896331 . T G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:93,0,60 Chr02 39954058 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;DP=19;Dels=0.00;FS=19.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.174;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,590 Chr02 39981398 . T A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:110,0,28 Chr02 39998090 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:110,0,65 Chr02 40001919 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr02 40011030 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 40079262 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 40105729 . T C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:80:80,0,135 Chr02 40109045 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 40118649 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 40119165 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 40124027 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr02 40138191 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 40168784 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 40172662 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:65:65,0,175 Chr02 40172686 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:65:65,0,183 Chr02 40172687 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.35;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:65:65,0,182 Chr02 40181058 . A T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:55:96,0,55 Chr02 40184691 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,66 Chr02 40189508 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,183 Chr02 40198897 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 40205590 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,66 Chr02 40205602 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr02 40207761 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:108,0,58 Chr02 40241872 . A T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61:133,0,61 Chr02 40266553 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr02 40293668 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr02 40302222 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 40346300 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,102 Chr02 40346330 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,110 Chr02 40374681 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,62 Chr02 40462793 . A C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;DP=31;Dels=0.03;FS=1.938;HaplotypeScore=2.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.835;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:99:114,0,931 Chr02 40473069 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 40480601 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 40494091 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 40515814 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 40515816 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 40515959 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 40623721 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 40640389 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:70,0,69 Chr02 40640400 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr02 40685335 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 40685358 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 40685361 . G C 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:74,0,24 Chr02 40688960 . A C 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:70,0,27 Chr02 40722546 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 40722549 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 40722567 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 40722577 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 40722581 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 40742674 . G T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr02 40750973 . T A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.818;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,244 Chr02 40777192 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 40777200 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 40838002 . A G 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=14.98;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:178,0,173 Chr02 40838016 . C G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:133,0,222 Chr02 40838038 . A G 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:137,0,220 Chr02 40843094 . G T 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.456;DP=97;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=12.4898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.00;MQ0=10;MQRankSum=3.730;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.748 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,5:97:70:138,0,70 Chr02 40847797 . G T 92.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=110;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.77;MQ0=1;MQRankSum=3.758;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.772 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:104,5:110:13:144,0,13 Chr02 40857497 . G C 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:92:92,0,256 Chr02 40857527 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,257 Chr02 40857636 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:51:51,0,97 Chr02 40859470 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 40882400 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.92;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 40882415 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 40882463 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 40882473 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 40902372 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 40917062 . A T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,182 Chr02 40924148 . C A 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.696;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=5.41;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:24:99:158,0,611 Chr02 40962244 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr02 40964878 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr02 40973807 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 40983070 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 40983086 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 40983120 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 40998804 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,298 Chr02 41009156 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 41010801 . T C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:102,0,30 Chr02 41028605 . T A 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;DP=17;Dels=0.00;FS=4.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=3.269;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:238,0,357 Chr02 41058853 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;DP=26;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=1.80;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:75:75,0,769 Chr02 41104260 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr02 41106312 . A T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:132,0,102 Chr02 41109391 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr02 41124968 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr02 41158208 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:112,0,69 Chr02 41160116 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr02 41165059 . T A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.873;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:126,0,565 Chr02 41189027 . T A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:136,0,255 Chr02 41189072 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,163 Chr02 41196123 . T G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:103,0,30 Chr02 41196144 . T A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr02 41214017 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;DP=17;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.693;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:61:61,0,496 Chr02 41216927 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 41218050 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,103 Chr02 41224680 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 41224689 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 41224696 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 41224703 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 41224710 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 41236246 . C A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.509;QD=5.51;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:133,0,516 Chr02 41240960 . T A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=10.31;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:121,0,163 Chr02 41243471 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 41243494 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 41243501 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 41243509 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 41243521 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 41243533 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 41243540 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 41243542 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 41243554 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 41283189 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 41312613 . A T 43.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:72,0,27 Chr02 41314640 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.813;QD=2.07;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:78:78,0,747 Chr02 41326459 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:101,0,65 Chr02 41329128 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,137 Chr02 41389331 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:67:67,0,482 Chr02 41415786 . G C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr02 41440842 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 41443906 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 41448584 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 41454396 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 41501673 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 41515194 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=23.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,329 Chr02 41516477 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.903;QD=1.10;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:71:71,0,1274 Chr02 41528900 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr02 41528905 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 41529020 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr02 41529047 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr02 41529053 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr02 41543712 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84:84,0,216 Chr02 41552396 . A T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,205 Chr02 41558274 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,149 Chr02 41561412 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 41561415 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 41564617 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 41576463 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr02 41588674 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:75:75,0,104 Chr02 41590161 . A T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.270;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.571;QD=2.12;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:96:96,0,1010 Chr02 41590257 . T A 184.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.58;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=20.54;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,6:9:18:213,18,0 Chr02 41637628 . T C 115.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:144,0,27 Chr02 41646248 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 41646285 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 41646288 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 41646289 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 41646294 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 41652764 . G C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:104,0,101 Chr02 41706298 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,142 Chr02 41785672 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.373;DP=39;Dels=0.00;FS=30.956;HaplotypeScore=1.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:74:74,0,1235 Chr02 41797908 . G T 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=13;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=4.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=9.83;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:156,0,286 Chr02 41797994 . C A 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=8.98;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:154,0,324 Chr02 41801160 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr02 41805528 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,173 Chr02 41832805 . A T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr02 41853382 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.01;MQ0=0;MQRankSum=2.317;QD=1.48;ReadPosRankSum=-2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,2:37:6:82,6,0 Chr02 41857500 . A T 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:68,0,23 Chr02 41857581 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,107 Chr02 41886787 . T C 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=14.48;ReadPosRankSum=2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:173,0,177 Chr02 41897254 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 41941589 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.85;MQ0=2;QD=4.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:55,6,0 Chr02 41952636 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,276 Chr02 41959407 . C A 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:173,0,60 Chr02 41991527 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 42000326 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,176 Chr02 42049300 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.12;MQ0=6;MQRankSum=-0.505;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,232 Chr02 42049309 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.12;MQ0=6;MQRankSum=-0.505;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,232 Chr02 42054821 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 42054866 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 42058238 . A C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.22;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr02 42060569 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 42060818 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.996;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:20:49:49,0,118 Chr02 42060824 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.585 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:49:49,0,118 Chr02 42067318 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 42089273 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,208 Chr02 42129489 . C A 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=26;Dels=0.00;FS=8.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=5.64;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:175,0,665 Chr02 42207158 . C A 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=16;Dels=0.00;FS=19.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=12.11;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:222,0,309 Chr02 42243812 . T C 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=9.29;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:84:84,0,97 Chr02 42261423 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,66 Chr02 42263195 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr02 42290538 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:69,0,65 Chr02 42305473 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr02 42319051 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 42322323 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:95:95,0,212 Chr02 42343056 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr02 42353401 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,143 Chr02 42365926 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 42375946 . G A 112.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.23;MQ0=1;QD=14.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:15:141,15,0 Chr02 42381669 . T G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,148 Chr02 42383501 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr02 42387854 . C G 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=19.38;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:222,0,132 Chr02 42387866 . G C 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.447;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=19.28;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:221,0,136 Chr02 42387892 . A G 181.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.866;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:210,0,114 Chr02 42387910 . T C 171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:200,0,123 Chr02 42387918 . A G 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=17.35;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:90:167,0,90 Chr02 42388320 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:72,0,67 Chr02 42393081 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 42393101 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 42393357 . A T 109.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:138,0,19 Chr02 42394012 . C A 110.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:139,0,19 Chr02 42403496 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 42409983 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,172 Chr02 42426052 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:99:99,0,212 Chr02 42430156 . A C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr02 42438913 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 42440729 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 42441344 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 42477531 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:69,0,66 Chr02 42477548 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:71:72,0,71 Chr02 42477553 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,101 Chr02 42477609 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,105 Chr02 42490849 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 42495036 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 42501197 . A G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:109,0,64 Chr02 42502385 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,97 Chr02 42517156 . G T 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;DP=13;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=9.75;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:155,0,275 Chr02 42518543 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,185 Chr02 42522596 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 42530713 . C G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:102,0,28 Chr02 42530731 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr02 42536010 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr02 42541356 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,710 Chr02 42544740 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 42565630 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,181 Chr02 42565774 . C G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:102,0,109 Chr02 42565775 . T A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:103,0,108 Chr02 42567945 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:57:57,0,1036 Chr02 42574941 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;DP=80;Dels=0.00;FS=12.430;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=0.95;ReadPosRankSum=-4.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,9:80:99:104,0,2591 Chr02 42582302 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:64:89,0,64 Chr02 42619190 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,170 Chr02 42623744 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,96 Chr02 42744716 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 42745853 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 42754655 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr02 42755414 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr02 42867272 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 42867278 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 42867283 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 42867287 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 42867311 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 42868036 . C G 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:223,0,258 Chr02 42873966 . G A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=4.44;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:86:86,0,357 Chr02 42873986 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,293 Chr02 42874012 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.80;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,290 Chr02 42877280 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,145 Chr02 42877298 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr02 42879401 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.121;QD=1.12;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:72:72,0,1281 Chr02 42882336 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 42890050 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 42891128 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 42897914 . C A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;DP=39;Dels=0.00;FS=2.457;HaplotypeScore=5.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.082;QD=2.30;ReadPosRankSum=-3.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:118,0,1207 Chr02 42913137 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 42913162 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 42915361 . G T 39.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.33;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:13:68,0,13 Chr02 42917740 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,205 Chr02 42917836 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr02 42931574 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=4.25;ReadPosRankSum=-3.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:23:99:126,0,628 Chr02 42975231 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQ0=0;MQRankSum=1.375;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:69:69,0,1321 Chr02 43000975 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:44:135,0,44 Chr02 43115615 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,175 Chr02 43154993 . C A 190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.215;QD=4.54;ReadPosRankSum=-4.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,9:42:99:219,0,1231 Chr02 43158842 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 43163801 . G T 69.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:98,0,26 Chr02 43264366 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:135,0,59 Chr02 43300591 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,143 Chr02 43326700 . T A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:97,0,56 Chr02 43368863 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 43500661 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 43505186 . C A 170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.676;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.520;QD=6.57;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:199,0,640 Chr02 43526938 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,100 Chr02 43527371 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 43621470 . C T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.511;DP=43;Dels=0.00;FS=43.528;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.827;QD=3.20;ReadPosRankSum=-3.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:166,0,1315 Chr02 43632768 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 43672352 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr02 43682328 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.607;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.256;QD=0.89;ReadPosRankSum=-3.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,6:55:77:77,0,1813 Chr02 43693230 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 43783506 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,96 Chr02 43789873 . A G 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:30:79,0,30 Chr02 43831043 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 43848136 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 43869687 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 43869691 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 43869695 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 43869756 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 43884178 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.500;QD=2.31;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:116,0,1199 Chr02 43885235 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr02 43885263 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 43900866 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,167 Chr02 43913899 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.907;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:74:74,0,1241 Chr02 43917767 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.818 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:58:58,0,200 Chr02 43926883 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 43951040 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 43966593 . A G 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=37;Dels=0.00;FS=11.720;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.177;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:94:94,0,1172 Chr02 43990415 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,161 Chr02 43991019 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,182 Chr02 44042198 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,443 Chr02 44043719 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 44043793 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,107 Chr02 44065566 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,69 Chr02 44088565 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=12.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.934;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,414 Chr02 44106796 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr02 44134997 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 44137567 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 44146180 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,325 Chr02 44146258 . T A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:125,0,125 Chr02 44146271 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:64,0,58 Chr02 44162213 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr02 44162963 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 44182028 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr02 44187117 . C A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:133,0,103 Chr02 44200371 . C A 215.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:244,0,17 Chr02 44204204 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:59:59,0,593 Chr02 44204326 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 44208546 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:111,0,63 Chr02 44209766 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:52,0,28 Chr02 44244168 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,250 Chr02 44261379 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 44262973 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 44262988 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 44262992 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 44263008 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 44263234 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=15;Dels=0.00;FS=9.961;HaplotypeScore=4.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=7.92;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:147,0,360 Chr02 44263768 . C T 103.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:132,0,27 Chr02 44279693 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,100 Chr02 44286728 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr02 44301233 . A G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.47;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:96:96,0,176 Chr02 44301271 . A G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,173 Chr02 44307278 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr02 44307786 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,145 Chr02 44307788 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,142 Chr02 44307817 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr02 44307820 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr02 44307835 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr02 44309365 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,65 Chr02 44315917 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,110 Chr02 44315925 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,112 Chr02 44315975 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,110 Chr02 44324309 . T G 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:103,0,26 Chr02 44324321 . A G 75.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:104,0,23 Chr02 44326822 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 44326838 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,72 Chr02 44326840 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr02 44326864 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr02 44326883 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr02 44339077 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,204 Chr02 44339224 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,177 Chr02 44340020 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,72 Chr02 44353540 . C T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.07;ReadPosRankSum=-1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:117,0,253 Chr02 44356801 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 44371909 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,214 Chr02 44379155 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr02 44379169 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,104 Chr02 44379224 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,164 Chr02 44389714 . A T 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:65,0,27 Chr02 44428069 . C T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=17.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:148,0,100 Chr02 44428210 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,103 Chr02 44428212 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,108 Chr02 44489784 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 44489789 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 44489803 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 44496881 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr02 44497633 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr02 44500510 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,303 Chr02 44500572 . T C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=12.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:85:85,0,285 Chr02 44508204 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 44508228 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr02 44514934 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,105 Chr02 44515020 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=4.12;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:123,0,666 Chr02 44515207 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,228 Chr02 44521302 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,107 Chr02 44523518 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr02 44526819 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.123;QD=1.67;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:99:100,0,1389 Chr02 44529188 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:70,0,29 Chr02 44543196 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.226;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:94:94,0,1029 Chr02 44546655 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr02 44612259 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr02 44620838 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr02 44621215 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr02 44633128 . A C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,137 Chr02 44651583 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,141 Chr02 44660134 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,163 Chr02 44671117 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,289 Chr02 44712853 . A G 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;DP=14;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:169,0,337 Chr02 44712864 . T G 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;DP=14;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.467;QD=9.84;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:166,0,329 Chr02 44720331 . T G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr02 44720339 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr02 44720363 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr02 44725788 . C A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=15.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:97:134,0,97 Chr02 44725792 . A C 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98:129,0,98 Chr02 44725795 . C G 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=15.11;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:94:134,0,94 Chr02 44725819 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:107,0,67 Chr02 44725823 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:108,0,68 Chr02 44725833 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:109,0,69 Chr02 44725867 . G T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr02 44734991 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,250 Chr02 44735668 . T G 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:92,0,30 Chr02 44735671 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:98,0,30 Chr02 44735746 . A G 79.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:108,0,26 Chr02 44735778 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr02 44736212 . A G 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:138,0,24 Chr02 44736253 . T C 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr02 44736576 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,205 Chr02 44770779 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.45;ReadPosRankSum=-1.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:80:80,0,455 Chr02 44770797 . C G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:78:78,0,457 Chr02 44770854 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:72:72,0,415 Chr02 44775390 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:69:69,0,511 Chr02 44804523 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 44818014 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 44839245 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr02 44846990 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,139 Chr02 44847052 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:54:64,0,54 Chr02 44852841 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 44852851 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr02 44852854 . G T 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:74,0,27 Chr02 44852920 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr02 44852934 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,208 Chr02 44852940 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,219 Chr02 44852949 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,226 Chr02 44859942 . A G 175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;DP=15;Dels=0.00;FS=5.434;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.377;QD=11.72;ReadPosRankSum=1.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:15:99:204,0,238 Chr02 44859964 . G C 172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.323;DP=15;Dels=0.00;FS=2.276;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=1;MQRankSum=-0.710;QD=11.52;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:201,0,273 Chr02 44882073 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 44895489 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 44895553 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,72 Chr02 44907809 . A T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr02 44914787 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,140 Chr02 44915384 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr02 44969339 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 44991247 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 45058472 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr02 45111749 . T C 151.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:180,0,24 Chr02 45116524 . T A 277.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:306,0,15 Chr02 45119624 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 45119677 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 45130418 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,150 Chr02 45156074 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,216 Chr02 45161356 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,160 Chr02 45189687 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,102 Chr02 45190963 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.339;DP=84;Dels=0.00;FS=20.504;HaplotypeScore=2.9245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.145;QD=0.77;ReadPosRankSum=-4.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,9:84:93:93,0,2756 Chr02 45192174 . C A 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;DP=12;Dels=0.00;FS=10.925;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.31;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:152,0,237 Chr02 45194820 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 45194827 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 45194832 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 45194834 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 45194842 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 45194852 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 45194873 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 45194891 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 45218579 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,182 Chr02 45230294 . T C 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=15.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:91:140,0,91 Chr02 45230300 . G A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:92:135,0,92 Chr02 45247604 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 45261640 . T C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,107 Chr02 45261646 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,145 Chr02 45261658 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,143 Chr02 45261661 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,143 Chr02 45261679 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr02 45268388 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,183 Chr02 45278596 . G A 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=12.06;ReadPosRankSum=-0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:173,0,252 Chr02 45288864 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 45296272 . T G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr02 45300696 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,217 Chr02 45312145 . C A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:167,0,58 Chr02 45317540 . C A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.143;QD=8.12;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:150,0,358 Chr02 45338753 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 45349873 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,64 Chr02 45362329 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr02 45362545 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,216 Chr02 45362743 . G T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.071;QD=5.91;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:111,0,352 Chr02 45386303 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 45392433 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,265 Chr02 45420573 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 45420592 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:74,0,29 Chr02 45424273 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 45427639 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 45427643 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 45427728 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 45441500 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr02 45478083 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr02 45485376 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 45485399 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 45485632 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,207 Chr02 45485646 . C G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,213 Chr02 45485663 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,220 Chr02 45485664 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,215 Chr02 45486563 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr02 45503383 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,107 Chr02 45512556 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 45512593 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 45512633 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 45531906 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 45535223 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 45558614 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 45559066 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 45559130 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45559136 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45569781 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 45569812 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 45570624 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 45572136 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 45580464 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 45629196 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45633756 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,136 Chr02 45641629 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 45641633 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 45641649 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 45641657 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 45654437 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45654571 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 45656104 . G T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr02 45676837 . C T 1000.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:75:1029,75,0 Chr02 45677026 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.88;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,252 Chr02 45677749 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 45678005 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 45678020 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:68,6,0 Chr02 45678040 . A C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 45678549 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 45678587 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr02 45680070 . A T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr02 45694637 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 45740743 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr02 45740882 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45740896 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 45740897 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 45750050 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 45757103 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 45771326 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 45814934 . T G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr02 45814963 . A T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr02 45815559 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 45815570 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 45815573 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 45828779 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45850178 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 45851127 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 45856750 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 45864882 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 45891854 . G T 67.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 45923898 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 45929789 . G T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=18.86;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:94:198,0,94 Chr02 45940556 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 45943898 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr02 45968250 . A G 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 46033837 . G T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 46033840 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr02 46043190 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 46060014 . T G 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=24.97;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:253,0,56 Chr02 46060147 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 46061315 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 46061383 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 46064809 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;DP=23;Dels=0.00;FS=5.706;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=0.90;ReadPosRankSum=-0.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,736 Chr02 46064840 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=23;Dels=0.00;FS=5.706;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.776;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,768 Chr02 46066420 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,69 Chr02 46081231 . G A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:161,0,247 Chr02 46081517 . G T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 46087038 . T A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;DP=21;Dels=0.00;FS=5.972;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=3.08;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:93:93,0,592 Chr02 46087039 . G C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;DP=21;Dels=0.00;FS=5.972;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.582;QD=3.51;ReadPosRankSum=1.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:102,0,606 Chr02 46091637 . T A 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr02 46097336 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 46097367 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 46098892 . G A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.447;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,191 Chr02 46112460 . G T 46.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:105,0,29 Chr02 46138097 . T C 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:137,0,64 Chr02 46142197 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46142198 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 46142202 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 46148093 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,99 Chr02 46157816 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 46170593 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 46170789 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,206 Chr02 46170793 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,201 Chr02 46170860 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,103 Chr02 46170867 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,109 Chr02 46171554 . T C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86:109,0,86 Chr02 46171562 . A G 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:132,0,93 Chr02 46174953 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 46174968 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 46174989 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 46183383 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 46198101 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;DP=27;Dels=0.00;FS=9.748;HaplotypeScore=12.1118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.174;QD=1.99;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:82:82,0,609 Chr02 46198124 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.196;DP=36;Dels=0.00;FS=8.655;HaplotypeScore=10.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=1.27;ReadPosRankSum=2.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:74:74,0,976 Chr02 46198376 . T C 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.7186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=2.766;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:123,0,528 Chr02 46198403 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.9931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=0;MQRankSum=1.398;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:59:59,0,554 Chr02 46199180 . T C 53.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.84;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:82,0,27 Chr02 46199233 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr02 46199781 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr02 46199788 . C T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:99,0,146 Chr02 46199789 . A C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr02 46199792 . A G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.11;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:99,0,147 Chr02 46200279 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,185 Chr02 46201463 . C T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.44;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:103,0,25 Chr02 46201479 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.01;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 46201518 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:64,0,29 Chr02 46201526 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:64,0,29 Chr02 46201537 . T C 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr02 46204787 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 46204794 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 46204811 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 46204818 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 46204847 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr02 46204863 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 46205032 . T A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQ0=0;MQRankSum=0.660;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:90:90,0,1300 Chr02 46205213 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,98 Chr02 46205219 . C T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=1.681;QD=8.74;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:168,0,316 Chr02 46205258 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=2.766;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:17:99:189,0,342 Chr02 46205261 . G A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=1.708;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:229,0,336 Chr02 46206731 . C T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 46206782 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 46257779 . T A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:69,0,31 Chr02 46257830 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr02 46270360 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:64,0,29 Chr02 46276487 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 46276595 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 46278935 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 46278945 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 46279115 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 46279117 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46279143 . G A 53.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 46313255 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 46314648 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 46314662 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 46328565 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,217 Chr02 46329412 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 46333321 . C G 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr02 46333662 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 46341341 . T A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.502;DP=38;Dels=0.00;FS=42.023;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.941;QD=3.36;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:156,0,1172 Chr02 46358767 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.21;MQ0=14;MQRankSum=0.736;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,2:17:30:68,0,30 Chr02 46366375 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 46391935 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 46406301 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:132,0,103 Chr02 46408897 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 46410415 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 46428167 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 46430845 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 46436888 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr02 46443288 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 46456592 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.396;DP=77;Dels=0.00;FS=12.377;HaplotypeScore=1.8940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=0.87;ReadPosRankSum=1.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:95:95,0,2506 Chr02 46456595 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=77;Dels=0.00;FS=12.377;HaplotypeScore=1.8940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.125;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:91:91,0,2514 Chr02 46456597 . A C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;DP=78;Dels=0.00;FS=12.277;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=0.75;ReadPosRankSum=1.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,8:78:87:87,0,2574 Chr02 46456599 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.411;DP=78;Dels=0.00;FS=12.377;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=0.86;ReadPosRankSum=1.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:78:95:95,0,2556 Chr02 46456612 . T G 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;DP=79;Dels=0.00;FS=12.357;HaplotypeScore=17.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.739;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:79:86:86,0,2730 Chr02 46456614 . C T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.918;DP=79;Dels=0.00;FS=12.357;HaplotypeScore=17.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.714 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:79:91:91,0,2716 Chr02 46462560 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46462562 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46467603 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr02 46467620 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 46467635 . A G 39.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 46571895 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 46571897 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 46577799 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46607360 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 46607374 . T C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 46657593 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 46662439 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46662493 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 46676894 . C A 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=12.85;ReadPosRankSum=-3.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:221,0,274 Chr02 46677609 . A G 42.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr02 46723587 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:64,0,50 Chr02 46723855 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 46723876 . C T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr02 46727030 . T A 104.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:132,12,0 Chr02 46733141 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:56:56,0,560 Chr02 46733242 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 46771986 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 46787757 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,186 Chr02 46800427 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 46852778 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 46860501 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 46877826 . T G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.09;MQ0=1;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr02 46898444 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 46898456 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 46914645 . T A 43.74 . 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T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,150 Chr02 46959738 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 46974022 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,253 Chr02 46983989 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 46994461 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 46994464 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr02 47002865 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 47013101 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47014006 . T A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr02 47014036 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.91;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 47028021 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.399;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.171;QD=1.40;ReadPosRankSum=-2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:66:66,0,809 Chr02 47029881 . C A 345.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:374,27,0 Chr02 47035459 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 47043635 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr02 47055430 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr02 47055498 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 47057204 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 47061471 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 47070852 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr02 47072470 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47073022 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr02 47073688 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47073725 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 47079486 . C T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:133,0,222 Chr02 47079494 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=3.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.344;QD=5.41;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:104,0,362 Chr02 47110050 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47110100 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47110116 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47110296 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47120409 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47120437 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47150201 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47156996 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 47175658 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47178158 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 47178178 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 47178180 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47185285 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47185336 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47191248 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 47195715 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;DP=85;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=1;MQRankSum=2.391;QD=0.54;ReadPosRankSum=-2.421 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:83,2:85:6:73,6,0 Chr02 47202047 . G C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr02 47209518 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47209587 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 47212477 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 47213137 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47220021 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 47220102 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 47220155 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47227818 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 47227876 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 47229564 . G T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=15.31;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:166,0,138 Chr02 47245894 . C G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr02 47245895 . G C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr02 47246954 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47279327 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47300016 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47304064 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47317140 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 47317152 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 47317186 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 47317187 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 47318400 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 47333840 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47348568 . A C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr02 47348600 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 47348612 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 47348624 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 47366150 . A T 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=14;Dels=0.00;FS=5.880;HaplotypeScore=5.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=2.933;QD=8.27;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:144,0,299 Chr02 47370543 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47371942 . C A 74.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=14.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21:103,0,21 Chr02 47371949 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:50,0,27 Chr02 47373249 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 47373276 . A C 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 47373303 . T G 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.94;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr02 47389100 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 47389141 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47399608 . G A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr02 47414354 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47415836 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 47415860 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 47421334 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 47421361 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 47425403 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 47433672 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 47433711 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47433713 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47433719 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47433927 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,177 Chr02 47440466 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47441946 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47441959 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 47460539 . C G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;DP=13;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.157;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,320 Chr02 47490277 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 47505330 . G C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 Chr02 47505520 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47505531 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 47508011 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47516084 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 47519201 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.477;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=2.02;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:93:93,0,1009 Chr02 47519297 . C A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:139,0,478 Chr02 47520502 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47523432 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47523465 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47551778 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47553704 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47553731 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47554691 . C A 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=5.78;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:190,0,764 Chr02 47560681 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47573853 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47583221 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 47587205 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr02 47593052 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47598427 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47598454 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47598472 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 47600278 . A G 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr02 47600328 . C T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr02 47600336 . A G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr02 47610124 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr02 47617964 . T G 217.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:246,21,0 Chr02 47620562 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47621768 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 47621770 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 47621794 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47625968 . T G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr02 47657227 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47658462 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 47658511 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47683702 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 47684420 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr02 47684444 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 47686659 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 47686708 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 47686720 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 47686721 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr02 47686731 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 47718526 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr02 47726585 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,108 Chr02 47734321 . G A 36.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.29;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:102,0,93 Chr02 47773351 . A T 180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.811;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=10.04;ReadPosRankSum=-3.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:209,0,375 Chr02 47774878 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47774895 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47777655 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47778899 . C T 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr02 47782977 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 47786066 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 47786067 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr02 47796540 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 47796562 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 47796563 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 47803544 . T G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr02 47806966 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,234 Chr02 47812903 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 47833326 . T C 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.58;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,244 Chr02 47846941 . T C 155.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:184,15,0 Chr02 47870806 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 47874543 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 47877206 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 47886077 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 47915919 . T A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4972;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.54;MQ0=4;MQRankSum=2.262;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:6:56,6,0 Chr02 47940431 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 47950480 . A T 70.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.70;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:99,0,21 Chr02 48043856 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 48082020 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 48082031 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48082038 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48082100 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48091468 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48092585 . C A 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=10.48;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:154,0,246 Chr02 48093408 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48093431 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 48093902 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 48093916 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 48093955 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 48099249 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr02 48099276 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr02 48099298 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 48120998 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48122861 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 48124055 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 48124092 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 48132234 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48134362 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 48134365 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr02 48140260 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:104,0,65 Chr02 48150773 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 48151579 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr02 48159168 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48175713 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr02 48184277 . T C 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=0;QD=9.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:73,9,0 Chr02 48184285 . G C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:71,9,0 Chr02 48184295 . T C 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6269;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.15;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:73,9,0 Chr02 48184304 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7836;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.15;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:6:49,6,0 Chr02 48184336 . T A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.30;MQ0=3;QD=5.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:73,9,0 Chr02 48187295 . C G 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.75;MQ0=6;QD=2.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:48,6,0 Chr02 48189679 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 48192857 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.837;DP=47;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=5.5647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.27;MQ0=4;MQRankSum=2.121;QD=0.53;ReadPosRankSum=2.407 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,3:47:53:53,0,252 Chr02 48192861 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=17;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=2.7823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.95;MQ0=4;MQRankSum=0.930;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,154 Chr02 48192936 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.384;DP=68;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=6.9098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.88;MQ0=12;MQRankSum=0.305;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,6:68:62:62,0,844 Chr02 48192974 . G A 191.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.10;MQ0=22;MQRankSum=3.433;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,6:46:19:220,0,19 Chr02 48193176 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.74;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:72,6,0 Chr02 48193223 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:94:94,0,108 Chr02 48196566 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.82;MQ0=2;QD=9.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:103,9,0 Chr02 48198559 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.22;MQ0=8;MQRankSum=-3.057;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,41:45:62:62,0,143 Chr02 48205241 . A T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=10;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.15;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=13.18;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:160,0,146 Chr02 48205283 . T C 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.15;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:66:253,0,66 Chr02 48205292 . T C 218.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.15;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=21.88;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:66:247,0,66 Chr02 48206675 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60:67,0,60 Chr02 48208812 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr02 48208840 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr02 48209858 . T C 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=37;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.77;MQ0=20;MQRankSum=-2.548;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:99:115,0,482 Chr02 48209865 . G A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=37;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.77;MQ0=20;MQRankSum=-2.548;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:99:117,0,491 Chr02 48210988 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=43;Dels=0.00;FS=2.788;HaplotypeScore=3.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.69;MQ0=21;MQRankSum=1.435;QD=0.53;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,3:43:51:51,0,661 Chr02 48215895 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.292;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:50:50,0,657 Chr02 48215946 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.8061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:73:73,0,634 Chr02 48215952 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.346;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:73:73,0,634 Chr02 48215969 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.102;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=26.6002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.42;MQ0=0;MQRankSum=0.328;QD=0.73;ReadPosRankSum=2.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,7:61:73:73,0,634 Chr02 48216840 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQ0=5;MQRankSum=0.370;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:71:71,0,283 Chr02 48216929 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.788;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.86;MQ0=28;MQRankSum=-2.971;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,4:44:53:53,0,437 Chr02 48218042 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,219 Chr02 48218121 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,210 Chr02 48220897 . T C 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.83;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr02 48220903 . G C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:101,0,68 Chr02 48220922 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:103,0,69 Chr02 48220923 . C T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:105,0,69 Chr02 48221083 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=39;Dels=0.00;FS=39.404;HaplotypeScore=2.4678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.38;MQ0=0;MQRankSum=-3.101;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.127 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,17:39:73:73,0,781 Chr02 48221829 . T A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.240;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=1;MQRankSum=1.178;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.368 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,11:35:6:51,6,0 Chr02 48221834 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7965;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=1;MQRankSum=0.861;QD=0.68;ReadPosRankSum=-0.207 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,17:35:6:51,6,0 Chr02 48221888 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.733;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3214;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=1;MQRankSum=-2.459;QD=0.68;ReadPosRankSum=0.703 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,10:35:6:51,6,0 Chr02 48221902 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9783;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=1;MQRankSum=2.306;QD=0.68;ReadPosRankSum=0.769 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:33,2:35:6:51,6,0 Chr02 48224328 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.176;DP=98;Dels=0.00;FS=20.049;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.37;MQ0=5;MQRankSum=1.085;QD=0.43;ReadPosRankSum=-2.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,9:98:70:70,0,2235 Chr02 48224341 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;DP=87;Dels=0.00;FS=17.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.41;MQ0=2;MQRankSum=-3.175;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,11:87:64:64,0,2212 Chr02 48224495 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.442;DP=83;Dels=0.00;FS=13.603;HaplotypeScore=16.9668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.71;MQ0=29;MQRankSum=-4.249;QD=0.41;ReadPosRankSum=1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,7:83:62:62,0,1740 Chr02 48231055 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:167,12,0 Chr02 48235697 . A G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=27.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 48235698 . T G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 48235700 . T A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=23.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr02 48235728 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=28.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr02 48235734 . G T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.21;MQ0=0;QD=29.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr02 48235945 . G T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.20;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr02 48236198 . A C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.28;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:89:89,0,247 Chr02 48237856 . G T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.06;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 48237864 . A T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.06;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 48237890 . T G 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.06;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr02 48239557 . A C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.76;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:111,12,0 Chr02 48239571 . C T 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.76;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:111,12,0 Chr02 48239753 . T A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.522;DP=28;Dels=0.00;FS=8.806;HaplotypeScore=1.8640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.909;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:155,0,711 Chr02 48258221 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.44;MQ0=28;MQRankSum=-0.358;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,3:33:43:71,0,43 Chr02 48258701 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.041;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.2004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQ0=2;MQRankSum=-1.176;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:99:106,0,502 Chr02 48259022 . A C 168.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=114;Dels=0.00;FS=7.761;HaplotypeScore=36.0294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.51;MQ0=1;MQRankSum=-0.741;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,21:114:99:197,0,1559 Chr02 48259028 . C T 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;DP=97;Dels=0.00;FS=1.316;HaplotypeScore=3.6698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.04;MQ0=1;MQRankSum=-4.006;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.780 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,22:97:99:174,0,1914 Chr02 48261262 . T C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.03;MQ0=2;MQRankSum=-0.731;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:87:87,0,209 Chr02 48263256 . T C 165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=76;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.9397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.84;MQ0=35;MQRankSum=3.669;QD=2.18;ReadPosRankSum=-2.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,13:76:99:194,0,412 Chr02 48265219 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 48268691 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,233 Chr02 48271307 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 48284301 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 48284304 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 48286366 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48286379 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48286382 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48287082 . T C 333.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:362,27,0 Chr02 48303191 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 48304177 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 48305153 . A T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.751;DP=37;Dels=0.00;FS=7.903;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=2.40;ReadPosRankSum=-3.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:99:117,0,1069 Chr02 48307466 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48309486 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr02 48310397 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48310426 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 48310468 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 48313116 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 48313649 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 48313686 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 48316921 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 48317724 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr02 48318179 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr02 48334288 . G T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.16;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr02 48334331 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 48334368 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 48334429 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 48338100 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 48338411 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr02 48344956 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 48380264 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 48381347 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48382504 . T G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr02 48391942 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48391954 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48391957 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48391959 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 48394954 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 48425719 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr02 48443587 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 48445965 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48445981 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 48445983 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 48446045 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 48458883 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=3.10;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:39:99:149,0,1193 Chr02 48459936 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 48459940 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48459949 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48459951 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48460153 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48460283 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 48460295 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48471204 . C A 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:136,0,24 Chr02 48475045 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr02 48479730 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 48486396 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr02 48519740 . C A 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:127,0,159 Chr02 48525733 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr02 48531750 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 48531811 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48531833 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 48532102 . C A 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.005;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=10.78;ReadPosRankSum=3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:190,0,300 Chr02 48532105 . A G 165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.770;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=11.05;ReadPosRankSum=3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:194,0,304 Chr02 48543323 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,178 Chr02 48610277 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 48610309 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 48610333 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 48620321 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr02 48644565 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.69;MQ0=0;QD=3.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:9:106,9,0 Chr02 48669701 . G A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr02 48681442 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=21;Dels=0.00;FS=4.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.18;ReadPosRankSum=2.362 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,661 Chr02 48692419 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr02 48693362 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:75:75,0,1281 Chr02 48704377 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 48746187 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48746215 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48749451 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 48749465 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48749481 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 48749488 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48769573 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 48769584 . G T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 48769601 . G T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr02 48769614 . T G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 48770334 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48772766 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr02 48772848 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr02 48797654 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,103 Chr02 48812017 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:88:88,0,178 Chr02 48822557 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 48822646 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr02 48840790 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr02 48840816 . T C 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr02 48840843 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr02 48840852 . T G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr02 48845873 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48859272 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=32;Dels=0.00;FS=8.062;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=2.06;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:94:94,0,1012 Chr02 48860602 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 48860666 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:113,0,29 Chr02 48860669 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr02 48860672 . A C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr02 48860856 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr02 48860885 . G A 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr02 48860887 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr02 48860891 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr02 48862016 . A G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:148,12,0 Chr02 48862034 . T C 150.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:179,15,0 Chr02 48862039 . A C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:143,12,0 Chr02 48862518 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48871279 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48874274 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;DP=38;Dels=0.00;FS=18.478;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=1.41;ReadPosRankSum=-3.132 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:38:82:82,0,1151 Chr02 48880946 . C A 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.377;QD=11.91;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:14:99:195,0,211 Chr02 48883536 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48883654 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr02 48903654 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.305;DP=45;Dels=0.00;FS=2.471;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.163;QD=0.55;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:53:53,0,1501 Chr02 48907337 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48921707 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:65,0,33 Chr02 48926559 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,478 Chr02 48932929 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:7:98:98,0,104 Chr02 48933154 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr02 48933172 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr02 48939831 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr02 48955473 . G T 197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.780;DP=14;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=14.13;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:226,0,232 Chr02 48959198 . C T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr02 48959889 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;DP=31;Dels=0.00;FS=19.793;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:60:60,0,941 Chr02 48969376 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.349;QD=4.99;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:21:99:133,0,548 Chr02 48969468 . A T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.845;DP=62;Dels=0.00;FS=18.103;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=1.09;ReadPosRankSum=-4.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,7:62:96:96,0,1992 Chr02 48969706 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 48970623 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 48974479 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr02 48976089 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 48976092 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr02 48976128 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr02 48979429 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 48980002 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:49:49,0,107 Chr02 48980966 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr02 48987487 . G A 102.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:8:130,0,8 Chr02 49004955 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 49012198 . C A 262.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.852;DP=31;Dels=0.00;FS=23.100;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=8.48;ReadPosRankSum=-4.458 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,10:31:99:291,0,667 Chr02 49012856 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr02 49012870 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr02 49012875 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr02 49013018 . A T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr02 49013033 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:121,9,0 Chr02 49013038 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr02 49013191 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr02 49019878 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr02 49025469 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr02 49026648 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 6022 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 11752 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11761 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 18892 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 40961 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;DP=61;Dels=0.00;FS=25.664;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.075;QD=0.88;ReadPosRankSum=-4.288 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,7:61:82:82,0,1962 Chr03 44803 . G T 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=8.04;ReadPosRankSum=-3.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:173,0,438 Chr03 44997 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 49173 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 55511 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 58846 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 58908 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 92463 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 92472 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 92474 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 92479 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 92492 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 96712 . G A 86.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:115,0,27 Chr03 96721 . A G 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr03 96739 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr03 100016 . C G 46.86 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:4:6:78,6,0 Chr03 112600 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 117493 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.10;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:75:75,0,212 Chr03 130100 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 148454 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 160808 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 160830 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 162000 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 174286 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,243 Chr03 195551 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 258413 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 305597 . G A 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.26;MQ0=4;QD=10.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:102,9,0 Chr03 305660 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.05;MQ0=5;QD=11.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:121,9,0 Chr03 305673 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.26;MQ0=4;QD=13.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:119,9,0 Chr03 310304 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,99 Chr03 316647 . C G 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.56;MQ0=0;QD=2.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:12:94,12,0 Chr03 316661 . T C 68.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.56;MQ0=0;QD=2.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:12:96,12,0 Chr03 316667 . T C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.21;MQ0=0;QD=1.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:9:70,9,0 Chr03 330084 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 330090 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 330092 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 330823 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 330897 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 339699 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 350110 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 358150 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 358151 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 358185 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 358191 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 398057 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 402513 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.65;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr03 405302 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr03 406673 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 406680 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 407316 . C A 101.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:130,0,21 Chr03 407318 . A C 101.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:130,0,21 Chr03 420436 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 422648 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr03 424115 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 424149 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 432897 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 444142 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 444149 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 458224 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 458236 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 458245 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 458254 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 459033 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 459077 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 460411 . A G 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 Chr03 472158 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 472923 . C A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.92;MQ0=0;QD=20.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:110,9,0 Chr03 473180 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 476565 . T A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr03 481173 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 481190 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 484980 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr03 515500 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 515524 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr03 515535 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 515540 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 515550 . A T 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr03 515552 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.76;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 515750 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 515751 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 515801 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 520020 . G C 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr03 520081 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 520309 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,142 Chr03 539505 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 554380 . A C 266.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:295,21,0 Chr03 554958 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 554990 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 555363 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.234;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.187;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:52:52,0,1131 Chr03 563226 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 564554 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 564735 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 571472 . A G 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.81;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr03 576327 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 576328 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 621131 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 622567 . A T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.50;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr03 622601 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 623485 . C A 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr03 626762 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 626829 . A C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 627537 . G T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.619;QD=4.89;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:131,0,553 Chr03 658528 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 674779 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 674780 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 674799 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 675266 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 676861 . A G 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr03 678792 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 723097 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 724716 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 724731 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 740701 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 752749 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 794233 . A G 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr03 794249 . C T 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 Chr03 794295 . T G 224.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:253,18,0 Chr03 795322 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 796029 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 804926 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 805046 . A C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 805092 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 808620 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 823622 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 823624 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 824213 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 824223 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 847790 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 847810 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 847817 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 847821 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 847840 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 847844 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 861440 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 873939 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,102 Chr03 885408 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,241 Chr03 902766 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 902816 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 902829 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 919684 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 947541 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 957451 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,143 Chr03 958390 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 958726 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 983948 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.67;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 1000369 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1001651 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1023100 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1024385 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.145;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.689;QD=0.90;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,748 Chr03 1024900 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 1042663 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr03 1043249 . G C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043251 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043256 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043258 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043263 . A C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043274 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043276 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043280 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1043296 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 1045142 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1045701 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.58;MQ0=31;QD=1.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,71:72:9:116,9,0 Chr03 1080882 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 1080932 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 1084733 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1084757 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1090393 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 1090402 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 1098839 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 1106916 . T G 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr03 1106937 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr03 1109709 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1122117 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1129863 . C T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 1130239 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 1130263 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr03 1130269 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 1143982 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 1154809 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 1176993 . C A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQ0=0;MQRankSum=-4.091;QD=3.43;ReadPosRankSum=4.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:155,0,1107 Chr03 1184605 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr03 1184620 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 1184641 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:70,0,65 Chr03 1203972 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:53:53,0,661 Chr03 1218238 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1234767 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1234769 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 1235449 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1235463 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1235514 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=0;QD=7.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:77,6,0 Chr03 1235524 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=0;QD=7.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:79,6,0 Chr03 1235529 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=0;QD=7.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:79,6,0 Chr03 1244202 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1244220 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 1244243 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1244680 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:66:100,0,66 Chr03 1244766 . C A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:139,0,24 Chr03 1251203 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;DP=15;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,443 Chr03 1261824 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,109 Chr03 1293985 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1294004 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 1297239 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1309390 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 1309465 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1351152 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 1353847 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 1380650 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 1380737 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,327 Chr03 1386882 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1386933 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1390435 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 1390438 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 1390456 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 1390470 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 1390482 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 1390506 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 1390798 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1390845 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1414245 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1439499 . G T 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.238;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.919;QD=3.51;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:37:99:158,0,1053 Chr03 1439579 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=9.78;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:10:99:126,0,177 Chr03 1442516 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1459134 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 1459135 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 1459213 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 1459418 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1459426 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1459452 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1459467 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 1464827 . G T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.275;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.259;QD=3.20;ReadPosRankSum=-4.397 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,8:44:99:169,0,1345 Chr03 1467323 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1467374 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1517913 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 1533985 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr03 1543079 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1543668 . A T 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr03 1543696 . G T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:160,12,0 Chr03 1560939 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 1561785 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;DP=28;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=1.63;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:74:74,0,878 Chr03 1562037 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1582479 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr03 1582999 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1583022 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 1605881 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,167 Chr03 1691993 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1698197 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 1708594 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 1709276 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 1711956 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 1715418 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1716286 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 1728814 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1728894 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1732806 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1732839 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1732844 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1732859 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1732886 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1732887 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1732893 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1733346 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 1759756 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 1763793 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.70;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr03 1763823 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.70;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 1763832 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1763833 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1763839 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1763860 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1763865 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1763868 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1825961 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 1839390 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.063;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=1.82;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:90:90,0,1082 Chr03 1839483 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 1866640 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1867639 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1900980 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 1901043 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1909106 . G C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 1911291 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,260 Chr03 1914159 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,204 Chr03 1924905 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr03 1940503 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 1950161 . A T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.07;MQ0=0;QD=3.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:65,9,0 Chr03 1950163 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.92;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=2.87;ReadPosRankSum=1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:9:65,9,0 Chr03 1950173 . T G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.75;MQ0=0;QD=3.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:87,12,0 Chr03 1950211 . T G 82.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.667;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.0620;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.33;MQ0=2;MQRankSum=-1.732;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,55:59:15:111,15,0 Chr03 1955133 . A T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=11.4261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:83:83,0,141 Chr03 1959554 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 1959557 . A C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 1994757 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 1994775 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 1994799 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1994824 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1994833 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 1994843 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 2002516 . G T 41.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr03 2039667 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 2068520 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 2069502 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 2069509 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 2069512 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2069518 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2069689 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 2072711 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2072758 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 2072764 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 2072769 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 2079291 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,100 Chr03 2085104 . A G 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr03 2085126 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr03 2092045 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 2096152 . A C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,184 Chr03 2096178 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,188 Chr03 2129829 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 2129832 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2144089 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2144091 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2144128 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2146245 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 2146249 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 2146270 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:72,0,33 Chr03 2156888 . G A 146.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:175,15,0 Chr03 2166399 . A C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 2166436 . T G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:107,9,0 Chr03 2166441 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 2172418 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 2172459 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 2177059 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2219648 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2219813 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 2219839 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 2239276 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 2239333 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2239341 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2265947 . C G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.96;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:100,0,87 Chr03 2286986 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 2292223 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 2302487 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2302683 . A G 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.35;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 2306087 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:59:59,0,143 Chr03 2307777 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:100,0,65 Chr03 2335739 . T C 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=11.58;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:144,0,169 Chr03 2335766 . T C 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=13.08;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:159,0,170 Chr03 2335768 . C T 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:158,0,178 Chr03 2356638 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 2384061 . T C 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:78:78,0,487 Chr03 2385902 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.68;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2386264 . G T 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:207,0,57 Chr03 2386747 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2387385 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.34;MQ0=1;QD=1.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:6:77,6,0 Chr03 2387905 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2387946 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 2388796 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 2388800 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 2388826 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2398553 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:51:51,0,84 Chr03 2423951 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,139 Chr03 2433471 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 2433512 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2433515 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 2438191 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 2438249 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 2463233 . G A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr03 2463235 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:99,0,29 Chr03 2463237 . C G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr03 2463245 . A G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:95,0,28 Chr03 2478340 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 2478359 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 2479647 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479658 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479661 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479676 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479688 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479706 . G T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2479709 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 2481916 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 2482512 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=2.02;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:107,0,1153 Chr03 2487914 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.948;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:60:60,0,552 Chr03 2493952 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2531818 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 2531822 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 2620735 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 2620750 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 2620767 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 2620794 . T G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr03 2620798 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 2620810 . G T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr03 2646546 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,166 Chr03 2647857 . A T 36.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:65,0,21 Chr03 2647894 . C T 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:75,0,26 Chr03 2663545 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 2663552 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 2678010 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr03 2692405 . G T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:167,0,100 Chr03 2707538 . T G 162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;DP=24;Dels=0.00;FS=55.392;HaplotypeScore=17.7794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=6.78;ReadPosRankSum=-3.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:191,0,593 Chr03 2711970 . T A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.609;QD=3.51;ReadPosRankSum=-4.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:179,0,1283 Chr03 2743115 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=1.08;ReadPosRankSum=3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:64:64,0,1086 Chr03 2744025 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.208;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:57:57,0,973 Chr03 2744137 . A T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.265 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:110,0,510 Chr03 2744166 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;DP=21;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:101,0,613 Chr03 2748012 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=1.40;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:66:66,0,833 Chr03 2755478 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=7.80;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:114,0,236 Chr03 2761508 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 2761510 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2761512 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 2761514 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 2761515 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 2768618 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 2768637 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,123 Chr03 2770276 . C T 142.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:171,0,21 Chr03 2770527 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.738;DP=44;Dels=0.00;FS=1.821;HaplotypeScore=1.6648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.294;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,5:44:72:72,0,1407 Chr03 2773500 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 2773514 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 2773975 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 2778459 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 2805585 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 2810653 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 2817201 . A C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,146 Chr03 2840560 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 2842305 . T C 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:106,0,104 Chr03 2860737 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.545;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:74:74,0,286 Chr03 2860742 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.267;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.55;MQ0=0;MQRankSum=1.714;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,2:17:50:50,0,289 Chr03 2860745 . T G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:49:49,0,287 Chr03 2861933 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,203 Chr03 2861950 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,161 Chr03 2882827 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 2917205 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,152 Chr03 2917305 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 2926843 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,223 Chr03 2939211 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 3021543 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,112 Chr03 3032664 . T G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,228 Chr03 3079923 . T A 109.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:138,0,23 Chr03 3095098 . G T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 3095195 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,181 Chr03 3097782 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr03 3182383 . C G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr03 3199226 . G C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 3200878 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 3200881 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 3200909 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 3200950 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 3200953 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 3201099 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 3201111 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 3203749 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 3204091 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 3221651 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 3232765 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 3238572 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 3245372 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:98,0,61 Chr03 3283219 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 3283229 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 3283248 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr03 3283874 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 3284020 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:96:96,0,259 Chr03 3364188 . A T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.531;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:146,0,544 Chr03 3364218 . T G 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:151,0,550 Chr03 3364264 . T A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.262;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:131,0,510 Chr03 3366153 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,338 Chr03 3366224 . G A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.139;QD=7.99;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:156,0,348 Chr03 3370041 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,346 Chr03 3370075 . C G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,344 Chr03 3377220 . C G 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.159;QD=4.33;ReadPosRankSum=0.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:184,0,997 Chr03 3377233 . G A 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.308;DP=28;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=4.63;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:158,0,795 Chr03 3377239 . T C 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;DP=28;Dels=0.00;FS=2.063;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=4.78;ReadPosRankSum=-1.260 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:162,0,791 Chr03 3388240 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.795;DP=60;Dels=0.00;FS=30.616;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=1.53;ReadPosRankSum=-4.534 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,8:60:99:120,0,1910 Chr03 3404124 . T C 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.276;DP=14;Dels=0.00;FS=23.314;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=12.63;ReadPosRankSum=3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:205,0,233 Chr03 3471802 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr03 3471862 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr03 3480878 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,150 Chr03 3501695 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 3510599 . A C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr03 3514804 . A G 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;DP=14;Dels=0.00;FS=2.836;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:116,0,337 Chr03 3533763 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:101,0,183 Chr03 3600228 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:98:98,0,223 Chr03 3616007 . G C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:96:96,0,256 Chr03 3624929 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:72:72,0,544 Chr03 3624932 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:72:72,0,548 Chr03 3624952 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:65:65,0,518 Chr03 3624958 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,488 Chr03 3648218 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 3650819 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,296 Chr03 3655764 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:108,0,68 Chr03 3689157 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 3695171 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.52;MQ0=18;MQRankSum=1.067;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,18:26:53:53,0,115 Chr03 3723004 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:53:53,0,289 Chr03 3737861 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 3748303 . T A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=56;Dels=0.00;FS=10.494;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.293;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.644 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,8:56:99:129,0,1712 Chr03 3750443 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 3771078 . C A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:129,0,180 Chr03 3807410 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,331 Chr03 3810128 . G C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 3831885 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:71,0,65 Chr03 3831957 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,174 Chr03 3841441 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,264 Chr03 3841782 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 3853883 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,109 Chr03 3883104 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 3984837 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.035;DP=53;Dels=0.00;FS=14.520;HaplotypeScore=2.9321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.632;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,6:53:71:71,0,1658 Chr03 3984926 . A G 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=9.93;ReadPosRankSum=-3.442 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:207,0,377 Chr03 4012810 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:103,0,173 Chr03 4016377 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 4021167 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.79;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr03 4021192 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.79;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 4026165 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.225;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQ0=0;MQRankSum=-3.775;QD=2.80;ReadPosRankSum=-2.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:115,0,911 Chr03 4105804 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 4136607 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=-2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,339 Chr03 4191731 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 4208371 . C G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,100 Chr03 4219670 . C A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;DP=34;Dels=0.00;FS=20.946;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.426;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:164,0,966 Chr03 4408556 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:89:103,0,89 Chr03 4415830 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;DP=15;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=2.7249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:82:82,0,435 Chr03 4416462 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:94:94,0,300 Chr03 4426637 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:69,0,33 Chr03 4451256 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 4475902 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:91:91,0,259 Chr03 4475903 . A G 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,292 Chr03 4476082 . G A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:99:101,0,177 Chr03 4486944 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.60;MQ0=6;MQRankSum=-0.988;QD=6.56;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:99:107,0,108 Chr03 4499687 . G A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.536;DP=27;Dels=0.00;FS=5.724;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=-3.174;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:82:82,0,850 Chr03 4499697 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;DP=30;Dels=0.00;FS=8.870;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQ0=0;MQRankSum=-3.203;QD=1.46;ReadPosRankSum=1.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:72:72,0,943 Chr03 4515798 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.482;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:51:51,0,591 Chr03 4540040 . T G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr03 4540043 . A T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr03 4541144 . A G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.20;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:138,0,182 Chr03 4556389 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 4556437 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 4556512 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,135 Chr03 4556620 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,265 Chr03 4584943 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:60,0,52 Chr03 4629350 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.208;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.57;MQ0=24;MQRankSum=2.077;QD=0.44;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,3:79:63:63,0,391 Chr03 4661846 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 4665267 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,341 Chr03 4666944 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 4666986 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 4667002 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 4667189 . A T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.290;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:146,0,594 Chr03 4669229 . G C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,257 Chr03 4672009 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:43:62,0,43 Chr03 4730223 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr03 4744348 . C T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,267 Chr03 4759419 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,173 Chr03 4782704 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,188 Chr03 4782771 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,188 Chr03 4782783 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,178 Chr03 4828323 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,207 Chr03 4828334 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,171 Chr03 4846711 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 4846784 . C T 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr03 4880259 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:61,0,32 Chr03 4937748 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 4941562 . G T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.89;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr03 4947000 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:52:52,0,101 Chr03 4947006 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:52:52,0,99 Chr03 4947014 . C G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.76;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:52:52,0,101 Chr03 4947045 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:52:52,0,112 Chr03 4948740 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,207 Chr03 4950781 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,103 Chr03 4950783 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,103 Chr03 4950818 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,104 Chr03 4950864 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,107 Chr03 4951071 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:113,0,676 Chr03 4954121 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 4957349 . C G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:95:95,0,248 Chr03 4957392 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:55:55,0,131 Chr03 4957393 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:53:53,0,131 Chr03 4957406 . T C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,152 Chr03 4989344 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,179 Chr03 5060043 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,147 Chr03 5061276 . C T 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 Chr03 5072446 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr03 5072491 . C T 45.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:74,0,23 Chr03 5112907 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 5112913 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 5112938 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 5131488 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,321 Chr03 5137904 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 5195150 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,236 Chr03 5203480 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:60,0,54 Chr03 5203493 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:87:87,0,119 Chr03 5203495 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:87:87,0,125 Chr03 5243252 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 5248123 . G C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 5314190 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.880;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:62:62,0,1127 Chr03 5375380 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 5379859 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 5387753 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr03 5443734 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.126;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:64:64,0,900 Chr03 5468172 . T C 60.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.01;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:12:88,0,12 Chr03 5468196 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:88,0,28 Chr03 5468202 . C G 59.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:88,0,19 Chr03 5548343 . A C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 5548392 . A C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 5559465 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 5604327 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 5604344 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 5604381 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 5607329 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.626;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:112,0,365 Chr03 5633511 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,221 Chr03 5645521 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:87:87,0,660 Chr03 5646431 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 5646502 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 5646770 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,259 Chr03 5647648 . C A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 5669864 . T C 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60:141,0,60 Chr03 5690892 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 5729528 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,306 Chr03 5729549 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,306 Chr03 5729630 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;DP=14;Dels=0.00;FS=6.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:68:68,0,416 Chr03 5788470 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 5788566 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.539;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=0.67;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:51:51,0,1109 Chr03 5799046 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 5799054 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 5799065 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 5851592 . G T 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.844;DP=65;Dels=0.00;FS=23.383;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=2.97;ReadPosRankSum=-5.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,11:65:99:221,0,1932 Chr03 5869252 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,105 Chr03 5875673 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 5895810 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr03 5895828 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 6040625 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,105 Chr03 6047771 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 6052597 . A G 45.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:74,0,20 Chr03 6113858 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 6115236 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 6144542 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 6167790 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.32;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:78:78,0,366 Chr03 6168076 . A G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:102,0,545 Chr03 6194009 . C T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:103,0,885 Chr03 6239669 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;DP=53;Dels=0.00;FS=1.639;HaplotypeScore=2.7321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.539;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,7:53:99:113,0,1498 Chr03 6246861 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;DP=16;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=2.80;ReadPosRankSum=-0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:73:73,0,440 Chr03 6262182 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.750;DP=19;Dels=0.00;FS=5.180;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:100,0,544 Chr03 6262254 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:98:98,0,179 Chr03 6262352 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,207 Chr03 6262786 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,209 Chr03 6280045 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.829;DP=55;Dels=0.00;FS=10.527;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.060;QD=2.14;ReadPosRankSum=-4.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,8:55:99:146,0,1689 Chr03 6281893 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 6281903 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 6281915 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 6283307 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 6283318 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 6286855 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.237;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:65:65,0,535 Chr03 6286892 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:73:73,0,511 Chr03 6312373 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 6313993 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 6315348 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 6317321 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:80,6,0 Chr03 6317543 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:108,0,68 Chr03 6319628 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;DP=22;Dels=0.00;FS=2.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.574 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,711 Chr03 6319634 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=22;Dels=0.00;FS=2.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.957;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,713 Chr03 6319638 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;DP=22;Dels=0.00;FS=2.817;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,706 Chr03 6322432 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 6363712 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 6398679 . C T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.05;MQ0=84;MQRankSum=1.195;QD=1.03;ReadPosRankSum=-2.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,57:111:75:143,0,75 Chr03 6398680 . C T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;DP=111;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.05;MQ0=84;MQRankSum=0.281;QD=0.44;ReadPosRankSum=-1.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,34:111:77:77,0,141 Chr03 6468882 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 6468893 . G T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 6476764 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,357 Chr03 6485285 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,268 Chr03 6514697 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:60:60,0,224 Chr03 6522575 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,105 Chr03 6522649 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr03 6523185 . C A 72.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:114,9,0 Chr03 6605816 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,259 Chr03 6605854 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:9:62:62,0,177 Chr03 6605856 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,250 Chr03 6607319 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,106 Chr03 6670430 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.07;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:116,9,0 Chr03 6692370 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 6701420 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 6707709 . C A 183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=20;Dels=0.00;FS=12.882;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=2.457;QD=9.19;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:212,0,433 Chr03 6713935 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,143 Chr03 6713938 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 6713989 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 6715740 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:66:66,0,641 Chr03 6833242 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr03 6836357 . C G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.75;MQ0=1;MQRankSum=-2.520;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:82:82,0,251 Chr03 6836363 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.75;MQ0=1;MQRankSum=-2.520;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:82:82,0,256 Chr03 6851707 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 6855704 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 6866495 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 6866568 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 6866574 . T G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 6866584 . C G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 6872946 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,134 Chr03 6873666 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;DP=24;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.039;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:89:89,0,749 Chr03 6886294 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:49:49,0,601 Chr03 6886301 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.376;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:49:49,0,607 Chr03 6920962 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,150 Chr03 6924344 . A T 221.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;DP=88;Dels=0.00;FS=24.584;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=2.52;ReadPosRankSum=-5.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,13:88:99:250,0,2716 Chr03 6993071 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr03 7012010 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr03 7017500 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 7017548 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 7017551 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 7017553 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 7017561 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 7017572 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 7018304 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,172 Chr03 7018306 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,149 Chr03 7019526 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,141 Chr03 7028772 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 7028834 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 7053801 . T A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:79,0,29 Chr03 7053846 . G T 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:79,0,27 Chr03 7053862 . C T 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.25;MQ0=0;QD=15.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:91,9,0 Chr03 7053890 . T C 50.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22:79,0,22 Chr03 7054835 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:72,0,57 Chr03 7054876 . A G 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.267 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:160,0,296 Chr03 7137917 . G A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:87:87,0,369 Chr03 7165830 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 7195738 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 7197101 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:105,0,64 Chr03 7221084 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,188 Chr03 7222211 . A T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;DP=25;Dels=0.00;FS=12.128;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,736 Chr03 7222841 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:95:95,0,182 Chr03 7245042 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr03 7281593 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 7281599 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 7281629 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 7417002 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 7430020 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr03 7446732 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.283 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:114,0,458 Chr03 7455923 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.33;MQ0=1;MQRankSum=-1.231;QD=12.46;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:68:103,0,68 Chr03 7461283 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.31;MQ0=2;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:71,6,0 Chr03 7480846 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 7500849 . T G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:85:85,0,281 Chr03 7514561 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 7514567 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 7540215 . A C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,263 Chr03 7540229 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,261 Chr03 7540281 . C G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,203 Chr03 7550084 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,211 Chr03 7554235 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,218 Chr03 7554246 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,226 Chr03 7643613 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.35;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 7643615 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.35;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 7671884 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 7671891 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 7671897 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 7671948 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 7671952 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 7672378 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 7672475 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,71 Chr03 7693732 . T A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:99,0,109 Chr03 7693747 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:101,0,106 Chr03 7711479 . A T 56.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:85,0,26 Chr03 7711499 . A G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:85,0,30 Chr03 7711529 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:85,0,29 Chr03 7711533 . T C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:85,0,29 Chr03 7751434 . T G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.425;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=2.49;ReadPosRankSum=3.477 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:99:108,0,1043 Chr03 7820178 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 7824325 . T A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,166 Chr03 7846980 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,66 Chr03 7900264 . G A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=11.53;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:132,0,180 Chr03 7949234 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,206 Chr03 8040433 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.007;QD=1.26;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:66:66,0,938 Chr03 8091330 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,149 Chr03 8091343 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,149 Chr03 8095067 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;DP=65;Dels=0.00;FS=1.727;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.420;QD=0.47;ReadPosRankSum=-1.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:65:59:59,0,2179 Chr03 8095083 . A G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=65;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.233;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.598 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:89:89,0,2214 Chr03 8095090 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.836;DP=65;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.471;QD=1.00;ReadPosRankSum=-2.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:93:93,0,2234 Chr03 8095093 . C T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.619;DP=65;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.809;QD=1.01;ReadPosRankSum=1.788 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:94:94,0,2241 Chr03 8095115 . T G 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;DP=65;Dels=0.00;FS=3.664;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.005;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.894 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:86:86,0,2209 Chr03 8095117 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.032;DP=65;Dels=0.00;FS=1.721;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.534;QD=0.41;ReadPosRankSum=2.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:55:55,0,2194 Chr03 8095331 . C T 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr03 8148493 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.54;MQ0=4;QD=3.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:65,6,0 Chr03 8182562 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,111 Chr03 8182573 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,179 Chr03 8189105 . C A 215.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:244,0,17 Chr03 8253552 . G C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,178 Chr03 8253553 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,175 Chr03 8255430 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,105 Chr03 8273157 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,253 Chr03 8289079 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,107 Chr03 8351030 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;DP=21;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,660 Chr03 8408700 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,141 Chr03 8471784 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,135 Chr03 8565363 . C G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.593;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:60:60,0,650 Chr03 8605955 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 8626413 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 8627337 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr03 8694272 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,260 Chr03 8695653 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 8695749 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 8701882 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,179 Chr03 8729102 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 8775157 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:94:94,0,170 Chr03 8775185 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;DP=15;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:113,0,391 Chr03 8775619 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr03 8790946 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,202 Chr03 8798630 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=8.40;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:87:87,0,136 Chr03 8803291 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 8804748 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 8804844 . C A 278.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:307,24,0 Chr03 8811066 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 8811612 . C A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr03 8861311 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,148 Chr03 8861343 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,146 Chr03 8927561 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:54:54,0,378 Chr03 8938941 . A G 24.87 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.61;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:17:53,0,17 Chr03 8939007 . T C 24.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.896;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:22:53,0,22 Chr03 8940428 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 8971083 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 8971506 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=3.73;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:73:73,0,332 Chr03 9018240 . T C 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.43;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 Chr03 9018394 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,189 Chr03 9033963 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 9044976 . A C 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=12;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:165,0,217 Chr03 9084379 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;DP=27;Dels=0.00;FS=5.579;HaplotypeScore=5.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:27:72:72,0,801 Chr03 9087617 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 9087700 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 9087708 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 9112171 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 9115675 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 9173175 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 9176732 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 9201692 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 9201701 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 9209733 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 9221770 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 9221891 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 9221898 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 9224740 . A G 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr03 9224837 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,259 Chr03 9225017 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.124;DP=33;Dels=0.00;FS=2.555;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.572;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:53:53,0,1059 Chr03 9238135 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 9238190 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 9264308 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 9269193 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 9271908 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 9298342 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.69;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 9298370 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 9356432 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 9519431 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 9519456 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 9519857 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr03 9597433 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 9597439 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 9597452 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 9716244 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 9806771 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 9806781 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 9831791 . C G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr03 9834632 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 9851663 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 9852738 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 9852782 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 9862740 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 9877026 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 9877289 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 9878349 . T C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 9886373 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr03 9911853 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 9936656 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 9937087 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:131,0,65 Chr03 9962781 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr03 9963229 . C A 35.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 10020852 . G C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 10069795 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 10072489 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.68;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 10128201 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 10223241 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 10223244 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 10239673 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 10241128 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 10337478 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 10341205 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 10341260 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 10341269 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 10435875 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr03 10435933 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 10437934 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 10438115 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 10467853 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 10472195 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,258 Chr03 10554906 . G T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.16;MQ0=12;MQRankSum=-0.546;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:99:134,0,249 Chr03 10605169 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,130 Chr03 10637063 . A G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.19;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:74,9,0 Chr03 10645273 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 10657566 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 10665239 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 10666318 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 10666328 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 10716155 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;DP=55;Dels=0.00;FS=15.977;HaplotypeScore=8.9629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.317;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,6:55:73:73,0,1711 Chr03 10721949 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 10745821 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 10745826 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 10765599 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 10770268 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 10770596 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 10813810 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.40;MQ0=0;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:61,6,0 Chr03 10813811 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.40;MQ0=0;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:61,6,0 Chr03 10813812 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.40;MQ0=0;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:61,6,0 Chr03 10813837 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.40;MQ0=0;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:61,6,0 Chr03 10893606 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 10894918 . T G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15:209,15,0 Chr03 10999555 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:111,0,67 Chr03 11000289 . T A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr03 11001444 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 11021047 . C A 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr03 11022246 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 11022258 . A G 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr03 11159044 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 11171153 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 11190811 . G T 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr03 11192750 . A T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr03 11194392 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 11194400 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 11215688 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 11282656 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;DP=21;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=4.85;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:130,0,582 Chr03 11317866 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 11317872 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 11317874 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11317881 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 11319994 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11370314 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr03 11370338 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr03 11382521 . C G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr03 11401446 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 11402049 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,302 Chr03 11402079 . T G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,169 Chr03 11402749 . A G 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.45;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr03 11404596 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 11419071 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 11419197 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11420827 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 11425646 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr03 11425662 . T C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr03 11425686 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 11425702 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 11430507 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 11432234 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.111;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.561;QD=0.82;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:56:56,0,1158 Chr03 11432807 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:69,0,60 Chr03 11456699 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 11458820 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 11485965 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 11499206 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 11518661 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11518719 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11527136 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11527150 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 11541357 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.19;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr03 11544582 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 11544592 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 11544594 . A G 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 11599035 . G C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 11610825 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 11610833 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 11610879 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 11610897 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 11625061 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr03 11626546 . G A 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr03 11647277 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 11648317 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648323 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648334 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648335 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648347 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648349 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 11648481 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 11648652 . T A 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr03 11648663 . C T 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr03 11648665 . A G 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr03 11648678 . G A 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr03 11648681 . C G 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr03 11648683 . C T 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr03 11648686 . C T 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr03 11648691 . T C 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr03 11648702 . G A 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr03 11648707 . G C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:85,0,29 Chr03 11648733 . C T 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.24;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr03 11689670 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11695126 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 11701173 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 11709870 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:121,0,215 Chr03 11734959 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,106 Chr03 11739799 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=2.90;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:92:92,0,624 Chr03 11741340 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 11741825 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.09;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 11741858 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.09;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 11742694 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11742719 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 11743126 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11745818 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;DP=15;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.501;QD=5.65;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:113,0,401 Chr03 11746485 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=16;Dels=0.00;FS=5.740;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=5.05;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:16:99:109,0,405 Chr03 11781296 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.63;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 11781297 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.63;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 11803384 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:92:92,0,139 Chr03 11803470 . C A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=11.62;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:156,0,209 Chr03 11814371 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 11856829 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr03 11909525 . C A 195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=13.98;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:224,0,216 Chr03 12062497 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:74:74,0,1271 Chr03 12099109 . G A 192.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.87;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:221,18,0 Chr03 12099148 . A G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr03 12116884 . C T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.75;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 12208218 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 12212379 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:132,0,103 Chr03 12273502 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 12301108 . C A 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=14;Dels=0.00;FS=9.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=8.98;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:154,0,293 Chr03 12321517 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 12371746 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,104 Chr03 12380211 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 12392261 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.03;MQ0=0;QD=8.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:61,6,0 Chr03 12396727 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.493;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.06;MQ0=0;MQRankSum=1.678;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:49:49,0,208 Chr03 12405800 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 12444826 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 12452697 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;DP=51;Dels=0.00;FS=40.210;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:51:77:77,0,1562 Chr03 12459783 . T C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr03 12507875 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr03 12507924 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr03 12507930 . A T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr03 12507935 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr03 12549925 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 12590471 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 12644187 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr03 12767290 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 12794253 . C T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7781;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:90,9,0 Chr03 12798819 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=70;Dels=0.00;FS=14.354;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.098;QD=0.38;ReadPosRankSum=-4.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,7:70:55:55,0,2283 Chr03 12805727 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 12865906 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 12914206 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 Chr03 12925208 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,149 Chr03 12925210 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr03 12925230 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,145 Chr03 12925262 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,145 Chr03 12925272 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,140 Chr03 12925275 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,129 Chr03 12925279 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,134 Chr03 12932541 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:76:76,0,460 Chr03 12942589 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 12952781 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 12982170 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,222 Chr03 12982250 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,214 Chr03 12992003 . T C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.04;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 13002073 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 13036464 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,141 Chr03 13098744 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.827;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.695;QD=0.31;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,9:74:51:51,0,1565 Chr03 13100340 . T A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:112,0,289 Chr03 13113284 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 13115636 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr03 13146348 . C T 153.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:182,0,24 Chr03 13147120 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.64;MQ0=4;QD=8.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:81,6,0 Chr03 13147645 . C T 109.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.18;MQ0=1;QD=6.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:15:138,15,0 Chr03 13161281 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 13168888 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,214 Chr03 13201142 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 13201227 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=24;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=2.24;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:82:82,0,711 Chr03 13317838 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.439;DP=63;Dels=0.00;FS=27.945;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.208;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,7:63:80:80,0,2057 Chr03 13321889 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,208 Chr03 13418759 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 13418797 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 13418810 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 13437933 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.35;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:51,6,0 Chr03 13559650 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 13584287 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.05;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 13584316 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.05;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 13599035 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 13606423 . C G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.3090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:85:85,0,131 Chr03 13606877 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr03 13626390 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=2;QD=22.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:12:165,12,0 Chr03 13662605 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 13662606 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 13670402 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 13672949 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 13675412 . A G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 Chr03 13847727 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,257 Chr03 13848064 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 13855068 . A G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr03 13857525 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 13866470 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 13879283 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 13901756 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 13947034 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 14026634 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 14026653 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 14100839 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 14100890 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 14189313 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr03 14189349 . C A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr03 14206048 . G T 118.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 14277496 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 14295974 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 14300721 . A C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr03 14314238 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 14348218 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 14391988 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 14395720 . T A 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.67;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr03 14395748 . T G 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.67;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr03 14395799 . G A 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.67;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr03 14395806 . A C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr03 14454129 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 14454215 . C A 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=13.32;ReadPosRankSum=-3.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:228,0,258 Chr03 14476165 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 14487962 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=29.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr03 14523158 . G T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.53;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 14536461 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.60;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 14536467 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.60;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 14536643 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.09;MQ0=33;QD=1.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:6:81,6,0 Chr03 14536663 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.75;MQ0=23;QD=2.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:80,6,0 Chr03 14580688 . C T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr03 14580980 . T C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr03 14645335 . A G 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=10.56;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:155,0,258 Chr03 14645592 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 14675384 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 14689816 . C T 119.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.06;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=17.13;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:15:148,15,0 Chr03 14713273 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 14713279 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 14713291 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 14713331 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 14722197 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 14722224 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 14722311 . A T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 14722325 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.07;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 14793266 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 14793310 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.28;MQ0=0;QD=10.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:79,6,0 Chr03 14817841 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 14847000 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 14847071 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 14860319 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 14865087 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,177 Chr03 14998336 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 15003294 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 15049119 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 15052299 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 15057670 . A G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr03 15071283 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.18;MQ0=0;MQRankSum=-2.856;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,13:28:61:61,0,456 Chr03 15151566 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.58;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 15151582 . A C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.58;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 15151618 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.20;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:30:51,0,30 Chr03 15338987 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr03 15350503 . C T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.99;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:70:99,0,70 Chr03 15381453 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 15459298 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 15549552 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr03 15668994 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.01;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 15739265 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.36;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr03 15754907 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=3;QD=14.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:114,9,0 Chr03 15766396 . C A 56.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:85,0,26 Chr03 15848334 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr03 15887035 . C T 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.45;MQ0=3;QD=10.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:88,9,0 Chr03 15906719 . A C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.22;MQ0=0;QD=1.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:52,6,0 Chr03 15914772 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 15919937 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 16203678 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.39;MQ0=3;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:6:57,6,0 Chr03 16208460 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 16214224 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.221;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.071;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:50:50,0,607 Chr03 16214276 . T G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.654;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.071;QD=1.09;ReadPosRankSum=2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:50:50,0,593 Chr03 16214281 . G C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.221;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.071;QD=1.09;ReadPosRankSum=2.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:50:50,0,582 Chr03 16237980 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.97;MQ0=2;QD=13.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:122,9,0 Chr03 16388207 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 Chr03 16421662 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 16421674 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 16540195 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.53;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr03 16668443 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.42;MQ0=2;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:49,6,0 Chr03 16760693 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 16784640 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 16784660 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 16791508 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.92;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 16960792 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.86;MQ0=35;MQRankSum=1.936;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:55,5:60:12:156,12,0 Chr03 16960804 . C G 112.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.86;MQ0=35;MQRankSum=2.928;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,4:60:17:141,0,17 Chr03 16960809 . G A 110.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.86;MQ0=35;MQRankSum=2.004;QD=1.85;ReadPosRankSum=-2.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,5:60:20:139,0,20 Chr03 16960813 . T C 95.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.86;MQ0=35;MQRankSum=2.928;QD=1.60;ReadPosRankSum=-2.928 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,10:60:17:124,0,17 Chr03 16981653 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 16981722 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 16981736 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 17143421 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.66;MQ0=0;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:51,6,0 Chr03 17249441 . A G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr03 17327429 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 17372710 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 17373188 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 17379854 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.62;MQ0=0;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:63,6,0 Chr03 17379856 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.62;MQ0=0;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:63,6,0 Chr03 17379867 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.62;MQ0=0;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:61,6,0 Chr03 17387449 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.85;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:29:50,0,29 Chr03 17421253 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.79;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 17431881 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 17431896 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr03 17434213 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.07;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:53,6,0 Chr03 17434222 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.07;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:53,6,0 Chr03 17434232 . A G 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7882;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.25;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.07;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:92,9,0 Chr03 17541829 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.53;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 17557370 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 17557391 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 17572295 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.18;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 17611530 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 17611788 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:66:66,0,102 Chr03 17611806 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.68;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 17662153 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.49;MQ0=1;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:69,6,0 Chr03 17663838 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 17676801 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.44;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:77,6,0 Chr03 17676887 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 17708621 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 17718154 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr03 17718208 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 17727338 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 17906222 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr03 17906319 . C A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.01;MQ0=4;QD=5.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:61,6,0 Chr03 17950596 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.68;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr03 17950645 . A G 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.92;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:53:150,0,53 Chr03 17971572 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18026638 . G T 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026649 . C A 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026651 . A G 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026654 . T A 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026669 . C G 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026681 . G C 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026688 . T C 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18026689 . G A 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.37;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr03 18099664 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 Chr03 18138571 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 18165265 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 18260239 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 18273511 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.66;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 18287122 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.86;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 18328461 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.04;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18353022 . T A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr03 18353023 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 18353025 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 18358870 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 18382268 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 18403814 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;DP=50;Dels=0.00;FS=5.026;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.911;QD=1.00;ReadPosRankSum=-3.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,6:50:78:78,0,1627 Chr03 18410900 . G T 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 18415395 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 18415552 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18417918 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 18419275 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 18483472 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 18489460 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.31;MQ0=7;QD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:57,6,0 Chr03 18513122 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 18513125 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 18513142 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 18513154 . T C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr03 18513184 . C T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr03 18513188 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr03 18514011 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18514013 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18514029 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18514039 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 18514061 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 18530544 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 18530550 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 18530587 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18544859 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 18563316 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 18563413 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 18596419 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 18598906 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 18690522 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 18727121 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 18842344 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 18844832 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 18863235 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 18922249 . G C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 19009620 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 19025746 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.14;MQ0=0;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:66,6,0 Chr03 19057033 . G A 144.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.46;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:173,15,0 Chr03 19057041 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.46;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:56:56,0,87 Chr03 19077034 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.28;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:67:67,0,500 Chr03 19108580 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 19108673 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.14;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:76,6,0 Chr03 19112449 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.29;MQ0=3;MQRankSum=-2.017;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:53:53,0,143 Chr03 19112460 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=2;MQRankSum=-2.017;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:53:53,0,125 Chr03 19112461 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.638;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=2;MQRankSum=-2.017;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:53:53,0,138 Chr03 19112462 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.62;MQ0=2;MQRankSum=-2.017;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:53:53,0,113 Chr03 19286792 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=46;Dels=0.00;FS=22.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=0.56;ReadPosRankSum=-3.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,5:46:54:54,0,1528 Chr03 19400679 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 19449830 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr03 19449877 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr03 19460825 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 19464413 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 19464802 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr03 19464821 . C T 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr03 19465851 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 19478401 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr03 19478433 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:67,0,65 Chr03 19479731 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 19490496 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr03 19501918 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 19509340 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 19509360 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr03 19628689 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 19628732 . A C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 19634673 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 19634693 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 19697170 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 19722997 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 19733631 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr03 19747723 . G T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 19767994 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr03 19768020 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr03 19833206 . C T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.94;MQ0=1;QD=15.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:90,9,0 Chr03 19859270 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 19868499 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.41;MQ0=0;QD=0.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:6:52,6,0 Chr03 19901275 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.82;MQ0=5;QD=3.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:10:6:65,6,0 Chr03 20013321 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.50;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:76,6,0 Chr03 20033043 . C T 280.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.101;DP=24;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.348;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,11:24:99:309,0,331 Chr03 20033068 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:85:93,0,85 Chr03 20040918 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 20040952 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 20041565 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.45;MQ0=0;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:69,6,0 Chr03 20075503 . G A 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr03 20075508 . G C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 20084505 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 20084581 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 20094251 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.49;MQ0=5;QD=2.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:60,6,0 Chr03 20190932 . C G 34.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.40;MQ0=1;MQRankSum=1.495;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:15:63,0,15 Chr03 20253934 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 20257420 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 20272736 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.64;MQ0=1;QD=3.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:6:63,6,0 Chr03 20277617 . G C 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.37;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr03 20284839 . A T 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.30;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:123,12,0 Chr03 20321371 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 20321405 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 20322337 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.65;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:121,9,0 Chr03 20334423 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.08;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:28:68,0,28 Chr03 20341380 . C G 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=18.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:118,12,0 Chr03 20363133 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.40;MQ0=4;QD=1.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:51,6,0 Chr03 20363398 . G A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.80;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr03 20365575 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr03 20365614 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.43;MQ0=37;QD=0.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,7:39:6:57,6,0 Chr03 20368626 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 20375900 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 20376946 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.10;MQ0=0;QD=15.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:107,9,0 Chr03 20429486 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 20460202 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.93;MQ0=21;QD=1.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,4:23:6:56,6,0 Chr03 20460246 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.27;MQ0=13;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,11:19:6:56,6,0 Chr03 20494838 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 20505164 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=0;QD=1.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:57,6,0 Chr03 20533862 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 20544374 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.28;MQ0=1;MQRankSum=0.720;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:9:89,9,0 Chr03 20546242 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr03 20547391 . T C 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.42;MQ0=0;MQRankSum=2.793;QD=13.49;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,5:12:15:190,15,0 Chr03 20549035 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 20596895 . A G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr03 20596902 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr03 20638718 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 20653697 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.38;MQ0=0;QD=5.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:60,6,0 Chr03 20677738 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 20677739 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 20677774 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 20688307 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 20688351 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 20688352 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 20722031 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 20729889 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 20758016 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr03 20758088 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 20791845 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 20833033 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.26;MQ0=3;MQRankSum=-0.895;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:62:62,0,135 Chr03 20833045 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.26;MQ0=3;MQRankSum=1.386;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:65:65,0,129 Chr03 20855679 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.04;MQ0=4;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:56:56,0,105 Chr03 20863138 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=2;QD=13.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:82,6,0 Chr03 20864657 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 20892292 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 20919623 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.60;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr03 20927174 . C G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=37;Dels=0.00;FS=8.664;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.80;MQ0=8;MQRankSum=2.685;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:88:88,0,175 Chr03 20981245 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 20995995 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.24;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:47:59,0,47 Chr03 21017782 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 21017991 . C G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr03 21054932 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr03 21054937 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.43;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr03 21117268 . A T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.64;MQ0=9;QD=3.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,6:15:9:83,9,0 Chr03 21154747 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 21220474 . G A 94.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=0;QD=7.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:123,15,0 Chr03 21220533 . A G 94.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=0;QD=7.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:15:123,15,0 Chr03 21282647 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 21282650 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 21293027 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 21297128 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 21297134 . A C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 21297145 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 21297158 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 21476332 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.28;MQ0=21;QD=1.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:23:6:72,6,0 Chr03 21477604 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.53;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 21478448 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.85;MQ0=1;MQRankSum=-3.264;QD=0.87;ReadPosRankSum=-0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,36:40:63:63,0,148 Chr03 21487384 . G A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=5.31;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:76:76,0,92 Chr03 21487753 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.47;MQ0=3;QD=15.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:122,9,0 Chr03 21543195 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 21598971 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 21654818 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 21665267 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 21696568 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=3.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:9:97,9,0 Chr03 21714145 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 21771685 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 21771805 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:53:69,0,53 Chr03 21776188 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr03 21777044 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 21782409 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 21786652 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 21812408 . G A 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;QD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:81,9,0 Chr03 21812426 . C T 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;QD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:81,9,0 Chr03 22006715 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 22037473 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=3.70;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:80:80,0,331 Chr03 22125545 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 22138477 . G T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 22153274 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 22200623 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.260;QD=2.13;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:109,0,1191 Chr03 22237795 . A G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=4;QD=7.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:99,12,0 Chr03 22237805 . C T 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=4;QD=7.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:99,12,0 Chr03 22237808 . A G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=4;QD=7.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:99,12,0 Chr03 22268796 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 22302270 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 22307965 . C T 45.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.88;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:23:74,0,23 Chr03 22317354 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 22352648 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.34;MQ0=1;QD=6.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:53,6,0 Chr03 22437545 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 Chr03 22514728 . T G 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr03 22579708 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 22612287 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.777;QD=1.40;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:80:80,0,1200 Chr03 22643039 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 22646728 . G A 36.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.07;MQ0=2;MQRankSum=2.268;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,2:29:14:65,0,14 Chr03 22652214 . C A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr03 22652215 . C T 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr03 22806931 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 22849087 . A G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr03 22856534 . T A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.96;MQ0=5;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:50,6,0 Chr03 22892291 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr03 22898969 . G T 98.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.35;MQ0=1;QD=19.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:126,12,0 Chr03 23004093 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 23004095 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 23123671 . C A 73.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15:102,0,15 Chr03 23190866 . T A 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.40;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr03 23225164 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23246631 . C T 454.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.48;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:42:483,42,0 Chr03 23286246 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 23286380 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23286432 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 23293510 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23293996 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 23298745 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.23;MQ0=4;MQRankSum=1.733;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,2:14:59:61,0,59 Chr03 23300513 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23307658 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 23307675 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 23307683 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 23376539 . G A 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.06;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr03 23391566 . G T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=3.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:69,9,0 Chr03 23391574 . T G 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=3.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:69,9,0 Chr03 23391577 . T C 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=3.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:69,9,0 Chr03 23391580 . A T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=3.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:69,9,0 Chr03 23391608 . T G 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:69,9,0 Chr03 23391610 . A T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:69,9,0 Chr03 23391620 . G A 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:69,9,0 Chr03 23391624 . C T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:69,9,0 Chr03 23391630 . A C 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.86;MQ0=0;QD=3.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:69,9,0 Chr03 23466656 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466668 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466678 . G C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466682 . A G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466693 . T C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466697 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466700 . A G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23466706 . G C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:87,12,0 Chr03 23499418 . A C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.79;MQ0=3;QD=0.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:6:48,6,0 Chr03 23511543 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.03;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 23521403 . A G 109.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 23716240 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,244 Chr03 23717782 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23721971 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 23750531 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 23770203 . T C 51.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.44;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr03 23976570 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 24087140 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 24153274 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.034;DP=11;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:65:65,0,250 Chr03 24229452 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 24229463 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 24229481 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 24229505 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 24229508 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 24230562 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 24230573 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 24230640 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 24230652 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 24247242 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 24258567 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:111,0,56 Chr03 24275560 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.44;MQ0=1;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:65,6,0 Chr03 24275563 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.44;MQ0=1;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr03 24275592 . C G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.44;MQ0=1;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:69,6,0 Chr03 24308352 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,263 Chr03 24327280 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 24327760 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.49;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 24357197 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:50,0,30 Chr03 24363794 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 24363807 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 24406121 . G A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr03 24433907 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 24445271 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 24447276 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 24459501 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 24491973 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 24609274 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,266 Chr03 24631650 . A G 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:142,0,469 Chr03 24638635 . G A 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;DP=26;Dels=0.00;FS=10.710;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.31;MQ0=0;MQRankSum=2.594;QD=3.61;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:99:122,0,313 Chr03 24638637 . G T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.171;DP=26;Dels=0.00;FS=15.091;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.31;MQ0=0;MQRankSum=3.058;QD=5.07;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:160,0,276 Chr03 24638724 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 24697454 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr03 24701290 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.21;MQ0=1;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr03 24707466 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.38;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 24732084 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 24777302 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 24791878 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr03 24805341 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 24806557 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 24806959 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:9:53:53,0,216 Chr03 24812114 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 24812815 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.12;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 24813483 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;DP=50;Dels=0.00;FS=13.278;HaplotypeScore=15.1424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.88;MQ0=1;MQRankSum=2.167;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:50:99:109,0,768 Chr03 24838879 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 24866064 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 24951142 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.92;MQ0=23;QD=1.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:65,6,0 Chr03 24951158 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.92;MQ0=23;QD=1.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:65,6,0 Chr03 24955869 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr03 24955884 . G T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr03 25007199 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;DP=14;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:50:50,0,354 Chr03 25014410 . G A 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.57;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr03 25015667 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 25019234 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 25019235 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 25019244 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 25019382 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 25026184 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 25059044 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 25059074 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 25060489 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 25060514 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 25060560 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 25095741 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 25095774 . G C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr03 25112083 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 25133510 . C T 90.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.01;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=18.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:119,0,24 Chr03 25147728 . C G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr03 25150582 . A T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;DP=33;Dels=0.00;FS=5.375;HaplotypeScore=5.8611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.285;QD=1.66;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:83:83,0,967 Chr03 25180696 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:56:56,0,514 Chr03 25190583 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr03 25193083 . A T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 25193634 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.457;DP=70;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.790;QD=1.53;ReadPosRankSum=-2.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,9:70:99:135,0,2261 Chr03 25216142 . C G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 25216166 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 25255898 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 25279907 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 25287983 . G T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr03 25288051 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,299 Chr03 25288066 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=27;Dels=0.00;FS=8.671;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.467;QD=3.10;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:112,0,808 Chr03 25288425 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,108 Chr03 25290274 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 25291260 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,182 Chr03 25302497 . T C 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr03 25379863 . G T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=2.5769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=10.28;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:131,0,216 Chr03 25384827 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 25389618 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 25441428 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,129 Chr03 25447249 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:113,0,28 Chr03 25505187 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.16;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr03 25505281 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=7.88;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:107,0,219 Chr03 25580681 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,106 Chr03 25626450 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 25697848 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.78;MQ0=22;MQRankSum=1.026;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,24:26:64:64,0,65 Chr03 25759929 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 25761127 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 25787340 . C G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr03 25861026 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 25916379 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 25916429 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 25982690 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,342 Chr03 25983676 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 26047643 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.46;MQ0=3;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:61,6,0 Chr03 26059368 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,177 Chr03 26073926 . C G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.25;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:57:57,0,107 Chr03 26074403 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.07;MQ0=5;QD=6.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:74,6,0 Chr03 26084527 . G T 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.766;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=3.23;ReadPosRankSum=-3.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:151,0,1151 Chr03 26095318 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:63,6,0 Chr03 26110442 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 26123537 . T C 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:106,0,68 Chr03 26130024 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 26130557 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 26145515 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,258 Chr03 26146412 . T A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:87:87,0,305 Chr03 26153908 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 26153950 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.08;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr03 26245013 . T C 249.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.307;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.56;MQ0=1;MQRankSum=-3.992;QD=7.81;ReadPosRankSum=1.677 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,25:32:99:278,0,209 Chr03 26284596 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,135 Chr03 26295633 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.78;MQ0=1;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:68,6,0 Chr03 26296742 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.934;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:56:56,0,325 Chr03 26297667 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.62;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:33:67,0,33 Chr03 26297820 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 26298488 . C G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.09;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:50:77,0,50 Chr03 26348385 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;DP=25;Dels=0.00;FS=22.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=2.07;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:80:80,0,764 Chr03 26353670 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 26411043 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.53;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 26411422 . T C 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.81;MQ0=0;QD=10.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:90,9,0 Chr03 26411428 . G A 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.81;MQ0=0;QD=10.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:90,9,0 Chr03 26420526 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 26456996 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 26457013 . C A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 26457014 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 26457021 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 26457657 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 26457662 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 26483172 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.03;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr03 26493610 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 26540156 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 26620972 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 26627085 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 26668559 . A T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 26672610 . C A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.242;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=3.90;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:118,0,665 Chr03 26725435 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 26725990 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=28;Dels=0.00;FS=12.798;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.399;QD=2.88;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:109,0,796 Chr03 26813398 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 26849530 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 26849532 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 26870552 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr03 26870558 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr03 26870559 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr03 26870564 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr03 26870568 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr03 26872501 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 26872545 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 26892081 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 26922261 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,251 Chr03 26923673 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 26923683 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 26928551 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 26965151 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 26965162 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 26969266 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 26970922 . G T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr03 26971614 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 26971638 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 26971671 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 26971684 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 26971702 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 26972883 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.98;MQ0=0;QD=6.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:80,6,0 Chr03 26972910 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=7.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:111,9,0 Chr03 26972923 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.31;MQ0=0;QD=8.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:9:123,9,0 Chr03 26978742 . G A 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr03 26978764 . T C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr03 27063216 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 27108378 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.10;MQ0=3;QD=6.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:80,6,0 Chr03 27109755 . G T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:135,0,25 Chr03 27194323 . T C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.58;MQ0=1;QD=7.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:80,9,0 Chr03 27231949 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 27268367 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 27269009 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr03 27358029 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.185;DP=56;Dels=0.00;FS=4.931;HaplotypeScore=4.7246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.066;QD=0.50;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:56:56,0,1634 Chr03 27528709 . A G 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.36;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:93,9,0 Chr03 27551165 . G A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.26;MQ0=2;MQRankSum=1.485;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:80:80,0,243 Chr03 27587160 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 27587191 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 27592796 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.83;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=8.19;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:30:61,0,30 Chr03 27592798 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.83;MQ0=1;QD=20.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:109,9,0 Chr03 27592861 . C T 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.52;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:59,0,29 Chr03 27672489 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 27672546 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 27720325 . T C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=16.5081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:15:99:110,0,303 Chr03 27790925 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;DP=74;Dels=0.00;FS=21.390;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQ0=0;MQRankSum=4.587;QD=0.77;ReadPosRankSum=-4.604 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,8:74:85:85,0,2390 Chr03 27870623 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 27878699 . A T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.60;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,134 Chr03 27883174 . A G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr03 27915976 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 27922676 . G C 150.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.17;MQ0=0;QD=25.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:179,18,0 Chr03 28007603 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.81;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,229 Chr03 28015940 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 28073643 . T G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.02;MQ0=0;QD=0.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:49,6,0 Chr03 28075843 . C T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.32;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:95:136,0,95 Chr03 28075859 . G A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.32;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:95:136,0,95 Chr03 28098287 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr03 28098637 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,539 Chr03 28143927 . G A 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr03 28143949 . T C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr03 28143951 . A C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr03 28143952 . A T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 28155478 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.698;DP=44;Dels=0.00;FS=2.434;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:44:99:99,0,1385 Chr03 28156399 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 28224501 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 28226076 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.464;QD=1.35;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:77:77,0,1163 Chr03 28306365 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.58;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 28338808 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 28387978 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.42;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr03 28387995 . T G 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.42;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr03 28388061 . C G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 28408480 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 28408484 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 28408501 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 28486238 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:160,12,0 Chr03 28487815 . G C 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:107,0,27 Chr03 28487830 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:32:74,0,32 Chr03 28487852 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:98,0,30 Chr03 28488254 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,100 Chr03 28503169 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 28509147 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 28520870 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 28520887 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 28520889 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 28520894 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 28520927 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 28520929 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 28524525 . T C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr03 28524562 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 28539433 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 28539537 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.557;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:70:70,0,384 Chr03 28549724 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 28549730 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 28551228 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 28551334 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.059;QD=1.19;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:52:52,0,591 Chr03 28552365 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 28553166 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 28573592 . C G 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:131,0,64 Chr03 28573599 . A G 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:56:147,0,56 Chr03 28616373 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 28622887 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 28636844 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:63,0,33 Chr03 28636905 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:63,0,32 Chr03 28638722 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 28672383 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,137 Chr03 28723650 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 28756236 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr03 28765958 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 28783307 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr03 28875144 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 28880543 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 28903025 . T C 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr03 28942901 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr03 28942927 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr03 28943067 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 28959669 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 28972473 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 29029187 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29029188 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29029209 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:116,9,0 Chr03 29029236 . A G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 29029247 . A G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr03 29029248 . G A 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr03 29048377 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 29067026 . T G 194.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:223,18,0 Chr03 29120700 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 29121566 . A G 101.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.12;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:129,12,0 Chr03 29121610 . G C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.12;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr03 29121845 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.137;DP=24;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.569 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:85:85,0,705 Chr03 29121847 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.346;DP=24;Dels=0.00;FS=2.644;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=2.37;ReadPosRankSum=-1.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:85:85,0,699 Chr03 29122237 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29122280 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 29122989 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 29122990 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.43;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 29122992 . G C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.76;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr03 29123004 . G A 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.76;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr03 29123030 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 29123043 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 29123045 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 29123053 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.55;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 29123939 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 29123985 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 29123986 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 29144969 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 29178351 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.22;MQ0=0;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr03 29204808 . C A 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:116,9,0 Chr03 29222003 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29242112 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 29242126 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr03 29248911 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.942;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.19;MQ0=0;MQRankSum=2.153;QD=2.30;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,426 Chr03 29259761 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.81;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=3.17;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:10:6:59,6,0 Chr03 29273654 . C T 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr03 29281531 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29285873 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.05;MQ0=2;QD=10.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:69,6,0 Chr03 29365297 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=4;QD=2.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:77,6,0 Chr03 29365350 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=2;QD=2.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:6:84,6,0 Chr03 29380934 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 29385558 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 29415648 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.10;MQ0=2;QD=15.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:123,9,0 Chr03 29415652 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.10;MQ0=2;QD=15.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:120,9,0 Chr03 29417969 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 29429929 . T C 81.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr03 29453510 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr03 29483843 . C A 250.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=27.88;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:14:279,0,14 Chr03 29508731 . C G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 29565459 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.619;DP=31;Dels=0.00;FS=9.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:56:56,0,928 Chr03 29580012 . A T 41.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 29593318 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 29593355 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr03 29593370 . A T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 29595976 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 29608633 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 29608644 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 29617509 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.99;ReadPosRankSum=2.095 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:113,0,443 Chr03 29618626 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 29626014 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 29626951 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 29651095 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 29669124 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,133 Chr03 29692879 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 29698675 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 29769956 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29821129 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.800;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=8.63;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:149,0,314 Chr03 29826049 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.02;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 29826776 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.10;MQ0=1;QD=9.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:65,6,0 Chr03 29839476 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,264 Chr03 29848730 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,97 Chr03 29861139 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 29863842 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,134 Chr03 29871817 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:64,0,33 Chr03 29872851 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 29882570 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:107,0,107 Chr03 29899894 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 29904608 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 29904870 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr03 29907441 . A C 268.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 29935143 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 29935906 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 29941653 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr03 29944081 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:101,0,182 Chr03 29945283 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 29947402 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.54;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:102,0,147 Chr03 29947445 . C T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:100,0,143 Chr03 29947478 . A C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,175 Chr03 29948184 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 29958341 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 29962377 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 29962382 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 29962387 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 29963198 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 29963220 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 29963231 . T A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr03 29963242 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 29964171 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 29964475 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 29964478 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 29964514 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 30035832 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 30036125 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 30036133 . C A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 30036160 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 30036162 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 30038059 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 30047390 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 30047473 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30064967 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 30064984 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 30065011 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30087732 . T A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.868;QD=4.21;ReadPosRankSum=-3.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:146,0,781 Chr03 30101132 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=23;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.45;MQ0=0;MQRankSum=-4.093;QD=1.38;ReadPosRankSum=-4.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:60:60,0,443 Chr03 30101171 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;DP=23;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.45;MQ0=0;MQRankSum=-4.093;QD=1.38;ReadPosRankSum=4.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,11:23:60:60,0,441 Chr03 30101186 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;DP=22;Dels=0.00;FS=2.663;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.61;MQ0=0;MQRankSum=-4.006;QD=1.58;ReadPosRankSum=3.940 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,11:22:63:63,0,373 Chr03 30101194 . C T 82.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.27;MQ0=0;QD=7.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:111,15,0 Chr03 30101196 . A T 82.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.27;MQ0=0;QD=7.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:111,15,0 Chr03 30101206 . G A 82.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.27;MQ0=0;QD=7.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:15:111,15,0 Chr03 30102956 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 30102977 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 30106279 . G A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:146,0,66 Chr03 30125357 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,247 Chr03 30126722 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 30127236 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 30160099 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 30166682 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,101 Chr03 30166977 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;DP=79;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=8.9611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=1;MQRankSum=-4.537;QD=0.44;ReadPosRankSum=-0.865 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,9:79:63:63,0,2694 Chr03 30167004 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=79;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.67;MQ0=1;MQRankSum=-4.537;QD=0.45;ReadPosRankSum=-2.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,9:79:64:64,0,2709 Chr03 30167518 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30168276 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.4570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.78;MQ0=5;MQRankSum=1.763;QD=2.84;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:43:85,0,43 Chr03 30168874 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 30168929 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 30169121 . C T 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:145,0,27 Chr03 30179686 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 30179738 . G C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 30179741 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 30181598 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:82:82,0,187 Chr03 30181708 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 30185859 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 30234892 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30234936 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 30243204 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:61:61,0,184 Chr03 30258197 . G A 145.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:174,0,21 Chr03 30260273 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 30278406 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 30284365 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr03 30284407 . T C 77.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:106,0,21 Chr03 30292446 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 30292457 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 30292461 . T C 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr03 30292494 . C T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr03 30292507 . T C 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.36;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr03 30308029 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr03 30315326 . T C 42.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;QD=14.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:83,6,0 Chr03 30319490 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 30326774 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,337 Chr03 30328095 . T G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.078;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.09;MQ0=5;MQRankSum=-0.705;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:97:97,0,572 Chr03 30328106 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.93;MQ0=0;MQRankSum=-2.318;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:97:97,0,576 Chr03 30333866 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 30333867 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 30353981 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr03 30389484 . G A 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:70,0,24 Chr03 30422320 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 30423526 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 30434295 . A G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=1;MQRankSum=-0.382;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:93:93,0,255 Chr03 30473891 . C T 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:102,0,25 Chr03 30522531 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr03 30522541 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 30522543 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 30523409 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 30523453 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 30524833 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 30524860 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr03 30524900 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 30528053 . A C 92.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 30717993 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 30741323 . T G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 30741977 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.275;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=3.64;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:141,0,928 Chr03 30744161 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr03 30790852 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30790901 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 30790904 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 30790911 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 30791958 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 30818407 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 30818413 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 30818415 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 30863002 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 30869177 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 30869186 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 30871312 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:75:75,0,1280 Chr03 30879466 . G T 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:139,0,25 Chr03 30902263 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,141 Chr03 30910084 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;DP=57;Dels=0.00;FS=7.691;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.559;QD=0.54;ReadPosRankSum=-3.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,6:57:59:59,0,1880 Chr03 30913035 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:61,0,31 Chr03 30918209 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 30942244 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr03 30951698 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 30969906 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:123,9,0 Chr03 31012445 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;DP=19;Dels=0.00;FS=14.423;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,576 Chr03 31012541 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr03 31018824 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,239 Chr03 31038798 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 31040740 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,224 Chr03 31058523 . T C 155.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:184,15,0 Chr03 31149784 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=0;QD=7.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:59,6,0 Chr03 31157325 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 31157354 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 31157401 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 31231193 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,226 Chr03 31270267 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.79;MQ0=5;MQRankSum=-1.881;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:92:92,0,143 Chr03 31328098 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,298 Chr03 31340879 . G A 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.09;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:26:79,0,26 Chr03 31380343 . T G 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.34;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr03 31380357 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 31456968 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 31521959 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=7.15;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:114,0,254 Chr03 31544425 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr03 31544465 . G A 65.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:94,0,27 Chr03 31571641 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 31574070 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:108,0,28 Chr03 31629693 . T A 425.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:454,33,0 Chr03 31632588 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 31632637 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 31632696 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 31634151 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 31674685 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 31674731 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 31674785 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 31674797 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 31677030 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 31677056 . A G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr03 31693036 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 31694008 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 31694010 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 31694039 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 31789594 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 31825309 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 31825953 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 31881796 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,112 Chr03 31930004 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=4.42;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:121,0,558 Chr03 31931052 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 31994884 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.99;MQ0=52;QD=1.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,31:54:6:84,6,0 Chr03 32023217 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,259 Chr03 32023233 . A C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,258 Chr03 32023236 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,258 Chr03 32023239 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,255 Chr03 32023243 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,249 Chr03 32035592 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32060757 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 32087844 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr03 32090364 . G A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:53:104,0,53 Chr03 32093912 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32093936 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32099562 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 32163041 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32163092 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 32165176 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 32180102 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr03 32183888 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.66;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 32196501 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,70 Chr03 32203505 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,144 Chr03 32215396 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,108 Chr03 32237610 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.122;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:105,0,415 Chr03 32259419 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 32259956 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 32259968 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr03 32292329 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 32295076 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 32344154 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 32344165 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 32344166 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 32344194 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 32344679 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32344681 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32344701 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 32344709 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 32344743 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 32344745 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 32356078 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr03 32356094 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 32374671 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,495 Chr03 32376455 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 32389538 . T C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:110,0,29 Chr03 32389628 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,172 Chr03 32390729 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 32399962 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,102 Chr03 32413347 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32432513 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 32433184 . G T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr03 32455546 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 32455556 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 32459287 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 32459347 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 32466466 . A T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:93:93,0,303 Chr03 32467329 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.046;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:82:82,0,1276 Chr03 32467557 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 32473739 . C A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.261;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=2.76;ReadPosRankSum=-3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:125,0,1076 Chr03 32514861 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:66,6,0 Chr03 32524686 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 32524694 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 32533729 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 32568771 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 32569054 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr03 32569067 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 32569071 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr03 32578108 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 32593028 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 32594754 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr03 32613607 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr03 32629208 . T G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,225 Chr03 32642954 . C T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59:100,0,59 Chr03 32670675 . A C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 32698787 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 32698790 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 32698802 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 32698811 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 32744561 . A C 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,174 Chr03 32744608 . T A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:251,0,253 Chr03 32751201 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,110 Chr03 32751203 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,110 Chr03 32751363 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr03 32772532 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 32773616 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 32775420 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 32936249 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,151 Chr03 32941017 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.502;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.228 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:55:55,0,764 Chr03 32945154 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr03 32970724 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:44:63,0,44 Chr03 33103902 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,99 Chr03 33134540 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr03 33166171 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr03 33167350 . T A 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-3.682;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.456 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:99:169,0,734 Chr03 33167391 . C T 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.791;DP=65;Dels=0.00;FS=10.019;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.205;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.651 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,11:65:99:229,0,1952 Chr03 33167401 . T C 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.826;DP=65;Dels=0.00;FS=10.019;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-5.205;QD=3.58;ReadPosRankSum=3.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,11:65:99:261,0,2009 Chr03 33167982 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 33168315 . C G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:110,0,67 Chr03 33168319 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:109,0,61 Chr03 33168322 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:111,0,68 Chr03 33168331 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:111,0,63 Chr03 33168337 . A G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:109,0,69 Chr03 33168359 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:108,0,68 Chr03 33168367 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:107,0,67 Chr03 33215450 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 33226626 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,141 Chr03 33226722 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 33235142 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;DP=17;Dels=0.00;FS=5.842;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.057;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,457 Chr03 33235524 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,218 Chr03 33324316 . G T 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr03 33520431 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr03 33524890 . G T 239.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.021;DP=42;Dels=0.00;FS=33.193;HaplotypeScore=2.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.015;QD=5.71;ReadPosRankSum=-4.721 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,10:42:99:268,0,1111 Chr03 33580267 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;DP=59;Dels=0.00;FS=19.042;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.645;QD=1.08;ReadPosRankSum=-4.114 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,7:59:92:92,0,1897 Chr03 33585627 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,169 Chr03 33585713 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 33671879 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.35;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 33801191 . C G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,66 Chr03 33807023 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:8:99:132,0,99 Chr03 34006600 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:66:66,0,886 Chr03 34078593 . T A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.525;DP=51;Dels=0.00;FS=39.256;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=2.39;ReadPosRankSum=-4.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,8:51:99:150,0,1570 Chr03 34151050 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.905;DP=24;Dels=0.00;FS=10.073;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.581;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:82:82,0,739 Chr03 34176898 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 34195599 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34197103 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,147 Chr03 34202831 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 34202834 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 34202837 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 34205939 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 34205961 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34213254 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 34214800 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr03 34228936 . A G 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr03 34234762 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.32;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:113,9,0 Chr03 34243481 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,190 Chr03 34243496 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr03 34243674 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 34244020 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,66 Chr03 34245378 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 34245387 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34245392 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34245440 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:75,0,31 Chr03 34245442 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 34245449 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr03 34273192 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 34273237 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 34273565 . C G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr03 34273591 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 34273633 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 34273899 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 34273909 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34273923 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 34273931 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 34273934 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 34275080 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:66:66,0,148 Chr03 34275109 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,175 Chr03 34275124 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,186 Chr03 34275126 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,175 Chr03 34275138 . C G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,164 Chr03 34365127 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,207 Chr03 34398134 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,332 Chr03 34493570 . G A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,363 Chr03 34493577 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:73:73,0,365 Chr03 34493599 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:70:70,0,360 Chr03 34628489 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:70,0,66 Chr03 34669251 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 34747852 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,147 Chr03 34885791 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 34964151 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,195 Chr03 35031539 . A T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=13.22;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:134,0,139 Chr03 35083990 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:64,0,30 Chr03 35145582 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 35164973 . C T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:141,0,176 Chr03 35167213 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 35169132 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.32;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:121,9,0 Chr03 35181307 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 35206989 . G T 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:139,0,25 Chr03 35305143 . C G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,139 Chr03 35306292 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,206 Chr03 35367886 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr03 35367899 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr03 35427008 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;DP=56;Dels=0.00;FS=16.344;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.570;QD=0.66;ReadPosRankSum=-3.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:65:65,0,1742 Chr03 35429731 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 35495336 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,137 Chr03 35497178 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,184 Chr03 35507017 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 35514806 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;DP=20;Dels=0.00;FS=6.952;HaplotypeScore=2.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:58:58,0,625 Chr03 35519825 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 35622205 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr03 35630640 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;DP=15;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:68:68,0,443 Chr03 35637997 . A G 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.53;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,213 Chr03 35667048 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=25;Dels=0.00;FS=2.566;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,3:25:51:51,0,805 Chr03 35682568 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=13;Dels=0.00;FS=3.736;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:85:85,0,372 Chr03 35702254 . T A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr03 35702338 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.88;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:137,0,195 Chr03 35713696 . T C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:105,0,109 Chr03 35715329 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.138 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:55:55,0,972 Chr03 35725368 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 35759510 . A C 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.488;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:139,0,712 Chr03 35759517 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:137,0,708 Chr03 35759535 . C G 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.284;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:118,0,640 Chr03 35763634 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35763654 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35763665 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35763679 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 35785308 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr03 35785390 . G T 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=16.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:92:162,0,92 Chr03 35786420 . A G 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:143,0,446 Chr03 35786753 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 35795947 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 35795948 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 35834509 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:67:100,0,67 Chr03 35848940 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.457;DP=17;Dels=0.00;FS=6.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.197;QD=2.05;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:63:63,0,517 Chr03 35877157 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,144 Chr03 35898166 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr03 35904636 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 35905195 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 35924183 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35924185 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35924222 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 35927849 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 35930156 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:65,0,62 Chr03 35934414 . T G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,134 Chr03 35936052 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=8.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 Chr03 35936096 . T C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr03 35936104 . A G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr03 35936108 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=8.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 Chr03 35936134 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.09;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr03 35965636 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,188 Chr03 35980181 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.28;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:10:51:51,0,260 Chr03 35981939 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 35983936 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,434 Chr03 35987715 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 35988159 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:57:57,0,511 Chr03 35988901 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr03 35988933 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,69 Chr03 35989563 . G T 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:106,0,27 Chr03 35989629 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr03 35997828 . G A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.047;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.890;QD=8.38;ReadPosRankSum=0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:179,0,416 Chr03 36000080 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 36000104 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 36003428 . A G 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.636;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.41;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:118,0,356 Chr03 36003446 . G A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:119,0,424 Chr03 36014097 . G C 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.965;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:117,0,802 Chr03 36017134 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:52:52,0,1193 Chr03 36017289 . T A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.853;DP=66;Dels=0.00;FS=3.437;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.562;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,7:66:86:86,0,2139 Chr03 36033616 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 36043761 . C A 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.077;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.560;QD=3.72;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:162,0,1084 Chr03 36044107 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.725;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=3.51;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:137,0,932 Chr03 36097467 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 36101731 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 36166829 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:53:69,0,53 Chr03 36166835 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:69,0,62 Chr03 36181857 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:64:64,0,136 Chr03 36183402 . G T 143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:92:172,0,92 Chr03 36219137 . T G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:100,9,0 Chr03 36231559 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 36237388 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 36237394 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 36293197 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.352 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:54:54,0,682 Chr03 36309396 . C A 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:149,0,26 Chr03 36347651 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 36347706 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 36396054 . T A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:103,0,454 Chr03 36411276 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,177 Chr03 36466133 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 36488409 . C A 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.56;MQ0=0;QD=12.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:88,9,0 Chr03 36610756 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,135 Chr03 36616948 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=11.31;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:130,0,141 Chr03 36659499 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 36665605 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 36746460 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr03 36767534 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 36828642 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=2.06;ReadPosRankSum=-4.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,7:48:99:127,0,1453 Chr03 36856154 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr03 36864435 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 36898670 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:92:92,0,106 Chr03 36937958 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,67 Chr03 36978934 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=13.424;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.06;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,312 Chr03 37000487 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr03 37034344 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:92:92,0,139 Chr03 37079199 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 37132824 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,101 Chr03 37132917 . T A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,103 Chr03 37134138 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.291;QD=1.29;ReadPosRankSum=-3.810 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:89:89,0,1468 Chr03 37151273 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,715 Chr03 37216743 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 37232764 . C T 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr03 37287722 . A C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:104,0,24 Chr03 37287743 . A T 40.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:69,0,22 Chr03 37287763 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 37291613 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 37291653 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291655 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291657 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291665 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291668 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291677 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37291684 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37325577 . C A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.810;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=6.08;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,8:21:99:156,0,333 Chr03 37327841 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:34:52:52,0,1080 Chr03 37327937 . C A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;DP=28;Dels=0.00;FS=9.118;HaplotypeScore=3.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.212;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.798 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:28:99:113,0,708 Chr03 37350501 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 37415987 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,259 Chr03 37422512 . G T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.855;QD=9.37;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:150,0,284 Chr03 37457716 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 37463435 . C A 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=16.98;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:198,0,132 Chr03 37465584 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 37522542 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 37595999 . A C 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:82:82,0,390 Chr03 37596019 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=0.495;QD=5.91;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:111,0,369 Chr03 37596020 . A G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=0.071;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:102,0,370 Chr03 37596023 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;DP=14;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:109,0,369 Chr03 37596217 . A T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.135;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=5.84;ReadPosRankSum=1.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:145,0,552 Chr03 37617343 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,217 Chr03 37630542 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.375;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:71:71,0,846 Chr03 37630638 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:146,0,363 Chr03 37649913 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr03 37680966 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,186 Chr03 37729292 . G A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=11;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,253 Chr03 37748639 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 37762402 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 37811145 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr03 37859983 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.76;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr03 37884419 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.918;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=4.11;ReadPosRankSum=-4.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:168,0,1006 Chr03 37906528 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 37935128 . G T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr03 37954434 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 37954461 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 37954502 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 37967149 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,219 Chr03 37976271 . C A 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:137,0,26 Chr03 38012726 . G T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:135,0,26 Chr03 38050168 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 38070230 . G C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;DP=37;Dels=0.00;FS=2.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.733;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.110 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:94:94,0,1182 Chr03 38070262 . A C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;DP=37;Dels=0.00;FS=2.057;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.111;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:99:100,0,1211 Chr03 38114833 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.88;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,252 Chr03 38136031 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,288 Chr03 38151579 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 38280309 . G T 74.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:115,9,0 Chr03 38295343 . C A 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr03 38316536 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,249 Chr03 38322505 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 38322979 . G T 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.359;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.773;QD=3.80;ReadPosRankSum=-4.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:184,0,1233 Chr03 38337320 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.135;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=1.74;ReadPosRankSum=-3.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:89:89,0,1122 Chr03 38342649 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,543 Chr03 38378527 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,220 Chr03 38378569 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,209 Chr03 38418643 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr03 38438112 . G T 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr03 38438209 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr03 38473354 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,248 Chr03 38473361 . T A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,266 Chr03 38640271 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,136 Chr03 38666513 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 38671404 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 38678814 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 38693597 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 38694119 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:87:87,0,372 Chr03 38800314 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:96,0,67 Chr03 38823531 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,107 Chr03 38910434 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.339;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.229;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:37:85:85,0,1157 Chr03 38931550 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:64,0,60 Chr03 38965343 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.486;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:67:67,0,927 Chr03 38965429 . C A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;DP=35;Dels=0.00;FS=2.502;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=3.79;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:161,0,1005 Chr03 38973786 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,140 Chr03 38992322 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 39042884 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.106;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=0.61;ReadPosRankSum=-3.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,5:44:55:55,0,1457 Chr03 39066797 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.355;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.98;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.711 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:51:51,0,446 Chr03 39081230 . C A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr03 39114463 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,144 Chr03 39130582 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 39137171 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 39171797 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:127,0,167 Chr03 39178262 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.796;QD=3.76;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:96:96,0,520 Chr03 39180072 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 39183642 . G T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 39206931 . T A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=23.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:119,0,222 Chr03 39217692 . C A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.101;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.143;QD=5.99;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:160,0,539 Chr03 39227446 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,172 Chr03 39235373 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:8:98:98,0,104 Chr03 39235470 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.052;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,689 Chr03 39292673 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr03 39292770 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.930;DP=13;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,351 Chr03 39373199 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 39413225 . C A 172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.508;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.434;QD=7.51;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:201,0,585 Chr03 39560268 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 39563510 . G T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.676;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:11:99:163,0,173 Chr03 39563606 . C A 143.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:172,0,24 Chr03 39616300 . C A 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.204;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.299;QD=13.32;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:15:99:228,0,246 Chr03 39616405 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 39626233 . G A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr03 39626705 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 39641703 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,105 Chr03 39641911 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 39650123 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 39651123 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 39651207 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 39654595 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 39659708 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,139 Chr03 39714346 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 39722756 . G T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:175,0,23 Chr03 39729014 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 39729227 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 39730264 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 39762183 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 39768329 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr03 39785453 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,223 Chr03 39819208 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 39821117 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 39830496 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 39831409 . T G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 39834722 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 39834746 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 39835950 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:98,0,67 Chr03 39855729 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 39855745 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 39855762 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 39878072 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,364 Chr03 39901905 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 39941903 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;DP=31;Dels=0.00;FS=5.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.081;QD=2.32;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:100,0,941 Chr03 39952539 . G A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr03 39969784 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr03 40057337 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;DP=20;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=1.9976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=5.39;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:20:99:136,0,444 Chr03 40062147 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,143 Chr03 40085987 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=28.325;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,537 Chr03 40087838 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 40094172 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 40097581 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 40097619 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 40147401 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.706;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=5.24;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:133,0,548 Chr03 40188086 . C A 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.359;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.661;QD=3.82;ReadPosRankSum=-4.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:185,0,1232 Chr03 40189351 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr03 40201191 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 40213123 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr03 40278248 . A C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,143 Chr03 40324503 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=28.325;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,500 Chr03 40325587 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 40325684 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 40388334 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,176 Chr03 40404032 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 40404128 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 40406969 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 40415409 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr03 40459191 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 40489288 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,103 Chr03 40489375 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:58:58,0,147 Chr03 40491892 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,118 Chr03 40558305 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.146;DP=42;Dels=0.00;FS=46.075;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=-3.418;QD=0.85;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:64:64,0,1406 Chr03 40582352 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:77:77,0,259 Chr03 40582438 . C A 212.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=26.62;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:241,0,14 Chr03 40589500 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 40695836 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,139 Chr03 40717835 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 40740916 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr03 40741013 . C A 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr03 40748786 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 40751043 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr03 40815165 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 40873472 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 40912983 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 40912997 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr03 40933569 . G T 34.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:19:63,0,19 Chr03 40974928 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.596;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.490;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:87:87,0,668 Chr03 40985111 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;DP=27;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.962;QD=4.32;ReadPosRankSum=-3.703 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:99:145,0,761 Chr03 40991233 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 40991261 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 41049568 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:111,0,29 Chr03 41123166 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.64;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr03 41165451 . C G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 41226918 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=17;Dels=0.00;FS=12.884;HaplotypeScore=2.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:66:66,0,513 Chr03 41365410 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 41409475 . T A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr03 41440455 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 41451823 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,244 Chr03 41533378 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=16;Dels=0.00;FS=14.472;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.211;QD=2.55;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:69:69,0,459 Chr03 41638798 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,175 Chr03 41682214 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 41682264 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 41697852 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,142 Chr03 41783483 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;DP=117;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.33;MQ0=0;MQRankSum=3.228;QD=0.40;ReadPosRankSum=-3.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:111,4:117:75:75,0,667 Chr03 41786966 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 41787060 . C A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=3.69;ReadPosRankSum=-3.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:139,0,875 Chr03 41878047 . G T 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.308;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.549;QD=9.80;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:185,0,362 Chr03 41896722 . A T 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr03 41896723 . A C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 41971978 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 41979719 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:101,0,62 Chr03 41985955 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,628 Chr03 41986049 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.961;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.176;QD=2.21;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:79:79,0,725 Chr03 42051090 . C T 34.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:63,0,28 Chr03 42123679 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 42123712 . G A 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.74;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr03 42130701 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 42216062 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:68,0,32 Chr03 42224938 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,256 Chr03 42234890 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.736;DP=54;Dels=0.00;FS=32.976;HaplotypeScore=2.5649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=0.53;ReadPosRankSum=-4.229 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,10:54:57:57,0,1640 Chr03 42236293 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:59:59,0,581 Chr03 42257897 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 42281174 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=26.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.85;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:88:88,0,616 Chr03 42281260 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 42391183 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:28:70:70,0,804 Chr03 42399421 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,331 Chr03 42399517 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr03 42426442 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr03 42430489 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,258 Chr03 42501275 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,234 Chr03 42503844 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,296 Chr03 42547167 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 42565353 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,204 Chr03 42574361 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.61;MQ0=1;QD=4.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:57,6,0 Chr03 42599625 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.399;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.222;QD=1.51;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:84:84,0,1202 Chr03 42691247 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,185 Chr03 42702059 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 42702116 . A C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr03 42702131 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 42715369 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.542;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.051;QD=6.66;ReadPosRankSum=-3.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:168,0,552 Chr03 42715461 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;DP=99;Dels=0.00;FS=31.484;HaplotypeScore=5.9966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=0.99;ReadPosRankSum=-5.394 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,11:99:99:126,0,3149 Chr03 42719354 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 42720549 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 42720948 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 42746044 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 42764877 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:52:135,0,52 Chr03 42768905 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 42768919 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 42784040 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr03 42784666 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:14:77:77,0,365 Chr03 42805009 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=2.81;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:107,0,853 Chr03 42821653 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 42821655 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 42881049 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 42881145 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.399;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,846 Chr03 42967378 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:62,0,51 Chr03 43007439 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.71;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:157,0,209 Chr03 43022753 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,234 Chr03 43234758 . C A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=7.48;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:118,0,293 Chr03 43276529 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 43281151 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;DP=45;Dels=0.00;FS=11.361;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.704;QD=0.77;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:63:63,0,1459 Chr03 43291400 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr03 43299793 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 43302150 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 43303394 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 43523955 . T G 56.48 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:4:6:84,6,0 Chr03 43530914 . G T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.835;DP=13;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=6.91;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:13:99:118,0,259 Chr03 43562732 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr03 43586033 . T A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr03 43674489 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 43693020 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 43693107 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr03 43703318 . G T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:118,0,278 Chr03 43703398 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=67;Dels=0.00;FS=13.639;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.435;QD=1.15;ReadPosRankSum=-4.496 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,8:67:99:105,0,2124 Chr03 43773311 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 43773313 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 43783173 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 43784134 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 43799306 . G T 278.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.448;QD=10.72;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,10:26:99:307,0,578 Chr03 43812876 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr03 43813323 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 43813788 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 43854509 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.67;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr03 43854606 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,555 Chr03 43895274 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,247 Chr03 43906255 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=2.72;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:88:88,0,661 Chr03 43908046 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 43920596 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:8:93:93,0,140 Chr03 43941915 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,225 Chr03 43960444 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,182 Chr03 43995767 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=1;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:67,6,0 Chr03 44117281 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 44129450 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 44149054 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 44165332 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 44166373 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 44166383 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 44166419 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 44193464 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 44194493 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr03 44195319 . A G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr03 44241333 . A G 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr03 44267654 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 44645815 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 44651493 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 44652175 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 44690787 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=18.98;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:99:237,0,131 Chr03 44700970 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.124;QD=4.66;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:126,0,593 Chr03 44951691 . G T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.305;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.416;QD=2.76;ReadPosRankSum=-3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:125,0,1063 Chr03 44969958 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,177 Chr03 45010465 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,96 Chr03 45032779 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 45032840 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 45036652 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 45039080 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 45044122 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr03 45044125 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 45078181 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 45078260 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 45091345 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:162,12,0 Chr03 45096061 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:50,0,102 Chr03 45237973 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,106 Chr03 45418800 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr03 45437497 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:53:53,0,84 Chr03 45503471 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:57,0,107 Chr03 45511897 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 45652417 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 45682301 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr03 45793329 . C A 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;DP=23;Dels=0.00;FS=12.352;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.085;QD=5.69;ReadPosRankSum=-3.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:159,0,591 Chr03 45888015 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 45892460 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 45917627 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.394;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=1.07;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:71:71,0,1311 Chr03 45955430 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:64,0,31 Chr03 46061758 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 46107067 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;DP=35;Dels=0.00;FS=14.062;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:50:50,0,987 Chr03 46108049 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:78:78,0,290 Chr03 46116569 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr03 46117858 . A G 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr03 46132479 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:91:91,0,601 Chr03 46140810 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 46162105 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,183 Chr03 46204127 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr03 46207429 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,182 Chr03 46234771 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 46252544 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 46300713 . G T 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=7.31;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:12:99:116,0,256 Chr03 46334744 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 46364964 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,201 Chr03 46382300 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,264 Chr03 46415401 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 46423937 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 46447968 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 46448367 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 46449372 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 46455438 . T A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr03 46457892 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 46457893 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 46457910 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 46457924 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 46458047 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr03 46464346 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=5.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,387 Chr03 46473185 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 46473186 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 46473259 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 46486754 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr03 46547423 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,215 Chr03 46590652 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.602;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.078;QD=0.92;ReadPosRankSum=-3.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:67:67,0,1382 Chr03 46603796 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr03 46606056 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr03 46606092 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 46606105 . C A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 46611065 . A T 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr03 46614911 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr03 46614935 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr03 46643030 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 46668226 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,252 Chr03 46714361 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 46869325 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 46953055 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 46956816 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 47007293 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr03 47007694 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr03 47007791 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:5:29:104,0,29 Chr03 47020384 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr03 47036152 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 47036161 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 47120136 . G T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr03 47120139 . C A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr03 47154938 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.896;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,251 Chr03 47231739 . A T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.041;DP=35;Dels=0.00;FS=31.100;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:86:86,0,1127 Chr03 47231980 . C G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr03 47232024 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 47326264 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr03 47326335 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 47449448 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 47511327 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.69;MQ0=21;QD=2.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,2:23:6:78,6,0 Chr03 47525887 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,192 Chr03 47538992 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,123 Chr03 47648392 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr03 47650235 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,108 Chr03 47791115 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 47794144 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 47798081 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 47802733 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 48017956 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr03 48021817 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48090681 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.959;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=1.19;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:64:64,0,972 Chr03 48090929 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,180 Chr03 48149879 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48149897 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 48149899 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 48149911 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48149916 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 48149955 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48149963 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 48149968 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 48153625 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 48153636 . A C 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr03 48159161 . G T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr03 48170869 . A C 39.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:68,0,20 Chr03 48190110 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,145 Chr03 48190197 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48201961 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48219997 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 48220007 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48220008 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48220016 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48220030 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 48220037 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 48220043 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 48220045 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 48220060 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48221098 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 48221356 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 48221537 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:61:61,0,927 Chr03 48227125 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr03 48232321 . A T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr03 48246123 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 48246133 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 48246134 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 48246175 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 48261902 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,97 Chr03 48269752 . G A 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;DP=29;Dels=0.00;FS=24.422;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,6:29:99:144,0,844 Chr03 48270072 . T A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.497;DP=42;Dels=0.00;FS=38.955;HaplotypeScore=1.7886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:142,0,1281 Chr03 48277295 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48284151 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 48288302 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 48330493 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 48445174 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 48446973 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=23.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:120,9,0 Chr03 48447051 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 48448193 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 48448422 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 48451528 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 48455343 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr03 48455351 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr03 48460757 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48473031 . T A 25.83 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.47;MQ0=1;QD=0.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,101:104:9:70,9,0 Chr03 48487046 . C T 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:97:185,0,97 Chr03 48487055 . C T 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:183,0,100 Chr03 48489974 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 48490390 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr03 48490391 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 48490410 . C G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 48490423 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 48498071 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 48498100 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 48509995 . A T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 48526321 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 48527313 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 48533757 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 48533839 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 48534359 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48534387 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 48534397 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 48539058 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 48539120 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48545097 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 48545114 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 48545212 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 48545215 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 48545582 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr03 48548432 . G T 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr03 48548519 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 48552553 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 48559084 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,558 Chr03 48559181 . C A 107.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:152,12,0 Chr03 48564266 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48564267 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 48577347 . G A 155.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:184,15,0 Chr03 48597223 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;DP=80;Dels=0.00;FS=25.574;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQ0=0;MQRankSum=0.872;QD=0.95;ReadPosRankSum=-4.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,9:80:99:104,0,2528 Chr03 48620147 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48621812 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 48624455 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 48632739 . C T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr03 48633925 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48633942 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 48640315 . A C 274.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.54;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:303,0,15 Chr03 48646757 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,464 Chr03 48646843 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 48695287 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr03 48695302 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr03 48725726 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,65 Chr03 48748235 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr03 48750311 . A G 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;DP=99;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.928;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.258 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,95:99:76:76,0,109 Chr03 48775636 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 48775672 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 48829399 . T C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr03 48837212 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 48953370 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr03 49088021 . T C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;DP=15;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:81:81,0,410 Chr03 49139550 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 49141393 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr03 49182065 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,292 Chr03 49203276 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,144 Chr03 49223241 . C A 54.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.80;MQ0=3;MQRankSum=2.793;QD=1.48;ReadPosRankSum=-2.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,3:37:14:83,0,14 Chr03 49257765 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.151;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=1.15;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:64:64,0,999 Chr03 49338260 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 49353645 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;DP=55;Dels=0.00;FS=2.377;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.499;QD=0.61;ReadPosRankSum=-3.982 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,6:55:62:62,0,1724 Chr03 49358409 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,260 Chr03 49459439 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQ0=0;MQRankSum=0.717;QD=1.47;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:68:68,0,861 Chr03 49512678 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=10.18;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:10:99:130,0,141 Chr03 49529157 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=29;Dels=0.00;FS=2.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.601;QD=1.23;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:64:64,0,907 Chr03 49545149 . A T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.541;DP=48;Dels=0.00;FS=18.138;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-4.206;QD=2.14;ReadPosRankSum=-4.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,7:48:99:131,0,1460 Chr03 49617051 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr03 49617147 . C A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.610;DP=33;Dels=0.00;FS=25.519;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.144;QD=2.93;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:125,0,943 Chr03 49645538 . A G 194.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:223,18,0 Chr03 49645545 . C T 196.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:225,18,0 Chr03 49645774 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr03 49650100 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 49678360 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 49678698 . G C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 49679293 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 49681640 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 49681666 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 49685172 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 49689279 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 49699078 . C T 323.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:352,27,0 Chr03 49699080 . C G 314.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:343,27,0 Chr03 49701114 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 49724401 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 49727906 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 49727964 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 49764757 . A C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr03 49770089 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 49771003 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 49771005 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 49771018 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 49771024 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr03 49791990 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 49799455 . T G 146.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:175,15,0 Chr03 49799464 . A G 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr03 49799488 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr03 49808797 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 49811781 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 49811793 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 49816462 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 49821982 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 49822016 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 49822025 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 49832634 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;DP=49;Dels=0.00;FS=16.519;HaplotypeScore=1.8279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.479;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,5:49:51:51,0,1556 Chr03 49847815 . T A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr03 49849843 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 49868074 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=19.243;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,215 Chr03 49878827 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 49878864 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 49878868 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 49878870 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 49878888 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 49878907 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 49880510 . A G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.5981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:90:90,0,136 Chr03 49880580 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 49880703 . G T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr03 49887019 . G A 466.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:495,36,0 Chr03 49889702 . A G 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr03 49889714 . C A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr03 49889750 . T A 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr03 49896327 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 49896361 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 49896363 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr03 49901210 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 49901216 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 49901248 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 49927167 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:133,0,64 Chr03 49927263 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=6.42;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:86:86,0,211 Chr03 49940710 . C G 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 Chr03 49960367 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 49965006 . C T 98.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:127,15,0 Chr03 49965046 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 49965110 . G A 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 49981560 . A T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 49981578 . A T 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr03 50001965 . A G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr03 50001967 . C T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr03 50001982 . G A 182.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50096484 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 50097194 . G A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=32.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 Chr03 50101984 . C G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 50108937 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 50109191 . A G 134.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 50130163 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.929;DP=67;Dels=0.00;FS=20.885;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.435;QD=1.16;ReadPosRankSum=-4.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,8:67:99:106,0,2138 Chr03 50130340 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr03 50133509 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;DP=25;Dels=0.00;FS=5.618;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=3.51;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:116,0,712 Chr03 50137367 . 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G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50196292 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 50196392 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr03 50197023 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50199863 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50199938 . T C 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 50211019 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 50211029 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 50214175 . G T 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.938;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.515;QD=3.88;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:164,0,1039 Chr03 50240618 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr03 50240654 . G A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr03 50240670 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr03 50256800 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50256842 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50256851 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50256869 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 50261178 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr03 50262201 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50264625 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr03 50265612 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 50268065 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 50268068 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50273547 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 50273601 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 50275102 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:94,0,106 Chr03 50275806 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50275832 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 50275837 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50276088 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 50330989 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 50332311 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 50335904 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 50336255 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:82:82,0,241 Chr03 50337439 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 50344083 . C G 152.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:181,15,0 Chr03 50358750 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 50378814 . C T 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr03 50378828 . T A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr03 50378831 . T G 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr03 50378852 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 50378886 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr03 50452286 . G T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:175,0,23 Chr03 50452382 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.600;QD=8.77;ReadPosRankSum=-2.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,320 Chr03 50461520 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr03 50465706 . G A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr03 50500072 . C A 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:115,9,0 Chr03 50500195 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,243 Chr03 50500857 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,212 Chr03 50527351 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,357 Chr03 50565869 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,296 Chr03 50565956 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:9:54:54,0,226 Chr03 50570528 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr03 50593212 . C A 167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.583;QD=13.98;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:196,0,211 Chr03 50624293 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;DP=28;Dels=0.00;FS=26.306;HaplotypeScore=3.7305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.819 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:56:56,0,822 Chr03 50722273 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 50722369 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 50747280 . G T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.428;DP=28;Dels=0.00;FS=2.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.260;QD=4.21;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:146,0,781 Chr03 50747360 . C A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.829;DP=41;Dels=0.00;FS=7.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.329;QD=2.92;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:148,0,1263 Chr03 50753000 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,337 Chr03 50755786 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 50850811 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,108 Chr03 50903709 . A C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:93,0,66 Chr03 50962761 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=1.72;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:61:61,0,533 Chr03 51007663 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr03 51026790 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;DP=17;Dels=0.00;FS=33.766;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.34;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,460 Chr03 51050981 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51072381 . A G 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr03 51075849 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 51090296 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 51090393 . T A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,103 Chr03 51121202 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr03 51121476 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 51121490 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr03 51121499 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 51121511 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 51121517 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr03 51121518 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr03 51121540 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr03 51121551 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 51130919 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=3.65;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:72:72,0,321 Chr03 51149064 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr03 51151621 . A T 25.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:54,0,26 Chr03 51155056 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 51163133 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:72,0,60 Chr03 51193257 . G C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 51199759 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 51205915 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.510;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:103,0,465 Chr03 51205995 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.991;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.199;QD=0.93;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:58:58,0,1040 Chr03 51227920 . C T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr03 51227942 . A T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr03 51232292 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr03 51259212 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr03 51267165 . C A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr03 51283103 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 51312140 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51315526 . T A 45.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:74,0,23 Chr03 51382904 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51399644 . G T 66.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.62;MQ0=3;MQRankSum=3.043;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,4:43:26:95,0,26 Chr03 51450187 . A C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr03 51450194 . A C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr03 51453822 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 51477255 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 51485204 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,250 Chr03 51485379 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=32;Dels=0.00;FS=2.485;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.038;QD=2.09;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:95:95,0,1011 Chr03 51500985 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.392;DP=13;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:117,0,325 Chr03 51516164 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr03 51534911 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,142 Chr03 51541384 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:85:85,0,202 Chr03 51555215 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr03 51555226 . T G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 51567547 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51587300 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr03 51612553 . G T 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.652;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:122,0,173 Chr03 51663951 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 51677213 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 51692136 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51694917 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 51706860 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr03 51712981 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr03 51715226 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 51715252 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 51715857 . T G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 51720972 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.779;QD=2.61;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:104,0,865 Chr03 51725373 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.931;QD=22.16;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:91:272,0,91 Chr03 51729134 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 51729150 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51729152 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51729211 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 51729220 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 51731316 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51731319 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51731423 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51731427 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51732955 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51733687 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 51733691 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51733727 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51740684 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr03 51746195 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,187 Chr03 51748093 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51748112 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 51753911 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 51755294 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51755338 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 51759234 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51763582 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51774170 . T G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=27;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.031;QD=2.66;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:100,0,821 Chr03 51783682 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr03 51812351 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 51832944 . T G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr03 51832971 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr03 51840301 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 51840304 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr03 51843280 . A T 426.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=32.81;ReadPosRankSum=-1.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:453,0,3 Chr03 51843486 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 51851315 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 51851319 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 51851321 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51851334 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 51851339 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 51871808 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 51894144 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr03 51897821 . T G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr03 51901744 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 51901755 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 51902796 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=1.39;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:81:81,0,1210 Chr03 51902961 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=1.47;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:71:71,0,933 Chr03 51904914 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr03 51927786 . C T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr03 51928578 . T C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr03 51929205 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 51929215 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 51929284 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 51937277 . A C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr03 51937293 . T G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 51937311 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 51945814 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 51961695 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 51961973 . T G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 51964717 . A C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr03 51967191 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,68 Chr03 51981630 . C G 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr03 51994216 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 52004781 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.54;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 52004787 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.37;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 52004809 . A C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr03 52006977 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 52007095 . A C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr03 52023529 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr03 52032371 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr03 52037071 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.98;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr03 52037189 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr03 52047999 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr03 52055902 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 52055936 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:74,6,0 Chr03 52056007 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr03 52056008 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 52056015 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr03 52057564 . C A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr03 52072004 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 52072114 . T A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;DP=19;Dels=0.00;FS=28.894;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.650;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:97:97,0,485 Chr03 52074405 . G A 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr03 52074434 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 52074483 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr03 52077179 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr03 52077757 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr03 52095230 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.01;MQ0=0;QD=4.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:59,6,0 Chr03 52100638 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr03 52106963 . C T 101.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:130,0,25 Chr03 52120193 . T G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr03 52123745 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:124,9,0 Chr03 52124761 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 52134106 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr03 52137539 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr03 52141620 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr03 52141641 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr03 52141663 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 52141670 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 52141677 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr03 52148120 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr03 52148143 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 52148161 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr03 52259284 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.64;MQ0=25;MQRankSum=1.423;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,4:54:95:95,0,518 Chr03 52265983 . T A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:96,0,87 Chr03 52272836 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 11418 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,147 Chr04 17396 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 18443 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 23377 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:61:61,0,102 Chr04 40796 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 54069 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 54079 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 54082 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 56881 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 69603 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.022;DP=71;Dels=0.00;FS=14.382;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.283;QD=0.38;ReadPosRankSum=-4.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,7:71:55:55,0,2371 Chr04 76391 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 79704 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 83014 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 83022 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 83037 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 89900 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 97078 . T G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=21;Dels=0.00;FS=5.815;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=4.51;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:123,0,587 Chr04 97801 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 97833 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 97866 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 207895 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 212846 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 212853 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 224423 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=3.9788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.24;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:89:89,0,90 Chr04 224721 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 225564 . G A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr04 225628 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 226174 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=54;Dels=0.00;FS=14.173;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.670;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,7:54:99:107,0,1673 Chr04 227176 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 229168 . T A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 235862 . T C 42.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:82,6,0 Chr04 240955 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 241875 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 243767 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr04 247691 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 258995 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 259039 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 259066 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 327764 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 359898 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 359939 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 360449 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,167 Chr04 365605 . G T 34.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:74,6,0 Chr04 379245 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 380275 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 442777 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.32;MQ0=0;QD=11.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:84,6,0 Chr04 442793 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.32;MQ0=0;QD=10.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:82,6,0 Chr04 455483 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 460398 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 460417 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 509966 . T A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr04 512983 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 525989 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 534965 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 543807 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 544102 . C A 143.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:172,0,24 Chr04 546772 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 564930 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.725;DP=31;Dels=0.00;FS=13.627;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.940;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:99,0,915 Chr04 572545 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 572548 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 572553 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 572566 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 572587 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 572598 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 572599 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 574084 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 579351 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 584660 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 584663 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 610560 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 648652 . G T 433.31 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.96;MQ0=3;MQRankSum=0.255;QD=24.07;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,13:18:1:459,1,0 Chr04 680919 . C G 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr04 767216 . C G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 771982 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr04 771998 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.56;MQ0=6;MQRankSum=1.380;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,2:12:6:74,6,0 Chr04 772006 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.56;MQ0=6;MQRankSum=1.380;QD=4.15;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,2:12:6:77,6,0 Chr04 772014 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.59;MQ0=7;MQRankSum=1.380;QD=4.21;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:6:82,6,0 Chr04 772063 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.12;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:83,6,0 Chr04 776965 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:71,0,69 Chr04 777016 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56:56,0,56 Chr04 779605 . C T 104.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:132,12,0 Chr04 792770 . A T 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.74;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:12:115,12,0 Chr04 813195 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 900760 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.40;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,139 Chr04 900780 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.08;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,124 Chr04 975089 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 1023050 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;DP=27;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.40;MQ0=0;MQRankSum=2.832;QD=2.84;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:99:105,0,292 Chr04 1035935 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 1055618 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 1060115 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,146 Chr04 1086079 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1097720 . A T 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr04 1141730 . A G 296.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:325,24,0 Chr04 1143095 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1143173 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 1154456 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 1220499 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 1220516 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 1220635 . G T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.60;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,140 Chr04 1220874 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:81,6,0 Chr04 1248370 . T A 196.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:18:225,18,0 Chr04 1310231 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1310246 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1310259 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1310282 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 1342011 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 1342024 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 1342027 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 1411440 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 1422595 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,70 Chr04 1454036 . G T 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=9.13;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:156,0,328 Chr04 1469192 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:65,0,59 Chr04 1488085 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 1509049 . C A 390.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:419,33,0 Chr04 1536413 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1536523 . C A 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.236;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.030;QD=4.87;ReadPosRankSum=-3.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,7:32:99:184,0,846 Chr04 1536742 . A G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr04 1536747 . G C 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr04 1539383 . C A 72.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.20;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:101,0,21 Chr04 1567470 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=6.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.34;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:75:75,0,400 Chr04 1573786 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 1573789 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 1573798 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.99;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 1581308 . A G 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr04 1581320 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:73:73,0,97 Chr04 1581326 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:73:73,0,103 Chr04 1581334 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=7.46;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:73:73,0,106 Chr04 1584861 . A G 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.66;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr04 1622540 . A T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;DP=14;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.26;MQ0=1;MQRankSum=1.775;QD=3.41;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:76:76,0,306 Chr04 1622805 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.04;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 1622889 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.20;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr04 1622893 . G A 119.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686894 . A G 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686895 . A G 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686902 . A T 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686908 . G T 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686909 . A G 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686912 . G A 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.91;MQ0=30;QD=2.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,35:38:15:118,15,0 Chr04 1686943 . G T 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:118,15,0 Chr04 1853180 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 1853192 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 1858620 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 1858639 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 1862189 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,223 Chr04 1882772 . A T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr04 1882778 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,101 Chr04 1883464 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 1883535 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 1890630 . G A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.295;DP=52;Dels=0.00;FS=2.404;HaplotypeScore=2.2312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.272;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.862 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:52:95:95,0,1597 Chr04 1892714 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 1903778 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 1905645 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:73:73,0,321 Chr04 1910799 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 1917662 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 1925935 . A T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:77:77,0,481 Chr04 1927074 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 1952059 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 1960542 . C T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,185 Chr04 1960575 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,109 Chr04 1960576 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,107 Chr04 1965966 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 1978341 . G T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr04 1978427 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 1982481 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr04 2005564 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 2009243 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.237;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:56:56,0,549 Chr04 2009485 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:104,0,102 Chr04 2010911 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,71 Chr04 2012259 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr04 2012291 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,143 Chr04 2012327 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,214 Chr04 2019224 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2019484 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:71,0,64 Chr04 2027786 . T A 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=11.34;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:187,0,281 Chr04 2074808 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr04 2111986 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 2111996 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 2112021 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 2112046 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 2112066 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 2113224 . G A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:103,0,143 Chr04 2113229 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:106,0,147 Chr04 2116085 . A G 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;DP=35;Dels=0.00;FS=3.013;HaplotypeScore=5.4824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-3.289;QD=2.51;ReadPosRankSum=-2.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:35:99:116,0,840 Chr04 2116087 . C A 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.755;DP=35;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=5.4824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQ0=0;MQRankSum=-4.095;QD=6.02;ReadPosRankSum=-2.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:239,0,842 Chr04 2116113 . T C 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.790;QD=3.59;ReadPosRankSum=-2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:143,0,964 Chr04 2116117 . T G 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQ0=0;MQRankSum=-3.597;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:137,0,952 Chr04 2116415 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 2117270 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,222 Chr04 2135281 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 2135337 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 2135358 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 2139605 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 2140387 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2144130 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 2144156 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,66 Chr04 2144174 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2144176 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2147024 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=3.13;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:72:72,0,400 Chr04 2151784 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;DP=40;Dels=0.00;FS=4.976;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.814;QD=2.02;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:109,0,1254 Chr04 2195111 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.53;MQ0=41;QD=3.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,46:46:15:209,15,0 Chr04 2238955 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 2249669 . T C 79.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=15.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:108,15,0 Chr04 2273199 . G T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr04 2273295 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1154 Chr04 2312995 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,176 Chr04 2364654 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 2374956 . C A 717.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:746,54,0 Chr04 2375139 . C G 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr04 2376395 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 2376410 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.51;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr04 2377514 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 2405262 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 2409330 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 2436627 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 2437658 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 2505144 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:50:50,0,143 Chr04 2507611 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 2520075 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 2542330 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 2550955 . C A 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=9.66;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:8:9:105,9,0 Chr04 2572491 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 2572494 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 2572508 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 2572522 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2573995 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 2574004 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 2589383 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 2608027 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 2689475 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,66 Chr04 2693826 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,407 Chr04 2712945 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.540;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.540;QD=1.93;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:92:92,0,1051 Chr04 2724467 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.74;MQ0=1;MQRankSum=-1.733;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:67:67,0,491 Chr04 2724473 . G C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.464;QD=2.99;ReadPosRankSum=-1.973 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:85:85,0,479 Chr04 2724487 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.708;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.903 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:19:61:61,0,491 Chr04 2724492 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:64:64,0,465 Chr04 2825689 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.861;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:75:75,0,1281 Chr04 2918922 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.960;DP=24;Dels=0.00;FS=6.214;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.436;QD=0.91;ReadPosRankSum=-2.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:50:50,0,754 Chr04 2918976 . A C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=6.31;ReadPosRankSum=1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:85:85,0,197 Chr04 2919003 . C G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:85:85,0,270 Chr04 2928872 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 2928873 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 2928876 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:61,6,0 Chr04 2940259 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 2969616 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.011;DP=64;Dels=0.00;FS=10.680;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=0.75;ReadPosRankSum=-4.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:64:76:76,0,2039 Chr04 2985100 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 2987626 . G T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr04 2987629 . C A 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr04 2989630 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,179 Chr04 2995317 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr04 2995332 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr04 2998290 . T A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr04 2998306 . T A 195.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:224,18,0 Chr04 2999597 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 3029146 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 3029160 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3036008 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 3094613 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 3100577 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,60 Chr04 3100671 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 3129769 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3144685 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr04 3151088 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 3171283 . C A 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr04 3178521 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3197956 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3198945 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3198965 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3231115 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3232661 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3232719 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3257583 . A G 43.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:72,0,23 Chr04 3260741 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 3260785 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 3322707 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 3331561 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 3331562 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3331607 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 3356298 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:94:132,0,94 Chr04 3356384 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.250;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,549 Chr04 3445813 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 3468639 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQ0=12;QD=5.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,3:15:9:116,9,0 Chr04 3474307 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 3492049 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 3508199 . T C 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr04 3541346 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 3548706 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 3566192 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:11:82:82,0,256 Chr04 3613610 . G C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr04 3613613 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 3621560 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr04 3621616 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr04 3623855 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3629194 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 3629442 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 3629443 . C A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr04 3635468 . G C 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:79:79,0,341 Chr04 3639329 . A C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr04 3639331 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 3688272 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 3688303 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3688311 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3688318 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3764856 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 3765707 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3776644 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 3776891 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3782526 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,220 Chr04 3782622 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.510;DP=24;Dels=0.00;FS=17.042;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.665;QD=2.16;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:80:80,0,712 Chr04 3788092 . G T 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.219;QD=7.67;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:174,0,472 Chr04 3806283 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 3811030 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 3815326 . G C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr04 3821626 . T G 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.38;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 Chr04 3822660 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 3823374 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 3826022 . G A 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 3911128 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 3924006 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 3924672 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3924679 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 3946597 . T A 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr04 3949498 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr04 3950158 . T C 157.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:186,15,0 Chr04 3950181 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr04 3958912 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 4002721 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.77;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=12.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:77,6,0 Chr04 4012107 . C G 85.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.976;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.77;MQ0=0;MQRankSum=1.469;QD=2.60;ReadPosRankSum=2.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,10:33:18:114,0,18 Chr04 4016805 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.41;MQ0=13;MQRankSum=1.231;QD=1.88;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,15:18:62:62,0,105 Chr04 4031819 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.606;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.62;MQ0=0;MQRankSum=3.327;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:69:69,0,1308 Chr04 4045096 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 4058645 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.76;MQ0=1;MQRankSum=-3.196;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,28:36:99:106,0,166 Chr04 4081709 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 4082654 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.39;MQ0=27;MQRankSum=0.727;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,24:31:9:119,9,0 Chr04 4132348 . G C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr04 4133423 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 4133427 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 4165326 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 4166812 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,448 Chr04 4166894 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr04 4182291 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 4234744 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 4235819 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 4241131 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 4241135 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 4242449 . G A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr04 4260101 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 4260303 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,236 Chr04 4274039 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 4299494 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 4299548 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 4305286 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 4305334 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 4307181 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 4330917 . C A 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.293;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.707;QD=3.73;ReadPosRankSum=-4.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:181,0,1231 Chr04 4360661 . T C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.34;MQ0=2;QD=5.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:80,9,0 Chr04 4415563 . T G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:69,0,64 Chr04 4415571 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:69,0,62 Chr04 4415595 . C T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.76;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr04 4415602 . A T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.76;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr04 4415603 . A T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.76;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr04 4483631 . A C 21.81 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.95;MQ0=10;MQRankSum=2.516;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,3:31:6:61,6,0 Chr04 4483632 . G T 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3302;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.95;MQ0=10;MQRankSum=2.821;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,4:31:9:98,9,0 Chr04 4525364 . C G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=14.4438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:58:58,0,290 Chr04 4525371 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;DP=14;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=13.5771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=2.41;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:62:62,0,304 Chr04 4536244 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 4539819 . C G 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.663;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.55;MQ0=17;MQRankSum=2.663;QD=1.48;ReadPosRankSum=2.663 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:35,3:38:9:84,9,0 Chr04 4539826 . T C 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.47;MQ0=18;MQRankSum=-2.218;QD=1.41;ReadPosRankSum=2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,32:40:9:84,9,0 Chr04 4586760 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.46;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=10.38;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:132,0,137 Chr04 4587278 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.76;MQ0=0;MQRankSum=-2.621;QD=2.60;ReadPosRankSum=-3.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:75:75,0,278 Chr04 4594271 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 4598933 . T C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.17;MQ0=0;QD=13.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:83,9,0 Chr04 4635339 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 4654953 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 4657399 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.363;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:52:52,0,1102 Chr04 4719934 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.95;MQ0=58;QD=0.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:6:78,6,0 Chr04 4719945 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.25;MQ0=46;QD=1.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:6:82,6,0 Chr04 4719947 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.25;MQ0=46;QD=1.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:6:82,6,0 Chr04 4824674 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 4824693 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 4824700 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 4853688 . A G 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.66;MQ0=1;QD=3.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:9:98,9,0 Chr04 4853695 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.66;MQ0=1;QD=3.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:9:95,9,0 Chr04 4928999 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 4929013 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 4951509 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 4959121 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 4959170 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 4982487 . G C 190.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.11;MQ0=6;QD=15.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:18:219,18,0 Chr04 4987822 . C G 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.092;QD=10.29;ReadPosRankSum=0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:162,0,282 Chr04 5025400 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 5025770 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5046818 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 5060760 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 5060762 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 5060770 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 5071683 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 5071696 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 5071712 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 5081629 . A G 80.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.43;MQ0=0;QD=13.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:108,12,0 Chr04 5103073 . C T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr04 5108594 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 5166424 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 5169164 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 5169329 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5169345 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5223633 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 5223882 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 5240080 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 5240384 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr04 5240400 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 5241285 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 5241309 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr04 5241312 . A C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 5241495 . G T 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.461;DP=12;Dels=0.00;FS=15.563;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:174,0,248 Chr04 5242373 . G C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr04 5395382 . G T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr04 5395391 . G A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr04 5395417 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr04 5482599 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:6:61:61,0,109 Chr04 5498622 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:92:92,0,102 Chr04 5501595 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 5502521 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 5589795 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 5590253 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5593691 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.37;MQ0=0;QD=1.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:51,6,0 Chr04 5593824 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 5593834 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 5616633 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr04 5616692 . C T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr04 5616708 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 5622134 . T C 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr04 5629552 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 5671089 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5700111 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 5700207 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 5700255 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 5722351 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr04 5733400 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr04 5743749 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 5743994 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:64,0,30 Chr04 5768942 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 5807612 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 5814192 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 5814758 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 5884899 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.47;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 5885688 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 5885694 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 5885711 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 5885745 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 5886289 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr04 5888619 . T G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr04 5888632 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr04 5888640 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr04 5963374 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 6001260 . G T 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.69;MQ0=2;MQRankSum=2.053;QD=1.03;ReadPosRankSum=-2.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,2:27:30:56,0,30 Chr04 6034006 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 6062543 . G A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:50:88,0,50 Chr04 6112145 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 6204271 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 6265733 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 6317177 . T G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.75;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr04 6317202 . G A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.75;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr04 6334546 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.85;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:30:67,0,30 Chr04 6357562 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 6501035 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.89;MQ0=6;MQRankSum=1.606;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:42:71,0,42 Chr04 6699873 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 6700027 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 6700029 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 6703772 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 6772673 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 6772675 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 6772677 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 6778161 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 6778203 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 6778220 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 6780404 . C A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr04 6810069 . G T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:108,0,407 Chr04 6810751 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.71;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:157,0,202 Chr04 6811785 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 6812397 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 6911568 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr04 6911576 . T A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr04 6911580 . G T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr04 6911596 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr04 6936681 . C G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr04 6936708 . C T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr04 6978614 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 6978626 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 6978876 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr04 6978880 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 6978925 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 6978943 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 7007560 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 7007602 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 7008213 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 7008232 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 7037331 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 7076832 . G T 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:137,0,26 Chr04 7086414 . C T 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.30;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr04 7086458 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 7086466 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 7100605 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 7310141 . C A 31.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.623;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.460;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:115,0,1193 Chr04 7758656 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,357 Chr04 7761189 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,69 Chr04 7828731 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 7829693 . G T 192.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 7920281 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 7920290 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 7940376 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 7940403 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 7945079 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 7945350 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 7984695 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 7984739 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 7984947 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 7996674 . T A 78.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 8047995 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 8047999 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 8048015 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 8048018 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 8048021 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.34;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 8083786 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 8105327 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 8105854 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr04 8114256 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:78,6,0 Chr04 8115531 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 8122241 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 8292484 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:106,0,105 Chr04 8296643 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 8298459 . T A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:160,12,0 Chr04 8298953 . A T 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 8340509 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 8430105 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:69:69,0,401 Chr04 8514966 . C T 79.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:108,0,26 Chr04 8514968 . A G 80.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:109,0,27 Chr04 8515389 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 8565447 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 8579014 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr04 8592193 . C A 73.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.48;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15:102,0,15 Chr04 8593561 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 8593622 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 8593814 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 8593835 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 8593837 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 8593861 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.43;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:63,6,0 Chr04 8593864 . C G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.43;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:63,6,0 Chr04 8593868 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.43;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:63,6,0 Chr04 8595213 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.82;MQ0=6;MQRankSum=2.498;QD=1.31;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:74:74,0,228 Chr04 8595278 . C A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.4472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.79;MQ0=4;MQRankSum=2.399;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:99:155,0,124 Chr04 8595288 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.48;MQ0=3;MQRankSum=1.246;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:61:61,0,122 Chr04 8595386 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.659;DP=19;Dels=0.00;FS=15.611;HaplotypeScore=3.9780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.60;MQ0=1;MQRankSum=-0.592;QD=1.67;ReadPosRankSum=2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:60:60,0,386 Chr04 8595394 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;DP=20;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.39;MQ0=1;MQRankSum=-0.727;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.957 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:57:57,0,421 Chr04 8595602 . T C 196.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.87;MQ0=0;QD=24.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:225,18,0 Chr04 8596282 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.38;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:32:73,0,32 Chr04 8600414 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.102;DP=27;Dels=0.00;FS=2.626;HaplotypeScore=3.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.04;MQ0=1;MQRankSum=2.096;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:82:82,0,742 Chr04 8601513 . T A 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.03;MQ0=8;MQRankSum=1.583;QD=1.23;ReadPosRankSum=-1.432 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,24:31:9:66,9,0 Chr04 8601520 . A T 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.03;MQ0=8;QD=1.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:9:66,9,0 Chr04 8601529 . T A 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.724;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.03;MQ0=8;MQRankSum=2.246;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.092 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,13:31:9:66,9,0 Chr04 8601560 . T C 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.816;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.03;MQ0=8;MQRankSum=2.185;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,13:31:9:66,9,0 Chr04 8603282 . C T 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.68;MQ0=30;MQRankSum=3.034;QD=2.09;ReadPosRankSum=1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:34,10:44:15:120,15,0 Chr04 8603299 . A C 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.667;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.91;MQ0=6;MQRankSum=2.933;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,5:20:15:120,15,0 Chr04 8603313 . T C 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.27;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:15:120,15,0 Chr04 8603317 . C T 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.27;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:15:120,15,0 Chr04 8603323 . C A 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.27;MQ0=5;QD=5.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:17:15:120,15,0 Chr04 8603332 . T G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.579;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.73;MQ0=5;MQRankSum=-0.579;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,16:17:12:99,12,0 Chr04 8604496 . G T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.99;MQ0=10;QD=2.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,2:12:6:53,6,0 Chr04 8604510 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.99;MQ0=10;QD=2.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:53,6,0 Chr04 8604525 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.99;MQ0=10;QD=2.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:53,6,0 Chr04 8619146 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,133 Chr04 8666281 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 8666313 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 8668007 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 8688119 . T C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.82;MQ0=0;QD=23.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:147,12,0 Chr04 8697954 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 8699961 . C T 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.31;MQ0=22;QD=2.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,6:25:9:86,9,0 Chr04 8699974 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.31;MQ0=22;QD=2.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,6:25:9:86,9,0 Chr04 8761528 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 8835726 . A T 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=7.92;ReadPosRankSum=1.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:26:147,0,26 Chr04 8835727 . C G 121.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=8.12;ReadPosRankSum=0.579 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:26:150,0,26 Chr04 8858728 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 8874459 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr04 8874471 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr04 8874483 . A C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr04 8874494 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 8874516 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 8874524 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 8874525 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 8921828 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.95;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 8948340 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 8948345 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 8967581 . C A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=27;Dels=0.00;FS=13.278;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.342;QD=3.03;ReadPosRankSum=-2.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:110,0,793 Chr04 8971948 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 8976185 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr04 8976237 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 8996705 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.071;QD=0.92;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:40:65:65,0,1213 Chr04 9139051 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 9139063 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 9139079 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9139488 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 9141155 . T A 101.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=20.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:130,0,26 Chr04 9250999 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 9251568 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr04 9260134 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr04 9284899 . T A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 9358548 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 9361673 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 9361692 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 9361702 . A C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.99;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr04 9361725 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.99;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 9361764 . T G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.99;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr04 9390343 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 9406525 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 9406542 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 9407818 . G A 191.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=31.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:220,18,0 Chr04 9407835 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr04 9407852 . A G 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=33.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 Chr04 9407853 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.21;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr04 9432806 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9443656 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 9443680 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 9472085 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 9472093 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 9472129 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 9497620 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr04 9569297 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr04 9570003 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:92:92,0,138 Chr04 9580861 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 9580891 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 9580920 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9589026 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 9589055 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9589091 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9695598 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr04 9700553 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9700570 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9700583 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9700640 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 9728444 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.289;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=2.17;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:113,0,1246 Chr04 9766959 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,483 Chr04 9767056 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.82;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:78:78,0,273 Chr04 9911299 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.156;DP=39;Dels=0.00;FS=29.117;HaplotypeScore=2.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.274;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:39:85:85,0,1174 Chr04 9944187 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 9982270 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.21;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr04 10059035 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr04 10059064 . T A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.50;MQ0=0;QD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:86,9,0 Chr04 10068506 . C T 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:65,0,28 Chr04 10101758 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,263 Chr04 10109844 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 10109910 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 10152689 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 10214205 . C T 149.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.36;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:178,15,0 Chr04 10241070 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 10242217 . C T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9963;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr04 10256139 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 10271397 . G T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr04 10271458 . T G 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr04 10271463 . G A 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 Chr04 10313502 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 10313508 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 10322471 . T A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr04 10322479 . C G 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr04 10322484 . T C 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=40.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 Chr04 10322527 . A T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr04 10333565 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 10333583 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 10362221 . G T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.31;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:166,0,132 Chr04 10384334 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 10387860 . C T 53.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 10490656 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.24;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 10490658 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.24;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 10490676 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.24;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 10531507 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 10531577 . G A 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr04 10819980 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=3.76;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:96:96,0,521 Chr04 10823801 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 10823915 . A G 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr04 10826777 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 10830261 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 10863262 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 10983645 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 11068070 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 11068079 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 11096735 . C T 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 11144272 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 11144277 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 11149952 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr04 11172703 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 11182701 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 11182750 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 11222309 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 11275093 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 11294207 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 11294211 . T G 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr04 11482770 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 11667393 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.876;QD=2.54;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:102,0,869 Chr04 11669411 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr04 11690248 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 11703729 . C T 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.75;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr04 11703748 . T C 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.75;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr04 11703776 . C T 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.75;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr04 11770712 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.73;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 12145510 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 12466098 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 12572557 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.07;MQ0=0;MQRankSum=2.166;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:98:98,0,102 Chr04 12572642 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:136,0,64 Chr04 12572792 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 12608063 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:96,0,93 Chr04 12698237 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr04 12827481 . C A 291.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;DP=63;Dels=0.00;FS=42.124;HaplotypeScore=5.4661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=2.424;QD=4.63;ReadPosRankSum=-5.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,12:63:99:320,0,1150 Chr04 13016399 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 13016406 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,255 Chr04 13099542 . A T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,178 Chr04 13205217 . G T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=21;Dels=0.00;FS=13.457;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=3.262;QD=4.27;ReadPosRankSum=-3.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:118,0,567 Chr04 13358708 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr04 13414435 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.180;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.347;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:52:52,0,1128 Chr04 13461292 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.936;DP=43;Dels=0.00;FS=33.188;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:58:58,0,1398 Chr04 13553000 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:77,6,0 Chr04 13555386 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 13557984 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr04 13661212 . C A 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.713;QD=4.07;ReadPosRankSum=-4.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:187,0,1154 Chr04 13805885 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 13839693 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.05;MQ0=1;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:63,6,0 Chr04 13866372 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.49;MQ0=36;MQRankSum=2.003;QD=0.76;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,2:47:52:64,0,52 Chr04 13883905 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:50,6,0 Chr04 13883939 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 13883940 . C A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 13883989 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.65;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 13960995 . A C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13960999 . T C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961002 . A G 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961007 . C A 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961030 . G A 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961034 . C T 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961049 . G T 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961054 . G C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 13961059 . C T 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.67;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr04 14100052 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 14190667 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.311;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.0528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.84;MQ0=0;MQRankSum=3.441;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,6:52:99:100,0,1418 Chr04 14204075 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:101,0,29 Chr04 14212913 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:50,0,30 Chr04 14228196 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 14228258 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 14228287 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 14237021 . C A 268.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.466;DP=13;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=20.67;ReadPosRankSum=-2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:297,0,100 Chr04 14344931 . C G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,229 Chr04 14376980 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,150 Chr04 14474506 . G T 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.758;DP=56;Dels=0.00;FS=29.587;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.246;QD=1.98;ReadPosRankSum=-4.507 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,8:56:99:139,0,1759 Chr04 14672778 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 14797572 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 15009863 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 15094915 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr04 15094986 . T G 20.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:49,0,30 Chr04 15367028 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.78;MQ0=1;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:67,6,0 Chr04 15391584 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.04;MQ0=4;MQRankSum=0.922;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:33:65,0,33 Chr04 15641803 . G T 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr04 15908837 . A G 186.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.337;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.52;MQ0=1;MQRankSum=-0.818;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:215,0,153 Chr04 15916172 . G T 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.41;MQ0=13;QD=3.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,6:17:9:88,9,0 Chr04 16020348 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 16059658 . G A 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr04 16067040 . C T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.655;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=20.7769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.66;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,10:64:99:147,0,1417 Chr04 16145141 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 16489988 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 16489990 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 16494489 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 16494490 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.67;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 16494524 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr04 16495310 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:53:137,0,53 Chr04 16495388 . C T 281.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.13;MQ0=0;QD=25.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:310,24,0 Chr04 16495392 . C T 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.13;MQ0=0;QD=30.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 Chr04 16496345 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:95,0,69 Chr04 16496365 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:93,0,100 Chr04 16496366 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=10.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:84:93,0,84 Chr04 16496367 . A T 70.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.81;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:18:99,0,18 Chr04 16496857 . A C 99.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.10;MQ0=0;QD=4.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:12:127,12,0 Chr04 16525014 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=3;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr04 16636886 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr04 16743623 . G C 99.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=19.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:128,15,0 Chr04 16755139 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 16928820 . T A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 17337835 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.20;MQ0=1;MQRankSum=-5.504;QD=1.75;ReadPosRankSum=3.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,13:62:99:137,0,1681 Chr04 17337886 . A G 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;DP=38;Dels=0.00;FS=1.868;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.796;QD=3.23;ReadPosRankSum=-4.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,11:38:99:151,0,952 Chr04 17385196 . G A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=4;MQRankSum=-2.996;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:119,0,473 Chr04 17563326 . C T 25.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:54,0,27 Chr04 17623507 . A T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=7.48;ReadPosRankSum=-0.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:133,0,330 Chr04 17623519 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:80:80,0,389 Chr04 17623558 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:75:75,0,385 Chr04 17820392 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 17961782 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr04 18004388 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 18004390 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 18083147 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 18094380 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.66;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 18107105 . C T 24.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.51;MQ0=1;MQRankSum=-1.203;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,13:14:21:53,0,21 Chr04 18107108 . C A 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.51;MQ0=1;QD=4.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:92,9,0 Chr04 18122103 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18139689 . G A 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 Chr04 18201281 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr04 18203603 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.02;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr04 18206392 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 18206397 . G T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr04 18218715 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 18218994 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 18222874 . A T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr04 18222909 . C T 263.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:292,21,0 Chr04 18236453 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18236473 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 18236488 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 18241187 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 18265903 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 18265911 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 18265923 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 18281255 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18309577 . G A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.03;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr04 18340097 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 18357992 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.46;MQ0=3;QD=4.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:6:59,6,0 Chr04 18394843 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18394848 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 18426035 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.66;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:64,6,0 Chr04 18532459 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 18532523 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 18548107 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18548120 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 18563061 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 18592699 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 18592795 . A G 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr04 18661239 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr04 18670135 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.29;MQ0=4;QD=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:49,6,0 Chr04 18701429 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 18708205 . T A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;DP=38;Dels=0.00;FS=12.135;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.605;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:79:79,0,1166 Chr04 18712240 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 18758849 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 18758916 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 18842424 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 18845464 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 18881688 . G C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.08;MQ0=3;QD=7.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:63,6,0 Chr04 18883175 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr04 18891584 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 18892304 . C T 305.31 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.10;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.771 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,17:18:1:331,0,1 Chr04 18894531 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 18894554 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 18907182 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 18907253 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.44;MQ0=1;MQRankSum=-2.393;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,42:44:59:59,0,64 Chr04 18907367 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 18937069 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=2;QD=11.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:75,6,0 Chr04 19002690 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.30;MQ0=6;MQRankSum=0.566;QD=3.87;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:94:94,0,130 Chr04 19029990 . G T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.52;MQ0=1;QD=16.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:92,9,0 Chr04 19055414 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 19084926 . G A 107.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:136,0,23 Chr04 19084941 . G T 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:141,0,27 Chr04 19085036 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.69;MQ0=15;MQRankSum=0.736;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,2:18:6:77,6,0 Chr04 19085041 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=15;QD=2.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:6:77,6,0 Chr04 19085074 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 19087618 . C T 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.30;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:114,12,0 Chr04 19087639 . C T 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:68,0,25 Chr04 19091748 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 19091758 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 19138964 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 19147034 . T C 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.47;MQ0=20;QD=2.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,29:32:12:123,12,0 Chr04 19157902 . T C 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr04 19158040 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 19158100 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 19172243 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 19179859 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 19193481 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 19193510 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 19223612 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 19223619 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 19227687 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 19227732 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 19443703 . G T 25.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.60;MQ0=16;MQRankSum=0.736;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,2:19:22:54,0,22 Chr04 19443809 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.60;MQ0=14;MQRankSum=0.736;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:83,6,0 Chr04 19443870 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 19491895 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.24;MQ0=0;MQRankSum=1.268;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:52:52,0,257 Chr04 19495913 . C G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr04 19607972 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 19674992 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:71,0,29 Chr04 19674993 . T C 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr04 19674995 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:71,0,30 Chr04 19691988 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 19691994 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 19692052 . G A 135.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.98;MQ0=0;QD=22.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:164,18,0 Chr04 19716062 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 19716088 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 19723160 . G A 124.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 20036067 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:66,6,0 Chr04 20041904 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 20072901 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 20072917 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 20074616 . A G 477.77 . 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G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.97;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 Chr04 20092437 . A C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.97;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 Chr04 20092442 . C A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.97;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 Chr04 20092476 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.97;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 Chr04 20092779 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.37;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 20092784 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.37;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 20159427 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.053;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.61;MQ0=3;MQRankSum=-1.953;QD=1.31;ReadPosRankSum=1.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,24:28:38:65,0,38 Chr04 20159431 . C A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.36;MQ0=3;QD=0.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:50,6,0 Chr04 20160245 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 20160266 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 20160269 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.69;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 20214327 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 20216107 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 20216115 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 20245234 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 20245254 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 20245257 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 20305558 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 20523503 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.03;MQ0=4;MQRankSum=-0.550;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:72:72,0,75 Chr04 20592198 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 20593445 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.81;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr04 20593473 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.81;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr04 20593534 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.12;MQ0=42;QD=0.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,14:44:6:57,6,0 Chr04 20616017 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 20635312 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 20635326 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 20706898 . A G 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr04 20713351 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.80;MQ0=12;QD=1.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:64,6,0 Chr04 20752646 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.10;MQ0=0;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr04 20752657 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.10;MQ0=0;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr04 20757353 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.58;MQ0=11;MQRankSum=-0.736;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,16:17:33:51,0,33 Chr04 20816084 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 20816143 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 20816154 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 20817383 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.36;MQ0=5;QD=4.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:59,6,0 Chr04 20844713 . T C 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr04 20914771 . T G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 21007880 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.40;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 21007905 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.40;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 21040432 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 21086118 . T G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.23;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 21088189 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.69;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 21195648 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 21195655 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 21200784 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 21266850 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.10;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 21266877 . G C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.10;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 21508639 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 21509967 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,184 Chr04 21591133 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 21604349 . C A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:53:141,0,53 Chr04 21640713 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 21658984 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.301;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=2.00;ReadPosRankSum=-4.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,7:48:99:124,0,1507 Chr04 21665914 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 21686543 . A G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.664;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:85:85,0,343 Chr04 21736493 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 21777969 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.24;MQ0=0;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:65,6,0 Chr04 21842347 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.210;DP=31;Dels=0.00;FS=2.599;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:58:58,0,985 Chr04 21842443 . C A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr04 21842448 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 21842535 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 21842870 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 21848031 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,670 Chr04 21872846 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 21872847 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 21872906 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 21874570 . A T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.98;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr04 21904606 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.88;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,253 Chr04 21904686 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;DP=26;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.959;QD=1.68;ReadPosRankSum=-2.878 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:72:72,0,775 Chr04 21944228 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 21944232 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 21944235 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 21946081 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 21992834 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.40;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:55,6,0 Chr04 21992843 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.40;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.62;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:55,6,0 Chr04 22534242 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.31;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr04 22590650 . C G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.34;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:51,6,0 Chr04 22590661 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.34;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:51,6,0 Chr04 22678177 . T G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3618;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.30;MQ0=0;QD=21.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:112,9,0 Chr04 22678217 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 22683194 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 22691655 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.61;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr04 22691699 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 22783135 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.25;MQ0=5;MQRankSum=0.727;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:9:86,9,0 Chr04 22783145 . G A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.25;MQ0=5;MQRankSum=0.727;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:9:86,9,0 Chr04 22784730 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.91;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 22843249 . G A 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:118,15,0 Chr04 22843266 . C T 89.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=17.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:118,15,0 Chr04 22887381 . T G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 22887401 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 22887404 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 22892917 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 22932828 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 23010702 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 23010732 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 23010771 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 23077231 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 23077416 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 23082563 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 23095624 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 23095640 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 23095641 . A C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 23096319 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.36;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 23103626 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.39;MQ0=10;QD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:6:55,6,0 Chr04 23103668 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.39;MQ0=10;QD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,2:12:6:55,6,0 Chr04 23157212 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.087;DP=57;Dels=0.00;FS=8.228;HaplotypeScore=3.9953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.24;MQ0=10;MQRankSum=0.983;QD=0.40;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,5:57:51:51,0,1281 Chr04 23157856 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 23205804 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.67;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 23323455 . G C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.50;MQ0=2;QD=1.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:51,6,0 Chr04 23345236 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 23363906 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 23363915 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 23363938 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 23363958 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 23420237 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.766;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.43;MQ0=0;MQRankSum=2.729;QD=1.30;ReadPosRankSum=-2.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,3:26:62:62,0,145 Chr04 23451281 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 23451285 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 23451335 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 23452928 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.33;MQ0=0;QD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:65,9,0 Chr04 23452933 . T C 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.33;MQ0=0;QD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:65,9,0 Chr04 23452937 . C G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.33;MQ0=0;QD=1.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:65,9,0 Chr04 23469617 . A C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 23469637 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr04 23469651 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 23469653 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 23469654 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 23489453 . G C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr04 23682408 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 23682416 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr04 23683951 . C T 67.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.66;MQ0=0;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:95,12,0 Chr04 23683972 . G A 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.66;MQ0=0;QD=9.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:65,9,0 Chr04 23684014 . G A 70.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.66;MQ0=0;QD=17.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:98,12,0 Chr04 23826027 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.10;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr04 23849218 . G C 53.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.25;MQ0=0;QD=22.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:116,12,0 Chr04 24129495 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 24129530 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 24129550 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 24129580 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 24137163 . C T 166.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.14;MQ0=4;QD=12.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:27:195,27,0 Chr04 24137184 . T C 166.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.14;MQ0=4;QD=12.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:27:195,27,0 Chr04 24137191 . C T 166.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.14;MQ0=4;QD=12.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:27:195,27,0 Chr04 24137196 . C T 166.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.14;MQ0=4;QD=12.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,9:13:27:195,27,0 Chr04 24137205 . A G 166.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.14;MQ0=4;QD=12.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:27:195,27,0 Chr04 24139179 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 24139192 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 24139209 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 24139238 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 24293770 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 24293800 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 24335748 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 24354334 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 24357878 . T C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr04 24357903 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr04 24357954 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 24370331 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 24370337 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 24370713 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 24375223 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 24375231 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 24375265 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 24407955 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 24412696 . G A 43.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.25;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:72,0,16 Chr04 24426822 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr04 24439841 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 24583458 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr04 24666210 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;DP=15;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,432 Chr04 24676293 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,107 Chr04 24703119 . T A 51.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 24931519 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 24963381 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr04 25071237 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 25165076 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr04 25181781 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.82;MQ0=0;QD=0.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:6:49,6,0 Chr04 25207903 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.99;MQ0=2;MQRankSum=0.742;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,8:9:9:114,9,0 Chr04 25229103 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr04 25258938 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 25283183 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 25289191 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 25290203 . A T 329.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;DP=53;Dels=0.00;FS=24.874;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.147;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.444 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,13:53:99:358,0,1462 Chr04 25377115 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 25377124 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 25397110 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 25397133 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 25397156 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 25397670 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 25429307 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 25429329 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 25429336 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 25476556 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 25613214 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr04 25613215 . A C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr04 25651685 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr04 25652082 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,177 Chr04 25688792 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=1;QD=8.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:77,6,0 Chr04 25725856 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 25725859 . A C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 25748064 . G T 145.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:174,0,22 Chr04 25789510 . A T 39.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:17:68,0,17 Chr04 25792321 . G T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr04 25792335 . G C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr04 25793262 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 25794768 . T C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr04 25830194 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 25984122 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.70;MQ0=0;QD=8.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 Chr04 25984158 . G T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.70;MQ0=0;QD=8.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:53,6,0 Chr04 26020960 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 26020965 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 26020971 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 26050162 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 26126054 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 26126094 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.85;MQ0=4;QD=13.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:123,9,0 Chr04 26152892 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.12;MQ0=8;MQRankSum=0.803;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.161 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,14:37:6:59,6,0 Chr04 26158414 . A G 52.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 26308602 . A T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr04 26342481 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 26377923 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 26377971 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 26378053 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 26378095 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 26487975 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 26543093 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 26557933 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr04 26559379 . G T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr04 26559407 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 26566199 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.10;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 26579435 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.58;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 26579518 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.58;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 26584456 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 26643561 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,165 Chr04 26644060 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 26644117 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 26644138 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 26821074 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 26856177 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.12;MQ0=0;QD=6.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:70,6,0 Chr04 26856220 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.12;MQ0=0;QD=5.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:68,6,0 Chr04 27028074 . C G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=11.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:40:107,0,40 Chr04 27028085 . G A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.76;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:7:42:89,0,42 Chr04 27097090 . A C 262.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:291,24,0 Chr04 27097091 . G C 264.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:293,24,0 Chr04 27097103 . C T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:100,0,176 Chr04 27097112 . C T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,177 Chr04 27097114 . G A 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:181,0,101 Chr04 27097125 . A G 302.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:331,24,0 Chr04 27097130 . A C 300.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:329,24,0 Chr04 27177365 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 27177380 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 27177385 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 27177393 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 27177394 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 27177409 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 27183274 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr04 27183289 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr04 27183388 . C T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=13.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:67:109,0,67 Chr04 27183410 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:137,0,59 Chr04 27192161 . G C 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.30;MQ0=3;QD=10.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:91,9,0 Chr04 27192168 . T G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.89;MQ0=3;QD=5.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:56,6,0 Chr04 27276762 . A G 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.13;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr04 27276771 . G T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.13;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr04 27278490 . A C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.48;MQ0=0;QD=5.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:53,6,0 Chr04 27278514 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.52;MQ0=10;QD=1.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:53,6,0 Chr04 27278553 . G C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.56;MQ0=10;MQRankSum=2.604;QD=1.03;ReadPosRankSum=-2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,12:25:6:53,6,0 Chr04 27278634 . A T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.72;MQ0=1;QD=1.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,26:27:9:80,9,0 Chr04 27278667 . C T 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=1.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:26:9:78,9,0 Chr04 27278682 . T C 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=1.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:9:69,9,0 Chr04 27278757 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=20;Dels=0.00;FS=22.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.87;MQ0=9;MQRankSum=-2.262;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,12:20:59:59,0,298 Chr04 27360646 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr04 27360669 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 27361817 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 27362491 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.339;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQ0=0;MQRankSum=2.287;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:84:84,0,1149 Chr04 27393137 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 27393167 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 27393205 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 27416458 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 27420278 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 27451248 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.69;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:59,0,50 Chr04 27451279 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.29;MQ0=1;MQRankSum=-1.733;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:50:50,0,61 Chr04 27472377 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:71,0,28 Chr04 27500381 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr04 27500443 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr04 27500452 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr04 27546931 . T G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr04 27546940 . G A 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:68,0,25 Chr04 27546945 . T G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr04 27546946 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr04 27547181 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,166 Chr04 27547192 . G A 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:259,0,171 Chr04 27547301 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr04 27564138 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 27618563 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 27658467 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 27664373 . C T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.37;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr04 27690632 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 27741431 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 27743896 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 27908673 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.23;MQ0=10;MQRankSum=-2.933;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,23:31:65:65,0,257 Chr04 27908788 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 27908825 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 27914127 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 27916254 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.59;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:62,6,0 Chr04 27916288 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr04 27945353 . C A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:171,0,58 Chr04 27955878 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,127 Chr04 27995489 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 28005961 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 28087469 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 28162269 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 28162285 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 28232756 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 28236784 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 28291669 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 28291680 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 28291736 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.61;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 28306461 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 28324487 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 28343060 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr04 28384721 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.663;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.278;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:58:58,0,91 Chr04 28396630 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr04 28409673 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 28412441 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,673 Chr04 28415527 . T A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=18.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:142,0,62 Chr04 28416814 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 28492429 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 28506734 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 28515585 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 28574760 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 28574774 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 28636327 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.653;DP=68;Dels=0.00;FS=25.666;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=0.61;ReadPosRankSum=-4.319 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,7:68:70:70,0,2309 Chr04 28682159 . A G 72.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.58;MQ0=3;QD=8.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:100,12,0 Chr04 28725881 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:78:78,0,291 Chr04 28726309 . A G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr04 28759436 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:50:50,0,187 Chr04 28761526 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.850;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9658;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.76;MQ0=1;MQRankSum=2.950;QD=3.40;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:22:99:103,0,370 Chr04 28770858 . G A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.679;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.976;QD=1.61;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:78:78,0,1007 Chr04 28781798 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 28823298 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 28823314 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 28823315 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 28824989 . T G 157.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:186,15,0 Chr04 28916502 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29032977 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 29034314 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 29118405 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 29176788 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 29176890 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29183003 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29183416 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 29185355 . T A 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr04 29189782 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.63;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 29199392 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 29199432 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 29199441 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 29199458 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 29222361 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 29365208 . A T 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.36;MQ0=0;QD=18.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:118,12,0 Chr04 29365290 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 29369337 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 29369381 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 29370346 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29370378 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 29384439 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:61,0,32 Chr04 29394342 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.37;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr04 29449236 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 29449634 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 29450370 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 29594480 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=13;QD=2.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:67,6,0 Chr04 29594483 . G T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=13;QD=2.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:67,6,0 Chr04 29594490 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.59;MQ0=13;QD=2.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:67,6,0 Chr04 29608827 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29608886 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 29640315 . C T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.35;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 29640319 . G T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.35;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr04 29674049 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29674086 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29721496 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29732506 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:69,0,29 Chr04 29737523 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.82;MQ0=1;QD=10.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:60,6,0 Chr04 29749757 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=10.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:91:91,0,99 Chr04 29749850 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.850;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=2.74;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:72:72,0,366 Chr04 29755485 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 29755514 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 29778022 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 29821824 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1557;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.08;MQ0=7;MQRankSum=3.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.209 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,4:28:12:154,12,0 Chr04 29879624 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr04 29908368 . T C 172.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:201,18,0 Chr04 29941808 . T G 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;DP=40;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.78;MQ0=24;MQRankSum=-2.657;QD=2.92;ReadPosRankSum=2.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:145,0,134 Chr04 29988795 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.67;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 29990486 . G A 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr04 29995132 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 29995157 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 29995222 . A T 99.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.58;MQ0=14;QD=5.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:127,12,0 Chr04 30071185 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;DP=39;Dels=0.00;FS=17.065;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.795;QD=2.22;ReadPosRankSum=-3.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:115,0,1116 Chr04 30075442 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:135,0,58 Chr04 30087424 . T G 126.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 30232289 . T G 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:125,0,163 Chr04 30232422 . T G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr04 30232694 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.29;MQ0=1;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:89,9,0 Chr04 30232697 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.29;MQ0=1;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:89,9,0 Chr04 30284588 . G T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.36;MQ0=2;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:89,9,0 Chr04 30327100 . C T 84.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.82;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:21:113,0,21 Chr04 30343690 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.12;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 30343697 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.843;DP=51;Dels=0.00;FS=8.900;HaplotypeScore=3.9949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.23;MQ0=1;MQRankSum=-0.097;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,5:51:56:56,0,717 Chr04 30355143 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 30355174 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 30398698 . G T 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.04;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:91,9,0 Chr04 30398745 . C T 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.81;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:91,9,0 Chr04 30532139 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 30553581 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.27;MQ0=2;MQRankSum=-1.231;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:66:66,0,110 Chr04 30560488 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 30578107 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 30578170 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 30578173 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 30587253 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.99;MQ0=1;QD=5.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:6:68,6,0 Chr04 30615370 . G A 43.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:72,0,18 Chr04 30615373 . C A 37.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:66,0,18 Chr04 30679623 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 30690141 . G T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.22;MQ0=2;QD=9.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:67,6,0 Chr04 30702941 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.67;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 30750668 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.76;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:71,0,30 Chr04 30781782 . T C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.32;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr04 30884538 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 30884540 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 30937515 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 30947534 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 30947546 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 31005056 . A G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.20;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 Chr04 31019078 . C T 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:111,12,0 Chr04 31019083 . C T 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:111,12,0 Chr04 31024328 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 31151825 . C A 23.84 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.73;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:19:52,0,19 Chr04 31172034 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.03;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 31219656 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 31259429 . A G 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.86;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr04 32016020 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 32036808 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 32037896 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 32079345 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 32079385 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 32079393 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 32129462 . G A 152.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:181,15,0 Chr04 32135463 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 32220014 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 32220037 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 32222255 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 32282903 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 32282925 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 32292569 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 32347294 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 32347327 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.58;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=6.55;ReadPosRankSum=2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:126,9,0 Chr04 32425358 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 32538498 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 32581113 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.66;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 32581880 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:65,6,0 Chr04 32623143 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 32636790 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 32678875 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 32694920 . C A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 32694952 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 32694953 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 32695014 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr04 32697345 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 32730962 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 32736993 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr04 32752947 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr04 32795902 . A G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;DP=19;Dels=0.00;FS=29.863;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.464;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:123,0,443 Chr04 32795906 . A G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;DP=19;Dels=0.00;FS=27.433;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQ0=0;MQRankSum=-3.287;QD=3.30;ReadPosRankSum=-3.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:91:91,0,474 Chr04 32819114 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr04 32858996 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.22;MQ0=1;MQRankSum=-1.231;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:64:64,0,69 Chr04 32859032 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:62:64,0,62 Chr04 32859036 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:62:64,0,62 Chr04 32859044 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.11;MQ0=1;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:62:64,0,62 Chr04 32861166 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 33033018 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 33060852 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 33081213 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 33087812 . T C 94.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 33178506 . A T 505.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:534,39,0 Chr04 33265913 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 33269806 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 33269828 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 33310138 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 33338731 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,137 Chr04 33342216 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=98;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.57;MQ0=59;MQRankSum=-3.382;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,93:98:61:61,0,188 Chr04 33342279 . C T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.300;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:121,0,1127 Chr04 33342289 . C T 123.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr04 33525491 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.38;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 33525494 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.38;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 33775608 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 33775609 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 33775610 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 33909336 . C T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.86;MQ0=1;MQRankSum=-2.196;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,11:18:99:124,0,132 Chr04 33909338 . C T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.317;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.86;MQ0=1;MQRankSum=-0.732;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:124,0,132 Chr04 33909561 . T G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.24;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:90:90,0,677 Chr04 33909601 . G C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.127;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.7984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.24;MQ0=0;MQRankSum=-3.950;QD=2.03;ReadPosRankSum=0.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:87:87,0,745 Chr04 33947137 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.27;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:49,6,0 Chr04 34013856 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:83,6,0 Chr04 34013857 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=6.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:83,6,0 Chr04 34013873 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=5.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:80,6,0 Chr04 34013874 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=5.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:80,6,0 Chr04 34013892 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=5.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:79,6,0 Chr04 34013894 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.66;MQ0=0;QD=5.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:74,6,0 Chr04 34023767 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.02;MQ0=1;QD=20.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:111,9,0 Chr04 34023772 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.17;MQ0=1;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:165,12,0 Chr04 34097690 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.88;MQ0=12;MQRankSum=-1.026;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,2:16:62:65,0,62 Chr04 34179966 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 34191652 . G A 165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.267;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.756;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,13:91:99:194,0,2873 Chr04 34191656 . C T 170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.482;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.756;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.469 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,13:91:99:199,0,2878 Chr04 34191657 . A C 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.119;DP=91;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQ0=0;MQRankSum=-5.756;QD=1.83;ReadPosRankSum=2.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,13:91:99:195,0,2841 Chr04 34191668 . C T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQ0=0;MQRankSum=-4.229;QD=1.17;ReadPosRankSum=4.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,7:51:88:88,0,1634 Chr04 34191671 . T C 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.091;QD=2.67;ReadPosRankSum=4.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:127,0,1149 Chr04 34191673 . A T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.091;QD=2.67;ReadPosRankSum=4.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:127,0,1141 Chr04 34191675 . T C 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-4.091;QD=2.67;ReadPosRankSum=4.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:127,0,1137 Chr04 34191690 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.550;QD=0.96;ReadPosRankSum=3.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:61:61,0,1111 Chr04 34219111 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 34224652 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.79;MQ0=1;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:165,12,0 Chr04 34224661 . C T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.62;MQ0=3;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:157,12,0 Chr04 34224673 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=4;QD=17.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:167,12,0 Chr04 34304659 . A C 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.68;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr04 34390380 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 34484247 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 34568965 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 34611953 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 34611971 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 34611974 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 34611984 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr04 34664297 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 34710622 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 34720264 . T A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 34814473 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 34814534 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 35092620 . T C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.04;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr04 35246082 . C T 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=19.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:98:181,0,98 Chr04 35246408 . A C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr04 35246414 . C A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr04 35328250 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 35629486 . C A 237.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:266,21,0 Chr04 35665856 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 35674097 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:64:64,0,64 Chr04 35780414 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 35797827 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 36313033 . A G 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.895;DP=27;Dels=0.00;FS=1.983;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.554;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.146 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:99:154,0,689 Chr04 36370954 . C T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.083;DP=27;Dels=0.00;FS=28.543;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.31;MQ0=14;MQRankSum=-2.855;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.700 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,18:27:76:76,0,325 Chr04 36422720 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.14;MQ0=6;MQRankSum=2.003;QD=1.87;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:17:6:59,6,0 Chr04 36449490 . G T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.47;MQ0=5;QD=6.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:80,9,0 Chr04 36449577 . C A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr04 36570783 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr04 36615399 . T C 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;DP=21;Dels=0.00;FS=5.909;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQ0=2;MQRankSum=0.602;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:134,0,491 Chr04 36654621 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr04 36748278 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 36808260 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 37101987 . C G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.76;MQ0=2;MQRankSum=0.549;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:73:73,0,476 Chr04 37102040 . G A 128.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.011;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.04;MQ0=3;MQRankSum=3.707;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.181 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,7:33:18:157,18,0 Chr04 37238848 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.36;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 37266932 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 37267213 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=63;Dels=0.00;FS=18.103;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQ0=0;MQRankSum=1.411;QD=0.87;ReadPosRankSum=-4.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,7:63:83:83,0,2077 Chr04 37267292 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 37276002 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr04 37380458 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.053;DP=47;Dels=0.00;FS=22.529;HaplotypeScore=3.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.293;QD=0.57;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:55:55,0,1559 Chr04 37380536 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;DP=45;Dels=0.00;FS=11.752;HaplotypeScore=6.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.291;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:45:99:101,0,1373 Chr04 37391663 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 37447869 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 37516659 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.32;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:59,6,0 Chr04 37661159 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 37661170 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.74;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 37670734 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.547;DP=52;Dels=0.00;FS=27.370;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.287;QD=1.23;ReadPosRankSum=-3.914 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:92:92,0,1549 Chr04 37671406 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 37671501 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 37846716 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr04 37864142 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;DP=29;Dels=0.00;FS=2.456;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.285;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:72:72,0,881 Chr04 37910304 . G T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=11.71;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:157,0,208 Chr04 37948757 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 37948813 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 38128098 . C A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.889;DP=37;Dels=0.00;FS=27.238;HaplotypeScore=6.9977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.524;QD=3.67;ReadPosRankSum=-3.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:164,0,1091 Chr04 38131603 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,143 Chr04 38254819 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.88;MQ0=20;MQRankSum=1.026;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,2:24:49:65,0,49 Chr04 38304877 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 38390434 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 38390459 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 38390489 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 38409350 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 38409369 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.31;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 38409393 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 38432426 . C A 111.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:140,0,24 Chr04 38432894 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:98,0,64 Chr04 38432938 . T G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:108,0,69 Chr04 38434686 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 38436061 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=15;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:74:74,0,441 Chr04 38495941 . A G 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.39;MQ0=2;QD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:9:83,9,0 Chr04 38507660 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 38509523 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 38509543 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 38549397 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 38550263 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 38589789 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 38589830 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.80;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr04 38589847 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 38634678 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 38634693 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 38634695 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 38634724 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 38704227 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.41;MQ0=1;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr04 38704230 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.41;MQ0=1;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr04 38704250 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.41;MQ0=1;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr04 38722965 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:107,0,363 Chr04 38723051 . C A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=11.07;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:150,0,212 Chr04 38765541 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 38832464 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 38837805 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 38837807 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 38837846 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=31.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 38837863 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr04 38837869 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr04 38870553 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.67;MQ0=2;MQRankSum=1.532;QD=2.06;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:55:55,0,97 Chr04 38870568 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 38915142 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 39013802 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 39021698 . C A 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 Chr04 39021756 . T A 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 Chr04 39027584 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 39101819 . T G 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.02;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr04 39102985 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:52,0,32 Chr04 39117822 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;QD=5.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:73,6,0 Chr04 39117840 . A T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.22;MQ0=0;QD=3.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:63,6,0 Chr04 39118130 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 39188060 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 39220477 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 39221204 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 39288837 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:75,0,31 Chr04 39288847 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr04 39288852 . T G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr04 39288863 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 39288876 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr04 39324613 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 39327555 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 39357862 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:108,0,69 Chr04 39357872 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:108,0,69 Chr04 39363229 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 39366395 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 39372294 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 39372314 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 39392469 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,130 Chr04 39394918 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 39394919 . T A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr04 39394922 . A T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr04 39394948 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 39408354 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 39408378 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 39408379 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 39410057 . T A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr04 39410060 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:107,0,30 Chr04 39410061 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr04 39415029 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr04 39421340 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 39421358 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 39421382 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 39437992 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 39437997 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 39438021 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr04 39438043 . T C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.15;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr04 39438078 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.59;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:45:62,0,45 Chr04 39438082 . A C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.59;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:45:62,0,45 Chr04 39438107 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.43;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 39450010 . T C 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:136,0,65 Chr04 39450015 . A G 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:146,0,27 Chr04 39452017 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 39473184 . A C 156.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:185,0,24 Chr04 39500925 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 39500936 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 39500940 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 39500967 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,70 Chr04 39501014 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 39542511 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr04 39554073 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 39663727 . T C 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.42;MQ0=0;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:78,9,0 Chr04 39701068 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 39704956 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 39710130 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr04 39788661 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 39791592 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 39793661 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 39841498 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,112 Chr04 39841516 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr04 39866845 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 39889015 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 39911356 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 39911380 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 39915709 . C A 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:259,21,0 Chr04 39926518 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr04 39927289 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 39927297 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 39927382 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 39953975 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 39954021 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 39954043 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 39976844 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.93;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 39977277 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 39977304 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 39977318 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 39977341 . C G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr04 39997973 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 39997991 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 39998039 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 39998050 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 40000303 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 40105603 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 40120161 . C T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:151,0,26 Chr04 40140637 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,134 Chr04 40148216 . A G 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr04 40148218 . G A 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr04 40148242 . T G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr04 40149399 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40149761 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40153095 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr04 40153192 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr04 40183939 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 40188108 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.58;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40188112 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.58;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40207851 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr04 40227425 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 40233910 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 40235750 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40235994 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40241091 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 40247587 . C T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:99,0,102 Chr04 40261801 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40263426 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 40263439 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40263457 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40286751 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 40286783 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 40286784 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 40286789 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 40287410 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr04 40287457 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 40288454 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 40288459 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40288469 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40288472 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40288493 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40298889 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40298892 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40304945 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.703;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=2.15;ReadPosRankSum=3.823 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:39:99:112,0,1195 Chr04 40305130 . A T 69.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:98,0,21 Chr04 40305145 . A G 72.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:101,0,16 Chr04 40336375 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40384502 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 40384510 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 40384516 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 40384520 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 40384521 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 40384543 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 40385400 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 40385451 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 40416396 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40421712 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40421758 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40430388 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40430396 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40437552 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 40437566 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 40437601 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40437920 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 40437967 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 40438277 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr04 40438536 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 40459409 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40518604 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 40555153 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 40565786 . C G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.40;MQ0=1;MQRankSum=-1.380;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:59:59,0,149 Chr04 40565838 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-2.589;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:50:50,0,336 Chr04 40565841 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-2.589;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:50:50,0,320 Chr04 40565862 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.54;MQ0=1;MQRankSum=-2.589;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:50:50,0,325 Chr04 40594101 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 40603704 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 40608263 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40608266 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40608274 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40608280 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40608281 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40608306 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr04 40613603 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 40618345 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 40618361 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 40618362 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 40622850 . T C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr04 40631348 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 40753684 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,187 Chr04 40816848 . T G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,30:31:30:100,0,30 Chr04 40817620 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 40817637 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 40875195 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 40878804 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr04 40878830 . G T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:105,9,0 Chr04 40878836 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:108,9,0 Chr04 40893006 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 40907346 . T C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 40928903 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 40928912 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 40928977 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 40932278 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 40933964 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr04 40934847 . C A 330.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.92;MQ0=0;QD=25.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:359,39,0 Chr04 40968107 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr04 40968417 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 41006707 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 41025180 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 41025224 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41052020 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41079886 . G A 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr04 41090338 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41090348 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41091853 . C G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.709;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:69:69,0,511 Chr04 41091870 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.323;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.709;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:69:69,0,503 Chr04 41091908 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.709;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:63:63,0,464 Chr04 41116919 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 41145502 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 41158312 . G C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr04 41219177 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 41219197 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 41219214 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 41231325 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr04 41231613 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=30.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr04 41231674 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41231677 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 41231724 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 41233502 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;DP=35;Dels=0.00;FS=5.042;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.752;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:60:60,0,1196 Chr04 41233604 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;DP=85;Dels=0.00;FS=14.068;HaplotypeScore=5.8323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.716;QD=1.26;ReadPosRankSum=5.094 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,10:85:99:135,0,2672 Chr04 41233618 . T C 173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.924;DP=75;Dels=0.00;FS=21.450;HaplotypeScore=35.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:64,11:75:99:202,0,2358 Chr04 41233621 . T G 177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.856;DP=48;Dels=0.00;FS=49.683;HaplotypeScore=35.9277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=3.70;ReadPosRankSum=-2.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,9:48:99:206,0,1483 Chr04 41234258 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;DP=39;Dels=0.00;FS=5.352;HaplotypeScore=1.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.597;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,4:39:52:52,0,1330 Chr04 41306243 . G C 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr04 41306244 . C T 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr04 41306291 . A C 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr04 41306297 . A T 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.75;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr04 41306642 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 41306649 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 41306651 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 41306666 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 41306684 . C T 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr04 41367463 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr04 41406702 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr04 41413385 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 41416700 . A C 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr04 41417150 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr04 41417452 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41417458 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 41417531 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41457584 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.712;DP=31;Dels=0.00;FS=8.913;HaplotypeScore=2.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.316;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:95:95,0,963 Chr04 41484197 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41484929 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 41504862 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 41508559 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,178 Chr04 41517772 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,134 Chr04 41529834 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 41539613 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41540341 . G T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.07;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 41573985 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41581134 . A T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.077;DP=36;Dels=0.00;FS=60.185;HaplotypeScore=28.9966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=3.69;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:161,0,1111 Chr04 41583464 . G T 258.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:287,21,0 Chr04 41585768 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41585771 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41585779 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41585789 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41585793 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41585794 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41606204 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 41606221 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 41606226 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 41629201 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 41630179 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.71;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:80:80,0,287 Chr04 41630804 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 41640667 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41645876 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41645888 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41645895 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 41645904 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 41697962 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQ0=0;MQRankSum=-3.090;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:92:92,0,567 Chr04 41753212 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:50:131,0,50 Chr04 41781986 . G A 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr04 41789720 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 41789726 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 41789744 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 41798648 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41800382 . T C 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41809094 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 41813146 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 41813372 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41813394 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41813405 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41813411 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41813788 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 41813795 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr04 41815348 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 41817732 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 41820501 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 41840679 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 41946225 . C T 122.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:151,0,19 Chr04 41946237 . C T 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:145,0,26 Chr04 41946401 . C T 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=24.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:228,0,57 Chr04 41947967 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 41948004 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 41951985 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.4952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.57;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:30:68,0,30 Chr04 41974734 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,150 Chr04 41988590 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 41988598 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 41988607 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41988632 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 41989134 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 41989158 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42024908 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr04 42118501 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.15;MQ0=1;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:49,6,0 Chr04 42158997 . C A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr04 42168744 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.17;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 42168774 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42168780 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 42213383 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 42224790 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,248 Chr04 42246876 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42256114 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.87;MQ0=0;QD=18.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:103,9,0 Chr04 42257264 . G T 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:141,0,24 Chr04 42310354 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 42375679 . G T 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr04 42401534 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42403721 . A C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr04 42403753 . C T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr04 42403761 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr04 42410635 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr04 42410638 . T C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr04 42410665 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 42410673 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 42410674 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr04 42410680 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr04 42422301 . T G 193.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.07;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:222,18,0 Chr04 42432470 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.83;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 42440262 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42440554 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 42441659 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,329 Chr04 42445721 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42445722 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42445725 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 42453494 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:64,0,50 Chr04 42471287 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42471290 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42471324 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42483091 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 42483102 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 42483132 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 42483552 . C T 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.936;QD=10.13;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:170,0,215 Chr04 42483553 . C T 185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=13.27;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:214,0,227 Chr04 42485892 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 42496740 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr04 42498822 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42498891 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 42515409 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,255 Chr04 42515493 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,103 Chr04 42516372 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,298 Chr04 42526860 . T G 204.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=17.06;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:233,0,157 Chr04 42528162 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42528312 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42536823 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:152,12,0 Chr04 42537077 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 42549584 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,111 Chr04 42558932 . C T 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr04 42560132 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,303 Chr04 42560266 . C A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:150,0,66 Chr04 42567779 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 42583207 . T A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr04 42612598 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,99 Chr04 42619959 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr04 42645827 . T A 69.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:98,0,18 Chr04 42651864 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.16;MQ0=0;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:78,6,0 Chr04 42653421 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.85;MQ0=10;MQRankSum=-2.054;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,13:19:55:55,0,221 Chr04 42653429 . T G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.85;MQ0=10;MQRankSum=-1.589;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:19:56:56,0,223 Chr04 42653436 . T G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.10;MQ0=8;MQRankSum=-1.589;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:52:52,0,207 Chr04 42653450 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:8:57:57,0,189 Chr04 42653457 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,228 Chr04 42653461 . G C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,217 Chr04 42653463 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,218 Chr04 42653464 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,228 Chr04 42653474 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,224 Chr04 42679155 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.424;QD=1.90;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:106,0,1300 Chr04 42688741 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,195 Chr04 42690596 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 42692859 . T G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr04 42694561 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,254 Chr04 42699678 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:102,0,30 Chr04 42702069 . C T 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.57;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr04 42704765 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 42706782 . T G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr04 42711594 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:73:73,0,370 Chr04 42721653 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42743367 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42756708 . G T 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:4:6:77,6,0 Chr04 42756795 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,187 Chr04 42766751 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 42771633 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42771811 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 42782781 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42803503 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42809026 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,218 Chr04 42815457 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 42828508 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42841920 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr04 42841935 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 42841948 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 42842060 . T G 175.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=21.93;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:8:203,0,8 Chr04 42982524 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 42994261 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:72,0,60 Chr04 43000515 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 43055886 . G T 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=18.88;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:217,0,138 Chr04 43055945 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 43056873 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr04 43058138 . C A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:11:99:160,0,162 Chr04 43065598 . T G 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:141,0,27 Chr04 43076696 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr04 43090988 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 43099076 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr04 43099100 . T C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr04 43099120 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr04 43099124 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:123,9,0 Chr04 43099130 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:121,9,0 Chr04 43099138 . T G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.91;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr04 43120450 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr04 43121380 . T C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:138,0,25 Chr04 43122047 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr04 43133384 . A G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:56,0,30 Chr04 43133388 . T G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:56,0,30 Chr04 43133389 . A C 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:56,0,30 Chr04 43198280 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.42;MQ0=1;QD=8.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:60,6,0 Chr04 43198297 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.7625;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.33;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:6:6:65,6,0 Chr04 43229860 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.437;DP=76;Dels=0.00;FS=11.513;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=1.26;ReadPosRankSum=4.839 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,9:76:99:124,0,2519 Chr04 43325031 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 43358047 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 43358211 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 43385689 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 43408431 . G A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr04 43412595 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 43422148 . G T 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.608;DP=20;Dels=0.00;FS=8.929;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=7.49;ReadPosRankSum=-3.093 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:178,0,475 Chr04 43424496 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:72,0,31 Chr04 43432286 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,181 Chr04 43464872 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 43465123 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 43466030 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 43466053 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 43482300 . A C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.71;MQ0=54;MQRankSum=1.708;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,37:65:9:103,9,0 Chr04 43490145 . G T 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:60,0,26 Chr04 43499688 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,70 Chr04 43500693 . G T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.29;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,104 Chr04 43503713 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 43566213 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr04 43566240 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 43568025 . T C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:104,0,28 Chr04 43568033 . C A 83.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.96;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:112,0,18 Chr04 43568047 . T G 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:110,0,25 Chr04 43568052 . C T 78.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.71;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:107,0,18 Chr04 43568073 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:75,0,33 Chr04 43568084 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:105,0,30 Chr04 43582172 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr04 43590842 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr04 43597944 . A G 114.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:143,0,27 Chr04 43606954 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 43606963 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 43607018 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 43607037 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 43607042 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 43607047 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr04 43607056 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr04 43607073 . C G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr04 43610257 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 43623340 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr04 43623724 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr04 43631779 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr04 43649294 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 43652779 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:71,0,55 Chr04 43652914 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr04 43653087 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,238 Chr04 43653122 . C T 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:165,0,325 Chr04 43653148 . C T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=9.84;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:166,0,333 Chr04 43653795 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:12:77:77,0,287 Chr04 43654670 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.97;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,137 Chr04 43654675 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 43654694 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 43654696 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 43662042 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:112,0,68 Chr04 43767758 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 43768569 . T C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr04 43768577 . C G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr04 43768595 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 43768625 . C T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr04 43800290 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 43821829 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 43821995 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;DP=46;Dels=0.00;FS=11.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.245;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,6:46:87:87,0,1441 Chr04 43850573 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 43850586 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr04 43852710 . G T 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.849;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.526;QD=5.95;ReadPosRankSum=-3.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:99:189,0,724 Chr04 43855160 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr04 43855748 . A G 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr04 43858557 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr04 43862893 . G T 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr04 43863772 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 43863807 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 43864424 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,177 Chr04 43865242 . A T 917.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.288;DP=34;Dels=0.00;FS=6.479;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=26.99;ReadPosRankSum=-0.859 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,25:34:99:946,0,261 Chr04 43869641 . C T 163.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=27.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:192,0,23 Chr04 43889924 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 43910350 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr04 43913918 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 43928631 . T G 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr04 43928661 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 43929088 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr04 43929100 . G T 46.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:75,0,20 Chr04 43930630 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 43930660 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 43948466 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr04 43948485 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr04 43960687 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr04 43962340 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 43962361 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 43962714 . T G 158.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:187,0,24 Chr04 43969510 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr04 43969702 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 43969744 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 43969765 . G A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:151,0,66 Chr04 43969797 . A G 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr04 43969813 . A G 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:135,0,64 Chr04 43969826 . T C 193.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:222,18,0 Chr04 43969833 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr04 43970269 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,101 Chr04 43970314 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:106,0,69 Chr04 43971649 . G C 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.81;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:86:86,0,322 Chr04 43976654 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 43992858 . C G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.65;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:103,0,107 Chr04 44021148 . G C 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.268;QD=7.03;ReadPosRankSum=-1.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:232,0,780 Chr04 44021173 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.867;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.320;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,723 Chr04 44023781 . C G 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.843;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:158,0,211 Chr04 44023783 . T A 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.843;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:158,0,213 Chr04 44023787 . T G 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQ0=0;MQRankSum=-2.843;QD=10.81;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:158,0,211 Chr04 44023812 . G C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:59,0,32 Chr04 44024802 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44024804 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44028839 . C G 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:67:115,0,67 Chr04 44028841 . A G 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:8:40:118,0,40 Chr04 44028846 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:64:115,0,64 Chr04 44040598 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 44040620 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44040713 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 44045579 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr04 44045631 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,72 Chr04 44058330 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;DP=20;Dels=0.00;FS=20.569;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.318;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:51:51,0,574 Chr04 44060582 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:64,0,60 Chr04 44065764 . T C 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=21.54;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:61:179,0,61 Chr04 44065851 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 44136640 . T C 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=27;Dels=0.00;FS=2.635;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=1;MQRankSum=-3.448;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,6:27:91:91,0,712 Chr04 44136684 . C T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=1;MQRankSum=-3.412;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:131,0,715 Chr04 44136685 . C T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.17;MQ0=1;MQRankSum=-3.412;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:131,0,708 Chr04 44151385 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr04 44151407 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr04 44151408 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:61,0,33 Chr04 44151415 . A T 42.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:71,0,25 Chr04 44151418 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr04 44160697 . G C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:49:49,0,177 Chr04 44172673 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44172940 . A C 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr04 44173294 . T G 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr04 44173327 . C G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr04 44173357 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44180418 . T C 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=17.48;ReadPosRankSum=1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:203,0,111 Chr04 44181913 . C A 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:100,0,26 Chr04 44182380 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:52,0,30 Chr04 44182437 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:69,0,33 Chr04 44185923 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44186389 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44197651 . T A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,105 Chr04 44198486 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:101,0,64 Chr04 44209115 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.287;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:55:55,0,698 Chr04 44209239 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr04 44220698 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 44220703 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 44221395 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 44221405 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44235454 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:67,0,63 Chr04 44251981 . C A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr04 44257150 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 44265609 . C G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,145 Chr04 44265666 . A G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,131 Chr04 44266258 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 44266745 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 44287103 . C T 187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=15.65;ReadPosRankSum=2.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:216,0,207 Chr04 44290416 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44290426 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44291080 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44304735 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44305836 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44311710 . C A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr04 44311887 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 44311901 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 44331395 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 44331491 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.540;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:93:93,0,1051 Chr04 44477711 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 44477723 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 44477765 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 44477771 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 44509131 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 44537720 . C A 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;DP=37;Dels=0.00;FS=51.287;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.095;QD=4.59;ReadPosRankSum=-4.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:37:99:198,0,1030 Chr04 44539107 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr04 44557830 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 44562864 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:10:50:50,0,260 Chr04 44566416 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 44575031 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 44582502 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44582528 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44582550 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44582588 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 44583328 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44607201 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:49,0,206 Chr04 44612023 . G C 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612026 . G C 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612028 . C G 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612029 . C A 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612039 . G C 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612044 . A G 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44612053 . C T 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr04 44613252 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.898;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.438;QD=2.85;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:145,0,1253 Chr04 44615031 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 44615044 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr04 44619044 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619053 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619069 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619076 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619085 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619256 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44619338 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.7788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.01;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:11:49:49,0,254 Chr04 44619664 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619665 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619678 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619689 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619692 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619693 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619694 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44619701 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44623877 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44641531 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 44646035 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44646043 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44646238 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44647294 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr04 44647317 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr04 44647485 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44650733 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 44653707 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44656467 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,187 Chr04 44668276 . C G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr04 44676771 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44676805 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44680715 . G C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,182 Chr04 44686618 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:100,0,99 Chr04 44702283 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44714684 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44716134 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44716135 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44728522 . G T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.183;QD=6.04;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:137,0,476 Chr04 44728618 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.443;DP=28;Dels=0.00;FS=6.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.420;QD=3.85;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:136,0,809 Chr04 44728711 . A C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:57,0,71 Chr04 44734326 . C G 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr04 44735696 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44842142 . G T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr04 44842143 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 44857607 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 44863431 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44863435 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44863462 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 44865518 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr04 44865523 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44875582 . T C 238.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:267,0,18 Chr04 44876668 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:113,0,29 Chr04 44876674 . A T 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=11;Dels=0.00;FS=6.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:171,0,201 Chr04 44878019 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 44878415 . C G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=24.564;HaplotypeScore=5.9975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,378 Chr04 44878910 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,112 Chr04 44878919 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,112 Chr04 44878925 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,147 Chr04 44878945 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,141 Chr04 44878973 . T C 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,108 Chr04 44888369 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr04 44895661 . G A 27.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.95;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:21:56,0,21 Chr04 44895691 . T A 30.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.81;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:21:59,0,21 Chr04 44895745 . G C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.3615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.14;MQ0=3;MQRankSum=-1.134;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,14:58:51:51,0,515 Chr04 44895758 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;DP=61;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=6.6278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.97;MQ0=7;MQRankSum=-0.167;QD=0.37;ReadPosRankSum=0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,10:61:51:51,0,521 Chr04 44895764 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;DP=61;Dels=0.00;FS=1.329;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.97;MQ0=7;MQRankSum=-0.234;QD=0.37;ReadPosRankSum=-0.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,10:61:51:51,0,530 Chr04 44895795 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.8308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.72;MQ0=5;MQRankSum=-0.406;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.360 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,10:57:51:51,0,523 Chr04 44899471 . T C 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.62;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:134,0,161 Chr04 44904930 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr04 44914897 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 44915326 . C T 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:94,12,0 Chr04 44915341 . G A 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:94,12,0 Chr04 44915346 . C T 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:94,12,0 Chr04 44915398 . C A 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:94,12,0 Chr04 44915401 . C T 66.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.70;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:12:94,12,0 Chr04 44924138 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.676;DP=44;Dels=0.00;FS=15.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=1.56;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:44:97:97,0,1422 Chr04 44924316 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:77:77,0,366 Chr04 44925530 . T G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr04 44941007 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr04 44941012 . G C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr04 44945545 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr04 44945554 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 44945558 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 44945560 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.82;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr04 44959127 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.51;MQ0=12;MQRankSum=2.123;QD=2.06;ReadPosRankSum=-2.293 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,2:27:6:83,6,0 Chr04 44961311 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr04 44961343 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 44969041 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 44969055 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr04 44972805 . C G 108.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.90;MQ0=2;QD=13.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:137,15,0 Chr04 44972845 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.90;MQ0=2;MQRankSum=-1.380;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:41:53,0,41 Chr04 44972857 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:50:53,0,50 Chr04 44972873 . A G 27.88 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:16:56,0,16 Chr04 44972993 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 44974886 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr04 44974902 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr04 44975330 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,64 Chr04 44975673 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 44977239 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr04 45003495 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45015769 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,112 Chr04 45015778 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,108 Chr04 45022151 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 45025099 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 45025103 . T A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 45039842 . T A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:105,0,65 Chr04 45051311 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 45051318 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.80;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 45061722 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45067704 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45067994 . C T 43.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:72,0,24 Chr04 45079319 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45113003 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45116478 . A C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 45134620 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 45135908 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr04 45135927 . G A 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:75,0,27 Chr04 45135929 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr04 45135935 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 45135941 . C T 36.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:65,0,22 Chr04 45135947 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr04 45169071 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:83:83,0,144 Chr04 45169492 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,211 Chr04 45206682 . A G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr04 45211450 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45211494 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 45211496 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr04 45213574 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 45213578 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45217333 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45218299 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 45218302 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45218310 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 45226842 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 45235923 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 45246982 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45248435 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 45268657 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:63,0,31 Chr04 45275867 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45283812 . C T 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr04 45283823 . G C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr04 45283827 . G T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr04 45283837 . G A 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr04 45285870 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr04 45287495 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 45288342 . G C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr04 45288390 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 45298999 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45299017 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45307698 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 45310099 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:64,0,30 Chr04 45314710 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr04 45339638 . A G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr04 45345181 . T G 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,304 Chr04 45345200 . T C 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.80;ReadPosRankSum=1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:92:92,0,304 Chr04 45348312 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45352429 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr04 45354960 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr04 45354967 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr04 45354970 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr04 45358450 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr04 45364225 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 45364243 . A C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr04 45364275 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,70 Chr04 45367677 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr04 45371998 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45372745 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45373345 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr04 45373355 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr04 45379142 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 45384328 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 45386328 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45386915 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 45394533 . C T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=11.31;ReadPosRankSum=1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:130,0,164 Chr04 45394921 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr04 45394928 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr04 45397687 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:64,0,61 Chr04 45404271 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45436907 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45444186 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr04 45457412 . C A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.128;QD=4.20;ReadPosRankSum=-4.046 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:171,0,950 Chr04 45457941 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45464678 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45464951 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.942;DP=16;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:67:67,0,465 Chr04 45469668 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 45475694 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr04 45501642 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45518947 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr04 45518985 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45519002 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr04 45520120 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,180 Chr04 45521438 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:75,6,0 Chr04 45521454 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45522789 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 45522821 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 45523125 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;DP=83;Dels=0.00;FS=22.180;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.671;QD=0.33;ReadPosRankSum=-4.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,8:83:56:56,0,2704 Chr04 45523894 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45524555 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45525123 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr04 45525144 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr04 45525605 . T C 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 45576088 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 45576112 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45605726 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr04 45605739 . G T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr04 45629204 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr04 45705798 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr04 45707010 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr04 45709321 . T C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr04 45712126 . A G 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr04 45712134 . T C 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr04 45712140 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=25.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:156,12,0 Chr04 45712157 . T C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=30.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr04 45712166 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=29.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr04 45712181 . G A 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.22;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr04 45727813 . T C 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.09;MQ0=4;QD=6.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:91,9,0 Chr04 45735706 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45754078 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr04 45755344 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr04 45755368 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr04 45755384 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45755389 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45760788 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=1.35;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:78:78,0,1203 Chr04 45760897 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45761282 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45768577 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr04 45770798 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr04 45772736 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr04 45781261 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr04 45788899 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45792718 . T A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,252 Chr04 45793192 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr04 45824277 . G T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr04 45828137 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr04 45828575 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr04 45828577 . A C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.36;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 78028 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 89581 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 99705 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:8:95:95,0,143 Chr05 107364 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,93 Chr05 113803 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 113814 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 116302 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 116337 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 116364 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 116580 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 116589 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 116602 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 116605 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 116610 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 116627 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 116630 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 118140 . A G 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.36;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:67,0,27 Chr05 128684 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 132503 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 135952 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 169582 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.73;MQ0=13;MQRankSum=-2.054;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,9:22:59:59,0,226 Chr05 169627 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.90;MQ0=3;MQRankSum=-2.054;QD=2.56;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:59:59,0,226 Chr05 175893 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 186178 . T A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 203839 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 206912 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr05 206974 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 224855 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,110 Chr05 225613 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 229423 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 238060 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 241203 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,238 Chr05 243724 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 263332 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.121;QD=3.43;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:114,0,743 Chr05 263530 . T G 421.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:450,33,0 Chr05 264205 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 264230 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 264250 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 266661 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 270163 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 293976 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 298636 . T A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.855;QD=5.56;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:156,0,618 Chr05 298808 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 303539 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 303975 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 304094 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 304110 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 304121 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 306830 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,361 Chr05 306842 . A G 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80:80,0,357 Chr05 327100 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 327103 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 336815 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 336848 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 336849 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 336872 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 337332 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 344200 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 345101 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr05 345158 . T A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr05 351491 . G A 637.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:666,48,0 Chr05 367959 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 371330 . T C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.7595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.837;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.347 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,9:19:85:105,0,85 Chr05 379920 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 379921 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 379931 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 379934 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 379959 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 399882 . C G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 411162 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr05 445845 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=15.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:75,6,0 Chr05 447050 . C T 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.67;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr05 453328 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:132,0,105 Chr05 466288 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 466327 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 516596 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 517114 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 519620 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:65,0,59 Chr05 521052 . C T 357.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.791;QD=32.54;ReadPosRankSum=1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:385,0,5 Chr05 542924 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 542925 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 542968 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 542984 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 542993 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 542998 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 550037 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 555532 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 561193 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 649225 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:96,0,67 Chr05 649312 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr05 661157 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.523;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.775;QD=0.98;ReadPosRankSum=-2.617 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:51:78:78,0,1667 Chr05 669502 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 669505 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 692294 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 692333 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 692340 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 694770 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 705290 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 705293 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 705320 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 705360 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 705363 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.53;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 736285 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 736292 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 737333 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 738141 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 738142 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 738154 . A C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr05 738211 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 738244 . C G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr05 738274 . A C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 738286 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 760465 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 813915 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 813933 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 818337 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.72;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 818997 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.34;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 842006 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 842025 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 846501 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 846510 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 846511 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 846512 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 860769 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 860805 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 877556 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,102 Chr05 877955 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 877956 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 877989 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 880986 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 881889 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 881930 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 881951 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 904810 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:9:52:52,0,199 Chr05 919180 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 919196 . G A 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr05 919197 . C A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr05 925594 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 942861 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 952462 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 952483 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 961395 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,817 Chr05 961480 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr05 961973 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 1023113 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=4.36;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:111,0,556 Chr05 1023122 . G C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=4.30;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:110,0,562 Chr05 1023131 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.750;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=4.41;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:112,0,555 Chr05 1023136 . T C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.550;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=4.41;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:112,0,554 Chr05 1023137 . A C 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.950;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:111,0,529 Chr05 1024760 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.140;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:35:90:90,0,1063 Chr05 1026378 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 1067624 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 1118484 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr05 1118514 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1127851 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr05 1137198 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 1140782 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 1143011 . A T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 1143015 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 1143883 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 1155676 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1164579 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1164742 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 1165438 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 1165780 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 1179343 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 1180287 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 1181856 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 1216996 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 1217052 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 1217060 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 1217801 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5115;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.78;MQ0=14;MQRankSum=0.736;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:6:61,6,0 Chr05 1217853 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.78;MQ0=14;QD=1.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:6:61,6,0 Chr05 1217855 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.78;MQ0=14;QD=1.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:6:61,6,0 Chr05 1289474 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:105,0,69 Chr05 1289477 . A G 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr05 1296683 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;DP=28;Dels=0.00;FS=14.569;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.952;QD=1.42;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:68:68,0,871 Chr05 1298753 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr05 1315799 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 1326392 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1326395 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1329692 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:124,9,0 Chr05 1329867 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1331903 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.855;DP=33;Dels=0.00;FS=14.768;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.028;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.028 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:69:69,0,1072 Chr05 1379132 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.72;MQ0=25;QD=1.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:6:81,6,0 Chr05 1386010 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 1386019 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 1386044 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1386062 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 1442718 . A G 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr05 1444850 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 1468973 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:55:55,0,145 Chr05 1468995 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:55:55,0,144 Chr05 1471798 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:31:60,0,31 Chr05 1484413 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 1484477 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 1516831 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 1580112 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr05 1583957 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1598822 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1598835 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1598836 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1614976 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 1615431 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.11;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr05 1615443 . A T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.11;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr05 1623302 . G T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr05 1623334 . C T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr05 1624032 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 1661065 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 1685153 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 1685250 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 1705216 . C T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.28;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr05 1737622 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 1742847 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 1816942 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 1851030 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr05 1851056 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr05 1851179 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.6847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.37;MQ0=1;MQRankSum=0.720;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:8:30:55,0,30 Chr05 1981394 . G C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,243 Chr05 1981425 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,294 Chr05 1981493 . A G 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;DP=15;Dels=0.00;FS=6.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:143,0,363 Chr05 1981551 . T C 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;DP=12;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:82:82,0,317 Chr05 1985121 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,136 Chr05 1985147 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.20;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:93:93,0,217 Chr05 1986265 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:66:66,0,563 Chr05 1993887 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:30:110,0,30 Chr05 2005201 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 2005207 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 2007372 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 2026891 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 2036894 . G T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr05 2036952 . A G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr05 2043718 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 2043771 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 2050085 . T G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 2050926 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 2050929 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 2058826 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 2065376 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 2090839 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 2095098 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 2116607 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 2122553 . C A 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:148,0,27 Chr05 2122555 . G C 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:142,0,27 Chr05 2133505 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,110 Chr05 2142003 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:67,0,60 Chr05 2142016 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:68,0,66 Chr05 2147830 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.91;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:74:74,0,369 Chr05 2147895 . G C 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.13;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:79:79,0,174 Chr05 2147955 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.05;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 2153738 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.07;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 2153739 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.07;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 2172449 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2172468 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 2172475 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 2173050 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr05 2196849 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 2201167 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 2201819 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr05 2225431 . C G 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.16;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:118,0,231 Chr05 2229448 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 2230700 . T C 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:132,0,132 Chr05 2230702 . G C 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:98,0,90 Chr05 2235792 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 2235828 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:71,0,65 Chr05 2235977 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 2236578 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr05 2236596 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 2236641 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr05 2237867 . G A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr05 2237879 . A T 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:137,0,27 Chr05 2237905 . C T 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.91;MQ0=0;QD=22.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:140,12,0 Chr05 2237929 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr05 2239204 . G C 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr05 2239254 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 2239257 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 2239263 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 2250482 . T A 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=26.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:53:266,0,53 Chr05 2250489 . C A 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:263,0,55 Chr05 2252666 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr05 2335626 . G A 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:67,0,26 Chr05 2339666 . A T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr05 2340561 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;DP=20;Dels=0.00;FS=28.682;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=5.14;ReadPosRankSum=-2.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:131,0,548 Chr05 2353081 . A C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr05 2353145 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr05 2359387 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr05 2359704 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 2365185 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2386638 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;DP=20;Dels=0.00;FS=15.849;HaplotypeScore=13.9946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQ0=0;MQRankSum=1.181;QD=3.04;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:89:89,0,581 Chr05 2389633 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=1.562;QD=0.83;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:54:54,0,908 Chr05 2392574 . T A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr05 2429822 . G C 441.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.88;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:470,36,0 Chr05 2484224 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 2511102 . A G 1016.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1045,75,0 Chr05 2533059 . G C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=3.86;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:90:90,0,279 Chr05 2552877 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.55;MQ0=7;QD=3.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:58,6,0 Chr05 2552881 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.55;MQ0=7;QD=3.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,7:9:6:58,6,0 Chr05 2589704 . C T 34.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.54;MQ0=3;MQRankSum=-1.617;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:21:63,0,21 Chr05 2631911 . A G 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=13.85;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:139,0,130 Chr05 2636384 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2637209 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 2637251 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 2637986 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,111 Chr05 2637992 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,111 Chr05 2638577 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,135 Chr05 2638578 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,135 Chr05 2650992 . C A 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:5:27:106,0,27 Chr05 2690811 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.650;DP=19;Dels=0.00;FS=2.350;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.550;QD=1.62;ReadPosRankSum=1.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:59:59,0,372 Chr05 2716985 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,180 Chr05 2718433 . C A 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr05 2721811 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2733483 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:50,0,69 Chr05 2733785 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 2734577 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 2734660 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr05 2736079 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:75,0,29 Chr05 2742471 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 2743782 . A C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,187 Chr05 2744648 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:67:67,0,479 Chr05 2747528 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 2747530 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr05 2748035 . A C 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=26.20;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:264,0,57 Chr05 2748073 . A G 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:56:264,0,56 Chr05 2759298 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:64,0,62 Chr05 2759391 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,144 Chr05 2784455 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 2784636 . G C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:81:81,0,370 Chr05 2785540 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 2786991 . T G 40.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:69,0,24 Chr05 2787038 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,261 Chr05 2806756 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 2814388 . C G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 2814400 . A C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr05 2814402 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 2814515 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 2814584 . A G 40.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:80,6,0 Chr05 2823999 . T A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,218 Chr05 2827847 . A T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:111,0,65 Chr05 2831322 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 2831330 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 2831469 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2860783 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2860784 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2860786 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2860787 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2860812 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 2866722 . G C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr05 2867628 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 2867687 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 2881920 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 2881990 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2881991 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2882329 . T C 448.89 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.347;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.116;QD=29.93;ReadPosRankSum=-0.810 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:2:475,2,0 Chr05 2906163 . T G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:104,0,61 Chr05 2917294 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 2918007 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2918015 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 2918032 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 2918044 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 2926014 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 2926042 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 2930794 . A T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:136,0,64 Chr05 2932679 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 2933581 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr05 2934206 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 2934231 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 2934429 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 2934448 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 2934721 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 2945071 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 2945079 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2946178 . T C 62.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:91,0,26 Chr05 2948387 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2948410 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2948431 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 2948457 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2948472 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 2949362 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:65,0,31 Chr05 2958615 . C T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:61:182,0,61 Chr05 2964090 . G C 187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.72;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=18.78;ReadPosRankSum=0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:216,0,138 Chr05 3018044 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 3018129 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr05 3032534 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 3033029 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 3033055 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3033629 . G C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr05 3037949 . G T 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.586;QD=7.24;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:144,0,396 Chr05 3038045 . C A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:13:99:160,0,208 Chr05 3047579 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3047599 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 3047631 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 3057235 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 3057246 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 3057277 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3057314 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3058806 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 3068255 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 3075383 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 3079149 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:135,0,58 Chr05 3079611 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:49,0,210 Chr05 3179125 . G T 177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;DP=22;Dels=0.00;FS=24.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.141;QD=8.08;ReadPosRankSum=-3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:206,0,496 Chr05 3195682 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3202228 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3212978 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 3213041 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 3217468 . G C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 3217532 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3217540 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3217559 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 3217560 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3280636 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 3281111 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3281117 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3281120 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3281145 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3281471 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 3282927 . A G 279.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=27.98;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:51:308,0,51 Chr05 3286195 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 3288765 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3313527 . C G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.06;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:65:82,0,65 Chr05 3336724 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,377 Chr05 3337340 . G A 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr05 3338143 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 3341890 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3341905 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3341910 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3341923 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3341930 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.42;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 3342140 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 3342879 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 3342883 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3355980 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 3358295 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 3358386 . A T 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr05 3358423 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 3358831 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 3358855 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 3360974 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:86:97,0,86 Chr05 3375466 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 3383462 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 3383509 . G A 140.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.23;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:169,15,0 Chr05 3383521 . A G 142.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.23;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:171,15,0 Chr05 3438315 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 3438373 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.39;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 3438390 . C G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.39;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr05 3457227 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:58,0,33 Chr05 3457235 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:63,0,33 Chr05 3458089 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 3467806 . T C 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:56,6,0 Chr05 3467857 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:56,6,0 Chr05 3473492 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 3510909 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 3535795 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3538480 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,196 Chr05 3566735 . C A 72.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:114,9,0 Chr05 3614826 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3614860 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.26;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3614942 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3614948 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3614963 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 3653260 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 3653277 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3663771 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 3704392 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 3723628 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:126,0,101 Chr05 3731131 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr05 3779685 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 3780770 . T A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 3793824 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3793884 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 3821471 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,187 Chr05 3836807 . G T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 3838257 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 3838267 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 3851365 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 3868425 . G A 154.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:183,0,24 Chr05 3892482 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.302;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:70:70,0,463 Chr05 3911879 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 3940451 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 3967966 . C G 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.99;MQ0=2;MQRankSum=1.026;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:24:68,0,24 Chr05 3993513 . A G 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr05 4019781 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4019799 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4021829 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,144 Chr05 4021857 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;DP=22;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:90:90,0,646 Chr05 4021891 . T C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;DP=22;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.213;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:99:100,0,670 Chr05 4031222 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4031979 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 4085796 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4092449 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.117;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.699;QD=0.71;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:58:58,0,1253 Chr05 4096534 . G T 164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.330;DP=25;Dels=0.00;FS=15.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.030;QD=6.59;ReadPosRankSum=-3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:193,0,637 Chr05 4109864 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 4123870 . G C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.41;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 4123951 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.54;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr05 4125533 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 4130401 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4130404 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4130425 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4145873 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr05 4146749 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4146759 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4209191 . A T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,104 Chr05 4232023 . T A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.38;MQ0=6;MQRankSum=2.054;QD=3.02;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:73,9,0 Chr05 4268373 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 4292493 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4292759 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4297812 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;DP=33;Dels=0.00;FS=9.887;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:55:55,0,1056 Chr05 4298633 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 4302905 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.05;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 4302920 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.05;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 4325926 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:101,0,65 Chr05 4326860 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 4335026 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 4359862 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 4359893 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 4376824 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 4390813 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 4390836 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 4422120 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4422121 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4424397 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.634;DP=38;Dels=0.00;FS=20.604;HaplotypeScore=3.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.073;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:79:79,0,1195 Chr05 4432180 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 4432186 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 4432672 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 4432675 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 4432676 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 4432718 . T G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 4432719 . G C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr05 4432720 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 4432746 . G C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 4445332 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 4445334 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr05 4445380 . G T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 4445383 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 4473187 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 4473189 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 4474970 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 4477251 . A T 185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.717;DP=18;Dels=0.00;FS=3.039;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.543;QD=10.32;ReadPosRankSum=-3.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:214,0,386 Chr05 4477590 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4478426 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 4478443 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 4478489 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4484261 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr05 4487375 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 4498609 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4498654 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4504124 . C T 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.28;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr05 4563262 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4563280 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4563314 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4563320 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 4587425 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.74;MQ0=15;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:59,6,0 Chr05 4587433 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.74;MQ0=15;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:59,6,0 Chr05 4610135 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4617547 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 4619352 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4656021 . G A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 4724052 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr05 4735974 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.35;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:73,6,0 Chr05 4736070 . A G 93.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4836828 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4836835 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4836845 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 4836848 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 4849672 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 4883308 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,222 Chr05 4899439 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 4912868 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 4933831 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 4935018 . G T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.680;QD=7.30;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:145,0,400 Chr05 4979411 . A T 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:155,0,59 Chr05 4979412 . A T 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 Chr05 4979413 . A T 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 Chr05 4979417 . A T 292.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:321,24,0 Chr05 5084897 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.02;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 5128515 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.15;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 5173846 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 5173857 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 5225825 . G C 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.26;MQ0=11;QD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:74,9,0 Chr05 5225826 . A G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.26;MQ0=11;QD=3.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:74,9,0 Chr05 5236465 . A T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,204 Chr05 5236837 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr05 5264285 . T A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 5277009 . A G 722.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.17;MQ0=0;QD=29.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:54:751,54,0 Chr05 5279105 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 5315568 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 5390087 . C A 1397.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:99:1426,102,0 Chr05 5391962 . A T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 5406525 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 5430145 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 5430259 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 5445715 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 5465576 . G T 56.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:85,0,26 Chr05 5583407 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 5583437 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 5583448 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 5583702 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 5583727 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 5583742 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 5584985 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 5643765 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 5644442 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,317 Chr05 5684422 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 5704485 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=35.9934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.306;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:112,0,1354 Chr05 5757024 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 5767665 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.41;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:107,0,87 Chr05 5788299 . C T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr05 5809834 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 5815459 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,196 Chr05 5825966 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 5837382 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 5837390 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 5837392 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 5837451 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 5838721 . A T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr05 5924526 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 5957621 . A T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 Chr05 5957640 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,103 Chr05 5978565 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr05 6004598 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 6004599 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 6058024 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:8:56:56,0,185 Chr05 6079381 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr05 6090484 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 6120613 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 6120622 . A G 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 6120656 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr05 6120905 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 6120909 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 6123819 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 6141928 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr05 6146303 . C T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.79;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr05 6146992 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.29;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr05 6174353 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 6233357 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 6233416 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 6359227 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 6440052 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.91;MQ0=0;MQRankSum=2.237;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.818 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,2:23:6:68,6,0 Chr05 6440056 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.91;MQ0=0;QD=2.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:23:6:82,6,0 Chr05 6440066 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.91;MQ0=0;QD=2.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:83,6,0 Chr05 6440075 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.53;MQ0=0;MQRankSum=2.246;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.888 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,2:24:6:82,6,0 Chr05 6440100 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.574;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.53;MQ0=0;MQRankSum=2.246;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.992 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,2:24:6:80,6,0 Chr05 6516038 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr05 6516121 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 6518446 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 6518454 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.15;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 6532613 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 6532624 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 6568681 . C T 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr05 6577733 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 6634065 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 6704307 . A T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.035;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=1;MQRankSum=2.858;QD=3.12;ReadPosRankSum=-3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:58:128,0,58 Chr05 6704403 . C A 167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=13.98;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:196,0,128 Chr05 6811774 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 6839555 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 6839580 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 6842457 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.23;MQ0=0;QD=0.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:6:59,6,0 Chr05 6851890 . G A 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=1;MQRankSum=1.537;QD=8.18;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:85,9,0 Chr05 6872383 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 6887306 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.81;MQ0=0;QD=5.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:97,9,0 Chr05 6894077 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.26;MQ0=0;MQRankSum=4.704;QD=1.60;ReadPosRankSum=-4.743 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,14:31:6:77,6,0 Chr05 6895917 . C G 257.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.77;MQ0=0;QD=32.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:286,24,0 Chr05 6895935 . C T 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.77;MQ0=0;QD=27.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:249,21,0 Chr05 6896340 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 6896355 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 6896358 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr05 6896363 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 6915886 . A T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,281 Chr05 6915982 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.550;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.875;QD=1.85;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:91:91,0,1090 Chr05 6921857 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 6952266 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr05 6952287 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 6953220 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 6953563 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,69 Chr05 6979737 . A G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr05 7006105 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 7007679 . A G 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:50,0,22 Chr05 7040940 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 7040955 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 7040959 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 7049429 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 7071100 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 7071133 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 7089662 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 7102256 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,335 Chr05 7106346 . C G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 7106363 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 7136586 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 7136769 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,111 Chr05 7137320 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr05 7137367 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:72:72,0,72 Chr05 7139796 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr05 7139809 . G A 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr05 7141313 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:70,0,68 Chr05 7142554 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 7144436 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 7203132 . G A 123.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:152,0,27 Chr05 7203140 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=26.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr05 7203141 . G C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr05 7203164 . A C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.30;MQ0=0;QD=30.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr05 7203202 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 7203403 . T G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 7213698 . A T 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.020;QD=2.39;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:119,0,1145 Chr05 7218036 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:60,0,51 Chr05 7256916 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,226 Chr05 7279071 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr05 7280595 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 7327236 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 7327280 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 7335814 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 7371306 . T C 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 7387684 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 7387904 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr05 7387912 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:125,9,0 Chr05 7387938 . T A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr05 7387940 . T C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr05 7396607 . A G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr05 7399693 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=6.86;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:9:90:90,0,182 Chr05 7419246 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr05 7445333 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 7445391 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr05 7456411 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.89;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr05 7469884 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 7477687 . C A 92.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.79;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=18.41;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:120,12,0 Chr05 7502461 . T A 27.86 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.82;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:17:56,0,17 Chr05 7502464 . A G 27.86 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.82;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:17:56,0,17 Chr05 7507598 . T G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 7507599 . T C 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr05 7525748 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:64,0,33 Chr05 7565498 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:63,0,60 Chr05 7565778 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.690;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:108,0,516 Chr05 7598527 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 7598628 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 7635058 . G A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.67;MQ0=8;MQRankSum=0.180;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,6:47:86:86,0,1187 Chr05 7635152 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 7667522 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 7675013 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 7693220 . C T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr05 7695203 . A T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,253 Chr05 7695300 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 7725243 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 7738225 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:64,0,29 Chr05 7739962 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 7739977 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 7739985 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 7739986 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 7744549 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:63,0,29 Chr05 7749177 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr05 7749241 . G A 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr05 7750700 . C T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr05 7750719 . C A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr05 7750910 . C A 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr05 7752579 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 7756142 . G T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;DP=16;Dels=0.00;FS=6.317;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.898;QD=9.61;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:182,0,320 Chr05 7758645 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=3.26;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:99:100,0,690 Chr05 7758822 . C G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.895;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:91:91,0,245 Chr05 7759313 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 7759348 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 7809417 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 7819865 . C T 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:147,0,26 Chr05 7996841 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 8010185 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.981;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:70:70,0,448 Chr05 8024085 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 8024113 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 8060693 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.68;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr05 8060735 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 8060738 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 8063346 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 8118154 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 8118210 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 8119743 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,185 Chr05 8159412 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=13.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98:126,0,98 Chr05 8197493 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.225;DP=33;Dels=0.00;FS=4.781;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.70;MQ0=1;MQRankSum=2.593;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:71:71,0,898 Chr05 8197495 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;DP=33;Dels=0.00;FS=4.959;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.70;MQ0=1;MQRankSum=2.137;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:69:69,0,927 Chr05 8197546 . C G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;DP=45;Dels=0.00;FS=4.781;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.70;MQ0=12;MQRankSum=1.582;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:85:85,0,899 Chr05 8215610 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.07;MQ0=0;QD=9.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:77,6,0 Chr05 8242111 . A T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr05 8291629 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 8332361 . T G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 8339451 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 8339498 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 8380782 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 8380797 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 8380815 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 8380844 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 8458185 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 8480187 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 8539747 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 8605788 . G T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.89;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr05 8606382 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 8606389 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 8606393 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 8606418 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 8724011 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8732772 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=1.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:6:57,6,0 Chr05 8748579 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8748587 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8748592 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8748595 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8748601 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 8760330 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 8764487 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr05 8788327 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 8788330 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 8790762 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 8790809 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 8802765 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr05 8802968 . A C 459.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:36:488,36,0 Chr05 8819665 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 8859425 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=4.26;ReadPosRankSum=-2.602 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:105,0,502 Chr05 8877779 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=51;Dels=0.00;FS=27.107;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.90;MQ0=19;MQRankSum=-0.826;QD=0.56;ReadPosRankSum=-2.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,4:51:57:57,0,1048 Chr05 8877875 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.02;MQ0=0;MQRankSum=2.933;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,320 Chr05 8954402 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 9065403 . C A 104.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:133,0,27 Chr05 9067490 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.392;QD=2.95;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:41:99:149,0,1235 Chr05 9080178 . A G 136.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.86;MQ0=0;QD=19.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:165,21,0 Chr05 9080181 . A G 136.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.86;MQ0=0;QD=19.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:165,21,0 Chr05 9096349 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 9124544 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr05 9124561 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.83;MQ0=1;MQRankSum=-1.026;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,71 Chr05 9214772 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.70;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr05 9230802 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 9260467 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 9260914 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.68;MQ0=18;MQRankSum=1.380;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,2:24:6:58,6,0 Chr05 9260947 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.182;DP=34;Dels=0.00;FS=6.117;HaplotypeScore=8.7781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.81;MQ0=18;MQRankSum=2.122;QD=2.52;ReadPosRankSum=-2.122 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:99:114,0,248 Chr05 9260956 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=20;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=8.9357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.94;MQ0=8;MQRankSum=0.370;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,11:20:71:71,0,297 Chr05 9267377 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 9268212 . C T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:128,0,211 Chr05 9268224 . G A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,201 Chr05 9268366 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.53;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:132,0,174 Chr05 9273921 . T A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr05 9275756 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,184 Chr05 9275769 . A C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,184 Chr05 9276294 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,151 Chr05 9375518 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9375547 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 9381339 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9381363 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 9381372 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9381645 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 9508137 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.88;MQ0=1;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr05 9508160 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.88;MQ0=1;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:65,6,0 Chr05 9534363 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 9580784 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.02;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 9580962 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 9587387 . T A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr05 9587446 . G A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr05 9716716 . T C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.52;MQ0=20;MQRankSum=0.742;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,24:27:9:94,9,0 Chr05 9716733 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6671;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.06;MQ0=20;MQRankSum=-0.988;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,4:26:6:50,6,0 Chr05 9722897 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 9751655 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 9754131 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.71;MQ0=17;QD=2.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:73,6,0 Chr05 9778626 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9778647 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9778652 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9784371 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 9784387 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 9784407 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 9784422 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 9784427 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 9793406 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=5;QD=11.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:116,9,0 Chr05 9793414 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=5;QD=11.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:116,9,0 Chr05 9793417 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.43;MQ0=5;QD=11.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:116,9,0 Chr05 9829186 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 9829201 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9842163 . G T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr05 9843669 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.176;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:85:85,0,1195 Chr05 9868649 . G C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr05 9868655 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 9868831 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 9891184 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 9892183 . T G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,171 Chr05 9893533 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 9893588 . T A 29.79 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:69,6,0 Chr05 9893616 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 9926101 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 9926108 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 9926132 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9926167 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9926178 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 9926201 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 9926261 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 9928154 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr05 10051245 . G A 85.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.44;MQ0=0;QD=9.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:15:114,15,0 Chr05 10100630 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 10171288 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.60;MQ0=1;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:57,6,0 Chr05 10201258 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 10201289 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 10239627 . C A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=1.683;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,132 Chr05 10244355 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 10245805 . G T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr05 10277590 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.59;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 10277633 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.59;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 10280853 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.52;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 10280859 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.52;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 10342339 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 10391098 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 10438104 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.83;MQ0=9;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:9:80,9,0 Chr05 10463265 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,105 Chr05 10471214 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 10472071 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr05 10478904 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,279 Chr05 10481818 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr05 10511440 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=3;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:59,6,0 Chr05 10512160 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 10526254 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 10527654 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,256 Chr05 10690973 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 10798350 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 10798352 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 10828008 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 10855254 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.53;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 10867943 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 10915785 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 10928876 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 10928952 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 10969697 . G A 117.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.66;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.42;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:11:145,0,11 Chr05 10984772 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 11002293 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 11090142 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 11095231 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.339;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=1.510;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1157 Chr05 11095317 . T A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.19;MQ0=17;MQRankSum=0.727;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:27:104,0,27 Chr05 11097885 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.15;MQ0=1;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr05 11208920 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 11221055 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.42;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:58:58,0,634 Chr05 11223945 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 11286169 . G C 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.34;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:84,9,0 Chr05 11317931 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr05 11374381 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 11395986 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 11466527 . T C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr05 11510760 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.56;MQ0=1;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:52,6,0 Chr05 11510791 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.56;MQ0=1;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:52,6,0 Chr05 11547400 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 11551505 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:32:60,0,32 Chr05 11551538 . T C 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:30:88,0,30 Chr05 11551544 . C T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:30:88,0,30 Chr05 11551575 . T G 58.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:27:87,0,27 Chr05 11610788 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 11632627 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 11650402 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 11650799 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 11698032 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.37;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr05 11720028 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 11721389 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:65,0,63 Chr05 11772145 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=5;QD=7.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:81,6,0 Chr05 11777688 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:126,9,0 Chr05 11777705 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 11800407 . G A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr05 11800427 . A C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr05 11800430 . T A 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr05 11800630 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 11802854 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 11802860 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 11813126 . T G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 11843558 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=2;MQRankSum=0.720;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,145 Chr05 11973425 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr05 11973434 . G T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr05 11976433 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,143 Chr05 12007866 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 12026177 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 12026218 . T C 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:99,0,24 Chr05 12026241 . C T 81.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:110,0,18 Chr05 12027093 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 12027101 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 12028218 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 12074267 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 12096450 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 12098171 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 12103365 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 12137742 . A C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 12137829 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 12189156 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.95;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 12189191 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.95;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 12210158 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 12210179 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 12216307 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 12216309 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 12216336 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 12216356 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 12261139 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 12322122 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.038;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:94:94,0,1037 Chr05 12434165 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 12443810 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 12443864 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 12461675 . T A 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.70;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 12563086 . G C 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:117,12,0 Chr05 12687969 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 12802697 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 12831055 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 12865124 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.985;DP=40;Dels=0.00;FS=8.125;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.900;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:72:72,0,1292 Chr05 12865210 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.646;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=4.15;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:103,0,479 Chr05 12873477 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 12873804 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 12900145 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.28;MQ0=0;QD=1.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:6:59,6,0 Chr05 12958450 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr05 12958457 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.75;MQ0=0;QD=8.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:68,9,0 Chr05 12958495 . G T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.75;MQ0=0;QD=8.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:68,9,0 Chr05 12958513 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.75;MQ0=0;QD=8.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:68,9,0 Chr05 12971035 . A T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.95;MQ0=0;QD=4.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:70,9,0 Chr05 12971062 . A C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.95;MQ0=0;QD=4.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:70,9,0 Chr05 12971073 . T C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.95;MQ0=0;QD=4.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:70,9,0 Chr05 12973007 . C G 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr05 13133869 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 13141174 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 13219994 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 13237364 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 13247392 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr05 13272399 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 13396143 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 13396157 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 13408041 . T C 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr05 13412022 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 13412027 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 13412048 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 13431415 . C T 44.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.34;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:72,9,0 Chr05 13431491 . C T 44.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.75;MQ0=1;QD=11.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:72,9,0 Chr05 13466626 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr05 13534924 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.55;MQ0=1;MQRankSum=1.380;QD=6.54;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:32:74,0,32 Chr05 13654291 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 13660933 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.08;MQ0=0;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr05 13729823 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.41;MQ0=39;QD=0.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,24:41:6:58,6,0 Chr05 13766565 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 13786048 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 13786050 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 13786084 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 13801002 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.08;MQ0=34;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:30:67,0,30 Chr05 13858892 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr05 13869667 . A G 24.92 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.26;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.31;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:15:53,0,15 Chr05 13902271 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.15;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:57,6,0 Chr05 13902299 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.15;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:57,6,0 Chr05 13954298 . G T 74.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.70;MQ0=1;MQRankSum=1.208;QD=3.00;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:13:103,0,13 Chr05 13975235 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.96;MQ0=7;QD=2.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,3:10:6:53,6,0 Chr05 14006285 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr05 14067286 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr05 14067361 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr05 14122007 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 14122039 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 14356198 . C G 114.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.28;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:15:143,15,0 Chr05 14380269 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.64;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 14380272 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.64;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 14521073 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=1.08;ReadPosRankSum=1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,47:48:30:80,0,30 Chr05 14621889 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=0;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:51,6,0 Chr05 14621908 . C G 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=0;QD=12.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:76,9,0 Chr05 14621925 . C G 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=0;QD=12.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:79,9,0 Chr05 14779133 . C A 111.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:140,0,19 Chr05 14784734 . T A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr05 14785232 . G T 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:137,0,26 Chr05 14785410 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,245 Chr05 14883349 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 14903668 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 14958995 . G A 98.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.89;MQ0=0;MQRankSum=1.668;QD=9.80;ReadPosRankSum=-1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:12:126,0,12 Chr05 14966219 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 14998842 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 15045912 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 15074700 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 15116148 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 15176838 . T A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr05 15176856 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr05 15184740 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,189 Chr05 15193606 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 15193647 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 15197553 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.16;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:32:68,0,32 Chr05 15197617 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr05 15276300 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 15315867 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 15326784 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 15332535 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;DP=23;Dels=0.00;FS=30.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=0.411;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:51:51,0,571 Chr05 15332632 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 15344483 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 15356229 . T G 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr05 15418753 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 15418833 . A G 622.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=1.156;QD=34.61;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:651,13,0 Chr05 15455598 . T C 34.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 15625287 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 15637896 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.52;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 15662837 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 15664457 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 15730298 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr05 15767348 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 15817336 . A G 78.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:106,12,0 Chr05 15817355 . T C 78.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:106,12,0 Chr05 15817398 . C T 78.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:106,12,0 Chr05 15817417 . G A 78.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:106,12,0 Chr05 15817420 . G A 78.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.75;MQ0=0;QD=19.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:106,12,0 Chr05 15944072 . T C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 15946100 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 15986510 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.31;MQ0=5;QD=6.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:76,6,0 Chr05 16041270 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=1;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:62,6,0 Chr05 16088488 . T C 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:27:146,0,27 Chr05 16088496 . G A 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:27:148,0,27 Chr05 16088504 . A C 114.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:27:143,0,27 Chr05 16133818 . T A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.350;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.50;MQ0=5;MQRankSum=-0.740;QD=2.64;ReadPosRankSum=-2.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:97:97,0,186 Chr05 16133857 . G A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.50;MQ0=5;MQRankSum=-0.740;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.829 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:97:97,0,186 Chr05 16215810 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr05 16220864 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 16240979 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 16246546 . C T 34.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:63,0,26 Chr05 16248914 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 16299493 . G A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.59;MQ0=1;MQRankSum=-1.683;QD=12.08;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:68:149,0,68 Chr05 16314138 . T C 190.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.17;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:219,18,0 Chr05 16314151 . G A 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.17;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr05 16317265 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.80;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr05 16317277 . T A 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:57,0,33 Chr05 16317303 . C A 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:57,0,33 Chr05 16317354 . C T 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:57,0,30 Chr05 16335175 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 16337301 . A G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr05 16346470 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 16419013 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 16422504 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 16422605 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.78;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:83,6,0 Chr05 16449290 . G A 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr05 16641639 . T C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.82;MQ0=0;QD=16.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:92,9,0 Chr05 16716696 . G A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.29;MQ0=0;MQRankSum=1.134;QD=8.81;ReadPosRankSum=-2.141 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:134,0,184 Chr05 16764244 . A G 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.34;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:93,9,0 Chr05 16767941 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 16767955 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 16767968 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 16767969 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 16767981 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 16772351 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 16772547 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 16864455 . A C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.04;MQ0=1;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:54,6,0 Chr05 16864487 . T A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=6;MQRankSum=1.652;QD=7.25;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:35:137,0,35 Chr05 16864518 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=6;MQRankSum=1.652;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:38:110,0,38 Chr05 16864539 . T C 111.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=6;MQRankSum=1.221;QD=7.46;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:15:14:140,0,14 Chr05 16864540 . C T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.92;MQ0=6;MQRankSum=1.652;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:35:137,0,35 Chr05 16914508 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:53:53,0,304 Chr05 16914750 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,272 Chr05 16919508 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.99;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 16951214 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 16956380 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 16958166 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 16990595 . T C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.82;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr05 17051873 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 17058240 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 17062082 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 17062084 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 17067112 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 17073474 . T A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 17078961 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 17096498 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.94;MQ0=30;MQRankSum=0.736;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,2:33:6:84,6,0 Chr05 17148838 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 17148860 . A G 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=0;QD=12.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:91,9,0 Chr05 17148863 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.95;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:51,6,0 Chr05 17148891 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.95;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:51,6,0 Chr05 17153312 . T G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 17232127 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr05 17279579 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr05 17291206 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.99;MQ0=1;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:68,6,0 Chr05 17291225 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.99;MQ0=1;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:73,6,0 Chr05 17421504 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,341 Chr05 17506326 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 17599636 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.34;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 17611150 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:68,0,30 Chr05 17672977 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 17874751 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.43;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 17900930 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=38;Dels=0.00;FS=15.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.04;MQ0=0;MQRankSum=-3.863;QD=0.60;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:51:51,0,1111 Chr05 18025496 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.015;DP=72;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=9.43;MQ0=7;MQRankSum=-3.628;QD=0.29;ReadPosRankSum=-3.015 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,29:72:49:49,0,52 Chr05 18118359 . A G 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.54;MQ0=6;MQRankSum=-2.219;QD=6.12;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:94:120,0,94 Chr05 18386028 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 18386048 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 18386082 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 18411959 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 18427382 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 18468034 . C T 144.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:173,15,0 Chr05 18528995 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 18582360 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 18596548 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 18597984 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 18608429 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.86;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 18706483 . G A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.59;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=12.42;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:140,0,121 Chr05 18734252 . A T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr05 18734268 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr05 18806167 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 18810441 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=1;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr05 18810446 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.78;MQ0=1;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 Chr05 18810493 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.63;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:6:55,6,0 Chr05 18868969 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr05 18918749 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 18918820 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 18918831 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.20;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 18919407 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 18919603 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 18952109 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 18952162 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 19009481 . T A 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.71;MQ0=14;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,12:21:9:96,9,0 Chr05 19013909 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 19014306 . C A 175.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=19.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:68:204,0,68 Chr05 19015390 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 19050714 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.05;MQ0=1;QD=11.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:73,9,0 Chr05 19050723 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr05 19050730 . G A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr05 19050788 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr05 19050795 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr05 19161771 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,248 Chr05 19189763 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 19189804 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 19238761 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 19238877 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 19238901 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 19242883 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 19247347 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr05 19279775 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.16;MQ0=0;QD=3.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:65,6,0 Chr05 19345077 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 19357084 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 19387469 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 19388895 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 19405650 . T G 130.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.34;MQ0=0;QD=26.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:159,15,0 Chr05 19411983 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 19412015 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 19412220 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 19412258 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 19428515 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 19428586 . A G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr05 19430616 . A G 104.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.95;MQ0=11;QD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:132,12,0 Chr05 19467573 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 19521411 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 19521414 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 19521471 . A C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.33;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 19521540 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.07;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 19542294 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 19542301 . T A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr05 19542317 . C A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr05 19573254 . C T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.13;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr05 19592699 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 19592724 . A T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 19592746 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 19648021 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 19648022 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 19648047 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr05 19648063 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.92;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 19653188 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:75,0,33 Chr05 19653191 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:74,0,33 Chr05 19729650 . C A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr05 19732976 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 19738931 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 19779479 . G T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.699;DP=61;Dels=0.00;FS=17.820;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.528;QD=1.57;ReadPosRankSum=-4.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,8:61:99:124,0,1905 Chr05 19779483 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;DP=29;Dels=0.00;FS=13.752;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.664;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:63:63,0,932 Chr05 19795121 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr05 19796747 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 19797214 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 19806386 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 19841192 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.55;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr05 19841236 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.55;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr05 19859039 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 19873885 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 19900575 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.67;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,207 Chr05 19929276 . A G 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr05 19929291 . C T 220.84 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 20047609 . G T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.160;QD=3.58;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:157,0,1078 Chr05 20052601 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 20075030 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 20075125 . A G 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.13;MQ0=0;QD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:86,9,0 Chr05 20096901 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 20190832 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 20202223 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 20202706 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,99 Chr05 20265713 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.11;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 20350502 . A T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr05 20405845 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr05 20441940 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 20441977 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 20455217 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.85;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 20493035 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 20493124 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 20497061 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 20619858 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 20619861 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 20660325 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 20720224 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.62;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr05 20720259 . A C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.62;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr05 20765100 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 20765123 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 20765168 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 20818416 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.07;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 20832830 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 20838887 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr05 20842806 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 20880526 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 20880576 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 20889507 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 20889533 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 21422663 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.96;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 21466755 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 21518342 . C T 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.51;MQ0=0;MQRankSum=1.041;QD=8.18;ReadPosRankSum=-0.919 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:151,0,273 Chr05 21627723 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 21627803 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 21874128 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 22102106 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.90;MQ0=0;QD=3.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:7:6:52,6,0 Chr05 22149843 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.351;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.11;MQ0=10;MQRankSum=1.897;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,2:28:53:53,0,189 Chr05 22149855 . T C 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.9216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.75;MQ0=11;MQRankSum=-1.608;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:39:99:138,0,335 Chr05 22149861 . C T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=17.4381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.75;MQ0=11;MQRankSum=0.252;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:135,0,359 Chr05 22149927 . A C 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.148;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.16;MQ0=13;MQRankSum=0.252;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:138,0,350 Chr05 22201611 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 22258704 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr05 22261185 . C G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr05 22330358 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 22359471 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 22361865 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 22366121 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 22391923 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 22391924 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 22391928 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 22429540 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 22472334 . C G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr05 22645244 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr05 22646693 . A T 38.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.37;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:16:67,0,16 Chr05 22925169 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.142;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.73;MQ0=5;MQRankSum=-2.693;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:57:57,0,519 Chr05 22925211 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.087;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.45;MQ0=7;MQRankSum=-2.693;QD=1.07;ReadPosRankSum=1.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:57:57,0,572 Chr05 22954842 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 22954932 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 23032415 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 23038685 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 23056002 . C A 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr05 23069832 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.73;MQ0=13;QD=1.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,10:23:6:53,6,0 Chr05 23090401 . G A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 23097565 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.33;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:59,6,0 Chr05 23113735 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 23173158 . T C 127.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.46;MQ0=0;QD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:156,18,0 Chr05 23173160 . G A 127.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.46;MQ0=0;QD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:156,18,0 Chr05 23173173 . C T 127.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.46;MQ0=0;QD=21.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:156,18,0 Chr05 23221569 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 23221625 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 23221628 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 23221634 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.14;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr05 23227228 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 23227231 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 23246442 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 23268143 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.72;MQ0=27;QD=1.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:6:61,6,0 Chr05 23279829 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:74,6,0 Chr05 23281059 . C G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 23282471 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr05 23341435 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.92;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr05 23341444 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.92;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr05 23364471 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,135 Chr05 23364548 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr05 23381113 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 23497117 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.40;MQ0=2;QD=3.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,6:8:6:56,6,0 Chr05 23594393 . T C 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 23595829 . C T 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.48;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr05 23595865 . T C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.48;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr05 23595909 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr05 23616240 . A G 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr05 23619763 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 23628366 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr05 23655343 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.63;MQ0=43;QD=1.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,48:48:9:118,9,0 Chr05 23662813 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 23707131 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.09;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:25:104,0,25 Chr05 23707662 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr05 23720366 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 23720407 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 23720422 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 23791753 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 23792046 . T C 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.08;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr05 23792047 . G A 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.08;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr05 23825124 . A G 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr05 23825131 . C T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr05 23864395 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 23865539 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 23865640 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 23865694 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 23896192 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 23903184 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 23904239 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 23913844 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 23955330 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 23955332 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 23955401 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.21;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=5.15;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:53,6,0 Chr05 24008781 . A G 760.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:789,57,0 Chr05 24084975 . T C 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr05 24085020 . C T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr05 24085041 . A G 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr05 24116085 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 24116152 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 24201711 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 24202690 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 24202691 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 24206560 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 24212584 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 24245463 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 24245469 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 24263503 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.82;MQ0=1;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr05 24346685 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr05 24349750 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 24349762 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr05 24349772 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 24349783 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 24349807 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 24350129 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 24386041 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.62;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 24411926 . T C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr05 24411936 . G C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr05 24451484 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 24523458 . G C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr05 24534338 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr05 24577598 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 24608688 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.18;MQ0=1;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:84,6,0 Chr05 24608692 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.69;MQ0=23;QD=2.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,5:25:6:82,6,0 Chr05 24826934 . G T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr05 24914871 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.65;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 24914899 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.65;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 24914937 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.65;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 24977492 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.60;MQ0=1;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:65,6,0 Chr05 25070445 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 25131510 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.50;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 25154962 . A G 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:96,9,0 Chr05 25164743 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.23;MQ0=0;MQRankSum=0.312;QD=2.06;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:55:55,0,57 Chr05 25380972 . G A 147.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=24.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:176,18,0 Chr05 25406014 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.11;MQ0=0;QD=18.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:119,9,0 Chr05 25406020 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.11;MQ0=0;QD=19.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:124,9,0 Chr05 25503062 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.67;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 25556098 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr05 25563901 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr05 25607090 . T A 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:143,12,0 Chr05 25701914 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 25702238 . C T 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.80;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr05 25702253 . A C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.62;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr05 25848098 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,285 Chr05 25886504 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 25944229 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.829;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,546 Chr05 25967680 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 25970763 . G A 389.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:418,33,0 Chr05 25970869 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,66 Chr05 25970873 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,70 Chr05 25970884 . A C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,71 Chr05 25970890 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,71 Chr05 25970893 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,72 Chr05 25970894 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:52,0,71 Chr05 25971757 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,208 Chr05 25988572 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 26001578 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 26017794 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr05 26017819 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 26144145 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:97:97,0,1012 Chr05 26144241 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.002;QD=2.49;ReadPosRankSum=-3.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:99:103,0,937 Chr05 26158369 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.25;MQ0=0;QD=9.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 Chr05 26316349 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 26317561 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 26325835 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 26657237 . A G 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=1;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:84,9,0 Chr05 26657252 . C A 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=1;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:84,9,0 Chr05 26748207 . T C 171.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.48;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:200,18,0 Chr05 26748221 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 26748764 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 26789819 . C G 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr05 26848584 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 26862031 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.32;MQ0=12;QD=1.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:53,6,0 Chr05 26888014 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 26888411 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 26975528 . G C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr05 26999565 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 27005717 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.70;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 27009916 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=30.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 27033480 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 27039003 . C G 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.80;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr05 27039647 . C A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.70;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr05 27071040 . G A 119.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=23.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:148,15,0 Chr05 27092502 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 27177600 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 27177715 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 27177717 . G T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 27270316 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.46;MQ0=1;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:74,6,0 Chr05 27275566 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 27279594 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.15;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr05 27290396 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.22;MQ0=1;QD=1.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:6:77,6,0 Chr05 27291091 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 27366360 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 27372625 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 27449842 . T G 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=7.1995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,131 Chr05 27490745 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 27574611 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr05 27590008 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 27598361 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.51;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr05 27598415 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.51;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 27611150 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 27667985 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 27675288 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 27692852 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 27783779 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 27797229 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 27811950 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr05 27811952 . A C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 27824529 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 27842271 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.04;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 27856406 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.34;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 27867409 . T C 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.851;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.55;MQ0=3;MQRankSum=1.951;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:164,0,118 Chr05 27867410 . G A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=13;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.55;MQ0=3;MQRankSum=-2.383;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:77:77,0,196 Chr05 27929915 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 28026983 . C G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;DP=21;Dels=0.00;FS=16.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.090;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.299 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:104,0,599 Chr05 28026984 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;DP=21;Dels=0.00;FS=16.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.090;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:103,0,598 Chr05 28026987 . T C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;DP=21;Dels=0.00;FS=16.767;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.090;QD=3.61;ReadPosRankSum=-1.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:104,0,585 Chr05 28058185 . C T 80.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.18;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:109,0,19 Chr05 28058240 . A G 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.97;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr05 28069067 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 28100405 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 28117750 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.27;MQ0=0;QD=12.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:114,9,0 Chr05 28160068 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 28245129 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 28281067 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.85;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:169,12,0 Chr05 28289715 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 28303104 . G T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.34;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr05 28303115 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 28303116 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 28303784 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.05;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 28303787 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,69 Chr05 28358651 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 28359150 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 28405405 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr05 28406076 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 28428505 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 28436184 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 28436241 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 28488463 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 28510033 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 28540800 . T C 37.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.22;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:23:66,0,23 Chr05 28540807 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.22;MQ0=0;QD=15.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:104,9,0 Chr05 28615121 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 28622680 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:50,0,30 Chr05 28629545 . A G 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 28642787 . T A 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr05 28648794 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 28671112 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 28705393 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 28707955 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,422 Chr05 28710764 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 28726153 . G A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.39;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=10.31;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:86:121,0,86 Chr05 28787411 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 28811555 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 28832370 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:66,0,65 Chr05 28832980 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,131 Chr05 28859674 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 28860021 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 28869506 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 28877946 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.87;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 28891089 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 28891165 . T G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr05 28893652 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 28920561 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr05 29036123 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr05 29085560 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 29085592 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 29091268 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 29108187 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 29111520 . A G 67.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:95,12,0 Chr05 29205505 . G A 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.08;MQ0=13;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:105,9,0 Chr05 29252541 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.67;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 29263108 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 29289284 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 29348964 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 29390132 . G T 88.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.26;MQ0=3;MQRankSum=1.754;QD=8.80;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,5:10:12:116,12,0 Chr05 29405085 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 29452965 . A G 25.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:54,0,23 Chr05 29452978 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr05 29452979 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr05 29453003 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:54,0,33 Chr05 29453017 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:54,0,31 Chr05 29453024 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:54,0,32 Chr05 29453036 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:54,0,33 Chr05 29496328 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.60;MQ0=3;QD=8.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:69,6,0 Chr05 29660199 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.59;MQ0=1;QD=6.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:89,9,0 Chr05 29680592 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 29847192 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr05 29873978 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 29883145 . C G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 29907739 . G T 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.573;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.44;MQ0=1;MQRankSum=3.573;QD=3.53;ReadPosRankSum=1.825 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,5:43:15:180,15,0 Chr05 29907835 . C A 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.97;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=18.32;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,5:9:15:193,15,0 Chr05 29917890 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 29981328 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 29987063 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=6.06;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:101,0,290 Chr05 29987160 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,364 Chr05 30020467 . C A 69.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:113,9,0 Chr05 30053872 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr05 30069602 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 30079415 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 30115549 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 30115590 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 30123862 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 30123888 . A G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr05 30124147 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 30202729 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 30275099 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 30275228 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 30307273 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 30349124 . C A 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr05 30357136 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.616;DP=77;Dels=0.00;FS=17.461;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.828;QD=0.59;ReadPosRankSum=-4.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:74:74,0,2640 Chr05 30369555 . A T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:104,0,66 Chr05 30389228 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.93;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 30394176 . C A 327.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.83;MQ0=0;QD=33.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:356,27,0 Chr05 30418884 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.65;MQ0=0;QD=9.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:56,6,0 Chr05 30430157 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.50;MQ0=0;QD=5.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:48,6,0 Chr05 30469743 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 30486284 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 30486293 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 30500918 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 30617114 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,270 Chr05 30654845 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 30664224 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 30665819 . T G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.81;MQ0=0;MQRankSum=2.646;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:54:54,0,557 Chr05 30688259 . C T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=13;Dels=0.00;FS=22.175;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.89;MQ0=1;MQRankSum=2.404;QD=4.67;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:89:89,0,148 Chr05 30716487 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr05 30752791 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr05 30757629 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr05 30778895 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 30779770 . A C 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr05 30779807 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 30792491 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 30792514 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 30817808 . C A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:103,0,24 Chr05 30837491 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 30874000 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 30874062 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.03;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 30874392 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 30916193 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 30930798 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 30946532 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr05 30949109 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 30949400 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,440 Chr05 30949486 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:91:91,0,581 Chr05 30965789 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,354 Chr05 31006640 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 31104161 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 31125515 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 31134284 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 31136692 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 31138014 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 31142043 . G T 78.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 31235831 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 31235838 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 31251312 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,203 Chr05 31350899 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr05 31384820 . A C 56.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 31438025 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 31457661 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 31494533 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:136,0,62 Chr05 31522601 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 31522613 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 31534232 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 31564774 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 31564800 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 31564817 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 31612184 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 31612198 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 31612215 . C G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 31612238 . G C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr05 31614290 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 31625182 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 31628811 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:6:61:61,0,109 Chr05 31648827 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,244 Chr05 31655871 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:103,0,30 Chr05 31733100 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.36;MQ0=5;QD=4.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:59,6,0 Chr05 31753725 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 31851870 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 31908183 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 32028825 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 32159738 . C A 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr05 32168308 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 32168319 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 32186583 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 32232003 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 32238320 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 32303264 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 32366934 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 32391012 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 32392189 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 32396753 . C A 83.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 32834398 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 32858027 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 32872965 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 32893229 . T A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr05 32928982 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:88:88,0,216 Chr05 32961698 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 32992988 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:116,9,0 Chr05 33007311 . A T 476.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.504;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.5646;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.116;QD=31.80;ReadPosRankSum=1.504 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,14:15:13:505,13,0 Chr05 33007769 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33025300 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33029511 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.795;QD=0.93;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:58:58,0,980 Chr05 33034751 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 33034848 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=25;Dels=0.00;FS=7.959;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=1.95;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:77:77,0,766 Chr05 33036304 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 33036315 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 33036324 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 33040376 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33064888 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr05 33105940 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 33105941 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 33105947 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 33105964 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33105970 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33105974 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33106749 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 33106754 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 33106770 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.81;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 33106787 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.81;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 33120637 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 33167548 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 33168081 . T G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 33176965 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr05 33212588 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 33213574 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33284619 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 33284839 . G A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr05 33287178 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 33288186 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33288422 . G T 71.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:20:100,0,20 Chr05 33288519 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 33288583 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33288612 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 33288623 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 33289163 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33292285 . G T 40.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.55;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr05 33417219 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.26;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr05 33417232 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.26;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 33455001 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33455029 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33464079 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 33480776 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 33480777 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr05 33488152 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33488184 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33498724 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 33499925 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 33509144 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 33523763 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33541062 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33541084 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33541092 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33541109 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33621261 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 33627376 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.62;MQ0=2;QD=3.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:6:52,6,0 Chr05 33631839 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33711314 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33711334 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 33713594 . A T 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=6.27;ReadPosRankSum=2.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:116,0,330 Chr05 33727446 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 33735362 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=32;Dels=0.00;FS=2.043;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.507;QD=2.06;ReadPosRankSum=-2.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:94:94,0,917 Chr05 33741607 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 33781570 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33781603 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33781608 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 33785987 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,478 Chr05 33820640 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.723;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.663;QD=1.32;ReadPosRankSum=-3.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:81:81,0,1229 Chr05 33833015 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 33835533 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33857834 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33864410 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33869846 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33870605 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33870622 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33870657 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33870975 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr05 33874380 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr05 33878251 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 33879133 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 33879154 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr05 33879194 . G T 124.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 33933392 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 33942836 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 33949149 . A C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.33;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr05 33959436 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 33985448 . A C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 33991313 . G T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;DP=33;Dels=0.00;FS=11.137;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.284;QD=3.05;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:129,0,954 Chr05 33994687 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,364 Chr05 33996851 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 33996956 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33996957 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 33997011 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 33997249 . A T 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.207;DP=73;Dels=0.00;FS=30.147;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.347;QD=2.93;ReadPosRankSum=-5.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,12:73:99:242,0,2210 Chr05 34005905 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,100 Chr05 34022767 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 34022771 . A T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 34051936 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 34060593 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 34060603 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 34075715 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr05 34117418 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 34190097 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 34207876 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207882 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207887 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207894 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207902 . T G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207907 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34207908 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34208631 . C A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr05 34271138 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 34283519 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 34291033 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 34294311 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,662 Chr05 34308034 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr05 34312101 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.180 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,393 Chr05 34326939 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 34337481 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;DP=71;Dels=0.00;FS=20.679;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQ0=2;MQRankSum=0.187;QD=1.64;ReadPosRankSum=-4.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,9:71:99:145,0,2232 Chr05 34344607 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:99,0,66 Chr05 34365116 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,68 Chr05 34367593 . A G 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 Chr05 34386160 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.07;MQ0=1;QD=1.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:54,6,0 Chr05 34411367 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 34465054 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 34468073 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 34468099 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 34468123 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 34474615 . G A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.624;DP=45;Dels=0.00;FS=30.134;HaplotypeScore=4.2377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.06;MQ0=1;MQRankSum=2.958;QD=2.51;ReadPosRankSum=-3.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:99:141,0,451 Chr05 34489878 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 34516959 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.11;MQ0=4;MQRankSum=1.231;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:74,6,0 Chr05 34518654 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.34;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 34581002 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 34586268 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 34605795 . G C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,126 Chr05 34619538 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr05 34620167 . G A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.962;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:117,0,494 Chr05 34620177 . T A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.40;ReadPosRankSum=-2.321 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:120,0,455 Chr05 34620187 . T C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:112,0,472 Chr05 34620410 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.335;QD=4.12;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:123,0,649 Chr05 34667049 . C G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 34667057 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:125,9,0 Chr05 34671201 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=19;Dels=0.00;FS=8.016;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:69:69,0,614 Chr05 34728986 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 34730676 . A G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.34;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr05 34756521 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 34757212 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 34757213 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 34757229 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr05 34757253 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr05 34762927 . C A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 34777419 . T C 186.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:215,18,0 Chr05 34830711 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.21;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 34831377 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr05 34833871 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.228;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:115,0,251 Chr05 34841717 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 34867484 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;DP=28;Dels=0.00;FS=16.166;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.689;QD=1.31;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:65:65,0,888 Chr05 34909187 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr05 34913521 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,180 Chr05 34917548 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,180 Chr05 34922342 . A C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 34922368 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 34923479 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.131;DP=33;Dels=0.00;FS=14.768;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.800;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:53:53,0,1033 Chr05 34955557 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 34980483 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 34993905 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 34993911 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 34994632 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 34994840 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 34996626 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 35000714 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 35000732 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 35000740 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 35003652 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 35003727 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 35003747 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 35007010 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35007022 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35007036 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35013217 . G A 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr05 35013251 . C A 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr05 35013253 . G T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.97;MQ0=0;QD=27.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:165,12,0 Chr05 35020083 . C T 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr05 35041459 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 35041486 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 35041506 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr05 35069786 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35069801 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35069835 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 35069847 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 35071425 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,293 Chr05 35072165 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 35073059 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35073085 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35154805 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 35154808 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 35154877 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35172683 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 35172696 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 35172720 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr05 35172740 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr05 35172744 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 35173911 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35174538 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35183986 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 35184083 . C G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,107 Chr05 35201668 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr05 35201911 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35209844 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 35209849 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35209893 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 35219710 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr05 35219717 . G C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr05 35219719 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.10;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr05 35222947 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 35228302 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.51;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 35244486 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35247194 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 35247715 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 35248155 . C T 467.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5709;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.75;MQ0=0;QD=30.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:496,39,0 Chr05 35248500 . A T 152.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.97;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:181,15,0 Chr05 35248501 . A T 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.97;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr05 35254426 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35254574 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35263920 . C T 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr05 35273105 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35290143 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.438;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.651;QD=0.40;ReadPosRankSum=-3.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,6:59:52:52,0,1898 Chr05 35294333 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35309653 . C G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 35311614 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 35320987 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35320989 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35320997 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35321014 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35321484 . A T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=12;Dels=0.00;FS=6.818;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,284 Chr05 35323405 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35324846 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35347413 . G A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr05 35347432 . A G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr05 35347438 . A C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr05 35347459 . G C 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr05 35350282 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 35366792 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr05 35367469 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr05 35367477 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 35378292 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 35380821 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35395257 . A C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.75;MQ0=0;QD=1.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:57,6,0 Chr05 35395271 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr05 35451383 . T A 25.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:54,0,23 Chr05 35451409 . A G 26.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:55,0,23 Chr05 35451420 . C G 26.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.74;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:55,0,23 Chr05 35461993 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr05 35471080 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 35471158 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr05 35483990 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35490697 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 35520232 . G T 39.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:79,6,0 Chr05 35525347 . G T 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:67,0,25 Chr05 35539106 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35539129 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35539131 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35554784 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 35554793 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35554805 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35554917 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 35559862 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 35559873 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35559875 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35562401 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr05 35565266 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr05 35578543 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 35578553 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35588219 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr05 35588991 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35589010 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35602838 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35602876 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35615859 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,142 Chr05 35619324 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 35619328 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 35624709 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 35629519 . T A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.67;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr05 35629525 . G C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.67;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr05 35650379 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,101 Chr05 35651817 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 35666352 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35674699 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35687291 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr05 35688841 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35698573 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 35698615 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35698629 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 35700309 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35700337 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 35711787 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 35711808 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 35740356 . A T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 35768412 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35768469 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 35787257 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 35787265 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 35788650 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 35853959 . C A,T 177.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=52.83;MQ0=0;QD=22.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,5:8:97:287,175,166,112,0,97 Chr05 35855844 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35857326 . G T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,208 Chr05 35858863 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35858864 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35858885 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 35864941 . G T 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;DP=69;Dels=0.00;FS=29.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=2.13;ReadPosRankSum=-4.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,11:69:99:175,0,2116 Chr05 35865703 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35888507 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35914600 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 35924894 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 35927213 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35927242 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 35927716 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 35946668 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,217 Chr05 35946876 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:13:74:74,0,326 Chr05 36024548 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr05 36024797 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr05 36034031 . C T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr05 36039920 . C A 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.093;QD=12.21;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:187,0,248 Chr05 36060504 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,325 Chr05 36061293 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 36062153 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36062212 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 36062306 . T A 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 Chr05 36063496 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36074027 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr05 36074885 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 36077248 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 36077259 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 36077331 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36091149 . C T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9913;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 36091162 . C A 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 36096642 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 36151347 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 36154832 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:13:99:117,0,291 Chr05 36155886 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,224 Chr05 36164618 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=21;Dels=0.00;FS=13.757;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.352;QD=1.09;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:51:51,0,610 Chr05 36181178 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 36181863 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 36181903 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36188802 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,298 Chr05 36216179 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr05 36216190 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 36229907 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 36238564 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 36239048 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36243355 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36247628 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 36247633 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 36337634 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 36350625 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36365746 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 36365774 . T C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr05 36365777 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr05 36365795 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9946;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 36365813 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 36416868 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 36429522 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 36430991 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36459864 . C T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr05 36459870 . A G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr05 36489228 . G C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 36494478 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:84,6,0 Chr05 36507897 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36532429 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 36532476 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 36532479 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 36532497 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 36532777 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr05 36532820 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr05 36532836 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 36532843 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr05 36532928 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 36536965 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 36558247 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 36595736 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36604522 . G T 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=15.09;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:164,0,135 Chr05 36629553 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 36630075 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 36631086 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,258 Chr05 36638933 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 36658867 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 36660027 . C T 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.26;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr05 36660038 . A C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.26;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr05 36664075 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 36676878 . G A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr05 36676889 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,218 Chr05 36695698 . A T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=6.78;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:96:96,0,207 Chr05 36699070 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr05 36728810 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr05 36768556 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36776771 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 36792883 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:115,0,28 Chr05 36793663 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 36793664 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 36793681 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 36795875 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36795881 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36797595 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36806457 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr05 36806459 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr05 36807646 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 36811686 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36824295 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36824318 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36847293 . G T 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:137,0,25 Chr05 36848511 . T A 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=14.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:128,0,103 Chr05 36849471 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:68,0,72 Chr05 36849481 . A C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:54:54,0,72 Chr05 36851692 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 36873689 . G A 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr05 36874508 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36886758 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr05 36894978 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 36895012 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36895026 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 36895029 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 36896676 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr05 36896681 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr05 36896726 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr05 36910885 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 36910921 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr05 36910942 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 36910970 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr05 36932333 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,295 Chr05 36951355 . G A 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:148,0,27 Chr05 36952265 . T G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr05 36952357 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,216 Chr05 36953629 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36953634 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36953694 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 36960377 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 36960548 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr05 36961554 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36961597 . T C 81.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:110,0,22 Chr05 36964953 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr05 36964978 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr05 36964989 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr05 36965178 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 36965307 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 36965310 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 36965337 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 36965389 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 36982143 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr05 36982145 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr05 36982147 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr05 36982150 . A C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr05 36982541 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36982961 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 36995041 . A C 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=11;Dels=0.00;FS=7.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.678;QD=8.98;ReadPosRankSum=1.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:127,0,239 Chr05 36995053 . A G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=11.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=10.98;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:138,0,213 Chr05 36995163 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37002946 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,64 Chr05 37003011 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,72 Chr05 37003988 . G C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.97;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,208 Chr05 37006778 . C T 110.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22:139,0,22 Chr05 37007087 . T G 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:140,0,165 Chr05 37007088 . G C 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:140,0,177 Chr05 37007269 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37007293 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37007295 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37008552 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 37008656 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37008658 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37008663 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 37008675 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 37008677 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 37008683 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37013948 . C G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr05 37025833 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,172 Chr05 37090678 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,147 Chr05 37090721 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,214 Chr05 37099666 . C G 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr05 37113808 . G C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:10:55:55,0,191 Chr05 37116129 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr05 37122648 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37137687 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,136 Chr05 37142735 . T A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.540;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:125,0,338 Chr05 37147760 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,374 Chr05 37153831 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,301 Chr05 37163289 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:93:93,0,274 Chr05 37169841 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr05 37170015 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:64:64,0,150 Chr05 37171226 . G T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.576;QD=2.90;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:147,0,1272 Chr05 37171771 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,157 Chr05 37171997 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 37172014 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37173002 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr05 37177655 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 37177675 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 37177737 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 37187950 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37187963 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37203185 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.516;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:81:81,0,446 Chr05 37203294 . T C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;DP=17;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:110,0,466 Chr05 37227724 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:89,0,62 Chr05 37248382 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=47;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=0.78;ReadPosRankSum=1.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:65:65,0,1581 Chr05 37248383 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;DP=47;Dels=0.00;FS=1.764;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=0.76;ReadPosRankSum=0.880 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:64:64,0,1594 Chr05 37248396 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.494;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,5:46:71:71,0,1549 Chr05 37248410 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,5:46:64:64,0,1487 Chr05 37248426 . T G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.833;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.309 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:52:52,0,804 Chr05 37258013 . T G 123.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:152,0,27 Chr05 37268231 . C G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.38;MQ0=20;QD=1.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:9:89,9,0 Chr05 37272295 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,213 Chr05 37282498 . G A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:118,0,854 Chr05 37282499 . T A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;DP=28;Dels=0.00;FS=1.974;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.755;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.952 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:79:79,0,875 Chr05 37282505 . G C 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:123,0,868 Chr05 37309148 . T C 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.157 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:123,0,284 Chr05 37309153 . A G 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=7.60;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:127,0,316 Chr05 37312970 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,168 Chr05 37312996 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,185 Chr05 37325691 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,226 Chr05 37325700 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,223 Chr05 37325730 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,228 Chr05 37332410 . T G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,235 Chr05 37335925 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr05 37335959 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr05 37375695 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,258 Chr05 37376070 . G T 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.714;QD=3.19;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:40:99:156,0,1197 Chr05 37407165 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.250;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:104,0,529 Chr05 37407814 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr05 37414199 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37414200 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37414201 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37414202 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37414205 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37414223 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37420613 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,130 Chr05 37420965 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 37443878 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37449895 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,145 Chr05 37456447 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;DP=17;Dels=0.00;FS=2.667;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.701;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:68:68,0,456 Chr05 37468241 . T C 139.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:168,0,21 Chr05 37468395 . A C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:105,0,60 Chr05 37468406 . G C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:103,0,95 Chr05 37468436 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr05 37468439 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr05 37481224 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37481245 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37486804 . T G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.053;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:103,0,506 Chr05 37487814 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37492025 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37498413 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:58:58,0,549 Chr05 37498956 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.11;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:7:67:99,0,67 Chr05 37506830 . C T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:89:89,0,309 Chr05 37507650 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,148 Chr05 37507655 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,147 Chr05 37508210 . C T 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.465;QD=9.30;ReadPosRankSum=-2.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:205,0,410 Chr05 37558141 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37561754 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,126 Chr05 37565592 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37571931 . G C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr05 37575632 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,185 Chr05 37581578 . A C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:102,0,60 Chr05 37581603 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 37581604 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.88;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 37589589 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:98:98,0,1319 Chr05 37601056 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37618619 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 37633533 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37644653 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 37659396 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37659414 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 37659513 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 37663259 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37663293 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37663294 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37663336 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr05 37670885 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 37674053 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 37674077 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 37674114 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 37675440 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37710595 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37711153 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37717565 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr05 37730552 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37730557 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37730566 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37730567 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37730579 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 37730600 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 37730606 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37739128 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,182 Chr05 37740240 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37753632 . C A 179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.150;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=5.99;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:208,0,813 Chr05 37754665 . G A 262.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:291,21,0 Chr05 37754707 . A C 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 Chr05 37759357 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 37776437 . A C 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr05 37776455 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr05 37780288 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,184 Chr05 37795057 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 37795064 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 37818603 . C G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:56,0,27 Chr05 37818611 . G C 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:79,0,24 Chr05 37818617 . C G 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:79,0,25 Chr05 37818660 . C G 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:79,0,27 Chr05 37818662 . C T 107.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.66;MQ0=0;QD=21.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:136,15,0 Chr05 37818682 . G A 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:79,0,27 Chr05 37824704 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.116;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.384 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,35:37:57:67,0,57 Chr05 37828489 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37828865 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37837381 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-3.863;QD=2.26;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:114,0,1201 Chr05 37891327 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37902982 . G T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr05 37905868 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.06;MQ0=0;QD=15.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:118,9,0 Chr05 37905894 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.53;MQ0=0;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:9:117,9,0 Chr05 37905901 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.53;MQ0=0;QD=6.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:9:118,9,0 Chr05 37918969 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37918997 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37919002 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 37920088 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,171 Chr05 37920110 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,69 Chr05 37928562 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 37931403 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=1.60;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:57:57,0,557 Chr05 37957553 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 37957555 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 37964481 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,70 Chr05 37967144 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 37968390 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr05 37968410 . G A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr05 37968448 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37968667 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 37968693 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 37968725 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37968727 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 37988262 . A G 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=45.2436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.24;MQ0=0;MQRankSum=2.001;QD=4.59;ReadPosRankSum=2.274 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,10:37:99:198,0,725 Chr05 37997925 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 37997929 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 37997930 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38022551 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr05 38029787 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 38035657 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 38037730 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 38046774 . T A 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.47;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:175,0,22 Chr05 38062186 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 38063690 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr05 38066053 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38066069 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38067409 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr05 38077383 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 38082400 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;DP=61;Dels=0.00;FS=7.817;HaplotypeScore=1.9465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.303;QD=0.37;ReadPosRankSum=-2.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,6:61:51:51,0,1953 Chr05 38117847 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 38168085 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=11;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=18.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:11:88:237,0,88 Chr05 38175904 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:57:57,0,552 Chr05 38211957 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38216383 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 38226301 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 38226675 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr05 38227350 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 38227401 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 38228714 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 38228720 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 38229141 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38278741 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 38279788 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 38281009 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr05 38281789 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,105 Chr05 38283642 . G T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 38283645 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:123,9,0 Chr05 38283652 . C G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 38283658 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr05 38283660 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 38283666 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.23;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr05 38283708 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38283770 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38357452 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr05 38368395 . T C 140.03 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,129 Chr05 38543862 . G T 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.102;QD=3.75;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:122,0,742 Chr05 38565669 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 38606737 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38620847 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38620848 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38620849 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38620874 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 38620882 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38646466 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 38646487 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 38651382 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 38671817 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr05 38674152 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr05 38674179 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 38675098 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,134 Chr05 38677361 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 38689217 . G T 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=3.44;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:159,0,1158 Chr05 38694240 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 38704827 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr05 38711412 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=10;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.57;MQ0=2;MQRankSum=-1.221;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:64:64,0,183 Chr05 38711902 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr05 38711914 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr05 38711931 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr05 38711945 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr05 38711953 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr05 38711985 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,138 Chr05 38730028 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr05 38730035 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 38742801 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 38742840 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 38742841 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr05 38751948 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 38751966 . C T 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.65;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr05 38766948 . G C 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,146 Chr05 38784573 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38797535 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr05 38819955 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 38821361 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,223 Chr05 38845298 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 38845303 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 38845854 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.64;MQ0=1;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr05 38864868 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr05 38866826 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38866913 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 38870808 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:126,9,0 Chr05 38870998 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr05 38882160 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.201;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQ0=0;MQRankSum=3.580;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:62:62,0,1422 Chr05 38882390 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:103,0,61 Chr05 38883600 . C G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:52:100,0,52 Chr05 38883639 . T C 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr05 38889721 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.523;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.036;QD=1.73;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:27:75:75,0,813 Chr05 38892033 . C G 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 38897441 . T C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.54;MQ0=0;QD=6.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:71,9,0 Chr05 38898640 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.13;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr05 38899063 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.77;MQ0=23;QD=1.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:6:69,6,0 Chr05 38899105 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.77;MQ0=23;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:6:76,6,0 Chr05 38899111 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.77;MQ0=23;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:6:76,6,0 Chr05 38899115 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.77;MQ0=23;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:6:76,6,0 Chr05 38900073 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr05 38900136 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 38908990 . G C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr05 38909010 . G T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr05 38916011 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr05 38916019 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr05 38918072 . A T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.91;MQ0=3;MQRankSum=2.205;QD=1.68;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,2:23:6:66,6,0 Chr05 38925816 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr05 38934556 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.12;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr05 38938813 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.147;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.357 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:74:74,0,1270 Chr05 38938829 . G A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.197;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:89:89,0,1218 Chr05 38954199 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 38954391 . A T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:121,0,64 Chr05 38954411 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:130,0,66 Chr05 38954417 . A G 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:127,0,66 Chr05 38954430 . T C 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=15.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:123,0,66 Chr05 38954436 . T C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:103,0,67 Chr05 38954455 . G A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:89,0,67 Chr05 38959412 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 38976536 . G T 82.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:111,0,23 Chr05 38976550 . A T 82.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.53;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:111,0,24 Chr05 38976575 . G A 47.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:76,0,27 Chr05 38976578 . G A 47.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:76,0,27 Chr05 38979445 . T A 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;QD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 Chr05 38979470 . G T 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;QD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 Chr05 38979472 . G C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;QD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 Chr05 38979481 . T C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;QD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 Chr05 38979482 . G C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;QD=16.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:111,12,0 Chr05 38982659 . C T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:105,0,30 Chr05 38983810 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 38996159 . A G 172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;DP=36;Dels=0.00;FS=23.335;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.09;MQ0=0;MQRankSum=-4.457;QD=4.80;ReadPosRankSum=3.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:201,0,959 Chr05 38996171 . T A 170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;DP=26;Dels=0.00;FS=20.225;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQ0=0;MQRankSum=-4.028;QD=6.57;ReadPosRankSum=2.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,8:26:99:199,0,648 Chr05 39011724 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 39013324 . A T 182.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.03;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:10:210,0,10 Chr05 39013420 . C A 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr05 39054286 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr05 39084678 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,373 Chr05 39155046 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.006;QD=3.86;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:117,0,637 Chr05 39202782 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,142 Chr05 39206797 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr05 39206880 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,66 Chr05 39215331 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 39217330 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr05 39227728 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:135,0,101 Chr05 39227820 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 39231507 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.897;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,6:46:95:95,0,1521 Chr05 39232362 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:56:56,0,546 Chr05 39232423 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:88:88,0,340 Chr05 39232816 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 39232856 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr05 39233629 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:72,0,66 Chr05 39233646 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr05 39233647 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:72,0,67 Chr05 39246396 . A T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr05 39293101 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,255 Chr05 39373162 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 39373553 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.711;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:58:58,0,558 Chr05 39382236 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.705;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:102,0,619 Chr05 39382237 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.405 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:99:100,0,625 Chr05 39384116 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:95,0,29 Chr05 39384140 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr05 39403543 . G T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=11.20;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:129,0,121 Chr05 39405848 . C A 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:148,0,27 Chr05 39405852 . T A 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr05 39405864 . G T 109.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:138,0,23 Chr05 39405885 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr05 39406238 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,224 Chr05 39406270 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,260 Chr05 39406281 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,262 Chr05 39411353 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,150 Chr05 39411360 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,148 Chr05 39414095 . C G 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQ0=0;MQRankSum=-4.171;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.481 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:80:80,0,1289 Chr05 39417165 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,241 Chr05 39442502 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 39442531 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 39454533 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr05 39469193 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr05 39474635 . G A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,148 Chr05 39474658 . A G 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=2.398;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=8.40;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:129,0,287 Chr05 39482169 . G A 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.621 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,8:54:99:159,0,1627 Chr05 39493893 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr05 39497491 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:109,0,63 Chr05 39497516 . A G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:104,0,63 Chr05 39497523 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:55:97,0,55 Chr05 39497543 . A G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59:99,0,59 Chr05 39505816 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr05 39551265 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.88;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:109,0,850 Chr05 39561425 . G A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.368;QD=12.10;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:125,0,142 Chr05 39561436 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=7.85;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:91:91,0,147 Chr05 39712695 . A T 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.516;DP=20;Dels=0.00;FS=5.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=1.938;QD=7.14;ReadPosRankSum=-3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:171,0,456 Chr05 39712775 . C A 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.351;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=6.89;ReadPosRankSum=-3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:166,0,494 Chr05 39729779 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;DP=19;Dels=0.00;FS=5.927;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:97:97,0,549 Chr05 39731206 . C A 143.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:172,0,13 Chr05 39841506 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr05 39856638 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,142 Chr05 39866836 . C A 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.656;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.954 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:99:190,0,248 Chr05 39951743 . C A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.33;MQ0=4;QD=9.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:97,9,0 Chr05 39972966 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.67;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,219 Chr05 39976910 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr05 39982185 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40040134 . G C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,185 Chr05 40061460 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 40090102 . C A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr05 40090901 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40118473 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr05 40119607 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 40123599 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr05 40128119 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.43;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:88:88,0,236 Chr05 40195560 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,123 Chr05 40210806 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr05 40214575 . G T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.897;DP=36;Dels=0.00;FS=5.176;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.342;QD=2.77;ReadPosRankSum=-3.567 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:36:99:128,0,997 Chr05 40237242 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr05 40261688 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.540;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.431;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:93:93,0,1048 Chr05 40321608 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:70,0,32 Chr05 40322974 . G C 53.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40383366 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr05 40398685 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr05 40398693 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr05 40398926 . A G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr05 40398970 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 40399221 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr05 40400385 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40400390 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr05 40401817 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40401849 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr05 40406043 . C T 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 Chr05 40406046 . G A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr05 40414117 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 40414129 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr05 40415177 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr05 40415200 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 40427508 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,257 Chr05 40437430 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 40443335 . C T 81.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.56;MQ0=0;QD=20.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:109,12,0 Chr05 40448478 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 40491766 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr05 40500984 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr05 40501009 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr05 40501373 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr05 40503232 . G T 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.320;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=8.42;ReadPosRankSum=-3.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,7:21:99:205,0,506 Chr05 40503318 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.280;DP=33;Dels=0.00;FS=22.658;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:94:94,0,1015 Chr05 40503384 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 40503481 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr05 40514555 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr05 40565595 . G T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:198,0,156 Chr05 40621783 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr05 40623028 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr05 40660624 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.23;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:64:64,0,94 Chr05 40660647 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.40;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:64:64,0,106 Chr05 40671799 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=0;QD=3.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:54,6,0 Chr05 40671803 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=0;QD=3.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:54,6,0 Chr05 40672985 . T C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.10;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:85:85,0,162 Chr05 40676929 . C T 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.02;MQ0=0;QD=14.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:87,9,0 Chr05 40677046 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:96,0,30 Chr05 40677049 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:96,0,30 Chr05 40677055 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.73;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:30:97,0,30 Chr05 40677064 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:52:52,0,68 Chr05 40677066 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:54:54,0,69 Chr05 40677070 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:93,0,66 Chr05 40677088 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:63,0,67 Chr05 40677092 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,67 Chr05 40677575 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,187 Chr05 40677583 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,175 Chr05 40679837 . T C 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=11.78;ReadPosRankSum=-1.453 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:146,0,158 Chr05 40680359 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.97;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:63:63,0,158 Chr05 40700582 . T G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.84;MQ0=9;QD=2.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:62,6,0 Chr05 40700919 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,106 Chr05 40701054 . A T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:84:84,0,397 Chr05 40726071 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr05 40743070 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=7.86;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:99,0,174 Chr05 40743082 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:107,0,168 Chr05 40743083 . T C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:110,0,133 Chr05 40743088 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:107,0,159 Chr05 40743095 . C T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:102,0,154 Chr05 40743101 . G A 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr05 40744076 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 34887 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:59:97,0,59 Chr06 113461 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 134703 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 172473 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 266951 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 298001 . C A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.510;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.71;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:142,0,1284 Chr06 301697 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 310668 . C T 156.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:185,0,21 Chr06 310680 . A C 156.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:185,0,21 Chr06 310699 . G A 156.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:185,0,20 Chr06 321214 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.03;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 366067 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 366095 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 376153 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 376209 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 376215 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 376219 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 376230 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.91;MQ0=13;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:15:6:76,6,0 Chr06 397681 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 400766 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:64,0,30 Chr06 435697 . C G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 458182 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 487497 . G A 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 Chr06 513693 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 522321 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 541105 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 583966 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr06 583983 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 584008 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.69;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 597924 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 597933 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 597935 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 614039 . G T 34.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:74,6,0 Chr06 671448 . T C 608.82 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,18:19:19:637,19,0 Chr06 678036 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr06 711882 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.01;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr06 728420 . C T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 737162 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 737982 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.53;MQ0=2;QD=6.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:8:6:76,6,0 Chr06 748031 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr06 748034 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr06 748040 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr06 761232 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 797685 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.92;MQ0=2;MQRankSum=0.942;QD=2.49;ReadPosRankSum=2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:73:73,0,166 Chr06 803044 . G C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.55;MQ0=0;QD=24.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:148,12,0 Chr06 803058 . C T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.55;MQ0=0;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:150,12,0 Chr06 808655 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr06 839517 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.66;MQ0=1;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:66,6,0 Chr06 857724 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 861751 . C T 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.53;MQ0=8;MQRankSum=2.637;QD=3.95;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,4:21:12:111,12,0 Chr06 867371 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr06 890863 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 892088 . G T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.51;MQ0=0;QD=5.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:50,6,0 Chr06 939934 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 970510 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 970513 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 972134 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 987762 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 994649 . C A 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.672;DP=36;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.209;QD=4.49;ReadPosRankSum=-4.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:99:190,0,1025 Chr06 1034491 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr06 1063491 . A G 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.67;MQ0=0;QD=23.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:121,12,0 Chr06 1063512 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.67;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:32:62,0,32 Chr06 1126809 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 1126835 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 1126891 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 1221107 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 1227927 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 1227949 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 1229610 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 1262192 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 1282118 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr06 1293921 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.48;MQ0=3;MQRankSum=0.248;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:57:57,0,60 Chr06 1353878 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.84;MQ0=1;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:116,9,0 Chr06 1353964 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 1402169 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,66 Chr06 1418074 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 1482182 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 1482183 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.16;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 1490510 . C T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr06 1490514 . C G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr06 1540576 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 1553391 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 1567388 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 1620148 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr06 1640071 . G T 235.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.772;QD=15.72;ReadPosRankSum=-3.366 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,8:15:99:264,0,240 Chr06 1742386 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 1793472 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr06 1821937 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 1844056 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.715;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,274 Chr06 1844271 . A T 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.985;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQ0=1;MQRankSum=-4.101;QD=3.02;ReadPosRankSum=-4.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:170,0,1413 Chr06 1845488 . T C 73.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:102,0,23 Chr06 1932043 . C A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:171,0,59 Chr06 1932476 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 1941719 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.18;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 1965930 . C A 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.167;QD=3.90;ReadPosRankSum=-4.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:41:99:188,0,1190 Chr06 1966186 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 1983456 . G A 410.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:439,33,0 Chr06 2014013 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 2017206 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 2025383 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.14;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:69,0,64 Chr06 2025417 . G A 44.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:73,0,23 Chr06 2025424 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr06 2025472 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.15;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 2025613 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 2025686 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 2046417 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr06 2055395 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 2141071 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.28;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 2172183 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 2215927 . A G 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.63;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr06 2234786 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.44;MQ0=3;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:61,6,0 Chr06 2317052 . G A 64.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.29;MQ0=0;QD=9.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:92,12,0 Chr06 2317055 . G A 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.935;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.71;MQ0=9;MQRankSum=1.656;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.369 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,6:22:9:66,9,0 Chr06 2338976 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:52:74,0,52 Chr06 2339098 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.19;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:75:75,0,260 Chr06 2346979 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 2381069 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr06 2757354 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.74;MQ0=1;QD=15.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:103,9,0 Chr06 2763135 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 2799574 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 2811898 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 2821677 . T C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr06 2830440 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr06 2898782 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 3016500 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 3026235 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 3084383 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.167;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.775;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:67:67,0,562 Chr06 3084395 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.840;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.775;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:64:64,0,571 Chr06 3084423 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.837;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.77;MQ0=0;MQRankSum=-3.775;QD=1.56;ReadPosRankSum=1.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:64:64,0,579 Chr06 3084437 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.37;MQ0=0;MQRankSum=-3.775;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.301 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:24:64:64,0,565 Chr06 3084440 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.999;DP=27;Dels=0.00;FS=2.682;HaplotypeScore=4.0916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.843;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.757 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:27:58:58,0,637 Chr06 3084441 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.913;DP=27;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=4.0916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQ0=0;MQRankSum=-3.901;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:27:52:52,0,672 Chr06 3101819 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:73:73,0,236 Chr06 3101835 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:73:73,0,238 Chr06 3101839 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.663 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:73:73,0,232 Chr06 3101841 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.75;MQ0=0;MQRankSum=-2.520;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:73:73,0,240 Chr06 3101931 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.57;MQ0=1;MQRankSum=0.118;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:54:54,0,220 Chr06 3103588 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.64;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 3113227 . C A 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 3113252 . G A 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 3113878 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 3113947 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 3113971 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 3148932 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 3176743 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 3176754 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 3332515 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 3386372 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 3460831 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 3592747 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 3596879 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 3692908 . C A 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.63;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 Chr06 3696277 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 3710255 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 3724216 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.41;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 3753538 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.92;MQ0=2;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:51,6,0 Chr06 3934323 . C T 65.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.96;MQ0=6;MQRankSum=2.113;QD=3.46;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:24:94,0,24 Chr06 3958028 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=73;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.14;MQ0=71;QD=0.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:53,20:73:6:59,6,0 Chr06 4036020 . T C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.389;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.04;MQ0=23;MQRankSum=-0.903;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.115 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,26:41:46:85,0,46 Chr06 4095988 . C A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 Chr06 4101426 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 4173993 . C G 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr06 4221612 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr06 4269437 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.55;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr06 4334336 . A G 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.82;MQ0=2;MQRankSum=0.751;QD=1.89;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:6:48,6,0 Chr06 4334342 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.65;MQ0=4;MQRankSum=2.228;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,4:15:6:48,6,0 Chr06 4334697 . C T 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.92;MQ0=3;MQRankSum=2.037;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,2:21:26:75,0,26 Chr06 4369088 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 4388403 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr06 4393144 . T G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.34;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 4572814 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 4691720 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.466;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.077;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:115,0,323 Chr06 4713066 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 4714363 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.57;MQ0=1;MQRankSum=-0.574;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:51:51,0,649 Chr06 4714448 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;DP=62;Dels=0.00;FS=14.346;HaplotypeScore=3.5997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQ0=0;MQRankSum=-3.715;QD=0.87;ReadPosRankSum=-4.293 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:55,7:62:82:82,0,1955 Chr06 4717862 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.54;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 4718991 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:6:53,6,0 Chr06 4795141 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.22;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:72,0,33 Chr06 4857089 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 4873658 . G T 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.739;QD=7.10;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:149,0,439 Chr06 4918426 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.24;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49:64,0,49 Chr06 4918461 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:45:68,0,45 Chr06 4928624 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=-3.001;QD=2.75;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:75:75,0,476 Chr06 4935942 . A C 69.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=17.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:97,12,0 Chr06 4962223 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.617;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.190;QD=3.02;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:34:99:131,0,1009 Chr06 5043527 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 5086392 . G A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.28;MQ0=12;MQRankSum=-1.734;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,24:36:29:87,0,29 Chr06 5129810 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 5209045 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,105 Chr06 5228848 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,222 Chr06 5240340 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 5279571 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 5279717 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.74;MQ0=1;QD=1.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:6:48,6,0 Chr06 5320191 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:59,6,0 Chr06 5320198 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=0;QD=2.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:59,6,0 Chr06 5320237 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:59,6,0 Chr06 5320238 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:59,6,0 Chr06 5320240 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.600;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.239;QD=2.65;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,8:12:6:59,6,0 Chr06 5582742 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 5608002 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 5613108 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.62;MQ0=13;QD=2.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:71,6,0 Chr06 5628610 . T A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.23;MQ0=1;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:61,6,0 Chr06 5646662 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 5680876 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 5691106 . G T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=9.91;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:157,0,250 Chr06 5691202 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQ0=0;MQRankSum=-2.434;QD=4.10;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:18:99:102,0,466 Chr06 5754409 . A G 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.36;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:75,9,0 Chr06 5860390 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 5879648 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6105223 . T C 80.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.06;MQ0=0;QD=13.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:108,12,0 Chr06 6105723 . T G 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.40;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:93,9,0 Chr06 6105766 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.40;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 6259383 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr06 6259479 . C A 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr06 6260254 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 6307636 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 6316786 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 6452586 . A C 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:102,0,26 Chr06 6488940 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 6503396 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 6503428 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 6503463 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 6548554 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6561891 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 6573580 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;DP=73;Dels=0.00;FS=17.549;HaplotypeScore=7.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=-3.788;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.512 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,8:73:88:88,0,2330 Chr06 6573813 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.17;MQ0=0;QD=3.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:63,6,0 Chr06 6599738 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6599741 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6599808 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 6635840 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 6682964 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6683584 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 6683586 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 6688422 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 6688438 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 6688444 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 6688445 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 6706686 . C T 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:137,0,27 Chr06 6706689 . A G 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:147,0,26 Chr06 6721871 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 6722239 . A C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr06 6820929 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,139 Chr06 6821016 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 6822974 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,61 Chr06 6824084 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 6910927 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,140 Chr06 7075677 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 7075816 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 7075823 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 7089693 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 7095356 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 7118911 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 7118913 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 7118959 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 7163171 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr06 7167610 . A G 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.40;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:48,6,0 Chr06 7167631 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.40;MQ0=0;MQRankSum=2.162;QD=1.22;ReadPosRankSum=-2.012 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,2:17:6:48,6,0 Chr06 7167696 . G T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.78;MQ0=6;QD=2.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:48,6,0 Chr06 7177874 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 7223573 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr06 7240313 . G A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.18;MQ0=0;MQRankSum=2.927;QD=12.53;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:15:191,15,0 Chr06 7320189 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.06;MQ0=1;MQRankSum=1.666;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:54,6,0 Chr06 7353483 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 7361153 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr06 7394801 . T A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr06 7394802 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr06 7394804 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr06 7394820 . G A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr06 7397667 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 7397703 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 7533428 . G A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:139,0,27 Chr06 7533431 . G A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:138,0,27 Chr06 7533434 . G T 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:139,0,27 Chr06 7611797 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 7662065 . C G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr06 7782523 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.19;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 7810615 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.99;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:79,6,0 Chr06 7816799 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.82;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 7821445 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,102 Chr06 7821456 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,96 Chr06 7821457 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:67:68,0,67 Chr06 7821461 . A C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,98 Chr06 7821464 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,90 Chr06 7821485 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,97 Chr06 7821503 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,101 Chr06 7821506 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,95 Chr06 7821515 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:65:65,0,94 Chr06 7825224 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 7826369 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=21.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:113,9,0 Chr06 7849726 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 7850707 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 7850738 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 7851745 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr06 7851768 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 7851808 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 7851818 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 7851819 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 7851823 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 7887169 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 7887237 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 7955674 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 7955716 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 7959291 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 7970037 . T C 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr06 7970672 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.89;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 7970677 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.89;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 8042446 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.85;MQ0=7;MQRankSum=-0.289;QD=3.30;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:91:91,0,137 Chr06 8078711 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr06 8079804 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8080844 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,97 Chr06 8081547 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 8100226 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 8142403 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 8142430 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8144271 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr06 8145026 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 8145674 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 8163471 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr06 8226036 . A C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 8226061 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr06 8226076 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 8231682 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 8231728 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8231729 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 8231741 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 8285117 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.35;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 8291279 . T C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr06 8292225 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 8304459 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.52;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 8306077 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;DP=44;Dels=0.02;FS=2.530;HaplotypeScore=8.1673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.10;MQ0=10;MQRankSum=0.508;QD=0.70;ReadPosRankSum=-2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,11:43:59:59,0,454 Chr06 8306102 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.46;MQ0=3;MQRankSum=-2.546;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:71:71,0,319 Chr06 8306107 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.46;MQ0=3;MQRankSum=-1.775;QD=2.67;ReadPosRankSum=2.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:71:71,0,300 Chr06 8375939 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 8383643 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 8502792 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 8502803 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 8523926 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 8523935 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 8525835 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.56;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:64,6,0 Chr06 8527703 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.04;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=27.01;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:163,12,0 Chr06 8545774 . G T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.31;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr06 8667515 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 8667539 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 8667563 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 8667564 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 8667588 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 8670348 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 8670349 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 8670453 . T C 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 8670474 . G C 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 8670480 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 8670517 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 8714076 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 8724742 . T C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr06 8724785 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8728843 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 8728865 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 8738578 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 8747567 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 8747591 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 8759358 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 8759445 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 8762392 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 8763304 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 8763314 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 8763318 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 8763346 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.17;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8764371 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8764380 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8764385 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8764416 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8764425 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8764435 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.09;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr06 8937259 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 8998469 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr06 8998475 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr06 8998485 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.27;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 8998498 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr06 8998512 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr06 8998541 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 8998543 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 8998558 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.56;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 8998607 . A T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.63;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr06 8999337 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.56;MQ0=4;QD=7.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:71,6,0 Chr06 8999356 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr06 8999359 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr06 8999361 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.24;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr06 9006349 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9006365 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9017278 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,144 Chr06 9017299 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,162 Chr06 9017309 . T C 79.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:108,0,22 Chr06 9017318 . T C 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:74,0,27 Chr06 9017320 . C T 79.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.95;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:108,0,23 Chr06 9017335 . A C 77.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17:106,0,17 Chr06 9017365 . T A 34.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:63,0,22 Chr06 9018003 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 9068929 . C G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr06 9109693 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 9120003 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 9141113 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,105 Chr06 9141593 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,140 Chr06 9160763 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.945;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,514 Chr06 9170701 . G A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr06 9170720 . C T 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:107,0,27 Chr06 9175202 . G C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.446;DP=77;Dels=0.00;FS=21.105;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.694;QD=0.62;ReadPosRankSum=-4.549 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:76:76,0,2521 Chr06 9175386 . C A 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.15;MQ0=0;MQRankSum=3.175;QD=4.70;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:174,0,303 Chr06 9180877 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,160 Chr06 9227754 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,71 Chr06 9245930 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 9263587 . A G 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr06 9276556 . G T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr06 9309758 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9323539 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.89;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr06 9326676 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.71;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 9326746 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 9343370 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 9352757 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr06 9352765 . C T 216.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:245,18,0 Chr06 9353027 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr06 9356347 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 9398960 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9398967 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9398979 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9399003 . T G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr06 9399011 . A T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 9399030 . G T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 9399034 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 9399046 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 9514791 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,416 Chr06 9522393 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9646815 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 9655103 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 9655107 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 9663392 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9663396 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9663402 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9663417 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9663427 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 9701813 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.411;DP=84;Dels=0.00;FS=21.483;HaplotypeScore=1.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=0.32;ReadPosRankSum=-4.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:76,8:84:55:55,0,2863 Chr06 9709526 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 9709537 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 9709651 . C T 795.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:824,66,0 Chr06 9716420 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:71:71,0,852 Chr06 9731336 . C T 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.61;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr06 9731347 . A G 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.61;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr06 9783142 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 9783149 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 9786628 . G C 238.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 Chr06 9811156 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;DP=95;Dels=0.00;FS=24.629;HaplotypeScore=2.6794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.28;MQ0=38;MQRankSum=1.547;QD=0.56;ReadPosRankSum=-3.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:89,6:95:81:81,0,867 Chr06 9811242 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=20;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.35;MQ0=5;MQRankSum=2.526;QD=2.14;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:71:71,0,371 Chr06 9869680 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,235 Chr06 9882750 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 9920323 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 9945801 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:29:68,0,29 Chr06 9946651 . G A 739.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:768,57,0 Chr06 9952037 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.234;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.523;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:50:50,0,1128 Chr06 9968842 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 9968851 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10090437 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10090516 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,68 Chr06 10090597 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,183 Chr06 10091597 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 10092547 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 10123333 . T G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 10124004 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr06 10144636 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr06 10189195 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.405;QD=2.58;ReadPosRankSum=-2.852 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:85:85,0,665 Chr06 10233464 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 10258349 . A T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr06 10258361 . C G 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr06 10258364 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10294595 . T G 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:97:132,0,97 Chr06 10350920 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 10351562 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr06 10380086 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10395421 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395430 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395435 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395454 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395459 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr06 10395461 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395468 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395473 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 10395474 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr06 10418560 . A C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr06 10418598 . C G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr06 10418599 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr06 10418607 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=22.57;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:118,9,0 Chr06 10546309 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 10546331 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 10588193 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 10588279 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 10597657 . G A 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=17.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:115,12,0 Chr06 10607812 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.63;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 10613394 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 10639086 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr06 10652389 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.92;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:32:71,0,32 Chr06 10679744 . G T 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:116,9,0 Chr06 10694814 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:101,0,63 Chr06 10708856 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 10723974 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10723996 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 10724321 . C G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:11:50:50,0,291 Chr06 10831153 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 10954243 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.73;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:61,6,0 Chr06 10983072 . C G 44.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:84,6,0 Chr06 11087352 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 11087360 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr06 11087365 . T G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr06 11087373 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr06 11087392 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr06 11087393 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.37;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr06 11100919 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 11100936 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr06 11110935 . T A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.72;MQ0=0;QD=11.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:73,9,0 Chr06 11136240 . A C 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 11136270 . G A 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 11136274 . G A 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 11136285 . T C 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=22.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:140,15,0 Chr06 11136296 . A T 85.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.41;MQ0=0;QD=17.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:113,12,0 Chr06 11136304 . G A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr06 11211675 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.37;MQ0=3;MQRankSum=1.380;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:68,6,0 Chr06 11211679 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.10;MQ0=2;MQRankSum=1.380;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:73,6,0 Chr06 11232292 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 11232391 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr06 11232392 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr06 11232409 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr06 11256973 . C T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=14;Dels=0.00;FS=6.560;HaplotypeScore=8.9935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=4.91;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:97:97,0,346 Chr06 11290061 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 11303934 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 11305362 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 11305406 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 11331488 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 11351813 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr06 11361491 . G T 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.67;MQ0=0;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:67,9,0 Chr06 11361530 . T C 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.67;MQ0=0;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:67,9,0 Chr06 11361531 . T C 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.67;MQ0=0;QD=13.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:67,9,0 Chr06 11374258 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 11374279 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 11375961 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.72;MQ0=0;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr06 11383044 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 11383067 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 11460234 . C T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr06 11461351 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:34:74,0,34 Chr06 11461420 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:34:74,0,34 Chr06 11461429 . G T 88.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.43;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.82;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:117,15,0 Chr06 11471764 . G A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr06 11471779 . G A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr06 11471794 . C A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr06 11473025 . C A 183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:212,0,58 Chr06 11473045 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=13.10;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:133,0,133 Chr06 11498515 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 11503138 . G C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr06 11521226 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr06 11531853 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 11544066 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 11548202 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.28;MQ0=3;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr06 11564167 . A G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=15;Dels=0.00;FS=5.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:104,0,378 Chr06 11564175 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;DP=15;Dels=0.00;FS=5.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.849 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:99,0,384 Chr06 11580290 . G T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.05;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr06 11589911 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.41;MQ0=0;MQRankSum=1.176;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:78:78,0,676 Chr06 11592744 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 11779609 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11779619 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11779646 . A T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=9.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:66,6,0 Chr06 11779653 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11779676 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11779679 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11779680 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.93;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr06 11862361 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.16;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 11889918 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr06 11895441 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:65,0,29 Chr06 11896267 . G A 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr06 11898839 . G T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr06 11911458 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 11937129 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,302 Chr06 11948099 . A C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=37.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr06 11948139 . T C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr06 11952715 . C T 672.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:701,51,0 Chr06 11972136 . C T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr06 11972160 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr06 11972162 . G A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr06 11978963 . G T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:101,0,26 Chr06 11979046 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,138 Chr06 12025375 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 12039385 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.19;MQ0=1;QD=4.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:65,6,0 Chr06 12083562 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 12086623 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 12235560 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 12235562 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 12235564 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 12235585 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 12235614 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 12243667 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 12243730 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 12247057 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 12247933 . C A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;DP=22;Dels=0.00;FS=23.201;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.078;QD=4.58;ReadPosRankSum=-2.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:129,0,619 Chr06 12319216 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 12319860 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=0.84;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:55:55,0,967 Chr06 12323266 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr06 12323361 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,214 Chr06 12411875 . A T 2453.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9982;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=26.90;ReadPosRankSum=0.718 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,65:67:99:2482,121,0 Chr06 12412052 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 12417076 . C T 189.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:218,18,0 Chr06 12523418 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr06 12528044 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.36;MQ0=0;MQRankSum=1.077;QD=4.26;ReadPosRankSum=-3.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:105,0,409 Chr06 12546572 . T G 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.97;MQ0=0;QD=18.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:101,9,0 Chr06 12556931 . T G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.65;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr06 12556950 . T C 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9320;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.58;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr06 12557029 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 12584552 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 12584555 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 12588793 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 12588812 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 12601145 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 12601636 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 12640241 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 12640317 . A T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 12671527 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 12671619 . A G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.13;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr06 12710881 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.03;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 12710892 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.03;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 12710904 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.03;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 12710916 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.03;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 12710924 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.03;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 12785348 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 12785700 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 12806166 . T C 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr06 12876281 . G T 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:268,21,0 Chr06 12876377 . C A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr06 12879292 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 12914363 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 13121365 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 13162680 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.69;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr06 13162732 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.91;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 13183311 . T C 111.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.26;MQ0=28;MQRankSum=0.198;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:14:140,0,14 Chr06 13227688 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 13227693 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 13227695 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13227698 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 13227724 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 13228814 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13271174 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 13273185 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13273437 . G C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr06 13277437 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 13308996 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 13309029 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 13311150 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.48;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:94:243,0,94 Chr06 13311236 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 13319999 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 13320356 . T C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:112,0,69 Chr06 13337018 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 13339275 . T C 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.61;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr06 13395748 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=1;MQRankSum=0.067;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,240 Chr06 13445806 . T A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;DP=21;Dels=0.00;FS=24.123;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.740;QD=6.61;ReadPosRankSum=-3.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:167,0,530 Chr06 13448466 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr06 13467549 . C T 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr06 13470181 . T C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr06 13470212 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr06 13470229 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 13470243 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 13470283 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 13470290 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 13474053 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 13474489 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 13483246 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 13487131 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:104,0,58 Chr06 13488377 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13545798 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 13545821 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13559570 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr06 13595564 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 13656175 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 13656191 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 13656192 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 13693482 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;DP=66;Dels=0.00;FS=27.694;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.286;QD=0.62;ReadPosRankSum=-4.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:66:69:69,0,2091 Chr06 13693486 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.813;DP=77;Dels=0.00;FS=21.721;HaplotypeScore=15.9929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.125;QD=0.63;ReadPosRankSum=-4.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:69,8:77:77:77,0,2505 Chr06 13772389 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 13772390 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 13774553 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 13776075 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;DP=80;Dels=0.00;FS=17.408;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.79;MQ0=0;MQRankSum=4.531;QD=0.37;ReadPosRankSum=-4.627 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,8:80:58:58,0,1882 Chr06 13783793 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 13868942 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 13871490 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.58;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:84,0,28 Chr06 13909852 . G T 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr06 13913274 . G T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 13913336 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 13924477 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 13924481 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 13924495 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 13924516 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 13924530 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 13949743 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.57;MQ0=0;QD=2.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:60,6,0 Chr06 13949759 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.58;MQ0=0;QD=0.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,40:40:6:61,6,0 Chr06 13970216 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 13994484 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 14108669 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 14119001 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 14119056 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr06 14130940 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 14218311 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 14228162 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 14233913 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 14247750 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,72 Chr06 14313562 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 14313569 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:75,0,31 Chr06 14421435 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr06 14421440 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 14421456 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 14433681 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr06 14433698 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 14460725 . C T 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr06 14506920 . T C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr06 14506946 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr06 14507008 . A T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.60;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr06 14507020 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 14513783 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14599736 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.74;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr06 14645663 . A C 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:136,0,24 Chr06 14668091 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 14671061 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 14693644 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 14706595 . C T 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.137;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.14;MQ0=7;MQRankSum=2.693;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.411 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:27,3:30:9:102,9,0 Chr06 14706668 . C T 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.324;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.96;MQ0=8;MQRankSum=2.693;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,3:31:9:102,9,0 Chr06 14760728 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr06 14760743 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr06 14760745 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr06 14760785 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr06 14761643 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 14763310 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 14765526 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 14836634 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14837830 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 14848280 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14848291 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 14850242 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQ0=0;MQRankSum=-4.117;QD=0.87;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:39:62:62,0,1196 Chr06 14851993 . G T 1038.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9598;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,28:28:81:1067,81,0 Chr06 14852459 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 14852511 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14852521 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 14862637 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=1.68;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:50:50,0,364 Chr06 14895710 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:120,0,215 Chr06 14898351 . A T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,200 Chr06 14904758 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.87;MQ0=1;MQRankSum=-2.854;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:52:52,0,685 Chr06 14904777 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=13;Dels=0.00;FS=7.368;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.57;MQ0=1;MQRankSum=-2.793;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:67:67,0,264 Chr06 14910566 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.07;MQ0=0;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:65,6,0 Chr06 14926602 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=2;QD=23.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:168,12,0 Chr06 14929587 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 14933288 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=12.72;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:130,0,132 Chr06 14935283 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.152;DP=69;Dels=0.00;FS=17.249;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=1.04;ReadPosRankSum=-4.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,8:69:99:100,0,2293 Chr06 14982173 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,68 Chr06 14982369 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14982729 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14982750 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 14998460 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 15044781 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.95;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:45:67,0,45 Chr06 15044820 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr06 15044821 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr06 15094138 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 15116306 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,485 Chr06 15123150 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:118,9,0 Chr06 15130013 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 15140155 . C T 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 Chr06 15150384 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 15155202 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 15166973 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.46;MQ0=0;MQRankSum=2.301;QD=1.63;ReadPosRankSum=2.301 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,2:33:6:81,6,0 Chr06 15167113 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.14;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:47:71,0,47 Chr06 15167117 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.14;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:47:70,0,47 Chr06 15167118 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.14;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:47:71,0,47 Chr06 15167192 . C T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.33;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=16.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:41:146,0,41 Chr06 15167193 . A G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.25;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=13.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:44:109,0,44 Chr06 15223025 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.520;DP=108;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.18;MQ0=1;MQRankSum=3.370;QD=0.96;ReadPosRankSum=-4.081 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:101,6:108:99:132,0,937 Chr06 15227545 . G T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:175,0,23 Chr06 15306002 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 15382187 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.740;DP=27;Dels=0.00;FS=15.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.171;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:71:71,0,821 Chr06 15587290 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:100,0,102 Chr06 15609738 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr06 15900695 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr06 15931490 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,205 Chr06 15932652 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,126 Chr06 15951933 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr06 15957018 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,182 Chr06 15963438 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.380;DP=51;Dels=0.00;FS=2.375;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.233;QD=1.64;ReadPosRankSum=-3.955 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,7:51:99:112,0,1632 Chr06 16038176 . A T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr06 16044532 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 16054491 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,103 Chr06 16054494 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 16058195 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,159 Chr06 16095961 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,102 Chr06 16151956 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 16182683 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,273 Chr06 16244291 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 16244295 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr06 16254987 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 16266300 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16282080 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 16282113 . T A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr06 16305122 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 16305139 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 16330691 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr06 16340938 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 16370307 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 16390878 . T C 261.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:290,21,0 Chr06 16407553 . A T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 16407554 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 16408324 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 16408369 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 16419429 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 16419434 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 16419440 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16419451 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 16449119 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr06 16465761 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 16465775 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 16471900 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr06 16471909 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 16476700 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 16514313 . G C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.89;MQ0=3;MQRankSum=2.141;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.374 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,2:35:50:50,0,51 Chr06 16516788 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16519818 . C A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.53;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr06 16522317 . A C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr06 16570053 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 16604444 . G T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:134,0,27 Chr06 16604479 . A G 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:145,0,27 Chr06 16610060 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 16612034 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 16614534 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 16648728 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr06 16648962 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 16648963 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr06 16649361 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.72;MQ0=3;QD=10.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:78,6,0 Chr06 16662308 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 16662332 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 16662375 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 16663593 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 16663614 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 16663654 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16681678 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 16683723 . G C 30.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.77;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:23:59,0,23 Chr06 16695162 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98:137,0,98 Chr06 16695551 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 16716884 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16716891 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 16716893 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 16716899 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 16738443 . A C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.04;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 16738477 . A G 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.91;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr06 16738497 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 16738524 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:75,0,29 Chr06 16738525 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr06 16738526 . C T 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:74,0,26 Chr06 16745377 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.563;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.029;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:60:60,0,1001 Chr06 16746426 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,64 Chr06 16749707 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 16791677 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 16791682 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 16791731 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16846289 . T C 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr06 16855271 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 16855315 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 16873644 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 16912397 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 16921879 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 16922000 . A G 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr06 16931792 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,109 Chr06 16935010 . A C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 16935016 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 16935031 . T C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr06 16953384 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 16968629 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 17131489 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 17131519 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 17132408 . A G 207.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.88;MQ0=0;QD=25.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:236,24,0 Chr06 17146838 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17147730 . G A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr06 17151477 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 17174318 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 17205856 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 17205890 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 17205902 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17215542 . G C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.44;MQ0=1;MQRankSum=-1.485;QD=3.05;ReadPosRankSum=2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:74:74,0,263 Chr06 17215924 . G T 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=18;Dels=0.00;FS=5.563;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.464;QD=5.21;ReadPosRankSum=-3.056 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:122,0,448 Chr06 17216017 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr06 17318794 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17386504 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 17391049 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 17391833 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 17400052 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 17400062 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 17400072 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 17400127 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 17430431 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 17468154 . G T 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:68,0,23 Chr06 17486699 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 17490291 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17490302 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17490308 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17502522 . G T 37.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17511729 . A C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr06 17547663 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 17547665 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17547685 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 17554080 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17578454 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 17584298 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 17584327 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17594425 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.924;QD=3.71;ReadPosRankSum=-3.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:25:99:121,0,701 Chr06 17605269 . G T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr06 17605271 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr06 17665770 . G T 1014.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.538;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.039;QD=33.83;ReadPosRankSum=1.039 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,28:30:16:1043,16,0 Chr06 17676073 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17676600 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,129 Chr06 17685792 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17685806 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 17694472 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,105 Chr06 17694477 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,111 Chr06 17717198 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 17760834 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,254 Chr06 17761171 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;DP=29;Dels=0.00;FS=12.802;HaplotypeScore=1.9877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.194;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:59:59,0,934 Chr06 17761175 . A C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;DP=29;Dels=0.00;FS=12.802;HaplotypeScore=1.9877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.194;QD=1.03;ReadPosRankSum=-1.233 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:58:58,0,913 Chr06 17761209 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;DP=28;Dels=0.00;FS=12.357;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQ0=0;MQRankSum=-3.184;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:59:59,0,897 Chr06 17761232 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;DP=18;Dels=0.00;FS=11.635;HaplotypeScore=3.7763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQ0=0;MQRankSum=-2.725;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:54:54,0,510 Chr06 17763668 . A G 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr06 17764364 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 17785209 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17785227 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 17789068 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 17795976 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17797252 . C T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:128,0,332 Chr06 17797273 . C G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;DP=25;Dels=0.00;FS=15.079;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.927;QD=2.67;ReadPosRankSum=3.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:95:95,0,709 Chr06 17797282 . G C 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;DP=27;Dels=0.00;FS=17.258;HaplotypeScore=2.9660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=2.03;ReadPosRankSum=3.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:83:83,0,814 Chr06 17798187 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17803598 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 17894989 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:111,0,29 Chr06 17923623 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17923627 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17923628 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17923643 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17923663 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 17923786 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 17924918 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 17924921 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr06 17927923 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 17938226 . G A 282.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:311,24,0 Chr06 17946693 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr06 17947804 . G T 183.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.27;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:212,0,15 Chr06 17947900 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=7.92;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:147,0,365 Chr06 17952030 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 17963951 . G C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr06 17965213 . A C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:107,0,30 Chr06 17966458 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 17970048 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 17970056 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 17975877 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 17975908 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 17990919 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,147 Chr06 17992709 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;DP=27;Dels=0.00;FS=30.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:69:69,0,834 Chr06 17992805 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.498;DP=38;Dels=0.00;FS=23.992;HaplotypeScore=1.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:73:73,0,1226 Chr06 18019859 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 18019895 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 18027342 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 18028291 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 18035062 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 18059462 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.311;QD=2.86;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:16:74:74,0,408 Chr06 18065665 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 18065666 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 18065667 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 18065691 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 18065693 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 18066012 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr06 18079203 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:95:135,0,95 Chr06 18079376 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 18079396 . A C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr06 18079427 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 18079673 . C T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=21.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:182,0,60 Chr06 18079732 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;DP=21;Dels=0.00;FS=21.239;HaplotypeScore=3.8315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=1.47;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:59:59,0,672 Chr06 18079975 . T A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=13;Dels=0.00;FS=11.139;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.620;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:125,0,334 Chr06 18081179 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 18081180 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 18081185 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 18081201 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.40;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 18081296 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 18081307 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 18081308 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 18081319 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 18096566 . T A 67.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.82;MQ0=3;MQRankSum=-1.666;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,10:12:23:96,0,23 Chr06 18096583 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.05;MQ0=6;MQRankSum=-1.159;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:15:49:49,0,104 Chr06 18113235 . G A 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.35;MQ0=1;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:67,6,0 Chr06 18128909 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.56;MQ0=5;QD=4.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:64,6,0 Chr06 18132142 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr06 18157620 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 18173420 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 18214302 . T A 123.03 . 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A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.10;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 18505359 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.10;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 18505366 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.10;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 18506267 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 18506283 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.23;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 18558852 . T G 49.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.32;MQ0=1;QD=9.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:77,9,0 Chr06 18599164 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 18599207 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 18599210 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.02;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 18605571 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr06 18624800 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 18626400 . C T 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr06 18626410 . C G 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr06 18629078 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr06 18629124 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr06 18629131 . C T 133.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr06 18883036 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 18884657 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 18896752 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 18928380 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 18931920 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 18945576 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 18967829 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 18995194 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 18995249 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 19014536 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19015463 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 19022457 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 19029987 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 19029993 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 19030266 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19031523 . T A 249.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:278,21,0 Chr06 19032117 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 19042461 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 19072399 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 19095446 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 19095498 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 19106122 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 19143525 . G T 74.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.71;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:103,0,19 Chr06 19182674 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 19183566 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 19183656 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 19183661 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr06 19202680 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,216 Chr06 19208008 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 19208094 . T A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:120,0,278 Chr06 19234901 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 19234902 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 19234913 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 19234916 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 19234918 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 19243753 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:11:52:52,0,304 Chr06 19245314 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr06 19250983 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 19261663 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 19269636 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 19269861 . G C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr06 19271806 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19272843 . C A 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.67;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 Chr06 19273453 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 19273473 . T C 56.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.28;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:101,0,445 Chr06 19394010 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 19425980 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 19436324 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 19436330 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 19463472 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 19463496 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 19463548 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 19472174 . A C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr06 19482968 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19483020 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 19496315 . T G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=18;Dels=0.00;FS=6.662;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:58:58,0,524 Chr06 19497001 . G T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:135,0,25 Chr06 19506398 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr06 19523902 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 19535164 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 19539382 . A T 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=7.09;ReadPosRankSum=-3.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:170,0,485 Chr06 19539475 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,444 Chr06 19539830 . G T 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=19.42;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:97:203,0,97 Chr06 19561900 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 19561911 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 19566358 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 19567101 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;DP=69;Dels=0.00;FS=18.497;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=0.49;ReadPosRankSum=-4.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,7:69:62:62,0,2293 Chr06 19619657 . T G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,258 Chr06 19657829 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,111 Chr06 19694136 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 19694160 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 19743325 . A G 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.645;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.097 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:144,0,638 Chr06 19743538 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,175 Chr06 19743590 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.40;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,163 Chr06 19743859 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 19748369 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;DP=20;Dels=0.00;FS=30.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.752;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:66:66,0,608 Chr06 19748378 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;DP=20;Dels=0.00;FS=30.569;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.752;QD=1.79;ReadPosRankSum=2.646 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:64:64,0,604 Chr06 19748387 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=13;Dels=0.00;FS=24.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:88:88,0,359 Chr06 19748389 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.88;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:97:97,0,253 Chr06 19758199 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,265 Chr06 19774394 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 19790214 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.171;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.866;QD=2.45;ReadPosRankSum=-4.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:136,0,1389 Chr06 19792113 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:107,0,106 Chr06 19809729 . G A 46.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:68,0,27 Chr06 19849425 . A C 35.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:64,0,22 Chr06 19854400 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19870824 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19873879 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 19893505 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 19899738 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19899764 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 19924368 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,480 Chr06 19925417 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr06 19938259 . A C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 19961004 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 19961045 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 19971965 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr06 19973197 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 20013006 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20018178 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 20048369 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20048627 . G A 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:107,0,27 Chr06 20143209 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 20146917 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr06 20148388 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr06 20148400 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 20148406 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr06 20153075 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=25.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:69:69,0,410 Chr06 20153076 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;DP=14;Dels=0.00;FS=25.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=2.91;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:69:69,0,405 Chr06 20153082 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=25.611;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.713 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:69:69,0,395 Chr06 20153119 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=2.91;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:69:69,0,383 Chr06 20156820 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 20166272 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,88 Chr06 20176803 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 20209816 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20211178 . A G 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=19.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:63:145,0,63 Chr06 20211215 . G C 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr06 20211218 . G C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr06 20213927 . G A 46.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.61;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:75,0,18 Chr06 20218653 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20244455 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 20267287 . T G 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:112,9,0 Chr06 20320202 . T C 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.133;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=8.48;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:147,0,302 Chr06 20328205 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.754;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=1.47;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:59:59,0,551 Chr06 20355279 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,178 Chr06 20362139 . C A 49.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,105 Chr06 20456078 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 20456239 . C A 172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.752;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.530;QD=4.94;ReadPosRankSum=-4.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:201,0,996 Chr06 20457096 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.483;DP=25;Dels=0.00;FS=9.048;HaplotypeScore=1.6649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=1.87;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:75:75,0,760 Chr06 20512759 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20524934 . A T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.04;MQ0=6;MQRankSum=-2.986;QD=7.76;ReadPosRankSum=-0.113 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:26:99:230,0,244 Chr06 20526000 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=6.26;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:18:99:141,0,413 Chr06 20531599 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 20536019 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20542000 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 20544671 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 20560038 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr06 20594038 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 20594082 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.89;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 20594116 . C G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.89;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 20615198 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20615256 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 20618265 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 20620025 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 20620054 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 20625073 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 20638061 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 20638063 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 20638102 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 20646751 . C G 36.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr06 20752995 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 20760453 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 20760480 . C G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 20788477 . G A 178.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:16:207,0,16 Chr06 20788514 . G A 192.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr06 20813643 . C G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:93,0,95 Chr06 20814783 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20815485 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 20839201 . C T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:45:133,0,45 Chr06 20887993 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888016 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888021 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888024 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888027 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888046 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888048 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20888054 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 20889323 . G C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:86:108,0,86 Chr06 20889328 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:107,0,96 Chr06 20889514 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,246 Chr06 20889855 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20889887 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20890680 . C G 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:98:175,0,98 Chr06 20891823 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 20896003 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,141 Chr06 20896657 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,236 Chr06 20905066 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr06 20907894 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 20907907 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 20907931 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20907941 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20907942 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20907947 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20907956 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 20907966 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20908107 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 20908357 . C A 46.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20949802 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 20969042 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 20971511 . T A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=1;QD=13.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:83,9,0 Chr06 20972497 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 20974775 . C T 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 21075505 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 21075516 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 21079817 . C T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr06 21079855 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:210,15,0 Chr06 21087511 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21103203 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 21112390 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 21148162 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 21148178 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 21148454 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 21150916 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 21152955 . G C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr06 21152956 . G T 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr06 21154129 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21177094 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21188589 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.355;DP=27;Dels=0.00;FS=5.787;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.355;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:71:71,0,838 Chr06 21188876 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr06 21203085 . C G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:49:49,0,181 Chr06 21203474 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21210703 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:100,0,65 Chr06 21247435 . G T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr06 21247883 . G T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:100,0,24 Chr06 21248071 . A T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 21252935 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21252951 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21252998 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21254585 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,178 Chr06 21264242 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21269668 . G T 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.85;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr06 21269676 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.01;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr06 21269744 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.01;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr06 21269755 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.01;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr06 21284728 . A T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.868;QD=4.28;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:101,0,414 Chr06 21300668 . G T 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.307;QD=4.73;ReadPosRankSum=-3.992 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,7:31:99:175,0,884 Chr06 21302094 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr06 21303583 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 21303585 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21303601 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21304202 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21304242 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21309233 . A T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.60;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:8:97:97,0,101 Chr06 21340555 . G A 41.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:13:70,0,13 Chr06 21341812 . G T 170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=21.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:58:199,0,58 Chr06 21360209 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr06 21360414 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21412028 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21412052 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21422234 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 21425020 . T G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr06 21436106 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 21436377 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr06 21438734 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 21438762 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 21464388 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 21470058 . A T 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.074;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.336;QD=3.97;ReadPosRankSum=-4.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:99:187,0,1185 Chr06 21480033 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21490858 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 21494258 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 21496177 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;DP=16;Dels=0.00;FS=27.482;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:63:63,0,492 Chr06 21507792 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 21532128 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21549730 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21549749 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21549763 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 21549783 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21558625 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 21562085 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21579928 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21579929 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21587034 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 21587550 . G T 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr06 21587560 . G C 148.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:177,0,21 Chr06 21620079 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.62;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:78,6,0 Chr06 21620085 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.62;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:62,6,0 Chr06 21628975 . C G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.05;MQ0=13;MQRankSum=-1.268;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:104,0,124 Chr06 21631097 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 21631108 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.12;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 21632154 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21647542 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr06 21654614 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.71;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21680871 . G T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.729;QD=15.31;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:166,0,137 Chr06 21681847 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;DP=43;Dels=0.00;FS=59.834;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:63:63,0,1310 Chr06 21688533 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21697380 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21711453 . A T 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr06 21711721 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21749284 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.034 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,324 Chr06 21751861 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 21752031 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21752569 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 21781827 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.580;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,253 Chr06 21787794 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21787796 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21787873 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 21788363 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 21834438 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 21869642 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr06 21869729 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr06 21891469 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 21896054 . G A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr06 21906793 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21906861 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21921546 . G T 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr06 21922924 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21931495 . C A 549.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:578,45,0 Chr06 21933252 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21936155 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 21937168 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,133 Chr06 21950578 . C T 587.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=11.9880;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.74;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:45:616,45,0 Chr06 21953143 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21954567 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr06 21954639 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 21955387 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21956424 . T G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr06 21972862 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 21979727 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 21985073 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21985075 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 21985096 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 21985129 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 21985767 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 21985826 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,220 Chr06 21992595 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 22004750 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22004755 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22004825 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22007113 . G C 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr06 22023674 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22023676 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 22023680 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22024183 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 22051602 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,101 Chr06 22052603 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr06 22057745 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 22057784 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22061656 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22094872 . A T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.303;DP=31;Dels=0.00;FS=52.302;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=1.57;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:77:77,0,952 Chr06 22107509 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 22107537 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 22107552 . C G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr06 22108619 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22111950 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22112880 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 22113466 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 22163479 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 22163560 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.800;DP=25;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.781;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,683 Chr06 22186793 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22189335 . C A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr06 22191031 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 22198992 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 22210445 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 22212111 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 22212115 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 22212136 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 22226479 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.251;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.256;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,631 Chr06 22230803 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22266753 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,242 Chr06 22293758 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 22304980 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,254 Chr06 22318714 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22320278 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 22320838 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.830;QD=2.56;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:23:87:87,0,673 Chr06 22323940 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22323946 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 22323953 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22323956 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 22333786 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22336090 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 22342351 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 22356400 . A T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr06 22356422 . G T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr06 22360525 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22360579 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22360581 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 22366360 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22388017 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr06 22396036 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 22396133 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 22418195 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 22421530 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 22426788 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.868;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,397 Chr06 22437692 . G T 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.850;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.797;QD=2.49;ReadPosRankSum=-3.947 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:138,0,1385 Chr06 22470650 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 22470938 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22472530 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 22484164 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 22484169 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22512714 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 22525727 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22547497 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 22558557 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr06 22594014 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:101,0,61 Chr06 22594111 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr06 22634453 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22634465 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 22643623 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 22646484 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,181 Chr06 22647978 . T A 279.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:308,24,0 Chr06 22647979 . T A 276.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.24;MQ0=0;QD=34.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:305,24,0 Chr06 22648960 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr06 22649014 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 22669893 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22669915 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 22669932 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 22669938 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22671626 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.837;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.929;QD=1.90;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:34:93:93,0,1023 Chr06 22697567 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 22705818 . G A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr06 22721311 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 22721412 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 22721574 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:157,12,0 Chr06 22721585 . A T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr06 22721628 . T A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:160,12,0 Chr06 22721629 . A T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr06 22722061 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,109 Chr06 22722150 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 22739591 . G T 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr06 22740554 . C A 69.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:112,9,0 Chr06 22779830 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,147 Chr06 22790765 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.819;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,514 Chr06 22790862 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr06 22790921 . G C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr06 22801576 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 22866981 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 22873848 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 22875906 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 22899735 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.613;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:69:69,0,1273 Chr06 22899821 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 22907988 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.752;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:99,0,493 Chr06 22938240 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 22970557 . G C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 22991400 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,202 Chr06 22991497 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,144 Chr06 23012474 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 23012476 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 23012481 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 23012669 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 23015773 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:99,0,63 Chr06 23059017 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.330;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.087;QD=0.48;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:51:51,0,1576 Chr06 23065282 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.775;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.525;QD=3.51;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:137,0,933 Chr06 23092595 . G T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr06 23103754 . G T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr06 23109663 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 23109695 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 23109714 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 23193418 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:122,9,0 Chr06 23234050 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,430 Chr06 23324358 . G T 185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;DP=30;Dels=0.00;FS=5.425;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.586;QD=6.19;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:214,0,741 Chr06 23353464 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.462;DP=49;Dels=0.00;FS=5.019;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.669;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.797 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,6:49:78:78,0,1592 Chr06 23395795 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 23435407 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 23490897 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=1.36;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:30:69:69,0,919 Chr06 23490977 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=1.57;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:45:99:99,0,1412 Chr06 23491918 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 23540390 . C A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:161,0,135 Chr06 23542898 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr06 23608076 . C A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr06 23618715 . G C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:53:53,0,70 Chr06 23659747 . C A 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=36;Dels=0.00;FS=5.191;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.548;QD=5.77;ReadPosRankSum=-3.434 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,9:36:99:236,0,971 Chr06 23676597 . C A 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=11.25;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:152,0,194 Chr06 23706098 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,129 Chr06 23722172 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 23773649 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,63 Chr06 23814635 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:62,0,31 Chr06 23830152 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,144 Chr06 23893097 . C A 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:68,0,25 Chr06 23919834 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 23957443 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.69;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr06 23957452 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.69;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr06 23957536 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.96;MQ0=1;MQRankSum=-3.137;QD=1.43;ReadPosRankSum=1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:64:64,0,147 Chr06 23957566 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.96;MQ0=1;MQRankSum=-3.137;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.433 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:60:60,0,147 Chr06 23957590 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.96;MQ0=1;MQRankSum=-3.137;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,21:25:66:66,0,133 Chr06 23957594 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.137;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.116 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:64:64,0,133 Chr06 23957600 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.426;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.137;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:62:62,0,133 Chr06 23957604 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.52;MQ0=0;MQRankSum=-3.137;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,20:24:63:63,0,133 Chr06 23987723 . T G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:100,0,145 Chr06 23989886 . G T 111.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=18.63;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:6:26:140,0,26 Chr06 24000846 . G C 34.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:74,6,0 Chr06 24026728 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 24053076 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 24099530 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 24153535 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 24155053 . G T 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.732;QD=11.34;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:221,0,359 Chr06 24176300 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 24179079 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 24191891 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 24226910 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 24227247 . T G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr06 24260627 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 24260723 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,143 Chr06 24315076 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 24348698 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.060;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.194;QD=2.16;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:80:80,0,746 Chr06 24352374 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 24367127 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 24370332 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr06 24375182 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,546 Chr06 24387546 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr06 24408820 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,91 Chr06 24409125 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 24449328 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.33;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr06 24449587 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.52;MQ0=19;QD=2.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,2:21:6:75,6,0 Chr06 24467439 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=14.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,214 Chr06 24468683 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 24468749 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 24468968 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.57;MQ0=1;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:63,6,0 Chr06 24492296 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,59 Chr06 24635073 . C G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.51;MQ0=2;MQRankSum=-1.537;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,102 Chr06 24645337 . G T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:103,0,24 Chr06 24645433 . C A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr06 24674875 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,132 Chr06 24705541 . C G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;DP=18;Dels=0.00;FS=5.035;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.066;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,534 Chr06 24705904 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 24737573 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 24741253 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;DP=79;Dels=0.00;FS=21.727;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=0.54;ReadPosRankSum=-4.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:79:71:71,0,2587 Chr06 24744456 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 24745690 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 24757815 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,408 Chr06 24796356 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 24821680 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.779;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:99,0,969 Chr06 24849264 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.406;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.618;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:69:69,0,1355 Chr06 24885486 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 24938828 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 24969578 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 24983700 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,234 Chr06 24983796 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=20;Dels=0.00;FS=10.620;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.276;QD=3.24;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:93:93,0,545 Chr06 25009208 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=7.72;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:90:90,0,183 Chr06 25035895 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=3.41;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:76:76,0,363 Chr06 25077642 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr06 25077688 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr06 25098796 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 25119380 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.76;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:72,6,0 Chr06 25146301 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr06 25148500 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,65 Chr06 25148513 . A C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,93 Chr06 25148523 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,106 Chr06 25167336 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;DP=17;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.315;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:74:74,0,530 Chr06 25177067 . C G 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.95;MQ0=0;QD=17.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:98,9,0 Chr06 25177074 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.95;MQ0=0;QD=17.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:97,9,0 Chr06 25177076 . C T 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.72;MQ0=0;QD=18.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:121,12,0 Chr06 25177083 . G A 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.72;MQ0=0;QD=18.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:121,12,0 Chr06 25189883 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.079;QD=2.81;ReadPosRankSum=2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:76:76,0,534 Chr06 25207024 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 25207159 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 25207174 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 25216766 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 25216934 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 25216963 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 25218073 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 25219126 . G A 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr06 25219130 . T G 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr06 25247920 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,104 Chr06 25249376 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 25249386 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr06 25314359 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,180 Chr06 25321343 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 25321406 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 25325047 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 25325695 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 25333276 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr06 25342985 . C T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr06 25342986 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr06 25386986 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,216 Chr06 25438766 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 25452256 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=8.22;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:94:94,0,176 Chr06 25454610 . G C 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:86:86,0,298 Chr06 25461572 . A T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.981;QD=4.46;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:104,0,424 Chr06 25475540 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:94:94,0,296 Chr06 25475570 . C G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:90:90,0,296 Chr06 25479892 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;DP=79;Dels=0.00;FS=24.952;HaplotypeScore=8.9951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.733;QD=0.96;ReadPosRankSum=-4.868 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:70,9:79:99:104,0,2632 Chr06 25486541 . C A 200.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=8.37;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:229,0,492 Chr06 25496767 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,187 Chr06 25497626 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,203 Chr06 25498108 . C G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,258 Chr06 25533801 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,72 Chr06 25554340 . T C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:81:81,0,359 Chr06 25561046 . G A 63.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:15:92,0,15 Chr06 25570998 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:60:60,0,95 Chr06 25591446 . C A 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.372;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.016;QD=3.52;ReadPosRankSum=-4.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,8:42:99:176,0,1272 Chr06 25602578 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.231;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:117,0,327 Chr06 25610169 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:63:63,0,485 Chr06 25643972 . A T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:103,0,24 Chr06 25644369 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 25680633 . T C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.395;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.482 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:94:94,0,440 Chr06 25689124 . T A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.285;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.195 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:171,0,332 Chr06 25689251 . G C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,169 Chr06 25708874 . C G 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.794;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:81:81,0,456 Chr06 25712416 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 25766228 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr06 25766325 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:82:82,0,251 Chr06 25788825 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr06 25817044 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,141 Chr06 25819847 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 25820158 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 25834852 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.055;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,665 Chr06 25840403 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,185 Chr06 25869442 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.34;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 25869444 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.34;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 25898651 . C A 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr06 25908824 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,111 Chr06 25908852 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,210 Chr06 25935609 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:67,0,60 Chr06 25938687 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,215 Chr06 25946635 . A G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.934;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:83:83,0,411 Chr06 25946709 . C A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:139,0,24 Chr06 25951220 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,217 Chr06 25964924 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr06 25968691 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr06 25970603 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr06 25971749 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr06 25974813 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,242 Chr06 25974831 . A C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,244 Chr06 25974948 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:74:74,0,275 Chr06 25974965 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-2.855;QD=3.29;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:71:71,0,305 Chr06 25975520 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr06 25975526 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr06 25975538 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr06 25975563 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr06 25975571 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr06 25975606 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 25975973 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:83:83,0,214 Chr06 25976021 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:95:95,0,212 Chr06 25981005 . T A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:121,0,286 Chr06 25981345 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,128 Chr06 25984209 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,252 Chr06 25989347 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.370 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:88:88,0,286 Chr06 25992777 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;DP=33;Dels=0.00;FS=9.238;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=1.08;ReadPosRankSum=2.510 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:64:64,0,1050 Chr06 26007212 . G A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.386;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:81:81,0,209 Chr06 26007230 . C G 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.30;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:94,0,65 Chr06 26025456 . G T 46.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.65;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:14:75,0,14 Chr06 26034696 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.592;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.844;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:50:50,0,1111 Chr06 26036367 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,265 Chr06 26049901 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr06 26067341 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 26067407 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 26068601 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 26107622 . T G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,141 Chr06 26119977 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 26127933 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 26129355 . T C 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.64;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:88:88,0,204 Chr06 26129657 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,409 Chr06 26196531 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.185;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:61:61,0,312 Chr06 26219800 . T A 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;DP=35;Dels=0.00;FS=6.582;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.010;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:182,0,1002 Chr06 26307121 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,99 Chr06 26319392 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,166 Chr06 26365132 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,147 Chr06 26365219 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,175 Chr06 26379784 . G T 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:162,0,172 Chr06 26403645 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,706 Chr06 26404085 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=38;Dels=0.00;FS=35.390;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=1.41;ReadPosRankSum=-3.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:82:82,0,1184 Chr06 26404351 . G T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;DP=19;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=5.41;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:131,0,496 Chr06 26438949 . G T 197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.699;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.427;QD=7.91;ReadPosRankSum=-3.990 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,8:25:99:226,0,616 Chr06 26445693 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.037;QD=7.89;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:115,0,249 Chr06 26488599 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 26492701 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 26513762 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:136,0,64 Chr06 26680468 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 26717137 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;DP=44;Dels=0.00;FS=19.667;HaplotypeScore=6.6921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.725;QD=0.81;ReadPosRankSum=-2.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:44:64:64,0,847 Chr06 26717481 . C G 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.66;MQ0=2;QD=4.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:8:6:77,6,0 Chr06 26732224 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 26749182 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.38;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:64:64,0,816 Chr06 26779876 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,256 Chr06 26789193 . A T 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;DP=26;Dels=0.00;FS=22.825;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=5.99;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:184,0,671 Chr06 26829232 . G T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.204;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=2.95;ReadPosRankSum=-4.430 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,8:47:99:167,0,1447 Chr06 26884338 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:61,0,32 Chr06 26981035 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 26983930 . C A 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:99:166,0,100 Chr06 26999428 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 27020434 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,209 Chr06 27071920 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 27078856 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 27140745 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:101,0,68 Chr06 27246885 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,149 Chr06 27251192 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=0.72;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:52:52,0,1091 Chr06 27266221 . G T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;DP=21;Dels=0.00;FS=5.815;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=6.61;ReadPosRankSum=-3.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:167,0,509 Chr06 27297668 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.553;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:87:87,0,659 Chr06 27303575 . C A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.10;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:138,0,461 Chr06 27419644 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.282;DP=13;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:74:74,0,366 Chr06 27480227 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 27480276 . T A 430.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:459,33,0 Chr06 27629449 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;DP=23;Dels=0.00;FS=6.628;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.502;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:51:51,0,745 Chr06 27633392 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:54:68,0,54 Chr06 27641990 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,88 Chr06 27642073 . C A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:110,0,1201 Chr06 27646335 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.910;QD=4.55;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:101,0,446 Chr06 27655211 . T A 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;DP=68;Dels=0.00;FS=34.971;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.948;QD=2.23;ReadPosRankSum=-4.753 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,10:68:99:180,0,2145 Chr06 27767706 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,180 Chr06 27823434 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,204 Chr06 27840206 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.841;DP=98;Dels=0.00;FS=12.343;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.886;QD=0.62;ReadPosRankSum=-5.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:88,10:98:89:89,0,3270 Chr06 27967398 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr06 28052742 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:104,0,25 Chr06 28052839 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 28088002 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr06 28098454 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 28137359 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr06 28217454 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr06 28247590 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:103,0,30 Chr06 28605614 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr06 28638458 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 28671253 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,257 Chr06 28696135 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,623 Chr06 28819720 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:65,0,59 Chr06 28987071 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,142 Chr06 28999318 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,181 Chr06 29009551 . G T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQ0=0;MQRankSum=2.133;QD=8.70;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:150,0,323 Chr06 29009647 . C A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.786;QD=5.24;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:133,0,524 Chr06 29058065 . C T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.14;MQ0=14;QD=4.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:97,9,0 Chr06 29058080 . T C 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.14;MQ0=14;QD=4.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:9:96,9,0 Chr06 29058091 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.33;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr06 29058130 . T G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.59;MQ0=1;QD=18.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:103,9,0 Chr06 29099294 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 29141258 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,98 Chr06 29142789 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:101,0,68 Chr06 29144749 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 29165664 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 29175537 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,249 Chr06 29190664 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,217 Chr06 29223487 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 29228160 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.740;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:76:76,0,286 Chr06 29254019 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 29254102 . T G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 Chr06 29270342 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 29310910 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 29327655 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,252 Chr06 29334491 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 29343679 . G T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.673;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.295;QD=4.85;ReadPosRankSum=-4.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:198,0,977 Chr06 29343763 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.997;QD=0.96;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:59:59,0,915 Chr06 29355364 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 29366398 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 29402155 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,260 Chr06 29425253 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 29453623 . C A 420.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.642;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.396;QD=24.75;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:449,0,111 Chr06 29455958 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,669 Chr06 29518868 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,103 Chr06 29518964 . C A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr06 29620880 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.749;QD=2.30;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,484 Chr06 29715628 . G T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.470;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:163,0,173 Chr06 29715724 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.062;DP=32;Dels=0.00;FS=24.053;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=1.68;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:82:82,0,964 Chr06 29731929 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 29793659 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.597;QD=8.43;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,256 Chr06 29793869 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.463 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:91:91,0,623 Chr06 29845717 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 29872339 . C G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr06 29880361 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,278 Chr06 29897383 . G T 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr06 29949412 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:63,0,32 Chr06 29975668 . T A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:169,12,0 Chr06 30047863 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 30053333 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,290 Chr06 30070017 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 30076216 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr06 30076296 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 30098915 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.87;ReadPosRankSum=2.887 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:111,0,468 Chr06 30100527 . A G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;DP=38;Dels=0.00;FS=1.854;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.648;QD=1.78;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:96:96,0,1259 Chr06 30102093 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,140 Chr06 30122711 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:72,0,68 Chr06 30142503 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,190 Chr06 30142540 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr06 30151024 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.243;DP=18;Dels=0.00;FS=3.214;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=1.200;QD=12.21;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:18:99:248,0,329 Chr06 30154055 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 30154075 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 30154079 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30155401 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.057;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=3.87;ReadPosRankSum=-3.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:121,0,696 Chr06 30161765 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,340 Chr06 30164084 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,304 Chr06 30164085 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,302 Chr06 30166761 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,220 Chr06 30178069 . G A 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.304;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.251;QD=2.94;ReadPosRankSum=1.125 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,8:50:99:175,0,1586 Chr06 30183166 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,252 Chr06 30190185 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 30190188 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr06 30190208 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr06 30190250 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr06 30190948 . T G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:72:72,0,418 Chr06 30190973 . T G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.090;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:85:85,0,376 Chr06 30191733 . G C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr06 30193098 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;DP=16;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:114,0,432 Chr06 30193117 . T C 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;DP=26;Dels=0.00;FS=1.796;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.636 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:171,0,637 Chr06 30193219 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,96 Chr06 30193668 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30201042 . G A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr06 30213684 . A C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr06 30213686 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 30213700 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 30213726 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 30214771 . T C 42.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:82,6,0 Chr06 30214891 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 30222369 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 30222389 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 30222391 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 30222395 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 30222420 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 30222723 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 30222724 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 30222794 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30224284 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr06 30225304 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 30225388 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30241076 . T C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr06 30241103 . T G 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr06 30244140 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 30248100 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:78:78,0,274 Chr06 30259239 . T A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr06 30259295 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr06 30259313 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 30263437 . C G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 30263451 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 30280136 . C G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr06 30280176 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr06 30280182 . G C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr06 30307289 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:113,9,0 Chr06 30307298 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr06 30307343 . T C 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr06 30307364 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30307376 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 30333588 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,255 Chr06 30336107 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.822;QD=1.45;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:82:82,0,1204 Chr06 30336226 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30336237 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30336300 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 30345618 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30353855 . T C 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr06 30353864 . T C 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr06 30353866 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr06 30357015 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.727;DP=30;Dels=0.00;FS=18.524;HaplotypeScore=3.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.167;QD=2.33;ReadPosRankSum=-3.506 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:98:98,0,916 Chr06 30357097 . C A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.549;QD=5.31;ReadPosRankSum=-4.498 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:230,0,1013 Chr06 30361621 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30361633 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30368703 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 30369350 . G T 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr06 30371346 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 30373755 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 30375450 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 30376566 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 30380484 . G A 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=30.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr06 30380504 . T C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr06 30380516 . T A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr06 30380518 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=34.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr06 30380519 . G T 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.93;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr06 30380520 . G T 166.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 30398346 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30406136 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 30421835 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30421863 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30455929 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 30455956 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 30455962 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 30456253 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr06 30480781 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.16;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,64 Chr06 30573092 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 30660082 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 30719188 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=2.90;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:147,0,1274 Chr06 30758599 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.900;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=1.83;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:105,0,1354 Chr06 30784687 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,244 Chr06 30804502 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr06 30863115 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,171 Chr06 30873248 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr06 30880583 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.519;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.060;QD=2.71;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:104,0,832 Chr06 30880668 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.518;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.477;QD=2.19;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:96:96,0,974 Chr06 30889230 . A T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=15;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:148,0,371 Chr06 30889326 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.323;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.448;QD=1.74;ReadPosRankSum=-3.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:89:89,0,1122 Chr06 30940210 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.293;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.961;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1160 Chr06 30963984 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr06 31008058 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:132,0,101 Chr06 31047430 . C G 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 Chr06 31048954 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr06 31048975 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr06 31054460 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=27.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,491 Chr06 31054505 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31062891 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr06 31062898 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 31067726 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 31067744 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr06 31067745 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31070072 . C A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr06 31088735 . C T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr06 31090393 . G T 165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=10.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=18.42;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:90:194,0,90 Chr06 31090489 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.202;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1149 Chr06 31092234 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr06 31096830 . C T 35.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 31110073 . T G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr06 31117489 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr06 31140916 . A G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.40;MQ0=2;QD=10.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:99,12,0 Chr06 31140928 . G A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.40;MQ0=2;QD=6.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:73,9,0 Chr06 31140952 . T G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31140953 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31140985 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31140988 . C G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31141000 . C A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31141001 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.07;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr06 31146435 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31153357 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31171295 . C A 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr06 31171311 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31171343 . C G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr06 31171366 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31171367 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31188775 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31197201 . C A 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=15;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.177;QD=10.25;ReadPosRankSum=-3.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:182,0,317 Chr06 31215471 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 31222651 . C T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr06 31226073 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31247491 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 31247496 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 31247516 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 31247518 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31247521 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31247548 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31247551 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 31247579 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 31248672 . G C 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.61;MQ0=0;QD=3.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:26:12:115,12,0 Chr06 31248681 . G C 71.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.605;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,26:27:23:100,0,23 Chr06 31248710 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;DP=30;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.450;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,25:30:65:65,0,179 Chr06 31250943 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr06 31251107 . C A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr06 31254762 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr06 31254768 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 31254779 . G C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr06 31257068 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 31257070 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 31268999 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 31269003 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 31269005 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 31270801 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr06 31270848 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,149 Chr06 31276734 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 31278268 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 31297004 . C G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:99,0,106 Chr06 31302556 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 31350610 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,69 Chr06 31371935 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31372591 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr06 31372917 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,370 Chr06 31373817 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31373833 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31376362 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 31385846 . T G 260.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:289,21,0 Chr06 31386032 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 31397045 . A G 177.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:206,0,17 Chr06 31397107 . A G 189.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.11;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:218,0,21 Chr06 31404304 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:83:83,0,255 Chr06 31417588 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr06 31418673 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr06 31422178 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31424750 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr06 31447086 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr06 31447099 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr06 31465643 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31465692 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31465710 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 31469294 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 31474500 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr06 31474506 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 31474793 . C A 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:151,0,25 Chr06 31474804 . A G 191.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.40;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:220,0,21 Chr06 31474811 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr06 31475206 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 31483425 . T A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 31483480 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 31487431 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31510847 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31515450 . T G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr06 31523325 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr06 31523358 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr06 31537467 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,109 Chr06 31539492 . A G 644.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.97;MQ0=0;QD=32.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:673,48,0 Chr06 31539687 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 31543350 . T G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr06 31552119 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 31552134 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 31552494 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31609666 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 31610467 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr06 31614557 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,217 Chr06 31629963 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.10;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:85:85,0,179 Chr06 31635615 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 31635627 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr06 31635831 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=26.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=2.45;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:65:65,0,458 Chr06 31640950 . A T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr06 31641176 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 31641191 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 31641226 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr06 31641244 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr06 31646633 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31662405 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;DP=44;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,5:44:59:59,0,1394 Chr06 31663254 . G C 157.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:186,15,0 Chr06 31666926 . G C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.89;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr06 31673774 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr06 31676413 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 31678098 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr06 31684042 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.827;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,516 Chr06 31686727 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31687542 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 31690565 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr06 31705364 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31710827 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 31711501 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr06 31713210 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.559;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:73:73,0,501 Chr06 31715375 . A G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr06 31718246 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr06 31719515 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr06 31721903 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr06 31732147 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr06 31735790 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr06 31736042 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr06 31747312 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr06 31747319 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr06 31752975 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr06 31771089 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.689;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:53:53,0,1086 Chr06 31771466 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr06 31771493 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr06 31784404 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr06 31787940 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31787941 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr06 31788019 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr06 31798118 . A G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr06 31825803 . C A 168.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=8.87;ReadPosRankSum=-0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,18:19:7:196,0,7 Chr06 31836811 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr06 31843846 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr06 31881440 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr06 31930488 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.323;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,515 Chr07 40202 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,101 Chr07 47201 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.829;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,555 Chr07 73573 . C A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.330;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.861;QD=3.87;ReadPosRankSum=-4.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:179,0,1158 Chr07 79276 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,144 Chr07 107274 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=2.26;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:114,0,1198 Chr07 133821 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr07 150494 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 153835 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 161366 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,241 Chr07 175584 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.86;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,260 Chr07 176465 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,151 Chr07 176485 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,150 Chr07 206837 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr07 216119 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=26.580;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,439 Chr07 216216 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr07 221963 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr07 222059 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;DP=18;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=6;MQRankSum=1.134;QD=4.93;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:117,0,286 Chr07 224290 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,181 Chr07 235470 . G A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:126,0,221 Chr07 251715 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 251723 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.82;MQ0=3;QD=1.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:6:50,6,0 Chr07 251748 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.09;MQ0=5;QD=1.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:50,6,0 Chr07 251759 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.09;MQ0=5;MQRankSum=0.762;QD=1.63;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,12:14:6:50,6,0 Chr07 251768 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.09;MQ0=5;QD=1.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:50,6,0 Chr07 251776 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.43;MQ0=4;QD=1.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:13:6:50,6,0 Chr07 259806 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.669;DP=56;Dels=0.00;FS=15.508;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.020;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:67:67,0,1892 Chr07 264923 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,248 Chr07 284044 . T A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.5934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:18:99:129,0,380 Chr07 294428 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 296614 . T C 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:149,0,66 Chr07 298004 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,103 Chr07 301933 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:69,0,67 Chr07 301991 . C G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,72 Chr07 303157 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 304183 . A G 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:87:87,0,161 Chr07 304422 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:168,0,59 Chr07 320009 . G T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.782;DP=46;Dels=0.00;FS=23.932;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-4.420 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,8:46:99:169,0,1374 Chr07 321394 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.914;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.275;QD=3.83;ReadPosRankSum=-3.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:25:99:124,0,665 Chr07 323368 . A G 182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=15.23;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:211,0,169 Chr07 333612 . T C 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:93,9,0 Chr07 341508 . A T 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.093;DP=13;Dels=0.00;FS=5.756;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.101;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:253,0,188 Chr07 343807 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr07 343808 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr07 360588 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 367654 . A T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:111,0,61 Chr07 379971 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 380016 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 388991 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 389441 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr07 390958 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr07 390984 . A C 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:88,0,69 Chr07 391161 . A C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr07 406539 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,146 Chr07 406966 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 411915 . A T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=37;Dels=0.00;FS=56.394;HaplotypeScore=24.6177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:81:81,0,1220 Chr07 412242 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 412244 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 413435 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 413436 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 413438 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 416146 . A C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:138,0,27 Chr07 418488 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=10.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:93,0,100 Chr07 439381 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:55:112,0,55 Chr07 439389 . C A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:110,0,56 Chr07 442625 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:71,0,33 Chr07 454191 . A G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr07 454209 . C T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:82,0,30 Chr07 462646 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 472943 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,255 Chr07 476745 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr07 481249 . G T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 481271 . G A 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr07 504065 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr07 520071 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 528836 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,136 Chr07 532328 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 541250 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:73:73,0,518 Chr07 541470 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 545733 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 613423 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,101 Chr07 617272 . C A 35.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr07 674168 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 675021 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 683124 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 686983 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 687081 . C T 98.28 . 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A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 840695 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 844370 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr07 884740 . T C 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.39;MQ0=1;QD=11.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:87,9,0 Chr07 933879 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.401;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,397 Chr07 933976 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr07 943467 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr07 967347 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 987341 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,218 Chr07 1005428 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1008375 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1009937 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1015013 . C T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:138,0,27 Chr07 1124626 . C G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr07 1130330 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 1130693 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1140071 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1140073 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1143790 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,257 Chr07 1143791 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,258 Chr07 1143794 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,263 Chr07 1144600 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1144619 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1144623 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1146505 . C T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:30:114,0,30 Chr07 1146607 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr07 1146988 . C A 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr07 1147423 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 1147426 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 1154428 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,220 Chr07 1159386 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 1160561 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1179263 . G T 173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=5.27;ReadPosRankSum=-4.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,8:33:99:202,0,870 Chr07 1179343 . C A 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.324;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.132;QD=7.88;ReadPosRankSum=-1.535 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:178,0,434 Chr07 1209125 . A T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,124 Chr07 1214113 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:49:49,0,71 Chr07 1220105 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.294;DP=34;Dels=0.00;FS=8.402;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=0.67;ReadPosRankSum=-2.432 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:51:51,0,1059 Chr07 1230457 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.577;QD=1.96;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:93:93,0,1041 Chr07 1230553 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.185;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.418 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:66:66,0,1375 Chr07 1245893 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,208 Chr07 1279273 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1329023 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1329093 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1329193 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 1329199 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 1329253 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1366965 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 1370837 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr07 1371701 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,109 Chr07 1372942 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1374190 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 1374199 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr07 1374239 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 1374247 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 1374249 . A T 36.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr07 1374253 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 1374261 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 1379932 . C G 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=2.20;ReadPosRankSum=3.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:81:81,0,739 Chr07 1385104 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 1386562 . T C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr07 1389001 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,99 Chr07 1389483 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 1396731 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 1396751 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,72 Chr07 1397551 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.517;DP=24;Dels=0.00;FS=15.079;HaplotypeScore=13.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=2.20;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:81:81,0,738 Chr07 1400143 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1400531 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 1409328 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr07 1415919 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1417868 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 1418814 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1420022 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 1421546 . C G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 1421559 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr07 1421561 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr07 1422922 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1432887 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,150 Chr07 1432889 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,151 Chr07 1432893 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,186 Chr07 1432896 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:97:97,0,182 Chr07 1432925 . A T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:93:93,0,182 Chr07 1432940 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,205 Chr07 1432946 . C T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=16.60;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95:161,0,95 Chr07 1432970 . C G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,174 Chr07 1432973 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,173 Chr07 1438802 . C T 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=21.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:51:178,0,51 Chr07 1439208 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 1439209 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 1440283 . G A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr07 1440300 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,110 Chr07 1440312 . G T 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr07 1443624 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:75,0,31 Chr07 1443650 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 1443687 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 1443691 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 1449509 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:57:83,0,57 Chr07 1453084 . C G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 1455166 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,71 Chr07 1459747 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,89 Chr07 1465425 . G T 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:203,0,56 Chr07 1468913 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr07 1474363 . C G 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr07 1474365 . G C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr07 1474376 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 1475990 . G T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 1476323 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1481227 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr07 1481234 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 1481728 . T G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 1481780 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1487298 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=3.29;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:94:94,0,593 Chr07 1487384 . C A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:118,0,280 Chr07 1489493 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1489509 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1493291 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.575;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQ0=0;MQRankSum=-2.875;QD=3.44;ReadPosRankSum=-3.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:135,0,924 Chr07 1498450 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=3.9964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:90:90,0,130 Chr07 1498783 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1498785 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 1498802 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 1498803 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 1498814 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 1498970 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1499420 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1499715 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 1501984 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 1504961 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1506870 . G C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:93:93,0,244 Chr07 1506932 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,227 Chr07 1507540 . A G 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;DP=21;Dels=0.00;FS=15.596;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.032;QD=5.37;ReadPosRankSum=1.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:141,0,586 Chr07 1507561 . A G 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;DP=21;Dels=0.00;FS=15.596;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.702 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:128,0,607 Chr07 1510179 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr07 1512609 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr07 1516080 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:49:96,0,49 Chr07 1531411 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,136 Chr07 1533032 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 1533866 . G A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:101,0,29 Chr07 1533874 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr07 1533936 . G C 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:102,0,26 Chr07 1533946 . G A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr07 1533951 . C T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr07 1534013 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 1534039 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1534044 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1534054 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1534057 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1542077 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr07 1542133 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 1542168 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr07 1542219 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:65,0,63 Chr07 1542826 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,103 Chr07 1547848 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 1555779 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr07 1561758 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,189 Chr07 1561769 . A T 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:45:187,0,45 Chr07 1561782 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,173 Chr07 1562116 . T G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.71;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 1562142 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.71;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 1565276 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1565288 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1579979 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1579984 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1580024 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1582027 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1582046 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 1589010 . C T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=16.10;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:89:157,0,89 Chr07 1589136 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,105 Chr07 1589149 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr07 1595889 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 1604139 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr07 1648535 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:96,0,30 Chr07 1661311 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.72;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 1661330 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.72;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 1664277 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.65;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1665491 . G C 97.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1711973 . T G 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 Chr07 1711982 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 1711995 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 1712650 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1760982 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 1760983 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 1766834 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 1771835 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:96,0,68 Chr07 1775966 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 1778722 . C A 241.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=30.19;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:7:269,0,7 Chr07 1780788 . A G 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.68;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:73:162,0,73 Chr07 1809907 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,339 Chr07 1830407 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:71,0,68 Chr07 1832631 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 1832668 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 1833203 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,134 Chr07 1833293 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1833999 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 1835359 . T A 143.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:172,0,21 Chr07 1835838 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 1835868 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 1835869 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr07 1842275 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,414 Chr07 1852923 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 1852935 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 1857560 . C T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:132,0,138 Chr07 1869017 . C T 242.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:271,21,0 Chr07 1869375 . C T 86.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:115,0,27 Chr07 1903218 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,70 Chr07 1908765 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 1913615 . T A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:57:137,0,57 Chr07 1914314 . C G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:7:99:106,0,100 Chr07 1916729 . A T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=3.72;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:99,0,499 Chr07 1935578 . A G 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 2043709 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2051767 . A T 269.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:298,24,0 Chr07 2053721 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 2068714 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,110 Chr07 2072694 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 2072844 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 2074645 . C G 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr07 2087755 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,300 Chr07 2090387 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,225 Chr07 2106881 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,106 Chr07 2107418 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,94 Chr07 2107500 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,172 Chr07 2108047 . T A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr07 2135864 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2155110 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2155120 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2155175 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2182501 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2182503 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2182512 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.39;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr07 2185470 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2185513 . C T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr07 2185551 . C A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:109,9,0 Chr07 2190747 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 2221895 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2230667 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 2231789 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQ0=0;MQRankSum=1.271;QD=2.25;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:11:53:53,0,248 Chr07 2277947 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 2277957 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 2277978 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2295081 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 2295118 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 2329776 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2329794 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2338726 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 2338741 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 2339066 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2339076 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2339077 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2339098 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2341461 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr07 2343468 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.174;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.102;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:73:73,0,864 Chr07 2345600 . G T 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr07 2345617 . A G 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:137,0,27 Chr07 2345622 . C G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 2345886 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:109,0,30 Chr07 2347363 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2347365 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2354350 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 2359898 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 2359939 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 2371436 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 2378764 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2381932 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2393417 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:53:110,0,53 Chr07 2405947 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,226 Chr07 2405983 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,219 Chr07 2407876 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2407915 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2414921 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2417100 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2417153 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2417166 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2426727 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2426743 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2426773 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2464831 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 2467031 . T A 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:65,0,28 Chr07 2467084 . A C 38.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:67,0,24 Chr07 2484377 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;DP=32;Dels=0.00;FS=21.756;HaplotypeScore=15.8300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.598;QD=0.87;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:56:56,0,1009 Chr07 2486634 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 2487364 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr07 2488197 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 2493577 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2493609 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2495758 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 2515956 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2516046 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2516082 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 2516112 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2516487 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2519316 . T A 711.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:740,57,0 Chr07 2526032 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2526063 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2526423 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 2526501 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 2526724 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2527189 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2528736 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2529232 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2529271 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 2535257 . C T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr07 2551789 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2570339 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2570444 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2582129 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 2611473 . T G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr07 2611864 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,141 Chr07 2615696 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2615738 . C G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 2616606 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2616621 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2616649 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2616669 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2616679 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2631784 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.36;MQ0=4;QD=6.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:65,6,0 Chr07 2646502 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=23;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.213;QD=2.56;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:23:87:87,0,652 Chr07 2672004 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 2672043 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2682005 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2682561 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 2682572 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 2682601 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2682608 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2687492 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2687566 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2687578 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2699981 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 2736541 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 2736544 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 2736566 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 2773267 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.28;MQ0=13;QD=2.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:65,6,0 Chr07 2773269 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.28;MQ0=13;QD=2.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:65,6,0 Chr07 2773330 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:53:53,0,66 Chr07 2779393 . T C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.734;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.10;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.734 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,19:20:30:105,0,30 Chr07 2779399 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr07 2779452 . C T 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.38;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:28:66,0,28 Chr07 2779471 . T C 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.38;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:28:65,0,28 Chr07 2780282 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 2780286 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 2780292 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 2784100 . G T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.283;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=3.65;ReadPosRankSum=-2.814 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:94:94,0,486 Chr07 2784640 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,162 Chr07 2784792 . C G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr07 2785570 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2785580 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2800262 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.63;MQ0=0;QD=2.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:6:71,6,0 Chr07 2814237 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2814296 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2820961 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 2820966 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 2821497 . T C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr07 2821502 . A C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 2821520 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 2821536 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 2821539 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 2823422 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 2837153 . A T 1072.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1101,81,0 Chr07 2838570 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 2839353 . G T 39.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr07 2843493 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 2845277 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2845278 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2845334 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 2847343 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2864930 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2864962 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2864977 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 2871070 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr07 2871169 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 2902072 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 2920939 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2922920 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 2922957 . A T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 2923762 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 2931519 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.59;MQ0=4;QD=5.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:63,6,0 Chr07 2931552 . A C 102.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.85;MQ0=5;QD=11.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:130,12,0 Chr07 2935897 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 2935899 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2936756 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 2936761 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 2936766 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 2937120 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 2937131 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 2937139 . G A 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 2969139 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 2971591 . C G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 2981171 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 2981193 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 2981196 . G C 46.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 3008865 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 3012452 . T G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr07 3012461 . T A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr07 3012511 . T G 181.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:210,18,0 Chr07 3076485 . G A 43.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.20;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:71:71,0,96 Chr07 3286793 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3296607 . A G 43.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:72,0,23 Chr07 3296671 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.794 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:74:74,0,421 Chr07 3296730 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,253 Chr07 3304528 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 3304529 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3304530 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3311703 . T C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:96:96,0,212 Chr07 3323995 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 3328770 . G T 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:66,9,0 Chr07 3328800 . T C 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:66,9,0 Chr07 3328802 . G A 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:66,9,0 Chr07 3328814 . G A 38.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.34;MQ0=0;QD=12.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:66,9,0 Chr07 3329634 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 3330072 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 3341439 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.484;QD=0.87;ReadPosRankSum=-2.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:33:57:57,0,996 Chr07 3350560 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3360159 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 3380073 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3380091 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3380094 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3381437 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 3393107 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr07 3395209 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 3397086 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 3397093 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 3397100 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 3406798 . C T 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr07 3410201 . A G 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr07 3415743 . C T 84.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.21;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:113,0,18 Chr07 3438635 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.650;DP=15;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:73:73,0,420 Chr07 3438976 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 3441431 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 3460552 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 3464246 . C T 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 Chr07 3465618 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 3469697 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 3469700 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 3469709 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 3469741 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 3482237 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,245 Chr07 3482551 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 3488860 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.913;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.861;QD=0.95;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:49:49,0,681 Chr07 3499679 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,170 Chr07 3499775 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.429;QD=7.92;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:147,0,351 Chr07 3505009 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 3505980 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr07 3506189 . C A 75.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:104,0,19 Chr07 3507479 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 3511198 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3514649 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3521975 . C A 93.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 3568579 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 3568585 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 3574154 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 3574193 . G T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 3601303 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 3601321 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 3615308 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.94;MQ0=0;QD=5.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:65,6,0 Chr07 3616489 . T G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:69:108,0,69 Chr07 3628219 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.56;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3632416 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.03;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 3633398 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:70:71,0,70 Chr07 3633610 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 3634872 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,134 Chr07 3637398 . G T 309.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:338,24,0 Chr07 3637416 . C G 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 Chr07 3637452 . T A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 Chr07 3640560 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr07 3641516 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 3642159 . T G 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:114,0,27 Chr07 3642179 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr07 3642352 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,106 Chr07 3642424 . C T 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=18.72;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:91:178,0,91 Chr07 3642428 . T A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:139,0,58 Chr07 3642613 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 3674359 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:66,0,61 Chr07 3703498 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 3762529 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr07 3772928 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3772952 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 3777518 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,105 Chr07 3799342 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr07 3799424 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 3799448 . G T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr07 3849176 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 3870955 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,333 Chr07 3871052 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,265 Chr07 3881228 . C G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:62,0,33 Chr07 3893554 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr07 3894927 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 3898823 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.303;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,544 Chr07 3901353 . A G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.04;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr07 3919340 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr07 3922477 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,101 Chr07 3925278 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr07 3932599 . G T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.13;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.981 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:124,0,199 Chr07 3933434 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 3946931 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=29.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr07 3948394 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.85;MQ0=12;MQRankSum=-1.537;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:74:74,0,97 Chr07 3967707 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.26;MQ0=1;MQRankSum=1.666;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:62:62,0,88 Chr07 4002554 . G C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=0;MQRankSum=-3.253;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.591 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,13:18:50:50,0,173 Chr07 4009688 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:53,0,33 Chr07 4015864 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:96:96,0,253 Chr07 4015867 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:99:99,0,221 Chr07 4015869 . A G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:97:97,0,248 Chr07 4015877 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:95:95,0,250 Chr07 4015878 . T G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.580;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:96:96,0,260 Chr07 4023672 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,163 Chr07 4023835 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 4028860 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 4036809 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 4048172 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr07 4063333 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr07 4070080 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4085025 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.630;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.782;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:101,0,712 Chr07 4085157 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr07 4085158 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr07 4085163 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr07 4106330 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 4106337 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 4106350 . C A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 4109217 . T C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,144 Chr07 4109947 . G A 43.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:72,0,27 Chr07 4116109 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,320 Chr07 4117472 . C A 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:106,0,27 Chr07 4130870 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr07 4146933 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 4152523 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,99 Chr07 4152562 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr07 4157521 . C G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr07 4188301 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 4191883 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 4191903 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 4219494 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4219539 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4225344 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 4225370 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 4225375 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 4227558 . T C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr07 4228714 . A T 20.87 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.70;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:49,0,18 Chr07 4229775 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4229812 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 4237599 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 4241715 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 4253020 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4253023 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4253035 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 4253140 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4253152 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4253311 . C G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr07 4322758 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 4322762 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4322771 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 4322804 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4322808 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4322815 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4322833 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 4322845 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 4332212 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 4344944 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 4350995 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4351320 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 4351322 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 4382487 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4382489 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4386159 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 4386201 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4387948 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4387967 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4390471 . A T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr07 4390515 . A C 140.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4397965 . T C 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr07 4397984 . C T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr07 4408017 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 4413361 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 4450957 . G T 73.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 Chr07 4677217 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:58:58,0,233 Chr07 4677230 . C T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.515 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:87:87,0,230 Chr07 4677237 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.09;MQ0=0;MQRankSum=-2.295;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.983 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:58:58,0,233 Chr07 4677246 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.215;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:58:58,0,233 Chr07 4677264 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.215;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:58:58,0,233 Chr07 4680921 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr07 4684013 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:105,0,29 Chr07 4684285 . T G 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4745339 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 4745348 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 4749569 . A G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr07 4752876 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 4752920 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 4752929 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 4780133 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 4780602 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 4783900 . T C 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr07 4788021 . T A 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 4798288 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 4808940 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=77;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.37;MQ0=68;MQRankSum=-1.666;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,75:77:66:99,0,66 Chr07 4811972 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=1;QD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:70,6,0 Chr07 4845492 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 4856255 . G A 46.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 4896779 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 4960293 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.05;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5034651 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 5034682 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5042083 . A G 212.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.40;MQ0=2;QD=19.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,9:11:24:241,24,0 Chr07 5042108 . T G 171.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.16;MQ0=2;QD=17.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:200,21,0 Chr07 5042425 . A C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:94,0,30 Chr07 5127489 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5142967 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 5163003 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 5169638 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5169670 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 5171171 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5171193 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 5191543 . A G 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr07 5219841 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 5238422 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5238714 . C T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr07 5239713 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 5239878 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,180 Chr07 5240271 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,132 Chr07 5243019 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5243411 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5245142 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5245170 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5245220 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5247965 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 5273851 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5273888 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5273889 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 5284405 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5308970 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 5311244 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5319715 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 5319717 . T C 40.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 5359686 . C G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 5359689 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 5359704 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 5368801 . T A 198.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.171;DP=53;Dels=0.00;FS=43.885;HaplotypeScore=3.9779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.443;QD=3.75;ReadPosRankSum=-4.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,10:53:99:227,0,1555 Chr07 5369261 . G T 116.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 5401948 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 5403902 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5403912 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5403915 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5403948 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5410019 . G T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:160,0,203 Chr07 5410115 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=7.30;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:145,0,404 Chr07 5420011 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 5422697 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr07 5441388 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5445514 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 5451421 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr07 5453015 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;DP=17;Dels=0.00;FS=10.843;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=4.34;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,485 Chr07 5453046 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=16;Dels=0.00;FS=2.933;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.538;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,477 Chr07 5456724 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5522353 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5528051 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5528052 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 5533655 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:93:93,0,136 Chr07 5549433 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 5563233 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,245 Chr07 5563330 . T A 41.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5634419 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 5640272 . T G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.73;ReadPosRankSum=1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:85:85,0,342 Chr07 5642452 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,103 Chr07 5655078 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 5655105 . G C 41.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 5677679 . C G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 5677683 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 5718898 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5739645 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 5742942 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5744986 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5744991 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5766163 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 5794628 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5794639 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 5794653 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 5799765 . A T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr07 5831859 . T G 167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;DP=95;Dels=0.00;FS=21.124;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.025;QD=1.77;ReadPosRankSum=4.968 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:83,12:95:99:196,0,2981 Chr07 5848795 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 5858082 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 5859280 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 5871079 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:87:87,0,139 Chr07 5888118 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5888131 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5897757 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 5907810 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 5907820 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 5907844 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 5913934 . G A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr07 5913938 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:164,12,0 Chr07 5913962 . T G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.14;MQ0=0;QD=27.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr07 5920531 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5930011 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 5930055 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 5932911 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 5932942 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5932962 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5932966 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 5934159 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 5955013 . C A 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.708;DP=26;Dels=0.00;FS=2.656;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=4.68;ReadPosRankSum=-3.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:99:150,0,722 Chr07 5955380 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 5955437 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 5959216 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 5959237 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 5959438 . T C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr07 5977153 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 5978042 . A G 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:102,0,27 Chr07 5997616 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,111 Chr07 5997617 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,112 Chr07 5997618 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,111 Chr07 5997629 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,110 Chr07 5997645 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54:54,0,105 Chr07 5997654 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:51:51,0,101 Chr07 5997659 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:50,0,100 Chr07 6003829 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 6042270 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=4.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,259 Chr07 6050869 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 6050878 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 6050950 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 6050951 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 6058898 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr07 6058927 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr07 6073186 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 6098148 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr07 6098151 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr07 6131012 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;DP=69;Dels=0.00;FS=17.249;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.440;QD=0.98;ReadPosRankSum=-4.508 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,8:69:96:96,0,2139 Chr07 6131887 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 6131935 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 6195913 . G A 1089.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:81:1118,81,0 Chr07 6197275 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 6197319 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 6219827 . A G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.568;DP=10;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.61;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,168 Chr07 6235190 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 6250135 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 6300852 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr07 6300919 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 6307859 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 6311368 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 6311377 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 6316294 . A G 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.193;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.193;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:9:67,9,0 Chr07 6328282 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 6328355 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 6335315 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.89;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,274 Chr07 6335316 . T C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=5.62;ReadPosRankSum=2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:90:90,0,272 Chr07 6351134 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.89;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 6379764 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 6397699 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 6420849 . A G 405.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.456;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.639 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:37:434,0,37 Chr07 6431592 . T G 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:187,0,63 Chr07 6445059 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr07 6446432 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 6447309 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr07 6447930 . T C 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:97:183,0,97 Chr07 6452682 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 6484809 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 6520967 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr07 6522052 . T A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:55:126,0,55 Chr07 6522084 . A G 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:50:146,0,50 Chr07 6523950 . G C 192.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:221,18,0 Chr07 6528670 . A T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:102,0,59 Chr07 6528873 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 6528878 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 6528936 . T A 79.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:108,0,27 Chr07 6556474 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.303;QD=4.67;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:103,0,359 Chr07 6580094 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 6582303 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr07 6582308 . T A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr07 6583919 . G A 335.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 6616317 . G T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:84:130,0,84 Chr07 6621260 . A T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:106,0,66 Chr07 6621262 . A T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:106,0,68 Chr07 6621513 . C A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 6621652 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr07 6625846 . A T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:110,0,69 Chr07 6626743 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,217 Chr07 6631801 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr07 6635193 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 6635222 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 6649344 . C A 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr07 6653985 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:94,0,96 Chr07 6654048 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,105 Chr07 6706950 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:99,0,65 Chr07 6738349 . G T 205.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:234,18,0 Chr07 6743560 . G C 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:145,0,27 Chr07 6760030 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,66 Chr07 6760031 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,67 Chr07 6760036 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,68 Chr07 6760039 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,69 Chr07 6772245 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 6785164 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:61,0,60 Chr07 6785247 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,141 Chr07 6804947 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 6804979 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 6846228 . G T 75.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr07 6890513 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:71,0,31 Chr07 6919728 . G C 196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.783;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.983;QD=5.05;ReadPosRankSum=-4.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,9:39:99:225,0,1127 Chr07 6919733 . G T 231.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.513;DP=40;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.422;QD=5.79;ReadPosRankSum=3.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:260,0,1108 Chr07 6922019 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 6932414 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 6935757 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 6935808 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 6979482 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 6989584 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr07 7008520 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:30:95,0,30 Chr07 7016959 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;DP=21;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=1.23;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:54:54,0,677 Chr07 7019014 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 7022057 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr07 7022187 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 7128684 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 7142845 . G C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:107,0,62 Chr07 7154237 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr07 7199934 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.78;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 7205426 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 7210561 . T A 37.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:66,0,23 Chr07 7214865 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 7222074 . C G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,161 Chr07 7229210 . G A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr07 7229225 . G C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 7239808 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 7239839 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 7241868 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr07 7249059 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 7251629 . C T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 7251658 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 7260093 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 7261768 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 7277856 . T A 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr07 7277865 . C T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr07 7278590 . C T 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr07 7303612 . G A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:102,0,30 Chr07 7327122 . A C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 7350688 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=25;Dels=0.00;FS=10.193;HaplotypeScore=3.9632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.371;QD=1.63;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:69:69,0,770 Chr07 7350766 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 7353048 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 7353871 . C A 50.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 7416451 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 7436454 . G T 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=14;Dels=0.00;FS=6.803;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=12.13;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:198,0,281 Chr07 7440051 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,250 Chr07 7444530 . G A 46.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.25;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr07 7732372 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 7745535 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 7745566 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 7755756 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 7756771 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 7759763 . C A 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:89:169,0,89 Chr07 7769710 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 7769712 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 7769776 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 7771742 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.238;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,739 Chr07 7818748 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 7824296 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr07 7824302 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 7824314 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.21;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 7824356 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.65;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,134 Chr07 7858612 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 7858779 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 7858790 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 7858806 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 7863686 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 7863727 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 7863740 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 7919202 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 7919206 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 7919225 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 7919231 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 7919689 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:84:84,0,124 Chr07 7919702 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:59:59,0,140 Chr07 7919718 . A G 156.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=22.33;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:9:184,0,9 Chr07 7919720 . A C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,161 Chr07 7919734 . T A 64.65 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:7:12:110,0,12 Chr07 7919744 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:53,0,50 Chr07 7919946 . A C 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=6.09;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:83:83,0,156 Chr07 7919999 . C G 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80:80,0,362 Chr07 7920008 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.9975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=4.21;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:83:83,0,366 Chr07 7920026 . C T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.167;DP=24;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=3.567;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:160,0,627 Chr07 7920034 . C T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=24;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=3.567;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.033 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:147,0,634 Chr07 7920044 . C T 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.300;DP=24;Dels=0.00;FS=2.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQ0=0;MQRankSum=3.567;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:173,0,594 Chr07 7920067 . A G 173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=17.38;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:96:202,0,96 Chr07 7920084 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.51;MQ0=0;MQRankSum=2.383;QD=10.78;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:95:136,0,95 Chr07 7920462 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 7920470 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 7920487 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 7945377 . G T 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.21;MQ0=8;QD=12.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:15:195,15,0 Chr07 7946303 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.90;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.82;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:115,9,0 Chr07 7947955 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.14;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 7947972 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.14;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 7949995 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 Chr07 7950025 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr07 7950058 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr07 7950083 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr07 7975630 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.25;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 7975631 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.25;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 8019522 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 8040633 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 8070944 . G A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:100,0,61 Chr07 8071079 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 8082036 . G A 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr07 8111121 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 8111535 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8112543 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 8112569 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 8120561 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:59:59,0,592 Chr07 8127793 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:71,0,68 Chr07 8152874 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr07 8157816 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,106 Chr07 8176095 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 8176141 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 8181237 . C T 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr07 8221984 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 8222049 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 8272004 . T A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.333;QD=8.48;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:147,0,313 Chr07 8348332 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 8348803 . T G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr07 8366578 . C T 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr07 8366725 . G T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.206;QD=5.04;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:134,0,553 Chr07 8377603 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 8382217 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 8398422 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 8399456 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr07 8399552 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,160 Chr07 8410557 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.99;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:51,6,0 Chr07 8424053 . G A 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.21;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 Chr07 8426309 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;DP=17;Dels=0.00;FS=16.564;HaplotypeScore=1.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.709;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:69:69,0,515 Chr07 8448939 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 8449247 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 8454485 . G A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:103,0,24 Chr07 8454802 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 8454808 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr07 8454845 . A T 37.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:66,0,23 Chr07 8454846 . T C 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:75,0,25 Chr07 8454879 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 8457054 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 8457970 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 8461549 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 8477872 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8512187 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 8523537 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr07 8535241 . A G 353.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.158;QD=32.12;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:381,0,9 Chr07 8536377 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,172 Chr07 8541418 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr07 8565556 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 8566570 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 8566571 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 8566583 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.10;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr07 8567565 . C T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr07 8568059 . C T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.549;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.782;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.522 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,15:42:94:94,0,222 Chr07 8568936 . G C 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:53:175,0,53 Chr07 8568944 . T C 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=22.54;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:186,0,60 Chr07 8568954 . C T 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.11;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:190,0,58 Chr07 8568959 . G A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=22.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:189,0,60 Chr07 8568973 . C T 161.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=23.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:57:190,0,57 Chr07 8574681 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 8597204 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,303 Chr07 8601801 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.66;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.46;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:115,9,0 Chr07 8620623 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 8621051 . G A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:136,0,59 Chr07 8654998 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 8699332 . T C 30.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.70;MQ0=3;MQRankSum=0.406;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:23:59,0,23 Chr07 8699394 . T C 30.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17:59,0,17 Chr07 8713647 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 8720757 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 8722484 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 8737680 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.64;MQ0=24;QD=1.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,22:26:6:76,6,0 Chr07 8742888 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 8815247 . G T 197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.97;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:91:226,0,91 Chr07 8815503 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.561;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.032;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:67:67,0,924 Chr07 8815595 . C G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,368 Chr07 8815640 . G A 185.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:214,0,98 Chr07 8815652 . T A 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=20.97;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:217,0,99 Chr07 8830413 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 8842740 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr07 8887075 . T G 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr07 8887083 . A G 101.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:130,0,24 Chr07 8889973 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,268 Chr07 8910768 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 8910784 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8910803 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8915601 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 8922390 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8933422 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8935569 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 8935601 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 8952322 . A G 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:153,0,27 Chr07 8973507 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 8974315 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 9014882 . G C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 9041031 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 9041040 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 9041041 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr07 9041125 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 9041314 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 9041341 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 9049632 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr07 9065983 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,179 Chr07 9079837 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 9082182 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.19;MQ0=2;MQRankSum=1.380;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:65:65,0,104 Chr07 9082211 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.19;MQ0=2;MQRankSum=1.380;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:66:66,0,104 Chr07 9109382 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 9109397 . G C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 9110771 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.682;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.152;QD=4.64;ReadPosRankSum=-3.682 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,6:26:99:149,0,744 Chr07 9124471 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 9124474 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 9124511 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 9124876 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 9135301 . G T 69.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 9158954 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,148 Chr07 9162028 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:99,0,68 Chr07 9163568 . A C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr07 9163657 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:57,0,70 Chr07 9172034 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 9172058 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr07 9172355 . A G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,214 Chr07 9173268 . T A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr07 9185240 . C T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=15.38;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:182,0,129 Chr07 9187037 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 9189556 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:70,0,68 Chr07 9189764 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 9205511 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 9205532 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.57;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 9247528 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 9257430 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 9260691 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 9260721 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 9261984 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 9262013 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 9262028 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 9262849 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.414;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:58:58,0,1014 Chr07 9265887 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr07 9265983 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 9278117 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 9312118 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,64 Chr07 9314752 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 9335323 . C T 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;DP=32;Dels=0.00;FS=9.975;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:223,0,857 Chr07 9343386 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 9351654 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 9355956 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 9359005 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,103 Chr07 9359014 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,106 Chr07 9407008 . C A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.156;QD=8.87;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:179,0,376 Chr07 9415752 . C T 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=25.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:43:257,0,43 Chr07 9416196 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr07 9424054 . A C 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr07 9424135 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 9443145 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 9448444 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 9448475 . A C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 9450743 . G A 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.347;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.46;MQ0=0;MQRankSum=0.579;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.270 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:185,0,152 Chr07 9450744 . G A 223.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.529;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.46;MQ0=0;MQRankSum=-2.752;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,17:20:84:252,0,84 Chr07 9455033 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 9455298 . G A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=11.20;ReadPosRankSum=1.881 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:129,0,173 Chr07 9459530 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 9464277 . C T 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:53:303,0,53 Chr07 9464331 . A G 300.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=27.34;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:46:329,0,46 Chr07 9464343 . C A 276.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=27.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,8:10:53:305,0,53 Chr07 9504453 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 9512323 . A G 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:132,0,62 Chr07 9512327 . A G 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:131,0,62 Chr07 9549027 . G C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr07 9552976 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,145 Chr07 9590470 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr07 9633967 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr07 9704877 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,227 Chr07 9720735 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 9728179 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6247;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=1.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:12:6:49,6,0 Chr07 9760601 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:50,0,30 Chr07 9789198 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 9789244 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 9832708 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,703 Chr07 9832804 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr07 9848494 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 9870027 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 9923057 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr07 9961074 . C T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr07 10013179 . G A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr07 10027074 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 10099852 . T C 95.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.76;MQ0=7;MQRankSum=-0.322;QD=5.04;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,12:19:17:124,0,17 Chr07 10101316 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.58;MQ0=58;QD=0.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:58,2:60:6:59,6,0 Chr07 10101365 . A C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=59;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.62;MQ0=57;QD=0.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:57,2:59:6:59,6,0 Chr07 10106833 . A G 24.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:53,0,30 Chr07 10142578 . G C 85.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr07 10173940 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr07 10175246 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 10175249 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 10220433 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10222033 . A G 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 10468333 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 10472414 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 10538509 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.63;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:92:92,0,103 Chr07 10538592 . T A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.171;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.553;QD=2.63;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:86:86,0,651 Chr07 10561859 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.428 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:75:75,0,101 Chr07 10588916 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr07 10609188 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.653;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.343;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:109,0,742 Chr07 10616205 . G A 195.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:224,0,21 Chr07 10679171 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 10693417 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 10693424 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 10693433 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10693435 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10693450 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10693454 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10693460 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 10693466 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 10693484 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 10697496 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 10748806 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 10749584 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.185;DP=12;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,271 Chr07 10814837 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=6.64;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:88:88,0,214 Chr07 10883337 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr07 10985034 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:56:56,0,68 Chr07 11001585 . C A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr07 11137597 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;DP=39;Dels=0.00;FS=4.979;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.785;QD=1.10;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:71:71,0,1246 Chr07 11247084 . G T 218.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=27.36;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:247,0,17 Chr07 11261362 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.71;MQ0=3;MQRankSum=-1.738;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,14:15:30:70,0,30 Chr07 11261376 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:30:68,0,30 Chr07 11261383 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.378;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.03;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=2.65;ReadPosRankSum=0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:30:60,0,30 Chr07 11267409 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 11275914 . C T 48.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.94;MQ0=1;MQRankSum=-0.731;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:19:77,0,19 Chr07 11417122 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 11561877 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 11612571 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,69 Chr07 11673569 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr07 11673570 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr07 11687787 . C T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:135,0,102 Chr07 11687788 . A T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,141 Chr07 11687839 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 11687846 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 11687850 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 11687859 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 11687866 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 11687867 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 11712100 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,181 Chr07 11712216 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 11712245 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 11712531 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,68 Chr07 11726349 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 11728920 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:59:59,0,614 Chr07 11747046 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 11747058 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 11747430 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 11749358 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:64,0,63 Chr07 11750153 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 11750165 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 11750283 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 11750396 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:72,0,58 Chr07 11751407 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 11751426 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 11818091 . C G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:92:107,0,92 Chr07 11818121 . A G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,104 Chr07 11856793 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 11856797 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 11880562 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 11881654 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,129 Chr07 11938807 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,106 Chr07 11949267 . G A 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.366;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,8:29:99:228,0,745 Chr07 11983517 . A C 183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:40:212,0,40 Chr07 12015817 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr07 12028554 . C G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:110,0,69 Chr07 12093872 . C G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.350 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:111,0,567 Chr07 12145595 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 12146378 . G T 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.404;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=5.07;ReadPosRankSum=-3.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:155,0,706 Chr07 12146464 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr07 12161482 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 12209438 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 12209458 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 12210271 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,147 Chr07 12214868 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 12215228 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 12225640 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 12237733 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 12239482 . C T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:109,0,68 Chr07 12243420 . C T 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.16;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:100,9,0 Chr07 12254827 . A C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,98 Chr07 12260299 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 12262973 . T C 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=9.98;ReadPosRankSum=2.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:168,0,336 Chr07 12264471 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 12264486 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 12334125 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 12335262 . C T 145.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:174,0,21 Chr07 12339469 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.429;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:63:63,0,1424 Chr07 12361954 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr07 12361988 . A T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr07 12362015 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr07 12362020 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr07 12395895 . C A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.286;DP=47;Dels=0.00;FS=4.833;HaplotypeScore=2.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.987;QD=2.14;ReadPosRankSum=4.168 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,7:47:99:129,0,1463 Chr07 12458963 . T G 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;DP=35;Dels=0.00;FS=1.640;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.118;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,23:35:99:149,0,431 Chr07 12486151 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 12486162 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 12486211 . A C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 12486230 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 12486237 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 12495112 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.53;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,7:11:65:65,0,132 Chr07 12495181 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.23;MQ0=1;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:71,6,0 Chr07 12525258 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr07 12570911 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr07 12608088 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr07 12667285 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 12687838 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:126,0,131 Chr07 12689148 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 12689879 . T C 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:142,0,26 Chr07 12689903 . G A 111.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:140,0,27 Chr07 12777266 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.18;MQ0=1;MQRankSum=-1.380;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:54:73,0,54 Chr07 12780610 . G A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.80;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:103,0,118 Chr07 12852887 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:81:81,0,247 Chr07 12867456 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;DP=23;Dels=0.00;FS=9.810;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.312;QD=2.34;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:82:82,0,667 Chr07 12867538 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 12872360 . T C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.52;MQ0=0;QD=16.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:92,9,0 Chr07 12872911 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.43;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 12886962 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr07 12886978 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 12886993 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 12887002 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 12986095 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,338 Chr07 12986985 . T A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:129,0,99 Chr07 13023807 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.595;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.849;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.595 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,30:33:52:52,0,107 Chr07 13024095 . C A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;DP=23;Dels=0.00;FS=7.140;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.307;QD=4.77;ReadPosRankSum=-2.706 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:99:138,0,559 Chr07 13024111 . T G 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;DP=23;Dels=0.00;FS=3.982;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQ0=0;MQRankSum=-3.905;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.936 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,8:23:99:143,0,541 Chr07 13072486 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr07 13072487 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr07 13072488 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 13072489 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr07 13076968 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 13091685 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.349;DP=67;Dels=0.00;FS=26.719;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.590;QD=1.24;ReadPosRankSum=-4.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:59,8:67:99:111,0,2150 Chr07 13104798 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.46;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:55,6,0 Chr07 13130719 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 13134845 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.060;DP=24;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=2.62;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:91:91,0,664 Chr07 13139466 . A C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 13139857 . T A 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr07 13141143 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 13145195 . C T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.505;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.30;MQ0=14;MQRankSum=1.617;QD=1.06;ReadPosRankSum=-3.038 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,16:49:80:80,0,192 Chr07 13145198 . A G 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.92;MQ0=10;MQRankSum=1.581;QD=1.15;ReadPosRankSum=-3.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,21:45:80:80,0,189 Chr07 13145225 . C T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.429;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.92;MQ0=10;MQRankSum=1.546;QD=1.15;ReadPosRankSum=3.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,12:45:80:80,0,198 Chr07 13146702 . T A 132.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.25;MQ0=1;QD=16.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:161,18,0 Chr07 13146736 . A G 132.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.25;MQ0=1;QD=16.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:18:161,18,0 Chr07 13146741 . A G 132.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.25;MQ0=1;QD=16.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:161,18,0 Chr07 13146751 . T A 132.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.25;MQ0=1;QD=16.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:18:161,18,0 Chr07 13168277 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 13168887 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.099;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:88:88,0,382 Chr07 13168923 . G A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.085;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=4.60;ReadPosRankSum=1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:88:88,0,382 Chr07 13172669 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr07 13172684 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr07 13172720 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr07 13196374 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 13260771 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.667;QD=8.63;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:149,0,326 Chr07 13284585 . A G 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.24;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr07 13284596 . G T 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr07 13284603 . C T 101.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:129,12,0 Chr07 13284606 . G A 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr07 13284645 . T C 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr07 13284656 . T C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.23;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr07 13316971 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=18;Dels=0.00;FS=2.823;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.54;ReadPosRankSum=2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:56:56,0,557 Chr07 13317441 . G A 35.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=7.16;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:22:64,0,22 Chr07 13317451 . G A 37.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=7.56;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:24:66,0,24 Chr07 13317493 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.89;MQ0=1;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr07 13325478 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,203 Chr07 13408863 . A G 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:103,0,26 Chr07 13423812 . C T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.761 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:85:85,0,357 Chr07 13522925 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.02;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,266 Chr07 13535229 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 13564691 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 13566247 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,516 Chr07 13580266 . G T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.79;MQ0=0;QD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:105,9,0 Chr07 13580487 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.11;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61:61,0,69 Chr07 13610791 . C A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.98;MQ0=5;QD=9.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:9:106,9,0 Chr07 13671281 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 13750890 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 13750909 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 13793110 . A C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.26;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 13793411 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr07 13803347 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 13824135 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr07 13843866 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 13851746 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 13852304 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 13857762 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 13859166 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 13886816 . A G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:100,0,518 Chr07 13886833 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.711;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.355;QD=1.93;ReadPosRankSum=-0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:63:63,0,567 Chr07 13929383 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 13929443 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 13970884 . A C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.47;MQ0=2;MQRankSum=-0.736;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:32:52,0,32 Chr07 14001513 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.52;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:6:70,6,0 Chr07 14011987 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr07 14012000 . T C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr07 14045176 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 14047019 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 14049140 . A T 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.371;QD=7.09;ReadPosRankSum=-3.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:170,0,498 Chr07 14049226 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.658;DP=41;Dels=0.00;FS=12.179;HaplotypeScore=3.7602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=1.07;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:41:72:72,0,1278 Chr07 14123568 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 14207721 . T G 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:126,0,139 Chr07 14209136 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 14209223 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,137 Chr07 14209272 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 14262910 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 14314292 . C A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.606;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.766;QD=5.77;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:161,0,605 Chr07 14349674 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:85,0,63 Chr07 14349714 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:98,0,69 Chr07 14349721 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr07 14451099 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 14467479 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 14536711 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 14536716 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 14536723 . T A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.03;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr07 14551936 . A G 20.83 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.95;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:23:49,0,23 Chr07 14552013 . G C 20.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.51;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:30:49,0,30 Chr07 14557846 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 14565662 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr07 14605749 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,185 Chr07 14745221 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 14909368 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 14938520 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.04;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr07 14938737 . A T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr07 14956931 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 14970948 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 14984535 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr07 14987561 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 15004205 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.02;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 15016376 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:81:132,0,81 Chr07 15055683 . T G 60.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.405;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=2.73;ReadPosRankSum=1.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:11:88,0,11 Chr07 15055684 . T A 60.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.575;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,18:22:11:88,0,11 Chr07 15055803 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr07 15107176 . G A 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;DP=20;Dels=0.00;FS=5.434;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.67;MQ0=7;MQRankSum=2.424;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:174,0,184 Chr07 15108056 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:103,9,0 Chr07 15108076 . A C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.30;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:103,9,0 Chr07 15110168 . C A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=9;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.03;MQ0=1;MQRankSum=-0.922;QD=6.86;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:90:90,0,98 Chr07 15110195 . T G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90:90,0,102 Chr07 15110196 . T C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.96;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.82;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:90:90,0,101 Chr07 15188324 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 15287533 . A T 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=5.57;ReadPosRankSum=-3.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:162,0,636 Chr07 15288070 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=20;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:59:59,0,629 Chr07 15329461 . G A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,133 Chr07 15346181 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 15358502 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;DP=15;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.241;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:67:67,0,325 Chr07 15461014 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 15506684 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:77:77,0,1243 Chr07 15511438 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr07 15533574 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr07 15556551 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 15569731 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569743 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569753 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569754 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569756 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569761 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569793 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15569816 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 15572931 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.58;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr07 15588059 . G T 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.20;MQ0=16;QD=3.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,3:19:9:91,9,0 Chr07 15588160 . G C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.33;MQ0=28;QD=1.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,2:30:6:58,6,0 Chr07 15660744 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.53;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:57:57,0,250 Chr07 15672246 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.10;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 15684203 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 15690645 . T C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr07 15794979 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.609;DP=47;Dels=0.00;FS=7.659;HaplotypeScore=1.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.612;QD=2.27;ReadPosRankSum=-4.190 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,7:47:99:135,0,1452 Chr07 15872067 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.35;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 15901969 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.40;MQ0=4;QD=3.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:51,6,0 Chr07 15902015 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.24;MQ0=4;MQRankSum=0.720;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:39:53,0,39 Chr07 15925096 . A T 39.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.98;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:19:68,0,19 Chr07 15937147 . A T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr07 15940858 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 15940909 . C T 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:93,9,0 Chr07 15941093 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.11;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr07 16028283 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.73;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:61,6,0 Chr07 16033736 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:43:101,0,43 Chr07 16044151 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr07 16070420 . C T 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:149,0,66 Chr07 16102500 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.15;MQ0=1;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr07 16102535 . G C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.15;MQ0=1;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr07 16116287 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 16126375 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 16245533 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 16245560 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 16291042 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.92;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 16291128 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.20;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:30:68,0,30 Chr07 16331051 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.49;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 16432194 . C A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr07 16471561 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.19;MQ0=0;QD=24.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:152,12,0 Chr07 16510347 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr07 16510364 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr07 16547395 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr07 16568165 . C A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=12.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:88:119,0,88 Chr07 16568197 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 16648188 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 16724079 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 16757628 . A G 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.44;MQ0=11;MQRankSum=1.453;QD=5.18;ReadPosRankSum=-1.951 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,15:21:99:137,0,108 Chr07 16773874 . T G 85.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.73;MQ0=0;QD=3.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:63,6,0 Chr07 17082134 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.87;MQ0=1;QD=3.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:6:59,6,0 Chr07 17082143 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.87;MQ0=1;QD=3.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,9:10:6:59,6,0 Chr07 17190165 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 17315633 . C G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr07 17378490 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 17390810 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.86;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr07 17546955 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 17546960 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.08;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 17557071 . A G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:104,0,65 Chr07 17572200 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 17604136 . T A 22.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:51,0,23 Chr07 17616612 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 17626701 . A G 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.80;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr07 17626965 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 17642212 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 17678323 . A T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr07 17695258 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.82;MQ0=8;MQRankSum=1.977;QD=6.44;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:157,0,186 Chr07 17795301 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.34;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=6.68;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:6:74,6,0 Chr07 17795407 . A C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.03;MQ0=20;MQRankSum=-0.550;QD=1.03;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:56:56,0,61 Chr07 17819969 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:65,0,29 Chr07 17839741 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 17898488 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.09;MQ0=2;QD=8.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:63,6,0 Chr07 17923940 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr07 17956104 . T C 46.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.72;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=6.69;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:21:75,0,21 Chr07 17997653 . G T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 17999327 . G T 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:50,0,22 Chr07 18050382 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;DP=57;Dels=0.00;FS=7.849;HaplotypeScore=4.6633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQ0=0;MQRankSum=1.105;QD=0.73;ReadPosRankSum=-3.991 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,6:57:70:70,0,1733 Chr07 18149245 . T C 82.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 18258863 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 18259014 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,66 Chr07 18259099 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:53:53,0,137 Chr07 18267602 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 18510307 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 18510331 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 18559280 . A T 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:61,0,26 Chr07 18574067 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr07 18616260 . A T 43.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 19135246 . C A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.18;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr07 19233722 . G T 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.967;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.03;MQ0=6;MQRankSum=0.367;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.767 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:186,0,282 Chr07 19266747 . T A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,98 Chr07 19275623 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 19275931 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 19282164 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,185 Chr07 19282221 . A C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.517;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:56:56,0,174 Chr07 19289734 . G A 226.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.35;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:255,0,18 Chr07 19337460 . A T 116.77 . 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G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 19884743 . G C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.95;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 19956558 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.72;MQ0=1;MQRankSum=1.380;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,91 Chr07 20030806 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 20089523 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.098;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.149 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:66:66,0,787 Chr07 20109141 . A T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.813 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:142,0,373 Chr07 20124070 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 20154010 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 20154040 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.90;MQ0=1;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:116,9,0 Chr07 20184975 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 20205225 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 20236317 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:99,0,29 Chr07 20255887 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 20261509 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.61;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 Chr07 20261520 . G A 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;MQRankSum=1.920;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:85,9,0 Chr07 20353130 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:59,0,32 Chr07 20360049 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 20388646 . C T 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.20;MQ0=2;QD=12.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:12:118,12,0 Chr07 20396931 . C T 118.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.89;MQ0=4;QD=11.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,6:10:15:147,15,0 Chr07 20642421 . C A 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:134,0,26 Chr07 20673371 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,218 Chr07 20714759 . A G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.709;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:138,0,246 Chr07 20778981 . C A 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.60;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:265,21,0 Chr07 20832932 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 20847832 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 20847836 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 20847888 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 20847906 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 21092563 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.068;QD=1.19;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:64:64,0,964 Chr07 21103644 . T G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;DP=18;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.57;MQ0=3;MQRankSum=1.083;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,190 Chr07 21202738 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=2.774;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=1.68;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:50:50,0,336 Chr07 21210419 . G T 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.27;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:95,9,0 Chr07 21300227 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 21300324 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 21491574 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr07 21491576 . C G 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr07 21491589 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.13;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr07 21562254 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 21624535 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,171 Chr07 21659064 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr07 21659068 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr07 21659073 . A T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr07 21659123 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr07 21659304 . C A 60.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.07;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:89,0,27 Chr07 21659409 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 21664434 . G A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:95,0,52 Chr07 21664438 . T C 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=11.72;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:51:122,0,51 Chr07 21664446 . C T 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:49:119,0,49 Chr07 21664460 . C G 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=12.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:131,0,57 Chr07 21664477 . T C 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:57:131,0,57 Chr07 21703008 . A C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 21735261 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 21739808 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 21751789 . C T 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr07 21767251 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr07 21767254 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;QD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:70,6,0 Chr07 21803068 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 21828743 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:45:135,0,45 Chr07 21853982 . C G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:108,0,306 Chr07 21863193 . T C 109.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=15.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:23:138,0,23 Chr07 21902631 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 21936119 . G A 41.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:70,0,23 Chr07 21993374 . G A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.813;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.06;MQ0=22;MQRankSum=-0.488;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,8:38:99:103,0,112 Chr07 21993380 . C T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.22;MQ0=19;MQRankSum=-1.134;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.244 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:103,0,112 Chr07 22038431 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:54,0,32 Chr07 22066358 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:73,6,0 Chr07 22066395 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.52;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr07 22070242 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.583;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.37;MQ0=0;MQRankSum=-2.843;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.718 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:104,0,177 Chr07 22070288 . A C 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.95;MQ0=0;MQRankSum=-3.165;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:125,0,208 Chr07 22070303 . C T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.95;MQ0=0;MQRankSum=-3.165;QD=6.91;ReadPosRankSum=1.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:99:125,0,208 Chr07 22093276 . T A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;DP=15;Dels=0.00;FS=2.963;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=7.92;ReadPosRankSum=-2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:147,0,353 Chr07 22096345 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 22187724 . A C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 22187731 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr07 22187744 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr07 22207808 . T G 124.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.16;MQ0=0;MQRankSum=1.517;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:13:153,0,13 Chr07 22231638 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 22247772 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:67,0,67 Chr07 22247798 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 22278310 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 22723283 . A G 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr07 22730318 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 22942396 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.474;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=1;MQRankSum=0.474;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,10:12:6:65,6,0 Chr07 23107539 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.27;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:51,0,57 Chr07 23107546 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.27;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,59 Chr07 23156387 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr07 23231775 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 23231812 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 23394947 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.53;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 23486661 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;DP=33;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.879;QD=2.14;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:99:99,0,952 Chr07 23598191 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;DP=56;Dels=0.00;FS=22.578;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.63;MQ0=12;MQRankSum=-2.737;QD=0.76;ReadPosRankSum=3.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,22:56:71:71,0,804 Chr07 23620929 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr07 23650936 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 23654382 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 23744505 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:70,0,28 Chr07 23851575 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 23961412 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr07 23995428 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.40;MQ0=1;MQRankSum=1.495;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:61,0,49 Chr07 23997245 . C T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQ0=1;MQRankSum=-2.637;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.600 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:83:83,0,297 Chr07 23997258 . A G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.85;MQ0=1;MQRankSum=-2.637;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:83:83,0,290 Chr07 24034774 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 24046949 . C T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.99;MQ0=0;MQRankSum=0.840;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:97:97,0,246 Chr07 24058946 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.01;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 24263258 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.73;MQ0=4;QD=5.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:60,6,0 Chr07 24333067 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 24354274 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 24479135 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 24479221 . C A 140.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.47;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:169,0,21 Chr07 24479446 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 24479448 . G A 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:68,0,25 Chr07 24501763 . A G 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;QD=15.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:118,12,0 Chr07 24508632 . A G 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.69;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr07 24566171 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.95;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 24566180 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.95;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 24609433 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 24669618 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;DP=32;Dels=0.00;FS=20.373;HaplotypeScore=1.7336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.764;QD=0.87;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:56:56,0,971 Chr07 24679384 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr07 24705933 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 24726136 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.24;MQ0=1;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:61,6,0 Chr07 24859963 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr07 24859979 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 24876641 . T G 98.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=24.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:126,12,0 Chr07 24884644 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 24893410 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.21;MQ0=3;MQRankSum=-0.736;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:32:51,0,32 Chr07 25074562 . G A 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:59,0,25 Chr07 25074878 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 25113279 . C T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:102,0,105 Chr07 25167962 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 25206882 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 25478268 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr07 25478354 . T A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=6.05;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:113,0,353 Chr07 25615383 . G A 244.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=1.6809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:65:273,0,65 Chr07 25617035 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 25618373 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 25705571 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 25729507 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.15;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 25784838 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 25784856 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 25784864 . C T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 25784870 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 25784899 . G A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 25899782 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 25919181 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 25936445 . G A 47.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.37;MQ0=1;MQRankSum=-0.727;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:19:76,0,19 Chr07 26029005 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:29:72,0,29 Chr07 26029006 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:72,0,30 Chr07 26115409 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=2.054;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:98:98,0,134 Chr07 26115433 . C T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=2.054;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:88:88,0,134 Chr07 26115434 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=-2.219;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:70:70,0,153 Chr07 26115435 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=-2.219;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:70:70,0,151 Chr07 26115438 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=-2.017;QD=3.73;ReadPosRankSum=1.368 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:73:73,0,120 Chr07 26115448 . C T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.70;MQ0=3;MQRankSum=2.054;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:89:89,0,100 Chr07 26210826 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 26344900 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 26396727 . G A 139.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.42;MQ0=0;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:168,15,0 Chr07 26422383 . G T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr07 26422879 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.13;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr07 26472198 . C A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.85;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 26482840 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr07 26499807 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.075;DP=31;Dels=0.00;FS=2.570;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.525;QD=3.44;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:135,0,914 Chr07 26556208 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 26651995 . G T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.75;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr07 26679547 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.38;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:64,0,50 Chr07 26723498 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 26752654 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.22;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 26761729 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 26763841 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 26790223 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.35;MQ0=3;MQRankSum=-2.219;QD=6.65;ReadPosRankSum=-0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:108,0,173 Chr07 26841713 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,163 Chr07 26841753 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,185 Chr07 26950850 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=18;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.50;MQ0=7;MQRankSum=-2.637;QD=3.04;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,12:18:83:83,0,176 Chr07 26951090 . G T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.47;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 26964032 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr07 26967542 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4632;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.54;MQ0=1;MQRankSum=0.740;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:6:60,6,0 Chr07 26967601 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.54;MQ0=1;MQRankSum=0.740;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,3:13:6:60,6,0 Chr07 26975718 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 27066478 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.67;MQ0=1;QD=6.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:76,6,0 Chr07 27068492 . C T 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr07 27269553 . G A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=8.88;ReadPosRankSum=-0.676 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:91:117,0,91 Chr07 27269554 . C T 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:89:149,0,89 Chr07 27332594 . T A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.67;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr07 27464839 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.59;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,110 Chr07 27493403 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 27493483 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 27535330 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 27535355 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 27579551 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 27649710 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 27767065 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.11;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 28025875 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.03;MQ0=1;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr07 28031940 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:74,0,30 Chr07 28057559 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,186 Chr07 28057575 . G C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,190 Chr07 28057582 . G A 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:57:188,0,57 Chr07 28057623 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,177 Chr07 28061288 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 28075322 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:101,0,64 Chr07 28075403 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 28167279 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr07 28225119 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 28230892 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 28317953 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr07 28372146 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 28372243 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 28403268 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.764;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.293;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.425 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:59:59,0,71 Chr07 28404142 . A G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.012;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:68:90,0,68 Chr07 28404162 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.63;MQ0=0;MQRankSum=-2.012;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.224 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:57:58,0,57 Chr07 28436667 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,64 Chr07 28454058 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 28464475 . T A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,99 Chr07 28514563 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.19;MQ0=1;MQRankSum=2.354;QD=0.69;ReadPosRankSum=-2.402 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,2:52:50:64,0,50 Chr07 28586199 . A G 100.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:129,0,23 Chr07 28595484 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.33;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 28835230 . A C 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.14;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:123,12,0 Chr07 28900245 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.54;MQ0=0;MQRankSum=1.437;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:61:80,0,61 Chr07 28969052 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.65;MQ0=1;MQRankSum=-0.358;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:55:81,0,55 Chr07 28969107 . A G 138.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.65;MQ0=1;QD=23.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:167,15,0 Chr07 29187305 . T A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr07 29332665 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 29348219 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.96;MQ0=0;QD=19.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:125,9,0 Chr07 29353834 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 29358751 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 29433884 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.547;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.849;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.654 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:51:51,0,592 Chr07 29433892 . G C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.634;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.849;QD=0.63;ReadPosRankSum=0.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,12:36:51:51,0,670 Chr07 29460626 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 29483325 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 29544276 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 29572304 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 29572312 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 29572386 . G T 33.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 29636878 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 29648046 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 29648833 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 29775017 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.60;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 29901305 . T C 42.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:15:71,0,15 Chr07 30130066 . T C 24.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:53,0,31 Chr07 30136777 . G C 95.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.34;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:123,12,0 Chr07 30139217 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.75;MQ0=0;MQRankSum=2.205;QD=2.14;ReadPosRankSum=-1.575 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,2:20:6:70,6,0 Chr07 30166559 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:60:60,0,117 Chr07 30166571 . G A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.796;QD=5.04;ReadPosRankSum=-1.545 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:119,0,230 Chr07 30185808 . T A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQ0=0;MQRankSum=0.722;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.648 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:133,0,1077 Chr07 30509369 . A T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 30509377 . C G 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr07 30509414 . C G 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.15;MQ0=16;QD=2.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:16,3:19:9:68,9,0 Chr07 30510570 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,71 Chr07 30531968 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 30610947 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=23.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:123,9,0 Chr07 30637565 . A T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr07 30642882 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=6;QD=5.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:80,9,0 Chr07 30666363 . G C 115.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.58;MQ0=2;QD=16.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:15:144,15,0 Chr07 30685598 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.90;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.26;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:114,9,0 Chr07 30702650 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.87;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:89,9,0 Chr07 30702659 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.37;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:59,6,0 Chr07 30728279 . G T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 30728376 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.75;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:48:49,0,48 Chr07 30742380 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.44;MQ0=1;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:78,6,0 Chr07 30845075 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.14;MQ0=22;QD=2.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,18:25:6:84,6,0 Chr07 31050992 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 31106381 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.23;MQ0=0;QD=3.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:49,6,0 Chr07 31106411 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.23;MQ0=0;QD=3.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:49,6,0 Chr07 31207152 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.84;MQ0=0;QD=6.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:61,6,0 Chr07 31207342 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 31236234 . G C 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:98,0,30 Chr07 31240830 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:52:52,0,110 Chr07 31256174 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:85:85,0,119 Chr07 31256212 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,146 Chr07 31269583 . T C 23.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:52,0,24 Chr07 31297931 . C T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;DP=40;Dels=0.00;FS=11.935;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.45;MQ0=1;MQRankSum=-2.396;QD=3.32;ReadPosRankSum=-2.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:99:161,0,675 Chr07 31374868 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.83;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr07 31383054 . A G 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:60:124,0,60 Chr07 31422955 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.504;DP=59;Dels=0.00;FS=18.401;HaplotypeScore=9.9767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-4.278;QD=0.50;ReadPosRankSum=-4.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,7:59:58:58,0,1791 Chr07 31423674 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;DP=29;Dels=0.00;FS=8.994;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.66;MQ0=0;MQRankSum=-2.916;QD=1.30;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:66:66,0,768 Chr07 31444258 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr07 31506991 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 31513148 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQ0=1;MQRankSum=-0.849;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:108,0,448 Chr07 31528168 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=0;QD=13.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:82,6,0 Chr07 31528199 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=0;QD=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:83,6,0 Chr07 31528221 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=0;QD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:73,6,0 Chr07 31528232 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=0;QD=12.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:77,6,0 Chr07 31528244 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.18;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr07 31558176 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.06;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:69,6,0 Chr07 31572604 . G A 122.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.60;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:13:151,0,13 Chr07 31587003 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 31616567 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.2561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:62:62,0,106 Chr07 31624780 . G C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.30;MQ0=0;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:66,6,0 Chr07 31624800 . C T 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:60,0,29 Chr07 31636111 . C G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=2;QD=11.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:99,12,0 Chr07 31657765 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.28;MQ0=0;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:57,6,0 Chr07 31698313 . T A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr07 31699071 . C A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.52;MQ0=4;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:6:50,6,0 Chr07 31749301 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.43;MQ0=5;MQRankSum=-1.031;QD=1.86;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,10:16:58:58,0,90 Chr07 31749388 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.09;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,2:13:6:49,6,0 Chr07 31751758 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:69,0,30 Chr07 31751782 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:69,0,30 Chr07 31758016 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr07 31805510 . G C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.42;MQ0=1;MQRankSum=0.778;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:6:59,6,0 Chr07 31825311 . G A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;DP=14;Dels=0.00;FS=6.532;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.71;MQ0=4;MQRankSum=-2.450;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:110,0,166 Chr07 31855158 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 31916817 . T A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:63:135,0,63 Chr07 31944464 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;DP=14;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=3;MQRankSum=-2.637;QD=2.20;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:59:59,0,210 Chr07 31960539 . T C 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr07 32015484 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.45;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:69,0,30 Chr07 32015556 . C T 107.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:136,0,22 Chr07 32015592 . T C 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:70,0,26 Chr07 32021287 . G T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=28.987;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.977;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:157,0,258 Chr07 32035596 . T C 134.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:163,15,0 Chr07 32053407 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr07 32102534 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 32181958 . A G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.78;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr07 32280658 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.38;MQ0=28;MQRankSum=2.260;QD=0.37;ReadPosRankSum=2.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:75,5:80:33:58,0,33 Chr07 32280667 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;DP=80;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.38;MQ0=28;MQRankSum=2.260;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:66,14:80:33:58,0,33 Chr07 32355290 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 32356278 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:67:67,0,451 Chr07 32420587 . G A 194.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.64;MQ0=2;MQRankSum=-0.742;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:18:223,0,18 Chr07 32423412 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.19;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr07 32427085 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 32582013 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.056;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:60:60,0,581 Chr07 32627119 . T C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.99;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 Chr07 32627134 . C G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.99;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 Chr07 32627151 . C G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.99;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 Chr07 32627152 . T C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.99;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 Chr07 32627167 . G A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.99;MQ0=0;QD=3.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:12:87,12,0 Chr07 32676132 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 32719424 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 32798687 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 32798777 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 32950020 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,107 Chr07 33120800 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 33158985 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 33159016 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 33204209 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 33239515 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 33308069 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 33387554 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr07 33451814 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 33452285 . G T 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=23.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:243,0,50 Chr07 33543246 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.641;QD=2.87;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:146,0,1272 Chr07 33559230 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr07 33577775 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 33590268 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,103 Chr07 33603297 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=55;Dels=0.00;FS=10.653;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.998;QD=1.43;ReadPosRankSum=-4.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,7:55:99:107,0,1757 Chr07 33618104 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 33633409 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,250 Chr07 33701422 . G T 144.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15:192,15,0 Chr07 33701518 . T A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.800;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,323 Chr07 33706372 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr07 33733203 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 33747041 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 33747109 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr07 33755745 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr07 33766109 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=17.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:81,6,0 Chr07 33857812 . G T 149.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:178,15,0 Chr07 33864388 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 33911901 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr07 33914403 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 33997042 . A G 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.14;MQ0=4;QD=7.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:88,9,0 Chr07 34000422 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr07 34147188 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 34151421 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr07 34182976 . G T 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr07 34186746 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 34186776 . T G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr07 34187790 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 34198672 . C T 636.98 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9955;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.193;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.385 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,17:18:13:665,13,0 Chr07 34222468 . A G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:123,0,135 Chr07 34222493 . A G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.835;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=7.90;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:12:99:123,0,130 Chr07 34300134 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr07 34354707 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:49:49,0,185 Chr07 34354800 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:73:73,0,437 Chr07 34377003 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 34377005 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr07 34377012 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 34377018 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 34377020 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 34377041 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 34377060 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 34377074 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 34381762 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 34381769 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 34396970 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr07 34397027 . T C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr07 34397031 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.38;MQ0=0;QD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:70,6,0 Chr07 34397044 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr07 34397045 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr07 34421150 . G C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.453;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.4788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.42;MQ0=2;MQRankSum=-0.559;QD=3.39;ReadPosRankSum=-2.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,19:25:36:113,0,36 Chr07 34421222 . C G 135.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.1138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.24;MQ0=1;MQRankSum=-0.474;QD=11.30;ReadPosRankSum=-1.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:7:163,0,7 Chr07 34421323 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=30.3021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.86;MQ0=2;MQRankSum=0.296;QD=0.43;ReadPosRankSum=4.779 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,30:48:49:49,0,220 Chr07 34421331 . A G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.429;DP=42;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=7.9689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.14;MQ0=2;MQRankSum=-0.648;QD=1.18;ReadPosRankSum=3.304 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:78:78,0,162 Chr07 34421332 . T G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;DP=42;Dels=0.00;FS=2.197;HaplotypeScore=7.9689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.14;MQ0=2;MQRankSum=-3.599;QD=1.18;ReadPosRankSum=1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,37:42:78:78,0,153 Chr07 34538878 . A G 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr07 34571737 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.95;MQ0=3;QD=9.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:76,6,0 Chr07 34588198 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 34593464 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 34604878 . G A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;DP=22;Dels=0.00;FS=5.348;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.979;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.638 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:86:86,0,618 Chr07 34614171 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:115,9,0 Chr07 34764749 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 34764782 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 34764812 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr07 34784795 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 34828085 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 34975024 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:66,0,63 Chr07 34980834 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 34980899 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 35072729 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.63;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 35097464 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,160 Chr07 35103699 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.355;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:96:96,0,1485 Chr07 35158158 . T A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr07 35270510 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.265;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.15;MQ0=1;MQRankSum=2.920;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.540 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,4:19:6:59,6,0 Chr07 35270536 . G C 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;DP=31;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=6.5075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.38;MQ0=1;MQRankSum=3.172;QD=3.44;ReadPosRankSum=-3.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:135,0,117 Chr07 35349720 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:50,0,31 Chr07 35489529 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 35598372 . C A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr07 35603845 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 35609299 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 35609310 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 35609379 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 35612480 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,145 Chr07 35658376 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 35658471 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr07 35662313 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 35697306 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 35762318 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 35768539 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 35768586 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 35803789 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.448;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=3.59;ReadPosRankSum=-3.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:136,0,878 Chr07 35840912 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 35845569 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 35845665 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=17;Dels=0.00;FS=9.260;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=6.87;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:17:99:145,0,390 Chr07 35882451 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 35904596 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 35904672 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.021;DP=38;Dels=0.00;FS=11.720;HaplotypeScore=1.9913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=1.44;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:38:83:83,0,1172 Chr07 35918780 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 35918797 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 35918809 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 35924744 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 35999935 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 36007622 . C T 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.01;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr07 36173491 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:63,0,30 Chr07 36224886 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 36224889 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 36257965 . A G 68.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.24;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:13:97,0,13 Chr07 36260464 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 36288586 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.70;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 36288874 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 36326715 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.63;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr07 36326745 . A G 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=0;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:78,9,0 Chr07 36326767 . G C 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=0;QD=16.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:78,9,0 Chr07 36361703 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 36361745 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 36361746 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 36361758 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 36365796 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 36389872 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr07 36418630 . C G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr07 36418645 . C T 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr07 36419242 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,147 Chr07 36424085 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 36498845 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 36595544 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 36651422 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=20;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.529;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,629 Chr07 36674399 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,137 Chr07 36708292 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr07 36740922 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,180 Chr07 36784570 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 36816880 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,136 Chr07 36836021 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.68;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 36872701 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 36907423 . A T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 36944002 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr07 36953540 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 36953558 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 36953588 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 36963694 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 36963696 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 36992219 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 36992231 . C G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr07 36992232 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 36992316 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 36992338 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 36994464 . A C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.02;MQ0=0;QD=4.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 Chr07 36994492 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.02;MQ0=0;QD=4.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 Chr07 36994493 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.02;MQ0=0;QD=4.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 Chr07 37134444 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr07 37267011 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.17;MQ0=0;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:62,6,0 Chr07 37278251 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=20;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=1.49;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:58:58,0,556 Chr07 37278337 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr07 37313952 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37334837 . C A 101.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr07 37376371 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 37392538 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr07 37401712 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37404736 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 37404738 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 37409064 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 37415137 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr07 37423670 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 37431310 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.496;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.752;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:100,0,515 Chr07 37453559 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37489019 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37524002 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 37524063 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 37524072 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 37582849 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 37595481 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 37595750 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37595760 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37598562 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 37621452 . C T 77.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:106,0,21 Chr07 37625121 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr07 37628299 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 37628327 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37628375 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 37636803 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 37644132 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 37644194 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 37645658 . C A 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:145,0,27 Chr07 37649400 . C T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr07 37649418 . C T 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr07 37649762 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 37655653 . A C 143.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:172,0,21 Chr07 37657132 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 37657145 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 37657189 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37657223 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 37657740 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,252 Chr07 37677168 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr07 37681066 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=3.54;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:99,0,585 Chr07 37684077 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37715204 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37716356 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr07 37717922 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 37718294 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37739587 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr07 37747813 . A G 235.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.48;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:264,0,18 Chr07 37751758 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=6.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56:56,0,69 Chr07 37751847 . G T 148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.558;QD=8.75;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:177,0,393 Chr07 37774876 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:68,6,0 Chr07 37804512 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 37805805 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 37806171 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 37842257 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,148 Chr07 37856240 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 37937826 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 37948873 . G T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.421;DP=39;Dels=0.00;FS=5.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.603;QD=2.10;ReadPosRankSum=-3.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:110,0,1180 Chr07 37948959 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:83:83,0,320 Chr07 37970806 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 37972348 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr07 37972445 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:61:61,0,517 Chr07 37972989 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:98,0,30 Chr07 37975731 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 37977905 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 37998474 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,220 Chr07 38010953 . A C 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr07 38023234 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 38029955 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 38067364 . G T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr07 38067450 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,136 Chr07 38070354 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 38093223 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 38109792 . C T 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.15;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:100,9,0 Chr07 38139642 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 38141241 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 38141276 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 38185815 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.650;DP=19;Dels=0.00;FS=6.767;HaplotypeScore=0.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.99;MQ0=0;MQRankSum=2.950;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,398 Chr07 38186495 . A G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:109,0,30 Chr07 38186510 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.87;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr07 38187115 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 38187168 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 38195268 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.45;MQ0=0;MQRankSum=2.627;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,597 Chr07 38209103 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 38209129 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 38233023 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 38233120 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,222 Chr07 38236705 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr07 38237580 . C T 293.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=29.31;ReadPosRankSum=0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:11:321,0,11 Chr07 38302001 . A T 48.74 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:139,0,27 Chr07 38353837 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 38401613 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 38404798 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,177 Chr07 38408057 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;DP=20;Dels=0.00;FS=2.702;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,611 Chr07 38417782 . T C 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:130,0,65 Chr07 38417827 . T A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:94:132,0,94 Chr07 38443019 . A T 75.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:104,0,22 Chr07 38451326 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 38464402 . T A 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr07 38558939 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=7.15;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:114,0,292 Chr07 38593036 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 38611530 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:126,0,178 Chr07 38617516 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,118 Chr07 38658648 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 38658659 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 38661134 . A T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr07 38666186 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 38666260 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.40;MQ0=0;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:154,12,0 Chr07 38666263 . C A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.40;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:158,12,0 Chr07 38666276 . T G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.40;MQ0=0;QD=24.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:148,12,0 Chr07 38673375 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 38673412 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 38703886 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 38718399 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 38719805 . A C 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.657;DP=58;Dels=0.00;FS=2.016;HaplotypeScore=17.9829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.89;MQ0=3;MQRankSum=-0.821;QD=1.72;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:128,0,613 Chr07 38719808 . C T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;DP=58;Dels=0.00;FS=5.653;HaplotypeScore=34.4665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.89;MQ0=3;MQRankSum=-0.744;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,16:58:99:109,0,640 Chr07 38719821 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.853;DP=50;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=42.0010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=1.30;ReadPosRankSum=-3.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,13:50:93:93,0,553 Chr07 38721007 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.99;MQ0=7;QD=5.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:78,6,0 Chr07 38754839 . T A 197.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.70;MQ0=0;QD=21.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:21:226,21,0 Chr07 38783857 . T G 133.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.42;MQ0=0;QD=22.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:162,18,0 Chr07 38794181 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 38817021 . T C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr07 38861057 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 38889626 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.03;MQ0=1;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:69,6,0 Chr07 38895120 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 38895587 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.78;MQ0=0;QD=3.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:9:121,9,0 Chr07 38895596 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.78;MQ0=0;QD=3.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:30:9:121,9,0 Chr07 38895614 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=1.33;ReadPosRankSum=1.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,29:30:33:68,0,33 Chr07 38895626 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.78;MQ0=0;QD=3.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,30:30:9:120,9,0 Chr07 38900741 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,195 Chr07 38913244 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.68;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr07 38913245 . G A 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr07 38947564 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr07 38947603 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 38947982 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 38956485 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.12;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:127,9,0 Chr07 38956489 . C T 97.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39061188 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.139;QD=5.46;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:132,0,506 Chr07 39073954 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr07 39074050 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,268 Chr07 39084874 . A C 34.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:66:66,0,100 Chr07 39092843 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 39095167 . A G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr07 39095319 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,435 Chr07 39098215 . A T 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr07 39108242 . A G 145.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39230127 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39245934 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;DP=18;Dels=0.00;FS=6.107;HaplotypeScore=2.9857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:99,0,478 Chr07 39252895 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 39274759 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 39275788 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 39309773 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 39311942 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 39312849 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 39318709 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 39318728 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 39334556 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.541;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.712 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:69:69,0,1026 Chr07 39385719 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 39385856 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 39424498 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 39432604 . T G 55.74 . 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G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 39504885 . C G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 39504892 . A C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr07 39537811 . A T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr07 39539439 . T A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 39552017 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39552021 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39552065 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39552099 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 39579867 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 39579873 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 39579900 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 39592694 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 39592697 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 39592698 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 39597464 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 39620223 . T C 28.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:57,0,24 Chr07 39649029 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39667048 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39667087 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 39667097 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 39703830 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 39703857 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr07 39733382 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.72;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 39800275 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 39841706 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39858170 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,208 Chr07 39864949 . G C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 39879833 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr07 39881401 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 39881457 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 39881464 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 39881465 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 39881469 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 39881476 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39881486 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39893849 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39893860 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 39901733 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 39902236 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:113,0,29 Chr07 39903469 . C T 251.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:280,21,0 Chr07 39903806 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 39903810 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 39915748 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 39916932 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 39917081 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 39917091 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 39919307 . T C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr07 39965384 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr07 40001715 . T G 159.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:188,0,24 Chr07 40001719 . C G 160.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:189,0,24 Chr07 40001729 . G A 157.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:186,0,24 Chr07 40002297 . T G 346.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.187;QD=24.78;ReadPosRankSum=-2.100 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,12:14:14:375,0,14 Chr07 40003316 . C T 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:66,0,26 Chr07 40003784 . A T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr07 40031298 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 40034459 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 40035659 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:107,0,30 Chr07 40037174 . G T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr07 40049796 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 40069059 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr07 40073872 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:101,0,62 Chr07 40097979 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,208 Chr07 40098992 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 40113889 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 40168367 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 40170167 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 40192660 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 40211388 . C T 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:56,0,30 Chr07 40243834 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 40245862 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,297 Chr07 40258964 . C G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 40278424 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 40282506 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.14;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr07 40282521 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=2;QD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:72,6,0 Chr07 40282563 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.14;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr07 40286595 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 40321892 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=1.55;ReadPosRankSum=-1.032 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:53:53,0,62 Chr07 40321901 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.311;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.416 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:53:53,0,65 Chr07 40325742 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 40342608 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 40344036 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr07 40344061 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 40371809 . G T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr07 40419388 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 40473537 . G T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr07 40503419 . A C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:54:54,0,64 Chr07 40548103 . A G 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.285 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:116,0,416 Chr07 40548156 . C G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,132 Chr07 40548256 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 40556307 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.263;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.263 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:57:57,0,773 Chr07 40557219 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,560 Chr07 40736787 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,198 Chr07 40772195 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,92 Chr07 40800479 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 40804634 . T A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:85:85,0,416 Chr07 40810873 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=7.677;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.606;QD=2.90;ReadPosRankSum=-2.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:147,0,1275 Chr07 40811008 . C A 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;DP=16;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.847;QD=12.05;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:221,0,315 Chr07 40905857 . A C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr07 40906011 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,257 Chr07 40941738 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr07 40941743 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr07 40941745 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:50,0,30 Chr07 40941756 . A C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr07 40941806 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:54,0,33 Chr07 40960088 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,227 Chr07 40984491 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr07 41049646 . C T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:103,0,107 Chr07 41061589 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 41084318 . G T 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.236;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.008;QD=5.56;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:184,0,768 Chr07 41156464 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr07 41205022 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 41206174 . C A 223.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:16:252,0,16 Chr07 41264624 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,556 Chr07 41309315 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr07 41309411 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr07 41323067 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 41323068 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 41325296 . G A 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr07 41326722 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 41328481 . T C 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 Chr07 41328484 . A T 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr07 41328487 . A G 326.96 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.739;QD=29.72;ReadPosRankSum=0.474 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:5:354,0,5 Chr07 41330028 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr07 41332743 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 41332760 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 41332785 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 41332790 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 41332804 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 41335311 . C T 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335323 . C T 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335327 . A C 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335330 . T C 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335351 . C G 84.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=16.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:113,15,0 Chr07 41335355 . C T 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335357 . C T 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335359 . C G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr07 41335373 . A G 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335380 . C T 87.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.64;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:116,15,0 Chr07 41335390 . G A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:91,12,0 Chr07 41335394 . G A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:91,12,0 Chr07 41335398 . C T 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:91,12,0 Chr07 41371505 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 41388992 . A G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=103;Dels=0.00;FS=15.478;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.621;QD=0.69;ReadPosRankSum=-2.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:93,10:103:99:99,0,3454 Chr07 41445609 . T C 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 41646401 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 41671311 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr07 41671766 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:78:78,0,728 Chr07 41679037 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 41686248 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=21;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.04;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:92:92,0,593 Chr07 41737733 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 41759447 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 41760945 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 41765672 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 41766689 . A T 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:115,9,0 Chr07 41767654 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,99 Chr07 41773188 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 41802226 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 41802243 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 41808240 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 41882715 . C A 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.096;DP=41;Dels=0.00;FS=7.097;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=3.87;ReadPosRankSum=-3.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:187,0,1224 Chr07 41905460 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 41908918 . G C 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.159;QD=5.63;ReadPosRankSum=-3.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:186,0,711 Chr07 41966531 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,69 Chr07 41984483 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.080;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:50:50,0,1089 Chr07 42015601 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=6.08;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,212 Chr07 42079410 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 42128370 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,107 Chr07 42170346 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:49,0,221 Chr07 42170443 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 42180799 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;DP=14;Dels=0.00;FS=19.590;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,418 Chr07 42188710 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 42189324 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 42224697 . C A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr07 42257811 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.682;DP=46;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.165;QD=0.52;ReadPosRankSum=-3.247 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,5:46:52:52,0,1520 Chr07 42257907 . T A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.339;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.320;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1154 Chr07 42264883 . G A 41.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,222 Chr07 42409923 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 42411391 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 42420935 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 42444238 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 42460273 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,69 Chr07 42460699 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 42465053 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.39;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 42465124 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.39;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:54,0,30 Chr07 42495580 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 42514382 . T C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr07 42551334 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 42561090 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,139 Chr07 42561392 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.816;DP=25;Dels=0.00;FS=2.601;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.149;QD=2.11;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:81:81,0,763 Chr07 42567840 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 42619636 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 42623703 . G A 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=38.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr07 42635739 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 42664515 . A G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr07 42666982 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 42720602 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 42741620 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 42753202 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 42779248 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 42805621 . G T 75.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:104,0,22 Chr07 42806355 . T A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.932;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=6.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:108,0,283 Chr07 42814741 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 42818837 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 42847825 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr07 42847826 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 42951894 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,96 Chr07 42984228 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 42989715 . G A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr07 43032713 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 43111475 . T A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.650;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,550 Chr07 43215268 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 43215385 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:71,0,28 Chr07 43215937 . T G 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=29.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr07 43241249 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 43245846 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 43248016 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,189 Chr07 43258504 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 43259990 . C A 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:165,0,128 Chr07 43263316 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 43265504 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-1.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,289 Chr07 43268233 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 43270965 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr07 43284485 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.414;DP=81;Dels=0.00;FS=21.452;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.874;QD=0.27;ReadPosRankSum=-4.499 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,8:81:50:50,0,2565 Chr07 43303496 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 43315686 . T G 143.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:172,0,21 Chr07 43356078 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 43371721 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr07 43420523 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr07 43426781 . A C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr07 43430039 . T C 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:132,0,62 Chr07 43440645 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr07 43441063 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr07 43463477 . T G 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr07 43529312 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.82;MQ0=2;MQRankSum=-1.964;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:55:55,0,514 Chr07 43535844 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.08;MQ0=3;QD=7.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:63,6,0 Chr07 43535930 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr07 43549073 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,383 Chr07 43560537 . T C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr07 43609719 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,237 Chr07 43610737 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 43675870 . T A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:78:78,0,284 Chr07 43675877 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,217 Chr07 43683019 . C A 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.373;DP=32;Dels=0.00;FS=8.247;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.140;QD=4.18;ReadPosRankSum=-3.145 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:162,0,901 Chr07 43720726 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 43741382 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 43743000 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:92:92,0,208 Chr07 43754025 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 43763917 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 43763943 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 43825074 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 43873563 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 43917825 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:93,0,107 Chr07 43934634 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 43936510 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,223 Chr07 43951616 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 43959084 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96:96,0,104 Chr07 43964466 . G C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr07 43964709 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 43968387 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 43968400 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 43971995 . T G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:98,0,64 Chr07 43974112 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,197 Chr07 43974983 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 43981997 . A T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr07 43982326 . A G 155.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:184,0,21 Chr07 43984705 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr07 43984712 . T C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr07 43992344 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 44007171 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:55:55,0,1047 Chr07 44008615 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr07 44019723 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 44019725 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr07 44020345 . C G 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:110,0,26 Chr07 44020511 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,129 Chr07 44025009 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44034358 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 44043531 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 44043797 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 44045602 . G A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:103,0,27 Chr07 44049991 . T A 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr07 44051457 . T G 290.41 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.348;QD=29.04;ReadPosRankSum=-1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,9:10:8:318,0,8 Chr07 44066784 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 44088744 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:100,0,67 Chr07 44097981 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.643;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.200;QD=1.32;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:77:77,0,1168 Chr07 44098803 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 44134407 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44146681 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 44163025 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44190846 . G C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 44191050 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 44208103 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 44213077 . G T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.723;DP=28;Dels=0.00;FS=55.760;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=4.24;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:147,0,813 Chr07 44243995 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=9.28;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:121,0,216 Chr07 44251119 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 44251148 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 44251186 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 44251190 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 44251198 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 44251208 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 44255473 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44255487 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44255497 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44255501 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 44297859 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44297867 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 44298566 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44298579 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 44298895 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,181 Chr07 44305460 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,179 Chr07 44315828 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 44319434 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44322100 . G T 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=8.18;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:15:99:151,0,310 Chr07 44341984 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 44344192 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44354167 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 44354183 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 44370145 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:94,0,104 Chr07 44381079 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 44381385 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.210;QD=0.55;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:53:53,0,1489 Chr07 44381471 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:112,0,859 Chr07 44386098 . A T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.56;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:27:101,0,27 Chr07 44389881 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,239 Chr07 44419793 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44459907 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44468306 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 44468324 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44469000 . T C 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:153,0,24 Chr07 44473654 . C T 24.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:53,0,26 Chr07 44473689 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr07 44475099 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44475100 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44475131 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44569640 . A G 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;DP=59;Dels=0.00;FS=3.172;HaplotypeScore=46.7569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQ0=0;MQRankSum=0.112;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,9:59:99:126,0,1621 Chr07 44570396 . G T 107.85 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:154,12,0 Chr07 44577240 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 44627695 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 44627703 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 44627925 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 44628141 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr07 44628630 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 44628905 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44630294 . G A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr07 44630303 . G A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr07 44630305 . C A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr07 44630314 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.72;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:74,6,0 Chr07 44630352 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 44630369 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 44630748 . G T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr07 44630776 . C T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr07 44631026 . A T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:134,0,27 Chr07 44631224 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44631248 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 44631694 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 44637120 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 44638402 . A G 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr07 44655190 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:93,0,28 Chr07 44655235 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 44662561 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr07 44678841 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 44679725 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=2.94;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:90:90,0,617 Chr07 44684333 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 44699175 . A G 83.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:112,0,27 Chr07 44756155 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44772214 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 44813780 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,195 Chr07 44813784 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,146 Chr07 44819733 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.675;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.675;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.675 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:89:89,0,831 Chr07 44833466 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.142;DP=32;Dels=0.00;FS=2.470;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.339;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:58:58,0,994 Chr07 44879161 . T G 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:84:84,0,369 Chr07 44884369 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 44884371 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 44885887 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.640;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.503;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.686 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:80:80,0,1036 Chr07 44885905 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.167;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.438 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:83:83,0,976 Chr07 44885917 . A C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:69:69,0,608 Chr07 44902937 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.107;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.102;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.178 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:90:90,0,841 Chr07 44902940 . T A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.249;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:90:90,0,842 Chr07 44902958 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.391;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:91:91,0,839 Chr07 44903004 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.533;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:76:76,0,760 Chr07 44903013 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.599;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:75:75,0,765 Chr07 44914856 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=9.97;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:7:98:98,0,106 Chr07 44941367 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;DP=28;Dels=0.00;FS=17.975;HaplotypeScore=2.7863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.308;QD=4.17;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:145,0,772 Chr07 44952169 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,304 Chr07 45019732 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 45026841 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 45026896 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 45078512 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,328 Chr07 45097564 . T A 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.130;DP=14;Dels=0.00;FS=23.314;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.194;QD=11.20;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:185,0,270 Chr07 45174398 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr07 45178356 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,171 Chr07 45231510 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,72 Chr07 45251789 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.56;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 45280032 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:72,0,63 Chr07 45280049 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr07 45289934 . G T 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.575;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=6.22;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:165,0,592 Chr07 45387390 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 45398528 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 45414959 . A G 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.597;QD=8.52;ReadPosRankSum=-0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:122,0,238 Chr07 45420060 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,147 Chr07 45429318 . T C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:107,0,104 Chr07 45429363 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:105,0,101 Chr07 45429378 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:65:65,0,147 Chr07 45429454 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,170 Chr07 45429459 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,172 Chr07 45429462 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,166 Chr07 45502871 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:62,0,29 Chr07 45505260 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 45505566 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 45506003 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.716;QD=3.21;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:27:99:115,0,778 Chr07 45506099 . T A 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;DP=12;Dels=0.00;FS=26.646;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.378;QD=13.90;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:195,0,201 Chr07 45510282 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 45512747 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,131 Chr07 45512957 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 45518422 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 45525106 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 45532455 . A G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;DP=63;Dels=0.00;FS=43.471;HaplotypeScore=3.9117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=0.96;ReadPosRankSum=-4.196 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,14:63:89:89,0,1179 Chr07 45615533 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,299 Chr07 45624187 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 45662986 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 45664347 . G A 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:66,0,26 Chr07 45664759 . C T 83.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:112,0,27 Chr07 45666476 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,225 Chr07 45666514 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,226 Chr07 45666537 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,211 Chr07 45666538 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,216 Chr07 45673992 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 45674038 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr07 45701501 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 45702989 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 45703075 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,99 Chr07 45709827 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 45736391 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.777;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:81:81,0,1198 Chr07 45778498 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 45792744 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.600;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:133,0,285 Chr07 45819262 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:84:84,0,420 Chr07 45821633 . T A 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.511 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,7:34:99:181,0,967 Chr07 45821657 . C T 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.025;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.123;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.019 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,8:36:99:228,0,997 Chr07 45821694 . C T 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.787;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.787;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.962 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,8:35:99:221,0,963 Chr07 45826692 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,102 Chr07 45827642 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr07 45827643 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr07 45830912 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,111 Chr07 45830925 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,110 Chr07 45830931 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr07 45837369 . G C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,227 Chr07 45840787 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 45867299 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 45891664 . C G 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr07 45892346 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,162 Chr07 45928838 . A T 209.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=17.48;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:238,0,163 Chr07 45979367 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr07 45979396 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr07 45979776 . C G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,106 Chr07 45980732 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,149 Chr07 45980736 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,148 Chr07 45980742 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:51:51,0,143 Chr07 45980746 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,148 Chr07 45990518 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,182 Chr07 45996292 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr07 46020497 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr07 46020507 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:71,0,29 Chr07 46037998 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;DP=31;Dels=0.00;FS=2.507;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.501;QD=1.19;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:65:65,0,895 Chr07 46041152 . T C 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.880;QD=5.55;ReadPosRankSum=-2.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:117,0,450 Chr07 46058008 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,141 Chr07 46058102 . T G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,301 Chr07 46058122 . T C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.62;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:90:90,0,297 Chr07 46069573 . T A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.89;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:126,0,204 Chr07 46083533 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr07 46083541 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 46085180 . C G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,219 Chr07 46094562 . G A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,170 Chr07 46132477 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.777;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.474;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:63:63,0,559 Chr07 46141167 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 46167172 . T C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.106;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:87:87,0,290 Chr07 46167191 . T A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,295 Chr07 46169227 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.050;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.750;QD=3.36;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:92:92,0,557 Chr07 46192545 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr07 46204868 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.504;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.221;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.331 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:107,0,578 Chr07 46207548 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.428;DP=51;Dels=0.00;FS=1.945;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.188;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.808 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,5:51:53:53,0,1745 Chr07 46267026 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,262 Chr07 46281109 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 46303807 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,100 Chr07 46315773 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,100 Chr07 46322612 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,216 Chr07 46324495 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:50:50,0,181 Chr07 46325354 . T C 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.548;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:141,0,626 Chr07 46325407 . A G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:82:82,0,445 Chr07 46331544 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.905;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.046;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:85:85,0,672 Chr07 46331575 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:94:94,0,789 Chr07 46331631 . A G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=2.47;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:90:90,0,777 Chr07 46336872 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,241 Chr07 46345205 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 46397067 . C A 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:97:169,0,97 Chr07 46404907 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 46429441 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,182 Chr07 46429483 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,256 Chr07 46430695 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,183 Chr07 46440954 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr07 46443567 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,111 Chr07 46444057 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 46446645 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 46446650 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 46446700 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 46447282 . C A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQ0=0;MQRankSum=1.333;QD=8.55;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:148,0,285 Chr07 46454901 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.303;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:73:73,0,570 Chr07 46454921 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:71:71,0,553 Chr07 46457369 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 46466885 . C T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.331;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:107,0,599 Chr07 46477879 . G C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.855;QD=1.33;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:72:72,0,1027 Chr07 46477881 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.572;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.083;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:67:67,0,1116 Chr07 46477882 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=1.27;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:70:70,0,1108 Chr07 46478202 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr07 46478221 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr07 46478255 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr07 46536094 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.437;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,361 Chr07 46537627 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.066 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:59:59,0,528 Chr07 46541309 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.503 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:63:63,0,607 Chr07 46552543 . G T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:57:128,0,57 Chr07 46553976 . A T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.566;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,275 Chr07 46554738 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.382;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.650;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:16:71:71,0,441 Chr07 46554835 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,327 Chr07 46869143 . G T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.73;MQ0=11;MQRankSum=0.736;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,2:14:6:60,6,0 Chr07 46932070 . G T 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr07 46974660 . A T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.408;QD=12.25;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:163,0,200 Chr07 46985115 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,149 Chr07 46992006 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr07 47006379 . C T 293.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:322,24,0 Chr07 47007064 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.386;DP=31;Dels=0.00;FS=9.209;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.854;QD=0.80;ReadPosRankSum=-2.622 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:53:53,0,985 Chr07 47027529 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=16.580;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.650;QD=2.65;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:68:68,0,404 Chr07 47097632 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 47255576 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 47256971 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.611;QD=5.34;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:135,0,557 Chr07 47269383 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 47359061 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 47365079 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 47386669 . C A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr07 47388846 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,492 Chr07 47388931 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 47402898 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,253 Chr07 47461035 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 47495011 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.804;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,434 Chr07 47503770 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 47577520 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 47608509 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.592;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,363 Chr07 47608605 . C A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:139,0,26 Chr07 47660127 . G C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr07 47670405 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 47716377 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 47764948 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr07 47840023 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:49,0,221 Chr07 47845046 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,99 Chr07 47874599 . A T 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:122,0,178 Chr07 47956818 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 47982167 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 48050961 . A T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.053;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.265;QD=3.93;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:99,0,493 Chr07 48083293 . C A 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.924;DP=50;Dels=0.00;FS=10.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.463;QD=2.60;ReadPosRankSum=-4.459 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,8:50:99:158,0,1526 Chr07 48089828 . A T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;DP=32;Dels=0.00;FS=4.625;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.086;QD=3.56;ReadPosRankSum=-3.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:142,0,946 Chr07 48240155 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 48268954 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,61 Chr07 48420069 . C A 145.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=20.83;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:7:21:174,0,21 Chr07 48424247 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,142 Chr07 48433356 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 48449765 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 48449783 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 48449788 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 48449795 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 48485033 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr07 48486131 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 48487202 . A G 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr07 48487390 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr07 48492215 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 48497662 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr07 48497663 . A T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr07 48505042 . G A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.35;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:103,0,181 Chr07 48508498 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 48520749 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 48520848 . C T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:107,0,107 Chr07 48520867 . T C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:102,0,101 Chr07 48520883 . C G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:104,0,108 Chr07 48520887 . C G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:105,0,108 Chr07 48520903 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,106 Chr07 48521764 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,165 Chr07 48525276 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 48525313 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 48525320 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 48525334 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 48536680 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 48548714 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr07 48548721 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr07 48554906 . T C 46.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.24;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:75,0,22 Chr07 48557967 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 48561416 . C A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.97;MQ0=0;MQRankSum=1.686;QD=2.77;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:139,0,896 Chr07 48563830 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,7:54:99:131,0,1804 Chr07 48563889 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 48591970 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr07 48594857 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr07 48595698 . T C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:93:93,0,183 Chr07 48638603 . C A 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr07 48681997 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;DP=23;Dels=0.00;FS=39.472;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.446;QD=2.47;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:85:85,0,702 Chr07 48835587 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr07 48835683 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:103,0,67 Chr07 48873965 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;DP=44;Dels=0.00;FS=8.033;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.256;QD=1.56;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:44:97:97,0,1439 Chr07 48913339 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.011;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=4.37;ReadPosRankSum=-4.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:168,0,928 Chr07 48915321 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.756;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.265;QD=2.20;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:114,0,1235 Chr07 48942623 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.738;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.094;QD=4.37;ReadPosRankSum=-4.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:168,0,920 Chr07 48951088 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 48964393 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr07 49074060 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,219 Chr07 49082518 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.07;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr07 49100017 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,285 Chr07 49104141 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr07 49129251 . G T 176.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.309;DP=34;Dels=0.00;FS=5.107;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.629;QD=5.20;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:205,0,945 Chr07 49196557 . T A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:135,0,64 Chr07 49256419 . C A 180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;DP=58;Dels=0.00;FS=20.415;HaplotypeScore=1.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.319;QD=3.12;ReadPosRankSum=-4.312 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,10:58:99:209,0,1696 Chr07 49284227 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:75,0,32 Chr07 49284228 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:31:75,0,31 Chr07 49284244 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:31:75,0,31 Chr07 49295012 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=1.36;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:54:54,0,578 Chr07 49303119 . G A 39.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:68,0,20 Chr07 49304567 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr07 49334403 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 49342574 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 49409420 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 49436327 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.174;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.950;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,563 Chr07 49454221 . C A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:139,0,26 Chr07 49480349 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.78;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:126,0,206 Chr07 49526163 . C A 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=24.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:248,0,54 Chr07 49645885 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr07 49735170 . G T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.731;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=2.02;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:109,0,1273 Chr07 49740394 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 49746702 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,157 Chr07 49822256 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,69 Chr07 49822871 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,261 Chr07 49831572 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:127,0,100 Chr07 49831668 . C A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr07 50052860 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;DP=11;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.663;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,235 Chr07 50059032 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 50059074 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr07 50059098 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr07 50059242 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 50061016 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr07 50061020 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 50061030 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 50061039 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr07 50061044 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 50061046 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 50070485 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,144 Chr07 50090853 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr07 50139935 . G T 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.083;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.694;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:116,0,321 Chr07 50149712 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.84;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:38:65,0,38 Chr07 50216611 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 50273900 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 50273913 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr07 50281296 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 50281300 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 50281329 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 50283931 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 50283937 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 50338373 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;DP=26;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.976;QD=3.30;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:114,0,714 Chr07 50429253 . G T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.732;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=3.69;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:36:99:161,0,1033 Chr07 50429339 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;DP=48;Dels=0.00;FS=2.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,6:48:85:85,0,1535 Chr07 50550416 . A C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,185 Chr07 50552287 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 50564979 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:82:82,0,260 Chr07 50566936 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,178 Chr07 50575525 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:66:66,0,333 Chr07 50578425 . A T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.350;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.350;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.750 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:97:97,0,510 Chr07 50578612 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,238 Chr07 50596156 . C T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.417;DP=19;Dels=0.00;FS=2.017;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.602;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:146,0,501 Chr07 50596159 . G C 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.070;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:156,0,453 Chr07 50613632 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,227 Chr07 50616177 . C G 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=2.730;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:92:92,0,236 Chr07 50628493 . T A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.553;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.043;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.128 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:90:90,0,617 Chr07 50635168 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 50635203 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr07 50637946 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr07 50662832 . T G 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;DP=15;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.072;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:81:81,0,446 Chr07 50728180 . C T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr07 50731593 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 50733780 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr07 50737952 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 50738145 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 50744803 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 50746187 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 50768657 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr07 50768741 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 50768749 . A G 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 50807205 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 50807265 . C A 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr07 50820784 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr07 50822261 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr07 50829366 . G C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr07 50831913 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 50839661 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 50858143 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr07 50865809 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 50865818 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 50867291 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 50867334 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr07 50891219 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 50914747 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.84;MQ0=0;QD=1.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:59,6,0 Chr07 50917290 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 50927525 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.457;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.457 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:113,0,360 Chr07 50927626 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,190 Chr07 50929377 . C T 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.430;DP=72;Dels=0.00;FS=3.636;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.907;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,9:72:99:140,0,2345 Chr07 50929453 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:80:80,0,365 Chr07 50930898 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,253 Chr07 50942458 . C G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr07 50945753 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 50952930 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr07 50971512 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr07 50975334 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr07 50980125 . G T 510.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.075;QD=30.05;ReadPosRankSum=-2.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,15:17:31:539,0,31 Chr07 51020668 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr07 51033986 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 51034348 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 51034370 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51034374 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51034383 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51034419 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 51034428 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 51035541 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,279 Chr07 51038131 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 51038507 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr07 51038515 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr07 51044785 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,140 Chr07 51045118 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 51046143 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:53:53,0,233 Chr07 51047149 . T C 41.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 51076748 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 51146917 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 51147151 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51147595 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,263 Chr07 51147596 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,265 Chr07 51150411 . C A 162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=11.63;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:14:99:191,0,243 Chr07 51154822 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,133 Chr07 51154837 . T G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.82;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,136 Chr07 51154840 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=8.47;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:96:96,0,177 Chr07 51154856 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr07 51157596 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51166709 . T A 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr07 51166722 . A G 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr07 51170077 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr07 51170288 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 51170307 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr07 51171444 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 51176405 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 51178874 . T C 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr07 51218323 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr07 51219214 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.63;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:6:62:62,0,105 Chr07 51223425 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 51231579 . C A 308.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:337,24,0 Chr07 51231585 . G A 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 Chr07 51231590 . C A 307.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:336,24,0 Chr07 51231602 . T C 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr07 51233218 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.000;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:157,0,249 Chr07 51234359 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51235517 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 51244842 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51244849 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51244867 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 51244876 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 51244886 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr07 51245715 . T A 152.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:181,15,0 Chr07 51245717 . G C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr07 51245797 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr07 51245894 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:56:56,0,600 Chr07 51246163 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr07 51254884 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 51258912 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 51263457 . C T 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 51267410 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 51278775 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51278820 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 51288457 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 51291336 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 51292683 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=41;Dels=0.00;FS=4.909;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=1.90;ReadPosRankSum=-2.932 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:106,0,1284 Chr07 51292763 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=3.34;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:20:95:95,0,532 Chr07 51324892 . G T 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.167;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.233;QD=5.16;ReadPosRankSum=-3.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:152,0,659 Chr07 51325961 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51331959 . G C 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr07 51408000 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 51416405 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;DP=20;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.953;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,627 Chr07 51420707 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51424860 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 51428996 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr07 51450704 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr07 51450734 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51451765 . A T 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:142,0,27 Chr07 51458064 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr07 51458067 . T G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr07 51500941 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr07 51501107 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr07 51501128 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr07 51514026 . A C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr07 51514052 . C T 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr07 51530808 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 51530834 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr07 51539620 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr07 51540401 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr07 51552701 . T G 42.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:71,0,27 Chr07 51555732 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 51555764 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr07 51558882 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr07 51561525 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,217 Chr07 51566059 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 51580819 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr07 51600850 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,109 Chr07 51601441 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr07 51628420 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:40:135,0,40 Chr07 51628425 . T A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr07 51665493 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr07 51666621 . G T 33.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr07 51713993 . C G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr07 51720208 . A T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr07 51720304 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:8:56:56,0,185 Chr07 51725799 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.333;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:81:81,0,1201 Chr07 51734084 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr07 51740198 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr07 51743679 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr07 51743724 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 164507 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 174058 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 178489 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 191015 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 191036 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 191044 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 213087 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 215537 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 227237 . C G 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr08 227246 . G C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 227395 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 227415 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 228223 . G C 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:153,0,27 Chr08 240201 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 240469 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 265319 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 267355 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr08 267374 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr08 267771 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 267790 . G T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 277539 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 283806 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 285598 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 285599 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 285621 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 293280 . G A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.61;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr08 293334 . T G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.61;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr08 295037 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 301295 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 325097 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 330665 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 332725 . C A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.151;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:130,0,1311 Chr08 332965 . A T 161.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 418811 . G T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 418825 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 418837 . A T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr08 419383 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 419496 . C T 135.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 421017 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 421022 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 421024 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 422786 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 422792 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 422808 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 422811 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 449687 . T A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 449725 . A T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 449739 . C G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 451081 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 451088 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 451593 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.673;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,423 Chr08 452472 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 452613 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr08 453088 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 455100 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 455127 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 488765 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 491961 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.43;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 494347 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 494966 . G T 180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.552;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.522;QD=5.32;ReadPosRankSum=-4.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:209,0,958 Chr08 511371 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 520237 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 553804 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=23.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,184 Chr08 554386 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:106,0,29 Chr08 554387 . A G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:108,0,29 Chr08 554442 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr08 556791 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr08 558789 . T G 88.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 562907 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 570086 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 578046 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 578048 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 578065 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 587326 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 587336 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 587346 . G A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr08 587385 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr08 587609 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 587622 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 587657 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 587671 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 587960 . C G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.674;DP=28;Dels=0.00;FS=2.634;HaplotypeScore=1.7335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=1.24;ReadPosRankSum=-2.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:63:63,0,842 Chr08 597282 . G T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.151;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.337;QD=2.53;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:43:99:137,0,1313 Chr08 597378 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.067;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=7.18;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:15:99:136,0,329 Chr08 618241 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:135,0,62 Chr08 659451 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 660422 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.11;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 662996 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 667044 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr08 669645 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 706794 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 706809 . A C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 707463 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 718521 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 718525 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 719590 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 719608 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 722301 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 722347 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 722518 . G A 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:136,0,24 Chr08 725377 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.3507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.68;MQ0=4;MQRankSum=-2.250;QD=0.76;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,39:43:61:61,0,64 Chr08 725384 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=22.3507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.84;MQ0=3;MQRankSum=2.430;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,4:42:61:61,0,65 Chr08 726587 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 758534 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 758926 . C A 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:67,0,27 Chr08 789578 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 789621 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 792777 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 808601 . T A 35.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 841203 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 841817 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 841818 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 843881 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 847687 . T A 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr08 895256 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 895263 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 895337 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 899120 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 899150 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 918837 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 918859 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 927952 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 935050 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 940966 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 941043 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 941071 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 944927 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 944935 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 944973 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 944976 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 949828 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 949833 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 952150 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 952191 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 952775 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,402 Chr08 953990 . G T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr08 962096 . T G 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.63;MQ0=33;QD=1.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:9:92,9,0 Chr08 970776 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 979670 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 1010289 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 1017750 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 1052152 . G T 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:68,0,23 Chr08 1062741 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 1062742 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 1062757 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 1062775 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 1062783 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 1062812 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 1062823 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.02;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 1102373 . T C 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 1216375 . G T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:98:169,0,98 Chr08 1232637 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.1942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.24;MQ0=73;MQRankSum=-3.778;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:92,24:116:66:66,0,472 Chr08 1283437 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 1284098 . T A 39.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,111 Chr08 1574148 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,107 Chr08 1574298 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1581326 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.191;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=1.69;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:99:101,0,1342 Chr08 1604955 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:62:62,0,1406 Chr08 1664544 . C T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:134,0,26 Chr08 1664590 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 1673509 . A T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=12.72;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:130,0,140 Chr08 1692667 . T A 40.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:69,0,23 Chr08 1693761 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 1694030 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 1694256 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 1694271 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 1708509 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 1708540 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 1716001 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 1722714 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.251 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,542 Chr08 1726366 . T G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 1726371 . T G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 1726414 . A G 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr08 1727276 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.53;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 1727309 . T G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.53;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 1727344 . T A 108.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:137,0,26 Chr08 1734865 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 1744621 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;DP=41;Dels=0.00;FS=15.045;HaplotypeScore=2.3660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.982;QD=0.87;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:41:64:64,0,1320 Chr08 1744774 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 1759341 . T A 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.464;DP=16;Dels=0.00;FS=21.553;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.36;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:178,0,333 Chr08 1768923 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 1768925 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 1795799 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 1795848 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 1795858 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 1801712 . G T 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.37;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 Chr08 1809512 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:96,0,65 Chr08 1809717 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 1810716 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,69 Chr08 1811444 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 1811513 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1811525 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1812731 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 1812744 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 1812765 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 1812785 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 1812786 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 1813708 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 1813719 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 1813789 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 1825078 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:106,0,29 Chr08 1825620 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 1826436 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 1827045 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 1834549 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 1854160 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1885977 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 1886035 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 1886226 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 1892585 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,221 Chr08 1903472 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1907683 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,97 Chr08 1916342 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1916348 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 1918914 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.003;DP=60;Dels=0.00;FS=7.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.474;QD=1.01;ReadPosRankSum=-4.053 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,7:60:89:89,0,1938 Chr08 1922364 . C T 215.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:244,18,0 Chr08 1923001 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 1928515 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 1954955 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:58:58,0,142 Chr08 1955002 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,150 Chr08 2010997 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr08 2011001 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr08 2011014 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr08 2023858 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2025774 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2047222 . G A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr08 2052477 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.499;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:40:72:72,0,1233 Chr08 2066682 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 2074321 . G T 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;DP=11;Dels=0.00;FS=2.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.387;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:173,0,203 Chr08 2074753 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,100 Chr08 2082003 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr08 2082026 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 2082066 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr08 2082067 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr08 2082505 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 2082567 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 2082572 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 2082888 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 2082934 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 2082949 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2085873 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2091424 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 2093571 . A G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:95,0,66 Chr08 2095247 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr08 2098501 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,105 Chr08 2104935 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2116193 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 2116245 . G A 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:102,0,25 Chr08 2122111 . A G 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:147,0,99 Chr08 2131353 . A G 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr08 2140752 . A T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:57:265,0,57 Chr08 2140846 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2140861 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2140864 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2162102 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2162144 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2163066 . G T 179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=19.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:93:208,0,93 Chr08 2163997 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2164073 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 2165290 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,110 Chr08 2175319 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 2185177 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:65,0,52 Chr08 2187255 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 2191015 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2193012 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:100,0,66 Chr08 2205553 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 2208630 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 2222120 . G T 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQ0=0;MQRankSum=-4.104;QD=3.10;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:39:99:149,0,1160 Chr08 2242297 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:83:83,0,745 Chr08 2284517 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 2286565 . T A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:136,0,144 Chr08 2286929 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,72 Chr08 2297167 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=18;Dels=0.00;FS=19.117;HaplotypeScore=3.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,530 Chr08 2297171 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;DP=33;Dels=0.00;FS=5.391;HaplotypeScore=4.8914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.634;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:51:51,0,1052 Chr08 2297247 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,587 Chr08 2317699 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2318422 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,143 Chr08 2321070 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr08 2321082 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,183 Chr08 2321096 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,187 Chr08 2324654 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:98,0,96 Chr08 2339574 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2344030 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2350219 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 2352770 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.38;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 2362591 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2382306 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr08 2382344 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr08 2382350 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:71,0,63 Chr08 2392681 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 2394237 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr08 2401274 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 2401842 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2402064 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 2402554 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2402555 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2402596 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2402599 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2402608 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2402627 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2408376 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2408419 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2408443 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2408447 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2409354 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 2416253 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2416262 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2416266 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2417125 . A T 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr08 2417204 . T C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:138,0,24 Chr08 2418714 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr08 2422460 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:79,6,0 Chr08 2422482 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 2422941 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 2425896 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2429283 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,102 Chr08 2429288 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,94 Chr08 2429332 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,171 Chr08 2430762 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2430776 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2480863 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 2487982 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:159,12,0 Chr08 2494069 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.11;MQ0=0;QD=9.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:83,6,0 Chr08 2494082 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.11;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=8.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:81,6,0 Chr08 2502568 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.020;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=1.76;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:74:74,0,823 Chr08 2508286 . G T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:49:108,0,49 Chr08 2508433 . G T 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.186;DP=23;Dels=0.00;FS=12.879;HaplotypeScore=2.9782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.085;QD=5.38;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:152,0,619 Chr08 2508556 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,72 Chr08 2512274 . C T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 2516739 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.105;DP=27;Dels=0.00;FS=35.453;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.375;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,886 Chr08 2516742 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.174;DP=27;Dels=0.00;FS=35.453;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.034;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:71:71,0,860 Chr08 2516745 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;DP=29;Dels=0.00;FS=28.316;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.170;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:61:61,0,955 Chr08 2521686 . G T 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.759;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.544;QD=3.73;ReadPosRankSum=-3.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:140,0,897 Chr08 2532041 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 2539811 . G A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:100,0,30 Chr08 2540410 . T G 274.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;DP=50;Dels=0.00;FS=20.413;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=1.007;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.656 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,11:50:99:303,0,1407 Chr08 2540417 . G T 313.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.757;DP=40;Dels=0.00;FS=7.981;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.818;QD=7.84;ReadPosRankSum=-2.241 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,11:40:99:342,0,1061 Chr08 2540584 . C G 114.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22:143,0,22 Chr08 2540585 . C A 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:145,0,24 Chr08 2551397 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2551719 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2551725 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2551738 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 2552783 . A C 362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.09;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:391,30,0 Chr08 2552808 . C T 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.32;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr08 2559816 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2561807 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr08 2563448 . G C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 2563502 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2566535 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2566721 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:70,0,63 Chr08 2573271 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr08 2580196 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 2587285 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,101 Chr08 2592171 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 2593644 . C A 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr08 2601802 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=24.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.930;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,355 Chr08 2621673 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2634210 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2639084 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 2701390 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.55;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr08 2715292 . C G 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr08 2715505 . G T 255.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:24:284,24,0 Chr08 2716297 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 2716316 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2716322 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2716337 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2716363 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2728564 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:48:100,0,48 Chr08 2728572 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 2728604 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2731202 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2731282 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 2757946 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.09;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr08 2758087 . A T 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.586;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.58;MQ0=0;MQRankSum=3.059;QD=8.11;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:158,0,143 Chr08 2767186 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2779403 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 2786929 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 2797925 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 2798996 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2799041 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2799521 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2799925 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2801351 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 2801369 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 2811004 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 2812256 . A G 158.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:187,0,24 Chr08 2813721 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 2813731 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 2814556 . T G 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 Chr08 2821076 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 2849571 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2849572 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 2880285 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2893674 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 2901455 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 2911046 . A G 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:151,0,26 Chr08 2911050 . C T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr08 2911422 . T C 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr08 2911433 . A T 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr08 2911462 . G A 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=0;QD=18.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:101,9,0 Chr08 2911514 . A G 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.25;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr08 2921952 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:72,0,29 Chr08 2923286 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 2927616 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 2928569 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 2928709 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr08 2928726 . C G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr08 2950817 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 2965117 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2967012 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 2974729 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 3031214 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=21.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:115,9,0 Chr08 3031298 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 3034349 . C T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr08 3034351 . G A 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr08 3034361 . G A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=18.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:139,0,65 Chr08 3035452 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 3035490 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 3037116 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 3037132 . C G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 3052568 . T A 361.28 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.107;QD=32.84;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,10:11:9:389,0,9 Chr08 3082459 . C A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.03;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 3101119 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,142 Chr08 3110252 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 3110260 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 3110277 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 3112742 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 3112747 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 3118797 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3154855 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3178923 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.391;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.453;QD=4.03;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:121,0,672 Chr08 3179394 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 3194135 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 3199217 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:102,0,66 Chr08 3231628 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3231629 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 3234053 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 3234062 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3235895 . T G 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.766 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:36:99:145,0,1116 Chr08 3235913 . C T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.531;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.743;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,6:36:99:145,0,1156 Chr08 3240535 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3240714 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 3240726 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3240730 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3278541 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.312;QD=6.67;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:115,0,329 Chr08 3280207 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3282937 . G C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 3282942 . T G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 3282972 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3283313 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 3294177 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 3298515 . G T 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:68,0,26 Chr08 3311223 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr08 3311226 . A C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr08 3311245 . A T 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr08 3312663 . A T 45.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 3320574 . A C 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=19.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:62:168,0,62 Chr08 3337405 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3338949 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 3338963 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3339034 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3342559 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 3343369 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3343456 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 3346725 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3351659 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 3351698 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3351699 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 3352849 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 3357432 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3363332 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr08 3387753 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,222 Chr08 3393598 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=20.10;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:53:189,0,53 Chr08 3404305 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3404316 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 3479948 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 3479986 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 3492226 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 3507303 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 3507306 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:64,0,30 Chr08 3511496 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3511507 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3575475 . G T 94.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:123,0,27 Chr08 3575514 . G C 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:82,0,69 Chr08 3575517 . T C 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:82,0,68 Chr08 3575907 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3603618 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3603631 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3603672 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3607124 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 3624246 . C A 181.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.97;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:210,0,20 Chr08 3624479 . A C 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr08 3624724 . A C 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=16.15;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:222,0,159 Chr08 3624745 . G A 205.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:234,0,175 Chr08 3624761 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,173 Chr08 3624764 . A C 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=17.98;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:244,0,174 Chr08 3624775 . T G 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=18.15;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:246,0,174 Chr08 3624794 . T C 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.793;QD=18.40;ReadPosRankSum=2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:99:249,0,175 Chr08 3627004 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3652647 . C G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 3675066 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 3686898 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,513 Chr08 3696529 . C A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=30.9871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=2.527;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.969 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:108,0,1294 Chr08 3700556 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3702097 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3702218 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 3702223 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3704037 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3704095 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3705079 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3721364 . A G 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:114,0,26 Chr08 3727133 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 3727139 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3727978 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 3734643 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 3737170 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3737183 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3737184 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 3737190 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3737206 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3737214 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 3737217 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 3744167 . G T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr08 3752752 . C A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr08 3754947 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,331 Chr08 3755120 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 3755146 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3755184 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3755189 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 3755193 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3764548 . G T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.898;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.468;QD=2.97;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:150,0,1269 Chr08 3776827 . G T 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.196;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=-4.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,9:62:99:159,0,1973 Chr08 3784388 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3795065 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 3802797 . T A 447.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.849;QD=26.34;ReadPosRankSum=-1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,13:17:99:476,0,116 Chr08 3805179 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:69,0,66 Chr08 3805279 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=80;Dels=0.00;FS=21.138;HaplotypeScore=8.9962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.154;QD=0.53;ReadPosRankSum=-4.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,8:80:71:71,0,2628 Chr08 3810009 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 3810053 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 3810638 . A T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,182 Chr08 3817982 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 3818014 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 3836801 . C T 110.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:139,0,23 Chr08 3853920 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 3853946 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 3869635 . G T 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr08 3887258 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 3887296 . G T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 3887301 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 3895020 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3895045 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 3895083 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 3895084 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 3895156 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3895160 . G T 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr08 3896248 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr08 3896275 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr08 3900009 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,110 Chr08 3900021 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,101 Chr08 3925177 . T G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.62;MQ0=19;MQRankSum=1.197;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:99:112,0,128 Chr08 3925212 . G C 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.269;DP=41;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.32;MQ0=19;MQRankSum=1.198;QD=3.29;ReadPosRankSum=-0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:163,0,122 Chr08 3935295 . C G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 3935302 . A C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr08 3935417 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 3935427 . T C 41.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:70,0,22 Chr08 3935479 . G A 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:101,0,24 Chr08 3936808 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3936841 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3965996 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.799;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:85:85,0,1129 Chr08 3966093 . C A 145.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=20.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:18:174,0,18 Chr08 3981547 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 3986084 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;DP=30;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=1.23;ReadPosRankSum=-1.800 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:65:65,0,879 Chr08 4005311 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.972;DP=42;Dels=0.00;FS=23.407;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=0.95;ReadPosRankSum=-3.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:68:68,0,1219 Chr08 4040304 . G T 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.799;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.785;QD=2.60;ReadPosRankSum=-3.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,6:36:99:122,0,1117 Chr08 4040389 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=11.97;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:124,0,138 Chr08 4086683 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr08 4143072 . A G 224.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=28.12;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:14:253,0,14 Chr08 4144710 . G C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 Chr08 4153397 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4153475 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 4172147 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 4172348 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 4172581 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 4172593 . T A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr08 4172617 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 4172629 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr08 4172678 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr08 4174061 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.442;QD=1.06;ReadPosRankSum=-3.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:61:61,0,1006 Chr08 4187434 . G T 109.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:138,0,23 Chr08 4191295 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4191306 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 4212091 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 4212099 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4215586 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:109,0,67 Chr08 4215601 . G C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:103,0,62 Chr08 4245306 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr08 4270828 . C T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 4270884 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 4273102 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 4273184 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,126 Chr08 4278963 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 4282858 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4282859 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 4288120 . C G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr08 4308288 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 4311361 . T C 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:105,0,29 Chr08 4315766 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 4328469 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 4339287 . C A 175.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.12;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:20:204,0,20 Chr08 4340607 . T C 844.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:63:873,63,0 Chr08 4342261 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 4342301 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 4345468 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 4386352 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 4388013 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4388057 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 4388573 . A C 271.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.212;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.271;QD=20.91;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:300,0,133 Chr08 4388627 . A T 256.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=19.75;ReadPosRankSum=2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:99:285,0,162 Chr08 4406461 . A T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 4414105 . A G 77.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:106,0,22 Chr08 4415042 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 4415521 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:110,0,66 Chr08 4428601 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,174 Chr08 4444416 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4477816 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 4489479 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr08 4499641 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 4504469 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 4514086 . T G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:103,0,69 Chr08 4523244 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:52:52,0,143 Chr08 4523579 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 4541042 . A T 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;DP=24;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=6.24;ReadPosRankSum=0.500 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:178,0,650 Chr08 4541048 . C T 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;DP=24;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.100;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:176,0,661 Chr08 4541058 . A G 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;DP=24;Dels=0.00;FS=2.066;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.367;QD=6.03;ReadPosRankSum=1.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:99:173,0,656 Chr08 4542480 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 4542485 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 4543204 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:107,0,63 Chr08 4551154 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4551177 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 4551198 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4553805 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:96:96,0,127 Chr08 4554859 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr08 4554862 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr08 4555433 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.157;QD=4.44;ReadPosRankSum=-3.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:126,0,625 Chr08 4557778 . G C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 4557809 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 4557849 . G T 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr08 4557896 . T C 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.05;MQ0=0;QD=13.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:82,9,0 Chr08 4557911 . A G 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.05;MQ0=0;QD=13.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:82,9,0 Chr08 4566778 . A C 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=21.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:203,0,56 Chr08 4568165 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 4568203 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 4575165 . G T 146.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:175,0,23 Chr08 4579285 . A T 251.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.377;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=22.89;ReadPosRankSum=1.931 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:89:280,0,89 Chr08 4580128 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:73,0,28 Chr08 4584127 . A G 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:57:129,0,57 Chr08 4587076 . T A 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:60,0,29 Chr08 4600477 . T A 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=19.29;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:144,0,59 Chr08 4600537 . T A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:107,0,30 Chr08 4600560 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr08 4605071 . G A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.356;DP=33;Dels=0.00;FS=11.716;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.859;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:164,0,926 Chr08 4619825 . A C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.667;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,169 Chr08 4619859 . G C 308.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.667;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.267;QD=22.05;ReadPosRankSum=0.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:337,0,167 Chr08 4619900 . A T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,167 Chr08 4621734 . G C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 4621740 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 4621799 . G T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 4621807 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 4622004 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 4622045 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 4622053 . G T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 4631016 . T C 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:145,0,26 Chr08 4631858 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4635302 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 4641404 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 4694146 . T G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,119 Chr08 4696034 . C T 198.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.41;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:227,0,18 Chr08 4704247 . T C 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.635;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.635 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:160,0,243 Chr08 4705451 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 4705494 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 4705502 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 4707281 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 4707318 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 4728645 . C A 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=23.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:241,0,55 Chr08 4744112 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 4744123 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 4744125 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 4744160 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 4750770 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 4763342 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 4784172 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 4797096 . A T 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.08;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:119,0,191 Chr08 4797145 . C T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=9.28;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:121,0,214 Chr08 4797149 . T A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:125,0,178 Chr08 4839514 . T C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:100,0,30 Chr08 4839518 . G A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr08 4842639 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4846754 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 4867704 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 4867723 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4874199 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.790;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=3.24;ReadPosRankSum=-3.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:33:99:135,0,970 Chr08 4879395 . C A 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:49:170,0,49 Chr08 4880043 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 4890500 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4892016 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 4895550 . A G 38.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:67,0,23 Chr08 4939429 . C T 160.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:189,0,24 Chr08 4939572 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 4940017 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr08 4958446 . A T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr08 4969105 . G A 196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=21.86;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:225,0,99 Chr08 4969151 . A G 196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.203;QD=21.86;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:225,0,98 Chr08 4972370 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 4974946 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,64 Chr08 4974955 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:45:92,0,45 Chr08 4985782 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,61 Chr08 4999492 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,180 Chr08 5004472 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 5012079 . T C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:107,0,28 Chr08 5017228 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5017357 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5019685 . A T 33.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:62,0,22 Chr08 5023853 . C T 325.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.099;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:32:354,0,32 Chr08 5036740 . G T 39.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 5098022 . A C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 5103385 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;DP=20;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,604 Chr08 5103848 . G C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 5103870 . T A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 5103890 . A T 141.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 5111158 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5118414 . A C 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr08 5118433 . G A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr08 5125436 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 5125508 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 5125512 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 5125526 . G T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 5125533 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 5129834 . A C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.27;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 5167182 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 5171691 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5174332 . G A 148.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:177,0,23 Chr08 5182503 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.467;QD=3.27;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:74:74,0,372 Chr08 5208189 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 5208214 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5245607 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.964;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-4.162;QD=2.62;ReadPosRankSum=-4.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:141,0,1347 Chr08 5254410 . A T 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=17;Dels=0.00;FS=6.317;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.31;MQ0=1;MQRankSum=1.898;QD=9.28;ReadPosRankSum=-3.308 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:186,0,318 Chr08 5254629 . G T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.880;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=-4.129;QD=3.04;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:150,0,1227 Chr08 5266788 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,181 Chr08 5268241 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 5268272 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 5268279 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5268284 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 5268334 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5268352 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5268366 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5270943 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 5271389 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr08 5272981 . C T 139.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5321539 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5357578 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 5388737 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr08 5390155 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 5390751 . A T 39.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 5525433 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5532165 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 5541303 . A T 121.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:150,0,27 Chr08 5560402 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5561401 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr08 5562061 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 5562063 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 5562625 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 5562871 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 5571566 . C A 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:6:26:139,0,26 Chr08 5571595 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr08 5592870 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 5610256 . C A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr08 5683717 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 5697632 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 5700737 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 5700813 . G A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 5700819 . T C 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr08 5703995 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 5800036 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 5800049 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.52;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 5928330 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5928335 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5928447 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 5936612 . A T 662.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:51:691,51,0 Chr08 5940315 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 5957981 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr08 5958039 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 5964285 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 5985385 . C G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 6029708 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 6040573 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.12;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 6040620 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.12;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 6057137 . C A 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 6100110 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 6119056 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=21;Dels=0.00;FS=34.123;HaplotypeScore=43.4929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=4.94;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:132,0,545 Chr08 6157662 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 6157673 . T C 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr08 6174671 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 6174716 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 6189326 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,371 Chr08 6227072 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 6260217 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,140 Chr08 6271544 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:81,6,0 Chr08 6307377 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 6317369 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr08 6327945 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 6345788 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 6351708 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6381208 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.88;MQ0=0;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:113,9,0 Chr08 6386144 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:106,0,29 Chr08 6389838 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6389841 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6389851 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6389856 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6389877 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6389885 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6392018 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr08 6392107 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 6439197 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 6454496 . T A 37.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:66,0,27 Chr08 6454501 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 6454502 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr08 6467665 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 6474193 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr08 6491925 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 6508962 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 6508969 . G A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 6508981 . T G 188.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:217,18,0 Chr08 6527814 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6527816 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 6546589 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 6549976 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 6567693 . C A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.301;QD=3.34;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:155,0,1160 Chr08 6569078 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 6569828 . G A 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.594;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.61;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=10.13;ReadPosRankSum=2.539 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:251,0,415 Chr08 6597562 . T C 117.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 6629313 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 6629320 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 6629339 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 6629354 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 6632148 . A G 98.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 6677194 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 6685589 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:52:52,0,144 Chr08 6685592 . G C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:52:52,0,145 Chr08 6685889 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:59:59,0,136 Chr08 6685923 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:56:56,0,182 Chr08 6775125 . G A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:91,12,0 Chr08 6845473 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 6845506 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 6878807 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 6878874 . G A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:86:102,0,86 Chr08 6880523 . T C 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:136,0,24 Chr08 6880532 . C T 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr08 6899378 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,210 Chr08 6904454 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,188 Chr08 6904479 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,186 Chr08 6924802 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 6926318 . G T 426.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.293;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.934;QD=28.45;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:37:455,0,37 Chr08 6955093 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr08 6960572 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 6968155 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 6968186 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 6993095 . C A 69.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:98,0,26 Chr08 7007959 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;DP=25;Dels=0.00;FS=10.193;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.187;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.964 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:61:61,0,690 Chr08 7013411 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr08 7059520 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.45;MQ0=5;MQRankSum=0.248;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:79:79,0,133 Chr08 7090582 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 7090642 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr08 7090718 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 7096731 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7114617 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=21;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.955;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,635 Chr08 7181929 . T C 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 7286571 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7292074 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 7292086 . T A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:110,0,29 Chr08 7292088 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:32:70,0,32 Chr08 7292099 . G C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 7292423 . A G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:103,0,30 Chr08 7292436 . A T 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:146,0,27 Chr08 7311336 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 7312886 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7314845 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 7320280 . C T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:114,0,28 Chr08 7320300 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7320313 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 7335656 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 7335660 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 7338451 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr08 7338476 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr08 7338505 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7338509 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 7343398 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 7355213 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 7356048 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7380139 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 7380150 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 7392999 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:103,0,28 Chr08 7403425 . T G 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.70;MQ0=0;MQRankSum=-3.241;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.177 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:121,0,332 Chr08 7403426 . A T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.48;MQ0=0;MQRankSum=-3.308;QD=5.61;ReadPosRankSum=1.139 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:118,0,345 Chr08 7403431 . T G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.419;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:112,0,421 Chr08 7403432 . T A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;DP=18;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-3.419;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:112,0,418 Chr08 7403450 . T G 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;DP=22;Dels=0.00;FS=1.860;HaplotypeScore=1.7803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.989;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.626 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,10:22:99:242,0,425 Chr08 7403778 . G T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;DP=25;Dels=0.00;FS=5.527;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.195;QD=4.23;ReadPosRankSum=2.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:134,0,586 Chr08 7403831 . A G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;DP=38;Dels=0.00;FS=7.751;HaplotypeScore=4.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.99;MQ0=0;MQRankSum=-3.183;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:91:91,0,1170 Chr08 7403851 . G C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.641;DP=35;Dels=0.00;FS=5.069;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQ0=0;MQRankSum=-3.698;QD=2.05;ReadPosRankSum=-3.217 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:100,0,1079 Chr08 7403853 . C T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;DP=33;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.83;MQ0=0;MQRankSum=-3.804;QD=2.36;ReadPosRankSum=-3.291 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:106,0,1013 Chr08 7405468 . C T 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.27;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:180,15,0 Chr08 7405469 . G T 149.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.27;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:178,15,0 Chr08 7406059 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 7406071 . A C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 7406077 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 7406083 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 7406093 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 7406119 . A T 236.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.18;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:265,21,0 Chr08 7427297 . T A 85.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.47;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:114,0,16 Chr08 7427318 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.533;DP=26;Dels=0.00;FS=41.746;HaplotypeScore=3.9733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.741;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:75:75,0,842 Chr08 7436230 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr08 7457092 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 7457131 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 7457138 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr08 7485440 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 7486168 . T C 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:132,0,144 Chr08 7487700 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 7488381 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 7488397 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7488403 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7488416 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 7488423 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7488426 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7490780 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 7490789 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 7490947 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 7495334 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 7516120 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7516282 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 7519255 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 7523779 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 7523780 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 7524824 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 7538827 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr08 7538914 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 7556825 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 7558391 . G A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr08 7560695 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 7562666 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 7562912 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7563852 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 7604771 . C A 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:57,0,30 Chr08 7620893 . G T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 7620900 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 7621489 . T C 41.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:81,6,0 Chr08 7621503 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 7621513 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 7621523 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 7621545 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7621546 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7621573 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 7622521 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:72,6,0 Chr08 7622608 . G C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 7634653 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:64,0,51 Chr08 7635900 . G T 172.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.878;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.261;QD=4.43;ReadPosRankSum=-4.330 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:201,0,1157 Chr08 7658685 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7658686 . T A 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 7682503 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 7686581 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 7707649 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 7709439 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 7721479 . G T 86.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 7789509 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.225;DP=56;Dels=0.00;FS=11.331;HaplotypeScore=2.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.073;QD=0.62;ReadPosRankSum=-3.987 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:63:63,0,1783 Chr08 7809262 . C A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr08 7809272 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 7809287 . G C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 7809300 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 7809316 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 7809348 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 7810319 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 7810380 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr08 7810716 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 7815564 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 7816074 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 7878165 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7878168 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7878408 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7906224 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7936997 . A G 183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=18.38;ReadPosRankSum=-1.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:82:212,0,82 Chr08 7937167 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7950616 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr08 7952109 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,135 Chr08 7954789 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 7977606 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 7985305 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 7990024 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 7990026 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 7990030 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 7990565 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 7990568 . G T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr08 7990601 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 7990604 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 7990628 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 7993979 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 7994612 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 7994621 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 7994622 . A T 96.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 8085016 . A C 171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=19.09;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:50:200,0,50 Chr08 8085708 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8085741 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 8086204 . G C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.41;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 8086518 . T A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 8086544 . G C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 8096581 . C A 105.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;QD=21.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:151,12,0 Chr08 8097053 . T C 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr08 8126393 . A T 273.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.43;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:302,0,15 Chr08 8140653 . G A 103.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:132,0,24 Chr08 8140663 . T C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:138,0,24 Chr08 8153355 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,69 Chr08 8161198 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr08 8166959 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 8313247 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr08 8313795 . T A 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:105,0,25 Chr08 8314105 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr08 8314138 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 8314158 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 8335603 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;DP=18;Dels=0.00;FS=10.386;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.540;QD=3.76;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:96:96,0,484 Chr08 8381260 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 8384968 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=1.516;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,447 Chr08 8430525 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 8430527 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8455469 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 8463157 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8524696 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,249 Chr08 8528966 . A C 128.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=21.48;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:15:157,0,15 Chr08 8528969 . T A 137.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.84;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:12:165,0,12 Chr08 8529044 . T C 159.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:188,0,21 Chr08 8535890 . T A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 8540403 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 8540443 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 8547546 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8566942 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 8591243 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 8592756 . G T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 8609684 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 8620030 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr08 8632835 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.97;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 8632917 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.10;MQ0=21;QD=1.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,23:23:6:57,6,0 Chr08 8636998 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 8658711 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:75,0,33 Chr08 8659074 . G C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:90:90,0,309 Chr08 8659105 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,323 Chr08 8659106 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,314 Chr08 8661934 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 8695950 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:62,0,33 Chr08 8708416 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 8708417 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 8753085 . G T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=4.75;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:128,0,587 Chr08 8753181 . C A 247.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;DP=23;Dels=0.00;FS=17.226;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.724;QD=10.77;ReadPosRankSum=-4.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,9:23:99:276,0,473 Chr08 8798485 . C T 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr08 8817661 . G A 213.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=23.75;ReadPosRankSum=-1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:48:242,0,48 Chr08 8819927 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 8819943 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 8823683 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.40;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 8823751 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.99;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 8823852 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.76;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,107 Chr08 8824000 . T A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 8824019 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 8825629 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 8831034 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.58;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,171 Chr08 8831217 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,215 Chr08 8853400 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8853454 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 8880909 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,69 Chr08 8882467 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 8883596 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 8919208 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,148 Chr08 8919258 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,136 Chr08 8920411 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 8980769 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 8980771 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 9062009 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.77;MQ0=0;QD=6.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:58,6,0 Chr08 9062030 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.72;MQ0=0;QD=8.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:69,6,0 Chr08 9073265 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.12;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 9076242 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,556 Chr08 9159407 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 9159440 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 9177073 . T A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr08 9189225 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 9193256 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 9195054 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 9195082 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 9204121 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,461 Chr08 9207701 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 9207712 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 9215836 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:32:66,0,32 Chr08 9215955 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.871;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.22;MQ0=2;MQRankSum=-2.203;QD=1.06;ReadPosRankSum=-2.286 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,28:32:62:62,0,65 Chr08 9215970 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.621;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.22;MQ0=2;MQRankSum=-2.203;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.042 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,30:32:62:62,0,63 Chr08 9252134 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:69:69,0,243 Chr08 9295693 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,318 Chr08 9300453 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,223 Chr08 9309764 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr08 9328154 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 9351343 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:111,0,68 Chr08 9372125 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 9374898 . A G 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:90,0,62 Chr08 9397557 . G T 183.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:212,0,60 Chr08 9398316 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 9440949 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 9452287 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 9461390 . A T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 9501185 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 9501954 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 9508671 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.426;DP=22;Dels=0.00;FS=15.420;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.298;QD=2.58;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:85:85,0,654 Chr08 9509623 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,180 Chr08 9519379 . C T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:151,0,26 Chr08 9529415 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 9559688 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 9636425 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 9636433 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 9636446 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 9636451 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 9636464 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.05;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 9641276 . G A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr08 9655014 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 9664028 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,107 Chr08 9731793 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 9739858 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 9740821 . A G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr08 9740842 . G A 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr08 9740846 . T C 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr08 9745393 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,275 Chr08 9745973 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:90:105,0,90 Chr08 9745988 . G A 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.60;MQ0=0;QD=35.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr08 9746000 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 9746003 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 9746015 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 9748362 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:85:85,0,133 Chr08 9748405 . G A 79.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:8:24:108,0,24 Chr08 9748430 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,103 Chr08 9761606 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 9787918 . T C 197.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.72;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:226,0,60 Chr08 9805236 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 9808385 . G T 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:158,0,171 Chr08 9808481 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.071;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.654;QD=3.19;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:92:92,0,597 Chr08 9812552 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 9812609 . C T 40.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:69,0,22 Chr08 9818690 . G C 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;DP=36;Dels=0.00;FS=16.196;HaplotypeScore=14.9976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=2.60;ReadPosRankSum=-3.587 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,6:36:99:122,0,1105 Chr08 9833018 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 9866647 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 9868192 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:56:56,0,104 Chr08 9868213 . A G 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.13;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,96 Chr08 9868216 . G C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.29;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:102,0,98 Chr08 9868219 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,133 Chr08 9870485 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,169 Chr08 9870495 . T G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,181 Chr08 9870499 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,181 Chr08 9870524 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,181 Chr08 9880186 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.191;DP=58;Dels=0.00;FS=15.517;HaplotypeScore=5.9976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.830;QD=0.67;ReadPosRankSum=2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,6:58:67:67,0,1892 Chr08 9881679 . G C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr08 9881708 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 9894077 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,108 Chr08 9895049 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 9923625 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 9923651 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 9925661 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 9926214 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 9926220 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 9926348 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 9926350 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 9926361 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 9929807 . G A 103.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:132,0,25 Chr08 9931740 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 9932916 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 9933428 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 9935490 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 9935510 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 9938555 . C A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=18;Dels=0.00;FS=14.443;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.281;QD=6.21;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:140,0,462 Chr08 9962581 . C T 103.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:131,12,0 Chr08 9962594 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 9962617 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 9962639 . T C 73.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:102,0,18 Chr08 9984171 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 10021885 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr08 10026989 . C A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 10031971 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 10035074 . G A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.103;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.676;QD=15.08;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:179,0,176 Chr08 10035088 . C T 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=13.80;ReadPosRankSum=1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:180,0,174 Chr08 10035100 . C G 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.89;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:181,0,180 Chr08 10035101 . C A 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.932;QD=13.80;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:180,0,178 Chr08 10042262 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 10042277 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr08 10051490 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 10080206 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 10083577 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 10128858 . C G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.26;MQ0=0;QD=0.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:55,6,0 Chr08 10129575 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10129577 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10129581 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10129603 . A G 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10129604 . A C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10129619 . G T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.43;MQ0=0;QD=6.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:48,6,0 Chr08 10150653 . T G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 10150659 . T A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 10150670 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 10185725 . A G 158.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:187,0,24 Chr08 10186280 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 10186487 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 10190132 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 10190135 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 10202823 . A T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,133 Chr08 10205324 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 10208570 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 10214076 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 10231301 . G T 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=19;Dels=0.00;FS=23.173;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=5.67;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:136,0,520 Chr08 10231397 . C A 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.633;QD=9.38;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:122,0,215 Chr08 10232087 . T C 247.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=27.46;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:275,0,11 Chr08 10237737 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,219 Chr08 10257698 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,105 Chr08 10386601 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,111 Chr08 10388310 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 10413248 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 10420717 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,257 Chr08 10516460 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.44;MQ0=3;MQRankSum=-0.736;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:30:61,0,30 Chr08 10528467 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.49;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 10574330 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 10574331 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 10574352 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 10590065 . A G 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:28:94,0,28 Chr08 10622644 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 10622651 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 10622653 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 10622674 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 10622681 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.73;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 10644710 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,197 Chr08 10666560 . A G 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr08 10668414 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 10736959 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 10774544 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=5;QD=7.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:78,6,0 Chr08 10777074 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 10827465 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 10828435 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr08 11010788 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 11024630 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 11024668 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 11025992 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 11042095 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 11042423 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 11042796 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:109,0,30 Chr08 11064545 . A C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 11088018 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 11088130 . G T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr08 11109793 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,455 Chr08 11112229 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 11114296 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 11132051 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 11133094 . T A 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:136,0,27 Chr08 11142840 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 11201445 . G T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr08 11202195 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr08 11258423 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 11260192 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.10;MQ0=8;MQRankSum=-1.754;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:64:64,0,101 Chr08 11260263 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.10;MQ0=8;MQRankSum=-1.754;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:64:64,0,101 Chr08 11274300 . G T 70.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.51;MQ0=0;QD=17.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:113,9,0 Chr08 11276241 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 11322644 . G T 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:99,0,27 Chr08 11362927 . T C 29.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.44;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:58,0,21 Chr08 11470422 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr08 11525528 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 11526252 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.40;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 11575916 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 11576013 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.594;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.462;QD=1.72;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:73:73,0,818 Chr08 11585169 . G C 45.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:74,0,23 Chr08 11585640 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr08 11617212 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.40;MQ0=0;QD=3.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:71,6,0 Chr08 11617216 . C T 45.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 11757319 . C A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.02;MQ0=14;QD=2.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,2:16:6:60,6,0 Chr08 11927134 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:74,0,33 Chr08 11927860 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 11929649 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,171 Chr08 11934796 . C A 38.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 11982599 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 11996293 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 12002243 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 12002268 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 12009067 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 12009075 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 12009095 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 12009104 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 12018083 . A C 173.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.568;QD=17.38;ReadPosRankSum=2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:202,0,131 Chr08 12019216 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:71,0,29 Chr08 12019287 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 12019590 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 12024868 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 12024870 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 12028270 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:49:101,0,49 Chr08 12038499 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 12039107 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 12039171 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 12039931 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 12039970 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 12039992 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 12052875 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,109 Chr08 12102862 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 12132524 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 12142196 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 12163909 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=0;QD=4.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:55,6,0 Chr08 12163956 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=0;QD=4.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:55,6,0 Chr08 12165393 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.561;DP=82;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.08;MQ0=2;MQRankSum=-6.355;QD=0.27;ReadPosRankSum=-4.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:50:50,0,984 Chr08 12165395 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;DP=82;Dels=0.00;FS=4.493;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.08;MQ0=2;MQRankSum=-6.355;QD=0.27;ReadPosRankSum=-4.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,51:82:50:50,0,984 Chr08 12265914 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:106,0,68 Chr08 12284090 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 12284095 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 12284814 . T G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.38;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:52:52,0,278 Chr08 12284910 . C A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;DP=21;Dels=0.00;FS=19.320;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:90:90,0,586 Chr08 12309382 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 12309399 . A T 972.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=25.1292;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1001,75,0 Chr08 12309400 . C T 975.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=25.1292;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,25:25:75:1004,75,0 Chr08 12309480 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 12314934 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 12318559 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 12318621 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 12350989 . C G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 12351045 . C A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 12351215 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 12506711 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 12533152 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 12581011 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 12648686 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 12655762 . C A 163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.366;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.127;QD=6.82;ReadPosRankSum=-3.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:192,0,616 Chr08 12660427 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 12669341 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 12669382 . A C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr08 12669392 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 12723876 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 12723883 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 12723901 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 12723919 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 12723932 . T G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 12749277 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.579;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.42;MQ0=1;MQRankSum=-0.869;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:6:58,6,0 Chr08 12829550 . C G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr08 12829594 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,107 Chr08 12829722 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.204;DP=43;Dels=0.00;FS=28.202;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:43:62:62,0,1298 Chr08 12831383 . A C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;DP=49;Dels=0.00;FS=32.421;HaplotypeScore=39.7783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.564;QD=1.08;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,6:49:81:81,0,1600 Chr08 12832362 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:94:135,0,94 Chr08 12832652 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 12832684 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:84,6,0 Chr08 12845873 . T G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.12;MQ0=1;QD=17.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:148,12,0 Chr08 12845874 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.12;MQ0=1;QD=18.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:154,12,0 Chr08 12845907 . G A 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.16;MQ0=0;QD=30.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:269,21,0 Chr08 12851010 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 12870791 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.86;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:30:75,0,30 Chr08 12922695 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 12922710 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 12922735 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 12922736 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 12922741 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 12922742 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 12922752 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 12922760 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 12926085 . A G 105.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.81;MQ0=0;QD=15.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:133,12,0 Chr08 12926097 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 12926114 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 12927706 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.589;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:50:50,0,99 Chr08 12927802 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 12972013 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 12972032 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 12972047 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 12988925 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 12988963 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 13072049 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:81:81,0,312 Chr08 13072310 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr08 13072372 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 13072373 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 13072379 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 13072395 . T G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr08 13072607 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr08 13076158 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 13076236 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 13129504 . A T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:51:107,0,51 Chr08 13129516 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:49:108,0,49 Chr08 13129522 . C A 105.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:18:134,0,18 Chr08 13129534 . T C 80.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:21:109,0,21 Chr08 13129535 . A C 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:110,0,24 Chr08 13155266 . T C 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:126,0,208 Chr08 13155284 . C G 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=13.53;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:150,0,121 Chr08 13182563 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;DP=17;Dels=0.00;FS=3.328;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.323 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:75:75,0,527 Chr08 13193472 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,184 Chr08 13218306 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 13226227 . C A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.55;MQ0=23;MQRankSum=1.380;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:25,4:29:6:66,6,0 Chr08 13228380 . G A 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:142,0,24 Chr08 13228463 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 13228479 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 13228481 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 13254300 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-2.308;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:73:73,0,910 Chr08 13254327 . T G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.886;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.199;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:83:83,0,920 Chr08 13254358 . C T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.068;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.755 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:76:76,0,863 Chr08 13254361 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.265;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.886 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:71:71,0,833 Chr08 13270236 . G C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;DP=41;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.454;QD=1.26;ReadPosRankSum=2.131 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:80:80,0,1304 Chr08 13270245 . T C 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.371;DP=41;Dels=0.00;FS=7.970;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.219;QD=1.43;ReadPosRankSum=3.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:87:87,0,1295 Chr08 13297994 . T A 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr08 13361932 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 13361933 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 13361936 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 13361942 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 13361963 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 13361969 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.02;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 13412465 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 Chr08 13416352 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 13481969 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.904;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.6213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.30;MQ0=11;MQRankSum=2.773;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.570 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,3:48:79:79,0,82 Chr08 13481983 . C T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.753;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.30;MQ0=11;MQRankSum=2.810;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.252 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,3:48:79:79,0,82 Chr08 13531758 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:54,0,31 Chr08 13674985 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 13761011 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,70 Chr08 13783152 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 13792411 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 13965984 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 13991658 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.383;QD=0.95;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:49:49,0,676 Chr08 14048931 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 14049904 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 14120468 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 14191244 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,183 Chr08 14202862 . G T 180.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:8:20:209,0,20 Chr08 14294891 . G C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-3.071;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:58:58,0,610 Chr08 14330265 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:55,0,30 Chr08 14378126 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 14595890 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 14644236 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 14793579 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,104 Chr08 14853001 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 14853010 . T C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr08 14855270 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.592;DP=36;Dels=0.00;FS=17.186;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.025;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:60:60,0,1082 Chr08 14855271 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;DP=36;Dels=0.00;FS=17.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.730;QD=0.72;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:54:54,0,1126 Chr08 14855272 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;DP=36;Dels=0.00;FS=17.697;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=0.74;ReadPosRankSum=2.039 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,4:36:55:55,0,1138 Chr08 14855276 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;DP=35;Dels=0.00;FS=18.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.685;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.996 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:54:54,0,1119 Chr08 14855277 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;DP=35;Dels=0.00;FS=18.647;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.804;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:56:56,0,1097 Chr08 14889765 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,137 Chr08 14964170 . G C 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.741;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:131,0,215 Chr08 14969830 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 15051789 . G T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.372;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.176;QD=3.66;ReadPosRankSum=-4.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,8:42:99:182,0,1272 Chr08 15183194 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 15384612 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 15454180 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.72;MQ0=16;MQRankSum=1.589;QD=0.91;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,6:24:50:50,0,200 Chr08 15495420 . C A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=6.15;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:58,6,0 Chr08 15546939 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=9.859;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQ0=0;MQRankSum=-0.979;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.415 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:103,0,388 Chr08 15647546 . C A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 15722737 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 15757001 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.157;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=6.67;ReadPosRankSum=-1.774 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:115,0,299 Chr08 15782120 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 15794156 . A G 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr08 15794168 . C T 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr08 15794186 . C G 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr08 15794188 . G T 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr08 15836554 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 15899066 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.11;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 16021563 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 16038239 . C T 174.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:203,18,0 Chr08 16062443 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.55;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 16112352 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 16189768 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 16357092 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 16357120 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 16357142 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 16383049 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 16396999 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.421;DP=67;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.44;MQ0=0;MQRankSum=3.004;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,4:67:99:124,0,164 Chr08 16403061 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 16403114 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 16426037 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 16448906 . T G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.12;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:57,0,65 Chr08 16448918 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.12;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:55:55,0,65 Chr08 16511993 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 16750576 . A C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.81;MQ0=0;QD=6.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:70,9,0 Chr08 16750644 . T C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=2;QD=13.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:111,12,0 Chr08 16760796 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 16761295 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 16761298 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 16761352 . A T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 16789174 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 16904082 . T C 91.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.05;MQ0=0;QD=10.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:119,12,0 Chr08 16980720 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 16980724 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 16982241 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 16982242 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 17054029 . A G 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:28:60,0,28 Chr08 17067922 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;DP=19;Dels=0.00;FS=28.894;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=3.36;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:92:92,0,551 Chr08 17170455 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr08 17170469 . A T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr08 17170479 . C G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr08 17170527 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 17224394 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 17258013 . T G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 17258071 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 17320695 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 17324615 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.11;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 17324625 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.11;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 17676301 . C A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.46;MQ0=3;QD=6.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:60,6,0 Chr08 17684887 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 17823365 . G A 56.28 . 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T A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.44;MQ0=1;QD=2.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:51,6,0 Chr08 17836943 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.26;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 17852742 . T C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr08 17859359 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.55;MQ0=1;QD=0.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:6:48,6,0 Chr08 17902448 . T G 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.26;MQ0=0;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:189,15,0 Chr08 17902468 . G A 168.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 17935169 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 17937421 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.65;MQ0=0;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr08 17937434 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.65;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 18067864 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 18067868 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 18067876 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 18067924 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 18089528 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 18168321 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 18170967 . C A 180.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=18.08;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:209,0,134 Chr08 18225494 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 18225532 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 18241902 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 18298152 . A G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr08 18303822 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 18303823 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 18317965 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.582;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.73;MQ0=0;MQRankSum=-2.335;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.176 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,17:27:9:124,9,0 Chr08 18377768 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 18378566 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 18523663 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 18531097 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 18561275 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.87;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 18561340 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.87;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 18629157 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.50;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:45:63,0,45 Chr08 18629186 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 18629228 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 18708384 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.58;MQ0=9;QD=4.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:77,6,0 Chr08 18858804 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 18858813 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 18921483 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.69;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr08 18921531 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.47;MQ0=16;QD=2.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:9:73,9,0 Chr08 18921547 . G T 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.47;MQ0=16;QD=2.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,21:21:9:73,9,0 Chr08 18940310 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 18940366 . A T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr08 18940414 . A G 92.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 19403396 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 19434968 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 19511150 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 19511163 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 19511170 . A T 44.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 19630239 . C A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.638;QD=12.60;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,138 Chr08 19664962 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr08 19665146 . T G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 19687936 . G T 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9867;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr08 19687960 . G C 138.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 19766335 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 19766389 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 19782002 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 19782067 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 19813822 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.94;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 19822183 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 19822208 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 19822244 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 19832145 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 19858589 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr08 19858618 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr08 19867659 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 19867662 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 19925269 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 20012131 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 20023751 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.01;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 20041925 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 20070993 . G A 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr08 20071009 . T C 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.60;MQ0=0;QD=6.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:12:134,12,0 Chr08 20109860 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,209 Chr08 20132662 . A T 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.496;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.992;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:9:96,9,0 Chr08 20229902 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=7.06;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:113,0,288 Chr08 20283622 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,139 Chr08 20347433 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.58;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:6:50,6,0 Chr08 20388786 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.866;DP=10;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQ0=0;MQRankSum=1.036;QD=9.18;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:120,0,207 Chr08 20700760 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 20714403 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=3.34;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:11:65:65,0,252 Chr08 20755548 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 20820455 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 20894587 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 20924755 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;DP=69;Dels=0.00;FS=3.591;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.944;QD=0.74;ReadPosRankSum=4.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,7:69:79:79,0,2312 Chr08 21022138 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr08 21047556 . C A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 21126344 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr08 21126364 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr08 21207442 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.85;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 21234240 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,102 Chr08 21317973 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;DP=21;Dels=0.00;FS=11.996;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.151;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,615 Chr08 21400222 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 21501853 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,97 Chr08 21532849 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 21532853 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 21532856 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.81;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 21532915 . G A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.20;MQ0=0;QD=27.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr08 21533188 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.70;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 21542952 . G T 38.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.37;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:14:67,0,14 Chr08 21669114 . T C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr08 21715424 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 21792691 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 21962712 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.870;DP=36;Dels=0.00;FS=12.044;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.082;QD=2.47;ReadPosRankSum=-3.842 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,6:36:99:117,0,1050 Chr08 21962836 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 21987457 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6208;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.77;MQ0=0;QD=4.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:75,6,0 Chr08 22023636 . G T 195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.298;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.058;QD=13.05;ReadPosRankSum=-3.298 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,7:15:99:224,0,284 Chr08 22023732 . C A 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:54:171,0,54 Chr08 22039587 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 22173844 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 22219412 . A T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.47;MQ0=0;MQRankSum=-5.428;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,23:48:99:235,0,784 Chr08 22219453 . T C 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;DP=52;Dels=0.00;FS=1.154;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.95;MQ0=0;MQRankSum=-5.746;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.613 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,25:52:99:176,0,773 Chr08 22241103 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 22304582 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 22304679 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 22404215 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 22554788 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 22577243 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 22609225 . A G 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22609234 . G A 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22609244 . C T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22609255 . G A 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22609284 . A G 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22609285 . G A 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=13.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:69,9,0 Chr08 22610954 . G A 105.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.54;MQ0=15;MQRankSum=2.771;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.812 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:10:133,0,10 Chr08 22610991 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.70;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:76,6,0 Chr08 22624620 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 22624648 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 22628111 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.59;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr08 22628120 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.59;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr08 22648167 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 22648181 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 22661893 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 22723653 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 22748642 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 22788656 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.02;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr08 22788724 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.09;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.20;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:41:49,0,41 Chr08 22822889 . C G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;DP=29;Dels=0.00;FS=41.590;HaplotypeScore=6.3748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.700;QD=2.10;ReadPosRankSum=-3.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,9:29:89:89,0,549 Chr08 22848803 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 22908472 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 22927269 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.64;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 23014277 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,72 Chr08 23020729 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 23164534 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.24;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 23164556 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.24;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 23164608 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 23170589 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:74,6,0 Chr08 23207226 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr08 23210526 . A T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=11.181;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,207 Chr08 23254831 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 23332415 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 23333946 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:53:53,0,664 Chr08 23390972 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=4;QD=6.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,4:7:9:74,9,0 Chr08 23502334 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr08 23502346 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=29.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 23502374 . A G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 23502384 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 23502387 . A G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=32.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 23502399 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 23507728 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.23;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 23507956 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.06;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 23517816 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.74;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 23526006 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 23548247 . G A 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.44;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:64,0,28 Chr08 23555164 . G A 48.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.03;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:16:77,0,16 Chr08 23563946 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 23563970 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 23576478 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 23641303 . T C 98.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 24135986 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.74;MQ0=3;MQRankSum=-1.307;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:93:93,0,112 Chr08 24136002 . G C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:90:90,0,130 Chr08 24171178 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr08 24227592 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr08 24256278 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.86;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:76,6,0 Chr08 24256735 . C A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 24272013 . G T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.76;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:97,9,0 Chr08 24275853 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.55;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr08 24399924 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 24400020 . C A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 24534099 . G T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:169,0,58 Chr08 24601417 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 24655435 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.15;MQ0=1;MQRankSum=-2.068;QD=1.66;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:63:63,0,463 Chr08 24696689 . G T 136.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.48;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.83;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:165,0,13 Chr08 24761065 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 24761094 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 24840752 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 24905781 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 24905845 . T G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.17;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr08 24931707 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.50;MQ0=4;QD=4.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:62,6,0 Chr08 24931785 . A C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.30;MQ0=4;QD=5.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:62,6,0 Chr08 25069034 . T C 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.26;MQ0=2;MQRankSum=-2.166;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,7:12:58:150,0,58 Chr08 25219273 . C A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.85;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 25288610 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 25432212 . G T 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432213 . A G 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432217 . A G 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432219 . A G 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432221 . T C 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432250 . A G 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.34;MQ0=0;QD=20.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:90,9,0 Chr08 25432252 . C T 175.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.05;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:204,18,0 Chr08 25496521 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 25630505 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 25655627 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.05;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:61,6,0 Chr08 25688768 . T A 69.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.51;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:17:98,0,17 Chr08 25723439 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 25742063 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 25742395 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.86;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:67,0,58 Chr08 25749830 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.22;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 25763143 . T C 79.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.84;MQ0=0;QD=13.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:108,15,0 Chr08 25860088 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.778 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:75:75,0,387 Chr08 25876010 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 25876048 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 25980913 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 25990885 . C G 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:100,0,69 Chr08 25990886 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.64;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:101,0,69 Chr08 25990903 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 25990913 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 26024862 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 26034649 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 26082412 . G T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.207;DP=22;Dels=0.00;FS=5.746;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=6.03;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:161,0,587 Chr08 26092274 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.88;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 26124221 . G C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.71;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:48,6,0 Chr08 26166010 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,177 Chr08 26166192 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 26282462 . C A 20.83 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=6.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:49,0,23 Chr08 26414448 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.03;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 26414480 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.03;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 26478313 . G T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.999;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.53;MQ0=0;MQRankSum=2.227;QD=1.03;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,2:22:6:50,6,0 Chr08 26731879 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 26731959 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,70 Chr08 26747251 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 26846267 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 26848227 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,150 Chr08 26950596 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.03;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 26960848 . T A 31.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=2.45;ReadPosRankSum=1.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:13:18:60,0,18 Chr08 27062922 . C A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.69;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 27082411 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr08 27160608 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.69;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 27242207 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 27313142 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 27313164 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 27383704 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 27407086 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.27;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 27407167 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 27415539 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.88;MQ0=4;MQRankSum=-2.318;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.070 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,18:22:63:63,0,69 Chr08 27466155 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 27469048 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 27488554 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 27534060 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 27638608 . G T 171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.18;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:200,0,135 Chr08 27638694 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,419 Chr08 27715307 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.664;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.925;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,315 Chr08 27718502 . C T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.67;MQ0=0;QD=14.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:70,9,0 Chr08 27718522 . C T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.67;MQ0=0;QD=14.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:70,9,0 Chr08 27736800 . C T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr08 27761375 . C G 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:183,0,58 Chr08 27767350 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 27784414 . T C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:102,9,0 Chr08 27784459 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 27784474 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 27784535 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 27784538 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 27784739 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.53;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 27787503 . G T 49.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 28027042 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 28065287 . T G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.71;MQ0=0;QD=9.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:74,9,0 Chr08 28214873 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 28217890 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 28231743 . G C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 28333039 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 28363998 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.13;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 28537813 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 28563641 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.30;MQ0=4;MQRankSum=2.262;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:126,9,0 Chr08 28567257 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQ0=1;MQRankSum=-1.768;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:54:54,0,306 Chr08 28579320 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.06;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 28628027 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 28667231 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr08 28667302 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 28700921 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:164,12,0 Chr08 28776710 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=2.25;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:62:62,0,403 Chr08 28801928 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.89;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:61,6,0 Chr08 28801929 . A C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.89;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:61,6,0 Chr08 28801931 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.89;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:61,6,0 Chr08 28801940 . A G 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.21;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.05;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:94,9,0 Chr08 28802377 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 28802430 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 28815277 . C T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=16;Dels=0.00;FS=4.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.95;MQ0=3;MQRankSum=-2.313;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:76:76,0,261 Chr08 28815336 . C T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=13;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.932;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:76:76,0,240 Chr08 28815347 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=13;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.70;MQ0=1;MQRankSum=-1.932;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:76:76,0,232 Chr08 28865897 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 28967801 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:109,0,66 Chr08 29030367 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.72;MQ0=1;MQRankSum=1.231;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:77,6,0 Chr08 29054456 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 29065426 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.8325;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 29082113 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.40;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:60,6,0 Chr08 29307151 . G A 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:50,0,22 Chr08 29328916 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 29561598 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 29606031 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.34;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 29623061 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 29709112 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,219 Chr08 29744077 . C A 73.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.81;MQ0=13;MQRankSum=0.727;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:16:102,0,16 Chr08 29763544 . G A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr08 29774883 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 29799335 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=2;QD=12.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:77,6,0 Chr08 29862728 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,169 Chr08 30186336 . C G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,249 Chr08 30188996 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.93;MQ0=69;MQRankSum=1.666;QD=0.68;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:74,4:78:6:80,6,0 Chr08 30194804 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 30288712 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;DP=13;Dels=0.00;FS=2.688;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.312;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,308 Chr08 30355984 . A G 376.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7884;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:30:405,30,0 Chr08 30359516 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.55;MQ0=9;QD=4.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,4:12:6:77,6,0 Chr08 30420437 . A G 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.04;MQ0=0;QD=6.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:12:118,12,0 Chr08 30583802 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 30621378 . A G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.05;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr08 30621456 . C T 87.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.66;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:116,0,13 Chr08 30710264 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 30710270 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 30710276 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 30710284 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 30710290 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.02;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 30731282 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:78,6,0 Chr08 30799441 . A G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799450 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799457 . G T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799467 . A T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799476 . G T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799494 . G A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799501 . T A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30799509 . G T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr08 30835043 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr08 30855022 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 30903778 . C A 195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.905;QD=12.24;ReadPosRankSum=-3.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,7:16:99:224,0,292 Chr08 30919726 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,252 Chr08 31025480 . A G 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.974;DP=48;Dels=0.00;FS=48.147;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQ0=0;MQRankSum=-4.440;QD=2.14;ReadPosRankSum=-4.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,8:48:99:131,0,1523 Chr08 31025489 . G A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;DP=49;Dels=0.00;FS=42.870;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.450;QD=2.06;ReadPosRankSum=-4.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,8:49:99:129,0,1420 Chr08 31025493 . G A 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;DP=49;Dels=0.00;FS=42.870;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQ0=0;MQRankSum=-4.450;QD=2.02;ReadPosRankSum=-4.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,8:49:99:127,0,1426 Chr08 31025517 . T C 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=50;Dels=0.00;FS=48.710;HaplotypeScore=5.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.65;MQ0=0;MQRankSum=-4.450;QD=1.86;ReadPosRankSum=4.206 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,8:50:99:121,0,1452 Chr08 31040392 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr08 31052671 . A T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.71;MQ0=0;QD=26.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 31128761 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 31149614 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,129 Chr08 31297493 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.54;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 31345222 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 31358809 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 31372017 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 31394513 . T C 140.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:169,15,0 Chr08 31395163 . A G 46.28 . 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A T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr08 31552954 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr08 31553010 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr08 31633586 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 31706601 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.03;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr08 31772835 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 31772847 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 31825696 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 31893332 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.44;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 31893361 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.44;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 31919389 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.31;MQ0=10;MQRankSum=-0.736;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:33:52,0,33 Chr08 31933963 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.50;MQ0=0;QD=9.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:74,9,0 Chr08 31938367 . A G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:82:82,0,274 Chr08 32085441 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 32146130 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 32227475 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 32227476 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 32227505 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 32239367 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 32269131 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 32275078 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;DP=14;Dels=0.00;FS=20.152;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.872;QD=11.48;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:189,0,255 Chr08 32344093 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=1;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:49,6,0 Chr08 32345711 . T G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.84;MQ0=2;MQRankSum=1.866;QD=5.65;ReadPosRankSum=-1.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:62:96,0,62 Chr08 32345761 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.59;MQ0=28;MQRankSum=-0.365;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:62:62,0,96 Chr08 32425866 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:30:68,0,30 Chr08 32426139 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,101 Chr08 32426164 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,106 Chr08 32600688 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 32617397 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 32641774 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 32648121 . A G 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.63;MQ0=0;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 Chr08 32656783 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.880;QD=5.51;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:133,0,507 Chr08 32656879 . C A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.285;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.196;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:108,0,395 Chr08 32659740 . C T 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:117,12,0 Chr08 32735063 . C T 22.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:51,0,21 Chr08 32780515 . A T 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQ0=0;MQRankSum=0.335;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.335 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:139,0,660 Chr08 32795918 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:68,0,65 Chr08 32795936 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.59;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:68,0,63 Chr08 32863782 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.41;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr08 32867131 . C A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.66;MQ0=0;MQRankSum=1.133;QD=13.18;ReadPosRankSum=-2.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:34:160,0,34 Chr08 32867212 . T A 25.83 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:19:54,0,19 Chr08 32870321 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.73;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=17.26;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:114,9,0 Chr08 32879533 . A T 102.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.81;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:130,12,0 Chr08 32882126 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.06;MQ0=0;QD=4.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:57,6,0 Chr08 32882195 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.06;MQ0=0;QD=4.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:57,6,0 Chr08 32916707 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 32963370 . A G 105.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:133,12,0 Chr08 33137574 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;DP=25;Dels=0.00;FS=31.547;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.93;MQ0=7;MQRankSum=2.201;QD=1.79;ReadPosRankSum=2.201 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,13:25:73:73,0,254 Chr08 33254591 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 33339860 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 33360709 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 33379301 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.36;MQ0=5;MQRankSum=1.231;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,7:10:6:83,6,0 Chr08 33436785 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.835;DP=45;Dels=0.00;FS=5.044;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.379;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.029 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:57:57,0,1466 Chr08 33517983 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 33542109 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 33543591 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 33543722 . C T 141.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:170,0,23 Chr08 33570995 . C G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.27;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:88:96,0,88 Chr08 33585508 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.96;MQ0=2;QD=7.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:64,6,0 Chr08 33651762 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,199 Chr08 33658138 . A T 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:180,15,0 Chr08 33732379 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 33778505 . C T 33.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:62,0,27 Chr08 33826036 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,210 Chr08 33829071 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:65,0,63 Chr08 33867395 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 33867406 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 33877486 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 33877661 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 33970959 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 34135464 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:107,0,60 Chr08 34135787 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=11.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:73,0,33 Chr08 34153188 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;MQ0=1;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr08 34153217 . C G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;MQ0=1;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr08 34153222 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.29;MQ0=1;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr08 34181030 . T C 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:121,0,459 Chr08 34181082 . A G 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:147,0,491 Chr08 34181094 . A T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.111;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.848;QD=3.94;ReadPosRankSum=-0.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:115,0,456 Chr08 34181114 . G A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=5.49;ReadPosRankSum=-0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:149,0,497 Chr08 34181115 . A G 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=10.9929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.018;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:99:149,0,506 Chr08 34184077 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:117,9,0 Chr08 34184606 . A T 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=20.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:171,0,63 Chr08 34205014 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 34205024 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 34205038 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 34226747 . G A 48.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.2434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.62;MQ0=19;MQRankSum=0.406;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,3:25:26:77,0,26 Chr08 34233575 . T A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.284;DP=39;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=6.0438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.15;MQ0=3;MQRankSum=2.995;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.831 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,4:39:69:97,0,69 Chr08 34252165 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;DP=48;Dels=0.00;FS=16.749;HaplotypeScore=1.5779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.65;MQ0=5;MQRankSum=-3.698;QD=0.66;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:60:60,0,1308 Chr08 34290966 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 34310338 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 34478251 . T C 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr08 34513543 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.07;MQ0=7;QD=5.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:10:9:80,9,0 Chr08 34545869 . G A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr08 34619363 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.68;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:28:74,0,28 Chr08 34690948 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 34691068 . A G 240.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=34.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:269,21,0 Chr08 34717724 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.76;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr08 34757142 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.80;MQ0=10;MQRankSum=1.666;QD=1.30;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,2:19:39:53,0,39 Chr08 34809784 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 34848601 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.16;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 34864391 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.36;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:49,6,0 Chr08 34864399 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.36;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:56,6,0 Chr08 34864447 . C T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:56,6,0 Chr08 34918565 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 34993705 . C T 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.72;MQ0=3;MQRankSum=1.920;QD=6.21;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,3:11:9:96,9,0 Chr08 35214102 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 35248954 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 Chr08 35249049 . T A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.22;MQ0=27;MQRankSum=1.300;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:91:132,0,91 Chr08 35281640 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.15;MQ0=4;QD=13.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:150,12,0 Chr08 35289621 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 35289670 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 35289678 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 35307198 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 35309677 . A T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.77;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 35394548 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.75;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 35435114 . G C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.55;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:54,6,0 Chr08 35442735 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.10;MQ0=14;MQRankSum=-0.727;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:30:104,0,30 Chr08 35504011 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 35508552 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 35577077 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 35707754 . G T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr08 35738949 . A G 22.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.48;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=5.71;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:21:51,0,21 Chr08 35740200 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.90;MQ0=3;MQRankSum=0.727;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,3:7:9:122,9,0 Chr08 35742772 . C A 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.97;MQ0=8;QD=17.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,8:16:24:312,24,0 Chr08 35774752 . C A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 35776727 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 35777159 . C G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.36;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:69,6,0 Chr08 35801926 . T C 152.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.79;MQ0=0;QD=2.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,57:57:15:181,15,0 Chr08 35838650 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 35876001 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=0;QD=4.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:114,9,0 Chr08 35876015 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=0;QD=4.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:118,9,0 Chr08 35876069 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.25;MQ0=0;QD=5.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:126,9,0 Chr08 35894005 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 35894035 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 35894071 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 35894072 . G T 45.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr08 36044293 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:72,0,29 Chr08 36140364 . G T 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr08 36184780 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 36184921 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.22;MQ0=0;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr08 36185080 . G A 40.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.768;QD=3.63;ReadPosRankSum=-1.202 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:79:79,0,267 Chr08 36549874 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 36549903 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr08 36550353 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 36550374 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 36550676 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr08 36556687 . G T 62.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.41;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:91,0,16 Chr08 36556773 . C A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.847;DP=43;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.77;MQ0=4;MQRankSum=2.847;QD=1.90;ReadPosRankSum=-2.708 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,4:43:99:110,0,126 Chr08 36605182 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.56;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 36675365 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=6.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:52,6,0 Chr08 36735333 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,67 Chr08 36773602 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 36773643 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 36879135 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 36879136 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 36879215 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 36904630 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.51;MQ0=0;QD=3.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:51,6,0 Chr08 36993580 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.02;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr08 37015323 . C A 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:50,0,22 Chr08 37015567 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 37047059 . T C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.04;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr08 37047120 . C T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.04;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr08 37063032 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.47;MQ0=8;QD=3.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:6:82,6,0 Chr08 37231595 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 37231619 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 37271302 . C T 97.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.59;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 37618843 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 37619318 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 37619320 . T G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 37619323 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 37619336 . C T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr08 37619337 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.54;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr08 37619855 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=3;QD=6.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:59,6,0 Chr08 37641100 . C T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=3.91;ReadPosRankSum=-2.333 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:83:83,0,229 Chr08 37751878 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 37869568 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 37869589 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 37973222 . G A 190.89 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.95;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:2:217,0,2 Chr08 38036707 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.36;MQ0=0;QD=4.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:56,6,0 Chr08 38065082 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.99;MQ0=0;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:51,6,0 Chr08 38065108 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.99;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:51,6,0 Chr08 38065131 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.99;MQ0=0;QD=5.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:51,6,0 Chr08 38082014 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.46;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 38196092 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.40;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 38196108 . C T 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.40;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr08 38301027 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.44;MQ0=1;MQRankSum=0.380;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:64:64,0,69 Chr08 38349669 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 38364955 . C A 25.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:54,0,23 Chr08 38374196 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.53;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 38374218 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.53;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 38447444 . G A 84.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:113,0,18 Chr08 38559704 . A T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr08 38589104 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 38608359 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.44;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:50,0,75 Chr08 38609064 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.55;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr08 38609074 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.55;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr08 38609099 . T C 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.15;MQ0=6;MQRankSum=0.224;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:83:83,0,1165 Chr08 38643236 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.82;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:9:112,9,0 Chr08 38740874 . C A 119.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.94;MQ0=9;QD=8.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,5:14:15:148,15,0 Chr08 38744127 . C T 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.62;MQ0=1;QD=3.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:75,9,0 Chr08 38744184 . G C 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.62;MQ0=1;QD=3.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:75,9,0 Chr08 38746940 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=0;QD=4.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:68,9,0 Chr08 38746955 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=0;QD=4.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:68,9,0 Chr08 38746976 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=0;QD=4.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:68,9,0 Chr08 38756153 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.95;MQ0=0;QD=2.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:80,6,0 Chr08 38791889 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 38834484 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 38868059 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 38909020 . T A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr08 38970056 . C T 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.19;MQ0=0;QD=12.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:77,9,0 Chr08 38970312 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.49;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:49,6,0 Chr08 38970349 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.49;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:49,6,0 Chr08 38970392 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.49;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:49,6,0 Chr08 38970396 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.49;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr08 38998460 . G A 60.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.62;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:89,0,24 Chr08 39013591 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.72;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 39013681 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.72;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 39057183 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 39060709 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.41;MQ0=0;QD=13.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:81,6,0 Chr08 39060765 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.920;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:53:53,0,165 Chr08 39060771 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.920;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:53:53,0,165 Chr08 39060790 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.920;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:53:53,0,164 Chr08 39060812 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.920;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:53:53,0,165 Chr08 39060835 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.09;MQ0=1;MQRankSum=-1.920;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:53:53,0,147 Chr08 39242846 . T A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.08;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 39329463 . A C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 39387464 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr08 39388266 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 39398758 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 39497481 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:55:55,0,138 Chr08 39514904 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr08 39632319 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 39716952 . G T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.50;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 Chr08 39716966 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.50;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 Chr08 39809090 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:97,0,67 Chr08 39817361 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 39820112 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 39859466 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.77;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 39863711 . G C 20.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.57;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:29:49,0,29 Chr08 39914335 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 39943182 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.45;MQ0=1;QD=1.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:51,6,0 Chr08 40075423 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.73;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr08 40131897 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr08 40131970 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.74;MQ0=1;QD=7.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:50,6,0 Chr08 40139524 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 40169442 . G A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr08 40169468 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 40169505 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 40193808 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 40201421 . T C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr08 40248446 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 40249531 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 40249545 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 40270616 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.26;MQ0=13;QD=3.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:15:6:84,6,0 Chr08 40273319 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.89;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr08 40273392 . C G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=0;QD=13.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:80,9,0 Chr08 40273406 . G A 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=0;QD=13.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:80,9,0 Chr08 40273456 . T G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.91;MQ0=0;QD=7.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:50,6,0 Chr08 40295877 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 40313911 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 40328588 . A T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 40328622 . C A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 40377014 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 40407512 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr08 40412668 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.411;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=1.44;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:83:83,0,1241 Chr08 40431432 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,146 Chr08 40466092 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr08 40466187 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.14;ReadPosRankSum=1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:69:69,0,371 Chr08 40466206 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:72:72,0,332 Chr08 40466214 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:69:69,0,363 Chr08 40466225 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:69:69,0,367 Chr08 40466249 . T G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQ0=0;MQRankSum=-2.620;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:69:69,0,347 Chr08 40484790 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;DP=45;Dels=0.00;FS=19.703;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=0.71;ReadPosRankSum=-2.454 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,6:45:60:60,0,1439 Chr08 40484840 . C T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.130;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=1.782;QD=2.69;ReadPosRankSum=-1.782 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:99:117,0,988 Chr08 40484867 . A T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=1.130;QD=2.72;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:99:118,0,985 Chr08 40484874 . T C 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.771;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=2.72;ReadPosRankSum=-3.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:118,0,969 Chr08 40484879 . G A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.947;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.110;QD=2.57;ReadPosRankSum=-2.884 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,7:33:99:113,0,952 Chr08 40496060 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 40496075 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.43;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 40572352 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,141 Chr08 40572438 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr08 40700057 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.36;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 Chr08 40700112 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.27;MQ0=0;QD=11.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:74,9,0 Chr08 40700125 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.27;MQ0=0;QD=11.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:74,9,0 Chr08 40709035 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 40763723 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.40;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr08 40763732 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.40;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr08 40763737 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.40;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr08 40842020 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.76;MQ0=1;MQRankSum=0.731;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:49,6,0 Chr08 40860973 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:68:68,0,84 Chr08 40860978 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:68:68,0,83 Chr08 40865070 . T C 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr08 40882882 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 40904760 . G C 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr08 40910695 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 40973372 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,182 Chr08 41020353 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr08 41114909 . T A 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.11;MQ0=2;QD=12.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:88,9,0 Chr08 41146641 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.13;MQ0=1;QD=1.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:9:65,9,0 Chr08 41146651 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.26;MQ0=0;QD=1.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:9:65,9,0 Chr08 41146653 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.26;MQ0=0;QD=1.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:9:65,9,0 Chr08 41146680 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.85;MQ0=0;QD=1.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:9:65,9,0 Chr08 41239782 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:101,0,60 Chr08 41292217 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=16;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,481 Chr08 41292314 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 41296627 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 41303147 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQ0=0;MQRankSum=-1.268;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,376 Chr08 41358749 . C T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.92;MQ0=0;MQRankSum=-3.906;QD=3.28;ReadPosRankSum=-2.472 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,9:35:99:143,0,972 Chr08 41358753 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.00;MQ0=0;MQRankSum=-3.796;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.035 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:112,0,968 Chr08 41366138 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 41366212 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 41366217 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 41366240 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 41366259 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 41401682 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 41454794 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 41466313 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,138 Chr08 41468453 . A T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.4930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:84:84,0,169 Chr08 41472207 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,141 Chr08 41485282 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:69:69,0,103 Chr08 41485289 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.79;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:69:69,0,95 Chr08 41492698 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;DP=34;Dels=0.00;FS=2.547;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.93;MQ0=0;MQRankSum=-1.732;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.577 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:34:99:106,0,1033 Chr08 41539353 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 41548468 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.02;MQ0=5;QD=0.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:6:53,6,0 Chr08 41548491 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=4;QD=4.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:53,6,0 Chr08 41550406 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 41558186 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 41590542 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,66 Chr08 41625487 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:53,0,33 Chr08 41625516 . T A 24.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:53,0,29 Chr08 41625704 . G T 732.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:761,57,0 Chr08 41625706 . T C 745.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=10.6316;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.90;MQ0=0;QD=27.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:57:774,57,0 Chr08 41626126 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.58;MQ0=6;MQRankSum=-2.637;QD=4.21;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:99:104,0,269 Chr08 41627365 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,186 Chr08 41627369 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,188 Chr08 41627372 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,190 Chr08 41628535 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.42;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:57,6,0 Chr08 41628546 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4725;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.42;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:57,6,0 Chr08 41628553 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.42;MQ0=1;QD=5.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:57,6,0 Chr08 41628579 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.42;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:57,6,0 Chr08 41628667 . G T 199.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=28.55;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:228,0,18 Chr08 41628671 . A G 195.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=27.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:224,0,19 Chr08 41631983 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.77;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:33:75,0,33 Chr08 41665962 . A G 102.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:130,12,0 Chr08 41742537 . C G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 41742930 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 41772151 . C G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.94;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr08 41790299 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 41803504 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,69 Chr08 41807374 . C A 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 Chr08 41814375 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr08 41819506 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 41819521 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 41878679 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 41882960 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 41882961 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 41882983 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 41882996 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 41882999 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 41883012 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 41927991 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 41953707 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 41961200 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.001;DP=124;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8261;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.18;MQ0=50;MQRankSum=0.987;QD=0.26;ReadPosRankSum=1.617 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:121,3:124:6:59,6,0 Chr08 41961225 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.297;DP=71;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3264;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.76;MQ0=13;MQRankSum=0.461;QD=0.45;ReadPosRankSum=-4.393 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,22:71:6:59,6,0 Chr08 41988312 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 42020059 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 42020067 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 42020122 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 42050316 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 42060606 . C A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=13;Dels=0.00;FS=12.175;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=10.14;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:13:99:160,0,206 Chr08 42061081 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 42084073 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 42084136 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 42092934 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 42134812 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 42140948 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.04;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 42193100 . G A 802.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:60:831,60,0 Chr08 42194780 . T C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:108,0,69 Chr08 42227067 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.66;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:82:85,0,82 Chr08 42227068 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.66;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,116 Chr08 42314180 . G T 20.83 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:49,0,22 Chr08 42314195 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.82;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:119,9,0 Chr08 42356537 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.04;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 42356555 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr08 42356597 . C T 105.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=0;QD=26.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:133,12,0 Chr08 42356603 . A C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.44;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 42376019 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 42455196 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 42455217 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 42456977 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr08 42508571 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 42508599 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 42570642 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.079;QD=1.93;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:18:63:63,0,515 Chr08 42576652 . C A 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr08 42750806 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 42772768 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 42789135 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 42790237 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr08 43008664 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 43009206 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr08 43013138 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 43083864 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 43086791 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr08 43140390 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 43229010 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.49;MQ0=4;QD=1.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:22:6:70,6,0 Chr08 43230919 . A G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.03;MQ0=0;QD=12.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:103,12,0 Chr08 43230965 . G A 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.28;MQ0=0;QD=9.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:73,9,0 Chr08 43307512 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 43307572 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 43348652 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.80;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr08 43348657 . A T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.80;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr08 43348672 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.80;MQ0=0;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:58,6,0 Chr08 43351036 . T A 265.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.901;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.94;MQ0=9;MQRankSum=-2.157;QD=3.91;ReadPosRankSum=-1.738 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,66:68:53:294,0,53 Chr08 43351074 . G C 191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;DP=69;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.78;MQ0=10;MQRankSum=4.020;QD=2.78;ReadPosRankSum=2.590 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:61,8:69:99:220,0,139 Chr08 43351080 . T G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.43;MQ0=1;MQRankSum=-4.712;QD=0.43;ReadPosRankSum=-0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,51:60:54:54,0,305 Chr08 43351209 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 43359733 . T C 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.306;QD=3.78;ReadPosRankSum=2.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:85:85,0,354 Chr08 43371020 . A T 179.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:208,0,21 Chr08 43381281 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 43392951 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.63;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:67:80,0,67 Chr08 43396875 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;DP=82;Dels=0.00;FS=18.671;HaplotypeScore=3.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.45;MQ0=0;MQRankSum=2.809;QD=0.35;ReadPosRankSum=-3.089 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:78,4:82:57:57,0,956 Chr08 43412037 . A C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,98 Chr08 43412044 . T C 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:79:79,0,331 Chr08 43465173 . G A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60:132,0,60 Chr08 43573043 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 43667985 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr08 43668061 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 43670793 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 43696863 . G A 235.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:264,0,17 Chr08 43777662 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.60;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr08 43777700 . C G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.60;MQ0=1;QD=9.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:56,6,0 Chr08 43857966 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 43857998 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 43858004 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.06;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 43911745 . A G 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.96;MQ0=0;QD=13.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:81,9,0 Chr08 43933494 . T G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.01;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr08 43940996 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:78,6,0 Chr08 43975555 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 43975565 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 43975582 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 44000025 . A G 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr08 44000035 . A G 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.83;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr08 44001143 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:68,0,51 Chr08 44024354 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 44025897 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.076;QD=4.40;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:103,0,483 Chr08 44078143 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 44078191 . T G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr08 44078217 . C A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 44171469 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 44171578 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 44193192 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.43;MQ0=0;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:68,6,0 Chr08 44193205 . T A 21.82 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:4:6:61,6,0 Chr08 44193210 . A T 30.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.52;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:23:59,0,23 Chr08 44388870 . C G 230.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:259,21,0 Chr08 44388878 . C T 231.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=33.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:260,21,0 Chr08 44388879 . A G 220.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=31.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:249,21,0 Chr08 44388885 . A G 234.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.41;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:263,21,0 Chr08 44440086 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 44440097 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 44444050 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 44444061 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 44486404 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:65,0,33 Chr08 44486407 . T G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 44502294 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 44515054 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr08 44515056 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:62,0,33 Chr08 44534846 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 44535796 . A T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,157 Chr08 44587521 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 44675513 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 44680174 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 44713433 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 44719946 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:61,0,60 Chr08 44720179 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.25;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:73,6,0 Chr08 44754439 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr08 44779054 . T C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=13.13;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:107,0,99 Chr08 44803534 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.73;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 44803554 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.56;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 44849779 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 44879912 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr08 44998704 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 45022708 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 45083770 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 45083783 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 45116460 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 45125113 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 45125146 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 45170833 . G A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr08 45176464 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.32;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 45176494 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.32;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 45176829 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 45194166 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 45279373 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 45281063 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 45281095 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 45281122 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 45281145 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 45326259 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.06;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 45431869 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.47;MQ0=1;QD=11.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:6:74,6,0 Chr08 45502348 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 45519735 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 45519771 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 45519797 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 45519808 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.37;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 45539668 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 45539691 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 45571544 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 45573083 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 45586659 . A T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:100,0,69 Chr08 45617178 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 45657092 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.16;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:29:107,0,29 Chr08 45675576 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr08 45858521 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 45913297 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 46029242 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.209;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.999;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.393 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:27:60:60,0,354 Chr08 46074966 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 46147206 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.42;MQ0=1;MQRankSum=-1.605;QD=1.13;ReadPosRankSum=-0.586 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,23:30:62:62,0,98 Chr08 46152978 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;DP=27;Dels=0.00;FS=10.098;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.034;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,802 Chr08 46206951 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr08 46216602 . T A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.75;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 46225051 . C A 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr08 46252843 . T A 267.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:296,21,0 Chr08 46265502 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 46267130 . T C 277.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;DP=82;Dels=0.00;FS=9.423;HaplotypeScore=50.5346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.89;MQ0=16;MQRankSum=4.136;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:71,10:82:99:306,0,529 Chr08 46331653 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 46331783 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 46331810 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 46350871 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 46382294 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 46396394 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 46401427 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 46401453 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 46430085 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,223 Chr08 46493259 . T A 80.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 46680273 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 46697286 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 46712079 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 46758070 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 46758095 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 46762330 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 46799480 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 46799481 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 46822491 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 46822519 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 46824409 . G A 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.05;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr08 46827742 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 46842806 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.46;MQ0=0;QD=21.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:113,9,0 Chr08 46854593 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 46868378 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 46883948 . C G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr08 46884704 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 46884721 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 46908167 . C T 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr08 46908196 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr08 46908199 . T A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr08 46908219 . T C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.66;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr08 47001750 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47013066 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,202 Chr08 47028713 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47057279 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 47074783 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 47075209 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47075225 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 47076029 . T C 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.34;MQ0=2;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,5:7:15:193,15,0 Chr08 47076074 . A G 153.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.84;MQ0=2;MQRankSum=-0.651;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,15:18:15:182,15,0 Chr08 47076084 . G A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.84;MQ0=2;QD=9.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,16:18:15:192,15,0 Chr08 47076094 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.06;MQ0=0;QD=5.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:9:109,9,0 Chr08 47150627 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,242 Chr08 47150806 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47150815 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 47166767 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 47166797 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 47210300 . C T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 47240150 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 47316104 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 47325251 . A C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.33;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 47325265 . C A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.33;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 47325284 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.33;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 47486821 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 47486862 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 47492286 . G C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:103,0,66 Chr08 47492290 . A C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:107,0,66 Chr08 47492329 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr08 47511347 . A T 813.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.56;MQ0=0;QD=25.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:66:842,66,0 Chr08 47555915 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr08 47576390 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47605733 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 47606268 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 47618097 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 47620410 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 47621884 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 47625489 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,109 Chr08 47626852 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.43;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:77:77,0,289 Chr08 47627637 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47632445 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 47634770 . G T 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.062;QD=3.94;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:166,0,1040 Chr08 47683114 . G T 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr08 47683124 . A G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr08 47719978 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 47722359 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.804;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.86;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:114,9,0 Chr08 47722371 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.86;MQ0=0;MQRankSum=2.526;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:9:114,9,0 Chr08 47722399 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.30;MQ0=0;QD=3.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:75,6,0 Chr08 47723159 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.79;MQ0=0;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr08 47723229 . A C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.79;MQ0=0;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr08 47723234 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.79;MQ0=0;QD=4.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:51,6,0 Chr08 47733708 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 47733736 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 47733794 . C T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 47735589 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 47749606 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.91;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 47749614 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.91;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 47749630 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.91;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 47758987 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 47759124 . G T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=11;Dels=0.00;FS=26.646;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.143;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:160,0,205 Chr08 47760105 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.03;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 47760124 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 47760154 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.85;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 47760597 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 47760603 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 47760612 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 47798063 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 47798079 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 47813497 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 47813519 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 47813546 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 47813555 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 47813680 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 47813698 . A T 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 47888500 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 47888508 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 47888511 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47888589 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 47897397 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 47897430 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 47898264 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 47898283 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 47898284 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 47898320 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 47898338 . G A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 48024049 . C T 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.51;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 48024077 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 48054566 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr08 48062138 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 48091421 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 48091471 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,137 Chr08 48097730 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.15;MQ0=2;QD=3.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:51,6,0 Chr08 48097985 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 48101205 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.32;MQ0=0;QD=10.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:80,6,0 Chr08 48101227 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.42;MQ0=0;QD=12.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:78,6,0 Chr08 48127113 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 48127137 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 48185875 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 48185887 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 48185890 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 48185902 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 48185947 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 48185959 . T A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr08 48186109 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 48186121 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 48190137 . A T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.85;MQ0=58;MQRankSum=0.727;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,3:62:6:53,6,0 Chr08 48190145 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.85;MQ0=58;MQRankSum=0.727;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:59,3:62:6:53,6,0 Chr08 48196005 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 48196008 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 48200847 . T C 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr08 48200883 . T C 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:230,18,0 Chr08 48218871 . T A 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr08 48218872 . T A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr08 48219483 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 48219484 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 48361324 . G A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.690;DP=53;Dels=0.00;FS=7.534;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.155;QD=2.24;ReadPosRankSum=-4.485 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,8:53:99:147,0,1663 Chr08 48392109 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 48402542 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 48450686 . C T 94.28 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.977;QD=10.90;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:159,0,240 Chr08 48589046 . T C 255.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:284,21,0 Chr08 48589066 . A T 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 Chr08 48589084 . T A 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:57:182,0,57 Chr08 48594163 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 48601050 . T A 37.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 48765149 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr08 48765158 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 48785797 . G C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr08 48787275 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr08 48787277 . T G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 48798608 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 48848041 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.386;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,254 Chr08 48848357 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.606;DP=81;Dels=0.00;FS=20.633;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=0.353;QD=0.92;ReadPosRankSum=-4.877 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,9:81:99:103,0,2738 Chr08 48858483 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 48858492 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 48905584 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 48913376 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr08 48918531 . G A 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr08 48944493 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 48969662 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr08 48983012 . T C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.82;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr08 49014174 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 49107521 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49127005 . T G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.99;MQ0=1;MQRankSum=-1.380;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:52:69,0,52 Chr08 49158783 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 49158797 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49213175 . A C 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr08 49260219 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.466;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.987;QD=1.05;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:69:69,0,1277 Chr08 49287708 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 49293056 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 49293420 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49293426 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49331191 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 49331264 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 49331765 . G T 32.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49368808 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr08 49368820 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 49368871 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 49368890 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49375158 . A T 147.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.63;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:176,0,21 Chr08 49416888 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,441 Chr08 49419390 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:133,0,104 Chr08 49506336 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49555692 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49558627 . G C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 49564999 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 49578031 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 49584990 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr08 49585521 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,182 Chr08 49588702 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr08 49648424 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49653548 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 49680096 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 49680117 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49689182 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49689184 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49689195 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 49709035 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr08 49709057 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49709376 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 49709411 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 49712106 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.997;DP=32;Dels=0.00;FS=33.797;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.137;QD=0.77;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:53:53,0,961 Chr08 49713693 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49713713 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49713751 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 49738818 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 49739052 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 49760314 . A T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:103,0,28 Chr08 49760364 . A G 42.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:71,0,27 Chr08 49765122 . A C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 49772845 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,260 Chr08 49778049 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr08 49793851 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr08 49798992 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,72 Chr08 49799114 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49808349 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 49808594 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 49808631 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 49834492 . A G 143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5027;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.633;QD=11.98;ReadPosRankSum=-1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:12:99:172,0,126 Chr08 49851080 . A G 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 Chr08 49854100 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 49856825 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 49868793 . G T 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.169;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.887;QD=6.15;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:139,0,464 Chr08 49872058 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.401;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:15:74:74,0,395 Chr08 49872273 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 49877011 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 49887294 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 49888084 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;DP=22;Dels=0.00;FS=2.605;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.457;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:22:53:53,0,660 Chr08 49907103 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 49924374 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 49924389 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 49924398 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 49924509 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr08 49924551 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 49959045 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 50008063 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,229 Chr08 50008074 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,229 Chr08 50015456 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.216;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:73:73,0,1241 Chr08 50016618 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 50017898 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 50027292 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 50027451 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 50029460 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 50049879 . C A 139.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:168,0,23 Chr08 50096125 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 50096131 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 50096168 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 50116506 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 50139109 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,144 Chr08 50149082 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 50158259 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 50163938 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.029;DP=29;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.318 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:60:60,0,183 Chr08 50163940 . T G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;DP=29;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.14;MQ0=0;MQRankSum=-3.493;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.144 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,24:29:60:60,0,179 Chr08 50166348 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 50232766 . T G 161.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:190,0,24 Chr08 50238485 . G A 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.754;QD=7.72;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:73:90,0,73 Chr08 50238513 . C T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.26;MQ0=1;MQRankSum=-1.754;QD=7.72;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:73:90,0,73 Chr08 50255262 . C T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 Chr08 50255554 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 50255577 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 50258637 . C G 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.48;MQ0=1;MQRankSum=-3.067;QD=14.05;ReadPosRankSum=-0.933 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:239,0,165 Chr08 50258643 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.533 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:239,0,155 Chr08 50258652 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=15.05;ReadPosRankSum=-0.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:239,0,163 Chr08 50258774 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr08 50259104 . C T 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:146,0,26 Chr08 50275386 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;DP=37;Dels=0.00;FS=44.031;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.42;MQ0=0;MQRankSum=-5.181;QD=1.51;ReadPosRankSum=-5.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,18:37:84:84,0,681 Chr08 50284988 . C A 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr08 50285609 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 50285614 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 50285620 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 50286444 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 50290564 . C T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr08 50313633 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 50313643 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 50313660 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 50315226 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 50315254 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 50315269 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.35;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 50329767 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.588;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.72;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:76:76,0,368 Chr08 50394391 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 50394395 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 50427233 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;DP=22;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=1.44;ReadPosRankSum=2.009 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,678 Chr08 50427240 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;DP=22;Dels=0.00;FS=6.690;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.148;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:63:63,0,674 Chr08 50489475 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr08 50489516 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 50489548 . T C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr08 50489553 . A C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr08 50492076 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr08 50503025 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 50509410 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 50536615 . T G 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr08 50536619 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=21.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:113,9,0 Chr08 50536625 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=12.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:77,6,0 Chr08 50536633 . G A 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr08 50536641 . A G 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr08 50536661 . G C 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.75;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.82;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:99,9,0 Chr08 50536986 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr08 50536987 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 50579158 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr08 50655444 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 50691451 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 50725744 . G T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 50725770 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 50725792 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 50725811 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 50873655 . T A 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;DP=37;Dels=0.00;FS=11.047;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.611;QD=5.45;ReadPosRankSum=-4.159 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,9:37:99:230,0,994 Chr08 50904395 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 50916560 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr08 50925351 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 50932042 . G T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.117;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.933;QD=2.79;ReadPosRankSum=-4.117 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,7:39:99:137,0,1197 Chr08 50938621 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 50940244 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.377 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:80:80,0,280 Chr08 50966219 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 50966827 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 50966876 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr08 50968871 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 50974761 . C T 42.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,147 Chr08 51125292 . G T 236.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.150;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.162;QD=9.11;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,9:26:99:265,0,619 Chr08 51138320 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 51138343 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 51144753 . C A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.175;QD=5.24;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:133,0,540 Chr08 51144845 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,133 Chr08 51146422 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:49:49,0,224 Chr08 51204235 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 51210631 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51220521 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51302655 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.24;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr08 51302687 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.24;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr08 51302713 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 51302729 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 51302732 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 51307397 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 51310895 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,108 Chr08 51319178 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 51331365 . C G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 51332653 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 51352320 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 51423086 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.75;MQ0=0;MQRankSum=2.197;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.051 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,2:39:72:72,0,72 Chr08 51426052 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:50:50,0,187 Chr08 51426053 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:53:53,0,149 Chr08 51426066 . G C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:50:50,0,188 Chr08 51426090 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.05;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:53:53,0,160 Chr08 51427590 . G A 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr08 51437436 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=9.48;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,215 Chr08 51439570 . C T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=64;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.17;MQ0=55;MQRankSum=-2.054;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,60:64:54:54,0,94 Chr08 51439699 . G C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.316;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.28;MQ0=3;MQRankSum=-4.091;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.601 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,10:40:80:80,0,1047 Chr08 51439714 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.667;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.723;QD=2.71;ReadPosRankSum=3.667 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:99:104,0,763 Chr08 51439741 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;DP=31;Dels=0.00;FS=52.302;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQ0=0;MQRankSum=-3.518;QD=2.06;ReadPosRankSum=3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:92:92,0,907 Chr08 51451783 . A G 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr08 51451795 . C T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr08 51451796 . A C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 51451819 . T G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 51451832 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 51451845 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 51451851 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 51451869 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 51494733 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr08 51494821 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:77:77,0,100 Chr08 51494822 . G C 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:11:60:80,0,60 Chr08 51494849 . A G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.8165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.633 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:11:66:102,0,66 Chr08 51494859 . A C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.8073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.52;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:63:63,0,108 Chr08 51494860 . A T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:63:63,0,105 Chr08 51494865 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.4773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.52;MQ0=0;MQRankSum=-2.166;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:63:63,0,109 Chr08 51494884 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.826;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.19;MQ0=0;MQRankSum=0.752;QD=1.83;ReadPosRankSum=-2.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:13:52:52,0,181 Chr08 51496471 . C G 188.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=26.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:217,0,21 Chr08 51496473 . A T 181.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.97;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:210,0,21 Chr08 51496874 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.24;MQ0=16;MQRankSum=1.537;QD=2.79;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:22:9:89,9,0 Chr08 51497235 . G A 61.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.68;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:17:90,0,17 Chr08 51499413 . T C 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr08 51499483 . C T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 51499488 . A G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 51504348 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr08 51504434 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.24;MQ0=0;MQRankSum=1.985;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.302 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,2:16:55:64,0,55 Chr08 51522857 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 51522874 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 51533279 . A T 38.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.95;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:67,0,18 Chr08 51542730 . T A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.06;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr08 51542876 . G C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542893 . C A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542895 . T A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542901 . C G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542903 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542909 . A G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542912 . T A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542915 . A T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542920 . G C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542924 . A C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542925 . C A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542929 . G C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.45;MQ0=0;QD=6.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:87,12,0 Chr08 51542931 . T G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.87;MQ0=0;QD=5.90 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:87,12,0 Chr08 51548575 . G A 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr08 51548590 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr08 51548601 . T C 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=12.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:65,9,0 Chr08 51548631 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:50:50,0,66 Chr08 51548634 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:50:50,0,67 Chr08 51548642 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:50:50,0,67 Chr08 51548679 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.81;MQ0=58;MQRankSum=-1.026;QD=0.54;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,60:62:62:62,0,71 Chr08 51548681 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.81;MQ0=58;MQRankSum=-1.026;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,60:62:57:57,0,69 Chr08 51548736 . C T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.788;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.36;MQ0=0;MQRankSum=3.766;QD=1.03;ReadPosRankSum=-3.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,6:52:82:82,0,1382 Chr08 51548758 . A G 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;DP=51;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.69;MQ0=0;MQRankSum=3.786;QD=0.94;ReadPosRankSum=-3.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:51:76:76,0,1382 Chr08 51548772 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.95;MQ0=0;MQRankSum=3.460;QD=0.54;ReadPosRankSum=2.134 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,5:50:55:55,0,1384 Chr08 51559660 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:63,0,32 Chr08 51564949 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 51566088 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.550;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.150;QD=3.19;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:20:92:92,0,550 Chr08 51570935 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr08 51570937 . A G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 51576404 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 51576798 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 51576808 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 51576862 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 51577233 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 51592312 . A T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=16;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=7.49;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:16:99:148,0,348 Chr08 51592392 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.725;DP=55;Dels=0.00;FS=14.682;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.316;QD=1.38;ReadPosRankSum=-4.255 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,7:55:99:104,0,1769 Chr08 51632038 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 51634898 . C G 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:35:188,0,35 Chr08 51757323 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 51761545 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 51763704 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;DP=35;Dels=0.00;FS=5.327;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=1.79;ReadPosRankSum=-3.161 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:35:91:91,0,1009 Chr08 51770356 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 51771110 . T A 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.18;MQ0=0;MQRankSum=1.944;QD=5.52;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:27:100,0,27 Chr08 51776444 . C A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.866;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.915 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:167,0,902 Chr08 51777532 . T A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr08 51778005 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 51782851 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 51794545 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 51800767 . G A 103.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:131,12,0 Chr08 51801539 . T A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;DP=36;Dels=0.00;FS=32.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.120;QD=3.77;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:164,0,1036 Chr08 51808275 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 51808306 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 51808829 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51846967 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,71 Chr08 51848465 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,315 Chr08 51864748 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:126,0,178 Chr08 51875282 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.928;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.630;QD=1.83;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:74:74,0,785 Chr08 51878167 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 51941980 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 51942027 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 51958558 . C G 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr08 51989642 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51989655 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51991985 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51992004 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 51992472 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51992853 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51992861 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 51992875 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 51993576 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 52065920 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 52066154 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.09;MQ0=6;QD=2.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:62,6,0 Chr08 52100998 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 52101548 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52154610 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 52159735 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52165478 . A G 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.11;MQ0=0;QD=13.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:107,12,0 Chr08 52165504 . T C 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.11;MQ0=0;QD=13.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:107,12,0 Chr08 52165505 . G A 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.11;MQ0=0;QD=13.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:107,12,0 Chr08 52165592 . A T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 52165602 . A T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr08 52174689 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52174733 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52174736 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52174804 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 52174846 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 52174860 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 52174903 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 52174904 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 52207704 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52207705 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52211858 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52218504 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 52218510 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52218731 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,142 Chr08 52224176 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:70,0,69 Chr08 52224198 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,70 Chr08 52224218 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,71 Chr08 52225460 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr08 52225481 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 52225485 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 52225486 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 52225512 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52243540 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 52243563 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52243590 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52243593 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52243596 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52244067 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52259300 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 52259840 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52278647 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:84:84,0,704 Chr08 52283218 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 52295499 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,104 Chr08 52336293 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,146 Chr08 52362211 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52362991 . G C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr08 52375191 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52375210 . G C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 52382712 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52389971 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,344 Chr08 52393752 . T A 187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;DP=39;Dels=0.00;FS=2.097;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.643 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,8:39:99:216,0,1110 Chr08 52393832 . A G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.379;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.112 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:133,0,652 Chr08 52414387 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 52414434 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52440353 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.234;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:90:90,0,617 Chr08 52446472 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.484 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:51:51,0,780 Chr08 52446492 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.227;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:79:79,0,1254 Chr08 52446994 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 52452795 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.088;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.559;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:86:86,0,1108 Chr08 52462242 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:127,0,103 Chr08 52462335 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:83:83,0,253 Chr08 52484595 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52491902 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52492262 . A T 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr08 52492358 . C A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr08 52506033 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52521124 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 52533076 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.240;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.700;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:49:49,0,1166 Chr08 52535784 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.754;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:52:52,0,621 Chr08 52554852 . C A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr08 52554856 . A G 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr08 52554872 . A T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr08 52554896 . C G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.98;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr08 52554911 . A T 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.98;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr08 52554930 . A G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.98;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr08 52555064 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 52555100 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52555104 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52555410 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 52555725 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52555732 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 52555734 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52557399 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 52566910 . G T 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr08 52595204 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52595220 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52601339 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 52601361 . A C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 52601393 . C G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr08 52633446 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 52638271 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 52644943 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 52654817 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr08 52654824 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr08 52657830 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 52672643 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 52672714 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52685896 . C T 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.742;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.87;MQ0=0;MQRankSum=-3.742;QD=9.74;ReadPosRankSum=0.193 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:223,0,426 Chr08 52689100 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.76;MQ0=5;MQRankSum=2.073;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,2:18:29:74,0,29 Chr08 52695098 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 52817629 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 52831209 . C A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,254 Chr08 52832650 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 52842453 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 52900061 . C T 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr08 52918581 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 52924127 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 52924164 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 52924170 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 52924173 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr08 52947109 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 53034159 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 53057687 . C T 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.35;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:96,9,0 Chr08 53057707 . G A 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.35;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:96,9,0 Chr08 53065545 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr08 53065561 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr08 53065576 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr08 53065588 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.52;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr08 53070008 . C T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr08 53071544 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53071569 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53071605 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53071615 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 53072078 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 53072138 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 53110299 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=1;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr08 53118850 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 53118859 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr08 53118942 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.05;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 53153219 . G T 29.79 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQ0=0;QD=9.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:69,6,0 Chr08 53158895 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 53174697 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 53174721 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 53174891 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53184997 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 53185009 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53207711 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,176 Chr08 53226695 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53254006 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53261860 . T C 117.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:22:146,0,22 Chr08 53273745 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.52;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 53287854 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:91:91,0,628 Chr08 53317384 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53330441 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53337536 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53342671 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 53342699 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 53371189 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53377643 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53414926 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.71;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr08 53423287 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53430991 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53432755 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 53433323 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 53433339 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 53433344 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 53442887 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53472807 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.189;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.804;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:49:49,0,1165 Chr08 53539106 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=26.580;HaplotypeScore=10.9984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,456 Chr08 53544206 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 53565779 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,68 Chr08 53570558 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 53570566 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53572596 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,215 Chr08 53578245 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr08 53603169 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.280;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.168;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:56:56,0,547 Chr08 53612227 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 53620563 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,205 Chr08 53620648 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr08 53622953 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,99 Chr08 53623050 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,285 Chr08 53625332 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr08 53630167 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr08 53647014 . A G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:56,0,32 Chr08 53685798 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 53688100 . T C 244.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:273,21,0 Chr08 53705957 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53730798 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53741948 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53741986 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 53742206 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 53742245 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53743765 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,65 Chr08 53773565 . G T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=5.27;ReadPosRankSum=-3.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:160,0,677 Chr08 53773648 . C A 142.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:171,0,23 Chr08 53786681 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53827112 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 53862784 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 53864920 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 53864963 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 53864995 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 53869217 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 53879687 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 53880446 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 53896321 . T C 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr08 53896339 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr08 53903969 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 53904033 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 53912285 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr08 53913289 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 53917608 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 53933997 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 53984109 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 53988328 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,267 Chr08 53990141 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 54006857 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 54010781 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 54024645 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 54044880 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 54046225 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 54053603 . C G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053619 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053624 . A G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053627 . A G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053632 . A C 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053635 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053636 . T C 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053639 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54053642 . A G 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:74,9,0 Chr08 54062984 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 54068150 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=6.13;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:114,0,328 Chr08 54087284 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 54104148 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 54104159 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 54132176 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:64,0,33 Chr08 54132220 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr08 54150904 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr08 54150913 . T C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:107,0,29 Chr08 54157349 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.002 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:78:78,0,766 Chr08 54162209 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.493;DP=24;Dels=0.00;FS=14.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.569;QD=3.49;ReadPosRankSum=-3.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:112,0,648 Chr08 54195858 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54195905 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54199697 . A T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:167,0,58 Chr08 54205590 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 54254874 . A G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:78,0,30 Chr08 54255161 . C G 117.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:146,0,23 Chr08 54286475 . T C 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.74;MQ0=0;QD=11.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:99,12,0 Chr08 54286549 . G A 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.74;MQ0=4;QD=7.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:12:99,12,0 Chr08 54301636 . A G 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.91;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:60:160,0,60 Chr08 54314508 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 54370154 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 54390125 . A T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:30:111,0,30 Chr08 54393197 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 54422426 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,263 Chr08 54457939 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,97 Chr08 54464363 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 54477161 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 54482585 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 54495890 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 54495931 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 54504514 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr08 54504745 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54512437 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 54512461 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 54519649 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;DP=57;Dels=0.00;FS=13.732;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQ0=0;MQRankSum=-4.514;QD=1.03;ReadPosRankSum=-3.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,8:57:87:87,0,1829 Chr08 54520395 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 54520397 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 54554395 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 54554879 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 54556281 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.050;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,665 Chr08 54561654 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54585381 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 54585428 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 54627978 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 54628869 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 54656345 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 54660324 . T G 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:103,0,30 Chr08 54699121 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 54700570 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:44:168,0,44 Chr08 54700577 . C T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=19.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:50:168,0,50 Chr08 54720241 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54721770 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 54723571 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,151 Chr08 54723586 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,149 Chr08 54725822 . G C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr08 54725947 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.955;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,611 Chr08 54725989 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.9942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,337 Chr08 54727098 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 54747049 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 54752157 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr08 54752198 . A T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr08 54752200 . A G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:112,0,29 Chr08 54752202 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr08 54753555 . C A 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=15.64;ReadPosRankSum=1.307 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:169,0,135 Chr08 54753624 . G C 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;DP=17;Dels=0.00;FS=6.245;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=9.10;ReadPosRankSum=-2.060 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:183,0,399 Chr08 54758132 . A G 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:136,0,58 Chr08 54758174 . T C 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:142,0,66 Chr08 54758180 . G A 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:143,0,66 Chr08 54772419 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 54772462 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr08 54775797 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr08 54775838 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr08 54776314 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 54776317 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 54776322 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr08 54800464 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 54801983 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 54802030 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 54802048 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 54812225 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 54812239 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 54812253 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 54817217 . T A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr08 54824347 . T G 118.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:147,0,19 Chr08 54827427 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 54831965 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 54832094 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 54834504 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,148 Chr08 54834520 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,149 Chr08 54837731 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:67,0,30 Chr08 54838669 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 54851291 . T C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.36;MQ0=1;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:188,15,0 Chr08 54878266 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54881767 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 54881777 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54882839 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,103 Chr08 54882847 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,109 Chr08 54886120 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 54888491 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 54888788 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 54888796 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 54889621 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 54890089 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr08 54891528 . T G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr08 54891567 . G C 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:70,0,27 Chr08 54891573 . T A 41.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:70,0,22 Chr08 54935707 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr08 54935738 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 54935776 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:71,0,31 Chr08 54935794 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr08 54938403 . A G 170.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=21.35;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:52:199,0,52 Chr08 54944289 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 54945133 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr08 54969845 . A T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:102,0,68 Chr08 54972262 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 54973202 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr08 54990088 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 54994981 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 54995976 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr08 55006744 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 55014112 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,302 Chr08 55014123 . C G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=1.7326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=4.14;ReadPosRankSum=-1.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:82:82,0,325 Chr08 55024698 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 55037500 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55037503 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55037505 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 55037528 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 55037533 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr08 55037536 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 55085467 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55091020 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 55091044 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 55096985 . T A 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr08 55098307 . G A 177.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:206,0,18 Chr08 55109489 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55109505 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55153784 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=20;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,625 Chr08 55176058 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55183310 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr08 55185025 . A T 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=15.09;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:164,0,135 Chr08 55244725 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:126,0,179 Chr08 55298634 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 55330805 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.109;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.370;QD=4.40;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,313 Chr08 55363653 . G T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.845;QD=6.75;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:143,0,392 Chr08 55369023 . T A 224.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=22.48;ReadPosRankSum=-0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:92:253,0,92 Chr08 55369045 . A T 222.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=22.28;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:96:251,0,96 Chr08 55369047 . A C 234.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=23.48;ReadPosRankSum=2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:263,0,95 Chr08 55369066 . A T 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=18.88;ReadPosRankSum=2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:217,0,135 Chr08 55376526 . C A 110.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;DP=42;Dels=0.00;FS=27.287;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=2.64;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:139,0,1232 Chr08 55394110 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr08 55405722 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:72:72,0,401 Chr08 55406672 . T A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.673 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:78:78,0,492 Chr08 55407034 . A T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr08 55410417 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 55447154 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 55451040 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55452851 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 55467825 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.32;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 55479294 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:105,0,30 Chr08 55479333 . A C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:110,0,28 Chr08 55486696 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.55;MQ0=32;QD=1.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,2:34:6:77,6,0 Chr08 55499076 . G A 197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:226,18,0 Chr08 55501790 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 55520783 . T C 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:146,0,27 Chr08 55524044 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr08 55532130 . A T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 55532360 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,137 Chr08 55538175 . T A 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=10;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=12.98;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:158,0,181 Chr08 55539859 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55539919 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 55539935 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 55541491 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 55541542 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55541648 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 55541777 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55541795 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 55541808 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 55578053 . G C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 55591551 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 55591577 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55597011 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55597044 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 55600706 . T A 46.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:75,0,27 Chr08 55600719 . A G 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:74,0,27 Chr08 55605216 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.42;MQ0=1;QD=8.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:63,6,0 Chr08 55606643 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 55623113 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr08 55629353 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,218 Chr08 55631183 . A G 175.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.43;MQ0=0;QD=25.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:204,18,0 Chr08 55631211 . G T 136.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 55690138 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 55690139 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 55691165 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55691202 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55691511 . G A 80.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:109,0,24 Chr08 55691520 . C A 82.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:111,0,23 Chr08 55692959 . T A 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 55703685 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55703694 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 55705442 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr08 55708657 . T C 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;DP=69;Dels=0.00;FS=24.905;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQ0=0;MQRankSum=-4.820;QD=1.76;ReadPosRankSum=-4.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:60,9:69:99:150,0,2206 Chr08 55712953 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr08 55721288 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr08 55732623 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr08 55732628 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr08 55741673 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr08 55745153 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,101 Chr08 55745154 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,100 Chr08 55746381 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 55746843 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr08 55779916 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55779931 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55783480 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 55794048 . G T 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.437;QD=8.98;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:14:99:154,0,277 Chr08 55814164 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 55814186 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 55814192 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55825812 . T C 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr08 55839237 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55839252 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 55839267 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55839272 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55839280 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 55839307 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 55839959 . C T 1422.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.875;DP=55;Dels=0.04;FS=3.132;HaplotypeScore=2.5114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.98;MQ0=0;MQRankSum=-4.694;QD=25.87;ReadPosRankSum=-1.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,43:53:99:1451,0,224 Chr08 55840784 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 55841801 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 55844707 . T A 68.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=15.80;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:202,0,172 Chr08 55965566 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.13;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,134 Chr08 55967393 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr08 55973711 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.19;MQ0=0;MQRankSum=1.659;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:70:70,0,556 Chr08 55973870 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 55984598 . A G 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:117,12,0 Chr08 55984906 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 55984914 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 55984918 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr08 55984925 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 55984930 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr08 55984935 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr08 56044754 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=39;Dels=0.00;FS=2.414;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.021;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:68:68,0,1261 Chr08 56044850 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr08 56068934 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr08 56069502 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr08 56097868 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,110 Chr08 56097873 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,111 Chr08 56097883 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,109 Chr08 56103499 . G T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 56103504 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 56103505 . T A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 56103527 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 56103565 . A C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr08 56111431 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 56111453 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 56114352 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:50:50,0,165 Chr08 56114681 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 56201029 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 56201041 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 56201085 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 56201587 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 56202245 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 56222796 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 56223198 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 56233816 . T A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr08 56233821 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr08 56233843 . C T 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr08 56233895 . G T 173.84 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:67,0,25 Chr08 56504561 . T C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr08 56528718 . T A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.97;MQ0=1;QD=24.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:150,12,0 Chr08 56538514 . T G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr08 56538515 . T G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr08 56538519 . T A 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.81;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr08 56540676 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=3.332;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,168 Chr08 56551114 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 56558097 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.725;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:58:58,0,556 Chr08 56575926 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 56583352 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.597;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.521;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:33:99:132,0,966 Chr08 56644337 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.268;DP=28;Dels=0.00;FS=16.251;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=0;MQRankSum=-3.723;QD=1.31;ReadPosRankSum=1.820 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:28:65:65,0,784 Chr08 56644338 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;DP=25;Dels=0.00;FS=18.266;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQ0=0;MQRankSum=-3.659;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:74:74,0,669 Chr08 56644342 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.950;DP=18;Dels=0.00;FS=37.916;HaplotypeScore=5.8404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.39;MQ0=0;MQRankSum=-3.419;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.609 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:69:69,0,437 Chr08 56663571 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,111 Chr08 56672757 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr08 56723285 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=15;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,438 Chr08 56759547 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 56821765 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=33;Dels=0.00;FS=5.179;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.396;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:33:53:53,0,1032 Chr08 56849606 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=44;Dels=0.00;FS=7.939;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.629;QD=0.72;ReadPosRankSum=-3.624 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,5:44:60:60,0,1420 Chr08 56886103 . C A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.536;QD=7.56;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:119,0,262 Chr08 56934169 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.056;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:20:59:59,0,598 Chr08 56934482 . C A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.215;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.685;QD=6.69;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:142,0,441 Chr08 57000813 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 57002235 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:70,0,29 Chr08 57013019 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=2;QD=11.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:72,6,0 Chr08 57013025 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=2;QD=11.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:75,6,0 Chr08 57013103 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:71,0,33 Chr08 57093213 . T G 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=5.05;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:16:99:109,0,196 Chr08 57123939 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:93:93,0,143 Chr08 57154397 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.335;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=2.84;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:68:68,0,399 Chr08 57154491 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.468;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,281 Chr08 57215991 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,140 Chr08 57224773 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=3.52;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:74:74,0,364 Chr08 57225305 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 57270516 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.482;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:58:58,0,1397 Chr08 57280060 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;DP=20;Dels=0.00;FS=11.326;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,588 Chr08 57311186 . C A 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=18.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:61:137,0,61 Chr08 57321299 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,265 Chr08 57345026 . G T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.386;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,296 Chr08 57367697 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,221 Chr08 57367944 . A C 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;DP=27;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=6.6960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.740;QD=5.25;ReadPosRankSum=-3.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,11:27:99:170,0,153 Chr08 57395764 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 57395794 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 57395805 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 57395833 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 57429469 . C A 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:65,0,26 Chr08 57457165 . T G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.658 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:91:91,0,734 Chr08 57457176 . A G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:97:97,0,760 Chr08 57457210 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=2.91;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:24:98:98,0,717 Chr08 57471976 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 57475563 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 57490259 . C A 174.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.155;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.380;QD=9.20;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:203,0,415 Chr08 57533045 . T C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,136 Chr08 57550642 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,149 Chr08 57558945 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 57571689 . T C 33.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:62,0,24 Chr08 57574948 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,147 Chr08 57575033 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:107,0,107 Chr08 57575553 . A T 202.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.359;DP=31;Dels=0.00;FS=7.607;HaplotypeScore=1.9914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.49;MQ0=0;MQRankSum=-3.914;QD=6.54;ReadPosRankSum=-1.521 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,12:31:99:231,0,651 Chr08 57605343 . C A 187.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=11.05;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:216,0,357 Chr08 57611542 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr08 57691034 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 57692812 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 57692954 . A G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr08 57692981 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr08 57694502 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 57729567 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 57729581 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr08 57729631 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 57732775 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 57734612 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 57735244 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 57752240 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr08 57773464 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.821;DP=54;Dels=0.00;FS=16.289;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.647;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,6:54:69:69,0,1748 Chr08 57783685 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.70;MQ0=1;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:69,6,0 Chr08 57883681 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 57886467 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,185 Chr08 57978751 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58034772 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr08 58037147 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 58045070 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 58198987 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,137 Chr08 58231323 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:79:79,0,1243 Chr08 58245312 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,136 Chr08 58252772 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:123,0,276 Chr08 58269831 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58281044 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr08 58287766 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.675;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.745;QD=0.76;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:34:54:54,0,1074 Chr08 58323904 . G A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr08 58363123 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 58376891 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;DP=18;Dels=0.00;FS=2.805;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.478;QD=3.82;ReadPosRankSum=-3.027 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,4:18:97:97,0,474 Chr08 58404881 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58440092 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,106 Chr08 58463723 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 58464674 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 58471104 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.39;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 58471113 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.39;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58471133 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:98,0,67 Chr08 58476072 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58476098 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 58477392 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 58482185 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 58485532 . C T 605.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;DP=48;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=26.3731;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.98;MQ0=19;MQRankSum=-1.733;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,45:46:9:633,9,0 Chr08 58502548 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.85;MQ0=1;MQRankSum=1.733;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:66:66,0,131 Chr08 58502569 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.51;MQ0=1;MQRankSum=2.262;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:99:102,0,128 Chr08 58502578 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.51;MQ0=1;MQRankSum=2.003;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:63:63,0,162 Chr08 58502579 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.51;MQ0=1;MQRankSum=2.003;QD=2.90;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:63:63,0,162 Chr08 58506563 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 58507314 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr08 58510477 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58512338 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:72,0,65 Chr08 58515254 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=14;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.08;MQ0=5;MQRankSum=-2.219;QD=1.77;ReadPosRankSum=-1.652 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:53:53,0,119 Chr08 58516093 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.86;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=18.66;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:121,9,0 Chr08 58519725 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.26;MQ0=2;QD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:55,6,0 Chr08 58519990 . G A 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:75,9,0 Chr08 58519998 . G A 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:75,9,0 Chr08 58519999 . A G 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:75,9,0 Chr08 58523035 . G C 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;DP=17;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=8.4967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.72;MQ0=2;MQRankSum=-0.884;QD=3.16;ReadPosRankSum=1.120 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,8:17:82:82,0,175 Chr08 58523041 . A T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.5300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.73;MQ0=2;MQRankSum=-0.289;QD=6.91;ReadPosRankSum=-1.835 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,8:14:66:125,0,66 Chr08 58523043 . C T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=14.0601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.07;MQ0=2;MQRankSum=0.143;QD=4.60;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,8:13:67:88,0,67 Chr08 58523044 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.0607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.57;MQ0=2;MQRankSum=0.198;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:12:52:52,0,72 Chr08 58523049 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.696;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.7294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.57;MQ0=2;MQRankSum=-1.741;QD=3.65;ReadPosRankSum=1.044 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:32:72,0,32 Chr08 58523101 . T C 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.19;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr08 58523185 . C T 41.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:27:70,0,27 Chr08 58526008 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr08 58527960 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.547;DP=25;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.28;MQ0=0;MQRankSum=1.463;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.801 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,3:25:53:53,0,163 Chr08 58528009 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.06;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58529296 . T A 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.62;MQ0=0;QD=12.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:114,12,0 Chr08 58529340 . C T 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.62;MQ0=0;QD=12.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:12:114,12,0 Chr08 58529428 . T C 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.65;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 Chr08 58529438 . G A 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.65;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:81,9,0 Chr08 58529440 . T A 96.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.40;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:7:124,0,7 Chr08 58529499 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.72;MQ0=1;MQRankSum=1.532;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:51:51,0,275 Chr08 58529503 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.72;MQ0=1;MQRankSum=1.532;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:51:51,0,275 Chr08 58530102 . G A 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.05;MQ0=0;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 Chr08 58530140 . A T 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.05;MQ0=0;QD=9.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:67,9,0 Chr08 58530141 . T G 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.05;MQ0=0;QD=9.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:67,9,0 Chr08 58536205 . G C 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=1;MQRankSum=-2.237;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:115,0,321 Chr08 58536219 . T C 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.62;MQ0=1;MQRankSum=-2.237;QD=6.98;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:126,0,316 Chr08 58536261 . G C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.13;MQ0=1;QD=26.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:162,12,0 Chr08 58536633 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58596069 . G T 144.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:173,0,23 Chr08 58596257 . T A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 58597272 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 58597283 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 58603140 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58603142 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58603150 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58603173 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58603288 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58604021 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 58610468 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 58611725 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58611728 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 58620791 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 58628216 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 58628453 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 58652217 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 58652581 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 58652592 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 58663621 . C A 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:7:18:238,18,0 Chr08 58675465 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 58682147 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58686329 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr08 58693114 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr08 58718241 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 58727313 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 58727393 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr08 58728732 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58734046 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58734470 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 58738944 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 58738955 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 58738984 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 58738992 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr08 58742690 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 58742707 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 58742738 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.56;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr08 58742992 . A C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.37;MQ0=4;MQRankSum=0.736;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:57,6,0 Chr08 58742993 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.37;MQ0=4;MQRankSum=0.736;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:6:57,6,0 Chr08 58743019 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.37;MQ0=4;MQRankSum=0.736;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:7:6:57,6,0 Chr08 58743032 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=5;MQRankSum=0.736;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:57,6,0 Chr08 58743044 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.2019;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=5;MQRankSum=0.736;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:6:57,6,0 Chr08 58743051 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.50;MQ0=5;MQRankSum=0.736;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:57,6,0 Chr08 58743052 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.17;MQ0=5;MQRankSum=1.026;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,2:9:6:57,6,0 Chr08 58745928 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr08 58745967 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 58746731 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.69;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 58746735 . G T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.69;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr08 58746755 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.33;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr08 58746766 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.33;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 58746783 . T A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.33;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr08 58752571 . A G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.06;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr08 58752586 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.06;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr08 58752624 . C A 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.02;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr08 58774998 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58775025 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58780024 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58781696 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58782293 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr08 58783778 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 58786373 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr08 58786454 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr08 58792984 . C G 150.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:179,15,0 Chr08 58816734 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 58836193 . T A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr08 58840934 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr08 58842102 . G T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr08 58842104 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr08 58842170 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 58842491 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58842492 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58843886 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 58843889 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr08 58843908 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58843917 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58847262 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr08 58847269 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 58849415 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 58858044 . G A 141.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 58896456 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 58903334 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 58903348 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr08 58905286 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58908587 . G A 56.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 58983540 . C T 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr08 59017249 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 59017838 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 59018681 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 59018769 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 59025901 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr08 59031004 . A G 210.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:239,18,0 Chr08 59031071 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 59031996 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr08 59032613 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 59033584 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 59037953 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 59040472 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 59040496 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 59068486 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 59068880 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 59068930 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr08 59084971 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr08 59087597 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59101661 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr08 59103700 . C A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=9.08;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:119,0,205 Chr08 59104988 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59105034 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:71,0,29 Chr08 59105159 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr08 59106236 . T C 179.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr08 59145374 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 59163524 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr08 59200145 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:69,0,65 Chr08 59200200 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:72,0,66 Chr08 59223821 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59223879 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr08 59223920 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 59223922 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 59224474 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 59225407 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr08 59225418 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr08 59246653 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 59253946 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.04;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 59255028 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 59256009 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 59256075 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr08 59257046 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr08 59258214 . C A 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.278;QD=8.52;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:122,0,256 Chr08 59269537 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,173 Chr08 59269927 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr08 59269944 . T A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr08 59276552 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 59292065 . G T 199.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:228,18,0 Chr08 59306632 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:135,0,62 Chr08 59333228 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr08 59333570 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,173 Chr08 59338805 . G A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.24;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr08 59351292 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 59365545 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr08 59376440 . A C 97.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr08 59411054 . G C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr08 59412137 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr08 59412140 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr08 59412206 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr08 59413417 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59413732 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 59420378 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr08 59420673 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr08 59421298 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=24.07;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:124,9,0 Chr08 59423025 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59431250 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr08 59435075 . T A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr08 59437121 . C G 230.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.85;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:259,0,18 Chr08 59437122 . A G 201.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=25.23;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:21:230,0,21 Chr08 59442829 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr08 59459484 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr08 59464707 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,368 Chr08 59466708 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr08 59478932 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr08 59478955 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr08 59478966 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.17;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr08 59480388 . G C 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr08 59484712 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=21;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:21:56:56,0,609 Chr08 59485795 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59486129 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59492500 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:10:89:89,0,196 Chr08 59493772 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr08 59607329 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr08 59619183 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.969;DP=60;Dels=0.00;FS=2.331;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.456;QD=0.35;ReadPosRankSum=-3.832 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,6:60:49:49,0,2014 Chr08 59627201 . A T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:131,0,943 Chr08 59627287 . C A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;DP=32;Dels=0.00;FS=8.263;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.410;QD=4.37;ReadPosRankSum=-4.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:168,0,890 Chr08 59634867 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.588;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.632 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:108,0,371 Chr08 59648656 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=32;Dels=0.00;FS=17.432;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.89;MQ0=1;MQRankSum=1.208;QD=1.06;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:62:62,0,917 Chr09 43258 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.80;MQ0=2;MQRankSum=2.205;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,2:22:6:59,6,0 Chr09 45747 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 175249 . T C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=8.22;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:94:94,0,113 Chr09 202124 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.383;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.24;MQ0=0;MQRankSum=-1.568;QD=4.38;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:72:72,0,125 Chr09 202190 . A C 43.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 474029 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.09;MQ0=1;MQRankSum=2.404;QD=3.29;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:71:71,0,302 Chr09 569036 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 569641 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr09 603118 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,148 Chr09 799012 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 800383 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 801901 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.006;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.359;QD=0.78;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:54:54,0,1085 Chr09 803515 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 859524 . G T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.511;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.184;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:146,0,363 Chr09 859648 . C G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQ0=1;MQRankSum=0.720;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,138 Chr09 872410 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,148 Chr09 877798 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 922166 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr09 1024654 . G T 212.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=9.67;ReadPosRankSum=-3.856 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:241,0,498 Chr09 1027862 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 1031017 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 1037863 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 1066013 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.52;MQ0=0;MQRankSum=1.777;QD=1.77;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:60:60,0,450 Chr09 1066098 . C A 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;DP=62;Dels=0.00;FS=21.211;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.12;MQ0=0;MQRankSum=0.939;QD=1.92;ReadPosRankSum=-4.776 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,9:62:99:147,0,1882 Chr09 1110461 . T C 82.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.05;MQ0=0;QD=16.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:110,12,0 Chr09 1115783 . G A 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.42;MQ0=0;QD=7.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:74,9,0 Chr09 1137927 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 1148095 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 1163440 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:105,0,67 Chr09 1163631 . A T 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7323;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:377,27,0 Chr09 1221256 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 1241413 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,174 Chr09 1270129 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:100,0,61 Chr09 1272020 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=2.52;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:66:66,0,438 Chr09 1336007 . A T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=62;Dels=0.00;FS=14.128;HaplotypeScore=8.7683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQ0=0;MQRankSum=1.359;QD=0.98;ReadPosRankSum=-3.523 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,9:62:89:89,0,1444 Chr09 1364762 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.85;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr09 1434293 . T A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,137 Chr09 1445013 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.472;DP=75;Dels=0.00;FS=19.336;HaplotypeScore=1.8664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.111;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.918 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,7:75:50:50,0,2452 Chr09 1462606 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,303 Chr09 1519014 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 1519015 . A C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr09 1572849 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 1572865 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 1572875 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 1572879 . C A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 1572885 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 1572919 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 1572921 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 1572926 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 1572933 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr09 1592443 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.446;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.056;QD=1.04;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:71:71,0,1355 Chr09 1594514 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.295;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:63:63,0,901 Chr09 1657937 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.50;MQ0=0;MQRankSum=2.850;QD=3.46;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:94:94,0,449 Chr09 1659146 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95:95,0,98 Chr09 1659150 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:87:95,0,87 Chr09 1659179 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.47;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95:95,0,102 Chr09 1686134 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.07;MQ0=6;MQRankSum=1.849;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:62:62,0,158 Chr09 1706831 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 1722072 . T A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,250 Chr09 1724233 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:65,0,63 Chr09 1826314 . G A 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.42;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:122,0,175 Chr09 1885780 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,72 Chr09 1903154 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.49;MQ0=1;QD=23.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:121,9,0 Chr09 1917851 . T C 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=44.3930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.77;MQ0=3;MQRankSum=0.777;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.043 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:41:91:91,0,747 Chr09 1997787 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=9.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:75,0,67 Chr09 1997823 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:69:69,0,133 Chr09 1997829 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:69:69,0,136 Chr09 1997839 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:69:69,0,134 Chr09 1997845 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=1.7338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:69:69,0,128 Chr09 1997846 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:69:69,0,133 Chr09 2024930 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=14;Dels=0.00;FS=6.008;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=5.98;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:112,0,368 Chr09 2059878 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 2222954 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr09 2381098 . G T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;DP=44;Dels=0.00;FS=2.458;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.251;QD=2.43;ReadPosRankSum=-3.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:135,0,1370 Chr09 2414111 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,150 Chr09 2465347 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 2482729 . G T 201.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;DP=17;Dels=0.00;FS=13.554;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.342;QD=11.87;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:17:99:230,0,347 Chr09 2483125 . G T 167.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.921;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=6.99;ReadPosRankSum=-3.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:196,0,600 Chr09 2642794 . A G 56.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.24;MQ0=0;QD=14.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:84,9,0 Chr09 2801271 . A T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;DP=17;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,516 Chr09 2801357 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 2917098 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 2921238 . A T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.500;DP=71;Dels=0.00;FS=20.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.100;QD=0.93;ReadPosRankSum=-4.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,8:71:94:94,0,2289 Chr09 2995867 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:100,0,104 Chr09 3115022 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=1;MQRankSum=-3.369;QD=1.16;ReadPosRankSum=-3.369 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:55:55,0,623 Chr09 3115118 . C A 112.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:140,12,0 Chr09 3151024 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.85;MQ0=0;QD=11.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:75,6,0 Chr09 3155031 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr09 3179125 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 3179130 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 3179137 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 3221310 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 3226238 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 3250377 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 3262949 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 3357297 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 3513167 . G T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.25;MQ0=0;MQRankSum=1.849;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:26:100,0,26 Chr09 3573055 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 3573077 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.67;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 3600758 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 3842709 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:70,6,0 Chr09 3852910 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,251 Chr09 3853482 . C G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 3859257 . G C 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.154;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.110;QD=5.18;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:106,0,396 Chr09 3859351 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 3970808 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 4029236 . A G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr09 4044434 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.53;MQ0=0;QD=9.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:77,6,0 Chr09 4114283 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 4165491 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,246 Chr09 4167072 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 4239899 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 4286003 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr09 4294204 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.48;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr09 4302845 . A G 69.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.46;MQ0=1;QD=13.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:97,12,0 Chr09 4302874 . G A 94.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.29;MQ0=1;QD=15.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:123,15,0 Chr09 4302878 . G A 94.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.29;MQ0=1;QD=15.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15:123,15,0 Chr09 4302934 . A G 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.70;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr09 4359929 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 4386136 . T C 102.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.26;MQ0=0;QD=8.50 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:12:130,12,0 Chr09 4457229 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.10;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr09 4457262 . C T 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.37;MQ0=0;QD=17.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:98,9,0 Chr09 4457273 . T C 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.37;MQ0=0;QD=17.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:99,9,0 Chr09 4523533 . G A 180.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=0;QD=16.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:11:21:209,21,0 Chr09 4523536 . C T 265.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.17;MQ0=0;QD=24.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:27:294,27,0 Chr09 4531354 . G T 31.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.59;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:22:60,0,22 Chr09 4592121 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.01;MQ0=4;MQRankSum=1.589;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,4:12:6:77,6,0 Chr09 4600483 . C A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.75;MQ0=6;QD=4.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:60,6,0 Chr09 4667664 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 4894083 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 5050223 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.55;MQ0=2;MQRankSum=0.950;QD=1.75;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:65:65,0,184 Chr09 5056897 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 5088924 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.537;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:62:62,0,75 Chr09 5088925 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.537;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:62:62,0,75 Chr09 5088959 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.52;MQ0=1;MQRankSum=-1.537;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:62:62,0,75 Chr09 5233287 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 5264727 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 5302897 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr09 5304958 . C A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:121,0,140 Chr09 5340163 . G T 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.226;DP=53;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.51;MQ0=5;MQRankSum=-4.607;QD=3.37;ReadPosRankSum=-5.155 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,13:53:99:207,0,1134 Chr09 5340218 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.107;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.06;MQ0=2;MQRankSum=-3.110;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:19:87:87,0,303 Chr09 5348885 . G T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.052;QD=2.87;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:146,0,1274 Chr09 5518139 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,147 Chr09 5610255 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 5888992 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.956;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,177 Chr09 5931488 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.64;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr09 5951410 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 5953069 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,106 Chr09 5980304 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,146 Chr09 6078859 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr09 6100694 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.307;QD=10.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:127,0,166 Chr09 6103130 . T A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.546;QD=5.68;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,247 Chr09 6104873 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 6104955 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=29;Dels=0.00;FS=18.572;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=1.65;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:76:76,0,839 Chr09 6142541 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 6149914 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,262 Chr09 6263134 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,104 Chr09 6267644 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.15;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr09 6276853 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:100,0,68 Chr09 6341223 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 6359441 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 6361698 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr09 6366362 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:64,0,62 Chr09 6413859 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:65,0,59 Chr09 6423192 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 6423816 . A T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;DP=13;Dels=0.00;FS=3.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.386;QD=6.37;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:111,0,304 Chr09 6457800 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;DP=45;Dels=0.00;FS=8.417;HaplotypeScore=4.9982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=0.71;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:60:60,0,1460 Chr09 6607918 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr09 6612154 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 6636333 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 6651686 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 6664503 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.162;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.082;QD=2.62;ReadPosRankSum=-4.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:141,0,1351 Chr09 6664596 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr09 6687103 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 6713472 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr09 6713480 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr09 6717479 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 6771922 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 6772681 . G T 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:304,24,0 Chr09 6829174 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,215 Chr09 6860497 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:66,0,29 Chr09 7160407 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,70 Chr09 7163348 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,176 Chr09 7253426 . G T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:110,0,29 Chr09 7570285 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 7571109 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,138 Chr09 7586747 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,108 Chr09 7599612 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.031;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:109,0,826 Chr09 7604750 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,255 Chr09 7604843 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,248 Chr09 7627834 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr09 7750920 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;DP=16;Dels=0.00;FS=10.532;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:105,0,410 Chr09 7868982 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.131;DP=56;Dels=0.00;FS=7.665;HaplotypeScore=7.9971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.793;QD=1.37;ReadPosRankSum=-4.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,7:56:99:105,0,1773 Chr09 7900313 . A T 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr09 7935482 . C A 196.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;DP=29;Dels=0.00;FS=15.352;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.331;QD=6.79;ReadPosRankSum=-3.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:29:99:225,0,716 Chr09 7959227 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 8022786 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,108 Chr09 8028796 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.799;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,620 Chr09 8062265 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr09 8094417 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:120,0,222 Chr09 8111320 . A C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.23;MQ0=39;QD=1.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,42:42:9:95,9,0 Chr09 8111350 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.23;MQ0=39;QD=1.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:9:95,9,0 Chr09 8111366 . A G 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.15;MQ0=30;QD=2.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:9:95,9,0 Chr09 8111370 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.81;MQ0=7;QD=6.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:95,9,0 Chr09 8111377 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.81;MQ0=7;QD=6.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:9:95,9,0 Chr09 8112421 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8112428 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8112431 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8112434 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8112442 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8112462 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 8147348 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 8231911 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.009;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=0.95;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:49:49,0,693 Chr09 8371587 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 8393282 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 8395130 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 8395140 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 8395152 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 8460333 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 8686873 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;DP=72;Dels=0.00;FS=18.748;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.418;QD=0.34;ReadPosRankSum=-4.334 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:65,7:72:53:53,0,2346 Chr09 8712414 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,109 Chr09 8727578 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.276;QD=1.84;ReadPosRankSum=-3.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,5:33:89:89,0,1041 Chr09 8777707 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 8781838 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 8781934 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 8826570 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 9064406 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;DP=17;Dels=0.00;FS=15.315;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.063;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,513 Chr09 9154353 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.270;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.052;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:97:97,0,1007 Chr09 9174800 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.203;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.275;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:62:62,0,978 Chr09 9174920 . C A 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.915;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=2.73;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:143,0,1294 Chr09 9190248 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,425 Chr09 9264179 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,59 Chr09 9329275 . C A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr09 9425492 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.109;DP=13;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.555;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:13:77:77,0,321 Chr09 9428406 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 9609376 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,257 Chr09 9790049 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.946;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.153;QD=1.19;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:64:64,0,896 Chr09 9806421 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:81:81,0,229 Chr09 9824324 . T C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.70;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr09 9887490 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr09 9928540 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr09 9964027 . G T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.542;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.039;QD=6.61;ReadPosRankSum=-3.542 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:99:167,0,553 Chr09 9978327 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 9986556 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 10027672 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 10027769 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,221 Chr09 10032659 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr09 10034993 . G T 217.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=27.15;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:10:245,0,10 Chr09 10042605 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 10171110 . T G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 10220464 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:83:83,0,173 Chr09 10374848 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 10390547 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr09 10435717 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=20;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=1.19;ReadPosRankSum=-1.905 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:52:52,0,603 Chr09 10440296 . G T 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr09 10483029 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 10502363 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr09 10504051 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,254 Chr09 10518181 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,275 Chr09 10527631 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 10530192 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,270 Chr09 10561030 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 10578593 . C A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:138,0,24 Chr09 10591469 . A T 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.025;DP=42;Dels=0.00;FS=14.183;HaplotypeScore=2.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.304;QD=2.76;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:144,0,1286 Chr09 10682574 . G T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.367;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.151;QD=8.28;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:169,0,400 Chr09 10791842 . G T 177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.525;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.070;QD=8.08;ReadPosRankSum=-3.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,7:22:99:206,0,550 Chr09 10888926 . G T 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:91:131,0,91 Chr09 10889012 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.837;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.214;QD=1.29;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:67:67,0,974 Chr09 10926361 . G T 39.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 11172307 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,141 Chr09 11172548 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 11214131 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr09 11226643 . G T 48.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 11415334 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:67,0,57 Chr09 11459514 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 11481909 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 11482004 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,139 Chr09 11506971 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.179;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:112,0,841 Chr09 11569101 . C T 94.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.08;MQ0=0;QD=11.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:15:123,15,0 Chr09 11578358 . G T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.964;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.135;QD=2.46;ReadPosRankSum=-4.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:134,0,1346 Chr09 11585036 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 11599492 . T C 135.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.78;MQ0=0;QD=13.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:15:164,15,0 Chr09 11628827 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr09 11628843 . T A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:103,0,132 Chr09 11628871 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:89:89,0,234 Chr09 11628879 . G A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=20.792;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.214;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,243 Chr09 11629679 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=23.32;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:121,9,0 Chr09 11642317 . G T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=5.70;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:108,0,360 Chr09 11686936 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,221 Chr09 11712089 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:32:68,0,32 Chr09 11715139 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 11733449 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 11735030 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.74;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr09 11753348 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:56:56,0,637 Chr09 11816078 . G T 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.659;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.668;QD=4.99;ReadPosRankSum=-3.659 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:99:153,0,703 Chr09 11852239 . G A 2432.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.02;FS=0.000;HaplotypeScore=7.6814;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.68;MQ0=0;QD=24.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:99:2461,184,0 Chr09 11885137 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 11896438 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 11900097 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.06;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,108 Chr09 11972590 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr09 12005606 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 12019189 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,140 Chr09 12120992 . T C 210.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;DP=13;Dels=0.00;FS=16.782;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.369;QD=16.21;ReadPosRankSum=2.777 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:239,0,193 Chr09 12121009 . C G 200.81 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 12198029 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 12380746 . C A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.529;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.529;QD=4.34;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,460 Chr09 12402260 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 12448613 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:67,0,58 Chr09 12509043 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 12522949 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,139 Chr09 12538395 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 12539795 . C T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.196;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=12.7425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.524;QD=3.06;ReadPosRankSum=-3.541 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:120,0,345 Chr09 12558666 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.855;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.977;QD=1.80;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:102,0,1313 Chr09 12577773 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,87 Chr09 12579062 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.06;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.19;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:31:65,0,31 Chr09 12595879 . G T 280.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:309,24,0 Chr09 12595959 . C A 189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.931;DP=30;Dels=0.00;FS=8.435;HaplotypeScore=1.9931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.492;QD=6.33;ReadPosRankSum=-4.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,8:30:99:218,0,799 Chr09 12672119 . G T 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.133;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.037;QD=6.17;ReadPosRankSum=-3.575 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:164,0,584 Chr09 12672215 . A G 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:59:136,0,59 Chr09 12690914 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:5:29:100,0,29 Chr09 12691010 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;DP=32;Dels=0.00;FS=8.572;HaplotypeScore=1.7335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.313;QD=1.02;ReadPosRankSum=-2.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:61:61,0,970 Chr09 12704973 . A C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr09 12704975 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr09 12834480 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,100 Chr09 12865470 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,263 Chr09 12882423 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,175 Chr09 13111106 . C A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.443;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.155;QD=1.32;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:77:77,0,1202 Chr09 13161520 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr09 13164305 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 13182948 . C A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:134,0,64 Chr09 13211322 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,144 Chr09 13262614 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 13303649 . G T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=16;Dels=0.00;FS=2.933;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=7.11;ReadPosRankSum=-1.699 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:142,0,365 Chr09 13378923 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr09 13378943 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 13378952 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 13378970 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr09 13378975 . C T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr09 13380649 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 13381744 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 13395084 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 13395107 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 13395115 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 13402092 . T A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.364;QD=2.73;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:140,0,1274 Chr09 13421727 . G T 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr09 13427570 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 13447017 . T A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.157;DP=13;Dels=0.00;FS=6.421;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=6.21;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:109,0,311 Chr09 13448358 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr09 13449274 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.899;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.68;ReadPosRankSum=-3.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:87:87,0,1106 Chr09 13462705 . C A 175.74 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.11;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:6:203,0,6 Chr09 13497602 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr09 13499245 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr09 13499435 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 13502680 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 13503002 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 13503062 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 13503658 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 13503672 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 13503970 . C A 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr09 13507086 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.023;DP=39;Dels=0.00;FS=13.341;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.820;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.455 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:39:75:75,0,1215 Chr09 13507182 . C A 191.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=28;Dels=0.00;FS=2.708;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.178;QD=6.85;ReadPosRankSum=-3.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:220,0,721 Chr09 13510399 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.240;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.24;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,13:14:6:58,6,0 Chr09 13510438 . C G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.24;MQ0=0;QD=2.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:58,6,0 Chr09 13535566 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 13547149 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr09 13590795 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 13616225 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:55:55,0,259 Chr09 13643270 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 13673963 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr09 13686048 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 13739748 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 13743945 . G C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.53;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:29:104,0,29 Chr09 13830137 . G T 115.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:144,0,26 Chr09 13957423 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;DP=16;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:99,0,431 Chr09 13998957 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=14.564;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,361 Chr09 14060568 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.404;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:72:72,0,1064 Chr09 14071405 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.164;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.511;QD=0.81;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:63:63,0,1420 Chr09 14154787 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:100,0,67 Chr09 14208173 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=18.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.063;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,527 Chr09 14208270 . C A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,274 Chr09 14230650 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr09 14246010 . A C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.227;DP=15;Dels=0.00;FS=2.869;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:81:81,0,438 Chr09 14294008 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 14299056 . A T 68.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 14325141 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 14325144 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 14325172 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 14348751 . G T 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:165,0,127 Chr09 14348835 . C A 94.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.938;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.65;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:68:68,0,420 Chr09 14513177 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,140 Chr09 14519297 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,101 Chr09 14519380 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,126 Chr09 14538269 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 14645914 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.14;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:74:95,0,74 Chr09 14671199 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 14691084 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.590;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.094;QD=2.88;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:106,0,803 Chr09 14744829 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;DP=19;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.57;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:58:58,0,553 Chr09 14792962 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.053;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:117,0,740 Chr09 14793038 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.284;QD=2.56;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:87:87,0,681 Chr09 14849231 . A T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.97;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:132,0,139 Chr09 14849312 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 14967275 . A T 40.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:69,0,21 Chr09 15039007 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,91 Chr09 15058139 . A T 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=15.09;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:164,0,137 Chr09 15058235 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;DP=59;Dels=0.00;FS=14.653;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.277;QD=1.18;ReadPosRankSum=-4.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,7:59:98:98,0,1824 Chr09 15069656 . C A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.361;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=5.78;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:138,0,469 Chr09 15170195 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 15182546 . T A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=6.14;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:108,0,308 Chr09 15286358 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,196 Chr09 15295340 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.620;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.085;QD=3.21;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:70:70,0,372 Chr09 15340046 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr09 15367894 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr09 15431660 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 15460278 . C A 395.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:424,33,0 Chr09 15611124 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,141 Chr09 15634044 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,104 Chr09 15634074 . T A 71.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.20;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:6:12:157,12,0 Chr09 15809351 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 15809604 . A T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.472;QD=2.54;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:102,0,869 Chr09 15809700 . C A 169.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=21.23;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:18:198,0,18 Chr09 15832141 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 15894796 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.953 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:57:57,0,641 Chr09 15895086 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,227 Chr09 15899655 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 15899752 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.72;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:61:61,0,603 Chr09 15900554 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=16;Dels=0.00;FS=4.559;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.404;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.269 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:67:67,0,471 Chr09 15907124 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:108,0,58 Chr09 15912880 . G T 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr09 15916609 . G T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=6.75;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,216 Chr09 15916706 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:100,0,67 Chr09 15926617 . T A 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.221;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:95:168,0,95 Chr09 15975729 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-1.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,473 Chr09 16048569 . C A 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.352;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.352;QD=9.10;ReadPosRankSum=-3.367 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:183,0,373 Chr09 16070992 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,129 Chr09 16071628 . G T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;DP=26;Dels=0.00;FS=8.909;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.586;QD=3.18;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:111,0,739 Chr09 16188730 . T G 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.454;QD=4.75;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:128,0,589 Chr09 16194901 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr09 16218022 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr09 16219989 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQ0=0;MQRankSum=-0.538;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,491 Chr09 16276938 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,135 Chr09 16287647 . C T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.032;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.236;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:97:97,0,606 Chr09 16365030 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr09 16365039 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr09 16365054 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr09 16393549 . C T 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;DP=15;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.041;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.306 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:160,0,367 Chr09 16393550 . A T 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;DP=15;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:157,0,358 Chr09 16407330 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.292;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.168;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:59:59,0,588 Chr09 16479168 . T A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.20;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:93:93,0,220 Chr09 16506737 . T G 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.214;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:94:94,0,261 Chr09 16533572 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr09 16552119 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 16616385 . G A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr09 16616387 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr09 16617427 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr09 16623824 . G C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:72,0,68 Chr09 16702579 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 16708772 . G T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,99 Chr09 16708858 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,295 Chr09 16816199 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.409;QD=1.07;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:71:71,0,1309 Chr09 16853518 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.9901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.675;QD=1.84;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:76:76,0,816 Chr09 16853538 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.052;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:59:59,0,717 Chr09 16854641 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 16854661 . G A 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=24.22;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:59:222,0,59 Chr09 16890449 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 16890465 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 16890468 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 16909763 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:67,0,31 Chr09 16953458 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 16967788 . C T 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=20.80;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:27:153,0,27 Chr09 16978435 . A G 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr09 16997709 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.231;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:114,0,332 Chr09 17032010 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 17033425 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 17053455 . G T 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr09 17053528 . T C 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 Chr09 17053536 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,183 Chr09 17065093 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 17066572 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 17066665 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,109 Chr09 17072133 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 17072172 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 17115834 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 17115930 . C A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.760;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=6.21;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:140,0,441 Chr09 17117759 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 17144830 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 17144890 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 17185945 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 17194239 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 17194557 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,102 Chr09 17194654 . C A 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.326;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.082;QD=3.77;ReadPosRankSum=-4.359 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,8:41:99:183,0,1231 Chr09 17208660 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,173 Chr09 17208752 . C A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr09 17240152 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 17240162 . A C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 17254194 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 17254198 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 17264740 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 17274067 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 17286368 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 17288210 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,134 Chr09 17303714 . T C 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr09 17337424 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:67:101,0,67 Chr09 17401029 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:56:56,0,204 Chr09 17436868 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.22;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr09 17499017 . T A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr09 17507166 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.552;DP=51;Dels=0.00;FS=4.804;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.53;MQ0=0;MQRankSum=3.230;QD=0.98;ReadPosRankSum=-1.272 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,6:51:78:78,0,1497 Chr09 17543947 . G T 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:67,0,27 Chr09 17558263 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 17558332 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 17571343 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 17572656 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 17572671 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,101 Chr09 17572758 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.404;DP=12;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.925 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,334 Chr09 17597346 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:99,0,67 Chr09 17603320 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 17603360 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 17604741 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 17611289 . T G 419.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:33:448,33,0 Chr09 17616362 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 17649465 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr09 17654295 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr09 17659731 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 17661139 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 17661425 . A G 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr09 17670712 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 17671689 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr09 17671800 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,104 Chr09 17671872 . T G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr09 17671878 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr09 17684332 . C G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr09 17684851 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 17697961 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr09 17765935 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 17771465 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 17847537 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 17902452 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.87;MQ0=2;QD=13.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:81,6,0 Chr09 17922094 . T C 202.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:231,18,0 Chr09 17922136 . G T 220.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:249,18,0 Chr09 17982807 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr09 18121225 . G T 44.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 18341221 . G T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:81:81,0,257 Chr09 18365157 . T A 110.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:20:139,0,20 Chr09 18367503 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:51:51,0,601 Chr09 18370741 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,221 Chr09 18375843 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 18385709 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 18488984 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,304 Chr09 18490885 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 18711968 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,189 Chr09 18762921 . G T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.410;QD=4.21;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:125,0,644 Chr09 18829463 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:71:71,0,379 Chr09 18994245 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,66 Chr09 19002473 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 19047933 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.648;QD=1.15;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:72:72,0,1243 Chr09 19049101 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 19063869 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.435 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,614 Chr09 19159858 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.288;DP=30;Dels=0.00;FS=13.027;HaplotypeScore=3.9986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.458;QD=1.26;ReadPosRankSum=-2.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:66:66,0,950 Chr09 19160464 . T A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.217;QD=3.40;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:99:120,0,751 Chr09 19242605 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:101,0,68 Chr09 19246876 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 19246913 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 19320134 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 19502456 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 19504714 . T G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,93 Chr09 19504716 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:57:57,0,100 Chr09 19519460 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 19544173 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:64,0,55 Chr09 19544254 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;DP=32;Dels=0.00;FS=2.485;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.868;QD=2.12;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:96:96,0,997 Chr09 19679366 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr09 19718568 . G T 35.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=11.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:74,6,0 Chr09 19721389 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.606;DP=17;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=6.87;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:17:99:145,0,392 Chr09 19759568 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 19766215 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 19766234 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 19766268 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 19766272 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr09 19766273 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 19766280 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.34;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 19786577 . C A 115.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.151;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=2.76;ReadPosRankSum=-2.970 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:144,0,1311 Chr09 19786686 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.345;QD=1.17;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:39:74:74,0,1243 Chr09 19786794 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:100,0,87 Chr09 19795105 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 19801144 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 19875388 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,278 Chr09 19875477 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.741;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:21:52:52,0,624 Chr09 19882746 . C A 151.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:180,0,22 Chr09 19938794 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.203;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.190;QD=1.19;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:64:64,0,977 Chr09 20034288 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 20054709 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.166;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.363;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:97:97,0,1003 Chr09 20093112 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 20151817 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 20324344 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 20324441 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr09 20401253 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 20421653 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr09 20428236 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 20553310 . A C 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:129,0,58 Chr09 20594451 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr09 20594458 . T G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr09 20594508 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr09 20641037 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,160 Chr09 20754747 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;DP=47;Dels=0.00;FS=16.588;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.546;QD=1.21;ReadPosRankSum=-3.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,6:47:85:85,0,1412 Chr09 20757496 . A T 73.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:102,0,22 Chr09 20763788 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.311;QD=2.77;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:67:67,0,403 Chr09 20800429 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,253 Chr09 20884452 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr09 20917062 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.029;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.328 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:32:60:60,0,942 Chr09 20941071 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,103 Chr09 20941504 . C A 104.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:133,0,23 Chr09 21127542 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 21283091 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 21283188 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;DP=13;Dels=0.00;FS=18.543;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.254;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,368 Chr09 21367641 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.05;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:71:71,0,367 Chr09 21368072 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:76:76,0,317 Chr09 21371229 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 21378331 . T A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:91:91,0,198 Chr09 21382886 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.139;QD=5.67;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:136,0,514 Chr09 21487477 . C A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 21558959 . G T 35.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:64,0,20 Chr09 21701563 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,262 Chr09 21760843 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:101,0,29 Chr09 21761882 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:136,0,64 Chr09 21783545 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,143 Chr09 21783641 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.650;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:97:97,0,542 Chr09 21839184 . C A 164.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.420;DP=25;Dels=0.00;FS=12.418;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.120;QD=6.59;ReadPosRankSum=-3.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:193,0,659 Chr09 21864024 . G T 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.524;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:154,0,286 Chr09 21907509 . G T 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.093;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.712;QD=3.04;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:150,0,1233 Chr09 21928597 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,180 Chr09 21959688 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:87:87,0,218 Chr09 21990447 . C A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=17;Dels=0.00;FS=2.884;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.580;QD=6.63;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:141,0,434 Chr09 22181844 . C G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,146 Chr09 22236370 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 22277142 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr09 22339715 . T A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:98:98,0,104 Chr09 22342914 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,141 Chr09 22432292 . A T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.566;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.136;QD=0.48;ReadPosRankSum=-3.536 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,6:58:56:56,0,1884 Chr09 22460231 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 22548256 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 22767935 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 22768022 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 22803651 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 22827036 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=1.98;ReadPosRankSum=-2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,343 Chr09 22867791 . T C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.55;MQ0=0;QD=10.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:71,9,0 Chr09 22867814 . T C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.55;MQ0=0;QD=10.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:71,9,0 Chr09 22867826 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr09 22867829 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr09 22867831 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr09 22867836 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr09 22867845 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr09 22881583 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 22883530 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr09 22981105 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,65 Chr09 23011493 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 23011544 . T C 156.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:185,0,24 Chr09 23100670 . A C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.31;MQ0=1;QD=1.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,54:54:9:94,9,0 Chr09 23100871 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.46;MQ0=1;QD=3.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:6:84,6,0 Chr09 23161825 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,137 Chr09 23165009 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr09 23283525 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=5.09;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:74:74,0,215 Chr09 23322910 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.074;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:50:50,0,1123 Chr09 23361773 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:50,0,33 Chr09 23385879 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 23385975 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.34;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:120,0,254 Chr09 23400845 . G T 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.545;QD=13.84;ReadPosRankSum=-3.204 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:99:222,0,237 Chr09 23418455 . C T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;DP=40;Dels=0.00;FS=1.452;HaplotypeScore=17.4561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.25;MQ0=3;MQRankSum=-3.745;QD=2.17;ReadPosRankSum=1.111 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,12:40:99:115,0,873 Chr09 23418482 . C T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;DP=34;Dels=0.00;FS=2.484;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.76;MQ0=2;MQRankSum=-2.921;QD=3.05;ReadPosRankSum=2.245 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,8:34:99:132,0,886 Chr09 23523215 . G T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr09 23594193 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,172 Chr09 23609708 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr09 23611883 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 23623967 . C A 102.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;DP=50;Dels=0.00;FS=2.443;HaplotypeScore=1.7883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.02;MQ0=4;MQRankSum=2.169;QD=2.06;ReadPosRankSum=-3.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,6:50:99:131,0,918 Chr09 23690834 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 23747982 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 23823276 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.664;QD=1.44;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:70:70,0,897 Chr09 23907491 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:50,0,106 Chr09 23933094 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,147 Chr09 23987300 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr09 23997821 . G T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.936;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.873;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:38:99:142,0,1118 Chr09 24044495 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 24125144 . T C 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:61,0,28 Chr09 24125157 . T C 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:57,0,28 Chr09 24154096 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,143 Chr09 24217205 . C A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.786;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.871;QD=1.82;ReadPosRankSum=-4.214 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,7:50:99:119,0,1524 Chr09 24250861 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=11.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,103 Chr09 24335190 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.694;DP=20;Dels=0.00;FS=2.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,621 Chr09 24368094 . A T 239.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.24;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:268,21,0 Chr09 24368532 . A T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.221;QD=1.23;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:64:64,0,838 Chr09 24377485 . T A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.433;QD=2.32;ReadPosRankSum=-3.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:99:114,0,1132 Chr09 24460041 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 24516084 . C T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.75;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 24516098 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.75;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 24516100 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.75;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 24516126 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.75;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 24516166 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.75;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr09 24545222 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.375;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.389;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:77:77,0,1178 Chr09 24545952 . C G 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.350;QD=3.57;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,536 Chr09 24661450 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 24673042 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,147 Chr09 24733786 . G T 148.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=18;Dels=0.00;FS=18.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=8.26;ReadPosRankSum=-3.419 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:177,0,423 Chr09 24799173 . C G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.69;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:88,0,61 Chr09 24824492 . G T 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.518;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.693;QD=4.75;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:128,0,585 Chr09 24964735 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,103 Chr09 25062365 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,255 Chr09 25181034 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.526;DP=15;Dels=0.00;FS=13.570;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=2.52;ReadPosRankSum=-2.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:66:66,0,445 Chr09 25270352 . C T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,183 Chr09 25375205 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 25389293 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,176 Chr09 25389477 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,134 Chr09 25521897 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:51:51,0,81 Chr09 25546910 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,142 Chr09 25620451 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 25631373 . T C 137.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=17;Dels=0.00;FS=2.246;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.06;MQ0=1;MQRankSum=-3.172;QD=8.10;ReadPosRankSum=2.266 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:17:99:166,0,171 Chr09 25633528 . A C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr09 25633605 . A C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr09 25638469 . A G 80.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:109,0,26 Chr09 25686209 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 25686221 . T A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 25805710 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr09 25820074 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 25870112 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr09 26065734 . T G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 26073014 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.599;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.063;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:68:68,0,1319 Chr09 26127279 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,93 Chr09 26140458 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.946;DP=82;Dels=0.00;FS=17.366;HaplotypeScore=3.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.023;QD=0.36;ReadPosRankSum=-4.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,8:82:58:58,0,2685 Chr09 26154028 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr09 26161115 . G C 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:92:92,0,130 Chr09 26306036 . A G 109.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:137,12,0 Chr09 26306052 . A G 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr09 26306055 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.76;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr09 26358207 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 26501279 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.19;MQ0=1;MQRankSum=-1.495;QD=2.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,171 Chr09 26582553 . C A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr09 26615574 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:62,0,59 Chr09 26623888 . G T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;DP=51;Dels=0.00;FS=10.603;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.028;QD=1.76;ReadPosRankSum=-4.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,7:51:99:118,0,1579 Chr09 26747659 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:65,0,31 Chr09 26844745 . A T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr09 26844841 . C A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:135,0,64 Chr09 26924740 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.270;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.34;MQ0=0;MQRankSum=2.073;QD=2.29;ReadPosRankSum=-2.270 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,2:13:6:57,6,0 Chr09 27033811 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,177 Chr09 27043901 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 27046536 . C A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr09 27048955 . C A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:133,0,100 Chr09 27106256 . A T 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;DP=32;Dels=0.00;FS=21.676;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=4.59;ReadPosRankSum=-4.011 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:175,0,864 Chr09 27118800 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 27122083 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 27157814 . G T 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;DP=36;Dels=0.00;FS=8.105;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.240;QD=3.85;ReadPosRankSum=-4.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,7:36:99:167,0,1066 Chr09 27268722 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 27271490 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 27272720 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.604;QD=1.64;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:71:71,0,821 Chr09 27272813 . T A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:57:130,0,57 Chr09 27273868 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,105 Chr09 27283767 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 27352935 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=4.76;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:52:52,0,104 Chr09 27391009 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 27402491 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.117;QD=0.88;ReadPosRankSum=-2.680 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:42:65:65,0,1331 Chr09 27433831 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 27544387 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:63:126,0,63 Chr09 27607977 . C A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.077;QD=6.91;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:118,0,278 Chr09 27642223 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,204 Chr09 27642657 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 27642826 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 27664833 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 27689229 . T A 1230.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.02 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,32:32:96:1259,96,0 Chr09 27689278 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.196;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.31;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:78:78,0,1234 Chr09 27746042 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 27761208 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 27792174 . C A 107.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:6:26:136,0,26 Chr09 27918134 . G T 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:102,0,27 Chr09 27966650 . G T 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.811;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.889;QD=6.95;ReadPosRankSum=-3.811 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,7:24:99:195,0,620 Chr09 27966736 . C A 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=3.522;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=14.53;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:159,0,137 Chr09 28017362 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr09 28055946 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr09 28187789 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;DP=58;Dels=0.00;FS=14.652;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.719;QD=1.12;ReadPosRankSum=-4.273 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:51,7:58:93:93,0,1752 Chr09 28196681 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;DP=113;Dels=0.00;FS=1.277;HaplotypeScore=263.8567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQ0=0;MQRankSum=0.955;QD=0.19;ReadPosRankSum=-2.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:103,10:113:50:50,0,3811 Chr09 28271728 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,69 Chr09 28326789 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr09 28331654 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr09 28331676 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr09 28373874 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 28374992 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 28389960 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr09 28389985 . T A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr09 28400702 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 28400722 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 28419525 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 28419545 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 28419639 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 28422082 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 28422110 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 28429143 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 28429894 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 28429907 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 28435426 . T A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 28444937 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 28444962 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 28444963 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 28448004 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 28468688 . C T 129.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.18;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr09 28578153 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,172 Chr09 28578856 . G T 196.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:225,18,0 Chr09 28578858 . T G 190.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:219,18,0 Chr09 28614900 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 28631474 . G A 84.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr09 29423234 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.484;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.182;QD=0.75;ReadPosRankSum=-3.972 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,6:54:69:69,0,1684 Chr09 29449998 . C A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;DP=23;Dels=0.00;FS=9.054;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.665;QD=5.77;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,6:23:99:161,0,601 Chr09 29497980 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 29500470 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr09 29545137 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr09 29553130 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 29555030 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 29702622 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr09 29735802 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 29740028 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.471;DP=30;Dels=0.00;FS=2.542;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.519;QD=1.03;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:59:59,0,944 Chr09 29793997 . C A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.228;DP=57;Dels=0.00;FS=33.516;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.701;QD=1.93;ReadPosRankSum=-4.514 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,8:57:99:138,0,1828 Chr09 29856787 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:105,0,444 Chr09 29931880 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 29931963 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 30003564 . C A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.718;QD=5.32;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:108,0,400 Chr09 30115570 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,143 Chr09 30175167 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr09 30184394 . C A 56.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:85,0,27 Chr09 30189846 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.54;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:20:59:59,0,601 Chr09 30317651 . G T 37.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 30419234 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 30419267 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 30419285 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 30419292 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 30427168 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr09 30427196 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr09 30427216 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 30427240 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 30427252 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr09 30441625 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 30487665 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,216 Chr09 30487684 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,227 Chr09 30487697 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,221 Chr09 30488078 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 30495524 . C G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr09 30501717 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=0;QD=3.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:55,6,0 Chr09 30503408 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 30504205 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 30504926 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr09 30541081 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 30561274 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 30623412 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,169 Chr09 30659457 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;DP=27;Dels=0.00;FS=21.439;HaplotypeScore=3.0436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQ0=0;MQRankSum=0.853;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,755 Chr09 30660580 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr09 30660595 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr09 30662002 . A G 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr09 30668053 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,98 Chr09 30694878 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 30698232 . G A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=15.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:135,0,59 Chr09 30698392 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 30718739 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 30727981 . G A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:107,0,66 Chr09 30732027 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 30737680 . A T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr09 30762475 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr09 30762478 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr09 30821134 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,107 Chr09 30831867 . A G 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.421;QD=11.97;ReadPosRankSum=2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:124,0,134 Chr09 30838956 . T G 81.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:110,0,19 Chr09 30841123 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 30843718 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 30854505 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 30857120 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 30858467 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr09 30892113 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr09 30920532 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 30929011 . A C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr09 30929057 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 30929058 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr09 30987223 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr09 30989668 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 31031334 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr09 31169684 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 31169702 . A C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 31169704 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 31169733 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 31169740 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr09 31169764 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.29;MQ0=0;QD=2.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:62,6,0 Chr09 31170100 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.16;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr09 31187482 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr09 31187510 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:68,0,67 Chr09 31187516 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:70,0,65 Chr09 31210459 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 31238723 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 31272343 . G A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:135,0,62 Chr09 31273751 . C G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr09 31276005 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 31280971 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr09 31280980 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr09 31280984 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:59,0,33 Chr09 31334307 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 31358526 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 31358537 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 31419365 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 31426338 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,135 Chr09 31426414 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,151 Chr09 31430805 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,72 Chr09 31442560 . A T 67.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=16.95;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:96,0,25 Chr09 31453801 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 31467648 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,103 Chr09 31497446 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.57;MQ0=2;QD=16.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:127,9,0 Chr09 31497468 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.57;MQ0=2;QD=15.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:121,9,0 Chr09 31497482 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 31533597 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 31539256 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 31543227 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr09 31543400 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 31589123 . T A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,112 Chr09 31663942 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 31676978 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 31677017 . T G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 31681502 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 31681518 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 31681593 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 31710620 . T G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.530;DP=35;Dels=0.00;FS=32.138;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=0.68;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:52:52,0,1179 Chr09 31760138 . G A 233.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=29.23;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:17:262,0,17 Chr09 31770033 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.56;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 31775085 . T G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=8.96;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:82:82,0,94 Chr09 31775094 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:60,0,32 Chr09 31797388 . G T 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=15;Dels=0.00;FS=21.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.551;QD=7.78;ReadPosRankSum=-2.756 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:145,0,360 Chr09 31820960 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr09 31924687 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr09 31964066 . C T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.26;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=15.11;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:134,0,99 Chr09 31964100 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,131 Chr09 31973182 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.71;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:30:68,0,30 Chr09 31999926 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 31999927 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 31999934 . T G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 32006220 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 32006241 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 32009888 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,217 Chr09 32009968 . C A 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.224;DP=16;Dels=0.00;FS=14.706;HaplotypeScore=1.8997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.874 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:183,0,354 Chr09 32034225 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 32048895 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,68 Chr09 32048970 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:75,0,29 Chr09 32057925 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 32057941 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32057945 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32057955 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 32057958 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32057963 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32057973 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.22;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32069135 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,187 Chr09 32070272 . T C 105.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.17;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:18:134,0,18 Chr09 32070275 . G A 77.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.46;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:106,0,19 Chr09 32072167 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 32078323 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr09 32078441 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 32092876 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 32095862 . C T 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.01;MQ0=0;MQRankSum=-4.780;QD=2.57;ReadPosRankSum=-4.408 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,33:47:99:149,0,513 Chr09 32271494 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr09 32311755 . A G 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr09 32314421 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 32325882 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 32345191 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 32345234 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 32348424 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 32352965 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 32369157 . T C 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr09 32393281 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr09 32393485 . G T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.386;DP=75;Dels=0.00;FS=22.252;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.244;QD=0.82;ReadPosRankSum=-4.608 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,8:75:90:90,0,2402 Chr09 32403628 . C T 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:60,0,26 Chr09 32413681 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,106 Chr09 32422444 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr09 32422455 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 32427559 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 32437160 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr09 32454914 . A C 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr09 32470119 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 32470152 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 32470935 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr09 32470965 . A G 157.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.30;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:186,0,24 Chr09 32470998 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 32471031 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 32474703 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 32502420 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.03;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 32502428 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.03;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr09 32504456 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 32512079 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 32512165 . C A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.35;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:93:167,0,93 Chr09 32523860 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 32552529 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr09 32552535 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr09 32574471 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 32577172 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 32586283 . G C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr09 32688695 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 32720972 . T C 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:180,0,63 Chr09 32720983 . T G 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=22.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:188,0,63 Chr09 32724972 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 32726606 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr09 32726630 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr09 32727868 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr09 32800919 . A C 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.01;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr09 32836372 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.709;DP=17;Dels=0.00;FS=18.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.567;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,529 Chr09 32852672 . A G 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=30;Dels=0.00;FS=43.265;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=4.09;ReadPosRankSum=3.707 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:151,0,887 Chr09 32855632 . G T 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;DP=17;Dels=0.00;FS=37.916;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=6.57;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:140,0,437 Chr09 32855728 . C A 61.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 32905234 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr09 32905824 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 32909392 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,217 Chr09 32909596 . G A 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:61:181,0,61 Chr09 32927052 . G C 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:97,0,30 Chr09 32927084 . C T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:104,0,30 Chr09 32927085 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:100,0,30 Chr09 32927433 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=14.564;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.62;MQ0=0;MQRankSum=1.606;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.282 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:75:75,0,264 Chr09 32928267 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr09 32928305 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr09 32945384 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.07;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 32945439 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.07;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 32967726 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.99;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr09 32976612 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 33021418 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 33021427 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr09 33021444 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 33025242 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr09 33057891 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.761;DP=13;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.423;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.451 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,356 Chr09 33064419 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 33071896 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=6.31;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:85:85,0,209 Chr09 33095745 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 33129426 . A G 73.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:102,0,22 Chr09 33132104 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 33133633 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,173 Chr09 33179276 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr09 33179300 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:112,0,69 Chr09 33188078 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=25;Dels=0.00;FS=5.869;HaplotypeScore=1.7323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=2.11;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:25:81:81,0,719 Chr09 33213748 . T C 118.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.18;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:15:147,15,0 Chr09 33216951 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 33218390 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.076;QD=2.67;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:71:71,0,446 Chr09 33218487 . C A 73.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:116,9,0 Chr09 33251005 . C T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr09 33285102 . A T 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.948;DP=35;Dels=0.00;FS=21.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.810;QD=2.76;ReadPosRankSum=-3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:125,0,1064 Chr09 33285187 . C A 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.064;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.173;QD=6.03;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:99:185,0,680 Chr09 33368211 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 33382127 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 33383254 . C A 50.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:105,0,67 Chr09 33651064 . G T 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr09 33651160 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 33678543 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 33678856 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.155;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.259;QD=0.48;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:51:51,0,1427 Chr09 33680268 . A G 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 33705671 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr09 33705697 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 33705703 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 33705706 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr09 33705708 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 33705737 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.61;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 33705837 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 33709991 . T G 102.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;QD=25.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:130,12,0 Chr09 33709996 . C A 51.10 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=0;QD=12.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:93,9,0 Chr09 33746461 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:63,0,31 Chr09 33762293 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr09 33762319 . A G 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr09 33780851 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr09 33783249 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr09 33801374 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 33801384 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 33801391 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 33801394 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 33801404 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 33801405 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 33801416 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 33837369 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 33841414 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr09 33841415 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr09 33847062 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 33849695 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 33849742 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 33868021 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 33868028 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 33868035 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr09 33868038 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 33873084 . G A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr09 33875064 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;DP=18;Dels=0.00;FS=2.823;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,550 Chr09 33878736 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 33880138 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.627;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.062;QD=1.51;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:57:57,0,596 Chr09 33898436 . A T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr09 33935354 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 33947658 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.82;ReadPosRankSum=-2.725 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:61:61,0,535 Chr09 33949829 . C A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=12.60;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,126 Chr09 33966997 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr09 33998038 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 33998071 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 33998447 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 34024527 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 34026213 . T G 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr09 34043320 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr09 34054135 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 34054145 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 34054157 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 34054167 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 34054206 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 34056252 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34088602 . C T 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr09 34088619 . T C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr09 34088635 . G C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr09 34089170 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 34111529 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr09 34116037 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34125939 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34125955 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 34125991 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 34126010 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 34139538 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 34139678 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr09 34139831 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 34144425 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 34144434 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr09 34144461 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 34145119 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 34145496 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr09 34156448 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 34188186 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 34188221 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 34189598 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.670;DP=26;Dels=0.00;FS=2.556;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.036;QD=1.84;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:76:76,0,778 Chr09 34274540 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr09 34387460 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 34548561 . C A 245.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.004;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.270;QD=5.12;ReadPosRankSum=-5.004 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,11:48:99:274,0,1374 Chr09 34548819 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=16;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,467 Chr09 34555302 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34555320 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34575553 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;DP=43;Dels=0.00;FS=21.967;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.403;QD=1.74;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:99:103,0,1302 Chr09 34623571 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;DP=13;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=16.52;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:243,0,204 Chr09 34648174 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.370;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6643;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.03;MQ0=0;MQRankSum=2.286;QD=1.56;ReadPosRankSum=-2.370 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:28,2:30:6:74,6,0 Chr09 34651021 . T A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.457;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.98;MQ0=0;MQRankSum=2.261;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.462 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:52:52,0,596 Chr09 34759850 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34770213 . T C 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:148,0,24 Chr09 34783391 . G T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr09 34837724 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 34861493 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr09 34876077 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 34876158 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr09 34877461 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 34878377 . G A 119.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:148,0,27 Chr09 34878393 . A T 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:153,0,27 Chr09 34878425 . C G 120.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:149,0,27 Chr09 34878819 . A T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.266;DP=44;Dels=0.00;FS=21.142;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQ0=0;MQRankSum=0.906;QD=1.61;ReadPosRankSum=-3.916 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,6:44:99:99,0,1428 Chr09 34893996 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 34894022 . C T 41.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:14:70,0,14 Chr09 34894061 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=17.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:68:168,0,68 Chr09 34920919 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr09 34921810 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr09 34925971 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 34938351 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.09;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,344 Chr09 34938917 . G T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.761;QD=3.67;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:76:76,0,342 Chr09 34972204 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 34972220 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 34972222 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 34972255 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr09 34989468 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 34999521 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 35023904 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 35026139 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,151 Chr09 35035267 . A G 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr09 35056109 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35059481 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 35061158 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 35062002 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 35062003 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 35062062 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 35095231 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 35095467 . C T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:99,0,137 Chr09 35102544 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 35102560 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 35112794 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 35112838 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 35117232 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 35117300 . T C 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;DP=32;Dels=0.00;FS=1.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.821;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,7:32:99:175,0,865 Chr09 35117330 . G C 38.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35125911 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 35127434 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr09 35174100 . A T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr09 35208710 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 35208888 . T A 46.77 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr09 35252843 . C T 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:114,0,27 Chr09 35256997 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr09 35257204 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,69 Chr09 35257228 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr09 35257230 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr09 35257245 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr09 35258490 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr09 35286086 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 35294356 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,209 Chr09 35294689 . A T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=9.700;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,185 Chr09 35303187 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 35303221 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr09 35303242 . G C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr09 35303251 . A T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr09 35303259 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.45;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr09 35304572 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 35314191 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 35315873 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 35316423 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 35318497 . G T 510.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:539,42,0 Chr09 35327976 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 35369122 . G T 217.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.742;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.042;QD=10.89;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,8:20:99:246,0,434 Chr09 35428404 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 35443212 . A T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,197 Chr09 35444546 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.86;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr09 35446732 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 35446803 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,147 Chr09 35448154 . G A 205.77 . 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C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,222 Chr09 35479559 . A T 305.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7308;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.63;MQ0=0;QD=26.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:334,24,0 Chr09 35524234 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.825;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.600;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:120,0,285 Chr09 35561322 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 35572806 . G A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.09;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:92:92,0,221 Chr09 35572816 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:100,0,68 Chr09 35577828 . A T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr09 35586263 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,241 Chr09 35590525 . C T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:97,0,28 Chr09 35602085 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr09 35615362 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 35637265 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 35648953 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 35654909 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35663199 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr09 35668969 . A G 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr09 35679683 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,70 Chr09 35707933 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:60,0,33 Chr09 35709501 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:99:100,0,210 Chr09 35712988 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,107 Chr09 35735098 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 35735140 . C G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr09 35735444 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr09 35771984 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.436;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.032;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.124 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:126,0,551 Chr09 35796703 . C A 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.009;QD=7.67;ReadPosRankSum=-2.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:174,0,449 Chr09 35807776 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:117,0,278 Chr09 35819090 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,140 Chr09 35830742 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,123 Chr09 35835061 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr09 35835071 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr09 35835073 . A C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr09 35835088 . G A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr09 35843153 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 35859159 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 35863077 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,262 Chr09 35881506 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 35881507 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 35881515 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 35881543 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.83;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr09 35883968 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:65,0,65 Chr09 35883994 . T G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:71:72,0,71 Chr09 35884040 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35884051 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 35891472 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 35891474 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 35891479 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 35891480 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr09 35891487 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 35891488 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 35891490 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr09 35919586 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,166 Chr09 35923493 . G A 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr09 35923520 . G C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=17.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:30:114,0,30 Chr09 35923564 . G T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr09 35939187 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 35939219 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35939244 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35951334 . T G 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:67,0,27 Chr09 35951930 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr09 35952096 . T C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr09 35956060 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,131 Chr09 35966711 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 35966714 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 35966724 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 35967736 . A C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:101,0,29 Chr09 35967749 . T C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:104,0,28 Chr09 35968143 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.908;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.824;QD=1.60;ReadPosRankSum=-3.908 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,6:43:97:97,0,1392 Chr09 35969575 . A G 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:101,0,26 Chr09 35994175 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:65,0,29 Chr09 35994793 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 36058691 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36093761 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,147 Chr09 36103756 . G T 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.065;QD=3.53;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:120,0,779 Chr09 36125343 . G T 188.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:217,18,0 Chr09 36152814 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 36152877 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36155228 . C G 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=10.38;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:132,0,209 Chr09 36155249 . T C 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.447;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:129,0,214 Chr09 36155252 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.447 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:93:93,0,219 Chr09 36155258 . A G 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=9.48;ReadPosRankSum=1.133 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:123,0,181 Chr09 36155273 . G A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.633;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQ0=0;MQRankSum=-2.072;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:135,0,210 Chr09 36155279 . C T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQ0=0;MQRankSum=-2.219;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:132,0,181 Chr09 36163392 . G A 135.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;DP=82;Dels=0.00;FS=23.983;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=1.66;ReadPosRankSum=-5.108 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:72,10:82:99:164,0,2584 Chr09 36178993 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 36186568 . C G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:83:83,0,270 Chr09 36206759 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 36206789 . C T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr09 36291865 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36291902 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 36291928 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36294422 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr09 36308516 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr09 36308552 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,72 Chr09 36336516 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.82;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr09 36336522 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.82;MQ0=0;QD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:105,9,0 Chr09 36336553 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36336554 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36336586 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 36336608 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 36357913 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,214 Chr09 36358701 . A T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,297 Chr09 36396689 . A G 104.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:133,15,0 Chr09 36396702 . C T 137.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:166,18,0 Chr09 36396707 . A C 137.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:166,18,0 Chr09 36396721 . T A 137.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:166,18,0 Chr09 36396722 . T C 137.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:166,18,0 Chr09 36396733 . C T 137.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=22.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:166,18,0 Chr09 36396768 . T C 104.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:133,15,0 Chr09 36396773 . A G 104.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=20.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:133,15,0 Chr09 36450075 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.050;QD=0.90;ReadPosRankSum=-2.784 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:49:49,0,715 Chr09 36532629 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr09 36533649 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:64,0,63 Chr09 36533653 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 36550464 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 36555457 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr09 36555535 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr09 36564854 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,69 Chr09 36567018 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36567048 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr09 36567053 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36567078 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 36639343 . G A 478.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:507,39,0 Chr09 36639363 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,175 Chr09 36642011 . G T 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.092;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=6.09;ReadPosRankSum=-4.176 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,8:31:99:217,0,837 Chr09 36646302 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36646322 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36646324 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36646643 . T A 295.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:324,24,0 Chr09 36657950 . C A 44.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr09 36717710 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=0;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:67,6,0 Chr09 36717716 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr09 36717718 . T A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=0;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:67,6,0 Chr09 36717723 . T A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.14;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr09 36717818 . T C 84.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 36758825 . A T 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;DP=31;Dels=0.00;FS=8.475;HaplotypeScore=2.5773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=4.93;ReadPosRankSum=-3.629 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,7:31:99:181,0,747 Chr09 36773158 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36773159 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 36773175 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 36774539 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 36775607 . A T 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.132;QD=7.51;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:171,0,446 Chr09 36777299 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36795031 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 36797370 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36798069 . C A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.166;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,256 Chr09 36807380 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.04;MQ0=0;QD=32.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr09 36822104 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36822106 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36822130 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 36822154 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 36822163 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36839627 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr09 36839645 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr09 36839691 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:73,0,29 Chr09 36841085 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr09 36841216 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:32:64,0,32 Chr09 36841218 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.71;MQ0=0;QD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:73,6,0 Chr09 36841219 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.71;MQ0=0;QD=11.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:73,6,0 Chr09 36842375 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr09 36842395 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 36849082 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 36856673 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr09 36858839 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr09 36859080 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,137 Chr09 36862288 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 36903161 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr09 36903164 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 36903193 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr09 36903198 . A T 86.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr09 36910899 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr09 36910900 . A T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr09 36910902 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr09 36910917 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 36910926 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 36910961 . G C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.75;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr09 36912122 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr09 36921931 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 36922084 . T A 310.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;DP=41;Dels=0.00;FS=42.744;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.530;QD=7.58;ReadPosRankSum=-5.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,12:41:99:339,0,1040 Chr09 36922681 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 36923098 . C A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;DP=20;Dels=0.00;FS=2.754;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.709;QD=3.19;ReadPosRankSum=-2.976 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:92:92,0,570 Chr09 36927780 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr09 36945703 . G C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr09 36956720 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:64,0,33 Chr09 36956757 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr09 36956769 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr09 36956775 . C G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.46;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr09 36957379 . G A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr09 36957524 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 36976274 . C T 33.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:62,0,26 Chr09 36976310 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr09 36976314 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr09 36976408 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr09 36976425 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr09 36976430 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.23;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr09 36999140 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 36999719 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 37004962 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr09 37005005 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr09 37007855 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr09 37052033 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.39;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:50,6,0 Chr09 37052042 . A G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.39;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:50,6,0 Chr09 37057186 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr09 37057192 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr09 37072080 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr09 37079059 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.915;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.535;QD=0.51;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:52:52,0,1520 Chr09 37127036 . T C 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127037 . G T 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127040 . T C 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127041 . T A 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127043 . T A 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.578 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127044 . G T 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127056 . C A 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127066 . T C 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37127076 . C G 109.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.734;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.413 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,20:21:10:137,0,10 Chr09 37212256 . A T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:101,0,62 Chr09 37234285 . G T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.621;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.468;QD=2.87;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:146,0,1266 Chr09 37234371 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.325;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.027;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.020 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:55:55,0,1075 Chr09 37235496 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.60;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:89:89,0,148 Chr09 37260442 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr09 37262693 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr09 37264696 . A C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.938;DP=15;Dels=0.00;FS=31.351;HaplotypeScore=10.9963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQ0=0;MQRankSum=2.807;QD=4.98;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:103,0,387 Chr09 37274519 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr09 37315582 . T G 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr09 37320021 . C A 123.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.437;QD=9.52;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:152,0,272 Chr09 37324510 . G T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.308;QD=4.10;ReadPosRankSum=-3.723 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,6:29:99:147,0,817 Chr09 37324596 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.636;QD=5.74;ReadPosRankSum=-3.901 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,7:28:99:189,0,732 Chr09 37336425 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr09 37336449 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr09 37341898 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,139 Chr09 37342312 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr09 37366237 . G C 235.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:264,21,0 Chr09 37366339 . G A 88.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.08;MQ0=0;QD=22.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:116,12,0 Chr09 37366388 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:62,0,61 Chr09 37366390 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:60:62,0,60 Chr09 37366391 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.29;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:62,0,61 Chr09 37424208 . A T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 129206 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.52;MQ0=1;MQRankSum=1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:6:67,6,0 Chr10 179289 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 226351 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:6:51,6,0 Chr10 374054 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 374075 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 374082 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 374085 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 374104 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 374105 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.17;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 404217 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.041;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.537;QD=1.90;ReadPosRankSum=-1.182 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,2:12:51:51,0,338 Chr10 404801 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,101 Chr10 408198 . C A 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=5.03;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,7:29:99:174,0,799 Chr10 413404 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 436337 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr10 436424 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:65:65,0,70 Chr10 490604 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 499738 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 523787 . C T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;DP=44;Dels=0.00;FS=14.894;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.995;QD=2.56;ReadPosRankSum=-4.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:141,0,1249 Chr10 523790 . T A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;DP=44;Dels=0.00;FS=14.894;HaplotypeScore=1.7675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=2.56;ReadPosRankSum=-4.171 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,7:44:99:141,0,1303 Chr10 550686 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:56:56,0,183 Chr10 552194 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 552206 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 552212 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 552242 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 579373 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.608;QD=2.34;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:82:82,0,688 Chr10 600510 . T A 117.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:162,12,0 Chr10 613797 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;DP=12;Dels=0.00;FS=4.393;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.678;QD=7.90;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:12:99:123,0,254 Chr10 636341 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 636355 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 636409 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 636461 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 645407 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 647430 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 655809 . G T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.356;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.426;QD=2.45;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:87:87,0,745 Chr10 675506 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 676232 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 676239 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 676244 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 676250 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 726406 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.99;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 746252 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 746263 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 758138 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,173 Chr10 758141 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,175 Chr10 759162 . G C 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:110,0,24 Chr10 782948 . C T 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:115,12,0 Chr10 783965 . C A 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.46;MQ0=3;MQRankSum=0.736;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:7:6:77,6,0 Chr10 784104 . G A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:104,0,24 Chr10 784112 . T G 75.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:104,0,23 Chr10 784131 . G C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.00;MQ0=21;MQRankSum=0.825;QD=2.27;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:57:101,0,57 Chr10 784138 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.00;MQ0=21;MQRankSum=0.825;QD=2.27;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:54:101,0,54 Chr10 785075 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 785081 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 785116 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 785130 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 814961 . A G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.44;MQ0=2;QD=8.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:9:80,9,0 Chr10 814985 . G A 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.44;MQ0=2;QD=8.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:9:80,9,0 Chr10 815005 . C A 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.04;MQ0=2;QD=10.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:80,9,0 Chr10 815006 . T C 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.04;MQ0=2;QD=10.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:80,9,0 Chr10 821655 . G A 90.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=12;Dels=0.00;FS=3.282;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.25;MQ0=0;MQRankSum=-2.367;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.529 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:119,0,227 Chr10 831253 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 831254 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 831260 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 831262 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 831269 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 831274 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 837034 . T G 90.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.31;MQ0=3;QD=3.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:29:18:142,18,0 Chr10 837073 . T C 113.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.82;MQ0=0;QD=4.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,24:24:18:142,18,0 Chr10 864163 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 890360 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:51:51,0,636 Chr10 907893 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 908132 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 913275 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 913282 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 913284 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 958451 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 971406 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 973848 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 973878 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 978964 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr10 990360 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 990364 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 990399 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 1008098 . T G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.40;MQ0=30;QD=0.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:12:87,12,0 Chr10 1008100 . T C 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=21.2850;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.40;MQ0=30;QD=0.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:12:87,12,0 Chr10 1018858 . A C 143.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.738;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.290 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,11:12:12:171,0,12 Chr10 1021070 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr10 1024135 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.955;QD=2.27;ReadPosRankSum=3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:101,0,805 Chr10 1024148 . A T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.907;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.811;QD=2.27;ReadPosRankSum=-3.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:101,0,804 Chr10 1024173 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.617;QD=2.27;ReadPosRankSum=-3.790 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,6:32:99:101,0,804 Chr10 1025106 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 1025243 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 1043303 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 1044559 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1102039 . A G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 1102058 . T A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:99,0,65 Chr10 1104522 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 1112582 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1113290 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1121233 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1123259 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 1123274 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 1139756 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 1173793 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1173805 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 1173824 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 1173848 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 1173850 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 1176532 . T G 55.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 1199920 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 1203799 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1207364 . T G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr10 1211299 . G A 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr10 1211335 . C G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 1211345 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 1216240 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 1216244 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 1294157 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 1294172 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 1301175 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1301212 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1301426 . C G 195.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;DP=18;Dels=0.00;FS=45.028;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.181;QD=10.88;ReadPosRankSum=-3.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,7:18:99:224,0,401 Chr10 1306706 . C A 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=21.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:61:182,0,61 Chr10 1306727 . G T 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=21.54;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:179,0,63 Chr10 1306737 . C G 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:180,0,63 Chr10 1306749 . G A 146.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=18.35;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:98:175,0,98 Chr10 1307857 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 1307859 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.34;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 1311948 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,148 Chr10 1311966 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.300;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:101,0,142 Chr10 1347271 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 1352162 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1455653 . A C 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr10 1491679 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,99 Chr10 1541331 . A C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 1562136 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 1562172 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1575151 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1579480 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 1596331 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 1596332 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 1604935 . C A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.62 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 1604950 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 1604972 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 1641463 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 1641485 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 1671797 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 1671799 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1674921 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,103 Chr10 1701605 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr10 1715879 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1738683 . T G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 1738687 . T A 37.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1820836 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 1820862 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 1822719 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1822744 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 1828765 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1830931 . A G 234.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:263,21,0 Chr10 1837173 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 1837209 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 1837219 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 1867973 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 1872351 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 1894353 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 1894391 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 1894999 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 1900919 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 1913232 . A C 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr10 1913237 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr10 1913280 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 1914915 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 1914922 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 1922917 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 1922929 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 1923599 . T A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 1926966 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 1927236 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 1928491 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 1928521 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr10 1980286 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 1980343 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2004194 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 2006128 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2006144 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2041209 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.05;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 2048662 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 2060439 . G A 114.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:160,12,0 Chr10 2060443 . C G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr10 2088431 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2220623 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr10 2220664 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 2221750 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 2235941 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 2265887 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr10 2269157 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=2.72;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:88:88,0,668 Chr10 2286724 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 2303822 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 2312601 . T G 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr10 2339131 . C G 404.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.73 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:12:33:433,33,0 Chr10 2355119 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 2441451 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2441468 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 2496832 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2497340 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 2497356 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 2524446 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 2546336 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 2546375 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 2546393 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 2546399 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 2591102 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 2591110 . C T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 2683216 . T A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.398;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.278 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:134,0,255 Chr10 2691111 . A T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr10 2691112 . C G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr10 2691138 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr10 2691149 . T A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr10 2691190 . G C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.21;MQ0=2;QD=6.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:52,6,0 Chr10 2716931 . G A 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 Chr10 2725550 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.15;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:74,6,0 Chr10 2737248 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,150 Chr10 2737317 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr10 2737328 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 2737367 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 2756593 . C T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr10 2756895 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 2756906 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 2756948 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 2808356 . G A 1251.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.26;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:93:1280,93,0 Chr10 2848130 . C A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.38;MQ0=14;MQRankSum=2.468;QD=1.09;ReadPosRankSum=-3.413 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:22,8:31:6:61,6,0 Chr10 2863046 . A T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=53;Dels=0.00;FS=14.548;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.21;MQ0=27;MQRankSum=-4.243;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,20:53:84:84,0,582 Chr10 2863099 . C T 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;DP=75;Dels=0.00;FS=3.376;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.11;MQ0=30;MQRankSum=-4.720;QD=1.68;ReadPosRankSum=1.615 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,43:75:99:154,0,1117 Chr10 2879892 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 2898411 . C A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.684;DP=44;Dels=0.05;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.018;QD=1.81;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:108,0,1345 Chr10 2900933 . A G 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2900960 . C T 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2900978 . A T 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2900982 . C T 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2900986 . T C 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2900991 . T A 125.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=20.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:154,18,0 Chr10 2908400 . C A 189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.242;DP=32;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.849;QD=5.93;ReadPosRankSum=-4.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,8:32:99:218,0,881 Chr10 2914317 . T A 155.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:184,15,0 Chr10 2918348 . T A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr10 3012708 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:67,0,65 Chr10 3012715 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:71,0,58 Chr10 3012718 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,68 Chr10 3021289 . T C 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.29;MQ0=0;MQRankSum=2.787;QD=1.19;ReadPosRankSum=2.787 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:30,3:33:9:67,9,0 Chr10 3071927 . C A 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.33;MQ0=5;QD=9.23 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:12:111,12,0 Chr10 3094292 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 3094304 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3094310 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3094356 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 3094357 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3094358 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 3095085 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 3095095 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3095098 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3095116 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 3095124 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3095137 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 3097997 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 3098028 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3100190 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3105501 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 3106109 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 3114516 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 3151485 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3160646 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3160651 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3232553 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 3232561 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3232563 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 3234468 . C G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 3246925 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3248018 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.873;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.019;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:112,0,1240 Chr10 3248810 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 3263879 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 3277852 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3286156 . A G 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr10 3391726 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3428308 . T C 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:107,0,27 Chr10 3428320 . T C 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:99,0,27 Chr10 3428330 . G A 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:110,0,27 Chr10 3428353 . G A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=7.782;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:98:98,0,181 Chr10 3443970 . C T 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.5401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.55;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=14.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:38:129,0,38 Chr10 3456768 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 3481598 . C T 207.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;DP=39;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.069;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.858 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,9:38:99:236,0,1006 Chr10 3490571 . A G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr10 3490710 . G C 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=3.41;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:93:93,0,550 Chr10 3492571 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 3492647 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 3532241 . G C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;DP=10;Dels=0.00;FS=21.004;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.08;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=7.88;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:99:107,0,138 Chr10 3536108 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.15;MQ0=13;QD=2.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,2:15:6:70,6,0 Chr10 3536117 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=2;QD=11.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:75,6,0 Chr10 3538603 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.89;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=8.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:61:85,0,61 Chr10 3538817 . G C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.56;MQ0=0;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:61,6,0 Chr10 3554200 . G A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.87;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=12.25;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:87:114,0,87 Chr10 3554481 . C G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.61;MQ0=2;QD=0.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,61:61:6:59,6,0 Chr10 3554619 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;DP=45;Dels=0.00;FS=8.953;HaplotypeScore=6.3500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.10;MQ0=1;MQRankSum=-4.887;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.681 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,24:45:65:65,0,589 Chr10 3554817 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr10 3561192 . G A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.37;MQ0=1;MQRankSum=-1.380;QD=14.54;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:130,0,63 Chr10 3562979 . G C 37.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.79;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.56;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:23:66,0,23 Chr10 3564287 . G C 126.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;QD=21.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:155,18,0 Chr10 3564347 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.23;MQ0=19;MQRankSum=0.732;QD=0.65;ReadPosRankSum=-2.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,6:55:64:64,0,293 Chr10 3564348 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;DP=55;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.23;MQ0=19;MQRankSum=0.732;QD=0.65;ReadPosRankSum=-2.562 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,7:55:64:64,0,293 Chr10 3595338 . A G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr10 3601839 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 3601885 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 3603937 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 3606322 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3631693 . C G 288.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.003;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=22.21;ReadPosRankSum=-2.392 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,9:13:99:317,0,124 Chr10 3715606 . T C 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=2;MQRankSum=-0.731;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:26:147,0,26 Chr10 3715611 . G A 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQ0=2;MQRankSum=0.731;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:27:147,0,27 Chr10 3715687 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 3736931 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,107 Chr10 3745461 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,108 Chr10 3747400 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 3748758 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 3748762 . G C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 3752959 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,319 Chr10 3754204 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.37;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr10 3762196 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=1;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr10 3762206 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=1;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr10 3762210 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=1;QD=16.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:78,6,0 Chr10 3762213 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr10 3762868 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.31;MQ0=3;MQRankSum=1.380;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:69,0,51 Chr10 3762879 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.31;MQ0=3;MQRankSum=-1.380;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:51,0,70 Chr10 3762880 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.31;MQ0=3;MQRankSum=-1.380;QD=2.53;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:51:51,0,70 Chr10 3762912 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.21;MQ0=2;MQRankSum=-1.380;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:51:51,0,71 Chr10 3762927 . A C 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.34;MQ0=0;QD=18.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:141,12,0 Chr10 3762932 . A G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.34;MQ0=0;QD=19.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:144,12,0 Chr10 3763281 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3763532 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=2;QD=12.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:77,6,0 Chr10 3763539 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=2;QD=12.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:79,6,0 Chr10 3763589 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=2;QD=8.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:62,6,0 Chr10 3765494 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 3765500 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 3765569 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr10 3767633 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.34;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr10 3812702 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 3815613 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:80,6,0 Chr10 3825709 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 3825722 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3825730 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 3840545 . C T 199.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=24.97;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:43:228,0,43 Chr10 3851535 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr10 3854426 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.71;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 3854484 . G C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 3854491 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 3860240 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 3860265 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 3860268 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 3860277 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 3860296 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 3860298 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 3860303 . G T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 3863114 . A T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=9.62;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:134,0,252 Chr10 3863155 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,109 Chr10 3865294 . C T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr10 3868269 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 3868544 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3875497 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,102 Chr10 3875518 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:54:54,0,104 Chr10 3875542 . T C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr10 3875935 . C G 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.369;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:129,0,410 Chr10 3884906 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 3884920 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 3884976 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 3893083 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,63 Chr10 3893089 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:99,0,30 Chr10 3893090 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr10 3893095 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr10 3893097 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,72 Chr10 3910482 . A T 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=3.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.876;QD=9.97;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:118,0,174 Chr10 3913485 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 3913924 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 3913925 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 3938024 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3938028 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3938031 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3938050 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3938072 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 3941658 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.135;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.72;MQ0=0;MQRankSum=2.345;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:45,2:47:6:81,6,0 Chr10 3943501 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 4002973 . T C 82.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.31;MQ0=0;QD=9.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:12:110,12,0 Chr10 4015028 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,307 Chr10 4033260 . T G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.10;MQ0=0;MQRankSum=1.422;QD=3.42;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:59:59,0,127 Chr10 4033315 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=10;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.64;MQ0=0;MQRankSum=1.866;QD=6.68;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:95:95,0,124 Chr10 4039798 . G C 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=5;MQRankSum=1.754;QD=4.27;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:9:79,9,0 Chr10 4039812 . C T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=5;MQRankSum=1.754;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:9:79,9,0 Chr10 4039841 . T C 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.18;MQ0=5;MQRankSum=1.754;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,3:12:9:79,9,0 Chr10 4040038 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 4071818 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.34;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr10 4075509 . C G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 4075512 . T C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr10 4078102 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.99;MQ0=14;MQRankSum=-0.736;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,2:17:31:67,0,31 Chr10 4078170 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.420;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:75:75,0,708 Chr10 4078176 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.260;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.89;MQ0=0;MQRankSum=-2.039;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.980 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:75:75,0,700 Chr10 4083989 . G T 261.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.51;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=23.80;ReadPosRankSum=0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,8:11:52:290,0,52 Chr10 4094273 . T G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.34;MQ0=23;MQRankSum=-3.892;QD=1.02;ReadPosRankSum=-2.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,34:49:78:78,0,522 Chr10 4124258 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 4124991 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 4132076 . T C 39.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.59;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=7.97;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:18:68,0,18 Chr10 4162028 . G A 198.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.86;MQ0=0;MQRankSum=-2.270;QD=15.30;ReadPosRankSum=2.073 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,11:13:15:227,0,15 Chr10 4163220 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.97;MQ0=0;MQRankSum=3.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=-2.284 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:99:105,0,513 Chr10 4163238 . A C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.769;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.769 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:103,0,229 Chr10 4182544 . T C 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:76:76,0,326 Chr10 4182546 . A T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=4.15;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:78:78,0,321 Chr10 4182566 . T C 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.70;MQ0=0;MQRankSum=-1.479;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:77:77,0,324 Chr10 4182583 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,226 Chr10 4232434 . T A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=32.68 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr10 4235882 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 4243743 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.46;MQ0=26;QD=1.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:6:71,6,0 Chr10 4250609 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:30:113,0,30 Chr10 4251250 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 4251260 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 4251423 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4290518 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.46;MQ0=1;MQRankSum=-0.742;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:33:71,0,33 Chr10 4295556 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 4295615 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 4295619 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 4295629 . T G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 4368272 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4368300 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.59;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 4377493 . T C 44.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.50;MQ0=0;QD=11.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:84,6,0 Chr10 4379158 . G T 108.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.27;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.88;ReadPosRankSum=-0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:35:137,0,35 Chr10 4384456 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 4389496 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4389522 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 4389523 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 4390672 . T G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr10 4390720 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 4390721 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 4390736 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 4391083 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 4391493 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:100,0,68 Chr10 4397198 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 4406734 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 4406759 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 4415114 . C T 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr10 4415154 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 4489746 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 4492034 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 4492184 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 4497008 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 4626738 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr10 4638956 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 4638957 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 4638958 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 4638965 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 4638995 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4638996 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4644131 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 4681235 . C A 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=15.43;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:198,0,170 Chr10 4682484 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;DP=15;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:50:50,0,414 Chr10 4682485 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.065;DP=15;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=1.45;ReadPosRankSum=-2.024 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:50:50,0,413 Chr10 4682487 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.110;DP=15;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=1.45;ReadPosRankSum=-0.979 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:50:50,0,412 Chr10 4682505 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.415;DP=15;Dels=0.00;FS=8.129;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.32;MQ0=0;MQRankSum=-2.938;QD=1.45;ReadPosRankSum=1.501 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:50:50,0,406 Chr10 4682686 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,137 Chr10 4682782 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQ0=0;MQRankSum=0.852;QD=2.56;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:87:87,0,664 Chr10 4708802 . C T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=5.229;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=6.38;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:92:92,0,258 Chr10 4708816 . C G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.72;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:98:98,0,184 Chr10 4711577 . A G 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.294;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.925;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,321 Chr10 4793365 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,135 Chr10 4793387 . C G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,217 Chr10 4795846 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr10 4823761 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.98;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:31:67,0,31 Chr10 4897522 . A C 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.446;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.37;MQ0=3;MQRankSum=-1.040;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,36:38:6:56,6,0 Chr10 4911071 . C G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.804;DP=65;Dels=0.00;FS=23.156;HaplotypeScore=4.9833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.286;QD=0.47;ReadPosRankSum=4.543 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,8:65:59:59,0,1635 Chr10 4940605 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr10 4940637 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 4940927 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 4949788 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 4949813 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 4954419 . C A 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr10 4955050 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 4955065 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 4975767 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,69 Chr10 5003834 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,68 Chr10 5044060 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 5044064 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 5044084 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 5044098 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.54;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 5180571 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,182 Chr10 5180574 . T G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,175 Chr10 5180585 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.54;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,159 Chr10 5180610 . G C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.199;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.62;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=1.16;ReadPosRankSum=-2.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:56:56,0,153 Chr10 5183734 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 5183735 . A T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 5212510 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 5240122 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5275233 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 5298009 . A C 65.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=1;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:9:93,9,0 Chr10 5298010 . A G 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=1;QD=10.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:91,9,0 Chr10 5298038 . A G 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.56;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr10 5298171 . A C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=4.49;MQ0=40;QD=0.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,63:63:6:51,6,0 Chr10 5298320 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.57;MQ0=0;QD=8.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:70,6,0 Chr10 5298346 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.57;MQ0=0;QD=9.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:74,6,0 Chr10 5323282 . G A 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr10 5362027 . G A 84.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.83;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:113,0,27 Chr10 5375561 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 5375789 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 5375818 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 5375827 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 5375842 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 5375852 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 5375858 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 5375859 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 5375862 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 5388469 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 5433686 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr10 5462365 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 5462376 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 5484494 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 5504473 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5545586 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 5639287 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:66,0,30 Chr10 5643471 . G T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.17;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr10 5643533 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 5667060 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 5668692 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 5683304 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5683316 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5687691 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 5696208 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5739052 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.79;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:51,6,0 Chr10 5771328 . C T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr10 5771338 . G C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 5771350 . T G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 5775792 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.88;MQ0=1;QD=25.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:154,12,0 Chr10 5777086 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5789559 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;DP=37;Dels=0.00;FS=2.526;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.26;MQ0=1;MQRankSum=0.091;QD=1.53;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:37:85:85,0,1002 Chr10 5789716 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQ0=1;MQRankSum=-1.495;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:57:57,0,186 Chr10 5792506 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:68,0,29 Chr10 5807199 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,147 Chr10 5808708 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5809861 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,72 Chr10 5811567 . G T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr10 5842149 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 5859335 . C T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr10 5859346 . T A 101.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:129,12,0 Chr10 5859349 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:116,9,0 Chr10 5859982 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.70;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 5861522 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:50:50,0,137 Chr10 5863196 . A G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 5869142 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 5869221 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,337 Chr10 5879179 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 5889045 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 5907590 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.95;MQ0=3;QD=10.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:79,6,0 Chr10 5925382 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 5966846 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6023885 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 6039674 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr10 6039682 . A G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr10 6039688 . C T 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 6039689 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 6039695 . G A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr10 6039700 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 6039728 . A C 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr10 6056304 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 6074496 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 6078391 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 6116473 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 6116485 . C G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 6120050 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6120771 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 6125697 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 6125702 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr10 6136087 . T G 44.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:73,0,23 Chr10 6144095 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6144155 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 6210595 . G C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 6275187 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 6275194 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 6275235 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr10 6275695 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 6275696 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 6276726 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 6320665 . T A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.246;QD=3.77;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:81:81,0,400 Chr10 6331009 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6372268 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,140 Chr10 6372271 . C G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,143 Chr10 6400970 . C G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:50,0,72 Chr10 6400981 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.41;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:50:50,0,71 Chr10 6420212 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 6464379 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr10 6484831 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.490;DP=25;Dels=0.00;FS=3.310;HaplotypeScore=4.8485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.01;MQ0=3;MQRankSum=0.809;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:65:65,0,195 Chr10 6484841 . A G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;DP=25;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=1.8332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.01;MQ0=3;MQRankSum=0.848;QD=2.27;ReadPosRankSum=-2.912 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,6:25:85:85,0,200 Chr10 6602153 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6602180 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 6602199 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6614689 . A C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,151 Chr10 6614727 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,150 Chr10 6623185 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 6642801 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.20;MQ0=0;MQRankSum=-2.180;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.934 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:59:59,0,366 Chr10 6643551 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.78;MQ0=2;MQRankSum=-0.922;QD=3.64;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:61:61,0,146 Chr10 6643597 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.65;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,130 Chr10 6651041 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr10 6660754 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 6682316 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,109 Chr10 6685224 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.18;MQ0=0;QD=8.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:61,6,0 Chr10 6755801 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:66,0,65 Chr10 6765372 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.623;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.557 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:80:80,0,408 Chr10 6774233 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 6785275 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 6852450 . A T 88.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.36;MQ0=0;QD=4.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:15:117,15,0 Chr10 6852506 . T C 88.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.36;MQ0=0;QD=4.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,18:18:15:117,15,0 Chr10 6860742 . G A 131.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.14;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:160,0,275 Chr10 6860811 . G A 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.163;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:140,0,273 Chr10 6878277 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,64 Chr10 6885005 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,101 Chr10 6885182 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 6905381 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,101 Chr10 6910835 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 6918848 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 6924690 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 6952623 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.30;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr10 6952628 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.30;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 6959215 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:85:85,0,175 Chr10 6971889 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:63:63,0,144 Chr10 6983328 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,291 Chr10 6994678 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;DP=74;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.67;MQ0=2;MQRankSum=-6.601;QD=0.44;ReadPosRankSum=-3.795 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,46:74:61:61,0,893 Chr10 6996084 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr10 7002743 . A T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQ0=0;MQRankSum=-2.486;QD=3.24;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:80:80,0,425 Chr10 7002824 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.55;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:76:76,0,109 Chr10 7007308 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.53;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 7128672 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 7151024 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9297;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQ0=0;MQRankSum=-1.185;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:67:67,0,548 Chr10 7151031 . G C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.529;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.106;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:58:58,0,618 Chr10 7151032 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.588 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:59:59,0,620 Chr10 7151050 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:73:73,0,493 Chr10 7166732 . C T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,221 Chr10 7166774 . C G 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;DP=12;Dels=0.00;FS=5.643;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.109 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:81:81,0,287 Chr10 7172132 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,213 Chr10 7211352 . G A 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.789;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.789;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:134,0,452 Chr10 7212899 . G A 39.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:19:68,0,19 Chr10 7214556 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 7215551 . A T 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.937;DP=20;Dels=0.00;FS=2.695;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.614;QD=3.29;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:94:94,0,576 Chr10 7241600 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:104,0,64 Chr10 7264152 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.76;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 7288914 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.128;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.609;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.519 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:99:100,0,925 Chr10 7288917 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.519;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:96:96,0,935 Chr10 7288924 . A C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.194;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:99:99,0,955 Chr10 7288963 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.104;QD=2.68;ReadPosRankSum=0.052 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,5:32:99:114,0,1009 Chr10 7289561 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:62,0,30 Chr10 7385379 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr10 7497278 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr10 7530740 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 7627028 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 7649675 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.861;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=1.04;ReadPosRankSum=-2.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:51:51,0,674 Chr10 7699069 . G T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.280;QD=4.66;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:126,0,580 Chr10 7730483 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=8.09;ReadPosRankSum=0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:9:99:101,0,186 Chr10 7746597 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,250 Chr10 7813066 . A G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.468;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.134;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:133,0,242 Chr10 7824475 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:48:111,0,48 Chr10 7825862 . A T 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:106,0,25 Chr10 7848291 . T G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,217 Chr10 7861512 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.050;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:99,0,521 Chr10 7877000 . C G 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=13;Dels=0.00;FS=6.929;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.085;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:84:84,0,368 Chr10 7898603 . G T 143.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=20.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:58:172,0,58 Chr10 7898699 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr10 7902142 . T A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=13;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=4.29;ReadPosRankSum=1.099 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:84:84,0,355 Chr10 7902221 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.055;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:63:63,0,689 Chr10 7907370 . A T 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=20.10;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:62:189,0,62 Chr10 7925370 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr10 7928158 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.022;QD=1.43;ReadPosRankSum=-3.576 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:81:81,0,1203 Chr10 7933493 . A T 111.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;DP=30;Dels=0.00;FS=31.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=3.73;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,6:30:99:140,0,868 Chr10 7937858 . G T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.354;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.422;QD=1.35;ReadPosRankSum=-2.555 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:78:78,0,1198 Chr10 7937954 . C A 143.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:172,0,22 Chr10 8042581 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.558;DP=21;Dels=0.00;FS=6.067;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.653;QD=1.28;ReadPosRankSum=-0.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:55:55,0,660 Chr10 8067478 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:103,0,29 Chr10 8067708 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 8116439 . A T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=13.29;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,109 Chr10 8117786 . T G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,186 Chr10 8172539 . G T 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.988;QD=11.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:97,0,104 Chr10 8172625 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 8246337 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.993;DP=53;Dels=0.00;FS=1.880;HaplotypeScore=1.8320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.172;QD=0.41;ReadPosRankSum=-0.989 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,5:53:50:50,0,1785 Chr10 8261592 . G A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,70 Chr10 8261649 . G A 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:57,0,28 Chr10 8261772 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.92;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 8266836 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 8355450 . G T 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;DP=51;Dels=0.00;FS=24.097;HaplotypeScore=6.9968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.344;QD=4.09;ReadPosRankSum=-4.875 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,10:51:99:237,0,1444 Chr10 8374204 . T C 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.315;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.627;QD=3.68;ReadPosRankSum=-4.315 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,8:38:99:168,0,1145 Chr10 8417175 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,260 Chr10 8427470 . A T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=12.35;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:127,0,129 Chr10 8427566 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 8430484 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.174;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.194;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:70:70,0,859 Chr10 8516509 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 8596787 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 8636615 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr10 8636635 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 8636673 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 8636682 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 8636688 . T G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 8652905 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 8736805 . C G 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.225;DP=93;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.71;MQ0=6;MQRankSum=1.182;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,53:93:47:141,0,47 Chr10 8765485 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 8874395 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 8879724 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 8921165 . C T 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr10 8921168 . C G 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=31.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:241,18,0 Chr10 8996733 . G T 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr10 9090505 . G C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,263 Chr10 9090541 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,265 Chr10 9102004 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 9112905 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.072;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.967 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:46,6:52:75:75,0,1694 Chr10 9145637 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 9158174 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr10 9158185 . G T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr10 9158198 . C A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr10 9182475 . C T 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.51;MQ0=12;MQRankSum=-0.501;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,12:32:38:181,0,38 Chr10 9182519 . C G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.79;MQ0=6;MQRankSum=0.736;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:9:6:57,6,0 Chr10 9206363 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.38;MQ0=7;MQRankSum=-1.754;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,10:14:61:61,0,135 Chr10 9206496 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.968;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.43;MQ0=4;MQRankSum=0.349;QD=0.81;ReadPosRankSum=-2.208 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:51:51,0,443 Chr10 9217279 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 9217291 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 9217292 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 9217315 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 9217321 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 9217326 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 9264911 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 9264914 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;DP=17;Dels=0.00;FS=18.325;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=4.28;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:101,0,473 Chr10 9295981 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,240 Chr10 9427392 . G T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr10 9427478 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 9428159 . A T 231.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.747;QD=28.88;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:12:259,0,12 Chr10 9449769 . G A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:99,0,69 Chr10 9508973 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:65,0,62 Chr10 9611516 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=8.10;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:93:93,0,169 Chr10 9613517 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;DP=22;Dels=0.00;FS=5.798;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.128;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:87:87,0,648 Chr10 9615673 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 9631839 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.382;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=1.20;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,5:39:75:75,0,1277 Chr10 9656843 . A G 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;DP=37;Dels=0.00;FS=4.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.244;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,5:37:87:87,0,1181 Chr10 9664690 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,105 Chr10 9693837 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 9801939 . G T 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:162,0,126 Chr10 9816606 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;DP=11;Dels=0.00;FS=3.090;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.566;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,271 Chr10 9816957 . C A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.261;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.335;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.379 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:125,0,1074 Chr10 9845143 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.05;MQ0=1;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr10 9855884 . T C 75.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.36;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:104,0,19 Chr10 9883832 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:53:53,0,147 Chr10 9884261 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;DP=29;Dels=0.00;FS=17.927;HaplotypeScore=4.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=1.44;ReadPosRankSum=-2.688 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:70:70,0,836 Chr10 9890303 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,144 Chr10 9917645 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 9926386 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.684;DP=34;Dels=0.00;FS=19.445;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.401;QD=0.79;ReadPosRankSum=0.187 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:55:55,0,1013 Chr10 10054070 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 10054150 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 10090781 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 10090801 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.26;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=10.95;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:82,6,0 Chr10 10193672 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 10297155 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.738;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQ0=0;MQRankSum=0.910;QD=0.69;ReadPosRankSum=-3.227 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:51:51,0,1037 Chr10 10466214 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:60,0,31 Chr10 10466217 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:60,0,33 Chr10 10466226 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr10 10466233 . T G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr10 10466237 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr10 10466238 . C G 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:60,0,29 Chr10 10517574 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,96 Chr10 10569138 . C A 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=5.63;ReadPosRankSum=-2.616 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:107,0,358 Chr10 10626239 . C A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.780;DP=25;Dels=0.00;FS=7.959;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.037;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:78:78,0,767 Chr10 10668142 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.24;MQ0=2;MQRankSum=2.663;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:20,3:23:9:114,9,0 Chr10 10712936 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 10837317 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 10970645 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.142;QD=0.99;ReadPosRankSum=-3.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:60:60,0,1053 Chr10 10971365 . A T 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:105,0,26 Chr10 10999232 . C A 83.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.75;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=16.64;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:10:111,0,10 Chr10 11062504 . A G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.84;MQ0=0;QD=5.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:77,9,0 Chr10 11092996 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,181 Chr10 11187040 . C T 311.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:340,27,0 Chr10 11259266 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 11331190 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 11359229 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,330 Chr10 11372967 . G A 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.38;MQ0=0;QD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:69,9,0 Chr10 11372981 . G C 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.38;MQ0=0;QD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:69,9,0 Chr10 11372997 . C T 41.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.38;MQ0=0;QD=10.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:69,9,0 Chr10 11380618 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:61,0,33 Chr10 11387892 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.71;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr10 11427242 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,133 Chr10 11448836 . C A 124.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.244;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.244;QD=10.40;ReadPosRankSum=-0.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:153,0,227 Chr10 11504796 . G T 74.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:10:102,0,10 Chr10 11504893 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr10 11584974 . T C 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr10 11585022 . G A 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr10 11622313 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.84;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.32;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:97,9,0 Chr10 11622355 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.29;MQ0=0;QD=11.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:63,6,0 Chr10 11886035 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.82;MQ0=2;QD=3.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:66,6,0 Chr10 12027325 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 12043830 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,160 Chr10 12086673 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 12167337 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,103 Chr10 12317291 . A T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQ0=0;MQRankSum=2.637;QD=7.23;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:115,0,284 Chr10 12364730 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr10 12375528 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 12375540 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 12375571 . T G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr10 12375574 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 12375587 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 12375590 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 12482600 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,99 Chr10 12507570 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 12507579 . A C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 12507586 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr10 12507606 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 12533600 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.22;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 12544677 . C T 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.64;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr10 12544688 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:52,0,32 Chr10 12544693 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:52,0,33 Chr10 12544722 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:52,0,33 Chr10 12550414 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.189;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:59:59,0,483 Chr10 12550437 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:60:60,0,485 Chr10 12550445 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.189;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,530 Chr10 12550450 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.693;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.567;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.441 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,494 Chr10 12629488 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 12629604 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr10 12629621 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:68,0,66 Chr10 12671682 . C A 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.32;MQ0=1;MQRankSum=-1.034;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.678 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:128,0,157 Chr10 12671720 . T C 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.400;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.78;MQ0=1;MQRankSum=-0.800;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.867 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:123,0,250 Chr10 12707127 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.58;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:49,6,0 Chr10 12758115 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr10 12844722 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-1.123;QD=2.12;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:79:79,0,734 Chr10 12962336 . A T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr10 12962355 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.02;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr10 12966677 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 12966679 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 13079499 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,109 Chr10 13159394 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:50:50,0,228 Chr10 13239387 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 13239396 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 13239443 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 13239450 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 13665260 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 13667127 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.51;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr10 13667133 . G A 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.51;MQ0=1;QD=4.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:48,6,0 Chr10 13667134 . T G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.51;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr10 13667143 . G T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.51;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr10 13667152 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.11;MQ0=0;QD=5.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:50,6,0 Chr10 13687004 . G C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQ0=0;MQRankSum=-1.415;QD=4.81;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:110,0,453 Chr10 13805610 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 13829522 . C A 27.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.35;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:56,0,24 Chr10 13954352 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.91;MQ0=8;MQRankSum=2.123;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.764 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,2:23:6:59,6,0 Chr10 13974320 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.34;MQ0=2;QD=9.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:65,6,0 Chr10 14079390 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQ0=1;MQRankSum=-0.898;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,266 Chr10 14117523 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 14124037 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 14220387 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.876 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:60:60,0,79 Chr10 14232901 . T C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr10 14327937 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 14386026 . C T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;DP=31;Dels=0.00;FS=10.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=5;MQRankSum=-2.310;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:83:83,0,806 Chr10 14386027 . A G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;DP=31;Dels=0.00;FS=10.058;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQ0=5;MQRankSum=-2.310;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,9:31:83:83,0,780 Chr10 14484177 . A G 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr10 14484416 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 14517784 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56:62,0,56 Chr10 14804678 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,68 Chr10 14818088 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:101,0,66 Chr10 14822504 . G C 63.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.33;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:92,0,27 Chr10 14829606 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.50;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 15026302 . G C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr10 15051345 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;DP=68;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.23;MQ0=44;MQRankSum=1.279;QD=1.81;ReadPosRankSum=-3.412 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,5:68:99:151,0,299 Chr10 15343925 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=3.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:51:51,0,137 Chr10 15354867 . C T 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr10 15354919 . T C 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 Chr10 15674882 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.91;MQ0=2;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:54,6,0 Chr10 15674887 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.91;MQ0=2;QD=6.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:54,6,0 Chr10 15693136 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.07;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr10 15693137 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.07;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr10 15693138 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.07;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr10 15693178 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.07;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr10 15791615 . G T 197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:226,18,0 Chr10 15833716 . T A 53.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.65;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=8.97;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:19:82,0,19 Chr10 15833758 . G A 54.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.72;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:11:82,0,11 Chr10 15833764 . C T 53.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.72;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:19:82,0,19 Chr10 15833785 . A C 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.11;MQ0=0;QD=16.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:94,9,0 Chr10 15876806 . A G 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;DP=26;Dels=0.00;FS=18.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.83;MQ0=3;MQRankSum=-1.176;QD=1.84;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,7:26:76:76,0,633 Chr10 15876822 . C T 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;DP=27;Dels=0.00;FS=18.468;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.10;MQ0=4;MQRankSum=-1.176;QD=1.77;ReadPosRankSum=2.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,5:27:76:76,0,607 Chr10 15977365 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.97;MQ0=23;QD=1.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:23,2:25:6:76,6,0 Chr10 15985391 . T C 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.129;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQ0=1;MQRankSum=-4.171;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.869 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,14:25:97:97,0,371 Chr10 16042861 . C T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.47;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.26;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:89,9,0 Chr10 16052531 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.817;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.2988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.90;MQ0=0;MQRankSum=2.270;QD=0.87;ReadPosRankSum=-2.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,2:41:64:64,0,65 Chr10 16170464 . T G 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 Chr10 16205561 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.118 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:53:53,0,303 Chr10 16282067 . A G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.58;MQ0=0;MQRankSum=0.466;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:53:106,0,53 Chr10 16448629 . G C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,69 Chr10 16564933 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.839;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:61:61,0,559 Chr10 16601634 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 16628889 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.84;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=6.10;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:77:77,0,129 Chr10 16698881 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.00;MQ0=16;QD=1.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,4:18:6:57,6,0 Chr10 16737935 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.568;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.091;QD=1.55;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:84:84,0,1165 Chr10 16781257 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:99,0,66 Chr10 16781641 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.205 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,486 Chr10 16814357 . A C 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=14;Dels=0.00;FS=2.622;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQ0=0;MQRankSum=-1.713;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.311 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:77:77,0,403 Chr10 16972331 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=5.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,139 Chr10 17074063 . C G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.25;MQ0=8;QD=2.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:6:55,6,0 Chr10 17143321 . G T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;DP=16;Dels=0.00;FS=10.532;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=4.99;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:108,0,443 Chr10 17190136 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr10 17209842 . G T 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.867;DP=21;Dels=0.00;FS=25.604;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQ0=0;MQRankSum=0.537;QD=4.42;ReadPosRankSum=-3.096 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:121,0,532 Chr10 17227810 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;DP=167;Dels=0.00;FS=2.588;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=7.88;MQ0=54;MQRankSum=2.938;QD=0.26;ReadPosRankSum=2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:164,3:167:47:71,0,47 Chr10 17227812 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.900;DP=166;Dels=0.00;FS=2.571;HaplotypeScore=1.3670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=8.03;MQ0=54;MQRankSum=2.937;QD=0.24;ReadPosRankSum=2.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:163,3:166:68:68,0,69 Chr10 17267731 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,341 Chr10 17352304 . T A 2855.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=72;Dels=0.04;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.75;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,69:69:99:2884,208,0 Chr10 17375683 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 17375684 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 17375685 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 17375721 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 17376292 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 17526468 . T A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.24;MQ0=1;QD=9.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:66,6,0 Chr10 17678653 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.45;MQ0=3;QD=10.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:78,6,0 Chr10 17764507 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.37;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:30:67,0,30 Chr10 17834020 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=5;QD=3.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:6:58,6,0 Chr10 17915264 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.32;MQ0=0;QD=3.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:57,6,0 Chr10 17915280 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.32;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:57,6,0 Chr10 17916523 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 18037932 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 18071158 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,267 Chr10 18156585 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 18389140 . G T 67.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:110,9,0 Chr10 18615464 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,239 Chr10 18619954 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 18619975 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 18619986 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 18797846 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr10 18815354 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.99;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:56:61,0,56 Chr10 18997523 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.54;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:53:53,0,184 Chr10 19003864 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 19007158 . G T 36.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:75,6,0 Chr10 19007243 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQ0=2;MQRankSum=-0.326;QD=5.22;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:117,0,275 Chr10 19053437 . A C 171.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:200,18,0 Chr10 19053458 . C A 170.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:199,18,0 Chr10 19053477 . A C 171.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;MQ0=0;QD=28.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:200,18,0 Chr10 19053482 . C T 118.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.16;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:147,15,0 Chr10 19053499 . G T 141.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:170,15,0 Chr10 19053501 . A C 142.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=28.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:171,15,0 Chr10 19053505 . T C 144.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=28.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:173,15,0 Chr10 19053507 . T A 132.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=26.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:161,15,0 Chr10 19053515 . A C 143.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.24;MQ0=0;QD=28.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:172,15,0 Chr10 19186241 . C A 37.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr10 19260066 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 19332020 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,214 Chr10 19340599 . C A 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;DP=15;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.061;QD=8.05;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:149,0,353 Chr10 19410557 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 19410569 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 19412246 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 19454917 . G A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.134;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:87:87,0,587 Chr10 19454948 . G A 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.493;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.746 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:84:84,0,601 Chr10 19614141 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.25;MQ0=20;MQRankSum=0.495;QD=1.26;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:71:71,0,101 Chr10 19617742 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 19617952 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;DP=21;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.926;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.403 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:60:60,0,570 Chr10 19674366 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.61;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:57,6,0 Chr10 19730171 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:100,0,63 Chr10 19759399 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,185 Chr10 19759432 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,180 Chr10 19759439 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,167 Chr10 19900420 . C T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.10;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr10 19921384 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 19921390 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 19921940 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQ0=0;MQRankSum=-2.764;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:53:53,0,654 Chr10 19936868 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.289;DP=22;Dels=0.00;FS=5.727;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.57;MQ0=2;MQRankSum=-3.505;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.103 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:98:98,0,411 Chr10 20021603 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr10 20021606 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr10 20054744 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 20054754 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 20054786 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 20054789 . G A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 20054803 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 20069025 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 20086186 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:62:62,0,141 Chr10 20410569 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.798;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQ0=0;MQRankSum=-1.419;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.879 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:73:73,0,699 Chr10 20515416 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 Chr10 20515420 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.76;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr10 20515455 . C T 31.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.21;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:60,0,18 Chr10 20516496 . G C 90.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=22.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:118,12,0 Chr10 20696590 . C A 39.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=9.96;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:68,0,18 Chr10 20733579 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.372;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.279 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:47,5:52:50:50,0,1786 Chr10 20801504 . T A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=13.35;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:29:95,0,29 Chr10 21043306 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.35;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 21055520 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 21192906 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 21355255 . G T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.41;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:64,6,0 Chr10 21391453 . A C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,318 Chr10 21492850 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.464;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.96;MQ0=1;MQRankSum=-1.577;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:19:56:56,0,212 Chr10 21497110 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.63;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:52,0,32 Chr10 21646291 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.537;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:64:64,0,67 Chr10 21659613 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 21714375 . G A 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.61;MQ0=2;MQRankSum=0.791;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,12:13:12:145,12,0 Chr10 21747401 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.08;MQ0=1;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:66,6,0 Chr10 21820226 . A C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,69 Chr10 21874805 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 21889778 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.68;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr10 22006006 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.38;MQ0=1;MQRankSum=-0.922;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,138 Chr10 22097220 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.80;MQ0=1;MQRankSum=-0.736;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:32:52,0,32 Chr10 22097317 . C A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.75;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49:49,0,64 Chr10 22114304 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.06;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,189 Chr10 22178919 . A G 33.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=10.69;MQ0=10;MQRankSum=-0.727;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:13:62,0,13 Chr10 22201880 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:74,0,29 Chr10 22425986 . A G 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.38;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:54,6,0 Chr10 22426004 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.38;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:54,6,0 Chr10 22486968 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:61,0,57 Chr10 22509181 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 22552941 . G T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 22553352 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.28;MQ0=27;MQRankSum=1.769;QD=1.78;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:96:96,0,158 Chr10 22553438 . C A 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 Chr10 22604197 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 22604257 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 22604266 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 22691616 . C G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,62 Chr10 22691657 . T C 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.25;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=9.85;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:44:107,0,44 Chr10 22785503 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.25;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:50,0,67 Chr10 22785509 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 22924258 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.27;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr10 22951772 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.29;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 22967210 . C T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.13;MQ0=1;MQRankSum=-1.537;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:56:86,0,56 Chr10 22983598 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 Chr10 23011924 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.14;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:65,0,62 Chr10 23051150 . C G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.70;MQ0=4;QD=4.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:53,6,0 Chr10 23051837 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 23207558 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.15;MQ0=36;MQRankSum=0.358;QD=0.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,2:41:30:67,0,30 Chr10 23393761 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 23529017 . C A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;DP=42;Dels=0.00;FS=5.053;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.709;QD=2.68;ReadPosRankSum=-4.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,7:42:99:141,0,1271 Chr10 23531768 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 23531786 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 23532104 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 23535596 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 23685737 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 24106789 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.3300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.32;MQ0=5;MQRankSum=1.995;QD=1.58;ReadPosRankSum=-1.077 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,11:41:93:93,0,99 Chr10 24691699 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 24723585 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,182 Chr10 24901247 . C T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.764;DP=22;Dels=0.00;FS=16.246;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.856;QD=5.22;ReadPosRankSum=-2.559 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:143,0,496 Chr10 24901280 . A G 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.150;DP=22;Dels=0.00;FS=16.246;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.67;MQ0=0;MQRankSum=-3.856;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.467 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,8:22:99:147,0,477 Chr10 24901431 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 24901453 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 24901476 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.70;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 24965276 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;DP=20;Dels=0.00;FS=8.239;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.529;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:62:62,0,630 Chr10 25039989 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr10 25132816 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 25190316 . G T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 25190341 . G A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=9.650;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQ0=0;MQRankSum=-0.423;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.944 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:82:82,0,346 Chr10 25328363 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 25403880 . A T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.43;MQ0=2;QD=5.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:54,6,0 Chr10 25460860 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 25507990 . G T 159.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.98;MQ0=6;QD=13.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,6:12:18:188,18,0 Chr10 25594697 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 25681982 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.60;MQ0=28;QD=1.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,31:31:9:68,9,0 Chr10 25691821 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.764;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.553 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:63:63,0,692 Chr10 25719390 . T C 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.387;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.00;MQ0=5;MQRankSum=-1.932;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,8:16:99:149,0,126 Chr10 25755599 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.164 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:66:66,0,648 Chr10 25756616 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 25836887 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 25836973 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.26;MQ0=9;MQRankSum=1.377;QD=2.69;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:82:82,0,234 Chr10 25837861 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.297;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQ0=0;MQRankSum=2.780;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.854 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:82:82,0,655 Chr10 25905398 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.385;DP=35;Dels=0.00;FS=2.198;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.86;MQ0=2;MQRankSum=-0.929;QD=0.96;ReadPosRankSum=-1.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:62:62,0,954 Chr10 25972587 . A C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,149 Chr10 26112894 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.62;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr10 26112951 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 26245279 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=0;MQRankSum=1.537;QD=14.21;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:113,9,0 Chr10 26251988 . C A 143.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.65;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.00;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:172,0,13 Chr10 26487645 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.017;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQ0=0;MQRankSum=-3.123;QD=1.15;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:58:58,0,690 Chr10 26609378 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.34;MQ0=26;MQRankSum=1.495;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,2:33:6:84,6,0 Chr10 26684810 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,174 Chr10 26688378 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr10 26811601 . A G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr10 27236495 . C A 23.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:52,0,22 Chr10 27313668 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.05;MQ0=2;MQRankSum=1.393;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,9:12:6:49,6,0 Chr10 27502370 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.18;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:80:80,0,238 Chr10 27505207 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,129 Chr10 27578787 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.59;MQ0=2;MQRankSum=1.589;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:59,6,0 Chr10 27578795 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.91;MQ0=3;MQRankSum=1.589;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:59,6,0 Chr10 27578830 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.65;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:59,6,0 Chr10 27684574 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.65;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=17.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:80,6,0 Chr10 27741274 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr10 27841540 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,167 Chr10 27863555 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 27964449 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.69;MQ0=0;QD=7.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:56,6,0 Chr10 28392688 . G A 232.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.883;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.883 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:261,0,258 Chr10 28392692 . G A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;DP=18;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=0.9967;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.222 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,10:18:99:157,0,240 Chr10 28432566 . G T 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:96,9,0 Chr10 28630597 . T C 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.161;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.53;MQ0=0;MQRankSum=-2.266;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:142,0,408 Chr10 28672621 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 28672703 . C G 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.55;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr10 28736501 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.04;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 28801107 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.94;MQ0=3;MQRankSum=0.727;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:6:68,6,0 Chr10 28801131 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.326;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.07;MQ0=21;MQRankSum=1.371;QD=1.05;ReadPosRankSum=-2.938 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,23:36:6:65,6,0 Chr10 28818394 . G T 66.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.67;MQ0=0;QD=22.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:94,9,0 Chr10 28994458 . G T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr10 29027535 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 29171932 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 29221978 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 29273836 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,268 Chr10 29318954 . G T 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318957 . C T 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318959 . A G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318972 . T C 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318976 . T C 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318978 . A G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318979 . C A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318984 . A G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29318993 . G A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.64;MQ0=0;QD=12.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:91,12,0 Chr10 29333608 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.68;MQ0=2;QD=7.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:59,6,0 Chr10 29503732 . C A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.324;QD=6.20;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:146,0,476 Chr10 29518825 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr10 29518898 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr10 29518914 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr10 29557248 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 29557947 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,318 Chr10 29587569 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:6:67:67,0,70 Chr10 29669743 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 29726365 . G C 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.63;MQ0=0;QD=10.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:92,9,0 Chr10 29925779 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:60:60,0,107 Chr10 30012922 . C A 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.435;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.241;QD=2.41;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:98:98,0,896 Chr10 30023095 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 30153034 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.43;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=3.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:50:50,0,120 Chr10 30481612 . C A 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:103,0,25 Chr10 30528188 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,71 Chr10 30528284 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr10 30535997 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;DP=50;Dels=0.00;FS=2.428;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.642;QD=1.18;ReadPosRankSum=-2.672 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,6:50:87:87,0,1637 Chr10 30571580 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 30863303 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.191;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,699 Chr10 30890219 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 30911300 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr10 31076630 . T C 43.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:16:72,0,16 Chr10 31126457 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.182;DP=62;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.5439;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.79;MQ0=33;MQRankSum=-2.498;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.929 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,58:62:6:67,6,0 Chr10 31126494 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.53;MQ0=33;QD=0.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:61:6:70,6,0 Chr10 31161503 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 31300337 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 31360255 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.40;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:66,0,65 Chr10 31400763 . T C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.13;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:95:95,0,102 Chr10 31465897 . C A 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr10 31633038 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 31719003 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.05;MQ0=0;MQRankSum=-3.211;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.324 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:57:57,0,1006 Chr10 31741120 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.81;MQ0=8;MQRankSum=0.736;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:9,2:11:6:55,6,0 Chr10 31741139 . C A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 Chr10 31741141 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.22;MQ0=0;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:55,6,0 Chr10 31843048 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.139;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.83;MQ0=6;MQRankSum=2.268;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.972 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,2:33:6:76,6,0 Chr10 32081127 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 32184575 . T C 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.88;MQ0=0;MQRankSum=-2.383;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,6:10:86:86,0,121 Chr10 32184593 . T C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.57;MQ0=0;MQRankSum=-2.054;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.422 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:80:89,0,80 Chr10 32242012 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:63:63,0,159 Chr10 32398050 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,248 Chr10 32522668 . T C 152.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.51;MQ0=1;MQRankSum=-2.074;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.101 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:181,0,213 Chr10 32615929 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 32684755 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,298 Chr10 32695754 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 32879668 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.785;DP=27;Dels=0.00;FS=10.372;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.785;QD=2.07;ReadPosRankSum=-1.126 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:84:84,0,846 Chr10 32905174 . T C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.106;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:66:66,0,644 Chr10 32941537 . C T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,297 Chr10 32944356 . G T 125.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.927;DP=13;Dels=0.00;FS=3.123;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.978;QD=9.67;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:154,0,286 Chr10 32954319 . A C 80.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:109,0,27 Chr10 32989301 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,99 Chr10 33072059 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 33117146 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.56;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr10 33304241 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;DP=60;Dels=0.00;FS=1.734;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:54,6:60:67:67,0,2007 Chr10 33369490 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 33405908 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:100,0,94 Chr10 33493948 . A C 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:67,0,26 Chr10 33563377 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,330 Chr10 33588352 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.399;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:51:51,0,1045 Chr10 33588368 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQ0=0;MQRankSum=-2.234;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.414 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,4:33:50:50,0,1041 Chr10 33604377 . G T 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;DP=17;Dels=0.00;FS=33.766;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.170;QD=4.34;ReadPosRankSum=-2.661 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:102,0,421 Chr10 33632768 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr10 33632771 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr10 33632777 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr10 33632789 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr10 33632793 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr10 33699721 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.729;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.159;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:65:65,0,128 Chr10 33716806 . G A 22.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:51,0,28 Chr10 33716808 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:51,0,32 Chr10 33716829 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:51,0,32 Chr10 33716831 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:51,0,32 Chr10 33716856 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:51,0,30 Chr10 33716873 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 33716874 . C T 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 33716889 . C G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr10 33717218 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 33718292 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 33787018 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 33790085 . C A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;DP=25;Dels=0.00;FS=2.715;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.89;MQ0=3;MQRankSum=-0.043;QD=2.27;ReadPosRankSum=-3.107 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:85:85,0,591 Chr10 33854595 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr10 33870597 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=40;Dels=0.00;FS=8.182;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.74;MQ0=0;MQRankSum=-3.882;QD=0.62;ReadPosRankSum=-2.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:53:53,0,1213 Chr10 33873207 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.14;MQ0=0;MQRankSum=2.556;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,440 Chr10 33895328 . C T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 33975051 . T G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr10 33975063 . C T 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr10 33975080 . A G 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr10 34064026 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 34065575 . C T 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-2.317;QD=0.81;ReadPosRankSum=-1.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,7:65:81:81,0,2057 Chr10 34065605 . T A 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;DP=65;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQ0=0;MQRankSum=-1.441;QD=0.98;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,7:65:92:92,0,2112 Chr10 34065653 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 34111745 . C A 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.036;QD=9.98;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:128,0,210 Chr10 34244536 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 34320536 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,260 Chr10 34344830 . C T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:107,0,67 Chr10 34651924 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,148 Chr10 34664241 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.20;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:84:84,0,197 Chr10 34683136 . A G 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=11.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:85,0,58 Chr10 34700316 . T G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=11.761;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=6.28;ReadPosRankSum=-0.546 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:91:91,0,245 Chr10 34700370 . C G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.86;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:54:54,0,251 Chr10 34910390 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 35077808 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 35208457 . T A 88.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:116,12,0 Chr10 35210312 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 35216860 . T A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,291 Chr10 35222575 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 35225736 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr10 35231291 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=18;Dels=0.00;FS=3.542;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.237;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.355 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:69:69,0,554 Chr10 35280118 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,147 Chr10 35280156 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;DP=24;Dels=0.00;FS=3.598;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.087;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:51:51,0,782 Chr10 35292429 . T C 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr10 35293156 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,202 Chr10 35311741 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 35314097 . T G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr10 35437291 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 35438161 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:101,0,138 Chr10 35438186 . C T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=8.68;ReadPosRankSum=1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:89:89,0,119 Chr10 35441148 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 35441179 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 35561904 . T A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr10 35575673 . T G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr10 35587057 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.898;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,296 Chr10 35629938 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 35634768 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.437;DP=13;Dels=0.00;FS=14.150;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.930;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.930 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:83:83,0,339 Chr10 35634793 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 35634810 . T G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,171 Chr10 35657883 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 35691253 . G T 181.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=25.99;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:210,0,15 Chr10 35737930 . G C 20.78 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.51;MQ0=0;QD=10.39 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:48,6,0 Chr10 35767984 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 35860482 . T G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;DP=19;Dels=0.00;FS=5.651;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:102,0,525 Chr10 35862913 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 35866712 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 35878017 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,179 Chr10 35908300 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 35986712 . C A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:138,0,27 Chr10 35997436 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 36016895 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.170;DP=17;Dels=0.00;FS=6.690;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.283;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:59:59,0,473 Chr10 36017751 . T C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.670;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.287;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.191 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:52:52,0,638 Chr10 36030136 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.635;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,637 Chr10 36088452 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 36123556 . G T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:100,0,30 Chr10 36123653 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,67 Chr10 36129088 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36130484 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.09;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:56:56,0,264 Chr10 36258536 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr10 36287931 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36394317 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 36394342 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 36394343 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36394346 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 36394367 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36394372 . T C 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:56,0,29 Chr10 36394400 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 36399239 . T C 123.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.73;MQ0=0;QD=17.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:152,18,0 Chr10 36399303 . C T 123.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.73;MQ0=0;QD=17.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:152,18,0 Chr10 36401534 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.532;QD=1.98;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,300 Chr10 36460329 . C A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 36548529 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36568485 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 36650783 . T C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.17;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 36665819 . T A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.976;DP=46;Dels=0.00;FS=68.255;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQ0=0;MQRankSum=-1.223;QD=2.26;ReadPosRankSum=-4.037 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,7:46:99:132,0,1500 Chr10 36685701 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 36836768 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;DP=22;Dels=0.00;FS=2.780;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.574;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.861 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,715 Chr10 36836776 . G A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;DP=26;Dels=0.00;FS=2.492;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.178;QD=2.11;ReadPosRankSum=-1.102 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:83:83,0,820 Chr10 36933834 . G T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.065;QD=3.26;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:113,0,782 Chr10 36933930 . C A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=39;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.020;QD=2.12;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:39:99:111,0,1202 Chr10 36955752 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 36955802 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 37055709 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 37138474 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.670;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.088;QD=1.87;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:105,0,1309 Chr10 37227590 . G A 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr10 37256495 . G T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=16.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:147,0,103 Chr10 37258128 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.457;DP=56;Dels=0.00;FS=4.955;HaplotypeScore=1.9976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=1.126;QD=0.60;ReadPosRankSum=-3.828 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:50,6:56:62:62,0,1865 Chr10 37328123 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 37328166 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 37328169 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 37328181 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 37328212 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 37355331 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 37356316 . C A 179.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.090;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=-3.645 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,7:20:99:208,0,466 Chr10 37396556 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 37396569 . G A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr10 37396587 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 37402405 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.780;DP=68;Dels=0.00;FS=27.295;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.816;QD=2.36;ReadPosRankSum=-5.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:57,11:68:99:189,0,2127 Chr10 37407806 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 37415862 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 37419704 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.90;MQ0=17;MQRankSum=-0.736;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,19:20:33:70,0,33 Chr10 37427815 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37444735 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr10 37444746 . G C 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr10 37444777 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr10 37445726 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37447327 . T A 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr10 37514122 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 37526661 . T C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.56;MQ0=5;MQRankSum=0.898;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:59:59,0,106 Chr10 37526697 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.22;MQ0=1;MQRankSum=0.720;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:6:66,6,0 Chr10 37563567 . A G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 37563591 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 37563595 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr10 37633319 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37633327 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37637361 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37637367 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 37649079 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37656324 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 37708362 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 37753689 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 37759683 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37769139 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr10 37771368 . G T 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.349;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:83:83,0,703 Chr10 37791575 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 37815169 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 37815180 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37815187 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37815210 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37815238 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 37815240 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 37815246 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 37815258 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 37815475 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 37815476 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 37816372 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 37816505 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 37817627 . A T 62.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=15.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:91,0,26 Chr10 37858599 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.04;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37859174 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.97;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:58,6,0 Chr10 37859223 . T C 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.97;MQ0=0;QD=23.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:99,9,0 Chr10 37872494 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 37882794 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 37890843 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr10 37890844 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 37890853 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 37890869 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 37890881 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 37890884 . G C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr10 37891526 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37891543 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37891560 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 37898130 . C A 137.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:166,0,22 Chr10 37898477 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,108 Chr10 37922588 . C T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,64 Chr10 37968896 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 37981313 . A G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 37981336 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 38001917 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 38001928 . A G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 38001931 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.02;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 38009142 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.883;DP=16;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.135;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,472 Chr10 38013978 . C G 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=21.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:54:176,0,54 Chr10 38014553 . T C 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr10 38017288 . G T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 38022797 . T A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr10 38038777 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,140 Chr10 38113882 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 38119558 . T A 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:270,21,0 Chr10 38119585 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 38119838 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 38126987 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 38153165 . A G 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr10 38224104 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,148 Chr10 38236486 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:46:60,0,46 Chr10 38236504 . A T 121.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:150,0,24 Chr10 38237465 . C A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.317;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.047;QD=5.09;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:130,0,556 Chr10 38256006 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 38256033 . G A 90.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:119,0,24 Chr10 38283376 . A C 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.46;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:91:91,0,107 Chr10 38290327 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,144 Chr10 38293223 . A G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.354;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,307 Chr10 38344040 . G T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.818;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:82:82,0,250 Chr10 38344731 . G A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr10 38404955 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 38412486 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 38412544 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 38485644 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 38486267 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 38486311 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 38554791 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 38565634 . C G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.271 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:56:56,0,263 Chr10 38605766 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 38605822 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 38621550 . A T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr10 38624590 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 38664251 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 38664263 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 38675480 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 38676470 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 38708823 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 38744262 . C A 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr10 38753942 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,248 Chr10 38759861 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38811121 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 38832248 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr10 38838333 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,97 Chr10 38839059 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 38839126 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 38839143 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 38839789 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 38864232 . T C 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=12.96;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:106,0,109 Chr10 38869649 . C A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr10 38898276 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 38907548 . C A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 38912593 . C T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=2.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:133,0,103 Chr10 38916771 . A C 107.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:5:12:153,12,0 Chr10 38918756 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38918778 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38946363 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr10 38946423 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr10 38950994 . T G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,242 Chr10 38955204 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38955226 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 38955259 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 38955279 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 38955283 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 38979315 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 38992839 . A C 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=3.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.25;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:100,0,145 Chr10 38992935 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 38992939 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38993082 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 38993090 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 38993131 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 38997280 . C T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr10 38998300 . T G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 39007739 . G A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.27;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr10 39025436 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39025662 . C A 103.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:132,0,24 Chr10 39050938 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39055195 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 39057835 . A T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.491;QD=2.51;ReadPosRankSum=-3.493 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,5:29:99:101,0,868 Chr10 39061388 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 39068277 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 39130347 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39131676 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 39131677 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 39132008 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,160 Chr10 39132039 . C A 386.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:415,30,0 Chr10 39132054 . A T 348.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:27:377,27,0 Chr10 39143551 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 39143554 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39143623 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39147821 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr10 39173058 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 39173062 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 39173066 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 39173592 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr10 39178679 . C T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9995;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 39178722 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 39178746 . T A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 39181706 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr10 39187716 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 39187718 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 39193900 . G C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,182 Chr10 39194988 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 39206637 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr10 39214806 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39227651 . T A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.68;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:96:145,0,96 Chr10 39234915 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 39239234 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 39239427 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr10 39239430 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:73,0,28 Chr10 39239462 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39244334 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr10 39244366 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr10 39246962 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39246980 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 39278086 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 39284033 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39291880 . T A 76.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:20:105,0,20 Chr10 39292944 . G T 589.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.183;DP=37;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.158;QD=15.94;ReadPosRankSum=-4.690 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,19:36:99:618,0,548 Chr10 39294392 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39297877 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 39298991 . G A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr10 39300737 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 39300752 . T C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:110,0,30 Chr10 39313935 . G A 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr10 39314946 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 39317400 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39321153 . G T 172.88 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:7:18:224,18,0 Chr10 39323563 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39323680 . G T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr10 39329493 . G C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 39332272 . A G 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.82;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,133 Chr10 39332321 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,144 Chr10 39332336 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:99,0,144 Chr10 39332349 . C T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,147 Chr10 39333290 . A T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 39333351 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=13.29;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,105 Chr10 39340261 . G T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr10 39340307 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr10 39354218 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 39369115 . A G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr10 39369136 . A G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr10 39369158 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr10 39381965 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 39384749 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 39384831 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 39396860 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39432877 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39434659 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 39467315 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39469768 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 39492476 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39492477 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39492504 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 39493574 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr10 39503412 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 39506119 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 39510778 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 39510839 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39525271 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr10 39525272 . A G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr10 39525290 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,104 Chr10 39525304 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:52:105,0,52 Chr10 39525308 . G A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:58:105,0,58 Chr10 39525342 . A G 179.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.82;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:208,0,21 Chr10 39528487 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:70,0,31 Chr10 39528584 . T C 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:106,0,26 Chr10 39528722 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=12.041;HaplotypeScore=6.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=2.018;QD=2.30;ReadPosRankSum=-2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,480 Chr10 39530928 . C G 161.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:190,0,24 Chr10 39542266 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 39547314 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:62,0,30 Chr10 39559483 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.02;MQ0=0;QD=7.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:57,6,0 Chr10 39561766 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.50;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 39562056 . T G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.46;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:69:91,0,69 Chr10 39584617 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39585266 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39585745 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,183 Chr10 39587641 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 39594536 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39594542 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39597903 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39599549 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39604288 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 39613968 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 39618383 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39618508 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 39618547 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 39626831 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 39626870 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 39633551 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr10 39633557 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr10 39641713 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 39649107 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39651170 . G A 145.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.717;QD=13.25;ReadPosRankSum=2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:174,0,214 Chr10 39651190 . C A 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr10 39651207 . G T 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr10 39674125 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39679809 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 39684477 . A T 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=15.64;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:169,0,140 Chr10 39684486 . C G 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:182,0,139 Chr10 39689345 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 39690005 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39733423 . G A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.566 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:91:91,0,283 Chr10 39733440 . C G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.382 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:93:93,0,302 Chr10 39733447 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.382;QD=5.98;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:94:94,0,304 Chr10 39733523 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,188 Chr10 39740307 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39740316 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39740335 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39740344 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39753987 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 39754219 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39754225 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39756348 . C A 78.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:121,9,0 Chr10 39764265 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:88:88,0,181 Chr10 39766351 . C A 324.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.606;QD=24.98;ReadPosRankSum=-0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,10:13:78:353,0,78 Chr10 39767696 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 39769179 . T G 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr10 39769235 . C G 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.017;QD=13.35;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:135,0,135 Chr10 39769270 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,150 Chr10 39769274 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,150 Chr10 39769300 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,256 Chr10 39769303 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.711;QD=2.21;ReadPosRankSum=2.488 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:68:68,0,546 Chr10 39792142 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,180 Chr10 39793628 . A C 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:145,0,66 Chr10 39812806 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,335 Chr10 39819037 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:101,0,65 Chr10 39822541 . A T 432.53 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQ0=0;MQRankSum=-0.668;QD=33.27;ReadPosRankSum=0.935 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,12:13:3:459,0,3 Chr10 39829126 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39861585 . C A 208.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=23.20;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:55:237,0,55 Chr10 39862467 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 39870944 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr10 39870950 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 39870960 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 39870966 . G C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 39870972 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 39871056 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 39876002 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39877800 . G C 45.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39882846 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39882859 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39882862 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 39882924 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 39882944 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39944475 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39944478 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.10;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39958646 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 39959859 . A G 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr10 39973447 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:68,0,57 Chr10 39978133 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 40021893 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40022215 . C A 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr10 40022221 . T C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr10 40029973 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:8:56:56,0,168 Chr10 40089010 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 40096844 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 40115602 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40116246 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 40116284 . A C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 40116287 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 40125369 . G A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr10 40125382 . A T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr10 40125383 . A C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9994;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr10 40130310 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 40130313 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 40130321 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 40130327 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 40130333 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 40130365 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 40152840 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:79,6,0 Chr10 40152909 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 40156320 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.91;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr10 40156342 . G T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 40156348 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 40156349 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 40156353 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 40156361 . C G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr10 40156370 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 40157659 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,142 Chr10 40157889 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:107,0,68 Chr10 40158851 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40159307 . G A 215.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;DP=50;Dels=0.00;FS=5.438;HaplotypeScore=4.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.201;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.327 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,10:50:99:244,0,1473 Chr10 40161248 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40166024 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 40166029 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40168319 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 40168355 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40169371 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 40170489 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:63,0,33 Chr10 40193243 . C G 36.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.34;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:26:65,0,26 Chr10 40201048 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40201051 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40201073 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40201080 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40201081 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40201118 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr10 40218932 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.96;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:58,0,33 Chr10 40218963 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.96;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr10 40245368 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr10 40245617 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 40248929 . G A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=15;Dels=0.00;FS=6.560;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.71;MQ0=1;MQRankSum=2.933;QD=8.45;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:155,0,254 Chr10 40248940 . C G 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.77;MQ0=1;QD=26.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:189,15,0 Chr10 40249171 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40278746 . C T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:53:53,0,306 Chr10 40279233 . A C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,71 Chr10 40279273 . T C 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr10 40279292 . A G 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.31;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr10 40291137 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40291150 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40291183 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 40291185 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 40348398 . C T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,103 Chr10 40348441 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,111 Chr10 40348462 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,103 Chr10 40394615 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:68,0,67 Chr10 40395772 . A T 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.94;MQ0=0;MQRankSum=-3.086;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.605 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,32:42:99:188,0,197 Chr10 40396073 . T A 39.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:68,0,23 Chr10 40401570 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.36;MQ0=1;QD=13.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:67,6,0 Chr10 40413344 . A C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.57;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:63:63,0,189 Chr10 40509238 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;DP=20;Dels=0.00;FS=9.442;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.484;QD=5.39;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:136,0,524 Chr10 40509258 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:102,0,29 Chr10 40515660 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40518555 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 40536699 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 40547629 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 40566689 . T A 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:64,0,26 Chr10 40566708 . C T 35.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:64,0,26 Chr10 40566735 . C T 29.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.12;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:58,0,30 Chr10 40566811 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:6:61:104,0,61 Chr10 40566815 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.7825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:29:106,0,29 Chr10 40566828 . G C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:57:96,0,57 Chr10 40566829 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:64:64,0,99 Chr10 40566830 . A G 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=10.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:64:89,0,64 Chr10 40567001 . C G 20.94 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.26;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:15:49,0,15 Chr10 40567569 . G T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:111,0,69 Chr10 40581435 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,176 Chr10 40582980 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:33:71,0,33 Chr10 40583008 . C T 43.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:72,0,26 Chr10 40585849 . T A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;DP=12;Dels=0.00;FS=6.021;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.479;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.664 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:83:83,0,304 Chr10 40586340 . A C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:103,0,109 Chr10 40589852 . G A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr10 40589855 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr10 40590651 . T A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr10 40590819 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,69 Chr10 40592125 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr10 40592949 . A G 93.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.929;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:122,0,299 Chr10 40595310 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 40599008 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 40599339 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 Chr10 40600523 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr10 40601471 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,107 Chr10 40601655 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,180 Chr10 40601684 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,222 Chr10 40601702 . C T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,297 Chr10 40602131 . C A 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=37;Dels=0.00;FS=11.431;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=2.40;ReadPosRankSum=-2.864 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:99:117,0,1129 Chr10 40602417 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:69:69,0,423 Chr10 40602487 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.345;QD=2.30;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,470 Chr10 40602488 . A C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.269;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:65:65,0,444 Chr10 40603783 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 40604654 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,72 Chr10 40605921 . C A 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:99,0,66 Chr10 40608178 . C A 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQ0=0;MQRankSum=1.559;QD=3.34;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:95:95,0,568 Chr10 40609504 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,125 Chr10 40609511 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,125 Chr10 40609513 . G A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:106,0,128 Chr10 40609522 . A G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:106,0,95 Chr10 40610208 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,243 Chr10 40610212 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,228 Chr10 40611096 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 40614158 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40616047 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40619108 . T A 451.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.783;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.255;QD=30.12;ReadPosRankSum=0.085 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,13:15:39:480,0,39 Chr10 40620943 . G A 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=19.35;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:80:183,0,80 Chr10 40620944 . A G 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:43:185,0,43 Chr10 40621055 . A G 65.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:94,0,25 Chr10 40621440 . G T 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr10 40621492 . T C 69.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:98,0,27 Chr10 40623041 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 40632949 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQ0=0;MQRankSum=1.084;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.084 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:112,0,473 Chr10 40637548 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 40637683 . C A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=12.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:104,0,103 Chr10 40637705 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=9.79;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:87:87,0,94 Chr10 40637726 . G T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:91:95,0,91 Chr10 40637737 . A C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:61:61,0,99 Chr10 40646339 . G A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,240 Chr10 40654200 . C A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.651;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.448 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:99:109,0,740 Chr10 40660329 . G A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr10 40660338 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr10 40660384 . G C 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:139,0,24 Chr10 40663145 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40664425 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 40664492 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr10 40664509 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr10 40684862 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40684865 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40685296 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,184 Chr10 40685698 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40698926 . C A 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:107,0,25 Chr10 40698927 . G A 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:107,0,26 Chr10 40698946 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr10 40698994 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 40715764 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:111,0,30 Chr10 40716066 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 40718579 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.06;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 40756176 . T C 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.99;MQ0=0;QD=5.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:97,9,0 Chr10 40756211 . A G 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.99;MQ0=0;QD=5.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:12:9:97,9,0 Chr10 40771523 . A G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.1014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:53:53,0,297 Chr10 40771530 . G C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.296;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:54:54,0,305 Chr10 40771547 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:54:54,0,296 Chr10 40771568 . T A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:54:54,0,306 Chr10 40773085 . G A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.017;DP=57;Dels=0.00;FS=4.192;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.01;MQ0=0;MQRankSum=-3.803;QD=0.94;ReadPosRankSum=-1.313 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,18:57:82:82,0,1114 Chr10 40779531 . G C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.24;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr10 40779809 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40779820 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40779885 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40783722 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=11.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:75,0,33 Chr10 40783845 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.776;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.214;QD=1.13;ReadPosRankSum=-3.142 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:62:62,0,987 Chr10 40790459 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40820453 . G T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr10 40822995 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.496;DP=93;Dels=0.00;FS=13.857;HaplotypeScore=13.7265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQ0=0;MQRankSum=-4.892;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.197 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:81,10:93:99:116,0,3005 Chr10 40823069 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,142 Chr10 40823135 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.18;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:53:53,0,133 Chr10 40831399 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr10 40837554 . T C 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.20;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:141,0,26 Chr10 40839644 . T C 253.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:282,21,0 Chr10 40839695 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr10 40852031 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 40852998 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 40854234 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40854736 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 40865236 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40866397 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 40866420 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 40866422 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 40866428 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 40874176 . T A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr10 40874188 . T C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.70;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr10 40876364 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40876403 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 40880105 . G A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr10 40880267 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 40880268 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 40880278 . A T 243.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:272,21,0 Chr10 40880285 . T A 225.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:254,21,0 Chr10 40880336 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 40884428 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,167 Chr10 40891387 . T G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 40891413 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 40891432 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 40891448 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 40891680 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40893990 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 40896605 . A T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 40902763 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 40903171 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 40903838 . A T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr10 40904237 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 40904280 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 40913051 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,258 Chr10 40915842 . G A 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr10 40915847 . T G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr10 40916876 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.438;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.118;QD=2.19;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:35:99:105,0,1133 Chr10 40917072 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr10 40935164 . G C 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr10 40936697 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40937005 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40961848 . C A 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr10 40962250 . A T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,105 Chr10 40962260 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,110 Chr10 40962271 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,106 Chr10 40962281 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,109 Chr10 40962305 . G C 80.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:109,0,26 Chr10 40963036 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,102 Chr10 40963353 . T A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 40967687 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 40969185 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:65,0,64 Chr10 40991238 . A G 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=16.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:143,0,104 Chr10 40996519 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,135 Chr10 40996544 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,112 Chr10 40996560 . G C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,110 Chr10 40996571 . A G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,105 Chr10 40997674 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 40997730 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 40997733 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 40997850 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 41007331 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:72,0,66 Chr10 41010519 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41010539 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41027655 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.480;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:51:51,0,303 Chr10 41027813 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,221 Chr10 41029885 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 41037414 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 41040593 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 41050161 . T A 115.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:144,0,24 Chr10 41052846 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 41057076 . G C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 41057142 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr10 41063079 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41065082 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 41084702 . G T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 41084720 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr10 41084723 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr10 41084735 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr10 41091446 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr10 41093674 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41097507 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 41098331 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,184 Chr10 41102305 . A G 418.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=26.17;ReadPosRankSum=-1.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,12:16:99:447,0,120 Chr10 41102714 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 41118584 . A T 123.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:152,0,27 Chr10 41120123 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,197 Chr10 41120830 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr10 41131775 . T G 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,215 Chr10 41138902 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr10 41139014 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 41141932 . C A 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.567;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.204;QD=2.76;ReadPosRankSum=-3.830 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,6:35:99:125,0,1075 Chr10 41142244 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 41155960 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41155963 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 41156800 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,67 Chr10 41156811 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 41167959 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 41172723 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 41174559 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 41174593 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41190349 . C T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.06;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 41190359 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.06;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr10 41190383 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:61,0,64 Chr10 41190395 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,69 Chr10 41190401 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.44;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:60,0,64 Chr10 41190439 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 41190451 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41202303 . A T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.203;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.689 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:88:88,0,701 Chr10 41206071 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41206105 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 41207676 . A G 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:134,0,58 Chr10 41207701 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 41207737 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 41208315 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41208595 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:75,0,28 Chr10 41209405 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr10 41214289 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 41215020 . G C 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.6215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,105 Chr10 41226670 . T C 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:149,0,66 Chr10 41241028 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr10 41241034 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr10 41241074 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.48;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:30:69,0,30 Chr10 41242386 . C G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,179 Chr10 41242387 . A G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,179 Chr10 41242389 . T A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.98;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,179 Chr10 41244680 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 41244687 . T G 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 41244709 . G C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 41244730 . T A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 41244748 . G T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr10 41245206 . T G 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.66;MQ0=2;MQRankSum=-0.937;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:62:62,0,92 Chr10 41248641 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 41253625 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,72 Chr10 41253635 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,72 Chr10 41254204 . C T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr10 41263441 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:83,6,0 Chr10 41283653 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.18;MQ0=0;QD=12.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:89,9,0 Chr10 41288439 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.05;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=-0.143 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:29:50,0,29 Chr10 41313705 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41315431 . T A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.066;QD=1.60;ReadPosRankSum=-1.896 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:57:57,0,515 Chr10 41360757 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 41362330 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41362379 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41366391 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41366398 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41366431 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41380432 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41385594 . C A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr10 41400917 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41408673 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41419165 . A T 149.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:178,15,0 Chr10 41419174 . A T 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:155,12,0 Chr10 41419182 . G C 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr10 41419192 . G A 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr10 41419198 . G A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.06;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:161,12,0 Chr10 41419570 . G A 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr10 41420830 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 41438803 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 41439849 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 41445404 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 41456125 . C A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr10 41457573 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,100 Chr10 41457605 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr10 41461329 . C A 112.18 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.44;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:10:140,0,10 Chr10 41462530 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 41463370 . T A 213.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:242,18,0 Chr10 41463377 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr10 41464822 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41464861 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 41465017 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 41465033 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 41467651 . G T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr10 41468157 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr10 41468192 . T C 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr10 41475747 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41475756 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41475758 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 41475797 . T G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 41475810 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 41476363 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 41476370 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41477907 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 41477951 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr10 41478071 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr10 41488520 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 41488636 . A G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.79;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr10 41489433 . T G 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:68,0,26 Chr10 41493165 . T G 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=22.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:189,0,63 Chr10 41493174 . T C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:63:63,0,187 Chr10 41493183 . A C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,185 Chr10 41493185 . T G 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.221;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,185 Chr10 41493211 . T C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:102,0,186 Chr10 41493535 . T C 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=11.53;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:132,0,184 Chr10 41493824 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41493836 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41493845 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41494578 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.733;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.271;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,301 Chr10 41494611 . A G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,303 Chr10 41494735 . G C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.80;MQ0=0;QD=28.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr10 41500136 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 41500174 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 41500191 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 41500223 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 41504843 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41510598 . T G 284.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:313,24,0 Chr10 41510604 . A G 283.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:312,24,0 Chr10 41510621 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr10 41521587 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,127 Chr10 41521629 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr10 41522494 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 41530451 . T C 120.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:65:149,0,65 Chr10 41547519 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 41547538 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41551846 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 41551850 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 41553507 . A T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,262 Chr10 41559715 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41568590 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 41598444 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 41611375 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 41611667 . T G 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr10 41616210 . G T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:146,0,105 Chr10 41618604 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41618618 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41619773 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr10 41619814 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41619816 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41619827 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41619863 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 41648986 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41649013 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 41649024 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 41649034 . A T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 41668042 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,71 Chr10 41668118 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41668119 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 41680833 . G A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,235 Chr10 41682260 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 41693675 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr10 41711571 . G A 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr10 41713006 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,163 Chr10 41713144 . A T 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.230;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.571;QD=4.79;ReadPosRankSum=-3.317 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:124,0,549 Chr10 41728811 . C A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.891;DP=41;Dels=0.00;FS=8.346;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.277;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.018 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:106,0,1317 Chr10 41733891 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 41736427 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr10 41736481 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 41739057 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41739233 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr10 41743838 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:71,0,55 Chr10 41767319 . A G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr10 41767329 . C G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr10 41767342 . C A 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr10 41767349 . A G 75.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=18.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:103,12,0 Chr10 41769563 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 41772500 . T C 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.071;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=28.0287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.236;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:78:78,0,557 Chr10 41774307 . G A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.119;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.690;QD=0.70;ReadPosRankSum=-0.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,4:38:55:55,0,1303 Chr10 41790489 . C A 50.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:26:79,0,26 Chr10 41803175 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 41803193 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41805196 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 41808039 . A G 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:111,0,67 Chr10 41808807 . T A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,208 Chr10 41808894 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.733;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,302 Chr10 41816725 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 41816754 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 41817321 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 41821309 . A C 556.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:585,42,0 Chr10 41828124 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr10 41831464 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41841383 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 41841759 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:58:135,0,58 Chr10 41844360 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:69:69,0,111 Chr10 41844372 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,111 Chr10 41844393 . T C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr10 41876769 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41879442 . C T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:70,0,67 Chr10 41886775 . A T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.6988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:106,0,146 Chr10 41887445 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=3.010;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.683 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:85:85,0,194 Chr10 41892012 . G A 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:106,0,65 Chr10 41892072 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:102,0,68 Chr10 41895376 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,170 Chr10 41895415 . A G 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.754;QD=16.25;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:142,0,101 Chr10 41895478 . G A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.368;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.421 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:129,0,120 Chr10 41896246 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 41899596 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 41904830 . C A 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.197;QD=6.10;ReadPosRankSum=-3.253 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,5:18:99:138,0,478 Chr10 41904980 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:208,15,0 Chr10 41905427 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr10 41915577 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 41915862 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr10 41918604 . T C 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr10 41918633 . C G 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr10 41918650 . A G 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr10 41918652 . A T 151.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=30.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:180,15,0 Chr10 41918688 . G T 157.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.61;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:186,15,0 Chr10 41924733 . A C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 41924745 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr10 41924755 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr10 41939843 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:63:63,0,189 Chr10 41944301 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr10 41972538 . G A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 41972539 . C T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 41972554 . T A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 41972560 . A T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr10 41974001 . C T 45.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:74,0,24 Chr10 41977956 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr10 41988219 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42004674 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 42014142 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 42015202 . T A 32.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:19:61,0,19 Chr10 42015230 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 42015290 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42017690 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42017695 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 42017705 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42017717 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42021791 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 42063751 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42064676 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 42065597 . A C 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr10 42069249 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 42069273 . C T 44.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:85,6,0 Chr10 42071512 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42071523 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42071531 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42077891 . T G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr10 42086623 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42102514 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42102550 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42104492 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr10 42104510 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 42106705 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr10 42106707 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 42111797 . G T 192.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;DP=13;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.200;QD=14.83;ReadPosRankSum=-2.281 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,7:13:99:221,0,182 Chr10 42119485 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 42119487 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42127752 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42155440 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 42155468 . A C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr10 42156299 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 42156309 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 42156310 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr10 42156751 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:60,0,137 Chr10 42158016 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr10 42173587 . T A 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr10 42174818 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,101 Chr10 42176009 . T C 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=17.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60:135,0,60 Chr10 42177007 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr10 42182417 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:71,0,58 Chr10 42198104 . C A 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.150;DP=73;Dels=0.00;FS=16.611;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.056;QD=1.31;ReadPosRankSum=-4.836 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:63,9:73:99:124,0,2289 Chr10 42205252 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr10 42232989 . C A 303.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:332,24,0 Chr10 42232990 . A T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.52 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr10 42233997 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr10 42234481 . C G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:63,0,33 Chr10 42234600 . G A 92.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.896;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:121,0,239 Chr10 42255452 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:79:79,0,409 Chr10 42255456 . G A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.156;QD=3.77;ReadPosRankSum=-0.623 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:81:81,0,401 Chr10 42275702 . T C 72.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:101,0,27 Chr10 42283214 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42283222 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42285573 . C G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:108,0,30 Chr10 42285909 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42307033 . T A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,244 Chr10 42307034 . A T 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=5.88;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:87:87,0,241 Chr10 42308308 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,176 Chr10 42308443 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42313966 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.478 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:60:60,0,668 Chr10 42314150 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,110 Chr10 42314231 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42314237 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 42315044 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr10 42315055 . C A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr10 42315505 . A G 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr10 42319023 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 42319031 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42319032 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr10 42319035 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.78;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 42319203 . G C 1362.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,33:33:99:1391,99,0 Chr10 42319312 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 42329813 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42337266 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 42337275 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 42347134 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42347169 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42347187 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42347193 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42358388 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.26;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:51:51,0,169 Chr10 42374197 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42374496 . A T 155.79 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:6:15:204,15,0 Chr10 42374499 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr10 42374512 . C A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr10 42374513 . A T 252.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:281,21,0 Chr10 42401445 . T C 73.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.20;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.46;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:18:102,0,18 Chr10 42413524 . G A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=16.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:110,0,61 Chr10 42425073 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 42425234 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42425235 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42429631 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 42429664 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 42430355 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr10 42437637 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42438607 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42451583 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 42473869 . T G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,68 Chr10 42474675 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:62,0,63 Chr10 42474824 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 42474886 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,228 Chr10 42474912 . G A 190.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=23.85;ReadPosRankSum=1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:56:219,0,56 Chr10 42481460 . A G 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr10 42481474 . C T 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:164,12,0 Chr10 42487487 . A T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.79;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr10 42491134 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42502392 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,207 Chr10 42503501 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42504521 . T A 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr10 42504533 . C T 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr10 42506050 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42506066 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42510821 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42525144 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42525145 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 42525147 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 42528133 . C A 158.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.321;QD=3.97;ReadPosRankSum=-4.345 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,8:40:99:187,0,1195 Chr10 42541635 . A C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42541648 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42541662 . G C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42541664 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42541665 . G T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42541699 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=10.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:49,6,0 Chr10 42546130 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42546133 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42550615 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.096;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.775 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:50:50,0,706 Chr10 42550743 . G T 166.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.047;QD=13.90;ReadPosRankSum=-2.843 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:99:195,0,202 Chr10 42568161 . A T 136.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:165,0,24 Chr10 42575435 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:76,6,0 Chr10 42580903 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 42589978 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 42590073 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=4.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,178 Chr10 42590201 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr10 42590209 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr10 42590211 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr10 42590233 . C T 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:57,0,30 Chr10 42594937 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42605344 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 42609048 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr10 42609475 . T C 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr10 42609476 . A T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr10 42609477 . G T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr10 42609504 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42614425 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 42614442 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42643848 . G T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=21.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:63:182,0,63 Chr10 42662196 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 42712577 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42712830 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42722724 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42728278 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr10 42732091 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 42752544 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;DP=20;Dels=0.00;FS=2.831;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.318;QD=1.19;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:52:52,0,599 Chr10 42769361 . C A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.479;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.109;QD=3.81;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:74:74,0,315 Chr10 42786197 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42789002 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 42789031 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr10 42789053 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 42789133 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42789243 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42789245 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 42789827 . G A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQ0=0;MQRankSum=-0.636;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:115,0,347 Chr10 42791148 . C G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr10 42791179 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:72,0,30 Chr10 42791205 . G A 43.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:72,0,27 Chr10 42791681 . A T 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:102,0,27 Chr10 42855936 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42872766 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,437 Chr10 42872863 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr10 42876329 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42879685 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 42884549 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr10 42891357 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr10 42912730 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 42912762 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr10 42928664 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 42929156 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 42929726 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 42933806 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 42934173 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 42935068 . G A 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr10 42960073 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr10 42963951 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,127 Chr10 42963954 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,138 Chr10 42963956 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,129 Chr10 42964946 . A T 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.54;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:91:130,0,91 Chr10 42964988 . C G 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:141,0,138 Chr10 42969835 . G A 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.35;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr10 42971711 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,72 Chr10 42980116 . A T 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:146,0,99 Chr10 42981974 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 42984719 . A G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.597;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.246;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.597 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:133,0,251 Chr10 42984724 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.296;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.532 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,341 Chr10 42984729 . C T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.8306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,330 Chr10 42984957 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 42985079 . C G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.54;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:88:88,0,132 Chr10 42991511 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:116,9,0 Chr10 42991512 . T C 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr10 42991550 . T A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr10 42991556 . T A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr10 43002549 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr10 43009367 . T C 151.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:180,0,18 Chr10 43009558 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:59,0,65 Chr10 43039675 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 43039680 . G T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr10 43045875 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;DP=19;Dels=0.00;FS=6.419;HaplotypeScore=13.6937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.280;QD=1.46;ReadPosRankSum=-2.516 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:56:56,0,547 Chr10 43056683 . G T 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr10 43057438 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr10 43057456 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr10 43057750 . G C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr10 43057785 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr10 43057789 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr10 43058006 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr10 43058294 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 43058330 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 43058367 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 43058376 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 43058455 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43059251 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr10 43064280 . C T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=14.82;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98:132,0,98 Chr10 43068648 . A C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr10 43070944 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr10 43070961 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43071095 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr10 43071232 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr10 43071246 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr10 43077644 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43079499 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr10 43079526 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr10 43079947 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr10 43081156 . A C 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr10 43083130 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:101,0,65 Chr10 43083155 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr10 43087137 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,100 Chr10 43089684 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43093114 . G T 162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.452;DP=14;Dels=0.00;FS=34.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.323;QD=11.63;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:191,0,271 Chr10 43094259 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr10 43118588 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.44;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr10 43118607 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.44;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr10 43118639 . T G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.44;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr10 43119345 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 43119382 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43119397 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr10 43119408 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43162728 . C A 91.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.289;QD=7.65;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:120,0,291 Chr10 43164886 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43172473 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;DP=34;Dels=0.00;FS=13.326;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.535;QD=1.79;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:89:89,0,1059 Chr10 43180745 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr10 43192357 . T C 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr10 43192375 . T C 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr10 43192376 . C T 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.24 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr10 43192442 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.678;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.398;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:135,0,254 Chr10 43192450 . T C 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=25.185;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.278;QD=9.71;ReadPosRankSum=2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:135,0,244 Chr10 43198725 . G C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:59:59,0,123 Chr10 43208089 . A C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:66:66,0,478 Chr10 43249367 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:65,0,32 Chr10 43266674 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.55;MQ0=4;QD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:6:49,6,0 Chr11 34358 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 34731 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 38540 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 39244 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.614;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.404;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,454 Chr11 40784 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43168 . C G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 43414 . C A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=17.11;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:98:148,0,98 Chr11 48823 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 48832 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 50234 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 50559 . A G 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr11 64353 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 64413 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 68010 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 102164 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 105351 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 105394 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 124552 . G C 82.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:111,0,24 Chr11 141960 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 141984 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr11 143165 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 143172 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 143187 . A T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 143189 . C G 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.22;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 144425 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 151190 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 153798 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 155080 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-3.240;QD=0.79;ReadPosRankSum=-3.240 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,4:35:56:56,0,1185 Chr11 155180 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;DP=46;Dels=0.00;FS=21.041;HaplotypeScore=5.6696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=4.97;ReadPosRankSum=3.023 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,10:46:99:257,0,1255 Chr11 155184 . A T 237.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.027;DP=45;Dels=0.00;FS=16.244;HaplotypeScore=5.6696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.021;QD=5.28;ReadPosRankSum=2.343 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:266,0,971 Chr11 155500 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 158775 . G C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.90;MQ0=0;QD=16.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:112,9,0 Chr11 164726 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 164748 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 169981 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 169988 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 175492 . T G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 175512 . T G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 177270 . G T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;DP=19;Dels=0.00;FS=9.745;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.972;QD=5.46;ReadPosRankSum=-3.287 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:132,0,486 Chr11 217859 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:69,0,30 Chr11 235449 . G T 37.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr11 239967 . A T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;DP=21;Dels=0.00;FS=2.740;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.030;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.373 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:90:90,0,592 Chr11 246542 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=2.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,221 Chr11 249573 . A G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.77;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.91;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:72,6,0 Chr11 258499 . C A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,101 Chr11 271160 . G T 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=7.65;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:143,0,366 Chr11 280186 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,180 Chr11 294035 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 294935 . C A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 301707 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 310121 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 310170 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 313712 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 321576 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 324949 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 324969 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 396609 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.48;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr11 400405 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 402636 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 402656 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 408646 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 408652 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 409051 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,181 Chr11 416798 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 424748 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 424789 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 425522 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 425525 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.08;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 450464 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 476145 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 476775 . G A 264.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:293,24,0 Chr11 487019 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 491779 . T C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.452;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.759 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:56:56,0,661 Chr11 498138 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 500567 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.970;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=8.62;ReadPosRankSum=-3.950 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:235,0,534 Chr11 501337 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=0;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:72,6,0 Chr11 505213 . C T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr11 505224 . A C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 506054 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 516897 . T A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr11 523690 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 591609 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.22;MQ0=0;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:65,6,0 Chr11 602665 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 602669 . C G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 602715 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 610709 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 618606 . A G 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr11 623795 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 623804 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 637685 . T C 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.67;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr11 637687 . C T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.67;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr11 637752 . G T 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.53;MQ0=30;QD=1.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,28:33:9:79,9,0 Chr11 640183 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr11 642325 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,104 Chr11 645312 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.39;MQ0=0;QD=10.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:71,6,0 Chr11 645380 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.98;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=8.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:71,6,0 Chr11 665161 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 668000 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 668023 . T G 110.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:139,0,27 Chr11 668084 . G A 113.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:142,0,24 Chr11 669079 . C G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 671054 . T G 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.237;DP=15;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.938;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.505 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:82:82,0,443 Chr11 676437 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 715735 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.19;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:52:53,0,52 Chr11 721113 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr11 721555 . G A 186.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.70;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:15:215,0,15 Chr11 721606 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 726788 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 727195 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 727327 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 727446 . T A 181.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=25.98;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:18:210,0,18 Chr11 727761 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 730034 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 739321 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:91:91,0,169 Chr11 742877 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,267 Chr11 743816 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.693 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:51:51,0,477 Chr11 745255 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 758339 . G A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.429;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.061;QD=8.85;ReadPosRankSum=0.551 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:161,0,335 Chr11 758352 . A G 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.047;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.047;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.465 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:99:99,0,590 Chr11 758811 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 760535 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 767143 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 768267 . T C 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;DP=19;Dels=0.00;FS=14.880;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.787;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.787 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,5:19:99:148,0,528 Chr11 770176 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:73:73,0,209 Chr11 770194 . T C 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.248;QD=7.31;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:94:94,0,225 Chr11 770197 . G C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=7.53;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:96:96,0,222 Chr11 770210 . C T 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:90:90,0,217 Chr11 770535 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr11 770545 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 781494 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,237 Chr11 783486 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 784979 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 788440 . T A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 788441 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 789147 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 789756 . A C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 789801 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 800595 . A G 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,99 Chr11 820874 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 Chr11 823893 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 823912 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 838559 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 838592 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 859003 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 859032 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 859033 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 865931 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 891651 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:60:60,0,186 Chr11 900278 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 907368 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 907786 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:48:68,0,48 Chr11 907792 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.22;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr11 915768 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 915798 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 915808 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 915837 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr11 917711 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:71,0,32 Chr11 932887 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:5:63:67,0,63 Chr11 941389 . A C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.071;QD=2.34;ReadPosRankSum=-1.449 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:68:68,0,509 Chr11 945249 . G T 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr11 945285 . T A 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr11 960342 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 961218 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 961292 . A T 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr11 964738 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 965135 . A G 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.768;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.909;QD=5.84;ReadPosRankSum=-2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:110,0,365 Chr11 965136 . A T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.202;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-1.626;QD=5.84;ReadPosRankSum=-2.758 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:110,0,350 Chr11 965157 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=5.880;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=3.05;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:71:71,0,387 Chr11 965170 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr11 965171 . C A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.09;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr11 965175 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr11 965177 . A G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.09;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:101,0,30 Chr11 965601 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:71,0,63 Chr11 965620 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr11 965761 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,196 Chr11 968513 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 968615 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,146 Chr11 968780 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.46;ReadPosRankSum=-0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:109,0,108 Chr11 972029 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 972460 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 973089 . G T 124.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:153,0,27 Chr11 981731 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.361;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.505;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:73:73,0,445 Chr11 991917 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.212;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.212 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:21:65:65,0,650 Chr11 991986 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:55:55,0,261 Chr11 992784 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 992826 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 992864 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 997081 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:61:72,0,61 Chr11 998150 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.694;QD=6.83;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:117,0,331 Chr11 1008793 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1008827 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1008854 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1009423 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr11 1018373 . C A 135.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:164,15,0 Chr11 1021249 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.122;QD=2.47;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:85:85,0,688 Chr11 1026624 . T C 114.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:143,0,27 Chr11 1033399 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1033454 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1047267 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1047363 . T A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,190 Chr11 1048384 . G A 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.078;DP=43;Dels=0.00;FS=1.523;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.014;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.389 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,8:43:99:188,0,1252 Chr11 1055531 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1067386 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 1073038 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1079103 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 1079109 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 1080841 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1080853 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1086133 . G C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 1088607 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 1090798 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 1090802 . C G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 1090864 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1090887 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1093797 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 1093927 . C G 41.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:70,0,23 Chr11 1105599 . T A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.588;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.059;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,582 Chr11 1112022 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 1112040 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 1114570 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.66;MQ0=3;MQRankSum=0.358;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:29:101,0,29 Chr11 1154736 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1154738 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1166428 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1167402 . G T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.164;QD=7.98;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:148,0,360 Chr11 1167485 . T A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;DP=33;Dels=0.00;FS=12.234;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.490;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:33:99:132,0,984 Chr11 1167629 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.134;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:91:91,0,603 Chr11 1167945 . A C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.854;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.558 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:50:50,0,683 Chr11 1167955 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.754;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:60:60,0,680 Chr11 1168377 . C T 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr11 1176011 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 1176387 . A G 105.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:20:134,0,20 Chr11 1182798 . C A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 1197843 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.449;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.029;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.630 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:40,5:45:57:57,0,1503 Chr11 1197939 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 1202926 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:72,0,32 Chr11 1202994 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 1203011 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr11 1203137 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 1203754 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=8.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:71,0,64 Chr11 1206919 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,69 Chr11 1209864 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 1213323 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1213329 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 1213339 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1213345 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 1219022 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,99 Chr11 1220658 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1220671 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1221539 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1225456 . A C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr11 1225460 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr11 1246164 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 1254522 . T A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.746;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.698;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.524 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,5:20:99:136,0,511 Chr11 1259507 . G T 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.937;QD=14.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:88:133,0,88 Chr11 1259595 . T A 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr11 1259600 . T C 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr11 1259706 . T C 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr11 1262291 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1262298 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1262319 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1262603 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1263631 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 1263638 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 1263641 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 1263653 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1264124 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 1268153 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQ0=0;MQRankSum=-1.775;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.423 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:74:74,0,323 Chr11 1270848 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.106;QD=4.62;ReadPosRankSum=1.106 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,284 Chr11 1279557 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 1280008 . G C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 1290879 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 1291493 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1291510 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1291525 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1309294 . T C 115.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:144,0,25 Chr11 1309302 . C T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr11 1309962 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:123,0,167 Chr11 1313637 . G T 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr11 1319921 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1319940 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 1320186 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1320188 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1322949 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 1322952 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1322957 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1322966 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 1329025 . A C 376.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.053;QD=20.93;ReadPosRankSum=-0.158 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,12:18:99:405,0,147 Chr11 1333972 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1345376 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.931;DP=43;Dels=0.00;FS=54.290;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.049;QD=2.62;ReadPosRankSum=-4.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:141,0,1336 Chr11 1365100 . A T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;DP=56;Dels=0.00;FS=25.472;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.768;QD=1.28;ReadPosRankSum=-2.824 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:49,7:56:99:100,0,1823 Chr11 1365610 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1365631 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 1369564 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 1373241 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1373965 . C G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 1375633 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 1381823 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1382982 . A C 96.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=16.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:53:125,0,53 Chr11 1391880 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1392906 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.003;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=2.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,333 Chr11 1414648 . T C 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:109,0,66 Chr11 1414651 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=15.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:108,0,65 Chr11 1414689 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:112,0,69 Chr11 1414707 . C T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:112,0,69 Chr11 1417763 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 1417827 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr11 1418194 . G C 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr11 1418199 . C T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 1418209 . A T 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr11 1418245 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:126,9,0 Chr11 1420454 . A T 158.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.46;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:187,0,24 Chr11 1420484 . A G 165.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=23.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:194,0,21 Chr11 1420543 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 1425706 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:109,0,29 Chr11 1426485 . C A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 1432821 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 1435716 . C T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,109 Chr11 1435742 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:68:68,0,109 Chr11 1435753 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:58:58,0,90 Chr11 1435771 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,96 Chr11 1436407 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1436452 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1436463 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1459060 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,67 Chr11 1459090 . C G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.623;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.401 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:77:77,0,396 Chr11 1459099 . C T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.401;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.156 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:79:79,0,411 Chr11 1459306 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,67 Chr11 1469243 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 1473759 . A T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr11 1473815 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1514865 . A G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 1514875 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 1514879 . A C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 1514896 . T G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 1514900 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 1524751 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1534766 . T G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 1553384 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 1553855 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr11 1553896 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 1553898 . A G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 1575989 . T C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 1576000 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 1581857 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1581899 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1586900 . C G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 1586907 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 1586916 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.68;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 1591972 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 1591990 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1591998 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 1592313 . T A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 1593323 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=29.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 1593346 . T C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 1593360 . C G 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr11 1593366 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 1593369 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 1593371 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 1593378 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 1593394 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 1593407 . T C 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.36;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 1594487 . A G 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:56:56,0,136 Chr11 1600392 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1600425 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 1600429 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 1600718 . A T 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.091;DP=34;Dels=0.00;FS=25.457;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.146;QD=1.79;ReadPosRankSum=-3.404 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:89:89,0,1070 Chr11 1604815 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 1613473 . T C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.807;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.076 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:53:53,0,446 Chr11 1614908 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 1614992 . G A 63.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:91,9,0 Chr11 1616164 . C G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:69,0,31 Chr11 1618057 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 1620534 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1622992 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1624531 . C A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr11 1632508 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,107 Chr11 1634722 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.806;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.080;QD=0.70;ReadPosRankSum=-3.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,4:34:52:52,0,1123 Chr11 1638347 . C A 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;DP=28;Dels=0.00;FS=9.040;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.540;QD=2.67;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:103,0,820 Chr11 1645056 . C T 214.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:243,18,0 Chr11 1647520 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.1524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.271;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:66:66,0,231 Chr11 1656674 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 1658290 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 1661153 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.326;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.326 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:123,0,409 Chr11 1662422 . A C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,221 Chr11 1670143 . T G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 1670158 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 1685105 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1685128 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 1685155 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1687380 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1687392 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1687438 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 1687470 . C A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 1691422 . T A 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr11 1691430 . A C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 1698618 . G T 193.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.687;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.483;QD=6.92;ReadPosRankSum=-3.280 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,8:28:99:222,0,729 Chr11 1698714 . C A 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.858;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.764;QD=3.48;ReadPosRankSum=-4.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:157,0,1117 Chr11 1716383 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1716384 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1716390 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1716394 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1716405 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1723520 . A C 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.95;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:103,0,67 Chr11 1723523 . A C 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:92,0,66 Chr11 1723530 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=12.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:89,0,67 Chr11 1725503 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 1725513 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 1725641 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1733077 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 1737616 . G T 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.33;MQ0=1;QD=25.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:153,12,0 Chr11 1746304 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 1749548 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 1749575 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1757508 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1776674 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 1776882 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1781636 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 1781651 . C G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 1781684 . A G 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 1785606 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1796364 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 1796383 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1799846 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1800827 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 1803927 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1807181 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 1807249 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1812792 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1812800 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1827359 . C A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 1828693 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 1831482 . G A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.29;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:96:96,0,102 Chr11 1831849 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.755;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:114,0,466 Chr11 1832379 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 1836713 . G T 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr11 1836780 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 1837532 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 1837581 . C A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 1842309 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 1842319 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 1843922 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr11 1843960 . C T 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:103,0,26 Chr11 1845635 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1851327 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1851328 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 1854407 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 1858004 . C A 312.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:341,27,0 Chr11 1858329 . A C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 1858481 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 1858505 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 1862686 . C G 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 1862696 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 1878550 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1878551 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1901871 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1948792 . T A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 1954900 . G A 207.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:236,21,0 Chr11 1968335 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.589;QD=1.98;ReadPosRankSum=-1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,339 Chr11 1979312 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1986197 . C T 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:110,0,26 Chr11 1986228 . T C 118.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:147,0,27 Chr11 1993637 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 1993816 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.85;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:51:51,0,209 Chr11 1994080 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 1994990 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,67 Chr11 1995553 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1995565 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 1996562 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 1997221 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 1997377 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr11 2007752 . T A 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr11 2007753 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 2007795 . C G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 2007801 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 2007821 . G C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 2007835 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2008418 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 2008423 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2008436 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2009587 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2011320 . G A 144.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.14;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:20:173,0,20 Chr11 2029964 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr11 2035692 . C A 149.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.380;QD=9.36;ReadPosRankSum=-2.332 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:178,0,338 Chr11 2035711 . T C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,99 Chr11 2035876 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.807 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:73:73,0,480 Chr11 2035957 . G C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.804;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,409 Chr11 2087172 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 2090249 . T A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;DP=54;Dels=0.00;FS=15.497;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.619;QD=0.74;ReadPosRankSum=-3.977 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,6:54:68:68,0,1698 Chr11 2106947 . G A 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.729;QD=17.31;ReadPosRankSum=-0.361 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:184,0,131 Chr11 2114146 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2116199 . C A 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr11 2119195 . T A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.135 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:78:78,0,485 Chr11 2119918 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2131337 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,68 Chr11 2131340 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,70 Chr11 2131348 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:71,0,68 Chr11 2131349 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr11 2131394 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr11 2144068 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.450;QD=3.57;ReadPosRankSum=0.250 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:96:96,0,513 Chr11 2144461 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr11 2144465 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr11 2144492 . A C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,174 Chr11 2144517 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,186 Chr11 2144519 . G C 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,182 Chr11 2145680 . C G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:108,0,107 Chr11 2153187 . T G 163.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=20.47;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:37:192,0,37 Chr11 2164910 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=8.85;ReadPosRankSum=-1.517 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:99,0,185 Chr11 2172326 . G T 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr11 2172349 . G A 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr11 2178021 . A C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.03 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 2189442 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.72;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:58:58,0,220 Chr11 2189454 . C A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,225 Chr11 2192740 . G A 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.555;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.740 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:85:85,0,341 Chr11 2192943 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 2209985 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 2210016 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 2210026 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 2210036 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2210042 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2210055 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2212948 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 2226814 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.441;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.189 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:67:67,0,486 Chr11 2227317 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.606;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.254;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,362 Chr11 2233712 . A C 194.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=27.83;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:223,0,21 Chr11 2251172 . T A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr11 2251177 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:66:66,0,147 Chr11 2251221 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.68;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:61:61,0,182 Chr11 2262237 . T C 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.103;QD=14.28;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:171,0,174 Chr11 2262957 . A T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,129 Chr11 2262983 . C G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 2263025 . G C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 2263039 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 2263050 . A G 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr11 2271526 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 2279501 . C T 37.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2360089 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 2360160 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2376660 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2380343 . T C 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380346 . T A 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380353 . A T 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380358 . C G 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380405 . G A 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380408 . G A 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380414 . G A 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2380423 . A G 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.14;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 2415289 . G T 676.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.031;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.998;QD=21.15;ReadPosRankSum=0.153 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,19:32:99:705,0,434 Chr11 2454827 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2454853 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2454871 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2471373 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 2471387 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 2471415 . G T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 2492725 . G T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,312 Chr11 2492805 . T A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.807;DP=38;Dels=0.00;FS=23.992;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.080;QD=1.28;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:77:77,0,1235 Chr11 2493974 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 2493977 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 2503324 . A T 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 2505640 . A G 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 2505641 . A T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 2513125 . T A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.39;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 2525122 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2525149 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 2525631 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2530935 . A C 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 Chr11 2530942 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr11 2530970 . A C 222.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:251,18,0 Chr11 2530971 . C T 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 Chr11 2530988 . T C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr11 2533374 . G A 95.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr11 2555060 . G T 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 2555090 . T C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 2562026 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 2594839 . C A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr11 2594891 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 2595261 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 2627931 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.532;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.397;QD=1.39;ReadPosRankSum=-3.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,4:30:70:70,0,952 Chr11 2638752 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 2640685 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 2642891 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2642896 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2642897 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2642905 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2642928 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 2642951 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 2645782 . A C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 2660959 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 2661007 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 2672264 . C T 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr11 2672282 . T C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 2678292 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=13.1546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.478;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.531 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:58:58,0,419 Chr11 2678358 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2701178 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 2702113 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2702358 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 2726376 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr11 2729464 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2734891 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 2744517 . C T 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 2761902 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 2764003 . C A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.74 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 2767400 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:60:71,0,60 Chr11 2767528 . A T 125.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:154,0,26 Chr11 2795025 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 2796086 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2798300 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2800257 . T A 370.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.34;MQ0=0;MQRankSum=-2.647;QD=26.48;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,11:14:84:399,0,84 Chr11 2813909 . T G 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 2820260 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.52;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 2820274 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.52;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2820277 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2823480 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.752;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.212;QD=1.34;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:55:55,0,637 Chr11 2824053 . G C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 2824084 . C G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 2827487 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 2827528 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2835851 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 2837954 . G T 63.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.684;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:92:92,0,168 Chr11 2840591 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 2884703 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2884718 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 2885266 . G A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr11 2885723 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 2890499 . G A 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=15.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:105,0,26 Chr11 2891045 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.739;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.950;QD=1.62;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:59:59,0,599 Chr11 2924453 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 2967953 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:101,0,63 Chr11 2968881 . A G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;DP=82;Dels=0.00;FS=21.976;HaplotypeScore=9.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.195;QD=0.53;ReadPosRankSum=-4.634 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:74,8:82:72:72,0,2740 Chr11 2971948 . A C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 2972908 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr11 2972916 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr11 2972918 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr11 2973802 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 2987875 . G T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:115,0,28 Chr11 2987893 . C T 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:114,0,29 Chr11 2987913 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:28:114,0,28 Chr11 2987914 . T A 86.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:25:115,0,25 Chr11 3005721 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3005727 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 3005773 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 3014543 . C T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 3028361 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 3032202 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3032205 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3044730 . C A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.034;DP=12;Dels=0.00;FS=2.932;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.185;QD=3.98;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:76:76,0,323 Chr11 3049651 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:70,0,29 Chr11 3059693 . T C 137.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=22.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:166,0,21 Chr11 3089502 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:66:66,0,67 Chr11 3089513 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr11 3089543 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:62:72,0,62 Chr11 3100275 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 3100276 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 3100296 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 3101086 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3101413 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr11 3102980 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 3104149 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3104167 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3104985 . G T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,183 Chr11 3105081 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 3107416 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3107417 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 3107746 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 3118716 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:57:57,0,72 Chr11 3120116 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 3128442 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3139388 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 3140252 . T A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 3140318 . A G 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 3159714 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3159737 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 3159764 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3164029 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.985;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.041;QD=1.27;ReadPosRankSum=-3.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,5:40:79:79,0,1318 Chr11 3165074 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 3179758 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 3206267 . A G 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.82;ReadPosRankSum=-0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,147 Chr11 3214119 . C T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr11 3216672 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr11 3216673 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr11 3220156 . T G 35.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:64,0,23 Chr11 3220384 . A T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:98:98,0,142 Chr11 3220386 . G A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.82;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:97:97,0,134 Chr11 3223001 . A C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 3223033 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 3223062 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 3227628 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,184 Chr11 3237966 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 3245016 . G C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=5.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:56:56,0,111 Chr11 3247942 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 3275124 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:64,0,51 Chr11 3286158 . T A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 3288670 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr11 3291335 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr11 3291376 . A T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:63:112,0,63 Chr11 3304714 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:72,0,71 Chr11 3304716 . G T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr11 3304717 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr11 3307021 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3310028 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr11 3311770 . C A 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.733;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.77;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:151,0,313 Chr11 3326873 . G A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 3327109 . A G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 3333306 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:59:64,0,59 Chr11 3333580 . C G 108.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:137,0,23 Chr11 3337167 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 3337195 . G T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr11 3339934 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 3341128 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 3343890 . G C 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,143 Chr11 3349339 . T C 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:99,0,29 Chr11 3385313 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 3387020 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3387021 . A C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3387034 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3387041 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3387047 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3393105 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 3393114 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3395663 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 3402720 . T A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr11 3403479 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 3405548 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 3405554 . C G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 3424887 . A C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:67,0,29 Chr11 3426189 . C G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,215 Chr11 3441561 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 3441566 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 3446269 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 3456331 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:161,12,0 Chr11 3471226 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,104 Chr11 3473406 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 3481291 . C T 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr11 3481316 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr11 3481345 . C T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=35.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 3481361 . C A 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr11 3484310 . A G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:68,0,33 Chr11 3486300 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 3486313 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3486330 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 3486343 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 3486344 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 3486375 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.63;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 3486677 . G A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.82;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,180 Chr11 3487476 . C G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 3487500 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 3487511 . A C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 3487533 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3488964 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=7.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:66:66,0,110 Chr11 3490394 . A T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 3504237 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 3517764 . C A 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;DP=16;Dels=0.00;FS=2.769;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.273;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.243 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:105,0,412 Chr11 3526224 . G T 206.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.709;DP=49;Dels=0.00;FS=41.041;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.360;QD=4.22;ReadPosRankSum=-4.230 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,10:49:99:235,0,1423 Chr11 3527579 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 3545959 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr11 3555144 . C G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,72 Chr11 3555149 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,71 Chr11 3555150 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:71:71,0,71 Chr11 3575878 . G A 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=10;Dels=0.00;FS=13.222;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.336;QD=13.38;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:162,0,177 Chr11 3593214 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.29;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 3605315 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 3608316 . C A 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.80;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:81:81,0,289 Chr11 3608971 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3624382 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 3637546 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:64,0,29 Chr11 3656173 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 3661583 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.67;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr11 3682736 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.15;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 3683909 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=6.368;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.592;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,369 Chr11 3688836 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 3731935 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 3748338 . G C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,149 Chr11 3754837 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.13;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:59:59,0,135 Chr11 3757759 . A G 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr11 3764434 . A C 157.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.422;QD=17.53;ReadPosRankSum=-1.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:99:186,0,101 Chr11 3767670 . T C 219.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.296;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.895 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,7:10:95:248,0,95 Chr11 3767679 . T C 189.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=21.09;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:98:218,0,98 Chr11 3768889 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 3768935 . G A 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:108,0,67 Chr11 3768936 . T G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:107,0,68 Chr11 3768963 . C G 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:68:101,0,68 Chr11 3768978 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr11 3768979 . G T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:71,0,70 Chr11 3769487 . T C 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;DP=21;Dels=0.00;FS=43.085;HaplotypeScore=13.9975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQ0=0;MQRankSum=1.693;QD=4.70;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:99:127,0,607 Chr11 3769583 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;DP=47;Dels=0.00;FS=5.104;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.707;QD=0.61;ReadPosRankSum=-3.640 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,5:47:57:57,0,1583 Chr11 3774692 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:72,0,33 Chr11 3774699 . A G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 3775155 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3776834 . T C 315.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.354;QD=28.71;ReadPosRankSum=0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:49:344,0,49 Chr11 3799987 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 3815106 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 3825048 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr11 3827923 . T G 198.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=28.40;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:21:227,0,21 Chr11 3861923 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 3861941 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 3861945 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 3864141 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:67,0,28 Chr11 3875780 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 3875785 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 3875786 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 3876308 . C T 277.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.751;QD=30.88;ReadPosRankSum=0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:15:306,0,15 Chr11 3890478 . G T 184.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.592;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.564;QD=9.72;ReadPosRankSum=-3.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,7:19:99:213,0,436 Chr11 3890564 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.467;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,392 Chr11 3895383 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 3904758 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,183 Chr11 3904841 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,240 Chr11 3909315 . T C 99.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=19.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:128,0,24 Chr11 3909374 . G T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 3933524 . G T 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr11 3943535 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 3966598 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.153;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:66:66,0,472 Chr11 3966685 . C A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,94 Chr11 4000516 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 4000595 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4002230 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4002538 . T C 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:102,0,30 Chr11 4002915 . G A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 4037678 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 4048700 . C T 151.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:23:180,0,23 Chr11 4048970 . T G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 4071293 . G C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.35;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 4071329 . A T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.35;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 4076787 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 4076794 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4076828 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4087027 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4090535 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 4090557 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 4090571 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4090587 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4112651 . A T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 4115017 . A T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,139 Chr11 4115878 . G T 74.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:16:103,0,16 Chr11 4116476 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.68;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:54:54,0,182 Chr11 4123134 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr11 4125819 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4125848 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4129357 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 4138642 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:58,0,33 Chr11 4143885 . T A 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:62,0,31 Chr11 4159871 . G T 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.714;DP=28;Dels=0.00;FS=5.383;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.265;QD=5.74;ReadPosRankSum=-3.926 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,7:28:99:189,0,769 Chr11 4159957 . T A 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.978;QD=10.21;ReadPosRankSum=-2.927 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:161,0,277 Chr11 4171691 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:67,0,33 Chr11 4174159 . C A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.133;QD=2.04;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:110,0,1278 Chr11 4189184 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 4189198 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4194879 . G T 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.53;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:123,0,179 Chr11 4211201 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4211286 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 4213387 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 4214485 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4214576 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4217399 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 4226330 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 4233683 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:65,0,31 Chr11 4239973 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 4241113 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 4241141 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr11 4241177 . G T 121.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:150,0,27 Chr11 4241195 . T A 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr11 4249042 . C G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr11 4275049 . T G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 4287686 . T G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 4296732 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr11 4296787 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4307719 . C A 112.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:141,0,25 Chr11 4329713 . G A 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr11 4329714 . A G 54.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.69;MQ0=0;QD=18.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:82,9,0 Chr11 4355724 . G C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 4380826 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 4383006 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 4399983 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 4407104 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr11 4420784 . C A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:94:94,0,141 Chr11 4428770 . T C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 4428805 . C G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 4429313 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 4429314 . T A 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr11 4429318 . C T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 4429331 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:124,9,0 Chr11 4429345 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 4460425 . C A 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;DP=29;Dels=0.00;FS=1.890;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.673;QD=3.96;ReadPosRankSum=-3.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,6:29:99:143,0,803 Chr11 4464515 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4481632 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr11 4484166 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr11 4485851 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 4495620 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.269;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:66:66,0,450 Chr11 4496208 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 4496587 . A T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:104,0,26 Chr11 4497921 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 4508975 . T C 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.07;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr11 4509655 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4509668 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4515954 . T A 290.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.354;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-2.239;QD=26.43;ReadPosRankSum=-1.768 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,9:11:45:319,0,45 Chr11 4532280 . A T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;DP=25;Dels=0.00;FS=5.395;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.781;QD=3.47;ReadPosRankSum=-3.431 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,5:25:99:115,0,679 Chr11 4534029 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.480;QD=2.24;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:64:64,0,477 Chr11 4547016 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 4555698 . G A 105.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.01;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:133,12,0 Chr11 4594754 . G T 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 4595774 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 4598332 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 4604758 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 4605409 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 4610557 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4614518 . C G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.88;MQ0=0;QD=5.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:65,9,0 Chr11 4624800 . A T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.118;QD=1.88;ReadPosRankSum=-2.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:62:62,0,533 Chr11 4627219 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4629253 . G C 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr11 4652525 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 4652551 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.03;MQ0=0;QD=15.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:74,6,0 Chr11 4664480 . A G 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=19.63;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:146,0,66 Chr11 4683485 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:72,0,29 Chr11 4686548 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 4686854 . C T 144.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:173,0,23 Chr11 4691120 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr11 4691154 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 4703392 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 4703479 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr11 4713263 . A T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.895;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.580 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:85:85,0,233 Chr11 4758330 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr11 4782706 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 4784329 . T C 204.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:233,18,0 Chr11 4816928 . A C 186.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.742;QD=26.69;ReadPosRankSum=-0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:19:215,0,19 Chr11 4824312 . G C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 4824539 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4828993 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 4831621 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 4859848 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 Chr11 4861278 . T A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 4861330 . G C 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.421;QD=12.35;ReadPosRankSum=-2.017 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:99:127,0,137 Chr11 4867001 . C T 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 4867473 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 4885196 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 4885824 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQ0=0;MQRankSum=-0.550;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:68:68,0,126 Chr11 4886411 . C G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr11 4886423 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 4886438 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 4901633 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 4901728 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.949;DP=16;Dels=0.00;FS=20.560;HaplotypeScore=1.8665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=2.55;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:16:69:69,0,447 Chr11 4901825 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 4909702 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 4909713 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 4909732 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 4924930 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 4934566 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 4953607 . T C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.203;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=5.86;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:81:81,0,213 Chr11 4953628 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.573 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:95:95,0,225 Chr11 4957700 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 4963476 . T A 165.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.151;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.756;QD=4.48;ReadPosRankSum=-4.003 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,8:37:99:194,0,1071 Chr11 5012749 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr11 5015100 . G A 162.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:191,0,24 Chr11 5019576 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr11 5024527 . G C 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:67,0,30 Chr11 5058291 . G C 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=28.98;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,5:6:15:202,15,0 Chr11 5058334 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 5062130 . T G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 5062201 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr11 5084927 . C T 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 5098730 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.156;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,389 Chr11 5112780 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 5113143 . G A 289.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:318,24,0 Chr11 5113155 . T C 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:293,21,0 Chr11 5113187 . C T 106.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.80;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:27:135,0,27 Chr11 5113354 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5113356 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5113393 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 5115212 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=7.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:58:58,0,59 Chr11 5115213 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:55:55,0,57 Chr11 5115259 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=11.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:60:100,0,60 Chr11 5115268 . C T 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:63:138,0,63 Chr11 5134373 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 5152111 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 5215438 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 5215444 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 5223652 . G A 133.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.405;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.765 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,6:22:99:162,0,556 Chr11 5224563 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 5227103 . T A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.93;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 5227145 . T A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.93;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr11 5237447 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5243719 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:70,0,32 Chr11 5243902 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 5247450 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 5247455 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 5271316 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5271401 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.382;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,274 Chr11 5278930 . G C 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.573;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:89:89,0,170 Chr11 5278955 . A G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.001;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:10:83:83,0,157 Chr11 5278971 . T C 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.386;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:81:81,0,202 Chr11 5279100 . A T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,217 Chr11 5279108 . A C 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,213 Chr11 5288992 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5289004 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5289040 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 5295269 . T A 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr11 5295287 . C T 159.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:188,0,24 Chr11 5295341 . G A 160.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:189,0,23 Chr11 5295664 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5295669 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5365703 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5367295 . A G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr11 5373027 . G T 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.968;QD=11.48;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:189,0,288 Chr11 5375019 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.825;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,321 Chr11 5385145 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.76;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 5386888 . G C 295.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.370;QD=24.65;ReadPosRankSum=0.185 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,9:12:69:324,0,69 Chr11 5388355 . T A 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 Chr11 5398261 . T A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 5398481 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 5425819 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,65 Chr11 5433526 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 5435365 . T C 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;DP=15;Dels=0.00;FS=2.796;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQ0=0;MQRankSum=-0.938;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.804 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:78:78,0,441 Chr11 5436478 . G T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.062;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.351;QD=3.85;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:163,0,1044 Chr11 5436564 . C A 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;DP=11;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.932;QD=11.89;ReadPosRankSum=-2.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:159,0,203 Chr11 5444926 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 5449473 . T C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.397;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.45;MQ0=0;MQRankSum=-2.302;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.556 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,14:16:57:57,0,70 Chr11 5461951 . G T 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.758;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.516;QD=4.86;ReadPosRankSum=-2.971 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:16:99:106,0,400 Chr11 5473998 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=3.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.296;QD=5.58;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:84:84,0,249 Chr11 5474389 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=16.154;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,297 Chr11 5474728 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 5474767 . A C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.24;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 5474776 . A G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr11 5474777 . C T 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.80;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr11 5484821 . A T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 5484916 . C T 58.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=14.70;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:22:87,0,22 Chr11 5484926 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr11 5488034 . C T 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:115,0,30 Chr11 5492047 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 5513870 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 5514488 . T C 107.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4328;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.95;MQ0=2;MQRankSum=1.920;QD=10.79;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,6:10:15:136,15,0 Chr11 5514509 . G A 108.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.95;MQ0=2;MQRankSum=1.920;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,6:10:15:137,15,0 Chr11 5514515 . G A 108.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.684;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.95;MQ0=2;MQRankSum=1.920;QD=10.89;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,6:10:15:137,15,0 Chr11 5535149 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr11 5535167 . G A 100.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.56;MQ0=0;QD=25.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:128,12,0 Chr11 5543214 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5551562 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5552103 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5561795 . G T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 5570763 . C A 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:97,9,0 Chr11 5583879 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.465;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:91:91,0,548 Chr11 5612316 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr11 5619814 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 5623246 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.847;QD=1.39;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:56:56,0,630 Chr11 5626889 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 5651964 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,71 Chr11 5651992 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:51:51,0,65 Chr11 5653335 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr11 5655577 . T A 154.03 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=25.67;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:12:182,0,12 Chr11 5655647 . C T 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 5655698 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 5655709 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 5655710 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 5661637 . T A 114.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=15.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.300;QD=16.40;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:143,0,101 Chr11 5662765 . T A 117.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.429;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.531;QD=7.85;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:146,0,337 Chr11 5669778 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 5671528 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5677179 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5677235 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 5697455 . T C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,111 Chr11 5710384 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 5710408 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 5715786 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5715791 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 5715813 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 5715875 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 5715879 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5717277 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5719516 . A C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 5719568 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 5719577 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 5734241 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 5734307 . A T 286.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:315,24,0 Chr11 5735090 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 5767330 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 5767384 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.57;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 5769784 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.63;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 5799785 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 5803674 . G A 207.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:236,18,0 Chr11 5825124 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 5826903 . C G 173.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:202,15,0 Chr11 5828236 . T G 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 5828304 . C T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr11 5828419 . G A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.39;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:72:72,0,72 Chr11 5829497 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 5829733 . A G 161.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:190,0,24 Chr11 5837763 . A C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=6.20;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:53:53,0,65 Chr11 5842244 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 5845098 . T A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 5858287 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5874309 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;DP=17;Dels=0.00;FS=6.864;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.575;QD=2.28;ReadPosRankSum=2.583 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:67:67,0,502 Chr11 5917172 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 5950508 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 5950529 . T G 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr11 5954144 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5961048 . G T 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.407;QD=3.43;ReadPosRankSum=-4.091 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,7:37:99:155,0,1084 Chr11 5966312 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5966318 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 5967778 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 5967801 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 5967844 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 5971536 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 5982448 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 6011414 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 6011753 . A G 188.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:217,18,0 Chr11 6011985 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 6012013 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 6012018 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 6012073 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 6013443 . G T 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 6013498 . T A 212.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.41 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:241,18,0 Chr11 6015336 . T G 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr11 6015348 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:70,0,30 Chr11 6015363 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr11 6016499 . C T 235.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.747;QD=29.48;ReadPosRankSum=-0.747 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,7:8:18:264,0,18 Chr11 6016553 . C G 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:151,0,27 Chr11 6016576 . A T 116.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:145,0,25 Chr11 6033808 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 6033809 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 6033830 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 6033869 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 6034085 . A T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr11 6034163 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 6041301 . A G 77.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:106,0,30 Chr11 6043293 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,204 Chr11 6044313 . C A 76.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:105,0,27 Chr11 6049557 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 6050814 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.53;MQ0=3;MQRankSum=1.799;QD=2.60;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,3:23:88:88,0,204 Chr11 6053356 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 6080549 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 6129429 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.482;QD=1.79;ReadPosRankSum=-3.150 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:73:73,0,758 Chr11 6143282 . A C 74.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:103,0,26 Chr11 6150016 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.331;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.693;QD=2.10;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:64:64,0,512 Chr11 6150531 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=14.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:101,0,62 Chr11 6150532 . A T 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=14.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:62:100,0,62 Chr11 6166412 . G A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;DP=45;Dels=0.00;FS=23.225;HaplotypeScore=11.9266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.417;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.890 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,6:45:94:94,0,1353 Chr11 6183566 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 6222190 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 6240804 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 6343210 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 6349596 . G C 223.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:252,18,0 Chr11 6350786 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 6350968 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 6353144 . G T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,215 Chr11 6371682 . A T 238.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=26.53;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:267,0,54 Chr11 6372215 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 6379777 . G T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 6379828 . A G 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 6379829 . A T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 6421035 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 6453795 . G T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.708;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.377;QD=5.07;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:84:84,0,255 Chr11 6456675 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 6472579 . T A 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr11 6472588 . T A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 6478487 . G C 45.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:74,0,22 Chr11 6478654 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,71 Chr11 6479058 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.64;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,257 Chr11 6535757 . A T 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 6536142 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 6537858 . A T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.357;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.050;QD=1.13;ReadPosRankSum=-2.764 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,3:21:52:52,0,652 Chr11 6538939 . T C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.21;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr11 6542402 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 6550025 . A C 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.86;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr11 6550053 . A C 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=19.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:107,0,27 Chr11 6550083 . C T 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr11 6550939 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 6558005 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 6559601 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;DP=22;Dels=0.00;FS=31.652;HaplotypeScore=17.9946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQ0=0;MQRankSum=2.256;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:88:88,0,684 Chr11 6559662 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,107 Chr11 6559686 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,107 Chr11 6559690 . C G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,106 Chr11 6564949 . T A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:100,0,29 Chr11 6565502 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 6565506 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 6576074 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 6576108 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 6613693 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 6613712 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 6621370 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.135;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:63:63,0,485 Chr11 6622389 . G C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=27.0622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.83;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,182 Chr11 6627189 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 6627193 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 6627427 . T A 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=15.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:104,0,67 Chr11 6629822 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 6630795 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 6642669 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:61,0,33 Chr11 6643477 . T A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=15.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:89,0,30 Chr11 6643479 . C G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr11 6660382 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:101,0,69 Chr11 6722482 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 6722579 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 6800752 . G T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQ0=0;MQRankSum=0.778;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.647 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,3:14:73:73,0,407 Chr11 6800849 . C A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:80:80,0,335 Chr11 6813412 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 6863872 . T G 87.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.64;MQ0=0;QD=21.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:115,12,0 Chr11 6918910 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 6997570 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 6997580 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 6997596 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.08;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 7005871 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 7005877 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 7005884 . A T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 7027237 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 7027241 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 7028261 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr11 7040608 . C A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;DP=64;Dels=0.00;FS=1.647;HaplotypeScore=3.7898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQ0=0;MQRankSum=-0.012;QD=0.42;ReadPosRankSum=-0.610 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:58,6:64:55:55,0,2183 Chr11 7040639 . A G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;DP=15;Dels=0.00;FS=3.222;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.326;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.065 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,4:15:99:112,0,414 Chr11 7040663 . C T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=14;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.495;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:113,0,375 Chr11 7040862 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr11 7043693 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 7052512 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.70;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 7087237 . C T 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.01;MQ0=0;MQRankSum=0.817;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.030 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,7:25:99:126,0,419 Chr11 7087367 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 7087886 . A G 121.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=86;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.13;MQ0=30;MQRankSum=-0.446;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.294 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,9:86:99:150,0,696 Chr11 7092797 . G C 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=-1.666;QD=3.20;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,239 Chr11 7093095 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.54;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 7109957 . G A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr11 7109967 . A G 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 7109968 . T C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 7109993 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 7109999 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 7110012 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 7111514 . G C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 7115346 . G C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 7115356 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 7121823 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.52;MQ0=19;MQRankSum=1.026;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:14,2:25:6:51,6,0 Chr11 7156319 . C A 160.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.517;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.968;QD=11.48;ReadPosRankSum=-3.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:189,0,282 Chr11 7158413 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 7200918 . T C 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr11 7200935 . C T 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.51;MQ0=0;QD=12.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:52,6,0 Chr11 7209059 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 7209101 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 7209138 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.57;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 7223733 . T A 219.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:248,18,0 Chr11 7224780 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 7228877 . C A 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:99,0,26 Chr11 7240334 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 7241698 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 7264608 . G T 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.403;QD=2.99;ReadPosRankSum=-3.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:91:91,0,617 Chr11 7306197 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 7331567 . A C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 7348087 . G T 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.876;QD=15.20;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:165,0,134 Chr11 7366889 . C A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.406;QD=10.79;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:93:93,0,96 Chr11 7422354 . G T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.098;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:163,0,175 Chr11 7422440 . C A 136.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.773;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.639;QD=3.91;ReadPosRankSum=-4.062 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,7:35:99:165,0,1038 Chr11 7423741 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 7455361 . T G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,65 Chr11 7496636 . G C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 7536578 . G C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 7548001 . T C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 7586595 . C G 107.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.37;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:135,12,0 Chr11 7588260 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.422;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.47;MQ0=0;MQRankSum=2.054;QD=9.81;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:9:116,9,0 Chr11 7588908 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 7591623 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 7591674 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 7591822 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 7593807 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 7593808 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 7593811 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 7593849 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 7595918 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 7596569 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 7596596 . A T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 7596600 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 7596653 . A C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 7607849 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 7607852 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 7607890 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 7612574 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 7626177 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 7639536 . T A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.913;DP=22;Dels=0.00;FS=14.393;HaplotypeScore=7.9087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.775;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.722 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:61:61,0,617 Chr11 7679904 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;MQ0=6;QD=10.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:122,9,0 Chr11 7679914 . G C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.18;MQ0=6;QD=9.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:9:111,9,0 Chr11 7687590 . C T 545.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.32;MQ0=0;QD=30.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:574,42,0 Chr11 7715054 . G C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 7716475 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 7757214 . T A 153.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:182,15,0 Chr11 7850593 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:98,0,30 Chr11 7866394 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 7866478 . C A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.250;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.050;QD=3.62;ReadPosRankSum=-3.050 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:97:97,0,521 Chr11 7910554 . T C 70.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:99,0,26 Chr11 7910600 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:72,0,69 Chr11 7910607 . T G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:73,0,31 Chr11 7910642 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:73,0,32 Chr11 7923639 . G A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr11 7987323 . C A 38.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:67,0,25 Chr11 7987811 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 7987847 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 7993055 . G C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:53:53,0,69 Chr11 7993082 . G A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.43;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:53:53,0,69 Chr11 7994063 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.02;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 7997908 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8048956 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 8080837 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:51:51,0,109 Chr11 8081403 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 8088747 . C T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 8119147 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.323;QD=2.16;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:65:65,0,497 Chr11 8243634 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8243675 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 8243678 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 8245886 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 8246153 . A G 381.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:410,30,0 Chr11 8246165 . A G 368.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:397,30,0 Chr11 8249018 . T C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr11 8249123 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:126,9,0 Chr11 8249133 . A G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 8278522 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 8278703 . G C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,262 Chr11 8285799 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.660;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,447 Chr11 8286050 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.584;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.561;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.584 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:79:79,0,1242 Chr11 8293880 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 8294839 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 8294841 . G A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 8294842 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 8294864 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 8315560 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 8315633 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8315970 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 8315971 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 8319711 . G A 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 8341275 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 8444951 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=2.72;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:50:50,0,208 Chr11 8473098 . G C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 8473105 . A T 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 8473111 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 8473138 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:114,9,0 Chr11 8473161 . T C 104.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:132,12,0 Chr11 8500389 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 8500476 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 8535324 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8553092 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 8635695 . T C 169.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:198,15,0 Chr11 8641078 . T A 1050.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.362;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.238;QD=34.06;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,27:28:42:1079,42,0 Chr11 8641271 . G T 122.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.140;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.121;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.140 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,7:41:99:151,0,1274 Chr11 8644570 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 8644833 . A T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.39;MQ0=7;MQRankSum=-0.736;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:32:60,0,32 Chr11 8644848 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.39;MQ0=7;MQRankSum=-0.736;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:13:32:60,0,32 Chr11 8644853 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.39;MQ0=7;MQRankSum=-0.736;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:13:32:60,0,32 Chr11 8645506 . G T 188.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.464;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.439;QD=9.94;ReadPosRankSum=-3.464 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,7:19:99:217,0,359 Chr11 8681511 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=1;QD=15.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:75,6,0 Chr11 8681544 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr11 8681560 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.76;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr11 8682967 . T C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=13.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:15:208,15,0 Chr11 8703638 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,198 Chr11 8707680 . G T 220.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.784;QD=11.62;ReadPosRankSum=-3.674 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,8:19:99:249,0,367 Chr11 8711251 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8712247 . G T 56.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.013;DP=36;Dels=0.00;FS=26.776;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.183;QD=1.58;ReadPosRankSum=-3.568 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:85:85,0,1125 Chr11 8718252 . T A 31.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8844634 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8844660 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8845143 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 8865793 . A G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 8865829 . T G 40.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 8887785 . G T 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 8893976 . C T 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr11 8918288 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 8918294 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 8959531 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 8959552 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 8963787 . A C 111.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:139,12,0 Chr11 8963863 . G C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 8964216 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8992748 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 8996465 . C T 160.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=26.80;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:189,0,23 Chr11 9018232 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.691;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.807;QD=2.49;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:68:68,0,485 Chr11 9020509 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 9023165 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 9040481 . G T 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=21.96;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:138,0,26 Chr11 9056400 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 9056401 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 9076457 . G T 74.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.95;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:103,0,64 Chr11 9076541 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,88 Chr11 9082445 . T G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 9097002 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 9101417 . A T 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr11 9103113 . G T 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQ0=0;MQRankSum=0.482;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.850 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,6:19:99:176,0,462 Chr11 9103117 . G C 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.525;DP=31;Dels=0.00;FS=15.600;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQ0=0;MQRankSum=0.325;QD=4.12;ReadPosRankSum=3.625 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,6:31:99:156,0,905 Chr11 9103118 . C T 156.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;DP=20;Dels=0.00;FS=37.433;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQ0=0;MQRankSum=-1.856;QD=7.84;ReadPosRankSum=3.340 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:99:185,0,504 Chr11 9133589 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 9133592 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 9133599 . T G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 9133602 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 9133608 . C T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 9138183 . C T 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr11 9138190 . G A 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:98,9,0 Chr11 9147841 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.978;DP=39;Dels=0.00;FS=30.360;HaplotypeScore=1.7338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQ0=0;MQRankSum=-0.915;QD=2.15;ReadPosRankSum=-3.873 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,6:39:99:112,0,1239 Chr11 9167842 . G T 62.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 9196216 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 9196856 . C G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr11 9203847 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 9205802 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 9205810 . C G 48.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 9325545 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 9330081 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 9330092 . C A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.38;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 9355144 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 9384016 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 9384482 . T A 364.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:30:393,30,0 Chr11 9389910 . T C 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.480;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:54:54,0,293 Chr11 9391882 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 9391891 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 9391942 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 9394659 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 9394673 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 9394674 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 9394680 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 9394681 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 9405786 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 9410514 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 9418558 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 9418574 . C T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 9418742 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 9419309 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 9420279 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 9421451 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,98 Chr11 9422233 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 9452761 . T G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 9452765 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 9471439 . G C 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr11 9472222 . A G 84.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;QD=14.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:112,12,0 Chr11 9472228 . G A 84.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;QD=14.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:112,12,0 Chr11 9472234 . C T 84.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;QD=14.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:112,12,0 Chr11 9472260 . T G 84.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.34;MQ0=0;QD=14.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:112,12,0 Chr11 9472289 . T C 30.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:26:59,0,26 Chr11 9552196 . A G 77.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=19.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:24:106,0,24 Chr11 9564641 . A G 234.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.54 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:263,21,0 Chr11 9564668 . A T 245.80 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.36 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 9835097 . A T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,127 Chr11 9835600 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 9839368 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.31;MQ0=0;QD=2.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:6:62,6,0 Chr11 9865734 . T A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.976;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=1.02;ReadPosRankSum=-3.211 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,4:31:60:60,0,996 Chr11 9906009 . A T 112.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr11 10060919 . A C 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,174 Chr11 10095507 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 10095508 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 10095511 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 10095522 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 10112565 . C A 59.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.00;MQ0=0;QD=14.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:87,12,0 Chr11 10112674 . A G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.78;MQ0=0;QD=0.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:12:91,12,0 Chr11 10112683 . C A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=78;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.78;MQ0=0;QD=0.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,78:78:12:91,12,0 Chr11 10112771 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr11 10136258 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 10136267 . C A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 10137648 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 10137981 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:54:54,0,143 Chr11 10139916 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 10156293 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 10158749 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 10162210 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 10225821 . C T 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 10242602 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 10242681 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 10284724 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:68,0,30 Chr11 10316825 . T G 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.71;MQ0=0;QD=8.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:52,6,0 Chr11 10322634 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 10322650 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.62;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr11 10322670 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.62;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr11 10322690 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.62;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr11 10419346 . G T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.099;QD=3.75;ReadPosRankSum=-2.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,3:13:77:77,0,371 Chr11 10419479 . G T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,71 Chr11 10420934 . G T 48.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 10727732 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 10729348 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.665;QD=2.24;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:82:82,0,724 Chr11 10731846 . G T 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.880;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.637;QD=2.99;ReadPosRankSum=-4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,7:40:99:148,0,1232 Chr11 10740088 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 10746456 . T A 202.84 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.634;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.22;MQ0=35;MQRankSum=0.580;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.791 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:46,6:52:9:74,9,0 Chr11 10773322 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 10777775 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 10778386 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.66;MQ0=0;QD=1.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:63,6,0 Chr11 10846592 . T A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.287;DP=16;Dels=0.00;FS=27.482;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.942;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:66:66,0,478 Chr11 10856255 . A G 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr11 10878149 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 10917987 . C G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 10956134 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 10956136 . T G 206.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:235,18,0 Chr11 10991062 . T A 2380.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=62;Dels=0.03;FS=0.000;HaplotypeScore=3.4779;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,60:60:99:2409,181,0 Chr11 11015228 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 11017776 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11034204 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 11047800 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.22;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:77,6,0 Chr11 11090531 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 11090976 . T C 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 11099610 . T G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 11101699 . T A 208.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:237,18,0 Chr11 11165964 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 11165989 . C A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 11166083 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 11197726 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 11213545 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 11213635 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 11213641 . T G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 11213642 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.04;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 11228291 . A G 145.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:174,15,0 Chr11 11228297 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 11398615 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11400384 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 11400392 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 11416524 . T C 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.72;MQ0=0;QD=19.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:66,6,0 Chr11 11434932 . G T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 11488754 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11490357 . T C 97.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.53;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 11512030 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 11512764 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 11512776 . T C 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr11 11534109 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 11561981 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.60;MQ0=4;QD=7.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:75,6,0 Chr11 11615204 . G T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 11627221 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11627228 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 11659456 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 11659486 . T C 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 11669219 . G A 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:101,9,0 Chr11 11709515 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11710697 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 11712740 . T C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.84;MQ0=0;QD=2.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,20:20:9:77,9,0 Chr11 11716421 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11742004 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 11742009 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 11763213 . A C 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.320;DP=58;Dels=0.00;FS=11.275;HaplotypeScore=6.7628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQ0=0;MQRankSum=3.168;QD=0.84;ReadPosRankSum=1.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,24:58:77:77,0,448 Chr11 11766008 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 11768144 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 11768196 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11832595 . G T 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;DP=36;Dels=0.00;FS=8.503;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=2.051;QD=1.66;ReadPosRankSum=-2.805 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,5:36:88:88,0,1073 Chr11 11832691 . C A 159.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.101;QD=11.41;ReadPosRankSum=-3.016 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,6:14:99:188,0,245 Chr11 11833358 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 11834642 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 11841320 . A C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 11854344 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11854390 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11928351 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 11929287 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 12002104 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 12006751 . T G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 12006922 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 12007036 . G A 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr11 12007065 . C T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 12007069 . A C 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr11 12007087 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 12135982 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 12136215 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 12252124 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;DP=16;Dels=0.00;FS=23.424;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.02;MQ0=4;MQRankSum=-0.925;QD=1.55;ReadPosRankSum=-2.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:53:53,0,235 Chr11 12359530 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 12363302 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 12363502 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 12440289 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 12525075 . A T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 12525092 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 12536211 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 12564516 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 12565328 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 12573784 . C A 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 12613280 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 12615988 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.13;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 12636550 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 12636615 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 12662619 . C G 34.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.22;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=8.70;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:21:63,0,21 Chr11 12662654 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.76;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr11 12665498 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 12665506 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 12689483 . C G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.90;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 12749848 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;DP=58;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQ0=0;MQRankSum=-4.436;QD=0.63;ReadPosRankSum=-1.348 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:48,10:58:65:65,0,1692 Chr11 12785487 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 12801017 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,67 Chr11 12865695 . T A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 12893914 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 12899045 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 12907244 . A C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 12960430 . G A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 12960469 . G A 110.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.03;MQ0=0;QD=27.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:138,12,0 Chr11 13024036 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.01;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:67,0,67 Chr11 13040432 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 13128909 . A C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr11 13128911 . A C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.11;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr11 13178832 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.62;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 13178853 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.62;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 13184135 . A G 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr11 13202390 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13202391 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13216200 . T G 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 13229310 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13266036 . A C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.65;MQ0=1;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr11 13292952 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 13292986 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 13293031 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 13293037 . C T 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 13298574 . T C 121.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.30;MQ0=0;QD=3.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:18:150,18,0 Chr11 13298576 . G A 121.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.30;MQ0=0;QD=3.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,36:36:18:150,18,0 Chr11 13305426 . A T 118.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;DP=14;Dels=0.00;FS=25.233;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.533;QD=8.48;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:147,0,328 Chr11 13305522 . C A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:100,0,66 Chr11 13318351 . G T 36.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.41;MQ0=3;MQRankSum=-0.731;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:10:11:85,0,11 Chr11 13318561 . G A 103.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.1877;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=17;QD=3.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,29:29:15:132,15,0 Chr11 13318703 . T C 73.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.77;MQ0=8;QD=3.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:12:101,12,0 Chr11 13321295 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13442190 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 13442211 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 13450822 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 13450826 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 13450830 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 13450837 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13450841 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13450854 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13450858 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 13450906 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.80;MQ0=10;QD=2.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:6:81,6,0 Chr11 13502005 . G T 171.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.567;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.57;MQ0=0;MQRankSum=-0.206;QD=4.77;ReadPosRankSum=-4.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:200,0,316 Chr11 13502387 . G C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 13550322 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 13550355 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 13550375 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 13587157 . A G 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.96;MQ0=3;MQRankSum=0.727;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,6:7:9:70,9,0 Chr11 13629748 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 13630222 . T C 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 13676672 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 13695067 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 13786022 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 13786494 . T C 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:125,12,0 Chr11 13861021 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 13861024 . T A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 13894270 . G T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=9.35;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:5:25:104,0,25 Chr11 13980540 . A T 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 14008580 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.182;DP=109;Dels=0.00;FS=2.447;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.34;MQ0=55;MQRankSum=1.833;QD=0.34;ReadPosRankSum=2.329 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:53,56:109:65:65,0,288 Chr11 14019084 . A C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.78;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 14033499 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 14060582 . T C 105.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.95;MQ0=2;QD=7.56 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:15:134,15,0 Chr11 14072943 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 14073541 . T C 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=18.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:83,9,0 Chr11 14199891 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:33:71,0,33 Chr11 14214957 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 14216528 . G T 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.474;QD=6.63;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:141,0,418 Chr11 14227771 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 14287147 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.10;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,203 Chr11 14287149 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=2.97;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,202 Chr11 14358617 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 14358650 . C G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 14358750 . G T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.27;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 14368025 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 14368050 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 14368085 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 14369072 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 14392110 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 14392155 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 14392188 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 14414976 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.08;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 14430270 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 14435228 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 14467789 . A T 41.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.84;MQ0=0;QD=13.93 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:3:6:81,6,0 Chr11 14467801 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 14467802 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.84;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 14467835 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 14467836 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 14479122 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 14479155 . C G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 14493866 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr11 14500300 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 14500303 . G C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.96;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 14505368 . A G 41.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.29;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 14589046 . T A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.29;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 14617913 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 14677363 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 14677368 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 14677371 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 14677381 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 14681028 . G A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;DP=11;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=7.9979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,295 Chr11 14700892 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 14701225 . A T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 14701279 . T A 182.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:211,15,0 Chr11 14750784 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 14814916 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 14814955 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 14876399 . C A 134.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:162,12,0 Chr11 14876922 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 14964492 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 14967347 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;DP=10;Dels=0.00;FS=7.068;HaplotypeScore=1.9992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.361;QD=6.28;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:10:91:91,0,173 Chr11 15004891 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.62;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 15004911 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.62;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 15005723 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.89;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 15067373 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 15070025 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 15079400 . C A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,135 Chr11 15386948 . C A 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr11 15417271 . G T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 15434309 . G T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,247 Chr11 15439553 . C T 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.18;MQ0=0;QD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 Chr11 15439596 . G A 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.18;MQ0=0;QD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 Chr11 15439599 . A G 55.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.18;MQ0=0;QD=9.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:83,9,0 Chr11 15440251 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.012;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.77;MQ0=25;MQRankSum=-1.714;QD=0.88;ReadPosRankSum=2.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,17:42:47:65,0,47 Chr11 15440260 . A T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.99;MQ0=25;MQRankSum=2.162;QD=0.83;ReadPosRankSum=3.841 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:30,17:48:47:68,0,47 Chr11 15440271 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.384;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.27;MQ0=32;MQRankSum=3.666;QD=0.96;ReadPosRankSum=3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,17:54:6:79,6,0 Chr11 15440281 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.27;MQ0=32;MQRankSum=3.666;QD=0.90;ReadPosRankSum=3.666 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,17:54:6:76,6,0 Chr11 15440284 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.27;MQ0=32;MQRankSum=3.666;QD=0.92;ReadPosRankSum=3.313 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,17:54:6:77,6,0 Chr11 15440292 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.27;MQ0=32;MQRankSum=3.666;QD=0.90;ReadPosRankSum=-3.243 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:37,17:54:6:76,6,0 Chr11 15440293 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.27;MQ0=32;MQRankSum=3.666;QD=0.92;ReadPosRankSum=-3.384 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:36,17:54:6:77,6,0 Chr11 15462368 . G T 442.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=27.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:48:471,48,0 Chr11 15504169 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 15604725 . G A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.36;MQ0=7;QD=3.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,5:11:6:61,6,0 Chr11 15620997 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 15621016 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.02;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 15731045 . C A 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr11 15735757 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 15740224 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 15740233 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 15746946 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=1;QD=12.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:66,6,0 Chr11 15746980 . T G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.43;MQ0=1;QD=12.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:65,6,0 Chr11 15753433 . C T 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr11 15823464 . G A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.56;MQ0=0;MQRankSum=2.192;QD=1.62;ReadPosRankSum=-1.395 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,2:19:6:58,6,0 Chr11 15824870 . C T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.01;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=7.40;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:58:80,0,58 Chr11 15839787 . G A 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.06;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr11 15955890 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 15955922 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 15955941 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 15979993 . G A 91.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=18.36;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:23:120,0,23 Chr11 16042464 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.76;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:97:98,0,97 Chr11 16318663 . C T 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.079;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.67;MQ0=1;MQRankSum=2.583;QD=4.18;ReadPosRankSum=2.079 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,3:18:9:103,9,0 Chr11 16372090 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.5226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.62;MQ0=0;MQRankSum=1.067;QD=4.60;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:64:65,0,64 Chr11 16372259 . C A 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.143;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.88;MQ0=0;MQRankSum=2.266;QD=7.18;ReadPosRankSum=-3.123 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:136,0,333 Chr11 16402687 . G T 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;DP=52;Dels=0.00;FS=10.695;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.046;QD=1.51;ReadPosRankSum=-4.236 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:45,7:52:99:107,0,1565 Chr11 16428981 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.71;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 16429234 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 16478087 . C T 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.37;MQ0=2;QD=10.66 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:9:81,9,0 Chr11 16481966 . G C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.99;MQ0=0;QD=13.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:111,12,0 Chr11 16481972 . T G 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.78;MQ0=0;QD=15.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:140,15,0 Chr11 16557490 . G A 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.55;MQ0=6;QD=3.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,16:16:9:80,9,0 Chr11 16609349 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 16611117 . G T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 16616437 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.94;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 16653677 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 16660246 . C A 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.74;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr11 16698917 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.61;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 16698928 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.61;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 16698933 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.61;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 16752929 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.48;MQ0=43;QD=0.75 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:42,3:45:6:61,6,0 Chr11 16758893 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 16760147 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.82;MQ0=0;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr11 16857521 . T G 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 16873720 . G T 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:29:104,0,29 Chr11 16876559 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 16876564 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 16900076 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 16900096 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 16930476 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.73;MQ0=0;QD=5.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:50,6,0 Chr11 16958649 . C T 21.85 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.78;MQ0=9;MQRankSum=1.026;QD=1.68;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,2:13:19:50,0,19 Chr11 16962344 . T C 33.86 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.55;MQ0=2;MQRankSum=0.470;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.268 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:17:62,0,17 Chr11 16962564 . T C 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.04;MQ0=0;QD=18.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:103,9,0 Chr11 16994843 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 17151047 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 17174630 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 17218089 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.44;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 17283865 . T G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;DP=14;Dels=0.00;FS=23.424;HaplotypeScore=1.9085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=1.63;ReadPosRankSum=-3.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:51:51,0,318 Chr11 17379004 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 17379085 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.67;MQ0=2;MQRankSum=2.178;QD=2.44;ReadPosRankSum=-2.318 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:18,2:20:6:76,6,0 Chr11 17380616 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.54;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 17419065 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.05;MQ0=24;MQRankSum=1.026;QD=1.78;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:26,2:28:6:77,6,0 Chr11 17474127 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 17570210 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 17570232 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 17576986 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.40;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 17577026 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.40;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 17592529 . A T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 17740310 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.75;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 17875842 . G C 47.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=0;QD=15.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:75,9,0 Chr11 17897055 . G A 154.56 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.63;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.179 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:7:182,0,7 Chr11 17913006 . A G 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.04;MQ0=6;QD=1.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:6:53,6,0 Chr11 17914855 . T C 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.74;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 17914865 . A G 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.74;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 17914909 . C A 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.74;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr11 17925999 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=3;QD=7.95 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:67,6,0 Chr11 17945592 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.68;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 17973229 . T A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 17973231 . G A 159.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:188,15,0 Chr11 18004143 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 18047006 . T A 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.48;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:83:83,0,236 Chr11 18109799 . T G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18109810 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18109834 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18109835 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18109839 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18109848 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.38;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 18162656 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.91;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 18197204 . T C 172.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:201,15,0 Chr11 18236193 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 18261145 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 18287050 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 18293369 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.63;MQ0=1;QD=14.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 18327719 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 18430948 . A T 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.15;MQ0=0;QD=7.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:67,9,0 Chr11 18430954 . T C 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.15;MQ0=0;QD=7.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:67,9,0 Chr11 18431022 . T C 39.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.15;MQ0=0;QD=7.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:67,9,0 Chr11 18452266 . C T 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.79;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:114,12,0 Chr11 18471631 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 18476054 . A C 200.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:229,18,0 Chr11 18492422 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 18510254 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.62;MQ0=1;MQRankSum=-1.231;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:46:59,0,46 Chr11 18560064 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.81;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 18631665 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:59:59,0,103 Chr11 18652017 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 18652037 . G T 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.54;MQ0=1;QD=16.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:108,9,0 Chr11 18652070 . T C 80.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 18908789 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 18908794 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 18957391 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 19066347 . C A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 19066391 . C T 68.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.50;MQ0=0;QD=22.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:96,9,0 Chr11 19110300 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 19110350 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.54;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 19186560 . C A 25.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=28.04;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:54,0,25 Chr11 19186573 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 19186624 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.73;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 19186640 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.90;MQ0=2;QD=8.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:62,6,0 Chr11 19187627 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr11 19187663 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 19232903 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=1;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr11 19232944 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.69;MQ0=1;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr11 19280546 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 19323761 . T A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 19372310 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 19404194 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 19452974 . C T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.03;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 19452975 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.03;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 19460056 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.01;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 19508324 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 19565429 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 19584933 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 19600941 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.57;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:77,6,0 Chr11 19620793 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 19622405 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 19659948 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 19698444 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 19705650 . A T 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.39;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:49:54,0,49 Chr11 19765119 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 19766768 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 19853380 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.67;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 19905856 . G T 37.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 20185073 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 20252571 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 20252592 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 20268744 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 20274508 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.02;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 20280899 . G A 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.52;MQ0=2;MQRankSum=-0.727;QD=8.13;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:29:77,0,29 Chr11 20328873 . G A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.63;MQ0=1;MQRankSum=-2.637;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,6:12:98:112,0,98 Chr11 20488919 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 20515836 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.85;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:54,0,29 Chr11 20555968 . G A 62.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.97;MQ0=33;QD=1.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:10,44:54:9:90,9,0 Chr11 20571350 . G A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.03;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=10.75;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:82,0,30 Chr11 20571370 . A G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.27;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:29:77,0,29 Chr11 20685071 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.54;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 20709993 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 20772105 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.35;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 20772776 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 20776886 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 20776889 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 20776907 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 20871150 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 20981647 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.16;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 21046067 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:62:62,0,107 Chr11 21099158 . C A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.048;DP=43;Dels=0.00;FS=2.494;HaplotypeScore=1.9956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.100;QD=0.95;ReadPosRankSum=-3.606 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,5:43:69:69,0,1326 Chr11 21099548 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr11 21199858 . T C 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;DP=19;Dels=0.00;FS=2.881;HaplotypeScore=10.1829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.43;MQ0=6;MQRankSum=0.289;QD=4.46;ReadPosRankSum=1.468 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,8:19:99:113,0,132 Chr11 21274672 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.35;MQ0=21;MQRankSum=1.666;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:13,16:30:6:59,6,0 Chr11 21279740 . G T 93.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.58;MQ0=0;QD=15.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:12:121,12,0 Chr11 21307390 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.61;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr11 21307394 . C G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.61;MQ0=1;QD=4.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:50,6,0 Chr11 21307401 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.48;MQ0=1;QD=3.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:50,6,0 Chr11 21307436 . T A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.19;MQ0=4;MQRankSum=1.231;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:6:50,6,0 Chr11 21307451 . G T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.81;MQ0=3;QD=2.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:50,6,0 Chr11 21307465 . G C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.81;MQ0=3;QD=2.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:8:6:50,6,0 Chr11 21307471 . T G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.56;MQ0=2;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:7:6:50,6,0 Chr11 21339597 . A G 78.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:107,0,69 Chr11 21339682 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 Chr11 21396263 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:71,0,33 Chr11 21402529 . T A 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr11 21418191 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.396;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7621;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.96;MQ0=3;MQRankSum=2.041;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,3:15:6:61,6,0 Chr11 21418232 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.43;MQ0=3;QD=1.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,17:17:6:61,6,0 Chr11 21491563 . G T 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.52;MQ0=0;QD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:117,12,0 Chr11 21515613 . C G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 21515638 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 21531307 . G A 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr11 21531330 . T C 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr11 21532718 . G T 79.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:107,12,0 Chr11 21532804 . C A 51.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.67;MQ0=0;QD=17.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:79,9,0 Chr11 21546050 . G A 158.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:187,15,0 Chr11 21602675 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 22007465 . G T 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr11 22009620 . T C 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.04;MQ0=0;QD=19.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:105,9,0 Chr11 22011125 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 22038028 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 22057816 . A G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 22057850 . C A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 22063895 . G A 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 22063955 . C T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.02;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 22138954 . G T 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:149,12,0 Chr11 22139040 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.182;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.07;MQ0=27;MQRankSum=3.067;QD=1.21;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:52,4:56:96:96,0,453 Chr11 22148438 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 22148439 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.52;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 22190899 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 22228047 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 22233526 . A G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.86;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 22240668 . A T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.43;MQ0=2;MQRankSum=0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:105,0,128 Chr11 22240693 . G A 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.43;MQ0=2;MQRankSum=-0.198;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:60:60,0,156 Chr11 22289036 . T C 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.75;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:114,12,0 Chr11 22289062 . G A 86.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.75;MQ0=0;QD=21.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:114,12,0 Chr11 22335513 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 22370931 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 22377847 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 22377849 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 22411781 . A T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.56;MQ0=0;QD=14.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:70,6,0 Chr11 22442736 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.20;MQ0=1;QD=0.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:6:59,6,0 Chr11 22442745 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9159;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.20;MQ0=1;QD=0.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,37:37:6:59,6,0 Chr11 22633303 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.68;MQ0=0;QD=2.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:50,6,0 Chr11 22649708 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 22661281 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 22661289 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.76;MQ0=3;QD=10.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:79,6,0 Chr11 22692522 . G A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.536;QD=7.48;ReadPosRankSum=-1.599 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:99:118,0,247 Chr11 22748954 . C T 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.69;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 22790457 . G T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.00;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr11 22820494 . C G 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 22887536 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9469;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.44;MQ0=0;QD=3.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:59,6,0 Chr11 22944489 . G A 100.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.7292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=12.73;MQ0=2;MQRankSum=2.509;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.181 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,9:30:13:129,0,13 Chr11 22951806 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.38;MQ0=1;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:54,6,0 Chr11 22951822 . A C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9445;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.38;MQ0=1;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:54,6,0 Chr11 23086747 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 23087122 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.6232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.49;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:55:55,0,71 Chr11 23087130 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.49;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,75 Chr11 23089090 . G T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.43;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:9:106,9,0 Chr11 23103649 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.88;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 Chr11 23103664 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.88;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 23104730 . A T 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 23122076 . C T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 23216819 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 23229739 . C T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.96;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 23263309 . T A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.67;MQ0=20;MQRankSum=0.736;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,2:23:29:67,0,29 Chr11 23292483 . T C 191.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.44;MQ0=2;QD=17.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:21:220,21,0 Chr11 23357985 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 23375838 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 23386971 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.23;MQ0=1;QD=11.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:61,6,0 Chr11 23406162 . G A 67.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.388;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.91;MQ0=0;MQRankSum=1.286;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.429 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:22:96,0,22 Chr11 23441595 . C T 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.00;MQ0=0;QD=17.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:99,12,0 Chr11 23476933 . A T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.05;MQ0=1;MQRankSum=2.262;QD=4.23;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,3:12:79:79,0,277 Chr11 23579901 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.86;MQ0=0;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:77,6,0 Chr11 23658884 . A G 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.64;MQ0=26;MQRankSum=0.736;QD=2.45;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,31:32:9:106,9,0 Chr11 23745025 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.406;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:48:75,0,48 Chr11 23758400 . T C 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.34;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:60,0,26 Chr11 23845023 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.39;MQ0=2;MQRankSum=0.736;QD=9.95;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:77,6,0 Chr11 23915292 . A G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.33;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr11 24037767 . C T 310.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.45;MQ0=0;QD=28.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:33:339,33,0 Chr11 24047168 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.81;MQ0=30;QD=1.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,41:41:6:79,6,0 Chr11 24053589 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.532;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.01;MQ0=20;MQRankSum=-0.354;QD=0.65;ReadPosRankSum=-2.239 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,2:32:49:49,0,208 Chr11 24070757 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.10;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=5.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:61:61,0,141 Chr11 24126625 . G A 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.088;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.01;MQ0=0;MQRankSum=-0.442;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,9:18:99:184,0,105 Chr11 24186335 . A T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr11 24190350 . T A 113.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.75;MQ0=0;QD=28.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:141,12,0 Chr11 24242648 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 24290485 . A G 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.63;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr11 24290553 . C T 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.63;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr11 24293272 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.101;DP=17;Dels=0.00;FS=3.358;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.90;MQ0=4;MQRankSum=-3.016;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,11:17:51:51,0,204 Chr11 24461765 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.031;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.69;MQ0=0;MQRankSum=2.686;QD=0.68;ReadPosRankSum=-4.758 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:19,13:32:6:49,6,0 Chr11 24493767 . C T 154.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.008;DP=62;Dels=0.00;FS=2.178;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.72;MQ0=1;MQRankSum=-6.593;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.209 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,29:62:99:183,0,1098 Chr11 24505356 . C T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=3;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:113,9,0 Chr11 24505368 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.46;MQ0=3;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:113,9,0 Chr11 24505666 . C T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.69;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr11 24505714 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.22;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:6:49,6,0 Chr11 24509456 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 24509469 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 24562304 . T A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.62;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 24562334 . G C 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.62;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 24609842 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.25;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 24609852 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.25;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 24628778 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.01;MQ0=0;QD=6.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:55,6,0 Chr11 24645951 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 24659923 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 24765877 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.33;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=16.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:77,6,0 Chr11 24769145 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 24845481 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 24845507 . G A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 24845541 . T C 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 24921886 . A G 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.53;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr11 24921898 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 24948579 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 24966876 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 25040198 . G A 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.21;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 25070167 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.39;MQ0=1;MQRankSum=0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:46:75,0,46 Chr11 25080307 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 25089286 . A G 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.78;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 25089325 . A G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.98;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 25124627 . G T 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:53,6,0 Chr11 25157755 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.88;MQ0=12;QD=1.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,8:19:6:49,6,0 Chr11 25157788 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.88;MQ0=12;QD=1.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:11,8:19:6:49,6,0 Chr11 25176188 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 25184391 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 25202377 . A T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.52;MQ0=1;QD=1.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,27:27:6:67,6,0 Chr11 25202423 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.325;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.85;MQ0=1;MQRankSum=2.614;QD=1.26;ReadPosRankSum=2.542 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:6:65,6,0 Chr11 25202433 . A G 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7825;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.85;MQ0=1;MQRankSum=2.542;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.184 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,27:30:6:67,6,0 Chr11 25339926 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 25372167 . G C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.08;MQ0=3;QD=5.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:55,6,0 Chr11 25439309 . A G 81.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:109,9,0 Chr11 25439335 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 25541511 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 25598229 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.04;MQ0=4;QD=13.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:9:121,9,0 Chr11 25622650 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.06;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr11 25672033 . G A 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.78;MQ0=0;QD=17.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:99,9,0 Chr11 25672117 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.20;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 Chr11 25715993 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 25810013 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.56;MQ0=1;QD=16.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:77,6,0 Chr11 25830276 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 25847708 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 25853973 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.14;MQ0=0;MQRankSum=-1.034;QD=3.65;ReadPosRankSum=-2.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,4:12:72:72,0,119 Chr11 25890411 . T G 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.80;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 25905136 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.34;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 25905156 . G C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.34;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 25905171 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.34;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 26117841 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 26118914 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 26140161 . T C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.02;MQ0=32;QD=1.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:6:70,6,0 Chr11 26142344 . T C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 26229574 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.72;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 26233890 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 26292035 . G A 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.96;MQ0=3;QD=13.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,3:6:9:107,9,0 Chr11 26295794 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 26384391 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 26386692 . T C 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.48;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 26386725 . T C 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 26386732 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.84;MQ0=0;QD=22.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:119,9,0 Chr11 26400854 . T G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.84;MQ0=1;QD=19.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:104,9,0 Chr11 26400869 . G C 61.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.46;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=12.35;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:34:90,0,34 Chr11 26408066 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.15;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 26408152 . T G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.04;MQ0=1;QD=27.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:166,12,0 Chr11 26468613 . C T 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.75;MQ0=0;QD=22.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:117,12,0 Chr11 26480303 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.59;MQ0=5;QD=7.96 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:83,6,0 Chr11 26480325 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 26483586 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.07;MQ0=5;QD=7.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:6:77,6,0 Chr11 26520170 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.77;MQ0=0;QD=4.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:71,6,0 Chr11 26599390 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.20;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 26680045 . T A 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.340;QD=7.11;ReadPosRankSum=-3.172 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:142,0,376 Chr11 26821409 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 26846822 . C A 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 26879094 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.88;MQ0=2;QD=1.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:9:65,9,0 Chr11 26879115 . A G 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.88;MQ0=2;QD=1.49 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,23:25:9:65,9,0 Chr11 26879116 . T C 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.73;MQ0=2;QD=1.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,24:26:9:65,9,0 Chr11 26879142 . C T 37.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.45;MQ0=4;QD=1.33 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,26:28:9:65,9,0 Chr11 26924904 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 27001476 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 27001493 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 27001535 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.02;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 27032736 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.46;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 27121236 . A G 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.1567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.37;MQ0=6;MQRankSum=1.176;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:57:57,0,177 Chr11 27142766 . C A 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.47;MQ0=0;QD=3.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:9:70,9,0 Chr11 27142794 . C A 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.47;MQ0=0;MQRankSum=1.670;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.696 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,5:13:9:70,9,0 Chr11 27181139 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.53;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 27183979 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 27184000 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 27184018 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 27184042 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 27198593 . T G 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.28;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr11 27204112 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 27237866 . T C 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=0;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr11 27237886 . C G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.61;MQ0=1;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:49,6,0 Chr11 27245655 . A T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 27258391 . G T 69.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.34;MQ0=8;QD=5.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,4:12:9:97,9,0 Chr11 27258432 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;DP=28;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.59;MQ0=15;MQRankSum=0.849;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.386 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:84:84,0,94 Chr11 27258439 . T C 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.620;DP=28;Dels=0.00;FS=2.522;HaplotypeScore=1.7339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.59;MQ0=15;MQRankSum=0.849;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.620 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:84:84,0,94 Chr11 27260523 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 27356743 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.82;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 27358676 . C T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.60 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 Chr11 27358718 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr11 27361437 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 27361474 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 27436022 . A G 252.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.96;MQ0=0;QD=13.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:30:281,30,0 Chr11 27467620 . T C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr11 27467656 . G C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=19.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:86,9,0 Chr11 27472660 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 27474265 . C A 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;DP=11;Dels=0.00;FS=16.154;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQ0=0;MQRankSum=0.715;QD=4.62;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:79:79,0,298 Chr11 27574474 . T A 89.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.66;MQ0=33;MQRankSum=-0.077;QD=1.95;ReadPosRankSum=-2.855 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:42,4:46:99:118,0,269 Chr11 27598944 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 27674245 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 27690948 . T A 73.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.246;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.2852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.70;MQ0=6;MQRankSum=1.505;QD=1.94;ReadPosRankSum=1.090 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,5:38:99:102,0,298 Chr11 27690977 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;DP=37;Dels=0.00;FS=2.004;HaplotypeScore=3.8516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.79;MQ0=6;MQRankSum=0.913;QD=1.07;ReadPosRankSum=-0.088 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:33,4:37:68:68,0,307 Chr11 27731263 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr11 27731265 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr11 27731278 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr11 27731285 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=15.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:73,6,0 Chr11 27731293 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr11 27731294 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr11 27731308 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.87;MQ0=0;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr11 27732705 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;DP=29;Dels=0.00;FS=2.576;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.16;MQ0=0;MQRankSum=2.941;QD=1.27;ReadPosRankSum=-3.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,4:29:65:65,0,813 Chr11 27781600 . C A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 27828389 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.61;MQ0=2;MQRankSum=1.231;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:81,6,0 Chr11 27867569 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 27867601 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 27867611 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 27898641 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 27950092 . A G 111.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.18;MQ0=0;QD=15.99 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:140,15,0 Chr11 27950111 . G A 208.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.34;MQ0=0;QD=20.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:24:237,24,0 Chr11 27950359 . G C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.76;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 27971167 . G T 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr11 28025518 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 28084716 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 28102059 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 28197923 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 28249431 . G A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.11;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 28312986 . G T 139.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=4.260;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.322;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:96:168,0,96 Chr11 28324461 . C G 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 28334596 . C A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 28334606 . C T 77.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:105,9,0 Chr11 28346511 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 28363523 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 28380947 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 28381015 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 28458951 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;DP=28;Dels=0.00;FS=4.512;HaplotypeScore=2.9667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.73;MQ0=0;MQRankSum=0.360;QD=1.06;ReadPosRankSum=1.320 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:58:58,0,480 Chr11 28552891 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 28613724 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 28742742 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.179;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.120;QD=3.06;ReadPosRankSum=-3.479 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,5:28:99:114,0,857 Chr11 28765045 . T A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 28815121 . T C 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=24.48 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr11 28830411 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.24;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 28899447 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 28899458 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 28904025 . A G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 28909655 . C A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.766;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQ0=0;MQRankSum=-4.104;QD=3.34;ReadPosRankSum=-4.104 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,7:38:99:155,0,1153 Chr11 28910146 . C A 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.853;DP=37;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.35;ReadPosRankSum=-3.853 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,6:37:99:115,0,1163 Chr11 28910557 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.315;QD=2.22;ReadPosRankSum=-2.709 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:66:66,0,472 Chr11 28928267 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.05;MQ0=0;QD=10.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:70,6,0 Chr11 28932117 . G A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:65:65,0,146 Chr11 28942160 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.41;MQ0=1;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr11 28984213 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 29048305 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr11 29048392 . A G 154.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:183,15,0 Chr11 29065156 . G C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 29074927 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 29133415 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:63:63,0,147 Chr11 29263230 . A T 166.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:195,15,0 Chr11 29274355 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 29274372 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29282308 . T C 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.35;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 29289415 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 29342005 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 29356720 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.16;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:82,6,0 Chr11 29363825 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29365436 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 29370386 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29370434 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29377218 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 29377242 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 29391927 . A G 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 29391953 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 29406964 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 29407002 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 29456712 . A T 238.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:267,21,0 Chr11 29459594 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 29591030 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 29591050 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.50;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 29604805 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 29619277 . A C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 29619278 . A T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 29619287 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 29619312 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 29619671 . G A 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 Chr11 29622247 . G C 108.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.19;MQ0=0;QD=27.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:136,12,0 Chr11 29633894 . C T 55.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;DP=14;Dels=0.00;FS=6.892;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.28;MQ0=0;MQRankSum=-3.204;QD=3.98;ReadPosRankSum=1.276 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,7:14:84:84,0,233 Chr11 29633906 . G C 91.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.90;MQ0=0;QD=13.13 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:15:120,15,0 Chr11 29633925 . G A 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.90;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:34:56,0,34 Chr11 29654066 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.72;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:60,0,30 Chr11 29654104 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.19;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:118,9,0 Chr11 29675011 . T C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 29704868 . A T 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.04;MQ0=0;QD=26.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 Chr11 29709663 . G A 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 29736822 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 29737885 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 29737901 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 29830495 . G A 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.97;MQ0=0;QD=4.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:53,6,0 Chr11 29896661 . C A 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 29904356 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 29931125 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 29948289 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29963840 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 29963843 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 30053051 . T G 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:143,12,0 Chr11 30148585 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 30148618 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.01;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 30215233 . G T 27.91 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=19.08;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=6.98;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:15:56,0,15 Chr11 30420959 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=8.33;MQ0=24;QD=2.27 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:24,3:27:9:89,9,0 Chr11 30498747 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=1;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr11 30498756 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.99;MQ0=1;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr11 30553619 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 30553662 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 30577502 . T A 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.19;MQ0=21;QD=1.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,20:28:9:71,9,0 Chr11 30598271 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 30603757 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 30669390 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 30760426 . C G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.69;MQ0=0;QD=3.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:58,6,0 Chr11 30773278 . A G 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.42;MQ0=1;QD=19.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:104,9,0 Chr11 30825878 . A T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=13.97;MQ0=19;MQRankSum=-2.362;QD=2.30;ReadPosRankSum=-0.653 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,11:36:99:111,0,123 Chr11 30826742 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.37;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=8.19;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:60,6,0 Chr11 30853615 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:71,6,0 Chr11 30875491 . T C 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.355;DP=15;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.57;MQ0=0;MQRankSum=2.062;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.530 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:176,0,220 Chr11 30875499 . C G 109.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;DP=15;Dels=0.00;FS=4.472;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.57;MQ0=0;MQRankSum=1.408;QD=7.32;ReadPosRankSum=-0.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,5:15:99:138,0,223 Chr11 30875501 . A G 142.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.002;DP=15;Dels=0.00;FS=3.979;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.57;MQ0=0;MQRankSum=1.945;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.059 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,6:15:99:171,0,220 Chr11 30877409 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 30895546 . C G 170.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.42;MQ0=0;QD=28.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:199,18,0 Chr11 30895585 . T C 94.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.18;MQ0=0;QD=23.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:122,12,0 Chr11 30921494 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQ0=2;MQRankSum=-1.026;QD=5.96;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:60:64,0,60 Chr11 30925749 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.52;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 30927169 . A T 265.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.59;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:294,21,0 Chr11 30927190 . G A 257.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.59;MQ0=0;QD=33.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:286,21,0 Chr11 30927200 . A G 264.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.59;MQ0=0;QD=28.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:293,21,0 Chr11 30949265 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 30952258 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 30979634 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 30979641 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 30979663 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 30983088 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 31004655 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.94;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:64,0,30 Chr11 31004746 . T C 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=16.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:77,9,0 Chr11 31090202 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 31171504 . C T 499.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.00;MQ0=0;QD=26.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,13:13:39:528,39,0 Chr11 31200029 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.52;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 31218911 . G A 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8321;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=13.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:69,6,0 Chr11 31238721 . C G 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:73,0,30 Chr11 31249269 . T C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 31249295 . G A 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.24;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr11 31375991 . A T 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.22;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:46:77,0,46 Chr11 31413933 . C A 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.22;MQ0=5;MQRankSum=3.262;QD=4.88;ReadPosRankSum=-3.344 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,5:26:46:155,0,46 Chr11 31423210 . C T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;QD=8.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:61,6,0 Chr11 31423235 . A C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:61,6,0 Chr11 31423246 . A T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:61,6,0 Chr11 31423256 . A G 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.46;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.44;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:61,6,0 Chr11 31445882 . C T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 31523554 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 31540843 . G T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr11 31556380 . G A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.09;MQ0=0;QD=3.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:49,6,0 Chr11 31590241 . T G 38.84 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.14;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.95;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:18:67,0,18 Chr11 31612550 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:66,0,33 Chr11 31620077 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 31630931 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=52.44;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 31653025 . T C 291.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:320,24,0 Chr11 31699695 . G T 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 31717525 . A C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.71;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 31717554 . A G 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.71;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr11 31785021 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 31785023 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 31785041 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 31785071 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 31786276 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.58;MQ0=1;QD=5.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:49,6,0 Chr11 31900156 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 31900179 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 31933893 . G A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 31937939 . A G 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr11 32049068 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 32049072 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 32049085 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32049094 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32049116 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 32049135 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 32063134 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 32063135 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32063148 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32063149 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32063157 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.12;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32189466 . A T 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;DP=10;Dels=0.00;FS=8.451;HaplotypeScore=2.4673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.72;MQ0=0;MQRankSum=0.365;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:82:82,0,135 Chr11 32198014 . C A 112.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.879;DP=43;Dels=0.00;FS=15.086;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQ0=0;MQRankSum=3.405;QD=2.62;ReadPosRankSum=4.129 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,7:43:99:141,0,1292 Chr11 32216412 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.94;MQ0=0;QD=0.85 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,43:43:6:64,6,0 Chr11 32218556 . T A 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 32246912 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.43;MQ0=23;MQRankSum=1.589;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:29,2:31:6:62,6,0 Chr11 32246979 . C A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.91;MQ0=2;QD=8.69 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:62,6,0 Chr11 32246986 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.16;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 32251961 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.02;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 32260387 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.33;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 32260417 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.69;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,2:7:6:71,6,0 Chr11 32263160 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 32268053 . C A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 32290339 . A G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.01;MQ0=14;MQRankSum=-3.505;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.526 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,9:34:70:70,0,529 Chr11 32290349 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.88;MQ0=2;MQRankSum=-3.464;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.833 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,6:21:73:73,0,494 Chr11 32294805 . C G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.06;MQ0=1;MQRankSum=1.495;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,2:8:6:57,6,0 Chr11 32294863 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.32;MQ0=1;MQRankSum=0.684;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.956 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:6,3:9:6:57,6,0 Chr11 32307334 . G A 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.36;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 32307723 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.80;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 32335728 . T C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 32343661 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 32376106 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.50;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 32521476 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.49;MQ0=16;QD=3.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,26:26:9:124,9,0 Chr11 32550954 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 32632077 . T G 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,70 Chr11 32655232 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 32655264 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.50;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 32714094 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 32714096 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 32714106 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 32714109 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 32714135 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 32715087 . A T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 32715088 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 32782411 . A G 105.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9832;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.13;MQ0=0;QD=7.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,15:15:12:133,12,0 Chr11 32883189 . C T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.60;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr11 32883207 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.60;MQ0=1;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:57,6,0 Chr11 32887674 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 32947080 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQ0=0;MQRankSum=-2.691;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.691 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:66:66,0,463 Chr11 32977088 . A G 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 32977654 . G A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr11 32977669 . A C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 Chr11 32977801 . A G 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 32977834 . G A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 32998621 . T C 194.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:223,18,0 Chr11 32998641 . G C 198.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:227,18,0 Chr11 33057324 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 33057375 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 33057409 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 33057420 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 33108262 . C A 97.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.79;MQ0=0;MQRankSum=2.219;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,4:9:99:126,0,114 Chr11 33151349 . C T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 33151372 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 33237158 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 33279328 . A T 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 33291224 . A T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.061;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.825 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:49:49,0,322 Chr11 33340905 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 33379169 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 33388959 . A G 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:78:78,0,102 Chr11 33388975 . G A 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:78:78,0,104 Chr11 33388985 . C T 49.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQ0=0;MQRankSum=-1.920;QD=6.22;ReadPosRankSum=-0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:78:78,0,100 Chr11 33389046 . T G 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.95;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 33389400 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.50;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 33389419 . G A 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.44;MQ0=0;QD=13.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:68,6,0 Chr11 33389422 . G A 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.44;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr11 33389444 . C T 78.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.44;MQ0=0;QD=26.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:106,9,0 Chr11 33409105 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 33461737 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.371;DP=15;Dels=0.00;FS=6.410;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.54;MQ0=0;MQRankSum=-2.670;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.650 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:61:61,0,444 Chr11 33469804 . A C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.68;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 33496904 . T C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 33496959 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 33581357 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:67:72,0,67 Chr11 33617843 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 33617888 . T A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 33658095 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 33658167 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 33684199 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 33685545 . C A 214.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.791;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=4.77;ReadPosRankSum=-4.791 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,10:45:99:243,0,1304 Chr11 33686389 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 33756380 . G T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,172 Chr11 33759012 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 33759014 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 33797296 . A G 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr11 33798728 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 33865478 . G T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr11 33865563 . A G 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:107,9,0 Chr11 33995277 . T C 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 34002581 . G A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 34002582 . G A 75.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:103,9,0 Chr11 34002628 . A G 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 34008764 . C A 228.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.10;MQ0=3;QD=22.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:257,21,0 Chr11 34008771 . G C 241.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.10;MQ0=3;QD=24.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:21:270,21,0 Chr11 34099896 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.895;QD=5.78;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:86:86,0,252 Chr11 34101931 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.358;QD=7.15;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,102 Chr11 34147854 . G A 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:23:50,0,23 Chr11 34147875 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 34148532 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 34149334 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 34149378 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 34149413 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 34207654 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr11 34219738 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 34219824 . T C 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 34231755 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,266 Chr11 34231769 . A T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.8660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:57:57,0,265 Chr11 34283549 . C G 49.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4679;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.45;MQ0=6;MQRankSum=0.731;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:7,4:11:9:77,9,0 Chr11 34292622 . C G 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.19;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 34325898 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 34338106 . C A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.179;QD=2.42;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,250 Chr11 34341956 . G A 168.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:197,15,0 Chr11 34353063 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 34371668 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 34516213 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 34545313 . T A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.965;DP=66;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.44;MQ0=16;MQRankSum=-2.401;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.173 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,48:66:69:88,0,69 Chr11 34545442 . C A 53.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.45;MQ0=0;MQRankSum=1.531;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:82:82,0,265 Chr11 34556695 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 34575515 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 34634903 . A C 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.59;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 34683839 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 34727228 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:74,0,32 Chr11 34727544 . G T 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.001;DP=19;Dels=0.00;FS=17.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=2;MQRankSum=2.208;QD=4.04;ReadPosRankSum=-3.001 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,4:19:99:105,0,348 Chr11 34727630 . C A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=25.21;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:154,12,0 Chr11 34807187 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 34914075 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 34955615 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.46;MQ0=4;MQRankSum=0.358;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:9:32:50,0,32 Chr11 34959135 . C A 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.07;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=11.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:61:112,0,61 Chr11 34974081 . G A 127.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.26;MQ0=1;MQRankSum=1.495;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:36:156,0,36 Chr11 34974202 . C T 66.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=11.71;MQ0=14;MQRankSum=0.198;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,5:21:15:95,0,15 Chr11 35006900 . G A 38.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.64;MQ0=4;QD=6.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:66,6,0 Chr11 35044950 . G T 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.55;MQ0=3;QD=5.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:55,6,0 Chr11 35166378 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 35166454 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.50;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 35180054 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.50;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 35186628 . G A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.04;MQ0=0;MQRankSum=-2.313;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.437 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:73:73,0,277 Chr11 35186640 . C T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;DP=30;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.08;MQ0=13;MQRankSum=-0.685;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.685 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:25,5:30:73:73,0,267 Chr11 35186830 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 35187159 . T G 73.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:102,0,27 Chr11 35192227 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.56;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 35213296 . T A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 35221668 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.34;MQ0=0;MQRankSum=1.666;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:50:50,0,207 Chr11 35225201 . A T 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.74;MQ0=0;MQRankSum=3.034;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.194 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,6:14:99:182,0,219 Chr11 35240166 . G A 89.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.37;MQ0=2;QD=14.84 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:12:117,12,0 Chr11 35286722 . G A 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr11 35322129 . G A 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.36;MQ0=0;MQRankSum=-2.450;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.470 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:86:86,0,164 Chr11 35322185 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.421;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:71:71,0,142 Chr11 35322186 . T G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=35.19;MQ0=0;MQRankSum=-2.017;QD=5.35;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,4:8:71:71,0,144 Chr11 35391735 . T G 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.51;MQ0=0;QD=15.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:58,6,0 Chr11 35426350 . C A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.61;MQ0=0;QD=2.72 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:49,6,0 Chr11 35426377 . A G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.67;MQ0=0;QD=4.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:49,6,0 Chr11 35457434 . T G 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.597;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.49;MQ0=0;MQRankSum=-2.657;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.356 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:128,0,341 Chr11 35457989 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 35458023 . T G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 35461340 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.81;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 35534805 . G A 82.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.67;MQ0=2;QD=13.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,4:6:12:110,12,0 Chr11 35604611 . A T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.744;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=7.9933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.13;MQ0=0;MQRankSum=1.419;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.446 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,4:23:79:79,0,452 Chr11 35649178 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 35680759 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.89;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 35680797 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.89;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 35680808 . C T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.89;MQ0=0;QD=17.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:62,6,0 Chr11 35809991 . G A 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 35810099 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:125,9,0 Chr11 35810139 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=0;QD=22.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:118,9,0 Chr11 35810152 . T C 79.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.59;MQ0=0;QD=19.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:107,9,0 Chr11 35811456 . C T 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 35811514 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.98;MQ0=0;QD=10.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:80,6,0 Chr11 35815665 . G C 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 35909997 . C G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 35924191 . C T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.75;MQ0=2;MQRankSum=-2.539;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:69:69,0,320 Chr11 35924198 . T C 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.75;MQ0=2;MQRankSum=-2.539;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.363 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,10:24:72:72,0,304 Chr11 35924211 . T A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.71;MQ0=2;MQRankSum=-1.306;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,7:23:72:72,0,293 Chr11 35924237 . A C 58.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.17;MQ0=0;QD=14.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:86,9,0 Chr11 35971486 . G T 21.82 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.34;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:22:50,0,22 Chr11 36056447 . A T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 36056474 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 36056480 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.04;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 36172029 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 36188941 . A T 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:109,0,30 Chr11 36188994 . A C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 36191868 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 36191891 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 36191933 . C A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 36191954 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 36193887 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 36193918 . T C 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 36193972 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 36194894 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 36199400 . C A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 36199402 . A G 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 36270912 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 36346101 . A T 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.33;MQ0=1;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:49,6,0 Chr11 36409859 . C A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.10;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 36441704 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 36441721 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 36471854 . C A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.48;MQ0=1;QD=8.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:54,6,0 Chr11 36471934 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr11 36549558 . G A 128.03 . 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T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.58;MQ0=0;QD=2.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:53,6,0 Chr11 36627901 . G C 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.69;MQ0=0;QD=7.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:111,12,0 Chr11 36627921 . C G 83.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=16.69;MQ0=0;QD=7.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:111,12,0 Chr11 36681018 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 36681035 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 36681041 . C G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 36681046 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 36681048 . C G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 36738332 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 36754033 . T C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 36754100 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 36772520 . A G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 36791626 . T A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.68;MQ0=4;MQRankSum=1.380;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:54,6,0 Chr11 36808955 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 36808981 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 37006449 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 37012606 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 37019726 . A G 93.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.19;MQ0=0;QD=15.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:122,15,0 Chr11 37021781 . C T 208.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.83;MQ0=0;QD=26.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:21:237,21,0 Chr11 37023408 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 37060857 . A C 187.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:216,18,0 Chr11 37060886 . T C 233.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:262,21,0 Chr11 37165629 . G A 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.51;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr11 37204301 . G A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 37226903 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.08;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 37226904 . C T 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.08;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 37226948 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.08;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 37245446 . T C 138.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.18;MQ0=0;QD=15.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:18:167,18,0 Chr11 37266467 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 37266479 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 37266504 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 37266507 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 37404796 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.29;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 37404807 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.29;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 37453509 . A T 122.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:150,12,0 Chr11 37466765 . G T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:58:58,0,147 Chr11 37479386 . C T 115.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:143,12,0 Chr11 37543725 . C A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;DP=66;Dels=0.00;FS=14.139;HaplotypeScore=9.2206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.41;MQ0=7;MQRankSum=2.005;QD=0.47;ReadPosRankSum=-3.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:62,4:66:59:59,0,890 Chr11 37614104 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 37614171 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 37709007 . T C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.180;DP=15;Dels=0.00;FS=10.170;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=23.12;MQ0=1;MQRankSum=2.335;QD=2.98;ReadPosRankSum=2.491 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:73:73,0,171 Chr11 37720907 . G T 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.52;MQ0=1;MQRankSum=0.736;QD=9.94;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:29:68,0,29 Chr11 37726607 . C A 98.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.35;MQ0=3;MQRankSum=-0.731;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,4:8:12:126,12,0 Chr11 37771283 . C G 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.18;MQ0=0;QD=19.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:85,9,0 Chr11 37771315 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.18;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 37774789 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 37825563 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 37861556 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.07;MQ0=2;MQRankSum=0.406;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:8:49:74,0,49 Chr11 37886784 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;DP=116;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.3472;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=13.34;MQ0=4;MQRankSum=2.406;QD=0.43;ReadPosRankSum=-1.219 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:114,2:116:6:77,6,0 Chr11 37887443 . G T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:25:134,0,25 Chr11 37887475 . C T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:134,0,27 Chr11 37887477 . T G 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:134,0,27 Chr11 37887489 . T A 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:134,0,27 Chr11 37887498 . C T 105.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.29;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=21.16;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:134,0,26 Chr11 38037987 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 38087968 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.75;MQ0=1;QD=14.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:71,6,0 Chr11 38091569 . C G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.42;MQ0=0;QD=12.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:64,6,0 Chr11 38091587 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.92;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 38091588 . C A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.92;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 38091589 . G A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.92;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 38091597 . T G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=0;QD=1.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:65,6,0 Chr11 38091624 . C G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=0;QD=1.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:65,6,0 Chr11 38091625 . A C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=0;QD=1.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:65,6,0 Chr11 38091627 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=0;QD=1.11 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:65,6,0 Chr11 38091642 . G A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.97;MQ0=0;QD=1.08 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,34:34:6:64,6,0 Chr11 38091797 . T C 44.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:25:73,0,25 Chr11 38091875 . T C 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:50:50,0,183 Chr11 38095608 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.67;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 38095609 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 38095613 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 38125813 . A G 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.05;MQ0=12;MQRankSum=0.727;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:30:115,0,30 Chr11 38125816 . A G 86.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.05;MQ0=12;MQRankSum=0.727;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,3:16:30:115,0,30 Chr11 38349021 . C T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 38417363 . C A 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 38428886 . A C 164.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:193,15,0 Chr11 38429010 . G T 203.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=22.64;ReadPosRankSum=1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,7:9:54:232,0,54 Chr11 38439739 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 38439797 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.67;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 38448213 . G T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.340;DP=36;Dels=0.00;FS=8.609;HaplotypeScore=1.5779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQ0=2;MQRankSum=0.243;QD=1.88;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:31,5:36:96:96,0,948 Chr11 38488287 . A G 71.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.34;MQ0=0;QD=14.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:99,12,0 Chr11 38538083 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 38538126 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 38570235 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 38592270 . G A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 38634802 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 38655565 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 38665310 . C G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 38732615 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 38732649 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9665;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 38732656 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 38782175 . G A 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.30;MQ0=3;MQRankSum=0.322;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.322 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:41:56,0,41 Chr11 38782193 . T A 26.97 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.94;MQ0=0;QD=3.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:8:9:71,9,0 Chr11 38782202 . C T 101.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.404;DP=21;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.14;MQ0=0;MQRankSum=-0.413;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,20:21:15:130,15,0 Chr11 38795725 . T C 25.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.09;MQ0=0;QD=12.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:53,6,0 Chr11 38805009 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 38811757 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,227 Chr11 38860988 . T A 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.20;MQ0=0;QD=29.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:207,15,0 Chr11 38860991 . G C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.20;MQ0=0;QD=30.15 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:15:209,15,0 Chr11 38957235 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 39014541 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 39014558 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 39014975 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 39015005 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=41.68;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 39043291 . G T 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.00;MQ0=0;QD=17.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:63,6,0 Chr11 39044783 . C A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.78;MQ0=0;QD=15.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:89,9,0 Chr11 39112742 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 39162260 . C G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 39162267 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 39162277 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 39171727 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 39187441 . G A 142.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.91;MQ0=0;QD=23.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:171,18,0 Chr11 39189066 . T A 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 39189067 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 39189079 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 39271297 . T A 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.898;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,256 Chr11 39339832 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.45;MQ0=0;QD=10.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:59,6,0 Chr11 39339900 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.45;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.58;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:59,6,0 Chr11 39347036 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 39387866 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 39402796 . A G 80.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.30;MQ0=0;QD=20.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:108,12,0 Chr11 39403797 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 39419232 . T A 65.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.406;QD=10.96;ReadPosRankSum=-1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:94:94,0,106 Chr11 39423285 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 39424595 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 39424596 . C T 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 39469413 . G A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.59 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 39470366 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 39470374 . G T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 39470391 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 39504906 . T C 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.43;MQ0=1;QD=5.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:9:74,9,0 Chr11 39504953 . C T 46.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.421;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.95;MQ0=1;MQRankSum=0.922;QD=5.14;ReadPosRankSum=-1.638 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,4:9:9:74,9,0 Chr11 39520709 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=10.19;MQ0=10;QD=1.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,12:16:6:50,6,0 Chr11 39546272 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 39551928 . C T 98.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 39681211 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 39681216 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 39681219 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 39686277 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.77 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 39686282 . G A 179.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 39709246 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 39709253 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 39713615 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 39713618 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 39713662 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 39713686 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 39724555 . T G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.50;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 39727452 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=0;QD=14.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:4:6:84,6,0 Chr11 39743320 . A T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.134;DP=28;Dels=0.00;FS=13.108;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.033;QD=1.49;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:24,4:28:70:70,0,879 Chr11 39775179 . C G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,105 Chr11 39826637 . G A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQ0=0;MQRankSum=-2.262;QD=5.34;ReadPosRankSum=-2.262 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:87:87,0,303 Chr11 39827692 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:96,0,69 Chr11 39827693 . T C 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:96,0,69 Chr11 39827695 . C A 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.13;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:69:96,0,69 Chr11 39827732 . T A 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=17.79;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:135,0,66 Chr11 39827733 . T G 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:134,0,66 Chr11 39827738 . A T 105.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:66:134,0,66 Chr11 39837387 . T C 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.92;MQ0=1;QD=12.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:78,9,0 Chr11 40046709 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 40053398 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,257 Chr11 40095680 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 40187921 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 40198809 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 40198820 . G A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 40198846 . A C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 40198861 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 40201432 . G A 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 40355713 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.91;MQ0=1;MQRankSum=0.727;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,3:5:6:58,6,0 Chr11 40470934 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 40492739 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 40505273 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 40555273 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 40558984 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 40596348 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 40605164 . C G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 40605165 . A G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.61;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 40657908 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr11 40657949 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:62,0,32 Chr11 40683752 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 40687111 . G A 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.83;MQ0=3;MQRankSum=2.878;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.817 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:12,12:24:12:168,12,0 Chr11 40703692 . T C 39.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:26:68,0,26 Chr11 40748444 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 40749748 . C A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:57:57,0,142 Chr11 40812053 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 40812070 . G T 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 40812107 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 40812135 . A G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=53.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 40815296 . A T 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.116;DP=42;Dels=0.00;FS=58.545;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.272;QD=3.52;ReadPosRankSum=-4.372 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,8:42:99:176,0,1289 Chr11 40815392 . C A 118.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:146,12,0 Chr11 40849380 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 40851658 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 40872470 . G T 70.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;DP=31;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.510;QD=2.28;ReadPosRankSum=-3.518 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,5:31:99:99,0,927 Chr11 40882940 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 40883316 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:28:68,0,28 Chr11 40883365 . A T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 40883385 . G C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 40883388 . T G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.72;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 40890423 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,104 Chr11 40890516 . C A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:68,0,31 Chr11 40926900 . C A 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.067;QD=2.75;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:53:53,0,258 Chr11 40957228 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 40957262 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 40957268 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 40965398 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 40965435 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41060726 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 41162663 . T C 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr11 41162675 . G A 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr11 41162682 . G T 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr11 41162683 . T C 48.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.67;MQ0=0;QD=16.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:76,9,0 Chr11 41173558 . T A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 41242356 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41242400 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:63:63,0,70 Chr11 41333672 . G A 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.720;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:57:57,0,148 Chr11 41336935 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:83,6,0 Chr11 41340564 . C A 54.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 41340635 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 41445140 . A G 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 41446700 . C A 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.689;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.831;QD=11.23;ReadPosRankSum=-2.793 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:99:163,0,238 Chr11 41477339 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.34;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 41515133 . A C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 41544387 . C A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:66,0,32 Chr11 41600862 . T G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 41601229 . C A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 41601280 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 41608848 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,95 Chr11 41608849 . A T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,92 Chr11 41612186 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 41612202 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41612231 . T C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 41614263 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.38;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 41643002 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41693317 . G T 71.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=17.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:100,0,27 Chr11 41697311 . G C 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 41715017 . G T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.787;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.803;QD=3.24;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:93:93,0,592 Chr11 41765274 . G T 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.67;MQ0=21;QD=1.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:21,2:23:6:61,6,0 Chr11 41779547 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41798270 . G T 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr11 41798282 . G A 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr11 41798283 . A G 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr11 41798331 . T C 40.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.00;MQ0=0;QD=13.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:68,9,0 Chr11 41799827 . G T 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.90;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:50:65,0,50 Chr11 41829956 . A C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 41844214 . G T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:52:52,0,187 Chr11 41845565 . T A 124.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:152,12,0 Chr11 41853712 . A G 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 41853740 . T C 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.03;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 Chr11 41861222 . G A 139.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:167,12,0 Chr11 41885174 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41886042 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41886714 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=9.69;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:67,0,64 Chr11 41888715 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41888748 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41954122 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 41954131 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 41956421 . C A 197.84 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 42139685 . C G 174.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:203,15,0 Chr11 42143122 . A T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 42143397 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 42143400 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 42143435 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 42143568 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42143571 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42147124 . A T 134.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.851;QD=13.48;ReadPosRankSum=-2.450 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:163,0,166 Chr11 42160169 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 42190072 . C G 54.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.33;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 42343315 . T C 125.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:153,12,0 Chr11 42372112 . C T 85.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:113,12,0 Chr11 42372127 . A G 85.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.51;MQ0=0;QD=21.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:113,12,0 Chr11 42391797 . T C 136.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:164,12,0 Chr11 42397980 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42397985 . G C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 42397996 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42402775 . C T 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 42422717 . C T 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:65:98,0,65 Chr11 42422719 . A G 69.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.19;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=13.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:66:98,0,66 Chr11 42453722 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 42453750 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 42453762 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42453763 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42453786 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42453796 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42457806 . T G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.77;MQ0=1;MQRankSum=0.358;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:54:54,0,111 Chr11 42461217 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42461232 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 42501706 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 42501726 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 42501741 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.01;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 42506491 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.49;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 42545462 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 42546533 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 42546574 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 42546585 . G T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 42546595 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 42546597 . A G 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 42568056 . T G 40.78 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 42618835 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 42618838 . C G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 42618860 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 42618866 . C T 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 42618868 . G A 92.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 42668399 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 42673924 . G A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 42677585 . G C 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 42677641 . G C 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr11 42720987 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 42744677 . C G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 42744699 . A T 156.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:185,15,0 Chr11 42757165 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42757173 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42757182 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 42757221 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 42785813 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.20;MQ0=7;MQRankSum=2.041;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,2:19:6:81,6,0 Chr11 42785851 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.826;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.20;MQ0=7;MQRankSum=2.041;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.107 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:17,2:19:6:81,6,0 Chr11 42974311 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 42974317 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 42974538 . C G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 42974562 . T C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 Chr11 42976030 . C T 32.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:27:61,0,27 Chr11 42990752 . G C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.52;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 43028863 . C T 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr11 43028889 . C G 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr11 43028895 . C T 43.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.00;MQ0=0;QD=14.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:71,9,0 Chr11 43033287 . C A 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 43033389 . G C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43033390 . C A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43033391 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 43055798 . A G 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43055826 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 43055851 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 43057940 . G A 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.212;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:93:93,0,365 Chr11 43057946 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.22;MQ0=0;MQRankSum=-1.318;QD=3.81;ReadPosRankSum=0.264 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:93:93,0,366 Chr11 43057973 . C T 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=6.7342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.047 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:93:93,0,365 Chr11 43057989 . A G 64.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.669;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.6253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.68;MQ0=0;MQRankSum=-1.171;QD=3.60;ReadPosRankSum=-2.388 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:93:93,0,366 Chr11 43058125 . T G 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.99;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr11 43058141 . C T 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.99;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr11 43058148 . C T 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.99;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr11 43058163 . G C 50.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.99;MQ0=0;QD=10.06 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:78,9,0 Chr11 43116578 . A T 130.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.387;QD=11.89;ReadPosRankSum=-1.749 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:99:159,0,195 Chr11 43116904 . G T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.99;MQ0=1;QD=18.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:82,6,0 Chr11 43123469 . G T 57.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.978;DP=11;Dels=0.00;FS=12.632;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.37;MQ0=0;MQRankSum=2.262;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.715 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:86:86,0,195 Chr11 43123618 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 43128670 . C A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.08;MQ0=0;QD=17.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:81,6,0 Chr11 43128678 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.51;MQ0=3;MQRankSum=1.660;QD=1.28;ReadPosRankSum=2.820 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,4:42:6:81,6,0 Chr11 43128681 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.260;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.51;MQ0=3;MQRankSum=0.350;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.942 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,40:42:6:81,6,0 Chr11 43128688 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8218;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.51;MQ0=3;QD=1.28 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:42:6:81,6,0 Chr11 43128714 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.51;MQ0=3;MQRankSum=1.502;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.976 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:38,4:42:6:81,6,0 Chr11 43133981 . T C 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.07;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 43134071 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 43148626 . T C 107.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=0;QD=21.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:136,15,0 Chr11 43148651 . A T 107.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.64;MQ0=0;QD=21.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:136,15,0 Chr11 43148683 . A C 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr11 43161266 . T C 53.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.81;MQ0=0;QD=8.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:9:81,9,0 Chr11 43186473 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 43186491 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43186528 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43191481 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.01;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43226569 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43233021 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 43233030 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43245797 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43288471 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:54:54,0,211 Chr11 43368244 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 43377243 . T C 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 43377282 . A C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43390833 . T C 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 43448438 . T A 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 43490172 . A G 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 43490261 . T G 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=14.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:72,0,29 Chr11 43493219 . T A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.217;QD=2.85;ReadPosRankSum=-2.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:71:71,0,416 Chr11 43523244 . T C 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 43523261 . T C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 43523278 . G T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,97 Chr11 43523461 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43535226 . T G 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 43535239 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 43535264 . T C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 43535295 . G A 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 43535305 . G T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 43548234 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43548238 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43548239 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43548240 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43548243 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 43548245 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43551393 . G T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 43569678 . T A 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.904;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.891 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:35,6:41:99:110,0,1250 Chr11 43624058 . T C 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.556;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-1.742;QD=2.39;ReadPosRankSum=1.297 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,4:25:88:88,0,764 Chr11 43624060 . C A 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.631;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.376;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,3:25:51:51,0,817 Chr11 43628006 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43635830 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43665709 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.09;MQ0=0;QD=17.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:80,6,0 Chr11 43677895 . A C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43677903 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 43700471 . G A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 43700490 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43704569 . A G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.213;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.426 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,5:24:99:133,0,620 Chr11 43706702 . T G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 43707697 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:69,0,64 Chr11 43711013 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;DP=74;Dels=0.00;FS=9.665;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.739;QD=0.47;ReadPosRankSum=1.238 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,7:74:63:63,0,2490 Chr11 43711045 . C T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.330;DP=74;Dels=0.00;FS=9.665;HaplotypeScore=4.7875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.330;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.259 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:67,7:74:63:63,0,2443 Chr11 43723038 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 43723579 . T C 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 43731135 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 43731154 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43731363 . A T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.974;DP=43;Dels=0.00;FS=4.951;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.701;QD=0.88;ReadPosRankSum=-3.618 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:38,5:43:66:66,0,1437 Chr11 43731575 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43734259 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43739700 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43739703 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43739705 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43739721 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 43742699 . A G 214.84 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 43760421 . G A 119.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:147,12,0 Chr11 43760446 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 43760524 . A G 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 43760911 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 43760983 . A T 52.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 43839396 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43839430 . A G 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 43839748 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:61:101,0,61 Chr11 43847544 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43847577 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 43858972 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 43860217 . G A 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 43888072 . C T 218.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:247,18,0 Chr11 43888079 . C T 203.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:232,18,0 Chr11 43888146 . T A 217.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:246,18,0 Chr11 43888159 . A G 197.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:226,18,0 Chr11 43890119 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 43899484 . A T 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.990;DP=27;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.444;QD=1.66;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:73:73,0,811 Chr11 43932562 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.589;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.354 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:51:51,0,345 Chr11 43971970 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 43973424 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 43982554 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 43982595 . G A 254.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=33.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:283,21,0 Chr11 43982597 . G T 256.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.14;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:285,21,0 Chr11 43984548 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 43984571 . T C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 43984577 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43984581 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 43984590 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 43984597 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 43984598 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 43984599 . T C 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 43984612 . C A 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 43998686 . T A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 43998688 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 43998691 . C T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 43998696 . C A 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 44009909 . G A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 44025687 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 44040958 . C T 131.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 44043726 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44044394 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44044935 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 44048233 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44060924 . G A 53.74 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr11 44113682 . A G 167.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:196,15,0 Chr11 44115869 . T C 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 44115872 . T C 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 44116871 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.505;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.670 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:70:70,0,439 Chr11 44117027 . T C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 44124634 . G C 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 44182039 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.47;MQ0=8;QD=4.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,10:10:6:68,6,0 Chr11 44347160 . G T 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.44;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:70,0,70 Chr11 44356371 . T C 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr11 44356376 . G A 170.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.00;MQ0=0;QD=34.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:199,15,0 Chr11 44356479 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.58;MQ0=2;QD=12.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:79,6,0 Chr11 44358950 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44358958 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44358974 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 44359244 . G A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 44359277 . T A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 44359287 . G C 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 44359290 . A T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.28;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 44389521 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 44417566 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 44422340 . A T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 44429693 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 44431170 . C T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 44431228 . A C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 44437343 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44437838 . T G 52.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.32;MQ0=0;QD=17.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:80,9,0 Chr11 44488972 . G T 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 Chr11 44531579 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 44663964 . G T 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.42;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 44719028 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 44719066 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44719069 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 44729382 . C T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 44733301 . C G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 44735052 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:65,0,67 Chr11 44736054 . C T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 44736094 . G T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 44741782 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44741831 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44741841 . T G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=15.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:53:105,0,53 Chr11 44749437 . C T 39.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.02;MQ0=0;QD=19.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:67,6,0 Chr11 44750281 . A G 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:6:55:55,0,135 Chr11 44765517 . A G 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=36.42 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr11 44765522 . T C 176.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:205,15,0 Chr11 44769790 . G T 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=13.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:69,0,32 Chr11 44779549 . A G 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr11 44779554 . G A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr11 44779569 . C A 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.55;MQ0=0;QD=14.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:56,6,0 Chr11 44784334 . A G 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 44784343 . G A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 44784364 . T A 141.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:170,15,0 Chr11 44784699 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 44785517 . T A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:75,0,32 Chr11 44785530 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:74,0,30 Chr11 44785548 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr11 44785613 . T A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 44785619 . T A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 44786273 . C A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 44787555 . T C 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:65,0,30 Chr11 44787588 . T C 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:146,0,27 Chr11 44798786 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44803381 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,217 Chr11 44814331 . T G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 44835918 . G A 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 Chr11 44835938 . A C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 44843627 . T A 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 44860315 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44860350 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=34.50;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 44862734 . T C 73.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=18.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:101,9,0 Chr11 44885658 . C A 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.546;QD=5.98;ReadPosRankSum=-2.166 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,3:10:88:88,0,198 Chr11 44885772 . A G 552.77 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.67 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,14:14:42:581,42,0 Chr11 44887490 . G A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 44887503 . G A 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 Chr11 44891169 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 44891253 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 44891822 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 44919683 . G T 243.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.289;QD=18.75;ReadPosRankSum=-2.637 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,8:13:99:272,0,122 Chr11 44919769 . C A 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 44929497 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 44929506 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 44936670 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.900;DP=42;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.162;QD=1.73;ReadPosRankSum=-3.900 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:36,6:42:99:101,0,1352 Chr11 44976640 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 45005881 . G A 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 45016395 . G A 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,111 Chr11 45025841 . C T 85.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.28;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.45;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:23:114,0,23 Chr11 45032262 . T C 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:55,0,33 Chr11 45032276 . T G 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.68;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:56,0,33 Chr11 45032314 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 45104365 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.03;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 45105360 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 45109942 . T G 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.683;DP=9;Dels=0.00;FS=4.771;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.27;MQ0=0;MQRankSum=0.248;QD=2.75;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:53:53,0,151 Chr11 45109963 . T G 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:107,0,26 Chr11 45109965 . A C 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.76;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:107,0,26 Chr11 45109967 . A C 78.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.69;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=15.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:107,0,26 Chr11 45109984 . T A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=12.13;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:51:101,0,51 Chr11 45109998 . A T 116.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.79;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=19.47;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:21:145,0,21 Chr11 45110003 . T C 138.85 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.42;MQ0=0;MQRankSum=-0.742;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.742 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,6:7:17:167,0,17 Chr11 45110181 . G C 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.548;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.369;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.078 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:66:66,0,633 Chr11 45110187 . C G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.369;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.705 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:66:66,0,640 Chr11 45110193 . A G 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQ0=0;MQRankSum=-3.369;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.410 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,5:22:66:66,0,644 Chr11 45116849 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45116852 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45116853 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45116878 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 45131112 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 45134355 . C A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.329;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.27;MQ0=0;MQRankSum=2.646;QD=1.29;ReadPosRankSum=-2.752 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,3:20:54:54,0,464 Chr11 45135601 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 45137691 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.57;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 45139698 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45140503 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 45142310 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.75;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 45144576 . G T 93.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.82;MQ0=0;QD=18.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:122,15,0 Chr11 45191064 . A G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 45191660 . T C 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr11 45212104 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 45212110 . T A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 45212113 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 45212119 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 45212276 . G A,T 162.29 . AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/2:0,3,4:7:99:268,157,148,112,0,100 Chr11 45232743 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.46;MQ0=3;QD=9.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:74,6,0 Chr11 45232805 . T C 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.50;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 45237756 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 45267165 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 45269651 . C T 130.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:158,12,0 Chr11 45277679 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 45282363 . C A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.381;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQ0=0;MQRankSum=-4.758;QD=1.31;ReadPosRankSum=4.719 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,13:32:70:70,0,718 Chr11 45283314 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 45294184 . G A 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 45296672 . G T 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.762;QD=2.31;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:49:49,0,263 Chr11 45302240 . G A 132.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:160,12,0 Chr11 45302258 . A G 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.679;DP=22;Dels=0.00;FS=31.875;HaplotypeScore=19.6232;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.383;QD=1.35;ReadPosRankSum=2.679 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:19,3:22:58:58,0,643 Chr11 45329435 . G A 114.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.37;MQ0=0;QD=28.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:142,12,0 Chr11 45329469 . G C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 45329497 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 45336272 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 45336334 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 45379904 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 45379908 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45379918 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 45382634 . G A 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:68,0,32 Chr11 45406055 . T C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,190 Chr11 45457123 . C G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.762;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.53;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:51:51,0,249 Chr11 45481325 . G T 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.572;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:53:53,0,214 Chr11 45481421 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 45568655 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 45733099 . G T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.110;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.264;QD=6.69;ReadPosRankSum=-3.215 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,5:17:99:142,0,439 Chr11 45756757 . A G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 45756786 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 45860680 . C T 85.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:114,0,27 Chr11 45860790 . G T 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:112,0,30 Chr11 45871608 . G T 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.863;DP=38;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.460;QD=2.34;ReadPosRankSum=-3.863 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,6:38:99:117,0,1201 Chr11 45871694 . C A 87.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.769;DP=40;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.572;QD=2.19;ReadPosRankSum=-3.882 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,6:40:99:116,0,1277 Chr11 45889868 . G A 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr11 45889873 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr11 45889905 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.00;MQ0=0;QD=11.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:51,6,0 Chr11 45983034 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 45983076 . T C 54.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.10;MQ0=0;QD=13.70 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:4:9:96,9,0 Chr11 45983081 . T C 106.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=26.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:134,12,0 Chr11 45983104 . G C 70.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.10;MQ0=0;QD=17.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:98,9,0 Chr11 45984295 . C A 60.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.046;DP=24;Dels=0.00;FS=21.813;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.891;QD=2.53;ReadPosRankSum=-3.137 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,4:24:89:89,0,712 Chr11 46061301 . G A 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.302;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.49;MQ0=102;MQRankSum=-0.293;QD=0.48;ReadPosRankSum=-0.753 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:83,49:132:12:91,12,0 Chr11 46061317 . A G 63.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;DP=132;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=3.49;MQ0=102;MQRankSum=0.904;QD=0.48;ReadPosRankSum=-0.215 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:116,16:132:12:91,12,0 Chr11 46147821 . C A 177.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.35 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:206,15,0 Chr11 46147836 . T G 171.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:200,15,0 Chr11 46156587 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46157351 . A C 181.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:210,18,0 Chr11 46163643 . A G 141.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.71 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:169,12,0 Chr11 46166450 . G T 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.029;DP=43;Dels=0.00;FS=5.252;HaplotypeScore=1.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.427;QD=0.88;ReadPosRankSum=-3.612 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:37,5:43:66:66,0,1384 Chr11 46169633 . T G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.720;QD=17.46;ReadPosRankSum=1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:133,0,62 Chr11 46169708 . T A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=19.46;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:6:62:145,0,62 Chr11 46189168 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 46191559 . T G 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 46191637 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46191691 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 46191819 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46191832 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46207154 . G T 124.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46222144 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 46222625 . C A 141.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.920;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.322;QD=15.75;ReadPosRankSum=-1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,5:9:98:170,0,98 Chr11 46223557 . A T 235.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.751;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.751;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.751 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,8:9:11:263,0,11 Chr11 46237084 . T C 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.45;MQ0=0;QD=29.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:18:238,18,0 Chr11 46237158 . T C 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.06;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:304,24,0 Chr11 46239234 . C T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 46324511 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:29:74,0,29 Chr11 46352334 . C A 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.832;DP=16;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.020;QD=7.30;ReadPosRankSum=-2.945 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,5:16:99:145,0,388 Chr11 46397856 . A T 209.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=44.93;MQ0=0;QD=34.97 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:238,18,0 Chr11 46399881 . C A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,184 Chr11 46403555 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 46404283 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 46404293 . A C 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 Chr11 46404298 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 46444913 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 46450344 . C A 272.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.29;MQ0=0;QD=34.10 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:301,24,0 Chr11 46451088 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46451106 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46509827 . T C 80.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:108,9,0 Chr11 46509828 . G T 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 Chr11 46540896 . T A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.60;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr11 46540905 . T G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.60;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr11 46540909 . T G 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.60;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr11 46540951 . C A 21.77 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.60;MQ0=0;QD=7.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:49,6,0 Chr11 46557145 . T G 125.03 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 46593452 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 46593461 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 46593467 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 46598713 . G T 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 46609478 . C G 70.28 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.22;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 46668992 . C T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 46669041 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 46669043 . A G 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:121,9,0 Chr11 46669048 . G T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 46672562 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 46676727 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46677844 . A G 122.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:21:151,0,21 Chr11 46682907 . A T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 46693359 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46704687 . A G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=20.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:68,6,0 Chr11 46704688 . A G 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 46704709 . C T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 46727616 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 46728181 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 46728184 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 46764101 . T C 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr11 46764110 . G T 26.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.55;MQ0=0;QD=13.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:54,6,0 Chr11 46766448 . T G 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=21.19;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:113,0,30 Chr11 46766520 . A C 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.01;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 46781338 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46789744 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 46789776 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 46799035 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 46858406 . G A 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.09;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr11 46858416 . T C 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.09;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr11 46858418 . T G 116.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.09;MQ0=0;QD=29.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:144,12,0 Chr11 46885191 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46917751 . A G 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 46917753 . A G 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 46920022 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 46920082 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 46921465 . C G 155.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:184,15,0 Chr11 46928646 . A G 128.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;DP=13;Dels=0.00;FS=8.921;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.696;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.381 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:99:157,0,285 Chr11 46930434 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 46931012 . C A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 46932867 . T A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9661;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.47;MQ0=0;QD=30.45 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 46932877 . A C 109.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:24:138,0,24 Chr11 46932887 . C T 161.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:190,15,0 Chr11 46949709 . G T 117.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.74;MQ0=0;QD=29.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:145,12,0 Chr11 46949733 . C T 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 46949737 . C G 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 46949751 . G C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 46949762 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=27.72;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 Chr11 46951065 . A T 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 46957867 . G C 58.90 . 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AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.881;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=20.99;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.729 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:58:105,0,58 Chr11 46971660 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 46971684 . G C 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 46971688 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 46971697 . G A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.34;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 46987151 . T C 158.90 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.66;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=22.57;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:118,9,0 Chr11 47027220 . A G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47027263 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 47036447 . A G 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr11 47036468 . T C 45.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.67;MQ0=0;QD=15.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:73,9,0 Chr11 47041289 . G T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.00;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 47049184 . G C 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.27;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 Chr11 47061155 . C G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 47061171 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47061209 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 47061226 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 47084363 . G T 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.503;QD=1.83;ReadPosRankSum=-2.739 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:63:63,0,575 Chr11 47084508 . G A 89.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:117,9,0 Chr11 47086502 . G A 44.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.94;MQ0=0;QD=22.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:72,6,0 Chr11 47086506 . T G 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=38.94;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 47097543 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.58;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 47097592 . A G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.58;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 47097595 . G A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=40.58;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 47126950 . A C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 47126951 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 47126953 . A T 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 47126966 . T C 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.10;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 47127013 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=45.10;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 47131665 . G C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.89;MQ0=0;QD=12.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:76,6,0 Chr11 47131749 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.92;MQ0=4;QD=8.12 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:4,2:6:6:76,6,0 Chr11 47155248 . T G 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47155258 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47155268 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47155286 . C A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47155297 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=39.01;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47159302 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 47165989 . C T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47165993 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47166032 . T C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47166863 . C T 76.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=25.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:104,9,0 Chr11 47166877 . T C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 47166891 . G A 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr11 47166918 . C G 72.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.06;MQ0=0;QD=24.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:100,9,0 Chr11 47167078 . C T 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=30.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 47167114 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=30.89 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 47167115 . A G 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=26.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 47167119 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=24.63 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 47167126 . T A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=27.44 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 47167138 . T C 178.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.81;MQ0=0;QD=29.30 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:207,15,0 Chr11 47178922 . G A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 47178928 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47182988 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47210765 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.423;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.03;MQ0=2;MQRankSum=-1.944;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.592 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,11:15:73:74,0,73 Chr11 47215422 . A C 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;DP=52;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=33.27;MQ0=3;MQRankSum=-5.724;QD=0.86;ReadPosRankSum=-5.724 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:20,32:52:73:73,0,592 Chr11 47215641 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47215642 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47215650 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47215682 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47220965 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 47226713 . T C 107.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.74;MQ0=4;MQRankSum=-2.949;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.743 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,18:32:99:136,0,171 Chr11 47226814 . C T 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.15;MQ0=0;MQRankSum=-1.067;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,198 Chr11 47251645 . G T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 47290085 . C A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr11 47290103 . T C 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 47290114 . C T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 47290122 . T A 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 47290133 . T G 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 47290138 . G T 133.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=37.51;MQ0=0;QD=33.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:161,12,0 Chr11 47290245 . A C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 47296107 . G A 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.22 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 47299973 . T A 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr11 47302223 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.77;MQ0=31;QD=1.57 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:31,2:33:6:79,6,0 Chr11 47303789 . A T 137.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:165,12,0 Chr11 47305574 . C T 160.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:189,15,0 Chr11 47312859 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 47321410 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47329032 . C A 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 47329049 . G C 180.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.80 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:209,15,0 Chr11 47329052 . G A 181.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.04 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:210,15,0 Chr11 47329053 . T C 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 47329063 . A G 179.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.64 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:208,15,0 Chr11 47329101 . A G 165.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:194,15,0 Chr11 47329499 . G A 117.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=23.56;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:146,0,27 Chr11 47355780 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47422235 . T A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;DP=14;Dels=0.00;FS=7.160;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.061;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.909 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:76:76,0,353 Chr11 47429645 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.054;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.97;ReadPosRankSum=-2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:91:91,0,221 Chr11 47431100 . G T 84.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:112,9,0 Chr11 47442873 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 47442876 . T G 81.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:110,0,27 Chr11 47458569 . A T 39.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:68,0,20 Chr11 47463556 . A T 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.02;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 Chr11 47484834 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 47484917 . A G 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 47484970 . G C 162.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:191,15,0 Chr11 47485425 . A T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.85;MQ0=0;QD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:70,9,0 Chr11 47485429 . C A 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.85;MQ0=0;QD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:70,9,0 Chr11 47485451 . T C 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.85;MQ0=0;QD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:70,9,0 Chr11 47485463 . A T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.85;MQ0=0;QD=8.46 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:9:70,9,0 Chr11 47486773 . G A 121.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.95;MQ0=0;QD=11.00 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:12:149,12,0 Chr11 47501008 . G A 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 Chr11 47501796 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.59;MQ0=0;QD=7.29 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:6:71,6,0 Chr11 47542424 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.47;MQ0=0;MQRankSum=1.733;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.480 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,2:10:6:82,6,0 Chr11 47583003 . C T 113.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.7055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.83;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:13:58:142,0,58 Chr11 47586761 . C T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;DP=32;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.168;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.256 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:28,4:32:72:72,0,1086 Chr11 47586893 . C A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 47645182 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,189 Chr11 47645199 . T C 163.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:192,15,0 Chr11 47645564 . T A 153.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.14;MQ0=0;QD=30.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:182,15,0 Chr11 47661068 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 47661660 . G T 114.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=22.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:26:143,0,26 Chr11 47661669 . C G 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 47687505 . A C 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 47687528 . C T 22.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.51;MQ0=0;QD=11.38 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:50,6,0 Chr11 47687534 . G C 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 47687535 . T A 61.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.89;MQ0=0;QD=20.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:89,9,0 Chr11 47697101 . T C 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 Chr11 47697275 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 47697299 . A T 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=43.01;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 Chr11 47697309 . G A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 47765634 . A G 175.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:204,15,0 Chr11 47769453 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47779971 . G A 126.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:154,12,0 Chr11 47779974 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.07 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:124,9,0 Chr11 47804521 . A G 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 47804539 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47804579 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47804594 . T C 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 47804599 . A T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 Chr11 47804600 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 47807592 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47807631 . G C 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 Chr11 47807633 . G A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 47810972 . C T 85.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.27;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:11:113,0,11 Chr11 47810986 . C G 87.10 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.74;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.77;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:11:115,0,11 Chr11 47811142 . G A 37.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.99;MQ0=2;MQRankSum=-0.851;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.851 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,5:12:56:66,0,56 Chr11 47811193 . C G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;DP=11;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.466 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:63:63,0,74 Chr11 47811194 . T C 53.16 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=0;QD=4.83 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:11:12:97,12,0 Chr11 47811195 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;DP=11;Dels=0.00;FS=3.424;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.12;MQ0=0;MQRankSum=-1.031;QD=3.16;ReadPosRankSum=-1.186 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,5:11:63:63,0,74 Chr11 47811260 . C G 28.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:57,0,33 Chr11 47811299 . C T 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.32;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:58,0,32 Chr11 47849502 . G A 71.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=17.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:99,9,0 Chr11 47849506 . T A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.96;MQ0=1;QD=20.82 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,3:4:9:111,9,0 Chr11 47899224 . G T 28.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.64;MQ0=0;QD=3.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:6:56,6,0 Chr11 47911020 . C A 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.83;MQ0=0;MQRankSum=3.423;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.371 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:91:207,0,91 Chr11 47911024 . A G 182.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=9.2375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.83;MQ0=0;MQRankSum=3.423;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,6:20:91:211,0,91 Chr11 47912036 . G T 303.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.483;DP=56;Dels=0.00;FS=44.021;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.252;QD=5.42;ReadPosRankSum=-4.929 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,13:56:99:332,0,1587 Chr11 47914715 . T C 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=57.46;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 47914721 . C A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:73,0,33 Chr11 47914725 . C A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 47938070 . T G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 47938096 . A T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 47938108 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47938124 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47938128 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47938138 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47938143 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47938146 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47964975 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47965006 . G T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47971089 . C T 687.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.694;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.51;MQ0=0;MQRankSum=1.387;QD=34.40;ReadPosRankSum=-1.041 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,19:20:15:716,15,0 Chr11 47971295 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47971303 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47971337 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 47972440 . T A 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 47996270 . G T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 47996287 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 47999310 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.5657;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.81;MQ0=0;QD=13.94 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:83,6,0 Chr11 47999326 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.81;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=12.19;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,2:4:6:76,6,0 Chr11 48020886 . G A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.139;DP=56;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.02;MQ0=29;MQRankSum=2.268;QD=0.39;ReadPosRankSum=2.083 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:32,24:56:50:50,0,188 Chr11 48023591 . A G 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.666;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.067 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,266 Chr11 48024676 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 48024716 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48024759 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.01;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 48055717 . T A 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 48055718 . C T 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:75,0,30 Chr11 48055742 . C T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:31:74,0,31 Chr11 48055772 . A T 40.80 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:21:69,0,21 Chr11 48065593 . G C 136.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=14.47;MQ0=0;QD=7.20 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,19:19:21:165,21,0 Chr11 48065614 . G C 99.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.559;DP=24;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=4.16;ReadPosRankSum=3.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:128,0,158 Chr11 48065635 . T A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;DP=24;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=4.20;ReadPosRankSum=3.341 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:129,0,145 Chr11 48065652 . A C 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.711;DP=24;Dels=0.00;FS=19.956;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=21.81;MQ0=0;MQRankSum=-3.412;QD=4.20;ReadPosRankSum=-2.061 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,19:24:99:129,0,158 Chr11 48065670 . G C 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;DP=32;Dels=0.00;FS=12.357;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.94;MQ0=4;MQRankSum=-3.184;QD=3.24;ReadPosRankSum=-3.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,28:32:99:132,0,123 Chr11 48070515 . G A 68.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;DP=22;Dels=0.00;FS=7.404;HaplotypeScore=2.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQ0=0;MQRankSum=1.149;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.809 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:97:97,0,674 Chr11 48070778 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48070779 . G T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48078554 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.08;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 48101937 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.17;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:68:68,0,70 Chr11 48101987 . C T 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.80;MQ0=42;MQRankSum=-1.026;QD=0.52;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:46:52:52,0,72 Chr11 48101998 . C A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.80;MQ0=42;MQRankSum=-1.026;QD=0.76;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:44,2:46:63:63,0,70 Chr11 48102009 . A G 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=45;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=14.96;MQ0=41;MQRankSum=-1.026;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:43,2:45:59:59,0,69 Chr11 48109764 . A T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr11 48109772 . C G 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr11 48109775 . C T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr11 48109780 . A T 64.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=26.00;MQ0=0;QD=21.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:92,9,0 Chr11 48152581 . C G 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=18.0163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.16;MQ0=0;MQRankSum=-2.948;QD=1.89;ReadPosRankSum=1.741 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,12:28:83:83,0,468 Chr11 48159027 . C T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:67,0,112 Chr11 48159034 . A G 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.15;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:64:64,0,112 Chr11 48162677 . A T 142.98 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=23.83;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:13:171,0,13 Chr11 48168173 . A C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 48168200 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 48168217 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 48173362 . T C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 48216576 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 48239453 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 48301082 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48301091 . T A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 48373089 . G C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 48379230 . T C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.02;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=10.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:71,0,30 Chr11 48379251 . A G 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:71,0,30 Chr11 48379267 . C T 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=32.66;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=8.55;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:30:71,0,30 Chr11 48405138 . C G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 48405214 . A C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 48444174 . G A 140.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQ0=1;MQRankSum=0.198;QD=17.60;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:47:169,0,47 Chr11 48444183 . G A 113.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=18.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:20:142,0,20 Chr11 48444187 . T C 147.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=24.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:22:176,0,22 Chr11 48444192 . A G 135.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.26;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=22.63;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,5:6:23:164,0,23 Chr11 48444204 . C T 144.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=20.68;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:173,0,59 Chr11 48444211 . G T 147.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.11;ReadPosRankSum=1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:60:176,0,60 Chr11 48444231 . G A 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=21.68;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:180,0,59 Chr11 48444248 . A G 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.15;MQ0=0;MQRankSum=0.198;QD=22.25;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:59:184,0,59 Chr11 48452952 . C G 120.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=30.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:148,12,0 Chr11 48465029 . T G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48465192 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 48488314 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 48490417 . T A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.670;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.083;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.938 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:64:64,0,436 Chr11 48522682 . G T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 48535510 . T A 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 Chr11 48535515 . G C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48546277 . G A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 48546350 . G T 92.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=55.34;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:120,9,0 Chr11 48546444 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48598703 . C A 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:67:101,0,67 Chr11 48616612 . T A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 48616617 . T C 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 Chr11 48621417 . G T 129.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.10;MQ0=0;MQRankSum=-2.533;QD=9.27;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:158,0,332 Chr11 48621426 . G T 98.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.231;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.70;MQ0=0;MQRankSum=-2.855;QD=7.60;ReadPosRankSum=0.540 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,4:13:99:127,0,338 Chr11 48622160 . T C 298.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.61 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:327,24,0 Chr11 48622173 . A G 275.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=34.47 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:24:304,24,0 Chr11 48625582 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 48649368 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 48649878 . A C 140.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.16 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:168,12,0 Chr11 48649918 . T G 129.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.26 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:157,12,0 Chr11 48649941 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 48654400 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48657958 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 48680040 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 48683273 . C A 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:115,9,0 Chr11 48715117 . G T 50.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.249;QD=1.95;ReadPosRankSum=-3.162 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,4:26:79:79,0,785 Chr11 48715202 . C A 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.150;DP=27;Dels=0.00;FS=9.748;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.512;QD=1.62;ReadPosRankSum=-3.174 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:23,4:27:72:72,0,820 Chr11 48780395 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 48872033 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 48878141 . C A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 Chr11 48878147 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.61;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 48880730 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 Chr11 48881059 . T A 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 48884447 . C A 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=21.44;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:114,0,30 Chr11 48926132 . C T 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 48926199 . C A 36.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.50;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:65:65,0,106 Chr11 48926513 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.98;MQ0=0;QD=24.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:125,9,0 Chr11 48926550 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.02;MQ0=0;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:76,6,0 Chr11 48934119 . T A 131.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:159,12,0 Chr11 48934220 . T A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 48937278 . C G 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 48937282 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.48;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 48992091 . C G 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;DP=27;Dels=0.00;FS=3.136;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.28;MQ0=0;MQRankSum=-2.507;QD=3.88;ReadPosRankSum=2.045 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,24:27:80:133,0,80 Chr11 48992134 . A G 82.94 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.62;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=20.73;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:14:111,0,14 Chr11 49045071 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.77;MQ0=1;QD=7.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,8:8:6:84,6,0 Chr11 49050853 . C A 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:64,0,32 Chr11 49121731 . A G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 49121756 . C T 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 49129397 . G C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 49173652 . G A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49173783 . C T 95.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:123,9,0 Chr11 49173799 . A C 135.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=33.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:163,12,0 Chr11 49199077 . A G 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 Chr11 49199132 . G A 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 Chr11 49199136 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 Chr11 49214885 . A T 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=12.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:32:67,0,32 Chr11 49214970 . T A 26.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.7340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:55:55,0,203 Chr11 49216026 . A G 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.34;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr11 49216051 . C T 59.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.34;MQ0=0;QD=19.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:87,9,0 Chr11 49344118 . G A 221.77 . 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AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 49364222 . C A 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 49365011 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49375443 . G A 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 Chr11 49375459 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49375473 . T A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 49376992 . T A 339.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=58.97;MQ0=0;QD=32.86 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,9:9:27:368,27,0 Chr11 49377401 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49377422 . C A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49385073 . C T 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:64,0,33 Chr11 49385088 . G C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 49385131 . A G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 Chr11 49386584 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 Chr11 49386975 . T G 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 Chr11 49391817 . A T 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 Chr11 49502180 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49504667 . C T 82.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.036 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:111,0,182 Chr11 49505295 . T C 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:70,0,33 Chr11 49505325 . G A 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.59;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:75,0,33 Chr11 49506106 . G C 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 49515259 . G A 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,72 Chr11 49515270 . T C 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,70 Chr11 49517844 . C T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 49552100 . C T 122.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.731;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:6:24:151,0,24 Chr11 49571482 . T A 177.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.203;QD=19.75;ReadPosRankSum=1.203 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,6:9:53:206,0,53 Chr11 49584287 . G A 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 Chr11 49616717 . G A 104.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.278;DP=11;Dels=0.00;FS=6.264;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.663;QD=9.52;ReadPosRankSum=1.246 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,4:11:99:133,0,257 Chr11 49712075 . C T 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 Chr11 49712939 . G T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 49722833 . A C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49732142 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 Chr11 49765143 . A T 43.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=10.94;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:70:72,0,70 Chr11 49768722 . C G 41.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.44;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:4:32:70,0,32 Chr11 49772568 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 49789849 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,213 Chr11 49789863 . A G 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,214 Chr11 49789880 . T C 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:60:60,0,223 Chr11 49789882 . A G 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.8667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQ0=0;MQRankSum=-1.589;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:63:63,0,183 Chr11 49804850 . C T 67.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.322;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.684;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.684 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:9:96:96,0,176 Chr11 49806359 . G A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 Chr11 49806704 . C G 40.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:69:69,0,69 Chr11 49807852 . C A 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 Chr11 49929246 . G A 119.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.333;DP=14;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.667;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.200 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,5:14:99:148,0,302 Chr11 49944813 . T C 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;DP=24;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.349 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:21,3:24:51:51,0,787 Chr11 49945181 . T A 44.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.217;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.072 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:73:73,0,449 Chr11 49959821 . A G 52.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQ0=0;MQRankSum=-1.683;QD=5.86;ReadPosRankSum=-0.248 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:81:81,0,204 Chr11 49959829 . C T 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;DP=10;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-1.133;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:108,0,207 Chr11 49959842 . A G 95.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;DP=10;Dels=0.00;FS=5.441;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQ0=0;MQRankSum=-0.365;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.365 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,4:10:99:124,0,204 Chr11 49975653 . A T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 49986387 . G T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.380;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.380;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.380 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,2:7:57:57,0,147 Chr11 49990778 . T C 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:64:101,0,64 Chr11 49990803 . T C 20.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.733 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,2:10:49:49,0,248 Chr11 49994168 . T A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.572;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.572;QD=3.85;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:59:59,0,224 Chr11 50004896 . G A 80.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.616;DP=14;Dels=0.00;FS=11.553;HaplotypeScore=6.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.778;QD=5.77;ReadPosRankSum=-2.899 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,4:14:99:109,0,374 Chr11 50112741 . A G 126.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.8995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.851;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.336 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:155,0,159 Chr11 50114304 . C T 230.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.439;DP=24;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.949;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.398 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:259,0,577 Chr11 50114323 . G A 228.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;DP=24;Dels=0.00;FS=1.680;HaplotypeScore=0.9999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.092;QD=9.53;ReadPosRankSum=-0.582 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,8:24:99:257,0,584 Chr11 50114378 . C A 127.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:155,12,0 Chr11 50159345 . T C 123.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:27:152,0,27 Chr11 50171269 . T C 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 50171282 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 50171283 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 50171285 . A T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 Chr11 50171311 . G C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 Chr11 50171380 . T C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 Chr11 50171398 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 Chr11 50189243 . A G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 Chr11 50197128 . C A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.067;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:9:52:52,0,243 scaffold_12 405 . G C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.312;DP=79;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.3893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.29;MQ0=4;MQRankSum=2.187;QD=0.45;ReadPosRankSum=-2.417 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:77,2:79:64:64,0,149 scaffold_12 5607 . C T 32.79 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:24:61,0,24 scaffold_12 11984 . C T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.03;MQ0=0;MQRankSum=0.355;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.237 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:15,3:18:60:60,0,503 scaffold_12 18479 . G A 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQ0=1;MQRankSum=1.026;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:67:71,0,67 scaffold_12 41790 . A G 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 scaffold_12 42571 . C T 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.55;ReadPosRankSum=-0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:61:61,0,100 scaffold_12 50304 . T C 35.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=6.55;MQ0=32;QD=1.05 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:32,2:34:6:63,6,0 scaffold_12 50325 . G A 138.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;DP=48;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.33;MQ0=1;MQRankSum=0.662;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.041 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,9:48:99:167,0,659 scaffold_12 50390 . A T 106.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;DP=47;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.36;MQ0=1;MQRankSum=-5.421;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.847 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,25:47:99:135,0,644 scaffold_12 50409 . G T 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.673;DP=46;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.83;MQ0=0;MQRankSum=0.367;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.520 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:39,7:46:99:110,0,714 scaffold_12 50674 . T C 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=31.32;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 scaffold_12 53847 . G T 31.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;DP=49;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.4538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=15.63;MQ0=4;MQRankSum=-4.371;QD=0.65;ReadPosRankSum=1.487 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:26,23:49:29:60,0,29 scaffold_12 168559 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 scaffold_12 205227 . G A 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:58:58,0,175 scaffold_12 210397 . G T 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;DP=36;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.37;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=0.63;ReadPosRankSum=-2.383 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:34,2:36:51:51,0,55 scaffold_12 220874 . G C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.14;MQ0=5;QD=5.34 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,7:8:6:70,6,0 scaffold_12 280847 . T A 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 scaffold_12 280850 . A C 33.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=16.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:61,6,0 scaffold_12 310409 . G T 162.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.963;DP=50;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.33;MQ0=1;MQRankSum=-1.123;QD=3.26;ReadPosRankSum=-4.660 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:41,9:50:99:191,0,1411 scaffold_12 315605 . A G 22.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;DP=13;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQ0=3;MQRankSum=-1.271;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.898 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,5:13:51:51,0,298 scaffold_13 173140 . A T 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.01;MQ0=1;QD=10.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:58,6,0 scaffold_13 173241 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=42.43;MQ0=2;QD=12.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:76,6,0 scaffold_14 50655 . G T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:56:56,0,97 scaffold_14 61287 . G T 31.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.423;DP=15;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.3123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=34.75;MQ0=2;MQRankSum=-2.620;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.254 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,3:15:60:60,0,345 scaffold_14 66092 . A G 221.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.53 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:250,18,0 scaffold_14 66106 . G A 71.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.988;QD=11.96;ReadPosRankSum=0.406 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,3:6:99:100,0,101 scaffold_14 66136 . G A 34.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.358;QD=6.95;ReadPosRankSum=0.358 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,2:5:63:63,0,91 scaffold_17 21835 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.12;MQ0=8;QD=3.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,11:11:6:65,6,0 scaffold_17 27319 . G A 100.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;DP=16;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=8.7319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.45;MQ0=1;MQRankSum=-0.530;QD=6.30;ReadPosRankSum=-0.295 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:10,6:16:99:129,0,207 scaffold_17 32733 . C G 83.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=3.680;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQ0=0;MQRankSum=-1.754;QD=11.97;ReadPosRankSum=0.937 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:3,4:7:99:112,0,106 scaffold_17 32808 . G C 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.367;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:88:88,0,288 scaffold_17 32812 . A T 84.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=24.88;MQ0=0;MQRankSum=-3.367;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.151 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:113,0,285 scaffold_17 32839 . G C 81.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;DP=18;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.78;MQ0=0;MQRankSum=-3.419;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.234 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,6:18:99:110,0,313 scaffold_17 35017 . C T 43.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=21.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:71,6,0 scaffold_17 35026 . A C 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.02;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 scaffold_17 77585 . T A 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=49.12;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 scaffold_22 11656 . A T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=51.79;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 scaffold_23 87584 . G A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.68;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 scaffold_23 87589 . A G 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=20.68;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:55,6,0 scaffold_23 87598 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 scaffold_23 121208 . T G 82.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.00;MQ0=0;QD=27.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:110,9,0 scaffold_23 136139 . C A 27.81 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=18.22;MQ0=4;MQRankSum=0.736;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:21:56,0,21 scaffold_24 135896 . C T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 scaffold_24 135915 . A C 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 scaffold_24 135940 . A G 98.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:126,9,0 scaffold_24 135971 . T A 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 scaffold_24 138302 . A C 128.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.01 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:156,12,0 scaffold_24 138630 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 scaffold_24 138689 . T C 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 scaffold_25 10794 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 scaffold_25 10795 . A C 55.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:83,6,0 scaffold_28 6153 . T C 67.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.13;MQ0=0;QD=22.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:95,9,0 scaffold_28 14005 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 scaffold_28 31571 . G A 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 scaffold_28 37745 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 scaffold_28 37767 . A G 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=56.14;MQ0=0;QD=28.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:84,6,0 scaffold_32 11544 . G T 46.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.00;MQ0=0;QD=23.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:74,6,0 scaffold_32 26328 . C T 178.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=22.35;ReadPosRankSum=0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,6:8:53:207,0,53 scaffold_32 26331 . G C 32.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=10.92;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:61,0,30 scaffold_32 33099 . G A 155.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.922;QD=22.25;ReadPosRankSum=0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,5:7:52:184,0,52 scaffold_32 33108 . A G 151.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.470;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.336;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.668 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,5:10:99:180,0,176 scaffold_34 22712 . C T 56.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=18.91 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:84,6,0 scaffold_36 141216 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.74;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_36 141247 . G C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9789;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.74;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_38 8231 . A T 99.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=47.39;MQ0=0;QD=33.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:127,9,0 scaffold_39 20086 . T G 40.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.87;MQ0=0;QD=10.19 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:6:68,6,0 scaffold_40 5393 . C A 36.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=29.12;MQ0=0;QD=18.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:64,6,0 scaffold_40 5504 . C A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=46.22;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 scaffold_40 5654 . T C 170.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.8216;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=12.04;MQ0=1;QD=4.88 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,35:35:24:199,24,0 scaffold_40 5739 . A G 87.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.76;MQ0=2;MQRankSum=1.537;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.988 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:115,9,0 scaffold_40 5744 . A C 93.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.406;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.76;MQ0=2;MQRankSum=1.537;QD=11.66;ReadPosRankSum=1.537 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:121,9,0 scaffold_40 7586 . C T 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.68;MQ0=9;MQRankSum=-2.927;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.978 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,14:22:80:80,0,279 scaffold_40 7588 . T A 51.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.68;MQ0=9;MQRankSum=-2.237;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,4:22:80:80,0,286 scaffold_40 9014 . A T 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 scaffold_40 19424 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_40 19426 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_40 19450 . A G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_40 19465 . T G 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.00;MQ0=0;QD=14.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:57,6,0 scaffold_47 10922 . C G 201.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=15.95;MQ0=2;QD=4.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:2,39:41:18:230,18,0 scaffold_47 16349 . T A 60.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=24.67;MQ0=0;QD=20.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:88,9,0 scaffold_48 13373 . C T 138.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=50.25;MQ0=0;QD=34.51 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:166,12,0 scaffold_48 19166 . G A 75.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.15;MQ0=0;MQRankSum=0.727;QD=18.94;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:27:104,0,27 scaffold_49 4607 . C T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.00;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 scaffold_51 10693 . A C 33.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.67;MQ0=0;MQRankSum=-1.495;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:62:62,0,183 scaffold_51 10720 . C T 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.67;MQ0=0;MQRankSum=1.495;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.922 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:59:59,0,176 scaffold_52 3104 . G C 168.78 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.31;MQ0=52;QD=2.81 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:49,11:60:24:197,24,0 scaffold_53 11992 . T C 124.88 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;DP=25;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=16.34;MQ0=1;MQRankSum=-1.734;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.289 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,24:25:16:153,0,16 scaffold_54 16125 . C A 81.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.60;MQ0=0;QD=16.21 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:12:109,12,0 scaffold_56 18789 . T A 64.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=31.64;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=12.96;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,4:5:24:93,0,24 scaffold_59 7142 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.4530;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.48;MQ0=0;MQRankSum=1.231;QD=6.55;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:3,2:5:6:60,6,0 scaffold_59 7154 . T C 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=17.48;MQ0=0;QD=6.55 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:6:60,6,0 scaffold_59 8210 . A G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.64;MQ0=1;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:62,6,0 scaffold_59 8212 . G A 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.64;MQ0=1;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:62,6,0 scaffold_59 8222 . G T 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.64;MQ0=1;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:62,6,0 scaffold_59 8232 . C G 34.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=21.64;MQ0=1;QD=11.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:62,6,0 scaffold_59 9221 . G T 211.84 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.65 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,6:6:18:240,18,0 scaffold_60 1752 . G A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.387;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=9.43;ReadPosRankSum=0.717 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:132,0,170 scaffold_60 1758 . C A 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=9.43;ReadPosRankSum=1.031 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:132,0,169 scaffold_60 1785 . C T 103.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.83;MQ0=0;MQRankSum=-2.637;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.387 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,6:11:99:132,0,166 scaffold_69 4199 . C G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:67,0,56 scaffold_69 4207 . A G 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=-1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:67,0,56 scaffold_69 4249 . C A 38.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.231;QD=7.75;ReadPosRankSum=1.231 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,3:5:56:67,0,56 scaffold_70 11340 . T C 42.81 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.27;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:20:71,0,20 scaffold_70 11348 . T C 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 scaffold_86 3120 . T C 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.061;DP=15;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.123;QD=12.98;ReadPosRankSum=0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:223,0,133 scaffold_86 3126 . C A 194.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;DP=15;Dels=0.00;FS=2.216;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.06;MQ0=0;MQRankSum=-3.123;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.184 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,10:15:99:223,0,137 scaffold_86 3132 . T C 169.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.800;DP=14;Dels=0.00;FS=2.363;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.96;MQ0=0;MQRankSum=-3.067;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.400 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,9:14:99:198,0,145 scaffold_100 946 . A G 57.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=22.20;MQ0=0;QD=14.32 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:9:85,9,0 scaffold_103 8436 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 scaffold_104 9791 . C G 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.67;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=15.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:33:74,0,33 scaffold_106 439 . T C 30.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=7.39;MQ0=20;QD=1.40 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,22:22:6:58,6,0 scaffold_122 6350 . C A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 scaffold_124 8904 . G T 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 scaffold_131 1066 . A T 37.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=30.36;MQ0=0;QD=18.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:65,6,0 scaffold_134 3213 . G A 27.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=29.41;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:27:56,0,27 scaffold_137 7750 . C T 48.82 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=12.21;ReadPosRankSum=-0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:19:77,0,19 scaffold_143 2233 . G A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 scaffold_154 4312 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 scaffold_173 2395 . G T 132.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;DP=9;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.361;QD=14.75;ReadPosRankSum=-2.219 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,5:9:99:161,0,129 scaffold_193 1218 . C A 50.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:78,6,0 scaffold_193 1842 . A T 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 scaffold_193 3397 . C A 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.693;DP=20;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.425;QD=3.14;ReadPosRankSum=-3.071 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:20:91:91,0,592 scaffold_206 2021 . C A 150.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.261;DP=17;Dels=0.00;FS=10.296;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQ0=0;MQRankSum=-2.462;QD=8.87;ReadPosRankSum=-2.261 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,6:17:99:179,0,354 scaffold_209 3608 . G T 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:114,9,0 scaffold_209 3636 . A C 74.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:102,9,0 scaffold_209 3656 . C T 97.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=32.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:125,9,0 scaffold_209 3659 . A G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 scaffold_215 2363 . C A 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 scaffold_217 3765 . T C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=35.67;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 scaffold_221 3394 . T C 31.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.00;MQ0=0;QD=15.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:59,6,0 scaffold_227 112 . C G 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 scaffold_227 814 . T C 153.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;DP=37;Dels=0.00;FS=3.497;HaplotypeScore=26.7183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQ0=0;MQRankSum=-1.273;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,8:37:99:182,0,1007 scaffold_227 971 . C G 48.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=1.377;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:8,3:11:77:77,0,266 scaffold_227 989 . C G 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.391;QD=1.36;ReadPosRankSum=2.068 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,3:19:54:54,0,557 scaffold_227 2717 . G A 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.198;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.198;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.198 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,158 scaffold_227 3000 . A G 85.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.283;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.642 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:114,0,491 scaffold_227 3028 . T G 79.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.170;QD=4.69;ReadPosRankSum=-0.170 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:13,4:17:99:108,0,344 scaffold_227 3041 . C G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.788;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.303 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:12,4:17:99:105,0,409 scaffold_227 3321 . G C 54.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;DP=23;Dels=0.00;FS=6.990;HaplotypeScore=8.5683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQ0=0;MQRankSum=-0.047;QD=2.38;ReadPosRankSum=-2.221 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:16,4:23:83:83,0,542 scaffold_227 3341 . T C 29.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.063;DP=17;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.449;QD=1.75;ReadPosRankSum=-1.701 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,3:17:58:58,0,481 scaffold_227 3469 . A G 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.026;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:47:50,0,47 scaffold_227 4127 . T A 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;DP=34;Dels=0.00;FS=2.026;HaplotypeScore=1.9866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQ0=0;MQRankSum=-3.550;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:29,5:34:50:50,0,1042 scaffold_238 8581 . G A 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 scaffold_238 8615 . C T 90.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:118,9,0 scaffold_238 8639 . T A 91.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=30.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:119,9,0 scaffold_238 8652 . T G 96.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=32.09 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:124,9,0 scaffold_238 8667 . T G 94.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.67;MQ0=0;QD=31.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:122,9,0 scaffold_242 383 . G T 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 scaffold_242 480 . C A 86.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=36.74;MQ0=5;QD=10.79 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:5,3:8:9:114,9,0 scaffold_247 969 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=22.25;MQ0=0;MQRankSum=1.532;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.589 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:48:56,0,48 scaffold_254 650 . T C 88.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.417;DP=34;Dels=0.00;FS=47.362;HaplotypeScore=0.6651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=30.56;MQ0=11;MQRankSum=-4.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-4.000 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:14,20:34:99:117,0,506 scaffold_254 721 . C T 23.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=18.72;MQ0=0;QD=7.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:51,6,0 scaffold_256 2344 . T A 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=23.00;MQ0=0;QD=13.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:55,6,0 scaffold_268 2491 . A G 45.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=32.50;MQ0=0;QD=22.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:73,6,0 scaffold_290 1811 . T C 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 scaffold_290 1813 . G A 42.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=54.00;MQ0=0;QD=21.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:70,6,0 scaffold_300 3451 . T A 32.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=25.62;MQ0=0;QD=16.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:60,6,0 scaffold_306 1147 . C A 83.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:111,9,0 scaffold_330 171 . C A 58.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.463;DP=21;Dels=0.00;FS=5.935;HaplotypeScore=2.9978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.493;QD=2.80;ReadPosRankSum=-2.105 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:17,4:21:87:87,0,619 scaffold_330 652 . G A 88.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=29.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:116,9,0 scaffold_330 1630 . T G 69.78 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:26:98,0,26 scaffold_330 1707 . T C 116.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.9973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.56;MQ0=0;MQRankSum=-1.380;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.720 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,4:7:63:145,0,63 scaffold_330 1722 . A T 21.80 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=3.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQ0=0;MQRankSum=-2.003;QD=1.98;ReadPosRankSum=1.296 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:9,2:11:50:50,0,318 scaffold_330 1820 . G A 30.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=11;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.762;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.762 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:11:59:59,0,210 scaffold_330 1970 . A C 42.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQ0=0;MQRankSum=-0.736;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:30:71,0,30 scaffold_330 1991 . T C 39.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=9.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:65:68,0,65 scaffold_330 2242 . T G 62.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.937;QD=8.97;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:91:91,0,125 scaffold_330 2253 . C T 27.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=2.9326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.922;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.495 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,2:7:56:56,0,171 scaffold_330 2276 . C T 66.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.754 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:95:95,0,143 scaffold_330 2315 . A G 76.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.550;QD=10.97;ReadPosRankSum=-0.550 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:105,0,147 scaffold_330 2322 . G C 75.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.300 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:4,3:7:99:104,0,144 scaffold_338 863 . C T 28.77 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;DP=29;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=5.8905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=27.39;MQ0=1;MQRankSum=-2.822;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.941 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:11,18:29:57:57,0,246 scaffold_355 392 . A T 45.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;DP=60;Dels=0.00;FS=29.985;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=25.89;MQ0=0;MQRankSum=3.275;QD=0.76;ReadPosRankSum=-3.275 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:56,4:60:74:74,0,715 scaffold_355 488 . C A 94.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.093;DP=23;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.54;MQ0=0;MQRankSum=3.317;QD=4.12;ReadPosRankSum=-3.391 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:18,5:23:99:123,0,660 scaffold_369 343 . G A 85.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.43 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:9:113,9,0 scaffold_373 2170 . T C 29.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=19.81;MQ0=0;QD=9.92 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,3:3:6:57,6,0 scaffold_403 724 . G C 24.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;DP=26;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.9155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=17.17;MQ0=0;MQRankSum=2.037;QD=0.95;ReadPosRankSum=1.619 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:22,2:26:53:53,0,170 scaffold_403 749 . G A 23.79 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.067;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=26.40;MQ0=0;MQRankSum=1.589;QD=2.97;ReadPosRankSum=-0.572 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,2:8:52:52,0,134 scaffold_407 1194 . C T 247.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=28.17 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:276,21,0 scaffold_411 723 . T C 133.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:162,15,0 scaffold_411 746 . T G 133.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=26.78 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:162,15,0 scaffold_411 762 . A G 97.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.731;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;MQRankSum=-0.731;QD=19.41;ReadPosRankSum=0.731 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,4:5:12:125,12,0 scaffold_411 764 . C G 125.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=25.18 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:154,15,0 scaffold_411 787 . C G 129.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:158,15,0 scaffold_411 793 . C G 129.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:158,15,0 scaffold_411 795 . C T 122.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=24.58 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:151,15,0 scaffold_411 804 . G T 129.90 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=28.23;MQ0=0;QD=25.98 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,5:5:15:158,15,0 scaffold_462 1296 . G T 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.29;MQ0=2;MQRankSum=1.642;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,4:19:9:70,9,0 scaffold_462 1299 . A G 42.28 . AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.415;DP=19;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=1.7128;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=11.29;MQ0=2;MQRankSum=1.642;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.396 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:15,4:19:9:70,9,0 scaffold_484 1209 . C T 259.80 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=48.08;MQ0=0;QD=32.14 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,7:7:21:288,21,0 scaffold_511 811 . T G 54.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=27.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:82,6,0 scaffold_511 843 . C G 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 scaffold_511 856 . T C 51.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=25.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:79,6,0 scaffold_524 740 . T C 46.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.9998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.40;MQ0=0;MQRankSum=-0.727;QD=11.69;ReadPosRankSum=0.727 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,3:4:30:75,0,30 scaffold_551 1177 . T C 52.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:80,6,0 scaffold_551 1216 . G C 53.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=26.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:81,6,0 scaffold_551 1285 . A T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 scaffold_551 1294 . C T 41.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=59.50;MQ0=0;QD=20.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:69,6,0 scaffold_581 709 . G T 49.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:77,6,0 scaffold_614 5059 . T A 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=33.48;MQ0=1;QD=16.25 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:1,2:3:6:76,6,0 scaffold_658 130 . G T 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 scaffold_658 258 . C T 72.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;DP=8;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=0.956;QD=9.10;ReadPosRankSum=1.920 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:5,3:8:99:101,0,180 scaffold_679 441 . T C 123.03 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=30.76 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,4:4:12:151,12,0 scaffold_705 71 . G A 24.76 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.070;DP=41;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.5784;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=5.10;MQ0=23;MQRankSum=2.178;QD=0.60;ReadPosRankSum=1.194 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:39,2:41:6:52,6,0 scaffold_727 675 . G C 47.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=23.87 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:75,6,0 scaffold_747 257 . G A 101.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;DP=34;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=15.9622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.34;MQ0=0;MQRankSum=0.257;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.163 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:27,6:34:99:130,0,908 scaffold_747 634 . A G 59.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=4.9969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-0.573;QD=6.64;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:88:88,0,202 scaffold_747 638 . T A 47.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;DP=9;Dels=0.00;FS=2.808;HaplotypeScore=4.9969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQ0=0;MQRankSum=-1.001;QD=5.31;ReadPosRankSum=2.054 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:6,3:9:76:76,0,197 scaffold_747 681 . G A 25.78 LowQual AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.666;DP=10;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=4.9722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQ0=0;MQRankSum=1.179;QD=2.58;ReadPosRankSum=-1.666 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:7,2:10:54:54,0,218 scaffold_747 1026 . A C 35.77 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.026;DP=4;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQ0=0;MQRankSum=1.026;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.026 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:2,2:4:64:64,0,64 scaffold_747 1040 . C T 39.90 . AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.736;DP=3;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQ0=0;MQRankSum=0.736;QD=13.30;ReadPosRankSum=-0.736 GT:AD:DP:GQ:PL 0/1:1,2:3:15:68,0,15 scaffold_747 1047 . C T 48.74 . AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=60.00;MQ0=0;QD=24.37 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:0,2:2:6:76,6,0 scaffold_886 936 . T C 27.75 LowQual AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;Dels=0.00;FS=0.000;HaplotypeScore=0.0000;MLEAC=2;MLEAF=1.00;MQ=9.39;MQ0=10;QD=2.31 GT:AD:DP:GQ:PL 1/1:8,4:12:6:55,6,0